PROSITE entry PS51281
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | TAP_C |
| Accession [info] | PS51281 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2006 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51281 |
| Associated ProRule [info] | PRU00611 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | TAP C-terminal (TAP-C) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9917423; R2=0.0210039; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3385.0000000; R2=1.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=310; H_SCORE=3695; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=215; H_SCORE=3600; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-10; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='P'; M= -8, -3,-28, 1, -2,-36,-14,-16,-28, -8,-32,-28, -8, 41, -6,-18, 2, -6,-22,-40,-28, -4; /M: SY='T'; M= -4,-14,-16,-13, -7,-16,-26,-20, 4,-12, -4, -4,-12,-16,-10,-16, -4, 17, 9,-28,-16, -7; /M: SY='R'; M=-10, -4,-34,-10, 10,-30,-20, 2,-30, 22,-22,-12, 0,-14, 30, 32, -4,-10,-24,-26,-20, 14; /M: SY='Q'; M=-12,-13,-26,-11, 7,-18,-26, -6,-11, -5, -1, 12,-13,-18, 23, -4,-10,-10,-10,-22,-16, 9; /M: SY='E'; M=-10, 6,-36, 12, 38,-30,-20, 4,-30, 10,-26,-12, 0,-10, 36, 4, 0,-10,-26,-26,-20, 36; /M: SY='M'; M=-12,-32,-16,-32,-24, 0,-34,-24, 19,-24, 24, 40,-27,-30,-11,-22,-22,-10, 14,-20,-10,-24; /M: SY='I'; M=-12,-34,-10,-34,-30, -2,-38,-30, 30,-28, 26, 14,-34,-28,-24,-26,-24, -8, 24,-22,-10,-28; /M: SY='Q'; M=-14, 0,-28, -4, 9,-24,-22, -4,-19, 7,-15, -8, 4,-17, 12, 1, -4, -8,-18,-28,-18, 9; /M: SY='A'; M= 18,-11,-13,-16, -1,-24, -9,-16,-19, 16,-24,-14,-11,-10, -1, 3, 6, -4, -9,-30,-20, -1; /M: SY='M'; M=-14,-32,-16,-34,-26, 11,-34,-22, 17,-26, 21, 29,-28,-32,-16,-24,-22,-12, 11,-14, -3,-26; /M: SY='S'; M= -3, -6, 0,-12, -5,-20,-14, 6,-22, 3,-26,-20, 0,-16, -1, -7, 11, -5,-20,-26,-11, -5; /M: SY='A'; M= 10,-19,-10,-19, -9,-18,-16,-17, -7,-11, -5, -2,-17,-14, 1, -8, -1, 5, -2,-26,-18, -7; /M: SY='Q'; M=-12, -1,-32, 1, 24,-13,-22, 2,-24, 2,-21, -9, -6,-16, 26, -2, -4,-12,-22,-19,-11, 23; /M: SY='S'; M= 6, -4,-10, -4, -4,-20, -9,-14,-16, -4,-21,-16, 6,-10, -4,-10, 27, 27,-11,-30,-20, -4; /M: SY='G'; M= -4, -6,-30, -8, -6,-30, 27,-12,-36, 1,-34,-22, -6,-16, 2, -5, 0,-16,-26,-28,-26, -4; /M: SY='M'; M=-14,-34,-16,-34,-24, 0,-34,-24, 14,-24, 29, 43,-29,-30, -9,-20,-24,-10, 10,-20,-10,-24; /M: SY='N'; M=-18, 19,-26, 2, -6,-24,-16, 2,-17, -6,-29,-14, 43,-22, -6, -6, 4, -2,-19,-36,-18, -6; /M: M= -1,-13,-18, -8,-11,-22,-19,-22, -5,-16, -9, -9,-19, -1,-12,-20, -9, -6, -1,-34,-20,-11; /M: SY='E'; M=-12,-12,-28, -8, 8,-13,-26, -5,-12, -8,-16,-14,-14, -1, -4,-14,-10,-12,-12,-19, 0, 4; /M: SY='W'; M=-24,-34,-20,-39,-26, 28,-30, -1,-12,-26,-12,-12,-29,-36,-22,-26,-24,-24,-18, 48, 44,-26; /M: SY='S'; M= 14, -7, -8, -7, -4,-20, -4,-14,-16, -4,-23,-16, 1,-10, -4,-10, 27, 17,-11,-30,-20, -4; /M: SY='H'; M=-14, -7,-32,-11, 7, -6,-22, 17,-23, -1,-20,-12, -4,-21, 12, 7, -8,-14,-24,-17, 0, 7; /M: SY='K'; M=-10,-13,-26,-19, -3,-17,-24,-14,-13, 20, -8, 15, -9,-19, 6, 3, -9,-10, -7,-26,-16, -3; /M: SY='C'; M= -4,-32, 68,-40,-38,-16,-32,-30, -3,-30, 1,-11,-32,-30,-28,-36,-14,-10, -6,-20,-18,-38; /M: SY='L'; M= -3,-33, 14,-36,-28, -9,-29,-28, 7,-26, 16, 5,-33,-26,-20,-22,-17, -8, 3,-22,-14,-28; /M: SY='E'; M= -1, 3,-31, 9, 33,-28,-16, -2,-26, 6,-26,-14, -4,-10, 22, 0, 2, -8,-23,-28,-20, 29; /M: SY='Q'; M=-14, 17,-36, 26, 26,-34,-16, 1,-30, 3,-29,-15, 4,-14, 30, -3, 0,-10,-26,-33,-24, 24; /M: SY='N'; M= -6, 4, 1, -5, -9,-24,-14, -8,-20, -8,-26,-18, 21,-18, -8,-12, 13, 10,-18,-32,-20, -9; /M: SY='N'; M= -9, 21,-24, 4, -2,-28, -8, 4,-26, -2,-36,-18, 45,-18, -2, -2, 10, 0,-24,-38,-20, -2; /M: SY='W'; M=-30,-40,-20,-50,-30, 10,-30,-20,-20,-30,-20,-20,-40,-40,-20,-30,-30,-30,-30,100, 20,-30; /M: SY='D'; M=-20, 36,-36, 40, 12,-36,-10, -2,-30, -6,-40,-26, 30,-20, 0,-12, 4, -6,-30,-46,-26, 6; /M: SY='Y'; M=-20,-30,-20,-34,-24, 41,-30, 9, -6,-24, -6, -6,-24,-34,-24,-24,-20,-20,-10, 16, 55,-24; /M: SY='N'; M=-14, 20,-30, 18, 13,-30,-14, -1,-26, -2,-32,-20, 27,-16, 2, -6, 6, 5,-24,-38,-22, 9; /M: SY='H'; M= -7,-14,-21,-20,-12, -3,-20, 5, -9, -8,-14,-10, -8,-22, -6, -3, -3, -7, -9,-21, -1,-10; /M: SY='A'; M= 34,-16, -2,-16, -8,-20, 0,-18,-12, -8,-22,-12,-14,-10, -8,-10, 16, 2, -4,-30,-20, -8; /M: SY='C'; M= 9,-28, 13,-30,-24,-11,-23,-26, 7,-22, 4, -1,-28,-22,-20,-22, -9, -6, 7,-24,-16,-24; /M: SY='Q'; M= -1,-10,-22,-14, 2,-10,-18, -5,-20, 7,-18, -7,-10,-16, 17, 0, -2,-10,-14,-19,-10, 5; /M: SY='A'; M= 8,-12,-16,-14,-10,-22, 3,-18,-15, -1,-23,-15,-10,-14, -8,-10, 7, -4, -7,-30,-20, -8; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 60,-30,-10, 0,-30, 0, 0,-30,-40,-30,-30,-20,-20,-10, 10, 30,-30; /M: SY='Q'; M=-12, -3,-24, -5, 6,-22,-22, -6,-15, -4,-11, -5, 3,-16, 11, -4, -3, 3,-14,-28,-18, 6; /M: SY='E'; M= -8, 4,-30, 4, 22,-24,-16, 11,-28, 12,-30,-20, 4,-12, 12, 2, 7, -8,-26,-28,-13, 18; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='L'; M=-14,-29, -8,-29,-23, 0,-31,-23, 19,-23, 28, 14,-29,-23,-18,-18,-22, -8, 12,-16, -8,-23; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='K'; M=-10, -6,-22,-14, 0, -6,-18, -8,-18, 24,-18,-12, -6,-14, 0, 6, -4,-10,-14,-16, -6, 0; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='S'; M= 12, -4,-12, -6, 0,-22, -4,-12,-20, 8,-28,-18, 3,-10, 0, -4, 27, 4,-16,-30,-20, 0; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='R'; M= -8, -7,-26, -9, 7,-18,-18, -6,-16, 11,-11, 1, -4,-15, 8, 12, -7, -8,-14,-22,-14, 5; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='N'; M=-13, 17,-24, 4, -4,-24, 5, 3,-26, -4,-32,-18, 36,-16, -4, -4, 6, -4,-24,-31,-18, -4; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='K'; M= -2, -7,-24, -7, 0,-24, -1,-15,-17, 3,-24,-16, -7,-14, -3, -9, 3, -6,-11,-30,-20, 1; /M: SY='I'; M= -8,-30,-10,-30,-30, -2,-38,-30, 38,-28, 18, 10,-30,-28,-28,-30,-20, -8, 32,-22,-10,-28; /M: SY='P'; M=-10,-20,-30,-20,-10,-40,-20,-20,-30,-10,-30,-30,-20, 80,-10,-20,-10,-10,-20,-40,-30,-10; /M: SY='A'; M= 10,-12,-22,-13, 3,-28,-12,-12,-22, 0,-24,-18,-12, 5, 0, 5, 0, -6,-16,-32,-22, 1; /M: SY='E'; M= -8, 3,-34, 11, 35,-26,-22, -6,-19, 4,-23,-14, -6,-12, 13, -6, -4, -8,-17,-30,-18, 29; /M: SY='A'; M= 40,-20, 0,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-20,-10,-20,-10,-10,-10, 10, 0, 0,-30,-20,-10; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 60,-30,-10, 0,-30, 0, 0,-30,-40,-30,-30,-20,-20,-10, 10, 30,-30; /M: SY='M'; M= 6,-22,-12,-22,-16,-10,-18,-20, 4,-14, -1, 19,-16,-20, -6,-18, -1, -2, 8,-26,-14,-14; /M: SY='K'; M=-12, 0,-30, -7, 10,-25,-20, 17,-30, 25,-27,-14, 2,-12, 24, 12, -2,-12,-22,-25,-10, 13; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 60,-30,-10, 0,-30, 0, 0,-30,-40,-30,-30,-20,-20,-10, 10, 30,-30; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 13 in 13 different sequences |
| Number of true positive hits | 13 in 13 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | TAP-C |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
13 sequences
MEX67_CANAL (P84149), MEX67_SCHPO (Q9Y8G3), MEX67_YEAST (Q99257), NXF1_BOVIN (Q1RMS5), NXF1_CAEEL (Q9XVS7), NXF1_COTJA (P58797), NXF1_DROME (Q9U1H9), NXF1_HUMAN (Q9UBU9), NXF1_MOUSE (Q99JX7), NXF1_PONAB (Q5R752), NXF1_RAT(O88984), NXF2_DROME (Q9VV73), NXF2_HUMAN (Q9GZY0)» more
|
| PDB [Detailed view] |
12 PDB
1GO5; 1JKG; 1JN5; 1OAI; 2JP7; 2KHH; 6E5U; 6EXZ; 6IEW; 6OPF; 8HBN; 8HFR |