Entry: PS51283

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] DUSP
Accession [info] PS51283
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2006 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); SEP-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51283
Associated ProRule [info] PRU00613

Name and characterization of the entry

Description [info] DUSP domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=114;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=109;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8272704; R2=0.0115847; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6905.22984; R2=18.29483; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=663; N_SCORE=8.5; H_SCORE=17443; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=421; N_SCORE=5.7; H_SCORE=14278; MODE=1; TEXT='RR';
/DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='E'; M=  0,  1,-17,  5, 11,-23,-13, -7,-16,  5,-10, -9, -2,  7,  7, -4, -2, -3,-17,-25,-12,  8;
/M: SY='K'; M=  0,  0,-14,  1,  1,-14,-12,-13, -9,  2, -8, -4,  0, -4, -1, -2,  2,  1,-10,-27,-11, -2;
/M: SY='I'; M=  0,-10,-21,-12, -8,  0,-15,-11,  8, -5,  7,  4,-10,-11, -7, -9, -6,  1,  6,-23,  3, -9;
/M: SY='D'; M=  3,  6,-18, 12, 10,-22,-13, -9,-13,  5, -7, -2,  0, -8,  4, -4, -1, -4,-11,-26,-11,  7;
/M: SY='Q'; M=  0, -4,-12,  1, 15,-19,-16, -8,-16,  7, -7, -3, -8, -2, 16,  7, -5, -8,-16,-17, -8, 14;
/M: SY='Q'; M=  7, -3,-14,  1, 23,-28,-12, -6,-21,  8,-15, -7, -7,  1, 34, 11, -2, -8,-22,-16,-16, 26;
/M: SY='R'; M= -3,-10,-22, -8, -2, -6,-13,-13,-12,  8, -9,  3,-10,-11,  7, 21, -6,-13, -7,-11, -2, -1;
/M: SY='Q'; M=  4, -1,-20,  3, 12,-21,-11, -7,-15,  7,-10,  0, -4, -3, 17,  4, -2, -5,-14,-22,-11, 13;
/M: SY='I'; M=  0, -4,-16,-10, -8, -3,-13,-14, 12, -5,  6,  5,  3,-20, -9,-15, -5,  2,  7,-29, -5, -9;
/M: SY='I'; M= -2,-16,-21,-20,-16,  3,-19, -7, 23,-14, 14,  6,-12,-25,-15,-14,-10,  1, 20,-22,  8,-17;
/M: SY='E'; M=  2, -1,-17,  0, 12,-18,-12, -8,-16, 10,-13, -1,  0, -5, 11,  7,  1, -6,-14,-21,-13, 11;
/M: SY='Q'; M=  2,  2,-17,  0,  6,-18, -8,-12,-13,  7,-10,  0,  4, -7,  9,  1,  1,  0,-14,-24,-13,  6;
/M: SY='L'; M= -6,-14,-10,-17,-12, 16,-18,-13, 12,-12, 22, 10,-15,-27,-15,-14,-11, -1,  8,-12, 16,-12;
/M: SY='I'; M=  0,-13,-16,-17, -9,  4,-15,-15, 11, -5, 11,  8,-10,-21, -9,-11, -8, -2,  8,-15,  3,-10;
/M: SY='Q'; M=  4,  0,-18,  1, 10,-20,-13, -7,-14,  7,-11,  0,  0, -6, 14,  6,  0, -4,-13,-24,-13, 11;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='E'; M=  3,  0, -8,  2,  6,-16, -8,-13,-10,  3, -6, -1, -2, -7,  4, -2,  1, -2, -9,-21,-13,  4; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='L'; M= -1, -1,-12, -2,  0, -1,-12,-11, -3,  0,  1,  0,  0,-11, -2, -7, -2,  0, -3,-18, -1, -1; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='K'; M= -2, -4,-14, -3,  3, -8, -6, -9,-10,  5, -6, -1, -4, -6,  2,  3, -1, -5, -9, -7, -3,  2; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='Y'; M= -3,-10,-17,-10, -1,  4,-16, -5, -6,  0,  2, -1, -8,-10,  3,  1, -5, -5, -3,-10,  5,  0; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='E'; M= -3, -4,-14, -4,  7,-12, -9, -6,-11,  4, -8, -8, -4,  7, -1, -8, -1, -3,-14,-14, -8,  3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='E'; M=  0, -3,-13, -4,  5,-10,-10, -9, -5,  1, -2, -1, -2, -8,  2, -4, -2, -2, -8,-17, -5,  3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='E'; M=  1, -2,-13,  0, 13,-19,-16, -6,-13,  9, -8,  2, -2, -4, 11,  2, -2, -4,-14,-24,-11, 12;
/M: SY='E'; M=  4,  2,-14,  8, 12,-21,-10,-11,-15,  4, -9, -9, -4,  0,  2, -9,  3, -3,-13,-25,-15,  7;
/M: SY='G'; M=  0,  3,-18, -3, -7,-19, 19,-19, -6, -5,-11,-10,  7,-10,-10,-14,  1, -3,-15,-19,-20, -9;
/M: SY='D'; M=  0,  9,-19, 20, 11,-28,-10, -7,-20,  3, -9,-10, -2, -3,  5, -4, -1, -5,-18,-24,-10,  7;
/M: SY='K'; M= -2, -5,-19, -3,  4,-13,-15,-12, -9,  5, -5, -1, -6, -1,  3, -1, -2, -2, -7,-21, -4,  2;
/M: SY='W'; M= -9,-18,-26,-17,-12,  3, -9,-19, -1, -8,  2, -5,-19,-19, -4, -3, -9, -8,  1, 15, 15,-10;
/M: SY='Y'; M=-28,-24,-40,-19,-22, 37,-28, -5, -5,-11, 21,-10,-23,-25,-15, -6,-15,-11,  8, 22, 54,-23;
/M: SY='I'; M= -7,-18,-15,-23,-21, 15,-18,-19, 26,-17, 21,  7,-16,-31,-19,-16,-14, -2, 22, -9, 16,-21;
/M: SY='I'; M=  0,-17,-16,-27,-26,  8,-18,-21, 44,-19, 21,  8, -9,-33,-23,-22,-12,  2, 35,-27,  4,-26;
/M: SY='S'; M=  4,  1,-23,  6,  5,-24, -5, -1,-18,  2,-19,-20, -3, 16, -5,-11, 18,  9,-18,-32,-19, -3;
/M: SY='K'; M= -3,-10,-21,-11, -2, -6,-15, -5, -8,  4, -4,  4, -7,-11,  0,  3, -1, -3, -6,-15, -1, -3;
/M: SY='E'; M=  3,  5,-21,  7,  8,-18, -9, -9,-17,  7,-14, -5,  5, -4,  8,  4,  1, -5,-16,-27,-16,  6;
/M: SY='W'; M=-47,-47,-21,-39,-11, 13,  7,-47,-28,-19,-18,-29,-65,-29,-10,  1,-27,-46,-27,183, 48,-11;
/M: SY='F'; M=-12,-22,-19,-26,-19, 30,-16,-20,  7,-14, 17,  1,-21,-30,-17,-12,-15,-12,  7, 18, 23,-19;
/M: SY='Q'; M=  2,  3,-18,  5,  5,-16,-13,-10,-10,  4, -9, -3,  3,-10,  7,  3, -2, -6, -9,-26,-12,  5;
/M: SY='Q'; M=  2, -2,-20, -1, 10,-19,-12, -7,-16,  9,-13,  0, -1, -5, 22, 12, -2, -4,-18,-19,-10, 13;
/M: SY='W'; M=-37,-39,-24,-33,-16, 25, -5,-36,-15,-17, -1,-19,-50,-30,-14, -4,-24,-33,-12,120, 47,-16;
/M: SY='R'; M= -2, -9,-15,-11,  0, -6,-15,-16, -8,  6, -6,  4, -6,-10,  5,  7, -2, -3, -7,-14, -5,  0;
/M: SY='Q'; M=  1,  2,-22,  4,  4,-16,-11,-10,-13,  4, -9, -4,  0, -8,  9,  2,  1, -1,-11,-22, -7,  4;
/M: SY='Y'; M=-25,-24,-40,-18,-16, 26,-22,  0,-10, -9, 13, -9,-25,-17, -9, -2,-13,-12,  0, 24, 45,-16;
/M: SY='I'; M=  5, -9,-14,-13,-16,  0,-17,-20, 22,-13,  9,  3, -7,-24,-17,-16, -4,  7, 21,-32, -2,-17;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='S'; M=  2, -1,-21, -2,  0,-13, -3,-12, -6,  0, -7, -6,  0,-11,  1, -4,  4,  0, -7,-19, -9, -2; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='Y'; M= -8, -3,-29,  4, -5, -8, -7, -5,-11, -2,  2, -6, -7, -9, -3, -4, -6, -5, -8, -6, 11, -5; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='D'; M=  3,  9,-21, 15,  1,-21, -8, -9,-12,  1, -8, -9,  4, -1, -2, -8,  1,  2,-10,-30,-12, -2; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='E'; M=  2, -2,-17,  0,  6, -9,-10, -9,-10,  4, -5, -3, -3, -4,  2, -5,  2, -1, -8,-17, -6,  4; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='E'; M=  2,  1,-16,  1,  3,-12, -7, -8, -4,  2, -6, -1,  1, -6, -1, -5,  0, -1, -5,-21, -9,  0; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='D'; M=  1,  2,-13,  3,  0,-10,-11,-10, -1, -1, -2, -4,  3,-10, -2, -7, -1,  0, -1,-21, -7, -1; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='E'; M=  2, -3, -9, -3,  4, -9, -8, -5, -5,  1, -4, -2, -3, -1,  2, -4,  0, -1, -6,-17, -8,  3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='D'; M= -1,  4, -4,  5,  5,-14, -4, -9, -9,  1, -6, -6,  2, -2,  1, -4, -2, -3,-10,-15,-10,  3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='K'; M=  0,  0,-10, -2,  1, -5, -6, -7, -1,  2, -2,  1,  2, -9, -1, -3, -1, -2, -4,-14, -5, -1; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='D'; M=  2,  4, -8,  5,  5,-14, -6, -4, -9,  1, -7, -5,  5, -1,  5, -3, -1, -1, -9,-19,-12,  4; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-3; IM=0; DM=-3;
/M: SY='P'; M=  1, -3,-15, -4, -2,-12,  1, -3, -5, -1, -8, -4, -2,  3, -1, -4,  0, -1, -7,-13, -9, -2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='E'; M= -3, -5, -7, -4,  4,-11, -7, -4, -8,  1, -4, -4, -5,  3,  3,  0, -4, -5, -9,-11, -5,  3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='T'; M=  2, -5,-11, -7, -3,-13, -5,-10,  0, -3, -6, -7, -4,  2,  0, -7,  2,  4, -3,-19,-11, -3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='R'; M= -4,-10,-19, -8, -3,  0,-12, -5,-10,  3, -5, -5,-11,  5,  1,  6, -3, -5, -7,-11,  1, -4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='P'; M= -6,-13,-25,-10,  1,-25,-11,  0,-11,  3,-14,-23,-17, 58, -6,-13, -8,  1,-20,-30,-14, -5;
/M: SY='G'; M= -1,  0,-31, -6,-12,-24, 46,-23,-12, -5,-17,-16,  0, -2,-14,-15,  1,-12,-25, -5,-24,-14;
/M: SY='P'; M= -2,-10,-20, -5, 11,-27,-12, -2,-19,  8,-18,-18,-14, 41,  6, -3, -2, -1,-22,-26,-16,  6;
/M: SY='I'; M= -1,-18,-18,-33,-26,  5,-13,-19, 49,-19, 20,  9, -3,-30,-19,-25,-11,  0, 34,-28, -3,-26;
/M: SY='D'; M=  1, 33,-23, 42,  0,-29, -4,-17,-17, -1,-11,-15, 26,-16,-10,-14,  2,  0,-14,-43,-18, -6;
/M: SY='N'; M=  2, 20,-10, -1,-11,-11, -2,-14,  4, -4,-13, -2, 45,-22, -9,-19,  2, 10, -9,-52,-30,-11;
/M: SY='S'; M=  3, -1,-21,  0,  3,-13, -8,-11,-13,  3,-11, -6, -2, -7,  3, -5,  9,  5,-12,-19,-10,  1;
/M: SY='D'; M=  0,  4,-13,  7,  1,-18,-10,-10,-10, -1, -5, -5,  0, -5, -2, -6, -1, -1,-11,-29,-11, -1;
/M: SY='I'; M= -7,-16, -1,-25,-19, 16,-19,-18, 27,-19, 26,  9,-11,-30,-19,-21,-14, -1, 18,-21,  9,-19;
/M: SY='I'; M=  0, -8,-13,-13, -9,  4,-15,-15, 14, -9, 11,  5, -5,-23,-11,-14, -5,  2, 10,-25,  1,-10;
/M: SY='D'; M= -1,  6,  3, 11,  7,-27, -8,-18,-18, -1,-10, -9,  1,-10,  1, -6, -2, -5,-16,-26,-20,  4;
/M: SY='D'; M=  2,  3,-20, 11,  6,-25,-11, -8,-14,  1, -8,-11, -5,  5, -1,-10,  1,  0,-10,-28,-11,  2;
/M: SY='H'; M= -3, -2,-25, -3,  1,-15,-12,  6, -8, -2, -5, -2,  0, -7,  4, -7, -2, -2,-10,-24, -5,  1;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='E'; M=  1, -2,-11, -2,  3, -9,-10, -4, -7, -1, -6, -5,  0, -5,  3, -3,  0, -2, -8,-18, -9,  2; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='B'; M= -1,  2,-10,  2, -1, -2, -7, -7, -4,  0,  1, -1,  2, -8, -5, -6, -1, -1, -4,-14, -2, -3; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
/M: SY='P'; M= -3, -3, -6, -2,  2,-10, -3, -6, -8,  0, -4, -8, -4,  6, -1, -5, -3, -3, -9, -9, -5,  0; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='E'; M= -3, -4, -9, -3,  3,-11,  0, -9, -9,  2, -8, -8, -5,  2, -1, -3, -1, -6,-12, -1, -7,  1; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='N'; M= -1,  8,-13,  5, -1,-10, -5, -1, -7, -1, -7, -4, 13, -8, -3, -7,  2,  0, -9,-26,-12, -3; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='G'; M= -1, -5,-21, -6, -7, -7,  3, -7,  0, -5,  1, -1, -7, -8, -6, -9, -5, -4, -4,-12, -1, -7; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='Q'; M= -1, -8,-20, -9,  0,-10,-13,-10, -7,  1, -7, -5, -5, -3,  3, -4, -4, -2, -8,-16, -5,  0;
/M: SY='L'; M=-10,-15,-16,-17,-15, 19,-19,-10, 11,-13, 22,  6,-17,-21,-14,-10,-14, -5,  8,-14, 21,-14;
/M: SY='K'; M= -2,  1,-20,  1,  2,-11,-12,-10,-11, 10, -9,  5,  2, -5,  0,  5, -4, -6,-12,-26, -8,  0;
/M: SY='P'; M= -3, -7,-21, -3, 10,-22,-13, -2,-16,  7,-12, -8,-11, 20,  8,  0, -4, -4,-18,-21, -8,  7;
/M: SY='N'; M=  0,  9,-24,  9, -1,-20,  4, -8,-12, -2,-13,-10, 10, -8, -4,-10,  1, -3,-16,-26,-16, -4;
/M: SY='L'; M= -1, -6,-13, -8, -8,  3,-15,-13, 13, -8, 16, 11, -8,-20,-12,-13, -9,  1,  7,-26,  7,-10;
/M: SY='Q'; M=  3,-10,-21, -8, -2, -8,-16,-12,  1,  0,  0,  4,-11,-12,  8,  5, -6, -2,  1,-19,  0,  0;
/M: SY='E'; M= -1, -6, -5, -3, 23,-25,-17, -1,-17,  7, -9, -7, -8,  9, 15, -5, -3, -6,-21,-19,-14, 21;
/M: SY='N'; M= -3,  6,-25,  6,  0,-20,  5, -7,-12,  0,-10, -7,  7, -8, -4, -9,  0, -5,-16,-22,-12, -3;
/M: SY='Q'; M=  0, -6,-14, -7,  0,-12,-17, -4, -4,  0, -5,  1, -3,-13,  4,  1, -4, -4, -5,-25, -9,  0;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='D'; M= -1, 30,-26, 49,  7,-35, -6, -7,-27,  2,-12,-17, 13, -3, -7,-10, -1, -7,-20,-38,-14,  0; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='Y'; M=-23,-23,-38,-20,-23, 38,-25,-11, -2, -9, 19, -9,-21,-24,-13, -2,-12, -9, 10, 18, 48,-22; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='V'; M=  4, -7,-15, -9, -5, -9,-16,-14,  9, -5,  2,  0, -5,-16, -4, -8, -2,  3, 10,-26, -6, -5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='I'; M= -2,-14,-10,-19,-14,  3,-17,-13, 20,-13, 14,  6,-10,-19,-12,-13,-10, -1, 14,-25,  1,-14; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='I'; M=  2,-19,-17,-27,-27, 10,-21,-23, 43,-20, 19,  6,-11,-34,-24,-20,-11,  4, 38,-28,  5,-27;
/M: SY='P'; M= -1,  0,-24,  2,  1,-25, -5, -5,-18,  2,-20,-22, -1, 33, -5,-11,  6,  7,-22,-33,-20, -5;
/M: SY='E'; M=  5, -1,-16,  5, 23,-25,-14, -7,-20, 13,-14, -3, -7,  4, 19,  5,  0, -7,-19,-21,-15, 21;
/M: SY='E'; M=  2,  1,-18,  5, 15,-23,-12, -8,-17,  8,-12, -9, -3,  8,  9, -4,  2, -2,-17,-24,-13, 11;
/M: SY='I'; M= 10,-10,-19,-13,-15, -2,-15,-18, 22,-11, 11,  9, -8,-26,-14,-16, -5,  6, 22,-32, -4,-15;
/M: SY='W'; M=-36,-40,-21,-36,-14, 21, -1,-38,-19,-16, -8,-22,-49,-29,-11, -2,-22,-35,-17,127, 39,-14;
/M: SY='E'; M= -1,  6,-15,  9, 12,-21,-14, -4,-16,  8, -9,  0,  6, -6,  4, -2, -1, -6,-16,-28,-13,  8;
/M: SY='F'; M=-10,-18,-26,-21,-15, 29,-21,-15, -2, -3, 10, -2,-13,-23,-10, -3, -9, -9,  3, -1, 19,-15;
/M: SY='F'; M=-12,-18,-12,-25,-20, 37,-21,-18, 16,-16, 27,  5,-17,-32,-20,-15,-16, -7, 11, -3, 25,-19;
/M: SY='Y'; M= -9,-12,-20,-13, -5,  0,-20, -3, -2, -5,  3, -1, -9,-17,  1, -3, -8, -4, -2, -9, 11, -4;
/M: SY='E'; M=  1,  2,-13,  3, 12,-20, -7, -9,-18,  6,-13, -8,  1, -6, 10,  2,  4, -5,-19,-20,-15, 10;
/M: SY='W'; M=-19,-21,-18,-20, -6,  6, -6,-24, -6, -7,  0, -6,-26,-21, -8, -5,-15,-19, -9, 50, 20, -7;
/M: SY='Y'; M=-34,-30,-52,-18,-23, 38,-28, -6, -7,-11, 25,-11,-34,-23,-13, -3,-18,-12,  9, 43, 73,-23;
/M: SY='G'; M=  0, -1,-34, -8,-12,-26, 49,-21,-10, -5,-18,-16, -1, -2,-12,-13,  0,-13,-25, -4,-24,-13;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='G'; M=  0,  0,-20, -1, -5,-17, 18,-11, -5, -2, -6, -6, -1, -4, -8,-11,  0, -4,-10, -8,-11, -7; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='G'; M=  2, -1,-28, -5,-11,-21, 34,-15, -4, -7,-11,-10, -1, -9,-12,-13,  0,-10,-14, -9,-19,-12; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='P'; M=  0, -1,-27,  0,  0,-27, 14,-11,-16,  1,-18,-19, -4, 20, -4,-10,  0, -5,-24,-20,-21, -4;
/M: SY='P'; M=  0,-10,-19, -9,  2,-14,-16, -7, -6,  0, -4, -8,-12, 13,  1, -9, -2,  3, -6,-24, -6,  0;
/M: SY='P'; M=  0, -9,-15,-11,  0, -9,-16,-11,  0, -1, -2, -4, -7,  1, -1, -9, -5,  0, -2,-24, -7, -2;
/M: SY='I'; M= -1,-12,-20,-25,-22,  7,-11,-19, 31,-14, 12,  3, -1,-25,-18,-21, -6,  2, 22,-27, -3,-23;
/M: SY='I'; M=  1,-10,-20,-10, -4,-14,-16, -7,  4, -1, -4, -1, -9, -1, -5, -8, -3,  1,  2,-27, -8, -7;
/M: SY='R'; M= -6,-11,-21, -5, -7, -9,-17,-11,-19,  7,-12,  0,-10,-12, 15, 43, -5,-15, -7,-11, -1, -3;
/M: SY='Q'; M= -1, -1,-23,  1, -2, -9, -8,-13,-10,  1, -4, -4, -3, -6,  2, -1, -4, -4,-10,-20, -4, -2;
/M: SY='V'; M=  4, -7,-19, -6, -8, -3,-15,-13,  4, -7,  3, -1, -7,-17, -8, -9,  0,  3,  7,-26, -2,-10;
/M: SY='I'; M= -4, -9, -7,-17,-13,  2,-18,-11, 12,-10,  4,  1,  0,-20,-15,-14, -7, -1,  7,-28, -5,-15;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_10 which contains 546'790 sequence entries.


Total number of hits 67 in 40 different sequences
Number of true positive hits 67 in 40 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 1
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 98.53 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 3
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] DUSP
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
40 sequences

UBP10_ARATH (Q9ZSB5), UBP11_ARATH (Q9MAQ3), UBP11_HUMAN (P51784), 
UBP11_MOUSE (Q99K46), UBP12_SCHPO (O60079), UBP12_YEAST (P39538), 
UBP15_BOVIN (Q2HJE4), UBP15_HUMAN (Q9Y4E8), UBP15_MOUSE (Q8R5H1), 
UBP15_RAT   (Q9R085), UBP15_XENTR (F6Z5C0), UBP1_SCHPO  (Q9USM5), 
UBP20_BOVIN (A7Z056), UBP20_DANRE (A5PN09), UBP20_HUMAN (Q9Y2K6), 
UBP20_MOUSE (Q8C6M1), UBP20_PONAB (Q5R5Z6), UBP20_XENLA (B1WBD7), 
UBP20_XENTR (A0JM59), UBP26_ARATH (Q9SCJ9), UBP26_ORYSI (A2XDG4), 
UBP26_ORYSJ (A3AF13), UBP32_HUMAN (Q8NFA0), UBP33_BOVIN (A6QNM7), 
UBP33_DANRE (A5PMR2), UBP33_HUMAN (Q8TEY7), UBP33_MOUSE (Q8R5K2), 
UBP33_PONAB (Q5REG5), UBP33_XENTR (Q28CN3), UBP48_CHICK (Q5ZM45), 
UBP48_HUMAN (Q86UV5), UBP48_MOUSE (Q3V0C5), UBP48_RAT   (Q76LT8), 
UBP4_BOVIN  (A6QR55), UBP4_HUMAN  (Q13107), UBP4_MOUSE  (P35123), 
UBP4_PONAB  (Q5RCD3), UBP4_RAT    (B2GUZ1), UBP5_ARATH  (O22207), 
UBP9_ARATH  (Q93Y01)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
1 sequence

UBP8_ARATH  (Q9C585)

		
PDB
[Detailed view]
9 PDB

1W6V; 3JYU; 3LMN; 3PPA; 3PV1; 3T9L; 4A3O; 4A3P; 4MEL

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission