Entry: PS51336

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] DM10
Accession [info] PS51336
Entry type [info] MATRIX
Date [info] OCT-2007 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51336
Associated ProRule [info] PRU00665

Name and characterization of the entry

Description [info] DM10 domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=103;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=98;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.0891621; R2=0.0286113; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5115.05412; R2=21.30670; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=190; N_SCORE=8.5; H_SCORE=8396; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=120; N_SCORE=6.5; H_SCORE=7651; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-10; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D'; M=-10, 10,-28, 16,  6,-30,-13, -9,-23, -4,-28,-20,  2, -8,  0,-10,  1, -6,-21,-38,-23,  2;
/M: SY='E'; M= -8, -1,-30, -2,  1,-25, -4, -7,-26,  0,-27,-20,  0,-11,  0,  1,  0, -7,-22,-31,-19,  0;
/M: SY='K'; M= -9, -1,-25, -4,  4,-25,-17, -7,-23,  8,-24,-16,  1, -7,  4,  1,  0, -6,-19,-30,-19,  4;
/M: SY='V'; M= -5,-22,-17,-24,-20,-11,-28,-19, 12,-12,  1,  3,-18,-21,-13,-13,-15, -3, 16,-27,-10,-15;
/M: SY='L'; M=-18,-38,-12,-38,-29,  3,-38,-25, 17,-28, 32, 19,-37,-30,-19,-21,-28,-10, 10,-17, -3,-28;
/M: SY='R'; M= -2,-10,-23,-16, -3,-26,-16, -6,-22, 10,-20,-16, -3,-17,  4, 25, -1, -4,-19,-29,-19, -2;
/M: SY='F'; M=-19,-30,-18,-39,-29, 55,-30, -8, -1,-29, -1,  0,-29,-39,-29,-29,-20,-20,-10, 10, 32,-29;
/M: SY='Y'; M=-11,-13,-23,-15, -9, -7,-21, -4,-11, -7,-11, -9,-10,-22, -6, -6, -9,-11,-11,-17,  2, -9;
/M: SY='A'; M= 17,-21,  9,-23,-20,-20,  0,-23,-10,-17,-16,-12,-20,-17,-16,-20,  1, -6, -4,-28,-20,-19;
/M: SY='Y'; M=-11,-15,-21,-17, -4, -8,-26, -4,-10, -3,-10, -8,-12,-20, -4, -5,-10, -6, -8,-17,  2, -4;
/M: SY='W'; M=-20,-34,-16,-39,-26, 13,-31,-18, -2,-26,  4,  5,-32,-34,-16,-24,-24,-18, -9, 26,  9,-26;
/M:         M=-11, -4,-23, -1, -5,-12,-22,-12, -5,-11,-12, -9, -9,-22, -8,-16, -8, -7, -4,-27, -9, -6;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='D'; M= -9, 16,-30, 24, 18,-31,-13, -6,-26,  1,-31,-22,  7,-13,  5, -7,  7, -1,-24,-37,-23, 13; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='P'; M= -5, -4,-19, -5,  1,-20,-12, -5,-16,  1,-16,-14, -3,  7,  0,  4, -2, -1,-13,-22,-14,  0; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='S'; M= -1, -2, -8, -2, -4,-13, -7, -6,-10, -6,-14,-10, -1,-11, -5, -9,  1, -1, -8,-19,-10, -5; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='N'; M= -5, -1,-16, -6, -4,-19,-14, -3,-14, -3,-19,-12,  7,-13, -3, -5,  5,  1,-12,-27,-13, -4; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='E'; M= -5,-10,-24, -9,  4,-21,-16,-10,-17, -2,-17,-11,-10, -1,  1, -6, -3, -7,-15,-27,-17,  2; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='E'; M= -1, -7,-18, -7,  2,-12,-13, -8,-16, -6,-19,-12, -9,-15,  0,-10, -1, -6,-13,-22,-10,  1; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='D'; M=-10,  6,-30, 11,  4,-24,  2, -5,-26, -8,-29,-20,  0,-17, -4,-12, -2,-12,-23,-31,-16,  0; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='R'; M=-10, -5,-26, -6,  2,-20,-20, -8,-17,  3,-15, -9, -5,-18,  3,  7, -7, -7,-16,-26,-15,  1; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='V'; M= -5,-15,-17,-16,-11,-16,-20,-17,  0, -8, -5, -2,-14,-17, -6,-10, -7, -6,  2,-27,-15,-10; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='R'; M=-11,-10,-37,-19, -1,-26,-21,  4,-27, 14,-18,-17,  0,-20,  9, 47,-10,-11,-27,-28,-15, -1;
/M: SY='K'; M= -8, -7,-26,-10,  3,-20,-21, -4,-19,  8,-20,-14, -5,-12,  5,  7, -4, -8,-16,-26,-13,  3;
/M: SY='F'; M=-16,-32,-12,-37,-29, 32,-32,-13,  6,-27,  6,  3,-30,-34,-26,-27,-21,-15,  0, -1, 21,-28;
/M: SY='V'; M= -6,-20,-14,-21,-15,-13,-28,-21,  9,-10,  1,  2,-17,-20,-11,-14,-10,  0, 11,-27,-14,-12;
/M: SY='I'; M=-12,-34,-11,-34,-30, -1,-38,-29, 28,-28, 26, 16,-34,-28,-23,-25,-24, -8, 22,-21, -9,-28;
/M: SY='Y'; M= -8,-13,-16,-17,-10, -5,-20,  1,-13,-10,-13, -8, -4,-20, -5, -8, -1, -1,-11,-16,  5,-10;
/M: SY='Y'; M=-17,-29,-18,-32,-23, 32,-29,  6, -4,-23, -5, -5,-24,-31,-22,-23,-19,-18, -6, 10, 47,-22;
/M: SY='Y'; M=-19,-24,-21,-28,-20, 32,-28, 15,-10,-21,-10, -9,-17,-31,-19,-21,-17,-19,-13,  9, 46,-20;
/M: SY='L'; M=-11,-33, -6,-34,-27, -6,-33,-27, 12,-24, 19, 10,-31,-19,-18,-22,-21, -4, 10,-23,-11,-25;
/M: SY='E'; M=  2,  1,-20,  2, 11,-25,-10, -7,-20,  0,-26,-16,  1,-13,  2, -6,  8, -4,-18,-31,-19,  8;
/M: SY='D'; M=-17, 30,-36, 43, 15,-36,-10, -9,-28, -8,-35,-26, 11,-19,  0,-14,  1, -6,-27,-45,-27,  7;
/M: SY='D'; M=-13, 17,-35, 23,  7,-34,  2, -6,-32,  0,-37,-27,  7,-18, -1, -6,  0,-12,-28,-39,-25,  3;
/M: SY='T'; M=  2, -5,-15, -4,  0,-21,-15,-15,-13, -4,-18,-12,  0,-11, -4, -9, 13, 23, -8,-30,-20, -2;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-11,-30,-26,  0,-34,-26, 25,-24, 15, 13,-28,-27,-21,-27,-19, -7, 22,-21, -8,-24;
/M: SY='E'; M= -1, -2,-23,  0, 13,-23,-12, -7,-20,  0,-21,-10, -2,-13,  9, -6,  7, -4,-18,-29,-19, 10;
/M: SY='I'; M= -7,-31,-11,-31,-30, -3,-35,-29, 32,-26, 17, 13,-30,-26,-24,-29,-21, -6, 31,-23, -9,-26;
/M: SY='Y'; M=-13,-20,-21,-25,-15,  8,-26, -7, -6,-11, -7, -4,-14,-26,-12,-10,-12, -8, -7, -8, 10,-15;
/M: SY='E'; M=-11, 10,-39, 20, 43,-29,-19, -1,-29,  8,-29,-19,  0,-12, 19,  0, -1,-10,-28,-31,-20, 34;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='P'; M= -4,-11,-16,-12, -6,-18,-15,-11,-10, -1,-11,-10, -9,  8, -4, -5, -4, -2, -6,-23,-15, -5; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='P'; M= -5, -6,-21, -8, -3,-20,-10, -9,-16, -1,-18,-14, -5,  3, -3, -4, -3, -6,-12,-25,-16, -3; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='Q'; M= -3,-12,-17,-13, -6,-16,-15,-10, -5, -4, -9, -4,-11, -7,  1, -8, -6, -4,  1,-22,-12, -3; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='R'; M= -7, -1,-26, -3,  5,-23,-14, -2,-22,  4,-22,-16,  2, -3,  7, 10,  0, -5,-20,-27,-17,  5; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='N'; M=-13, 18,-23,  7,  1,-24, -9,  2,-22,  1,-30,-16, 35,-14,  0, -2,  9,  1,-21,-32,-17,  0; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='S'; M=  4, -1,-12,  0, -2,-18,  1,-10,-19, -2,-25,-17,  3, -9, -3,-10, 21,  4,-17,-26,-17, -2; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='G'; M= -3,-11,-24,-11,-13,-26, 28,-18,-29,-15,-29,-22,-11,-20,-13,-14, -3,-14,-23,-26,-25,-14;
/M:         M=-11,-15,-23,-19,-13, -5,-24,-12, -4, -8, -7, -6,-13,-22,-11, -4,-10, -8, -6,-21, -7,-13;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='P'; M= -6,-11,-19,-13, -9,-24,-14,-14,-17, -8,-19,-14, -7,  5, -6,-11, -4, -6,-13,-29,-20, -8; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='G'; M= -6, -9,-26,-11, -6,-18,  5, -8,-26, -3,-26,-17, -7,-14, -1, -8, -2,-13,-20,-24,-14, -5;
/M: SY='G'; M= -3,-10,-30,-13, -9,-30, 17,-12,-33, -3,-32,-25, -7, -1, -5, -1, -1,-13,-26,-31,-25, -9;
/M:         M= -5,-17,-12,-21,-12,-17,-24,-19, -3, -2, -4,  0,-14,-17, -7, -7, -8,  0,  0,-27,-16,-11;
/M: SY='F'; M=-18,-29,-17,-36,-27, 39,-31,-11,  2,-27,  3,  3,-27,-34,-25,-27,-20,-16, -6,  2, 20,-27;
/M: SY='L'; M=-17,-36,-12,-36,-28,  1,-37,-25, 18,-28, 29, 16,-35,-29,-19,-21,-26,-10, 11,-17, -7,-27;
/M: SY='K'; M= -6, -3,-28, -8,  7,-26,-17,  0,-26, 21,-25,-18,  1,-13, 10, 18,  4, -6,-22,-29,-17,  7;
/M: SY='R'; M=-10, -7,-38,-16,  2,-30,-20, -3,-30, 25,-23,-20,  0,-16,  9, 48, -8,-10,-28,-31,-20,  2;
/M: SY='Q'; M= -1,-10,-12,-12, -6,-23, -9, -7,-19, -6,-19,-12, -5,-13,  5, -5,  4,  4,-13,-26,-19, -4;
/M: SY='R'; M= -6, -8,-28,-14,  1,-25,-20, -7,-22, 16,-21,-16, -5,-14,  5, 19, -5, -7,-18,-26,-17,  1;
/M: SY='I'; M= -7,-28,-10,-29,-24, -5,-31,-22, 18,-23, 11,  5,-27,-21,-19,-24,-18, -7, 17,-22, -8,-22;
/M: SY='P'; M= -9,-12,-27,-12, -4,-29,-20,-12,-21, -5,-21,-18,-11, 23, -5, -8, -7, -7,-16,-34,-21, -5;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='K'; M= -9,  1,-27, -6,  3,-25,-15, -6,-23, 16,-25,-17,  7,-13,  2,  7,  0, -5,-19,-30,-18,  2; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='P'; M= -6, -7,-20, -7, -3,-23,-14, -9,-16, -5,-19,-16, -7, 22, -3, -9, -4, -6,-12,-26,-17, -3; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M:         M= -2, -7,-11, -8, -7,-10, -5, -9, -9, -8,-11, -7, -7, -1, -6,-10, -3, -4, -7,-16,-10, -7; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
/M: SY='E'; M= -4, -1,-18, -1,  3,-16, -7, -6,-12, -2,-15, -8, -1, -8,  0, -4, -2, -5,-10,-20,-13,  1; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='T'; M= -4, -1,-16, -1, -2,-16,-11, -9,-11, -4,-15,-11, -1, -4, -4, -7,  1,  4, -8,-23,-13, -3; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='G'; M= -6,  0,-21, -1, -1,-20,  1, -8,-19,  1,-21,-14,  0, -7, -2, -5,  0, -5,-14,-24,-16, -1; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='E'; M= -4,  3,-20,  6,  9,-21, -9, -5,-17,  1,-19,-13,  0, -7,  5, -3,  1, -4,-13,-24,-15,  7; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='Y'; M=-12,-18,-13,-20,-14,  8,-20,  1, -9,-14, -9, -8,-15, -9,-12,-16,-12,-12,-10, -1, 18,-14; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='Y'; M=-16,-30,-15,-31,-24, 22,-31, -5,  7,-23,  5,  1,-26,-29,-22,-23,-20,-14,  3,  2, 30,-23; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='T'; M= -4, -5,-20, -8,  0,-23,-15, -6,-19,  1,-19,-13,  0,-12,  3,  0,  4,  8,-14,-29,-18,  0;
/M: SY='P'; M= -5,-15,-22,-13, -6,-22,-21,-15,-14,-11,-15,-13,-17,  6, -6,-13, -9, -7,-11,-24,-16, -7;
/M: SY='E'; M= -5,  2,-27,  2, 10,-25,-11, -6,-25,  6,-27,-18,  3,-13,  7,  1,  7, -5,-22,-28,-19,  9;
/M: SY='D'; M=-16, 32,-37, 48, 19,-37,-11, -6,-29, -7,-37,-27,  9,-18,  4,-16,  2, -9,-28,-45,-27, 11;
/M: SY='F'; M=-19,-35,-14,-39,-30, 25,-36,-21, 13,-30, 21, 12,-34,-34,-24,-25,-25,-14,  4, -8,  7,-30;
/M: SY='Y'; M=-12,-12,-25,-17, -8, -1,-18,  3,-17, -6,-17,-12, -5,-23, -4, -2, -8,-11,-16,-12, 10, -8;
/M: SY='V'; M= -6,-29,-10,-29,-27, -7,-33,-28, 26,-23, 13,  7,-29,-19,-22,-27,-19, -4, 27,-26,-11,-23;
/M: SY='G'; M= -1, -9,-30, -9,-19,-30, 58,-19,-40,-20,-40,-30, -9,-20,-19,-20,  0,-20,-30,-30,-30,-19;
/M: SY='S'; M=  5, -3,-18, -6, -1,-23,-10,-10,-18,  2,-23,-14,  1,-14,  1, -2,  8,  0,-13,-31,-19, -1;
/M: SY='T'; M= -5, -7,-19, -9, -5,-20,-20,-14,-10, -2,-15,-11, -4,-14, -5, -7,  1, 10, -5,-27,-17, -4;
/M: SY='I'; M= -8,-32,-10,-32,-30, -3,-35,-28, 30,-25, 19, 12,-32,-26,-23,-27,-22, -6, 29,-23, -7,-25;
/M: SY='N'; M=-10, -1,-23, -5, -1,-20,-20, -8,-12, -5,-15, -7,  7,-18,  1, -6,  0,  2,-10,-30,-17, -1;
/M: SY='I'; M= -7,-31,-10,-32,-29,  0,-35,-28, 29,-26, 18, 10,-31,-27,-25,-27,-20, -8, 25,-21, -8,-26;
/M: SY='Y'; M=-17,-16,-21,-24,-17, 16,-24,  2,-11,-17,-11, -7, -6,-29,-15,-16,-12,-13,-14, -2, 20,-17;
/M: SY='G'; M= -1, -5,-20, -7,-12,-27, 26,-14,-31,-10,-34,-24, -3,-18,-11,-13,  5,-10,-24,-31,-25,-12;
/M: SY='R'; M=-11,-14,-31,-22, -6,-17,-21,  1,-22,  8,-17,-15, -7,-22,  3, 28,-11,-11,-22,-18, -9, -5;
/M: SY='Q'; M= -7, -8,-26,-10,  1,-26,-20,-11,-18,  4,-18,-13, -7, -2,  6,  3, -4, -1,-12,-30,-20,  2;
/M: SY='F'; M=-17,-31,-16,-36,-28, 35,-31,-11,  5,-27,  5,  4,-29,-34,-25,-27,-20,-15,  0,  1, 23,-27;
/M:         M=-13,-12,-25,-15, -4, -6,-26, -3, -9, -4,-10, -7,-10,-22, -3, -5,-10, -9, -9,-19, -1, -4;
/M: SY='I'; M=-13,-35,-10,-35,-30, -1,-39,-30, 29,-29, 28, 15,-35,-29,-24,-25,-25, -9, 22,-21,-10,-29;
/M: SY='Y'; M=-11,-21,-16,-21,-17,  0,-26, -8,  0,-15, -3, -2,-16,-23,-13,-17,-12, -2,  2,-14,  8,-15;
/M: SY='D'; M=-11, 19,-34, 29, 15,-34, -1, -8,-30, -5,-36,-25,  7,-17,  2,-10,  2, -9,-28,-40,-26,  8;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='C'; M= 16,-23, 25,-26,-20,-16,-13,-20,-10,-17,-13, -8,-21,-19,-14,-21,  1, -5, -5,-24,-15,-20;
/M: SY='D'; M=-15, 31,-35, 45, 14,-36, -8,-10,-28, -9,-38,-28, 11,-17, -1,-17,  4, -6,-28,-46,-28,  6;
/M: SY='E'; M= -7,  6,-31, 12, 20,-29,-13, -7,-25,  0,-28,-19, -2, -8,  8, -7,  0, -7,-22,-33,-21, 15;
/M: SY='Y'; M=-14,-20,-23,-24,-14, 21,-22,  3,-10,-17,-11, -8,-16,-28,-15,-16,-13,-15,-12, -4, 22,-14;
/M: SY='T'; M=  2, -9,-10,-10, -9,-20,-18,-19,-11, -9,-12,-11,  1,-10, -9,-10, 11, 43, -1,-30,-20, -9;
/M: SY='R'; M= -8,-15,-27,-20, -5,-20,-20, -8,-17,  8,-10,-10,-10,-19,  2, 21, -9, -8,-15,-26,-15, -5;
/M: SY='N'; M= -6,  5,-24,  3,  8,-26,-14, -5,-23,  6,-27,-17, 10,-15,  5,  2,  7, -1,-21,-32,-19,  6;
/M: SY='Y'; M=-14,-28,-18,-31,-22, 24,-28, -1, -4,-21, -4, -4,-23,-30,-20,-21,-17,-16, -7,  7, 32,-22;
/M: SY='M'; M=-14,-31,-11,-33,-24,  9,-32,-14,  6,-22, 13, 20,-26,-30,-14,-21,-21,-11,  4,-10,  9,-23;
/M: SY='E'; M= -5, -1,-28,  0, 15,-25,-15, -4,-24,  7,-24,-16, -4,-15,  8,  5, -2, -9,-21,-29,-17, 12;
/M: SY='E'; M= -1, -4,-22, -4,  7,-24,-13, -8,-20,  1,-22,-13, -4,-14,  6, -3,  2, -4,-16,-26,-18,  6;
/M: SY='K'; M= -9, -6,-22,-12, -2,-20,-18,  1,-20,  7,-21,-12,  1,-17,  4,  4, -3, -8,-16,-25, -9, -1;
/M:         M= -6,-14,-19,-16,-12, -9, -5,-11,-17,-12,-18,-14,-11,-14,-11,-14, -2,-10,-16,-20, -6,-12;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 22 in 10 different sequences
Number of true positive hits 22 in 10 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 3
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] DM10
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
10 sequences

EFHC1_HUMAN (Q5JVL4), EFHC1_MOUSE (Q9D9T8), EFHC2_CHICK (Q32TG3), 
EFHC2_DANRE (Q32TF8), EFHC2_HUMAN (Q5JST6), EFHC2_MOUSE (Q9D485), 
NDK7_BOVIN  (Q5E9Y9), NDK7_HUMAN  (Q9Y5B8), NDK7_MOUSE  (Q9QXL8), 
NDK7_RAT    (Q9QXL7)
» More

PDB
[Detailed view]
2 PDB

2Z13; 2Z14

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission