PROSITE entry PS51358

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	NOP
Accession [info]	PS51358
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-JUN-2012 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51358
Associated ProRule [info]	PRU00690

Name and characterization of the entry

Description [info]

Nop domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=119;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=114;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6107154; R2=0.0177536; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6842.3481445; R2=11.6284542; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=445; H_SCORE=12017; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=276; H_SCORE=10052; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-75; I=-75; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='I';  M= -8,-22,-22,-27,-18,  0,-30,-18, 19,-18, 10,  9,-17,-22,-14,-15,-14, -6, 15,-19, -1,-18;
/M: SY='A';  M= 31,-15, -8,-23,-14,-10, -9,-20, -4,-14, -3, -4,-14,-13,-14,-20,  2, -1,  5,-20,-14,-14;
/M: SY='P';  M= -8,-18,-37,-10, -1,-28,-20,-20,-19, -8,-28,-18,-18, 76, -9,-16, -8, -7,-26,-29,-28,-10;
/M: SY='N';  M= -9, 30,-21, 15,  2,-20, -3,  7,-20,  1,-28,-19, 46,-16,  1,  2, 10,  1,-27,-36,-17,  1;
/M: SY='L';  M= -6,-26,-15,-28,-21,  6,-27,-20, 17,-25, 32, 15,-25,-27,-20,-19,-21, -5, 14,-22, -3,-20;
/M: SY='T';  M=  2, -2,  3, -8, -8,-15,-14,-13,-14,-12,-17,-12,  2,-16, -8,-13, 16, 17, -6,-34,-14, -8;
/M: SY='A';  M= 19, -6,-16,-11, -4,-15, -9,-14,-10, -8, -9, -9, -4,-14, -6,-12,  4, -1, -5,-20,-13, -5;
/M: SY='L';  M=-10,-26,-21,-29,-21,  7,-30,-20, 23,-27, 37, 20,-25,-27,-19,-20,-25, -9, 14,-21, -1,-21;
/M: SY='V';  M= -3,-27,-15,-30,-25,  1,-27,-25, 24,-23, 20, 13,-25,-26,-22,-21,-15, -3, 27,-25, -6,-24;
/M: SY='G';  M= -2, -6,-29, -6,-17,-29, 59,-17,-37,-17,-29,-19,  1,-20,-18,-17,  0,-18,-28,-22,-28,-17;
/M: SY='E';  M=  1, -2,-20, -1,  8,-21,-11, -8,-19, -6,-20,-15, -2,  6, -2,-11,  8,  3,-16,-29,-16,  2;
/M:         M= -2, -9,-18, -9, -6,-15,-13,-13, -7, -9, -6, -5, -8,-12, -9, -9, -1, -1, -3,-28,-14, -8;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='V';  M= -5,-25,-15,-28,-24,  1,-28,-24, 20,-23, 18, 10,-23,-26,-22,-20,-15, -1, 22,-20, -4,-24;
/M: SY='A';  M= 23, -7,-16,-14,-11,-19,  8,-18,-16,-11,-13,-11, -5,-13,-10,-16,  8,  4, -8,-23,-19,-10;
/M: SY='A';  M= 30, -7,-12,-13, -7,-19, -4,-14,-14,-10,-14,-11, -6, -6, -8,-16, 10,  1, -5,-24,-18, -8;
/M: SY='R';  M=-12, -2,-28, -2,  7,-25,-17, -3,-25, 24,-21, -8,  1,-14, 13, 31, -6, -9,-20,-23,-11,  8;
/M: SY='L';  M=-10,-26,-21,-27,-18,  7,-29,-18, 18,-26, 40, 19,-26,-27,-18,-19,-26, -8, 10,-20,  0,-18;
/M: SY='I';  M= -7,-27,-21,-32,-24,  3,-32,-22, 29,-24, 22, 18,-22,-23,-19,-22,-19, -7, 21,-21, -1,-24;
/M: SY='A';  M= 12, -7,-16,-10, -8,-18,  3,-16,-14,-12,-17,-12, -1,-12, -9,-15, 12,  4, -7,-27,-17, -9;
/M: SY='H';  M= -7, -8,-23, -9, -2,-15,-18, 12,-12, -3, -9, -2, -3,-18,  4,  2, -4, -5,-10,-24, -2, -1;
/M: SY='A';  M= 31, -8,-11,-15,-10,-17, -5,-15,-10,-11,-11, -9, -8,-10, -9,-17,  8,  4, -1,-23,-17,-10;
/M: SY='G';  M= -2, -6,-29, -5,-16,-28, 55,-14,-37,-16,-29,-19,  2,-17,-16,-17,  0,-17,-29,-21,-25,-16;
/I:         I=-18; MD=-25;
/M: SY='G';  M=  2, -4,-17, -5, -8,-24, 30,-14,-30,-14,-28,-20,  4,-16,-10,-15, 14, -3,-21,-25,-23, -9; D=-18;
/I:         I=-18; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='L';  M= -7,-27,-18,-28,-20,  6,-28,-20, 18,-23, 34, 16,-26,-27,-19,-17,-22, -7, 14,-21, -2,-19; D=-18;
/I:         I=-18; DM=-25;
/M: SY='T';  M= -3, -5,-21, -7, -1,-13,-15, -6,-13,  0,-10, -7, -3,-16, -3,  0,  1,  2, -9,-23, -6, -3;
/M: SY='N';  M= -1,  2,-23, -2,  3,-21,-10, -2,-19,  3,-18,-11,  8,-12,  5,  4,  1, -5,-18,-23,-14,  3;
/M: SY='L';  M= -8,-28,-19,-28,-19,  9,-28,-20, 16,-27, 42, 16,-27,-28,-19,-18,-26, -8,  8,-20,  0,-19;
/M: SY='A';  M= 25, -8, -6,-14, -9,-16, -6,-17,-12,-11,-14,-11, -5,-13, -9,-16, 14,  6, -2,-26,-16, -9;
/M: SY='K';  M= -8, -3,-27, -4,  4,-24,-16, -7,-22, 24,-21, -8,  0,-11,  8, 19, -5, -5,-16,-22,-10,  5;
/M: SY='M';  M= -8,-19,-18,-25,-17,  1,-25, -8, 13,-15, 14, 23,-17,-22, -8,-13,-15, -4,  6,-17,  5,-14;
/M: SY='P';  M= -6,-16,-34, -9, -1,-26,-17,-14,-18,-10,-27,-17,-14, 62, -7,-18, -4, -6,-24,-28,-22, -8;
/M: SY='A';  M= 24, -2,-13, -6, -5,-21,  1,-15,-16,-10,-20,-15,  1, -9, -6,-15, 20,  7, -7,-30,-20, -6;
/M: SY='C';  M=  0, -7, 26,-10,-11,-20,-11,-17,-21,-16,-20,-16, -3,-21, -9,-16, 13,  6,-10,-39,-21,-10;
/M: SY='N';  M= -4, 13,-18,  3, -3,-17,-10, -5,-14, -4,-18,-13, 20,-15, -3, -3, 10, 13,-13,-33,-15, -3;
/M: SY='I';  M= -7,-29,-22,-33,-26,  3,-32,-26, 31,-26, 23, 16,-25,-23,-22,-23,-19, -7, 25,-20, -3,-25;
/M: SY='Q';  M= -5, -7,-26, -8,  6,-27,-18, -1,-12,  1,-11,  3, -6, -5, 27,  1, -4, -8,-17,-22,-12, 16;
/M: SY='I';  M= -4,-19,-19,-23,-18, -6,-22,-17, 12,-17,  6,  7,-15,-19,-14,-16, -7, -3, 11,-23, -7,-17;
/M: SY='L';  M= -8,-26,-20,-29,-21, 11,-28,-18, 17,-25, 32, 17,-24,-25,-19,-19,-23, -9, 10,-17,  3,-20;
/M: SY='G';  M=  0,-11,-27,-11,-19,-28, 60,-20,-37,-18,-28,-19, -2,-20,-19,-19, -1,-19,-27,-18,-27,-19;
/M: SY='A';  M= 20, -6,-16,-11, -3,-18, -8,-13,-14, -3,-16,-11, -2, -9, -1, -7, 10,  2, -8,-24,-15, -2;
/I:         I=-3; MD=-4;
/M: SY='E';  M= -9,  6,-27, 10, 26,-26,-16, -3,-24, 12,-21,-13,  3, -6, 13,  4, -1, -7,-23,-26,-15, 19; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-4;
/M: SY='K';  M= -8,  1,-27,  2, 10,-26,-17, -7,-27, 35,-25,-11,  1, -9,  8, 27, -7, -8,-19,-20,-11,  9; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-4;
/M: SY='A';  M=  9, -5,-19, -8, -2,-18, -8, -9,-15,  4,-15, -7, -3,-10, -1, -1,  2, -2, -9,-22,-12, -2; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-4;
/M: SY='L';  M= -4, -8,-17,-10, -8, -5,-19,-12,  0,-14,  8,  1, -8,-17, -8,-12, -4,  5, -1,-23, -6, -8; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-4;
/M: SY='F';  M= -8,-17,-17,-21,-17, 23,-20,-14,  1,-19, 10,  2,-13,-22,-19,-12,-10, -4,  1,-12,  5,-17; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-4;
/M: SY='R';  M=  1, -7,-18, -9, -3,-14,-12, -4,-13,  1,-12, -6, -3,-12,  0,  6,  4,  1, -8,-22, -9, -3; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-4;
/M: SY='G';  M=  6, -7,-20,-10, -9,-16, 12, -1,-19,-10,-16,-10, -2,-15, -8,-12,  1, -8,-14,-15, -9, -9; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-4;
/M: SY='F';  M= -9,-18,-18,-21,-16, 13,-17,-11,  3,-17, 12,  6,-14,-21,-15,-10,-12, -6,  1,-12,  5,-16; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-4;
/M: SY='S';  M=  0, -2,-15, -3, -1,-17, -2, -6,-19,  2,-18,-11,  3,-12, -1,  1,  8,  1,-12,-24,-13, -1; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4;
/M: SY='T';  M= -2, -3,-15, -5, -3,-11, -9, -8,-13, -2,-13, -8, -1,-12, -4, -5,  5,  6, -7,-18, -8, -4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-4;
/M: SY='R';  M= -2, -3,-19, -6, -3,-14, -9, -9,-15,  4,-12, -8,  0,-14, -3,  8,  0,  1,-10,-22,-11, -4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-4;
/M: SY='S';  M=  6, -3,-17, -6, -4,-19,  0, -8,-16, -4,-17,-10,  1, -9, -1, -4,  8,  3,-11,-24,-15, -3; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-4;
/M: SY='N';  M= -1, -3,-20, -7, -6,-17, -4, -8,-14, -1,-14, -7,  1,-10, -4, -3,  0, -2,-11,-24,-13, -6; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-4;
/M: SY='T';  M= -2, -8,-20,-12, -8,-14,-14,-15, -6,-10, -8, -4, -5, -8, -6,-11,  2,  9, -4,-24,-12, -7;
/M: SY='P';  M=-10,-14,-30,-10, -4,-16,-19,-14,-16, -5,-18,-12,-11, 32, -8, -3, -7, -5,-19,-25,-16, -9;
/M: SY='K';  M= -9, -3,-26, -4,  1,-24,-15, 11,-22, 13,-21, -7,  1,-10,  7,  8, -5, -9,-18,-24, -5,  3;
/M: SY='Y';  M= -9,-11,-24,-13, -9, -2,-19, 10,-10, -9, -8, -3, -8,-16, -3, -5, -6, -1,-10,-12, 14, -8;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-28,-11,-17,-26, 48,-17,-32,-17,-25,-16, -2,-15,-16,-17,  0,-15,-24,-20,-24,-17;
/M: SY='F';  M=-12,-22,-23,-25,-20, 17,-29, -9, 12,-21, 17,  8,-18,-26,-18,-17,-19, -9,  7,-10, 15,-20;
/M: SY='I';  M= -9,-28,-24,-34,-25,  5,-34,-24, 33,-28, 29, 17,-22,-25,-20,-24,-22, -9, 21,-20,  0,-25;
/M: SY='Y';  M=-15,-19,-22,-22,-17, 32,-24, -4, -4,-16, -1, -3,-15,-26,-19,-14,-13, -7, -5,  7, 33,-18;
/M: SY='H';  M= -9,  2,-25, -2,  2,-15,-15, 19,-18, -1,-16, -5,  7,-17, 13,  0, -3, -7,-21,-19,  4,  6;
/M: SY='S';  M=  1, -5,  0, -9, -8,-16,-12,  1,-19,-11,-20,-13,  1,-15, -6, -9, 12,  6,-12,-29,-10, -8;
/M: SY='D';  M=-10, 15,-27, 24, 15,-31,-10, -4,-29,  1,-27,-21,  6,  4,  5, -6,  5, -3,-25,-33,-19,  9;
/M: SY='L';  M= -9,-25,-19,-29,-21, 12,-26,-18, 13,-22, 18, 10,-21,-25,-18,-18,-17, -7,  9,-13,  6,-20;
/M: SY='V';  M= -2,-25,-17,-29,-24,  0,-29,-26, 26,-20, 11,  9,-21,-25,-22,-20,-12, -3, 31,-25, -6,-24;
/M: SY='Q';  M= -5, -4,-25, -5,  3,-26, -8,  0,-19,  3,-18, -6,  1,-12, 17,  7,  2, -5,-19,-25,-13,  9;
/M: SY='K';  M= -3,  1,-24,  0,  1,-22, -4, -7,-23,  5,-21,-13,  5,-12,  2,  4,  3, -3,-19,-24,-14,  1;
/M: SY='A';  M= 12,-10,-11,-16,-10,-13,-16,-15, -4,-11, -4, -4,-10,-16, -8,-13,  3,  7,  2,-25,-12, -9;
/I:         I=-12; MD=-17;
/M: SY='P';  M= -1,-12,-28, -8,  0,-22,-16,-14,-16, -6,-22,-14,-11, 37, -5,-12,  0, -2,-19,-27,-20, -5; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='P';  M= -4, -6,-27, -3,  0,-23,-14,-13,-17, -3,-21,-14, -5, 21, -4, -7,  0, -3,-17,-27,-19, -4;
/M: SY='K';  M= -6,  0,-22,  2,  6,-23,-16, -5,-24,  8,-22,-13, -2, -9,  6,  6,  0, -4,-19,-17, -9,  5;
/M: SY='L';  M= -8,-11,-21,-16,-14,  2,-21, -8,  5,-16,  8,  4, -6,-23,-13,-13,-12, -6,  2,-21, -1,-14;
/M: SY='R';  M=-12, -6,-29, -7,  4,-24,-20,  0,-24, 27,-20, -6, -2,-13, 13, 37, -9,-10,-18,-21, -9,  6;
/M: SY='G';  M= -7, -5,-28, -5, -5,-24, 14,-12,-27,  5,-22,-11,  0,-15, -4,  5, -4,-10,-20,-22,-17, -5;
/M: SY='K';  M=-12, -4,-26, -4,  6,-26,-18, -2,-27, 30,-25, -8, -1,-14, 15, 29, -7, -9,-20,-21, -9, 10;
/M: SY='A';  M= 14,-18,-15,-25,-16, -7,-15,-20,  9,-17,  3,  6,-15,-17,-14,-20, -5, -4,  9,-21,-10,-16;
/M: SY='A';  M= 11,-14,-10,-19,-13,-11,-13,-14, -1,-15,  0,  2,-11,-18, -9,-16,  1,  0,  2,-26,-12,-11;
/M: SY='R';  M=-15, -9,-28, -9,  1,-20,-20, -2,-26, 25,-18, -9, -2,-18, 10, 52, -8, -9,-18,-20,-10,  2;
/M: SY='M';  M= -4,-18,-20,-24,-18,  1,-22, -7, 10,-16, 10, 15,-15,-22,-11,-15,-13, -5,  7,-17,  5,-16;
/I:         I=-17; MD=-23;
/M: SY='L';  M= -8,-26,-19,-28,-22,  8,-29,-21, 22,-25, 31, 16,-25,-26,-20,-20,-21, -6, 18,-19,  1,-22; D=-17;
/I:         I=-17; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='A';  M= 30,-10,  3,-17,-11,-19, -3,-19,-13,-13,-13,-12, -8,-12,-11,-19, 10,  2, -3,-27,-20,-11; D=-17;
/I:         I=-17; DM=-23;
/M: SY='A';  M=  9,  3,-10, -3, -7,-21,  6,-11,-21, -8,-20,-15,  9,-15, -8,-10,  7, -1,-15,-29,-20, -8; D=-17;
/I:         I=-17; DM=-23;
/M: SY='K';  M= -9,  2,-26,  2,  9,-29,-19, -9,-29, 39,-28,-11,  1,-11, 10, 24, -7, -7,-20,-22,-10,  9;
/M: SY='V';  M=  0,-20,  9,-24,-20, -8,-24,-18,  5,-20,  4,  1,-17,-25,-17,-19, -7, -3, 11,-30,-12,-19;
/M: SY='A';  M= 18, -8,-12,-13, -8,-16, -8,-15, -8,-11,-11, -9, -4,-14, -8,-13, 14, 10,  0,-29,-16, -8;
/M: SY='L';  M=-10,-28,-22,-32,-22,  5,-31,-20, 27,-26, 36, 23,-26,-26,-17,-20,-25,-10, 16,-20, -1,-21;
/M: SY='A';  M= 31,-11,  0,-18,-11,-18, -6,-20,-10,-13, -9, -9,-11,-12,-12,-20,  5,  0,  0,-25,-20,-12;
/M: SY='A';  M= 28,-12, -4,-19,-12,-15, -8,-20, -7,-13, -9, -8,-10,-14,-12,-18,  7,  2,  1,-25,-17,-12;
/M: SY='R';  M=-18, -9,-27,-10,  0,-17,-19, -3,-28, 28,-20,-10, -1,-19,  7, 55,-10,-10,-19,-19, -8,  0;
/M: SY='V';  M=  1,-23,-18,-29,-22, -3,-27,-24, 23,-20, 11,  9,-20,-22,-18,-19, -9, -1, 24,-24, -6,-22;
/M: SY='D';  M=-19, 44,-30, 61, 19,-38,-11,  0,-36,  1,-29,-27, 19,-10,  2, -8,  0,-10,-29,-38,-19, 10;
/M: SY='C';  M=  3,-15,  5,-20,-16, -3,-19,-10, -6,-16, -3, -5,-13,-24,-14,-16, -5, -4, -1,-21,  0,-16;
/I:         I=-15; MD=-21;
/M: SY='F';  M=-10,-19,-15,-24,-18, 25,-21,-11, -5,-17,  1, -2,-13,-22,-19,-12,-10, -5, -4, -8, 12,-18; D=-15;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='R';  M= -6,  0,-23,  0,  2,-24, -3,  2,-25,  4,-23,-13,  5,-15,  4,  8,  5, -4,-19,-28,-13,  1;
/M: SY='E';  M= -4,  4,-21,  5,  8,-23, -4, -7,-22, -2,-20,-14,  4,-11,  2, -6,  3, -3,-19,-28,-16,  5;
/M: SY='S';  M= -2,  0,-18, -1, -2,-16, -8, -7,-16, -5,-17,-12,  2,-15, -5, -5,  8,  2,-10,-28,-12, -4;
/M: SY='P';  M= -7, -8,-27, -7, -3,-16,-14,-11,-15, -3,-17,-11, -5, 10, -6, -5, -4, -4,-14,-24,-13, -6;
/M: SY='D';  M=-10, 19,-23, 23,  8,-26, -9, -2,-25, -2,-23,-18, 12,-10, -1, -7,  4, -1,-21,-31,-15,  3;
/M: SY='G';  M= -1, -5,-22, -6, -9,-19, 17,-14,-22,-11,-18,-12,  0,-16, -9,-12,  1, -8,-17,-24,-18, -9;
/M: SY='E';  M= -1,  1,-22,  1,  8,-20,-13, -5,-16, -2,-17,-12,  1,-12,  0, -5,  5, -1,-11,-26,-12,  4;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='F';  M= -6,-15,-17,-18,-10, 11,-20,-10,  1,-12,  5,  2,-13,-17,-11,-11,-10, -4,  0, -8,  9,-11; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-9;
/M: SY='G';  M=  1, -8,-23, -9,-15,-22, 46,-16,-28,-15,-21,-15, -1,-16,-15,-15,  1,-12,-21,-18,-22,-15; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-9;
/M: SY='E';  M= -3, -7,-18, -7,  3,-12,-16, -4, -9,  1, -6, -4, -6,-13, -1,  1, -5, -5, -7,-19, -5,  0; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-9;
/M: SY='K';  M= -2,  0,-23, -1,  7,-22, -9, -6,-20, 13,-19,-10,  2,-11,  6,  9,  0, -5,-16,-22,-12,  6; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-9;
/M: SY='L';  M=-12,-19,-22,-21,-13,  8,-24, -9,  0,-16,  9,  4,-16,-23,-12,-12,-17,-10, -5, -2,  7,-13;
/M: SY='R';  M=-12, -9,-22,-10, -2,-17,-17, -4,-20, 14,-12, -6, -5,-18,  3, 24, -9, -8,-14,-21, -6, -2;
/M: SY='E';  M= -4,  3,-25,  7, 17,-22,-16, -5,-19,  1,-15,-12, -2, -8,  6, -3, -1, -6,-16,-26,-13, 11;
/M: SY='E';  M=-10,  2,-24,  6, 16,-19,-20, -4,-18,  4,-12, -9, -2,-11,  9,  0, -5, -8,-18,-24,-10, 12;
/M: SY='I';  M= -6,-25,-17,-29,-22, -1,-28,-24, 25,-24, 17, 13,-22,-24,-20,-22,-16, -7, 22,-24, -6,-23;
/M: SY='E';  M= -8, -1,-19,  1, 13,-20,-21, -8,-15,  1,-10, -8, -5,-12,  5, -2, -5, -5,-13,-27,-12,  8;
/M: SY='K';  M= -3, -2,-24, -2,  8,-23,-15, -6,-19, 11,-17, -8, -2,-11,  7,  9, -2, -5,-14,-24,-13,  7;
/M: SY='R';  M= -9, -4,-28, -4,  3,-24,-14, -7,-24, 22,-20, -8, -1,-13,  5, 26, -6, -8,-17,-22,-12,  2;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-23,-32,-23, 17,-30,-18, 19,-25, 23, 14,-23,-25,-21,-20,-21, -8, 12,-10,  8,-22;
/M: SY='E';  M= -7,  6,-20,  8, 14,-23,-13, -3,-23,  4,-20,-14,  4, -9,  4,  2,  0, -6,-20,-28,-14,  8;
/M: SY='K';  M= -6, -2,-25, -1,  8,-19,-16, -9,-22, 17,-21,-11, -2,-11,  5,  9, -2, -3,-16,-22,-10,  6;
/M: SY='L';  M= -6,-24,-24,-27,-18,  3,-25,-18,  8,-18, 16,  8,-22,-24,-14,-13,-19, -8,  2,  1,  4,-16;
/M: SY='Q';  M= -5, -3,-23, -3, 11,-21,-19, -5,-12, -1, -6, -3, -4,-12, 12, -1, -5, -7,-14,-25,-12, 11;
/M: SY='E';  M= -4,  6,-25,  9, 24,-24,-13, -6,-24,  6,-19,-15,  2, -8,  9, -1,  2, -3,-20,-27,-15, 16;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.

Total number of hits	54 in 54 different sequences
Number of true positive hits	54 in 54 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Archaea, Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Nop
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

54 sequences

NOP56_BOVIN (Q3SZ63), NOP56_CAEEL (Q21276), NOP56_DICDI (Q54MT2),

NOP56_HUMAN (O00567), NOP56_MACFA (Q95K50), NOP56_MOUSE (Q9D6Z1), 
NOP56_PONAB (Q5RA29), NOP56_SCHPO (O94514), NOP56_YEAST (Q12460), 
NOP58_AJECN (A6QYH8), NOP58_ASPCL (A1CL70), NOP58_ASPFU (Q4WYK9), 
NOP58_ASPNC (A2QE38), NOP58_ASPOR (Q2UC04), NOP58_ASPTN (Q0CQH1), 
NOP58_BOTFB (A6RMY5), NOP58_CANAL (Q59S06), NOP58_CANGA (Q6FQ21), 
NOP58_COCIM (Q1E1Q5), NOP58_CRYNB (P0CP27), NOP58_CRYNJ (P0CP26), 
NOP58_DEBHA (Q6BIX6), NOP58_DICDI (Q55FI4), NOP58_EMENI (Q5B8G3), 
NOP58_EREGS (Q753I4), NOP58_HUMAN (Q9Y2X3), NOP58_KLULA (Q6CKR8), 
NOP58_LODEL (A5E4V9), NOP58_MACFA (Q4R779), NOP58_MOUSE (Q6DFW4), 
NOP58_NEOFI (A1D688), NOP58_NEUCR (Q8X066), NOP58_PICGU (A5DHW0), 
NOP58_PICST (A3LUT0), NOP58_RAT   (Q9QZ86), NOP58_SCHPO (Q9P7S7), 
NOP58_SCLS1 (A7F2R6), NOP58_USTMA (Q4PBF2), NOP58_VANPO (A7TIF5), 
NOP58_YARLI (Q6CG46), NOP58_YEAS7 (A6ZPE5), NOP58_YEAST (Q12499), 
NOP5A_ARATH (O04658), NOP5B_ARATH (Q9MAB3), NOP5C_ARATH (O04656), 
PRP31_ARATH (Q8RXN6), PRP31_DANRE (Q7SXM7), PRP31_HUMAN (Q8WWY3), 
PRP31_MOUSE (Q8CCF0), PRP31_SCHPO (O42904), PRP31_XENLA (Q5U5C5), 
PRP31_XENTR (Q6NVP6), PRP31_YEAST (P49704), Y694_METJA  (Q58105)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

45 PDB

2OZB; 3JCM; 3JCR; 3SIU; 3SIV; 5GAN; 5GAP; 5NRL; 5O9Z; 5WLC; 5WYJ; 5WYK; 5ZWM; 5ZWO; 6AH0; 6AHD; 6KE6; 6LQP; 6LQQ; 6LQR; 6LQS; 6LQT; 6LQU; 6LQV; 6ND4; 6QW6; 6QX9; 6ZQA; 6ZQB; 6ZQC; 6ZQD; 6ZQE; 7AJT; 7AJU; 7D4I; 7D5S; 7D5T; 7D63; 7MQ8; 7MQ9; 7MQA; 7SUK; 8Q7N; 8QO9; 8Y6O
» more