PROSITE entry PS51362
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | TGF_BETA_2 |
Accession [info] | PS51362 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-JAN-2008 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC00223 |
Associated ProRule [info] | PRU00696 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | TGF-beta family profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=120; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=115; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3468330; R2=0.0066716; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=983; N_SCORE=8.9; MODE=1; TEXT='R'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=623; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='R?'; /DEFAULT: M0=-21; D=-100; I=-100; B1=-300; E1=-300; MI=-155; MD=-155; IM=-155; DM=-155; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=0; BI=-155; BD=-155; /M: SY='R'; M=-17,-60,-44,-21,-29,-18,-11,-30, 7,-36,-42,-23,-54,-16, 96,-40,-44,-26,-56,-42; /M: SY='R'; M=-19,-56,-33,-10,-53, 8, 15,-33, 34,-28,-35,-21, 7, 1, 59, 10, -6,-10,-38,-44; /M: SY='R'; M=-36,-58,-29, -3,-55,-43,-25,-48, 58,-24,-29,-19,-20, 0, 74,-28, -3,-37,-56,-44; /M: SY='R'; M=-28,-62,-37,-33,-54,-52, -2,-36, 13,-39,-42,-18,-28,-23, 99,-37,-40,-40, 2,-42; /I: I=-17; MD=-26; /M: SY='S'; M= 26,-59, 0,-20,-66,-12,-12,-62,-22,-56,-42, 16,-47, 34,-44, 37,-13,-53, 4,-55; D=-17; /I: I=-17; MD=-26; /M: SY='R'; M= 12,-69,-61,-56,-57,-62, 3,-57,-18,-23,-43,-12, 0,-33, 28,-15, 3,-29, 4,-25; D=-17; /I: I=-17; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26; /M: SY='P'; M=-15,-74, -6,-26,-74,-16,-37,-50,-26,-71,-44, -1, 22,-26, 5,-23, 5,-25,-81,-41; D=-17; /I: I=-17; DM=-26; /M: SY='G'; M= 6,-56, -7,-11,-37, 36,-27,-34,-16,-48,-20, 11,-12,-11, 20, 8, 24,-45,-62,-29; D=-17; /I: I=-17; DM=-26; /M: SY='P'; M=-12,-30, 25, -5,-26,-20,-19,-17, -3, 7, 4, 3, 30, 2, 13,-11,-23,-24,-62,-35; D=-17; /I: I=-17; DM=-26; /M: SY='D'; M=-30,-20, 25, 16,-14,-42, 24,-38, -6,-46, -9, 21, -1,-16, 14, 16, -8,-10,-60, 17; D=-17; /I: I=-17; DM=-26; /M: SY='C'; M=-23, 99,-18,-29,-28,-19, 13,-38, 0,-16,-21, -7,-18,-22, 17, 1,-35,-33,-68,-32; D=-17; /I: I=-17; DM=-26; /M: SY='D'; M=-35,-70, 32,-14,-12,-13,-33,-39,-11,-58,-31,-17, -1, -1, -4, 1,-29,-15,-38,-21; D=-17; /I: I=-17; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26; /M: SY='P'; M=-16,-62,-24, 16,-59, 2, 15,-54, 4,-35,-51, 6, 32,-16, 30, 17,-19,-51,-63,-13; D=-17; /I: I=-17; DM=-26; /M: SY='G'; M= 10,-53, 8, 0,-32, 27,-19,-37, 7,-23,-10, 26, 3, -7, 11, 23,-17,-12,-59,-47; /M: SY='R'; M= -8,-17, -8, -2,-52, 18, 8,-35, 27, -2,-40, 18, 2, 21, 31, -7,-10,-29,-58,-32; /M: SY='H'; M=-17,-55, 6, 25,-56, 3, 33,-29, 31,-44,-13, 18, 7, 12, 5, 23, 1,-33,-61,-45; /M: SY='N'; M=-22,-55, -4, 11,-57, 17, 14,-56, 18,-47,-20, 42, 19, 11, 28, 5, 21,-50,-36,-44; /M: SY='R'; M=-26,-55, 4,-18,-41, 11,-17,-11, -4, 7,-23, 14, 25, 16, 34, 10, 2,-21,-58,-25; /M: SY='C'; M=-41,148,-61,-62,-52,-57,-61,-59,-57,-49,-49,-48,-72,-65,-64,-44,-42,-46,-82,-62; /M: SY='C'; M=-18, 99,-27,-17,-54,-27, 28,-54, 6,-35,-44,-33,-56, 27, 49, 7,-39,-23,-65,-47; /I: I=-32; MD=-49; /M: SY='R'; M=-43,-58,-51,-40,-42,-61,-20,-12, 26, 36,-16,-45,-46,-32, 74,-47,-37, -7,-56,-41; D=-32; /I: I=-32; MI=-49; IM=-49; DM=-49; /M: SY='H'; M=-33,-58,-40, -4,-32,-53, 63,-45, 30,-26,-37,-26,-51, 29, 47,-28, 4, -2, 35, 37; /M: SY='P'; M= -3,-57, 26, 33,-60,-36, 5,-46, 6,-47,-48, -7, 50, 27, -6, 34,-12,-46,-62,-49; /I: I=-32; MI=0; MD=-49; IM=0; DM=-49; /M: SY='L'; M=-46,-50,-61,-54, 41,-43,-31, -6,-52, 64, 37,-56,-61,-25,-21,-31, -9,-11,-46,-11; /M: SY='Y'; M=-44,-55,-18, -4, 25,-53, 43, -9,-25,-33,-35, -1,-17, -5,-18, -7, 30, -9, 17, 77; /M: SY='V'; M=-37,-50,-62,-37,-32,-66,-61, 46,-54, 14, -6,-58,-58,-35,-37,-49,-34, 76,-62,-40; /M: SY='D'; M=-15,-53, 77,-16,-59,-34,-35,-30,-35,-58,-53, 49,-14,-33,-34, 44,-11,-37,-73,-50; /I: I=-32; MD=-49; /M: SY='F'; M=-51,-51,-66,-62,104,-62,-50,-25,-58, 0,-30,-56,-65,-65,-56,-15,-33, 12,-28, -6; D=-32; /I: I=-32; MI=-49; IM=-49; DM=-49; /M: SY='R'; M= -6,-56, -3, 35,-31,-34, -5,-53, 37,-27,-43,-13,-46, 27, 48, 10, -2,-34,-57,-38; /I: I=-24; MI=0; MD=-37; IM=0; DM=-37; /M: SY='D'; M=-18,-62, 72, 55,-63,-51, 1,-28, 0,-37,-52,-29,-46, 21,-31,-27,-24,-49,-69,-51; D=-24; /I: I=-24; DM=-37; /M: SY='L'; M=-39,-55,-66,-48, 12,-68,-57, 44,-37, 51, 20,-61,-62,-55,-58,-56,-28, 22, 7,-35; D=-24; /I: I=-24; DM=-37; /M: SY='G'; M=-30,-60,-32,-26,-35, 87,-47,-71,-26,-67,-57,-16,-51,-13,-49,-28,-50,-66,-57,-58; D=-24; /I: I=-24; DM=-37; /M: SY='W'; M=-57,-77,-81,-62,-10,-50,-76,-48,-54, 5,-29,-74,-63,-54,-23,-52,-65,-59,160,-14; D=-24; /I: I=-24; DM=-37; /M: SY='D'; M=-32,-76, 37,-24,-81,-15, 28,-81,-38,-80,-58, 25,-69, 8,-49, 9,-55,-78,-90,-66; D=-24; /I: I=-24; MI=0; MD=-37; IM=0; DM=-37; /M: SY='D'; M=-48,-63, 66, 0,-66,-33, 38,-67, 22,-65,-57, 32,-53, -1, 0, 7,-28,-64,-76,-51; D=-24; /I: I=-24; DM=-37; /M: SY='W'; M=-51,-71,-72,-60, 24, 15,-50,-32,-52,-26,-48,-63,-59,-52,-48,-37,-60,-58,156, 12; /M: SY='I'; M=-44,-56,-64,-61,-14,-68,-55, 81,-57, 4, -9,-57,-57,-54,-58,-52,-38, 36,-46, 40; /M: SY='I'; M=-18,-54,-32, -9,-32,-63, 23, 65,-51, 25,-20,-52,-55,-24,-42,-48,-38, 40,-57,-14; /M: SY='A'; M= 60,-48,-39, 22,-35,-25, 14,-26,-19,-48,-42,-37,-14, -2,-41, 27, 0,-33,-53, 13; /M: SY='P'; M=-46,-70,-11, -8,-66,-48,-48,-55, -7,-64,-51,-49,115,-32,-49,-27,-39,-59,-60,-61; /M: SY='K'; M=-16,-57, -9, 40,-57,-48, 16,-54, 52,-32,-19,-17, 32, 10, 17, 11, -6,-43,-59,-46; /M: SY='G'; M=-24,-54,-18, 10,-37, 59, -9,-41, 10,-33,-26,-14,-47,-11, 20, -2, 22,-29,-57,-48; /M: SY='Y'; M=-12,-56,-56,-55, 52,-58,-28,-19,-50, 1,-28,-54,-63,-47,-47,-47,-44, 5,-17,104; /M: SY='N'; M=-23,-54, 24, 13,-12,-28, 25, 10,-10,-16, 8, 58,-49, 36,-22,-11, 0,-38,-60,-14; /M: SY='A'; M= 73,-46,-52,-45, 32,-24,-51, 6,-47,-16,-21,-46, 2,-45,-50,-26,-22,-21,-50,-38; /M: SY='Y'; M=-46,-55,-35,-42, 25,-18, 13,-47,-32,-45,-40, 69,-57, -3, 29,-15,-25,-50, -9, 77; /M: SY='Y'; M=-50,-59,-45,-17, 44,-55, 26,-39,-38,-32, 21, 17,-59,-16, 15,-44,-44,-43,-21, 99; /M: SY='C'; M=-41,148,-61,-62,-52,-57,-61,-59,-57,-49,-49,-48,-72,-65,-64,-44,-42,-46,-82,-62; /M: SY='H'; M= 7,-54, -8, 31,-43,-27, 57,-23, 15,-39,-10,-21,-46, 33, 2, 34, -9,-21,-60,-29; /M: SY='G'; M=-29,-57,-45,-56,-63, 97,-51,-71,-50,-66,-56,-30,-48,-47,-57,-20,-48,-64,-54,-58; /M: SY='E'; M= 4,-53, 30, 44,-46, -5,-18,-36, -6,-39,-38, -5, 9, -7,-10, 33, 1, -8,-62,-49; /M: SY='C'; M=-41,148,-61,-62,-52,-57,-61,-59,-57,-49,-49,-48,-72,-65,-64,-44,-42,-46,-82,-62; /M: SY='P'; M= 6,-58, 11, -2,-38,-15, -7,-46,-34,-43,-26,-12, 83,-19, -4, 17, 0,-36,-58,-11; /M: SY='F'; M= 2,-54,-40,-25, 66,-22, 15,-22,-29, -9,-18,-24,-15, -9, 2, 8,-22,-21, 23, 47; /M: SY='P'; M= 3,-60,-27,-18,-52,-28, 29,-14,-32,-23, -9,-18, 90,-22,-22, -3,-33, -4,-59,-18; /M: SY='W'; M=-11,-53,-36, 2, 9,-58, 24, 7,-45, 47, 24,-40,-30,-12, -3,-37,-30, 3, 52, -6; /M: SY='N'; M= 15,-51, -4,-37,-51, 1, 13,-27,-26,-11,-35, 42,-11, -1, 31, 23, 27,-33,-62,-46; /M: SY='N'; M= -4,-53, 28, 20,-37, -5, 4,-28, -9,-34, 27, 38, 14, 15,-24, 9, 16,-36,-61,-19; /I: I=-13; MD=-21; /M: SY='H'; M= -5,-40,-29,-25,-35,-16, 63,-34, -9,-38, 17, -1, -9,-13, -5, -8, -5,-16,-61, 26; D=-13; /I: I=-13; MD=-21; /M: SY='M'; M=-33,-69, 13,-59, 9,-37,-55,-43,-63, 17, 31,-22,-13,-39,-65,-37,-20,-31,-61, 24; D=-13; /I: I=-13; MD=-21; /M: SY='N'; M=-52,-77,-33,-34,-82,-12,-15,-82, 7,-70,-72, 59,-57,-34,-19,-38,-24,-80,-91,-74; D=-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='P'; M= 25,-67, -1,-19,-53,-11,-18,-65,-55,-40,-60,-44, 34,-38,-44, 17,-18,-60,-72,-19; D=-13; /I: I=-13; DM=-21; /M: SY='T'; M=-33,-54,-44,-47,-55,-34,-20,-11,-28,-27,-15, 28, 1,-23,-51, 28, 66,-42,-72,-53; D=-13; /I: I=-13; DM=-21; /M: SY='N'; M=-36,-53,-30,-31, 5,-18, 23,-48, -8, -9, -6, 86, 10, -2,-40,-11, -2,-41,-65,-43; D=-13; /I: I=-13; DM=-21; /M: SY='H'; M=-50,-61,-38,-38,-33,-38,127,-58, -6,-11,-34,-12,-53,-32,-35,-29,-48,-59,-68, 24; D=-13; /I: I=-13; DM=-21; /M: SY='A'; M= 68,-45,-44,-42,-56,-27, -7,-48,-27,-40,-44, 4,-48,-39,-47, 27, 29,-38,-62,-51; D=-13; /I: I=-13; DM=-21; /M: SY='I'; M= -4,-56,-53,-41,-21,-19, 28, 48,-12, 5, 12,-24,-55, -2,-31,-16, 0, 9,-54, 19; D=-13; /I: I=-13; DM=-21; /M: SY='V'; M=-21,-51,-63,-58,-10,-63,-58, 48,-56, 27, 31,-57,-58,-54,-57,-20,-23, 57,-59,-38; D=-13; /I: I=-13; DM=-21; /M: SY='Q'; M=-20,-57,-46,-31,-37,-55,-11, -8, 10, 25, 12,-41,-53, 81, 12,-39,-15, 2,-55,-40; D=-13; /I: I=-13; DM=-21; /M: SY='N'; M= 4,-49,-28,-31,-54,-17,-13,-49, -7,-21,-45, 50,-26, 9,-18, 40, 49,-45,-66,-49; D=-13; /I: I=-13; DM=-21; /M: SY='L'; M=-36,-53,-53,-37,-35,-57,-14, -3, 12, 55, -4,-48,-57, 2, 10, 17,-15,-14,-57,-40; D=-13; /I: I=-13; DM=-21; /M: SY='V'; M=-18,-57,-59,-34,-22,-33, 3, 11,-20, 20, 31,-55,-61,-17, -6,-42,-32, 37,-53, 36; D=-13; /I: I=-13; DM=-21; /M: SY='H'; M=-41,-65,-41,-33,-41,-29, 71,-16, 29,-59,-50, 51,-17,-38, 10,-24,-46,-38,-73,-27; D=-13; /I: I=-13; DM=-21; /M: SY='H'; M=-11,-62,-51, 0,-43,-28, 26,-22,-22, 4, 26,-22,-59, 13,-10, 20, -4,-48, 5,-28; D=-13; /I: I=-13; DM=-21; /M: SY='M'; M=-29,-65,-42,-45, -9,-66, 18,-20,-21, 14, 35,-16,-67,-10,-14, -1,-35, 3,-66, -3; D=-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='N'; M=-21,-57, 25,-21,-46, -5, 13,-42, 0, -7,-37, 60,-55, 21, 6, -3,-34,-19,-67,-27; D=-13; /I: I=-13; DM=-21; /M: SY='P'; M=-19,-65, 13,-20,-62,-50,-48,-45, -2,-31,-48,-20, 89, -2, -5, -6,-10,-21,-64,-57; D=-13; /I: I=-13; DM=-21; /M: SY='G'; M=-11,-54, 14, 26,-13, 30, -4,-21, 6,-30,-29, 19,-47, 2, 3, 19, 1,-37,-24,-45; D=-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='A'; M= 20,-62,-35,-15,-62, -5,-42,-42, 8,-20,-52,-14,-24,-34, 13, 7, -3,-21,-69,-45; D=-13; /I: I=-13; DM=-21; /M: SY='V'; M= 3,-55,-50,-12,-40,-14, 7, 3,-48,-37,-33, -6,-23,-21,-28, 23, 7, 42,-69,-50; D=-13; /I: I=-13; DM=-21; /M: SY='P'; M= 10,-59,-38,-25,-56, 5, 5,-18,-26,-36,-15,-22, 83,-19, 25, 2,-24,-19,-59,-51; /M: SY='R'; M= 2,-55,-41,-19,-55, 6,-40,-38, 35,-29, -7,-10, 11, 31, 47, 12, 1,-16,-57,-46; /M: SY='P'; M= 22,-58,-45,-12,-56,-34,-47,-30,-42,-31,-23,-45, 94,-20,-50, 22, -9,-24,-58,-36; /M: SY='C'; M=-40,145,-59,-59,-52,-56,-60,-57,-39,-49,-49,-46,-70,-62,-61,-15,-30,-34,-80,-61; /I: I=-30; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47; /M: SY='C'; M=-41,146,-60,-60,-52,-56,-60,-58,-56,-49,-49,-47,-71,-63,-50,-30,-28,-46,-81,-62; /M: SY='V'; M= 23,-48,-54,-47,-26,-53, 1, 8,-42,-29,-29,-47,-54,-13, 15,-19, 9, 68,-61,-14; /I: I=-29; MI=0; MD=-45; IM=0; DM=-45; /M: SY='P'; M=-29,-71,-48,-36,-67,-48,-51,-55,-44,-65,-51,-47,119,-47,-56,-34,-39,-59,-60,-64; D=-29; /I: I=-29; DM=-45; /M: SY='T'; M=-15,-46,-13,-23,-43,-49,-46, -3,-17,-24,-36,-23,-45, 5,-44, 13, 79, 19,-60, 6; /M: SY='K'; M= 15,-54, 9, 36,-58,-46,-22,-48, 55,-54,-46,-13,-22, 2, 23, 7, 2,-25,-59,-48; /I: I=-32; MD=-49; /M: SY='Y'; M=-48,-54,-58,-35, 15,-62,-35,-22,-50, 52, 59,-56,-61,-45,-26,-51,-19,-29,-32, 77; D=-32; /I: I=-32; MI=-49; IM=-49; DM=-49; /M: SY='S'; M= 0,-51, 42, 16,-30,-22,-28,-19, -6,-39,-32, 17,-47,-31, 13, 50, 5,-32,-61,-14; /M: SY='P'; M= 5,-58, 35,-32,-60,-18,-44,-52,-26,-57, -8,-31, 88,-33,-48, 35,-12,-42,-62,-35; /M: SY='I'; M=-45,-53, 3,-24,-29,-63,-50, 55,-17, 48, 46,-52,-56,-29,-51,-51,-40, 11,-55,-24; /M: SY='S'; M= -9,-17,-28, -7,-27,-39,-40,-36,-11,-14,-42, 24, 16, -6,-14, 65, 17,-15,-60,-19; /M: SY='M'; M=-28,-50,-62,-56, 10,-59,-49, 39,-52, 28, 82,-53,-56,-48,-52, 1,-37, 36,-20,-32; /M: SY='L'; M=-45,-51,-63,-56, 24,-63,-49, 20,-53, 66, 27,-58,-61,-50,-20,-24,-24, 5, 4,-30; /M: SY='Y'; M=-48,-58, -1,-19, 25,-57, 23,-13,-34, 10, 1,-46,-59,-22,-34,-21,-20,-30,-23, 99; /M: SY='Y'; M=-47,-55, 25,-45, 48,-58, -5, 5,-19, 26, 13,-45,-58,-24,-18,-30,-13, -6, 10, 61; /M: SY='D'; M=-24,-55, 75, 25,-58,-34,-36,-25, -6,-43,-49, 39,-47, -1,-26, -1, 4, -3,-71,-49; /I: I=-19; MD=-30; /M: SY='D'; M= -9,-56, 44, 39,-46, 7, 17,-59, 4,-53,-39, 43,-47, -2, -6, 13,-22,-50,-64,-21; D=-19; /I: I=-19; MD=-30; /M: SY='N'; M=-19,-46, 34, 30,-22, 14, 13,-61, 1,-55,-34, 43,-50,-15, -1, 12,-23,-54,-63,-13; D=-19; /I: I=-19; MD=-30; /M: SY='G'; M=-32,-61, 30, 28,-59, 41, 1,-63, -4,-43,-27, 15,-50, 16, -5,-10,-15,-60, 1,-14; D=-19; /I: I=-19; MD=-30; /M: SY='N'; M=-57,-71,-22,-39,-73,-28,-42,-56, 3,-69,-53, 55,-68, 16,-10, -6, 3,-47,-81,-33; D=-19; /I: I=-19; MI=0; MD=-30; IM=0; DM=-30; /M: SY='V'; M=-19,-51,-59,-55, 6,-62, 15, 42,-52, 6, -5,-53,-31,-52,-33,-31, 1, 60,-57, 0; D=-19; /I: I=-19; DM=-30; /M: SY='V'; M=-28,-52,-35, 9,-14,-56,-25, 22, 17, 1, -4,-13,-53,-17,-23, 0,-11, 50,-56, 6; D=-19; /I: I=-19; DM=-30; /M: SY='Y'; M=-27,-53,-57,-52, -6,-60, -4, 18, -3, 45, 2,-52,-59,-33,-46,-31, -4, 13, 19, 59; D=-19; /I: I=-19; DM=-30; /M: SY='K'; M=-24,-29,-23, 18,-55,-25, 20,-41, 52,-53,-44,-30,-47, 16, 48, 11, 7,-23,-57,-15; D=-19; /I: I=-19; MI=0; MD=-30; IM=0; DM=-30; /M: SY='H'; M=-38,-57, 11, 18,-28,-50, 57, 0, 14,-32,-41, 38,-49, 39, 1,-34, 28,-35,-64,-27; D=-19; /I: I=-19; DM=-30; /M: SY='Y'; M=-48,-58,-55,-40, 14,-62, 37, 14,-19, 29, -4,-53,-38,-36,-47,-50,-44, 11, 14, 82; D=-19; /I: I=-19; DM=-30; /M: SY='P'; M=-37,-61, 1, 42,-63,-47,-32,-57, 10,-59,-44, 12, 72, 36, 7, 16,-36,-44,-61,-53; D=-19; /I: I=-19; DM=-30; /M: SY='N'; M=-33,-55, 69, 15,-62, 4,-31,-61, 10,-62,-54, 73,-48, 11,-35,-17,-34,-60,-71,-51; /M: SY='M'; M=-42,-50,-62,-53,-31,-57, 21, -1,-48, 18,124,-50,-53,-40,-46,-42,-40, -4,-55,-30; /M: SY='V'; M=-21,-50,-55,-28,-36,-57,-56, 51,-38, -4, -7,-48,-54, -6,-52, 23,-15, 61,-61,-41; /M: SY='V'; M= 49,-45,-57,-50,-41,-48,-59, 4,-50,-24,-29,-52,-27,-50,-53,-29,-20, 72,-63,-45; /M: SY='E'; M= -7,-57, 28, 55,-57,-29,-38,-52, 45,-27,-45,-28,-44, 17, 19,-28, 3,-18,-60,-48; /M: SY='E'; M= 5,-54, -5, 55,-59, 11, 16,-59, 22,-53,-49, -3,-36,-25, 19, 33,-18,-52,-60,-48; /M: SY='C'; M=-41,148,-61,-62,-52,-57,-61,-59,-57,-49,-49,-48,-72,-65,-64,-44,-42,-46,-82,-62; /M: SY='G'; M= -1,-54,-41,-34,-60, 82, -4,-64, -3,-62,-52,-10,-47,-41,-41, 16,-11,-57,-56,-54; /M: SY='C'; M=-42,147,-61,-62,-32,-57,-61,-58,-57,-49,-49,-48,-72,-65,-64,-44,-42,-46,-80,-61; /M: SY='R'; M= -9,-38,-43,-32,-46,-11, 29, 2,-15,-18,-38,-14,-38, -4, 63, 40,-29,-11,-56, 1; /I: E1=0; IE=-155; DE=-155;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 228 in 228 different sequences |
Number of true positive hits | 228 in 228 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | window20 |
Author [info] | N_Hulo |
Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
228 sequences
60A_DROME (P27091), 60A_DROVI (Q24735), ARTN_HUMAN (Q5T4W7), ARTN_MOUSE (Q9Z0L2), ARTN_RAT(Q6AYE8), BMP10_HUMAN (O95393), BMP10_MOUSE (Q9R229), BMP10_RAT (Q4AEG6), BMP15_BOVIN (Q6PX77), BMP15_HUMAN (O95972), BMP15_MOUSE (Q9Z0L4), BMP15_SHEEP (Q9MZE2), BMP2A_XENLA (P25703), BMP2B_XENLA (P30884), BMP2_CHICK (Q90751), BMP2_DAMDA (O19006), BMP2_HUMAN (P12643), BMP2_MOUSE (P21274), BMP2_RABIT (O46564), BMP2_RAT(P49001), BMP2_TETNG (Q804S2), BMP3_BOVIN (P22444), BMP3_HUMAN (P12645), BMP3_MOUSE (Q8BHE5), BMP3_RAT(P49002), BMP3_XENLA (Q7T2X7), BMP4_BOVIN (Q2KJH1), BMP4_CHICK (Q90752), BMP4_DAMDA (Q29607), BMP4_HUMAN (P12644), BMP4_MOUSE (P21275), BMP4_RABIT (O46576), BMP4_RAT(Q06826), BMP4_SUNMU (Q8MJV5), BMP4_XENLA (P30885), BMP5_HUMAN (P22003), BMP5_MOUSE (P49003), BMP6_HUMAN (P22004), BMP6_MOUSE (P20722), BMP6_RAT(Q04906), BMP7_HUMAN (P18075), BMP7_MOUSE (P23359), BMP7_XENLA (P30886), BMP8A_HUMAN (Q7Z5Y6), BMP8A_MOUSE (P34821), BMP8B_HUMAN (P34820), BMP8B_MOUSE (P55105), DAF7_CAEEL (P92172), DBL1_CAEEL (G5EEL5), DECA_DROME (P07713), DECA_DROPS (P91699), DECA_DROSI (P91706), DECA_TRICA (Q26974), DERR_XENTR (Q66KL4), DSL1_CHICK (P34822), DVR1_DANRE (P35621), DVR1_STRPU (P48969), DVR1_XENLA (P09534), GDF10_BOVIN (Q08DX6), GDF10_HUMAN (P55107), GDF10_MOUSE (P97737), GDF10_RAT (P55108), GDF10_XENLA (Q7T2X6), GDF11_HUMAN (O95390), GDF11_MOUSE (Q9Z1W4), GDF11_RAT (Q9Z217), GDF15_HUMAN (Q99988), GDF15_MACFA (G7PWZ3), GDF15_MOUSE (Q9Z0J7), GDF15_RAT (Q9Z0J6), GDF1_HUMAN (P27539), GDF1_MOUSE (P20863), GDF2_DANRE (F1QWZ4), GDF2_HUMAN (Q9UK05), GDF2_MOUSE (Q9WV56), GDF3_HUMAN (Q9NR23), GDF3_MOUSE (Q07104), GDF3_XENLA (Q9YGV1), GDF5_HUMAN (P43026), GDF5_MOUSE (P43027), GDF6A_DANRE (P85857), GDF6B_DANRE (A8E7N9), GDF6_BOVIN (P55106), GDF6_HUMAN (Q6KF10), GDF6_MOUSE (P43028), GDF6_RAT(Q6HA10), GDF7_CHLAE (Q9BDW8), GDF7_HUMAN (Q7Z4P5), GDF7_MOUSE (P43029), GDF8_AEPME (Q5USV7), GDF8_ANAPL (Q8UWE0), GDF8_ANSAN (Q8UWD9), GDF8_ANTAM (Q5USV5), GDF8_BOSGA (Q5USW1), GDF8_BOSIN (Q5RZV4), GDF8_BOVIN (O18836), GDF8_BUBBU (Q6X5V1), GDF8_CANLF (Q6UKZ8), GDF8_CAPHI (Q6T5B8), GDF8_CAPIB (Q5USV9), GDF8_CHICK (O42220), GDF8_COLLI (Q8UWD8), GDF8_COTCO (Q8AVB2), GDF8_DANRE (O42222), GDF8_EPICO (Q5I3Q2), GDF8_EXCCH (Q8UWD7), GDF8_GORGO (A1C2V5), GDF8_HEMJE (Q5USV8), GDF8_HORSE (Q9GM97), GDF8_HUMAN (O14793), GDF8_LEPCA (Q8HY52), GDF8_MACFA (Q95J86), GDF8_MACMU (A1C2U6), GDF8_MELGA (O42221), GDF8_MOUSE (O08689), GDF8_OREMO (Q98TB4), GDF8_PANPA (A1C2U7), GDF8_PANTR (A1C2V0), GDF8_PAPHA (O18828), GDF8_PIG(O18831), GDF8_PONPY (A1C2U3), GDF8_RAT(O35312), GDF8_SHEEP (O18830), GDF8_SYLGR (Q5USV6), GDF8_TAUDE (Q5USW0), GDF8_VULLA (Q6J1J2), GDF8_VULVU (Q6DTL9), GDF9_BOVIN (Q9GK68), GDF9_CAPHI (Q66NC0), GDF9_HUMAN (O60383), GDF9_MOUSE (Q07105), GDF9_PAPAN (A9CB18), GDF9_SHEEP (O77681), GDNF_DANRE (Q98TU0), GDNF_HUMAN (P39905), GDNF_MOUSE (P48540), GDNF_RAT(Q07731), GDNF_XENLA (Q06PM8), INHA_BOVIN (P07994), INHA_CHICK (P43031), INHA_HORSE (P55101), INHA_HUMAN (P05111), INHA_MOUSE (Q04997), INHA_PIG(P04087), INHA_RAT(P17490), INHA_SHEEP (P38440), INHA_TRIVU (O77755), INHBA_BOVIN (P07995), INHBA_CHICK (P27092), INHBA_FELCA (Q6X2S4), INHBA_HORSE (P55102), INHBA_HUMAN (P08476), INHBA_MOUSE (Q04998), INHBA_PIG (P03970), INHBA_RAT (P18331), INHBA_SHEEP (P43032), INHBB_BOVIN (P42917), INHBB_CHICK (P27093), INHBB_HUMAN (P09529), INHBB_MOUSE (Q04999), INHBB_PIG (P04088), INHBB_RAT (P17491), INHBC_HUMAN (P55103), INHBC_MOUSE (P55104), INHBC_RAT (Q9WUK5), INHBE_HUMAN (P58166), INHBE_MOUSE (O08717), INHBE_RAT (O88959), INHB_DROME (O61643), LFTY1_HUMAN (O75610), LFTY1_MOUSE (Q64280), LFTY2_HUMAN (O00292), LFTY2_MOUSE (P57785), MIS_BOVIN (P03972), MIS_HUMAN (P03971), MIS_MOUSE (P27106), MIS_PIG (P79295), MIS_RAT (P49000), NOD2A_XENLA (Q91620), NOD2B_XENLA (Q90XB7), NOD3A_XENLA (Q91609), NOD3A_XENTR (Q800C0), NOD3B_XENLA (Q91621), NOD3B_XENTR (Q800B9), NOD3C_XENTR (Q800B8), NOD4A_XENLA (O13048), NOD4B_XENLA (Q90XB8), NODAL_HUMAN (Q96S42), NODAL_MOUSE (P43021), NODAL_XENLA (Q91619), NODAL_XENTR (Q28GB8), NRTN_HUMAN (Q99748), NRTN_MOUSE (P97463), PSPN_HUMAN (O60542), PSPN_MOUSE (O70300), PSPN_RAT(O70301), SCW_DROME (P54631), TGFB1_BOVIN (P18341), TGFB1_CANLF (P54831), TGFB1_CAVPO (Q9Z1Y6), TGFB1_CHICK (P09531), TGFB1_CHLAE (P09533), TGFB1_CYPCA (Q9PTQ2), TGFB1_HORSE (O19011), TGFB1_HUMAN (P01137), TGFB1_MOUSE (P04202), TGFB1_MUSPF (Q38HS2), TGFB1_ONCMY (O93449), TGFB1_PIG (P07200), TGFB1_RAT (P17246), TGFB1_SHEEP (P50414), TGFB1_XENLA (P16176), TGFB2_BOVIN (P21214), TGFB2_CHICK (P30371), TGFB2_CHLAE (P61811), TGFB2_HUMAN (P61812), TGFB2_MOUSE (P27090), TGFB2_MUSPF (Q38L25), TGFB2_PIG (P09858), TGFB2_RAT (Q07257), TGFB2_XENLA (P17247), TGFB3_CHICK (P16047), TGFB3_HUMAN (P10600), TGFB3_MOUSE (P17125), TGFB3_PIG (P15203), TGFB3_RAT (Q07258), UN129_CAEEL (G5EBY8), UNIV_STRPU (P48970)» more
|
PDB [Detailed view] |
140 PDB
1AGQ; 1BMP; 1ES7; 1KLA; 1KLC; 1KLD; 1KTZ; 1LX5; 1LXI; 1M4U; 1NYS; 1NYU; 1REU; 1REW; 1S4Y; 1TFG; 1TGJ; 1TGK; 1WAQ; 1ZKZ; 2ARP; 2ARV; 2ASK; 2B0U; 2BHK; 2GH0; 2GOO; 2GYR; 2GYZ; 2H62; 2H64; 2P6A; 2PJY; 2QCQ; 2QCW; 2QJ9; 2QJA; 2QJB; 2R52; 2R53; 2TGI; 2V5E; 3B4V; 3BK3; 3BMP; 3EO1; 3EVS; 3FUB; 3HH2; 3KFD; 3QB4; 3RJR; 3SEK; 4FAO; 4KV5; 4KXZ; 4MID; 4MPL; 4N1D; 4UHY; 4UHZ; 4UI0; 4UI1; 4UI2; 4UX8; 4YCG; 4YCI; 5E4G; 5F3B; 5F3H; 5FFO; 5HK5; 5HLY; 5HLZ; 5HZW; 5I05; 5JHW; 5JI1; 5MR4; 5MR5; 5MR9; 5NMZ; 5NTU; 5NXS; 5TX2; 5TX4; 5TX6; 5TY4; 5UHM; 5VQF; 5VQP; 5VT2; 5VZ3; 5VZ4; 6GL7; 6I9J; 6MAC; 6OMN; 6OMO; 6Q2J; 6Q2N; 6Q2O; 6Q2R; 6Q2S; 6SF1; 6SF3; 6UJA; 6UMX; 6XM2; 6Y6N; 6Y6O; 6Z3G; 6Z3H; 6Z3J; 6Z3L; 6Z3M; 7AB8; 7AG0; 7AML; 7L0J; 7MRZ; 7OLY; 7PPA; 7PPB; 7PPC; 7RCO; 7U5O; 7U5P; 7Y1R; 7Y1T; 7ZJF; 8BWL; 8BWM; 8BWN; 8DC0; 8E3G; 8FXS; 8FXV; 8OS6; 8V52 » more |