Entry: PS51431

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] KAIA_C
Accession [info] PS51431
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JAN-2009 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); SEP-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51430
Associated ProRule [info] PRU00761

Name and characterization of the entry

Description [info] KaiA C-terminal domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=109;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=104;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6425400; R2=0.0104764; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2085.99364; R2=30.26232; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=560; N_SCORE=8.5; H_SCORE=23330; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=369; N_SCORE=6.5; H_SCORE=13223; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-22; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D'; M=-25, 37,-61, 41, 10,-57,-24, -7,-61, 13,-59,-45, 37,-30,  2, -8, -3,-11,-51,-71,-48,  5;
/M: SY='P'; M= -6,-32,-52,-27,-18,-56,-43,-35,-47,-16,-47,-37,-30, 87,-25,-23, -6,-17,-37,-67,-54,-18;
/M: SY='Q'; M= -4, -5,-42, -7, 14,-47,-28, -6,-47, 13,-42,-23,  1,-25, 35,  1, 14,  1,-35,-52,-35, 20;
/M: SY='Q'; M=-27,-22,-49,-30,-14,-22,-43,  2,-36, -1,-23,-15,-10,-39, 12, 11,-19,-19,-31,-38,-14, -5;
/M: SY='F'; M=-37,-53,-43,-55,-50, 74,-57, -2,-14,-44, -7, -5,-49,-56,-41,-42,-36,-36,-18, -8, 36,-50;
/M: SY='F'; M=-35,-62,-37,-65,-58, 38,-65,-24,  2,-43, 23,  7,-56,-55,-41,-43,-38,-33, -7,-13, 26,-51;
/M: SY='R'; M=-21,-12,-55,-22, -6,-50,-25,  3,-52, 17,-44,-29,  0,-32, 16, 48,-13,-17,-41,-50,-37,  3;
/M: SY='N'; M=-20, 16,-51,  1,  5,-48,-24, 12,-54,  5,-51,-35, 35,-33, 10,  0,  8, -6,-43,-57,-29,  5;
/M: SY='M'; M=-27,-63,-30,-66,-53,  5,-63,-45, 19,-37, 47, 49,-53,-47,-30,-37,-37,-24,  9,-35,-20,-44;
/M: SY='P'; M=  6,-17,-37,-20,-17,-49,-28,-28,-40,-13,-42,-29, -9, 31,-18,-24, 14,  9,-27,-61,-44,-17;
/M: SY='P'; M= -8,-31,-51,-26,-11,-53,-44,-31,-43,-11,-41,-29,-29, 62,-11,-22,-12,-12,-31,-61,-49,-10;
/M: SY='E'; M= -2, -2,-47,  2, 11,-45,-24, -9,-44, -6,-45,-31, -6,-27,  2,-16, -4, -9,-28,-54,-36,  7;
/M: SY='E'; M=-22, 19,-70, 35, 69,-60,-38, -4,-62,  4,-62,-44, -4,-22, 22,-14,-10,-20,-44,-64,-52, 51;
/M: SY='R'; M=-20,-14,-55,-20,  8,-50,-37,  0,-50, 36,-40,-23, -4,-27, 38, 46,-11,-13,-40,-49,-36, 18;
/M: SY='Q'; M=-20, -6,-52,-10, 10,-49,-35,  3,-50, 18,-43,-24,  2,-29, 36, 30, -5, -8,-39,-50,-35, 19;
/M: SY='E'; M=-10, -1,-59,  3, 30,-54,-18,-14,-51, 12,-51,-36,-10,-26,  7,-11, -9,-17,-35,-60,-48, 20;
/M: SY='L'; M=-32,-67,-33,-68,-59, 15,-68,-39, 12,-41, 45, 21,-58,-52,-40,-41,-39,-31,  3,-29, -1,-50;
/M: SY='L'; M=-28,-60,-32,-63,-50, -8,-64,-39, 18,-33, 37, 24,-51,-46,-33,-28,-36,-24, 11,-42,-22,-43;
/M: SY='E'; M=-20, -4,-57,  1, 20,-50,-39, -7,-48, 11,-43,-29, -9,-27, 19, 19,-14,-17,-34,-55,-43, 19;
/M: SY='Q'; M= -3, -3,-43, -4, 16,-48,-28, -7,-47,  9,-43,-24,  0,-24, 31,  0, 14,  0,-35,-52,-36, 21;
/M: SY='L'; M=-30,-68,-29,-69,-59,  2,-69,-49, 23,-41, 53, 30,-59,-50,-40,-41,-39,-28, 12,-39,-19,-50;
/M: SY='K'; M=-17,-13,-55,-19, 10,-46,-36, -1,-45, 36,-38,-22, -5,-26, 26, 28,-10,-12,-34,-52,-35, 15;
/M: SY='R'; M= -5,-17,-37,-26,-17,-39,-30,-16,-34,  0,-25,-19, -6,-29, -4, 14, 10, -2,-26,-52,-33,-12;
/M: SY='D'; M=-17, 16,-47, 28,  3,-46,-33,-21,-41,-14,-42,-31,  5,-31, -3,-24,  3,  3,-33,-63,-43,  0;
/M: SY='Y'; M=-40,-50,-50,-60,-50, 40,-60, 30,-30,-40,-20,-30,-40,-60,-30,-40,-30,-30,-30, 30,110,-40;
/M: SY='R'; M=-24,-17,-54,-26, -8,-49,-37, -3,-48, 24,-40,-28, -7,-29, 13, 70,-10,-11,-37,-50,-38,  1;
/M: SY='D'; M=-17,  9,-55, 24, 11,-46,-36,-13,-47,-10,-40,-32, -5,-30,  1,-15,-11,-14,-36,-61,-42,  8;
/M: SY='I'; M=-29,-62,-22,-70,-59, -8,-70,-57, 58,-47, 28, 22,-60,-50,-47,-47,-40,-21, 35,-48,-28,-57;
/M: SY='I'; M=-23,-65,-25,-67,-53, -9,-67,-52, 36,-42, 35, 21,-57,-47,-42,-42,-37,-18, 36,-45,-25,-48;
/M: SY='L'; M=-26,-66,-27,-69,-59, -4,-67,-52, 31,-41, 47, 26,-59,-49,-42,-42,-38,-26, 17,-43,-23,-51;
/M: SY='N'; M= -9, 22,-44, 14,  1,-50,-14,-10,-51, -4,-51,-35, 31,-29, -3,-16, 24,  1,-41,-65,-40, -2;
/M: SY='Y'; M=-40,-50,-50,-60,-50, 40,-60, 30,-30,-40,-20,-30,-40,-60,-30,-40,-30,-30,-30, 30,110,-40;
/M: SY='F'; M=-40,-60,-40,-60,-60,100,-60,-20,-10,-50,  0,  0,-60,-60,-50,-50,-40,-40,-20,  0, 40,-60;
/M: SY='S'; M=  0, -5,-35,-13, -9,-46,-19,-15,-41,  0,-40,-25,  4,-27,  3,  2, 20, 17,-28,-54,-36, -5;
/M: SY='D'; M=-15, 17,-48, 25,  6,-52,-26,-16,-50, -8,-51,-34, 12,-24,  6,-18,  4, 11,-37,-62,-44,  5;
/M: SY='D'; M=-23, 23,-66, 48, 10,-60,-36,-24,-62,-17,-62,-51,  1, 19,-13,-28,-12,-22,-52,-75,-58,  3;
/M: SY='S'; M= 10,-14,-39,-19, -4,-43,-18,-18,-41, 10,-38,-27, -8,-17, -5,-12, 11, -1,-29,-54,-34, -5;
/M: SY='T'; M= 21,-15,-25,-21,-14,-43,-20,-26,-30, -6,-34,-20,-10,-12,-12,-21, 19, 24,-14,-54,-37,-15;
/M: SY='V'; M=  0,-53,-21,-55,-43,-18,-48,-45, 16,-32, 16,  9,-46,-37,-35,-37,-18, -9, 22,-47,-29,-39;
/M: SY='N'; M=-26, 38,-52, 12, -6,-58,-14,  6,-58, 16,-56,-38, 72,-36,  4, -2,  6, -2,-48,-68,-40, -6;
/M: SY='Q'; M=-16,  4,-54,  7, 33,-52,-34,  5,-54, 10,-48,-24,  4,-27, 53, -2, -7,-12,-41,-51,-37, 38;
/M: SY='K'; M= 15,-20,-37,-25, -8,-43,-22,-18,-37, 19,-30,-22,-14,-21, -3,  5,  1, -8,-25,-54,-38, -7;
/M: SY='I'; M=-30,-63,-23,-70,-60, -7,-70,-57, 57,-47, 31, 23,-60,-50,-47,-47,-40,-23, 32,-47,-27,-57;
/M: SY='D'; M=-27, 47,-70, 79, 36,-60,-33,-15,-67,-12,-67,-55, 12,-27,  0,-25,-10,-20,-55,-75,-57, 23;
/M: SY='E'; M=-10, 11,-51, 11, 20,-52,-26, -8,-53, 15,-50,-34, 12,-24, 16, -5, 13, -4,-41,-61,-41, 17;
/M: SY='F'; M=-39,-61,-39,-61,-60, 84,-61,-23, -6,-48,  8,  3,-59,-59,-48,-48,-40,-38,-16, -5, 34,-58;
/M: SY='V'; M=-14,-60,-20,-62,-44,-18,-62,-52, 46,-42, 12, 12,-52,-42,-42,-42,-32, -4, 64,-50,-30,-44;
/M: SY='N'; M=-19, 39,-44, 13,-11,-57,-10,  4,-55, -2,-56,-37, 74,-36, -2,-12, 14,  5,-44,-67,-39,-11;
/M: SY='T'; M= -9,-18,-31,-24,-12,-37,-37,-23,-21, -4,-21, -4, -8,-32,  5,-15,  1, 33, -8,-48,-31, -8;
/M: SY='A'; M= 40,-40, -7,-42,-31,-32,-21,-39, -4,-22,-17,-10,-38,-22,-29,-36,  2, -4,  7,-50,-38,-31;
/M: SY='F'; M=-40,-60,-40,-60,-60,100,-60,-20,-10,-50,  0,  0,-60,-60,-50,-50,-40,-40,-20,  0, 40,-60;
/M: SY='F'; M=-38,-59,-30,-61,-59, 82,-60,-17,-13,-49, -5, -6,-57,-60,-47,-49,-37,-37,-21,  1, 43,-58;
/M: SY='A'; M= 48,-24,-10,-27,-22,-42,  2,-31,-35,-14,-35,-25,-20,-18,-21,-30, 26,  4,-18,-53,-40,-22;
/M: SY='D'; M=-30, 58,-66, 84, 14,-60,-26,-14,-68,-16,-68,-56, 34,-32, -8,-26, -6,-16,-58,-78,-56,  6;
/M: SY='I'; M=-28,-63,-24,-69,-57, -7,-68,-55, 47,-45, 33, 25,-58,-49,-44,-45,-39,-21, 31,-46,-27,-53;
/M: SY='P'; M=  9,-24,-41,-23,-18,-51,-22,-32,-46,-16,-46,-35,-19, 47,-23,-27, 16, -9,-35,-64,-48,-18;
/M: SY='V'; M=-12,-58,-19,-62,-46,-18,-60,-52, 46,-42, 11, 12,-52,-42,-42,-43,-30, -7, 54,-50,-31,-46;
/M: SY='T'; M=  7,-19,-29,-23,-19,-43,-29,-31,-31,-14,-33,-21,-13, 10,-17,-24, 20, 26,-18,-57,-38,-19;
/M: SY='Q'; M=-21,-14,-53,-19, 12,-46,-39,  3,-48, 29,-39,-19, -4,-29, 50, 30,-12, -9,-38,-44,-29, 25;
/M: SY='I'; M=-16,-49,-21,-56,-46,-19,-56,-49, 35,-37,  9, 11,-44,-42,-37,-40,-23,  5, 31,-49,-29,-45;
/M: SY='V'; M=-21,-63,-23,-65,-51,-12,-65,-52, 40,-42, 28, 18,-55,-45,-42,-42,-35,-14, 45,-47,-27,-47;
/M: SY='E'; M=-20, 11,-69, 22, 75,-60,-40,  0,-60,  9,-59,-39, -8,-21, 31,-10,-10,-20,-41,-60,-49, 58;
/M: SY='I'; M=-29,-59,-21,-68,-59,-10,-69,-58, 64,-48, 21, 20,-58,-49,-48,-48,-38,-17, 37,-49,-29,-58;
/M: SY='H'; M=-30,-10,-70,-20,  0,-20,-40,120,-60,-10,-50,-40, 10,-40, 10,  0,-20,-30,-50,-40, 30,  0;
/M: SY='M'; M=-18,-52,-28,-60,-40, -3,-52,-42, 23,-32, 27, 76,-42,-40,-15,-32,-30, -8, 20,-33,-30,-32;
/M: SY='E'; M=-23, 26,-66, 35, 46,-59,-32, -4,-62,  7,-61,-44, 14,-26, 15,-11, -7,-16,-46,-66,-50, 33;
/M: SY='L'; M=-28,-66,-29,-67,-55, -4,-68,-48, 21,-38, 50, 26,-57,-48,-35,-38,-38,-26, 15,-41,-22,-46;
/M: SY='M'; M=-25,-55,-25,-65,-50, -5,-60,-50, 45,-40, 25, 55,-50,-45,-30,-40,-35,-15, 25,-40,-30,-45;
/M: SY='D'; M=-28, 48,-70, 81, 35,-60,-32,-15,-68,-13,-68,-55, 13,-28,  0,-25,-10,-20,-55,-75,-58, 22;
/M: SY='E'; M=-15, 17,-61, 29, 45,-57,-27,-10,-58, -2,-59,-42,  0,-24, 11,-18, -3,-12,-42,-64,-50, 31;
/M: SY='F'; M=-40,-60,-41,-61,-60, 93,-60,-19,-13,-50, -3, -3,-60,-60,-49,-50,-40,-40,-22,  8, 43,-59;
/M: SY='S'; M= 22,-22,-22,-28,-21,-33,-16,-26,-39,-19,-37,-27,-15,-26,-18,-28, 33,  2,-28,-20,-23,-20;
/M: SY='K'; M=-18,-14,-50,-21, -1,-43,-39,-16,-27, 34,-30,-18, -7,-29, 17,  6,-15,-12,-25,-56,-37,  3;
/M: SY='Q'; M=-20,-10,-53,-13, 24,-49,-39, 12,-50, 27,-40,-15,  0,-29, 73, 16,-11,-11,-40,-43,-29, 40;
/M: SY='L'; M=-30,-70,-30,-70,-60,  0,-70,-50, 20,-40, 60, 30,-60,-50,-40,-40,-40,-30, 10,-40,-20,-50;
/M: SY='K'; M=-12,-14,-56,-23,  2,-49,-31, -8,-49, 57,-40,-30, -4,-23, 14, 44, -9,-12,-38,-56,-40,  5;
/M: SY='L'; M=-30,-69,-29,-69,-59,  2,-69,-49, 22,-41, 54, 28,-60,-50,-41,-41,-40,-29, 13,-39,-19,-50;
/M: SY='E'; M=-20, 10,-70, 20, 80,-60,-40,  0,-60, 10,-60,-40,-10,-20, 30,-10,-10,-20,-40,-60,-50, 60;
/M: SY='G'; M=  0,-20,-60,-30,-40,-60, 90,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
/M: SY='R'; M=-30,-15,-62,-26, -8,-44,-39, 27,-53, 20,-43,-33, -2,-33, 10, 66,-19,-21,-43,-49,-24,  0;
/M: SY='S'; M=  7,  0,-33,-11, -5,-44,-17,-16,-43, 14,-41,-29, 12,-22, -1, -6, 42, 15,-32,-60,-33, -5;
/M: SY='E'; M=-19, 22,-58, 20, 37,-56,-28,  2,-57,  2,-57,-39, 21,-27, 13,-12,  3, -7,-42,-63,-43, 26;
/M: SY='D'; M=-24, 31,-70, 54, 54,-60,-36, -9,-64, -3,-64,-49,  3,-24, 13,-19,-10,-20,-49,-69,-54, 39;
/M: SY='I'; M=-23,-49,-26,-55,-48, 12,-57,-41, 25,-40,  4, 10,-46,-47,-39,-42,-26, -2, 19,-36,-12,-48;
/M: SY='L'; M=-30,-70,-30,-70,-60,  0,-70,-50, 20,-40, 60, 30,-60,-50,-40,-40,-40,-30, 10,-40,-20,-50;
/M: SY='L'; M=-26,-52,-34,-53,-35,-15,-61,-34,  2,-24, 29, 18,-42,-44, -5,-27,-30,-21, -2,-41,-23,-23;
/M: SY='D'; M=-30, 60,-70,100, 20,-60,-30,-20,-70,-20,-70,-60, 20,-30,-10,-30,-10,-20,-60,-80,-60, 10;
/M: SY='Y'; M=-40,-50,-50,-60,-50, 40,-60, 30,-30,-40,-20,-30,-40,-60,-30,-40,-30,-30,-30, 30,110,-40;
/M: SY='R'; M=-30,-20,-60,-30,-10,-50,-40,  0,-50, 30,-40,-30,-10,-30, 10, 90,-20,-20,-40,-50,-40,  0;
/M: SY='L'; M=-30,-70,-30,-70,-60,  0,-70,-50, 20,-40, 60, 30,-60,-50,-40,-40,-40,-30, 10,-40,-20,-50;
/M: SY='T'; M= 21,-18,-17,-25,-21,-39,-22,-31,-20,-11,-28,-12,-11,-24,-14,-24, 18, 52,  0,-50,-33,-21;
/M: SY='L'; M=-30,-70,-30,-70,-60,  0,-70,-50, 22,-40, 59, 30,-60,-50,-40,-40,-40,-30, 11,-40,-20,-50;
/M: SY='I'; M=-30,-63,-23,-70,-60, -7,-70,-57, 57,-47, 30, 23,-60,-50,-47,-47,-40,-23, 32,-47,-27,-57;
/M: SY='D'; M=-30, 60,-70,100, 20,-60,-30,-20,-70,-20,-70,-60, 20,-30,-10,-30,-10,-20,-60,-80,-60, 10;
/M: SY='V'; M=-16,-55,-20,-60,-45,-18,-61,-52, 45,-41, 10, 12,-49,-42,-41,-42,-29,  1, 53,-50,-30,-45;
/M: SY='M'; M=-26,-60,-27,-66,-52, -3,-62,-49, 32,-39, 38, 49,-52,-46,-31,-39,-36,-19, 19,-39,-26,-45;
/M: SY='A'; M= 70,-30,-10,-30,-20,-40,  0,-30,-30,-10,-30,-20,-30,-10,-20,-30, 20,  0,-10,-50,-40,-20;
/M: SY='H'; M=-30,-10,-70,-20,  0,-20,-40,120,-60,-10,-50,-40, 10,-40, 10,  0,-20,-30,-50,-40, 30,  0;
/M: SY='L'; M=-30,-70,-30,-70,-60,  0,-70,-50, 20,-40, 60, 30,-60,-50,-40,-40,-40,-30, 10,-40,-20,-50;
/M: SY='C'; M= -6,-50, 90,-60,-61,-43,-33,-62,-29,-52,-37,-33,-40,-56,-46,-54,-12,-19,-27,-52,-50,-61;
/M: SY='E'; M=-20, 10,-70, 20, 80,-60,-40,  0,-60, 10,-60,-40,-10,-20, 30,-10,-10,-20,-40,-60,-50, 60;
/M: SY='M'; M=-13,-50,-28,-58,-40, -5,-48,-41, 18,-30, 25, 73,-41,-38,-15,-31,-27, -9, 14,-34,-30,-31;
/M: SY='Y'; M=-40,-50,-50,-60,-50, 40,-60, 30,-30,-40,-20,-30,-40,-60,-30,-40,-30,-30,-30, 30,110,-40;
/M: SY='R'; M=-30,-20,-60,-30,-10,-50,-40,  0,-50, 30,-40,-30,-10,-30, 10, 90,-20,-20,-40,-50,-40,  0;
/M: SY='R'; M=-22,-20,-42,-30,-14,-48,-37, -7,-47, 19,-39,-30,-10,-31,  3, 65, -8,-15,-37,-51,-39, -6;
/M: SY='S'; M= 22, -4,-14,-14,-13,-40,-11,-23,-39,-12,-39,-29,  5,-21,-12,-22, 63, 17,-28,-59,-31,-13;
/M: SY='I'; M=-27,-57,-20,-67,-57,-12,-67,-58, 64,-48, 17, 17,-56,-48,-48,-48,-34,-17, 38,-50,-30,-57;
/M: SY='P'; M= -5,-34,-54,-27,-18,-57,-44,-37,-48,-18,-48,-38,-32, 99,-27,-28, -6,-22,-38,-68,-55,-18;
/M: SY='R'; M=-19,-22,-60,-27, -8,-53,-35,-13,-51, 30,-43,-33,-14,  6,  2, 42,-17,-20,-41,-58,-45, -3;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_10 which contains 546'790 sequence entries.


Total number of hits 8 in 8 different sequences
Number of true positive hits 8 in 8 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] KaiA C-terminal
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
8 sequences

KAIA_ACAM1  (Q6L8L3), KAIA_NOSS1  (Q8YT42), KAIA_SYNE7  (Q79PF6), 
KAIA_SYNP2  (Q6L8L7), KAIA_SYNPX  (Q7U8R5), KAIA_SYNY3  (P74644), 
KAIA_THEEB  (Q79V62), KAIA_THEVL  (Q6L8K1)
» More

PDB
[Detailed view]
8 PDB

1Q6A; 1Q6B; 1R5Q; 1R8J; 1SUY; 1SV1; 1V2Z; 4G86

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission