Entry: PS51436

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] POTYVIRUS_NIA_PRO
Accession [info] PS51436
Entry type [info] MATRIX
Date [info] AUG-2011 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51436
Associated ProRule [info] PRU00766

Name and characterization of the entry

Description [info] Potyvirus NIa protease (NIa-pro) domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=219;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=214;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.9606562; R2=0.0154373; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9690.02537; R2=55.76110; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=392; N_SCORE=9.0; H_SCORE=27868; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=230; N_SCORE=6.5; H_SCORE=22459; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-100; I=-100; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='A'; M= 10,  0,-19, -4, -5,-22,  8,-12,-17,-10,-20,-14,  5,-14, -5,-13, 10, -1,-12,-28,-20, -5;
/M: SY='K'; M= -6, -3,-24, -4,  3,-20,-20, -6,-17, 15,-17, -8, -4,-14,  0, 11, -4, -1, -8,-24, -8,  0;
/M: SY='S'; M=  6, -3,-14, -4, -2,-15, -8,-11,-11,-12,-10, -9,  2,-14, -4,-12, 16,  9, -7,-33,-15, -3;
/M: SY='M'; M= -7,-12,-22,-14, -3, -7,-23, -8,  3,-11,  6,  8,-11,-18, -3,-11, -7, -2,  0,-23, -3, -4;
/M: SY='V'; M= -5,-20, -6,-24,-20, -1,-21, -8,  5,-20,  4,  4,-16,-25,-16,-18,-12, -8,  8,-21,  0,-19;
/M: SY='R'; M= -5, -6,-23, -9, -2,-17,-15, -9,-14,  9,-15, -3, -3,-11,  2, 11, -2, -3, -9,-24,-12, -1;
/M: SY='G'; M=  0, -6,-25, -7,-11,-25, 34, -7,-31,-13,-25,-16,  1,-16,-11,-13,  4, -5,-23,-24,-20,-12;
/M: SY='L'; M=  0,-18,-21,-20,-13, -8,-12,-17,  1,-16, 10,  6,-17,-14,-12,-13,-10, -5,  0,-23,-11,-13;
/M: SY='R'; M=-13, -9,-27,-10,  0,-19,-20, -6,-18, 15,-14, -7, -2,-13,  6, 36, -8, -7,-14,-23,-11, -1;
/M: SY='D'; M= -3, 17,-13, 18,  1,-25,-11, -8,-23, -7,-21,-19, 12, -5, -6,-12,  3,  0,-19,-35,-20, -3;
/M: SY='Y'; M=-15,-17,-26,-18,-16, 10,-28,  3,  5,-12,  5,  6,-16,-25, -8, -9,-16, -7, -1,  0, 33,-15;
/M: SY='N'; M= -3, 21,-20, 15,  0,-21, -7,  0,-16, -6,-23,-16, 27,-15, -3, -9, 11,  2,-17,-36,-17, -2;
/M: SY='P'; M= -7, -5,-30, -1,  0,-24,-11, -2,-20, -8,-24,-12, -5, 30, -1,-13, -2, -8,-24,-29,-18, -3;
/M: SY='I'; M= -9,-27,-23,-32,-23,  7,-34,-24, 30,-22, 13, 11,-21,-23,-21,-21,-16, -7, 25,-18,  2,-24;
/M: SY='A'; M= 13, -2,-16, -7, -5,-12, -4, -9,-14,-11,-16,-12,  2,-13, -8,-14, 13,  4, -8,-26,-13, -6;
/M: SY='Q'; M= -3, -2,-22, -5,  0,-21,-15,  6,-14,  1,-16, -6,  3,-15,  8,  1,  4, -2,-12,-28, -8,  3;
/M: SY='B'; M= -2,  7,-11,  3, -6,-18,-14, -1,-11,-10,-12, -9,  7,-20, -7,-11,  0, -3, -6,-33,-13, -7;
/M: SY='I'; M= -6,-22,-22,-26,-17, -6,-30,-16, 24,-19,  9, 12,-18,-21,-11,-18,-11, -6, 21,-25, -5,-16;
/M: SY='C'; M=  1,-17, 44,-24,-22,-15,-11,-24,-20,-18,-15,-13,-15,-29,-22,-18, -6, -9, -4,-34,-22,-22;
/M: SY='R'; M= -7, -3,-24, -8, -3,-19,-16, -1,-12,  4,-15, -5,  4,-15,  5,  7,  0, -1,-12,-26, -9, -1;
/M: SY='L'; M=-11,-26,-23,-29,-20,  2,-30,-18, 19,-19, 29, 20,-23,-26,-14, -8,-23,-10, 12,-20, -2,-19;
/M: SY='V'; M= -3,-11,-21,-12, -3,-14,-16,-17, -4, -4, -5, -3,-11,-16, -7, -6, -4,  1,  2,-25,-12, -5;
/M: SY='N'; M= -6,  9,-23, -1, -7,-14,  5, -4,-15, -8,-16,-12, 20,-20, -8, -7,  0, -7,-18,-26,-12, -8;
/I:         I=-30; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M:         M= -8, -5,-24, -6, -2, -8,-21, -6, -9, -5, -8, -7, -5,-13, -6, -3, -4, -1, -7,-20,  0, -6;
/M: SY='S'; M=  1, -9,-12,-12,-12,-11,-12,-10, -1,-15,-10, -4, -1,-19,-10,-14, 10,  4,  3,-31,-11,-12;
/M: SY='D'; M=-10, 14,-25, 18,  7,-23, -6, -5,-25, -1,-20,-16,  9,-14,  1, -3,  1, -5,-20,-29,-15,  4;
/I:         I=-28; MD=-29;
/M: SY='G'; M= -5, -1,-25, -1,-11,-19, 19,-14,-22,-12,-20,-14,  1,-17,-11,-14,  1, -6,-16,-23,-16,-11; D=-28;
/I:         I=-28; MD=-29;
/M:         M= -5, -8,-16, -9, -6, -9,-10, -3, -8, -5, -5, -1, -7,-16, -6, -3, -6, -6, -5,-19, -5, -7; D=-28;
/I:         I=-28; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='T'; M= -5, -5,-12, -8,-11,-14, -5,-16,-16, -5,-16,-11, -1,-19,-11, -4,  2,  3, -7,-27,-14,-12;
/M: SY='D'; M= -9,  2,-23,  3, -5,-14, -1, -9,-22, -5,-16,-11,  2,-17, -7,  0,  1,  1,-16,-24,-10, -7;
/M: SY='T'; M= -4,  0,-10, -3,  0,-17,-11, -9,-15, -9,-13,-11,  3,-15, -4, -8,  8, 10,-10,-32,-15, -2;
/M: SY='M'; M= -4,-21,-20,-27,-19, -2,-23,-17, 18,-20, 18, 19,-17,-20,-11,-18,-12, -1, 11,-22, -4,-16;
/M: SY='Y'; M=-12, -2,-23, -9,-10,  8,-19, 14,-10, -9,-10, -5,  6,-23, -4, -7, -6, -5,-14, -9, 20, -8;
/M: SY='G'; M= -2,-14, 28,-18,-23,-26, 30,-24,-35,-23,-26,-20, -8,-27,-23,-24, -3,-16,-21,-31,-30,-23;
/M: SY='I'; M=-10,-22,-22,-29,-24, 12,-30,-20, 23,-24, 16, 10,-16,-25,-22,-21,-16, -5, 17,-17,  4,-24;
/M: SY='G'; M= -7,-18,-19,-22,-21, -2, 13,-20,-12,-20, -6, -5,-11,-23,-19,-18,-11,-14,-11,-16,-10,-20;
/M: SY='Y'; M=-17,-18,-25,-22,-18, 25,-28, 15, -2,-17,  3,  2,-14,-26,-14,-12,-16, -6, -7,  4, 41,-18;
/M: SY='G'; M= -3, -7,-28, -7,-12,-27, 41,-15,-31,-13,-22,-14,  0,-19, -9,-13, -1,-15,-25,-22,-23,-10;
/M: SY='D'; M= -2, 11,-22, 14,  3,-26, -9, -9,-22, -6,-26,-19,  8,  7, -3,-11, 12,  3,-18,-35,-21, -1;
/M: SY='W'; M=-15,-23,-32,-24,-17, 11,-25,-10, -6, -5, -8, -3,-21,-15,-13, -9,-21,-13, -9, 30, 25,-16;
/M: SY='I'; M=-10,-26, -7,-33,-26,  1,-34,-22, 26,-27, 16, 12,-21,-25,-19,-25,-18, -9, 16,-21,  2,-26;
/M: SY='I'; M= -9,-27,-25,-34,-26, -1,-35,-18, 37,-26, 18, 16,-20,-23,-19,-25,-18, -9, 27,-23,  0,-26;
/M: SY='T'; M=  9,-13,-13,-21,-17, -4,-19,-20,  4,-14,  1,  3,-12,-17,-15,-16,  3, 17, 11,-24, -9,-16;
/M: SY='P'; M= -7,  9,-28,  3, -1,-24,-10, -7,-19, -6,-28,-19, 17, 30, -6,-10,  2, -1,-27,-34,-24, -6;
/M: SY='A'; M=  4,-11,-17,-14, -7,-12, -7, -3,-18, -2,-15, -9, -6,-18,  1,  4, -2, -7,-14,-14, -1, -5;
/M: SY='H'; M=-19,  1,-30,  0, -1,-20,-15, 91,-30,-10,-21, -2, 12,-20,  8, -1, -9,-19,-30,-30, 16, -1;
/I:         I=-24; MD=-25;
/M: SY='L'; M= -8,-25,-14,-27,-19,  7,-27,-19, 16,-25, 34, 15,-24,-26,-18,-18,-21, -3, 10,-20, -1,-19; D=-24;
/I:         I=-24; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='F'; M=-10,-21,-21,-28,-20, 36,-21,-16, -2,-19,  2, -1,-13,-24,-20,-13,-13, -9, -2, -5, 11,-18;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-25, -2,  4,-19,-17, -6,-18, 15,-18, -4,  1,-11,  6, 12, -3, -5,-14,-24,-10,  5;
/M: SY='R'; M=-10, -1,-27, -2,  9,-23, -9,  2,-24, 11,-18, -8,  4,-15,  8, 21, -4, -9,-21,-25,-13,  7;
/M: SY='N'; M= -5, 13,-15,  6,  1,-18, -4, -4,-22, -5,-24,-18, 20, -9, -4, -8,  6, -1,-22,-31,-16, -2;
/M: SY='N'; M= -9, 20,-17, 13,  2,-24,  4, -2,-24, -5,-26,-19, 28,-12, -4, -7,  4, -6,-25,-35,-22, -1;
/I:         I=-30; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='G'; M= -4,  1,-28,  0,-11,-27, 38,-14,-32,-10,-25,-17,  6,-18,-13,-12, -1,-12,-26,-24,-24,-12;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='T'; M= -3, -1,-21, -3,  7,-19,-15,-12,-19, -1,-19,-14,  0, -5,  2, -5, 11, 14,-14,-21,-13,  4;
/M: SY='L'; M= -9,-26,-20,-28,-19,  8,-29,-19, 18,-26, 35, 16,-25,-27,-16,-18,-22, -5, 11,-20,  0,-18;
/M: SY='T'; M= -8, -6,-23, -9,  0,-16,-23,-13, -7,  1, -9, -5, -4,-13,  2,  5,  1, 10, -6,-25, -9, -1;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-22,-36,-28, 12,-34,-25, 32,-26, 21, 19,-23,-25,-23,-24,-20, -8, 25,-18,  2,-27;
/M: SY='R'; M=-10, -7,-25,-10, -2,-16,-21, -4,-13,  8,-13, -3, -4,-11,  7, 11, -4,  0,-12,-20, -3,  1;
/M: SY='T'; M=  0, -1, -7, -5, -7,-10,-13, -9,-15,-12,-16,-13,  2,-14, -8,-11, 19, 23, -7,-33,-11, -7;
/M: SY='Q'; M= -4, -7,-18,-10, -2,-20,-18, -4,-14,  4,-14, -4, -5,-15,  8,  6,  1,  2,-10,-22, -9,  3;
/M: SY='H'; M=-14, -4,-26, -7, -3,-12,-18, 35,-23,  1,-17, -4,  4,-19,  6, 17, -5, -8,-20,-24,  4, -1;
/M: SY='G'; M= -2,-13,-28,-13,-21,-19, 54,-18,-32,-20,-24,-16, -4,-22,-21,-19, -3,-18,-23,-16,-20,-21;
/M: SY='T'; M= -6, -7,-13, -9, -4,-14,-23, -9, -5, -9, -3, -2, -8,-18, -1, -9, -2,  7,  0,-28, -9, -3;
/M: SY='F'; M=-17,-22,-22,-28,-23, 45,-29, -2,  0,-19,  3, -1,-18,-28,-24,-15,-15, -3, -2, 10, 43,-23;
/M: SY='T'; M= -8,  7,-20,  6,  1,-19,-18,-11,-17,  4,-15,-12,  4,-13, -3,  3,  3, 13, -9,-29,-12, -1;
/M: SY='I'; M= -8,-25,-14,-31,-24,  5,-31,-21, 23,-23, 18, 16,-22,-24,-19,-21,-16, -2, 19,-21,  1,-23;
/M: SY='E'; M= -2,  0,-28,  2,  7,-28,  4,-11,-28,  1,-26,-18,  2,  7, -2, -4,  0, -9,-25,-27,-22,  1;
/M: SY='N'; M= -4, 11,-22,  2, -4,-20, -7, -5,-16,  1,-22,-14, 20, -9, -4,  2,  4,  0,-17,-31,-17, -5;
/M: SY='T'; M= -4,-12,-18,-17,-13, -6,-20,-15,  2,-16,  7,  7,-10, -8,-10,-14, -2, 10,  0,-27, -9,-12;
/M: SY='T'; M= -2, -2, -9, -6, -4,-19,-13,-11,-17, -3,-16,-11,  0,-10, -5, -7,  4,  7,-10,-30,-15, -5;
/M: SY='S'; M=  0,  0,-19, -4,  5,-20,-15, -8,-13,  2,-16, -8,  2,-13,  4,  1,  6,  4, -8,-28,-14,  4;
/M: SY='L'; M=-10,-19,-10,-23,-15, -4,-29,-11, 10,-18, 13,  8,-15,-24,-11,-16,-17, -9,  5,-23, -1,-15;
/M: SY='K'; M=-10, -1,-28, -3,  3,-24, -9,  1,-26, 18,-25,-10,  3,-12, 12, 14, -4, -9,-23,-20, -7,  7;
/M: SY='I'; M= -6,-26,-10,-32,-26, -2,-30,-23, 27,-23, 15, 18,-22,-25,-19,-22,-14, -6, 25,-26, -6,-24;
/I:         I=-26; MD=-27;
/M: SY='R'; M= -7, -7,-21, -8, -1,-12,-18,  5,-13,  6, -9, -2, -4,-14,  0,  8, -6, -3, -9,-19, -2, -2; D=-26;
/I:         I=-26; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='P'; M=-10, -6,-28, -3,  7,-23,-15,  4,-21,  8,-21,-10, -5, 18,  8,  4, -7,-10,-23,-21,-11,  5; D=-26;
/I:         I=-26; DM=-27;
/M: SY='V'; M= -7,-27,-15,-31,-27, 20,-29,-24, 23,-23, 12,  9,-23,-25,-27,-20,-14, -5, 28,-15,  3,-27; D=-26;
/I:         I=-26; DM=-27;
/M: SY='E'; M= -5, -7,-22, -5,  7,-19,-17,-12,-17,  4,-15,-11, -9,  2, -2, -4, -4, -2,-13,-24,-12,  2;
/M: SY='G'; M= -8,  9,-27,  9, -2,-27, 20, -8,-29, -3,-23,-13, 10,-16, -6, -6, -2,-12,-24,-27,-21, -4;
/M: SY='R'; M=-13,-14,-21,-17, -9, -4,-23,  1, -8,  1, -4,  4, -9,-21, -2, 11,-11, -7, -7,-19,  2, -7;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-22,-33,-24,  5,-32,-22, 30,-27, 34, 23,-26,-26,-19,-22,-24, -9, 19,-21, -1,-23;
/M: SY='V'; M= -2,-27,-17,-31,-26,  0,-30,-26, 30,-23, 17, 15,-25,-25,-23,-22,-14, -3, 33,-25, -6,-26;
/M: SY='I'; M=  2,-26,-20,-32,-25, -3,-25,-27, 27,-24, 15, 11,-22,-23,-21,-24,-13, -6, 26,-23, -7,-25;
/M: SY='I'; M=-10,-27,-20,-33,-25,  6,-30,-22, 26,-26, 17, 13,-21,-24,-18,-23,-19,-10, 17,-17,  3,-24;
/M: SY='R'; M=-12, -6,-27, -7,  3,-24,-20, -6,-23, 23,-20, -8, -2,-11, 13, 33, -5, -2,-16,-22,-11,  6;
/M: SY='M'; M=-11,-20,-18,-24,-16, -1,-21,-10,  7,-13, 22, 23,-17,-25, -9, -2,-21,-10,  2,-22, -4,-13;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='K'; M= -3, -5,-26, -7,  3,-26,-14,-10,-20, 21,-21, -5, -3, -8,  9, 12, -4, -6,-15,-22,-12,  5;
/M: SY='D'; M=-16, 36,-27, 49, 13,-34,-13, -4,-30, -2,-24,-23, 14,-11,  1,-10,  2, -2,-23,-36,-17,  7;
/M: SY='F'; M=-14,-28,-16,-35,-27, 41,-29,-17, 11,-26, 14, 10,-22,-28,-29,-19,-19, -9, 11, -7, 14,-26;
/M: SY='P'; M= -7,-14,-33, -9,  1,-28,-19,-13,-19, -3,-24,-14,-13, 46,  3, -5, -5, -5,-23,-27,-22, -1;
/M: SY='P'; M= -4,-20,-35,-13, -4,-26,-19,-21,-14,-11,-22,-16,-20, 68,-12,-20, -9, -9,-21,-29,-27,-12;
/M: SY='F'; M= -9,-25,-19,-32,-23, 39,-25,-17,  0,-18,  7,  3,-18,-26,-26, -7,-15, -8,  4, -5, 12,-22;
/M: SY='P'; M=-10,-11,-29, -8,  1,-25,-20,-10,-24, 13,-25,-14, -8, 26, -1, 13, -7, -5,-22,-26,-18, -3;
/M: SY='Q'; M= -7, -4,-18, -6,  6,-28,-18,  0,-20, 13,-20, -3, -2,-14, 23, 12, -1, -5,-18,-24,-11, 14;
/M: SY='R'; M= -9, -8,-18, -9, -5,-16,-21,-12,-12,  8, -9, -4, -5,-17, -2, 12, -5, -2, -8,-26,-10, -5;
/M: SY='L'; M= -1,-17,-20,-20,-12, -7,-22,-16,  7,-11, 13,  9,-14,-21, -8,-11,-12, -6,  4,-23, -7,-11;
/M: SY='R'; M= -8, -8, -6,-13, -5,-21,-22, -9,-15,  7,-15, -6, -5,-18,  3, 10, -5, -3, -9,-26,-11, -3;
/M: SY='F'; M=-11,-27,-20,-35,-26, 53,-27,-18,  4,-26, 12,  4,-20,-27,-31,-20,-18, -9,  2,  2, 21,-26;
/M: SY='R'; M=-17, -8,-28, -8,  4,-16,-19, -2,-27, 21,-19,-11,  0,-18,  9, 51, -6, -8,-19,-21,-10,  3;
/M: SY='E'; M=  7, -3,-24, -4,  9,-24, -9,-11,-17,  1,-19,-11, -2,  2,  3, -7,  3, -4,-15,-26,-18,  5;
/M: SY='P'; M= -6,-20,-35,-14, -4,-24,-20,-20,-12,-12,-20,-13,-19, 67,-11,-20,-10, -8,-21,-28,-25,-12;
/M: SY='K'; M=-11,  0,-22, -1,  1,-20,-22,-11,-11,  9,-15, -7,  1,-15,  0,  7, -6, -4, -8,-27,-11, -1;
/M: SY='E'; M= -7, -3,-23, -1,  7,-20,-18, -2,-15,  0,-12, -6, -4, -9,  6,  3,  0, -1,-12,-28,-12,  5;
/M: SY='G'; M= -5,  2,-21,  6, -2,-29, 21,-13,-33, -9,-28,-21,  4, -5, -9,-12,  3,-10,-26,-29,-25, -6;
/M: SY='E'; M=-11, 15,-27, 23, 35,-27,-18, -2,-24,  3,-17,-14,  3, -7,  9, -5, -1, -6,-21,-32,-17, 22;
/M: SY='R'; M=-11, -3,-27, -1, 10,-22,-21, -5,-19, 16,-16, -9, -2,-13,  6, 19, -5, -5,-14,-25,-11,  7;
/M: SY='V'; M=  9,-25,-16,-31,-25, -5,-26,-28, 26,-21,  8,  8,-22,-22,-22,-23, -8, -3, 32,-25, -9,-25;
/M: SY='C'; M= -8,-17, 25,-22,-18,-14,-27,-17, -4,-15, -8, -2,-15,-27, -9,-13, -8, -5,  4,-31,-11,-14;
/M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-21,  5,-26,-13, 22,-22, 35, 35,-26,-26,-12,-16,-25,-10, 12,-20,  0,-17;
/M: SY='V'; M= -5,-30,-17,-33,-28,  2,-33,-28, 33,-25, 22, 15,-27,-27,-25,-23,-17, -5, 36,-25, -5,-28;
/I:         I=-26; MD=-27;
/M: SY='G'; M= -1, -8,-14,-10,-13,-16, 17,-15,-20,-12,-17,-12, -3,-16,-13,-12,  5,  2,-12,-21,-13,-13; D=-26;
/I:         I=-26; MD=-27;
/M: SY='T'; M=  0,-10, -6,-15,-13, -3,-12,-15, -2,-14, -4, -1, -6,-16,-12,-13,  5, 10,  3,-23, -8,-13; D=-26;
/I:         I=-26; MD=-27;
/M: SY='N'; M= -6, 11,-19,  6,  5,-18,-10,  3,-17,  8,-17,-10, 16,-12,  4,  6,  0, -2,-17,-24,-11,  4; D=-26;
/I:         I=-26; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='F'; M=-18,-22,-24,-26,-18, 34,-27, -6, -7, -9,  1, -2,-15,-27,-18,  7,-16, -9, -6,  2, 26,-18;
/M: SY='Q'; M= -7,  5,-24,  5,  9,-28,-18, -3,-16,  3,-18, -8,  4,-12, 22,  0,  5,  3,-16,-27,-12, 15;
/M: SY='E'; M= -8, 10,-25, 12, 15,-27,-14, -7,-24,  6,-22,-16,  5,  1,  7, -2,  3,  4,-21,-29,-17, 10;
/M: SY='K'; M=  0,  4,-25,  0,  1,-26, -2, -4,-25, 15,-27,-14, 10, -8,  1,  5,  2, -6,-21,-26,-16,  0;
/M: SY='G'; M= -4, -6,-23, -8, -9,-17,  8,  1,-22, -8,-19,-11,  1,-18, -5, -4,  5, -3,-16,-24, -9, -8;
/M: SY='I'; M= -6,-15,-24,-20,-19, -5,-11,-19,  6,-19,  2,  3,-10,-22,-16,-18,-10, -7,  3,-10, -7,-18;
/M: SY='S'; M= -2, -5,-19, -8, -5,-16,-15, -7,-11,  1,-15, -7,  1,-17,  0,  5,  6,  3, -5,-28,-10, -3;
/M: SY='T'; M= -2, -7,-14,-11, -8, -9,-13,-11,-12, -7,-12, -7, -2,-16, -4, -5,  9, 12, -7,-25, -7, -6;
/M: SY='T'; M= -6, -9,-15,-11, -1,-16,-22,-13, -6,  1, -8,  0, -8,-16,  1, -1, -2,  4, -2,-27,-11, -1;
/M: SY='V'; M= -5,-25,-17,-29,-23, 11,-29,-24, 17,-18, 10,  7,-23,-26,-22,-17,-12, -3, 24,-20, -1,-22;
/M: SY='S'; M=  7, -1,-11, -3, -3,-17, -5,-11,-16,-10,-24,-14,  7,-11, -2,-10, 33, 24, -7,-37,-17, -2;
/M: SY='E'; M= -5, 11,-25, 17, 28,-29,-16, -4,-26,  4,-22,-17,  3, -2, 12, -3,  5, -1,-23,-30,-18, 20;
/M: SY='S'; M=  1, -4,-15, -5, -1,-14,-13,-14,-13, -8,-17,-13, -1, -8, -4, -8, 17, 17, -5,-31,-14, -3;
/M: SY='S'; M=  7, -6, -8, -9, -8,-12, -5,-16,-13,-13,-19,-14,  0,-14, -9,-13, 24, 18, -2,-33,-16, -8;
/M: SY='T'; M= -3, -5,-22, -8, -4,-12,-20, -8, -3, -5, -7, -3, -4,-16, -4, -6, -2,  1, -2,-23, -4, -6;
/M: SY='I'; M=  0,-19,-12,-28,-22, -5,-29,-26, 21,-22,  7,  6,-15,-19,-18,-22, -5,  8, 19,-25, -7,-22;
/M: SY='Y'; M= -3,-12,-20,-16,-13, 11,-18, -7, -8,-10, -5, -5, -9,-20,-12, -6, -2,  1, -5, -9, 14,-13;
/M: SY='P'; M=-10, -9,-32, -5,  6,-23,-18, -4,-21,  6,-22,-13, -7, 21,  3,  4, -8,-10,-22,-23,-13,  1;
/M: SY='H'; M= -4, -7,-24, -8,  1,-18,-13,  4,-16,  4,-13, -5, -5,-16,  2,  3, -5, -7,-12,-22, -5,  0;
/M: SY='G'; M= -5,  1,-26,  2,  1,-23,  4, -4,-25, -4,-24,-16,  4, -1, -4, -9,  3, -5,-22,-26,-15, -3;
/M: SY='N'; M= -8, 19,-26, 18,  3,-29, 13, -4,-31,  1,-29,-20, 22,-15, -2, -4,  4, -8,-28,-31,-21,  1;
/M: SY='S'; M= -1,  4,-17,  1,  1,-22,  0,-10,-23, -2,-23,-16,  7,-13,  0, -3, 13, 10,-17,-31,-18,  0;
/I:         I=-24; MD=-25;
/M: SY='H'; M= -8, -3,-17, -6, -7, -9,  0, 11,-19, -5,-15, -8,  3,-16, -4, -2, -2, -6,-16,-14,  3, -7; D=-24;
/I:         I=-24; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='F'; M=-14,-25,-20,-30,-23, 36,-27,-15,  6,-19, 13,  7,-19,-26,-24, -9,-19, -9,  6, -4, 15,-22; D=-24;
/I:         I=-24; DM=-25;
/M: SY='W'; M=-19,-38,-47,-39,-29, 12,-18,-28,-18,-20,-17,-15,-37,-29,-20,-20,-37,-28,-27,130, 27,-20;
/M: SY='K'; M= -8, -6,-22, -7,  1,-21,-16,-10,-19, 19,-20, -8, -4,-15,  3, 14, -4, -5,-11,-22, -8,  1;
/M: SY='H'; M=-20, -3,-30, -3, -3,-12,-22, 87,-25,-10,-17,  0,  5,-22,  7, -2,-12,-18,-27,-20, 30, -3;
/M: SY='W'; M=-12,-22,-36,-24,-17, -3,-15,-14,-17, -9,-17,-10,-20,-23, -7,-10,-22,-19,-20, 62, 11,-10;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-20,-37,-29,  1,-38,-28, 41,-28, 18, 16,-21,-23,-21,-28,-19, -9, 27,-20,  1,-29;
/M: SY='S'; M=  0,  9,-18, 11,  5,-24,-10,-10,-23, -2,-25,-19,  7, -4, -1, -7, 18, 14,-15,-35,-18,  2;
/M: SY='T'; M=  1,  0,-11, -9, -9,-12,-14,-19,-12,-10,-13,-12,  1,-10, -9,-10, 22, 43, -2,-31,-12, -9;
/M: SY='K'; M= -4, -2,-22, -4, -1,-20,-18,-12,-13, 14,-17, -8,  0,-16, -1,  9, -2, -2, -4,-27,-13, -1;
/M: SY='E'; M= -7,  2,-27,  6,  7,-19,-14,  4,-20, -4,-15,-12, -1, -1, -1, -6, -5, -9,-20,-24, -7,  1;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='H'; M=-16,  9,-21, 13,  1,-18,-18, 19,-18, -6,-14, -1,  3,-18,  5, -7, -7,-11,-17,-28, -2,  2;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='L'; M= -1,-13, -4,-16,-15,-10, -2,-17, -9,-21,  3, -4, -8,-23,-15,-18, -3, -5, -7,-29,-15,-15;
/M: SY='P'; M= -7,-20,-35,-15, -4,-24,-22,-18, -9,-12,-18, -9,-19, 59, -7,-19,-11,-10,-19,-27,-23,-10;
/M: SY='I'; M= -6,-27,-20,-33,-25,  8,-29,-21, 27,-23, 22, 22,-24,-24,-20,-21,-18, -7, 22,-19,  0,-23;
/M: SY='V'; M= -5,-30,-16,-32,-28,  6,-29,-26, 25,-21, 14, 14,-28,-28,-25,-20,-16, -5, 34,-16, -3,-27;
/M: SY='S'; M= 15,  3, -4,  1, -3,-22, -4,-13,-20,-10,-23,-18,  6,-13, -5,-14, 21,  9,-10,-35,-20, -4;
/M: SY='V'; M= -4,-17,-10,-19,-13, -7,-25,-21,  6,-15,  3,  2,-17,-15,-15,-14, -4,  8, 14,-29,-11,-15;
/I:         I=-30; MD=-32;
/M: SY='S'; M=  0,  3,-19,  2,  6,-22,-11, -9,-22, 10,-23,-14,  4,-10,  3,  8, 11,  7,-14,-28,-14,  4; D=-30;
/I:         I=-30; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='D'; M=-14, 35,-25, 48, 15,-33,-12, -4,-32, -2,-26,-25, 14,-10, -1,-10,  6,  1,-22,-38,-18,  7;
/M: SY='G'; M= -7, -5,-27, -9,-12,-21, 24,-10,-24, -6,-17, -7,  4,-20, -8,  0, -5,-13,-21,-23,-19,-11;
/M: SY='K'; M= -5, -6, -4, -9, -4,-16,-19,  1,-22,  7,-19, -9, -4,-19,  1,  1, -6, -9,-15,-23, -4, -2;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-26,-38,-30,  0,-38,-30, 45,-28, 19, 18,-22,-22,-22,-28,-18, -8, 33,-22, -2,-30;
/M: SY='V'; M= -3,-25,-15,-26,-26, -1,-30,-27, 27,-21, 13, 10,-26,-27,-26,-21,-12, -2, 38,-28, -8,-26;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='F'; M=-13,-30,-25,-39,-29, 29,-35,-25, 28,-30, 19, 13,-21,-25,-27,-25,-21,-10, 18,-10, 10,-29;
/M: SY='H'; M=-20,  2,-30,  1,  0,-20,-19, 96,-30,-10,-20, -1, 12,-20, 10,  0, -9,-19,-30,-30, 18,  0;
/M: SY='S'; M=  5, -3,-14, -5, -7,-17,  0,-13,-12,-12,-22,-14,  6,-14, -7,-12, 24, 12, -4,-35,-18, -7;
/M: SY='L'; M=  2,-22,-20,-24,-18, -4, -7,-19,  4,-24, 21,  8,-19,-24,-17,-20,-15, -9,  1,-21, -9,-18;
/M: SY='G'; M=  7, -9,-16,-14,-12,-18,  9,-13,-18,-10,-16, -8, -5,-17, -7, -8,  5,  0,-10,-22,-13,-10;
/M: SY='S'; M=  5,  3,-20, -1, -3,-21, -2, -1,-17, -7,-19,-12,  9,-12, -1, -7, 10, -1,-15,-30,-15, -3;
/I:         I=-26; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='T'; M= -9,  0,-20, -1, -4,-12,-19, -4, -5, -4, -7, -2, -1,-16, -1, -5, -3,  1, -4,-22, -2, -4; D=-26;
/I:         I=-26; DM=-27;
/M: SY='N'; M= -3,  6,-18,  1, -5,-16, -9, -6,-10, -4,-13, -7,  8,-15, -5, -5,  2,  4, -6,-27,-13, -6; D=-26;
/I:         I=-26; DM=-27;
/M: SY='K'; M= -6,  3,-23, -1, -2,-21, -8, -8,-19,  8,-21,-11,  7,-15,  0,  7,  2,  1,-14,-26,-12, -2;
/M: SY='N'; M= -4,  6,-23,  4,  3,-20, -7, -6,-21,  5,-18,-11,  7,-14,  0,  2,  1, -2,-17,-25,-11,  1;
/M: SY='R'; M= -9, -7,-16, -8, -1,-18,-14, -8,-12, -2,-11, -5, -5,-18,  0,  4, -4, -6, -7,-27,-13, -2;
/M: SY='N'; M= -9, 33,-20, 18,  2,-20, -3,  5,-19, -1,-27,-19, 47,-18, -1, -2, 10,  2,-24,-39,-19,  0;
/M: SY='Y'; M=-14,-14,-25,-16,-10, 18,-26,  0, -4, -7, -1, -1,-13,-23,-11, -8,-13, -6, -6,  2, 31,-12;
/M: SY='F'; M=-16,-27,-22,-34,-26, 52,-21,-15,  0,-26, 11,  3,-19,-29,-31,-19,-19,-11, -2,  4, 24,-26;
/M: SY='T'; M= 11, -6,-15,-10, -3,-18,-13,-14,-11, -5,-14, -9, -4,-12,  0, -5, 12, 13, -3,-27,-15, -2;
/M: SY='P'; M=  9,-10,-18,-11, -7,-22, -5,-12,-16,-10,-20,-14, -6, 13, -8,-16,  6,  1,-13,-28,-20, -9;
/M: SY='F'; M=-13,-30,-19,-37,-29, 43,-31,-23, 17,-27, 13,  8,-23,-28,-32,-21,-18, -8, 18, -6, 14,-29;
/M: SY='P'; M= -8, -4,-24, -5, -6,-11,-17,-15,-16,-11,-18,-14, -5, 20,-12,-14,  2, 14,-15,-25,-11,-10;
/M: SY='E'; M= -5,  2,-19,  6, 11,-26,-13,-10,-25,  1,-22,-17, -1,  4,  3, -2,  3, -1,-20,-30,-19,  6;
/M: SY='D'; M=-10, 18,-26, 24, 10,-25,-11, -3,-23, -4,-22,-19, 10,  0, -3,-10, -1, -7,-20,-33,-18,  3;
/M: SY='F'; M= -8,-22,-16,-30,-25, 30,-26,-21, 10,-22,  8,  5,-17,-26,-28,-18,-11, -1, 15,-12,  7,-24;
/M: SY='E'; M= -9,  0,-24, -1,  2,-15,-17, -9, -5, -7, -5, -3,  2,-12, -5, -9, -6, -5, -7,-29,-13, -2;
/M: SY='E'; M= -5, 10,-24, 14, 20,-27,-14, -6,-23,  5,-20,-16,  3, -9,  8, -2,  4,  1,-18,-30,-17, 14;
/M: SY='E'; M= -6, -4,-22, -4,  2, -4,-21,-12,-10, -6, -4, -6, -7,-16, -6, -8, -5,  1, -7,-20, -4, -2;
/M: SY='L'; M=-11,-26,-22,-30,-24, 16,-31,-16, 21,-24, 23, 12,-23,-28,-21,-20,-21, -8, 14,-10, 15,-24;
/I:         I=-28; MD=-29;
/M: SY='L'; M= -7, -4,-21, -8, -5, -6,-19,-11,  3,-14,  8,  1, -1,-19, -8,-13, -9, -6, -3,-25, -8, -7; D=-28;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='E'; M= -1, -4,-22, -2,  7,-20, -9,-10,-18, -2,-12,-11, -3,-13,  1,  2,  4, -1,-14,-27,-15,  3;
/M: SY='K'; M= -7, -2,-23, -5,  0,-19,-18, -9,-12,  3,-13, -5,  1, -1,  2, -2, -1,  2,-13,-28,-14,  1;
/M: SY='L'; M= -2,-11, -9,-12,-10,-13,-12,-17, -5,-17,  2, -3,-11,-19,-11,-17, -8, -6, -4,-27,-14,-11;
/M: SY='D'; M= -4,  8,-23, 12, 11,-24,-11, -3,-22, -4,-21,-17,  5, -1,  0, -8,  7,  1,-18,-33,-17,  5;
/I:         I=-19; MD=-19;
/M: SY='E'; M= -4,  7,-19,  8, 11,-21,-12, -3,-20, 10,-20,-13,  6, -9,  4,  4,  5,  1,-15,-25,-12,  7; D=-19;
/I:         I=-19; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='L'; M= -5, -7,-16, -7, -2, -9,-10, -4, -6, -8,  1, -2, -4,-15, -5, -4, -3, -3, -5,-22, -8, -4; D=-19;
/I:         I=-19; DM=-19;
/M: SY='E'; M=-10, -2,-26,  1, 16,-23,-13, -6,-17, -1,-15,-10, -3, -4,  8, -6, -5, -9,-20,-24,-12, 11;
/M: SY='W'; M=-11,-27,-39,-27,-16, -4,-18,-16,-17,-12,-17,-11,-26, -8,-11,-12,-25,-20,-23, 69, 10,-12;
/M: SY='L'; M= -7, -8,-18,-11, -8, -8,-22,-12,  0, -9,  2, -1, -5,-20, -8, -9, -7,  0, -1,-24, -5, -9;
/M: SY='K'; M=-10, -3,-18, -5, -3,-14,-16,-11,-18, 11,-18, -9, -2,-18, -2,  8, -6, -8,-11,-23, -9, -3;
/M: SY='D'; M=-11, -1,-28,  1, -5,-14, -3, -2,-23, -6,-21,-14,  1,  1, -8, -8, -5,-10,-20,-24,-12, -7;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='K'; M= -7, -7,-23, -8,  1,-18,-21,-11,-14, 18,-15, -6, -7,-15,  1, 11, -5, -2, -6,-22, -7,  1;
/M: SY='F'; M=-19,-26,-24,-32,-25, 55,-30, -4,  0,-23,  8,  1,-20,-30,-27,-16,-21,-11, -4, 16, 43,-25;
/M: SY='N'; M= -7, 25,-11, 13, -2,-20, -5,  1,-18, -4,-26,-18, 38,-19, -3, -5, 12,  4,-20,-39,-19, -2;
/M: SY='P'; M= -3, -4,-28, -1,  1,-25,-13,-15,-18, -5,-20,-15, -7, 23, -4,-10, -2, -2,-17,-28,-20, -4;
/M: SY='D'; M=-10, 25,-27, 31, 21,-28,-12,  0,-28,  2,-25,-22, 15, -5,  4, -6,  1, -8,-27,-31,-15, 12;
/M: SY='M'; M= -3, -7,-21,-12, -4,-12,-18, -4, -4, -5,  3,  8, -5,-17,  0, -5, -7, -2, -7,-24, -8, -2;
/M: SY='V'; M= -6,-25,-12,-30,-25, -2,-31,-21, 26,-24, 12, 10,-21,-25,-22,-22,-12, -3, 28,-27, -5,-25;
/M: SY='S'; M=  1,  5,-10,  5,  2,-26,  2,-10,-26, -6,-24,-18,  5,-14, -2,-10, 10, -2,-19,-32,-21,  0;
/M: SY='W'; M=-18,-34,-43,-34,-26,  7,-23,-18,-12,-19,-13,-12,-33,-23,-17,-19,-32,-24,-20, 98, 26,-19;
/M: SY='G'; M= -3,  5,-20,  6, -6,-29, 25,-12,-33, -5,-28,-20,  7,-17, -9, -7,  3,-11,-25,-28,-23, -8;
/M: SY='G'; M=  5, -1,-20, -4, -8,-23, 19,-13,-26,-10,-26,-18,  7,-12, -8,-10, 15,  4,-18,-29,-22, -8;
/M: SY='L'; M= -6,-22,-19,-27,-20,  3,-25,-11, 17,-21, 23, 21,-20,-25,-15,-17,-18, -8, 14,-22, -2,-18;
/M: SY='K'; M= -8,  1,-26, -2,  1,-20,-19, -3,-13,  6,-15, -7,  4,-10,  2,  4, -3, -2,-13,-27,-10,  0;
/M: SY='L'; M=  1,-20,-21,-22,-14, -6,-22,-19,  7,-17, 13,  4,-17,-11,-13,-14,-10, -3,  4,-24, -9,-15;
/M: SY='T'; M= -1, -6,-20,-11, -8,-14,-19,-15, -3, -3, -7, -3, -4,-17, -5, -6, -2,  3,  0,-22,-10, -7;
/M: SY='N'; M= -7,  8,-22,  7,  5,-16,-12, -6,-19, -2,-18,-12,  9, -9, -1,  0,  6,  2,-17,-30,-14,  1;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 38 in 38 different sequences
Number of true positive hits 38 in 38 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Peptidase C4
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
38 sequences

POL1_BAMMN  (P90245), POL1_BAYMG  (Q04574), POL1_BAYMJ  (Q01206), 
POL1_BAYMY  (Q9YJW3), POLG_BCMNN  (Q65399), POLG_BSTV1  (Q65730), 
POLG_BSTVG  (Q65729), POLG_BTMV   (Q6XW15), POLG_BVY3   (A0AUJ5), 
POLG_BYMV   (P17765), POLG_LMV0   (P31999), POLG_LMVE   (P89876), 
POLG_OMV    (P20234), POLG_PEMVC  (Q01500), POLG_PEMVM  (O56075), 
POLG_PPVD   (P13529), POLG_PPVEA  (Q01681), POLG_PPVNA  (P17766), 
POLG_PPVRA  (P17767), POLG_PPVSK  (Q84934), POLG_PRSVH  (Q01901), 
POLG_PSBMV  (P29152), POLG_PVMA   (Q85197), POLG_PVYHU  (Q02963), 
POLG_PVYN   (P18247), POLG_RGMVD  (O11436), POLG_SBMVG  (Q90069), 
POLG_SBMVN  (P21231), POLG_SPMMV  (P89201), POLG_TEV    (P04517), 
POLG_TRMVU  (A4KZ49), POLG_TUMVJ  (P89509), POLG_TUMVQ  (Q02597), 
POLG_TVMV   (P09814), POLG_WMV2U  (P18478), POLG_ZYMVC  (P18479), 
POLG_ZYMVR  (Q89330), POLG_ZYMVS  (O36979)
» More

PDB
[Detailed view]
4 PDB

1LVB; 1LVM; 1Q31; 3MMG

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission