PROSITE entry PS51436
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | POTYVIRUS_NIA_PRO |
| Accession [info] | PS51436 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-AUG-2011 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51436 |
| Associated ProRule [info] | PRU00766 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Potyvirus NIa protease (NIa-pro) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=219; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=214; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.9606562; R2=0.0154373; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2638.7468262; R2=22.7319775; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=392; H_SCORE=11550; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=230; H_SCORE=7867; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-100; I=-100; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='A'; M= 10, 0,-19, -4, -5,-22, 8,-12,-17,-10,-20,-14, 5,-14, -5,-13, 10, -1,-12,-28,-20, -5; /M: SY='K'; M= -6, -3,-24, -4, 3,-20,-20, -6,-17, 15,-17, -8, -4,-14, 0, 11, -4, -1, -8,-24, -8, 0; /M: SY='S'; M= 6, -3,-14, -4, -2,-15, -8,-11,-11,-12,-10, -9, 2,-14, -4,-12, 16, 9, -7,-33,-15, -3; /M: SY='M'; M= -7,-12,-22,-14, -3, -7,-23, -8, 3,-11, 6, 8,-11,-18, -3,-11, -7, -2, 0,-23, -3, -4; /M: SY='V'; M= -5,-20, -6,-24,-20, -1,-21, -8, 5,-20, 4, 4,-16,-25,-16,-18,-12, -8, 8,-21, 0,-19; /M: SY='R'; M= -5, -6,-23, -9, -2,-17,-15, -9,-14, 9,-15, -3, -3,-11, 2, 11, -2, -3, -9,-24,-12, -1; /M: SY='G'; M= 0, -6,-25, -7,-11,-25, 34, -7,-31,-13,-25,-16, 1,-16,-11,-13, 4, -5,-23,-24,-20,-12; /M: SY='L'; M= 0,-18,-21,-20,-13, -8,-12,-17, 1,-16, 10, 6,-17,-14,-12,-13,-10, -5, 0,-23,-11,-13; /M: SY='R'; M=-13, -9,-27,-10, 0,-19,-20, -6,-18, 15,-14, -7, -2,-13, 6, 36, -8, -7,-14,-23,-11, -1; /M: SY='D'; M= -3, 17,-13, 18, 1,-25,-11, -8,-23, -7,-21,-19, 12, -5, -6,-12, 3, 0,-19,-35,-20, -3; /M: SY='Y'; M=-15,-17,-26,-18,-16, 10,-28, 3, 5,-12, 5, 6,-16,-25, -8, -9,-16, -7, -1, 0, 33,-15; /M: SY='N'; M= -3, 21,-20, 15, 0,-21, -7, 0,-16, -6,-23,-16, 27,-15, -3, -9, 11, 2,-17,-36,-17, -2; /M: SY='P'; M= -7, -5,-30, -1, 0,-24,-11, -2,-20, -8,-24,-12, -5, 30, -1,-13, -2, -8,-24,-29,-18, -3; /M: SY='I'; M= -9,-27,-23,-32,-23, 7,-34,-24, 30,-22, 13, 11,-21,-23,-21,-21,-16, -7, 25,-18, 2,-24; /M: SY='A'; M= 13, -2,-16, -7, -5,-12, -4, -9,-14,-11,-16,-12, 2,-13, -8,-14, 13, 4, -8,-26,-13, -6; /M: SY='Q'; M= -3, -2,-22, -5, 0,-21,-15, 6,-14, 1,-16, -6, 3,-15, 8, 1, 4, -2,-12,-28, -8, 3; /M: SY='B'; M= -2, 7,-11, 3, -6,-18,-14, -1,-11,-10,-12, -9, 7,-20, -7,-11, 0, -3, -6,-33,-13, -7; /M: SY='I'; M= -6,-22,-22,-26,-17, -6,-30,-16, 24,-19, 9, 12,-18,-21,-11,-18,-11, -6, 21,-25, -5,-16; /M: SY='C'; M= 1,-17, 44,-24,-22,-15,-11,-24,-20,-18,-15,-13,-15,-29,-22,-18, -6, -9, -4,-34,-22,-22; /M: SY='R'; M= -7, -3,-24, -8, -3,-19,-16, -1,-12, 4,-15, -5, 4,-15, 5, 7, 0, -1,-12,-26, -9, -1; /M: SY='L'; M=-11,-26,-23,-29,-20, 2,-30,-18, 19,-19, 29, 20,-23,-26,-14, -8,-23,-10, 12,-20, -2,-19; /M: SY='V'; M= -3,-11,-21,-12, -3,-14,-16,-17, -4, -4, -5, -3,-11,-16, -7, -6, -4, 1, 2,-25,-12, -5; /M: SY='N'; M= -6, 9,-23, -1, -7,-14, 5, -4,-15, -8,-16,-12, 20,-20, -8, -7, 0, -7,-18,-26,-12, -8; /I: I=-30; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: M= -8, -5,-24, -6, -2, -8,-21, -6, -9, -5, -8, -7, -5,-13, -6, -3, -4, -1, -7,-20, 0, -6; /M: SY='S'; M= 1, -9,-12,-12,-12,-11,-12,-10, -1,-15,-10, -4, -1,-19,-10,-14, 10, 4, 3,-31,-11,-12; /M: SY='D'; M=-10, 14,-25, 18, 7,-23, -6, -5,-25, -1,-20,-16, 9,-14, 1, -3, 1, -5,-20,-29,-15, 4; /I: I=-28; MD=-29; /M: SY='G'; M= -5, -1,-25, -1,-11,-19, 19,-14,-22,-12,-20,-14, 1,-17,-11,-14, 1, -6,-16,-23,-16,-11; D=-28; /I: I=-28; MD=-29; /M: M= -5, -8,-16, -9, -6, -9,-10, -3, -8, -5, -5, -1, -7,-16, -6, -3, -6, -6, -5,-19, -5, -7; D=-28; /I: I=-28; MI=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='T'; M= -5, -5,-12, -8,-11,-14, -5,-16,-16, -5,-16,-11, -1,-19,-11, -4, 2, 3, -7,-27,-14,-12; /M: SY='D'; M= -9, 2,-23, 3, -5,-14, -1, -9,-22, -5,-16,-11, 2,-17, -7, 0, 1, 1,-16,-24,-10, -7; /M: SY='T'; M= -4, 0,-10, -3, 0,-17,-11, -9,-15, -9,-13,-11, 3,-15, -4, -8, 8, 10,-10,-32,-15, -2; /M: SY='M'; M= -4,-21,-20,-27,-19, -2,-23,-17, 18,-20, 18, 19,-17,-20,-11,-18,-12, -1, 11,-22, -4,-16; /M: SY='Y'; M=-12, -2,-23, -9,-10, 8,-19, 14,-10, -9,-10, -5, 6,-23, -4, -7, -6, -5,-14, -9, 20, -8; /M: SY='G'; M= -2,-14, 28,-18,-23,-26, 30,-24,-35,-23,-26,-20, -8,-27,-23,-24, -3,-16,-21,-31,-30,-23; /M: SY='I'; M=-10,-22,-22,-29,-24, 12,-30,-20, 23,-24, 16, 10,-16,-25,-22,-21,-16, -5, 17,-17, 4,-24; /M: SY='G'; M= -7,-18,-19,-22,-21, -2, 13,-20,-12,-20, -6, -5,-11,-23,-19,-18,-11,-14,-11,-16,-10,-20; /M: SY='Y'; M=-17,-18,-25,-22,-18, 25,-28, 15, -2,-17, 3, 2,-14,-26,-14,-12,-16, -6, -7, 4, 41,-18; /M: SY='G'; M= -3, -7,-28, -7,-12,-27, 41,-15,-31,-13,-22,-14, 0,-19, -9,-13, -1,-15,-25,-22,-23,-10; /M: SY='D'; M= -2, 11,-22, 14, 3,-26, -9, -9,-22, -6,-26,-19, 8, 7, -3,-11, 12, 3,-18,-35,-21, -1; /M: SY='W'; M=-15,-23,-32,-24,-17, 11,-25,-10, -6, -5, -8, -3,-21,-15,-13, -9,-21,-13, -9, 30, 25,-16; /M: SY='I'; M=-10,-26, -7,-33,-26, 1,-34,-22, 26,-27, 16, 12,-21,-25,-19,-25,-18, -9, 16,-21, 2,-26; /M: SY='I'; M= -9,-27,-25,-34,-26, -1,-35,-18, 37,-26, 18, 16,-20,-23,-19,-25,-18, -9, 27,-23, 0,-26; /M: SY='T'; M= 9,-13,-13,-21,-17, -4,-19,-20, 4,-14, 1, 3,-12,-17,-15,-16, 3, 17, 11,-24, -9,-16; /M: SY='P'; M= -7, 9,-28, 3, -1,-24,-10, -7,-19, -6,-28,-19, 17, 30, -6,-10, 2, -1,-27,-34,-24, -6; /M: SY='A'; M= 4,-11,-17,-14, -7,-12, -7, -3,-18, -2,-15, -9, -6,-18, 1, 4, -2, -7,-14,-14, -1, -5; /M: SY='H'; M=-19, 1,-30, 0, -1,-20,-15, 91,-30,-10,-21, -2, 12,-20, 8, -1, -9,-19,-30,-30, 16, -1; /I: I=-24; MD=-25; /M: SY='L'; M= -8,-25,-14,-27,-19, 7,-27,-19, 16,-25, 34, 15,-24,-26,-18,-18,-21, -3, 10,-20, -1,-19; D=-24; /I: I=-24; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='F'; M=-10,-21,-21,-28,-20, 36,-21,-16, -2,-19, 2, -1,-13,-24,-20,-13,-13, -9, -2, -5, 11,-18; /M: SY='K'; M=-10, 0,-25, -2, 4,-19,-17, -6,-18, 15,-18, -4, 1,-11, 6, 12, -3, -5,-14,-24,-10, 5; /M: SY='R'; M=-10, -1,-27, -2, 9,-23, -9, 2,-24, 11,-18, -8, 4,-15, 8, 21, -4, -9,-21,-25,-13, 7; /M: SY='N'; M= -5, 13,-15, 6, 1,-18, -4, -4,-22, -5,-24,-18, 20, -9, -4, -8, 6, -1,-22,-31,-16, -2; /M: SY='N'; M= -9, 20,-17, 13, 2,-24, 4, -2,-24, -5,-26,-19, 28,-12, -4, -7, 4, -6,-25,-35,-22, -1; /I: I=-30; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='G'; M= -4, 1,-28, 0,-11,-27, 38,-14,-32,-10,-25,-17, 6,-18,-13,-12, -1,-12,-26,-24,-24,-12; /I: I=-28; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='T'; M= -3, -1,-21, -3, 7,-19,-15,-12,-19, -1,-19,-14, 0, -5, 2, -5, 11, 14,-14,-21,-13, 4; /M: SY='L'; M= -9,-26,-20,-28,-19, 8,-29,-19, 18,-26, 35, 16,-25,-27,-16,-18,-22, -5, 11,-20, 0,-18; /M: SY='T'; M= -8, -6,-23, -9, 0,-16,-23,-13, -7, 1, -9, -5, -4,-13, 2, 5, 1, 10, -6,-25, -9, -1; /M: SY='I'; M= -9,-29,-22,-36,-28, 12,-34,-25, 32,-26, 21, 19,-23,-25,-23,-24,-20, -8, 25,-18, 2,-27; /M: SY='R'; M=-10, -7,-25,-10, -2,-16,-21, -4,-13, 8,-13, -3, -4,-11, 7, 11, -4, 0,-12,-20, -3, 1; /M: SY='T'; M= 0, -1, -7, -5, -7,-10,-13, -9,-15,-12,-16,-13, 2,-14, -8,-11, 19, 23, -7,-33,-11, -7; /M: SY='Q'; M= -4, -7,-18,-10, -2,-20,-18, -4,-14, 4,-14, -4, -5,-15, 8, 6, 1, 2,-10,-22, -9, 3; /M: SY='H'; M=-14, -4,-26, -7, -3,-12,-18, 35,-23, 1,-17, -4, 4,-19, 6, 17, -5, -8,-20,-24, 4, -1; /M: SY='G'; M= -2,-13,-28,-13,-21,-19, 54,-18,-32,-20,-24,-16, -4,-22,-21,-19, -3,-18,-23,-16,-20,-21; /M: SY='T'; M= -6, -7,-13, -9, -4,-14,-23, -9, -5, -9, -3, -2, -8,-18, -1, -9, -2, 7, 0,-28, -9, -3; /M: SY='F'; M=-17,-22,-22,-28,-23, 45,-29, -2, 0,-19, 3, -1,-18,-28,-24,-15,-15, -3, -2, 10, 43,-23; /M: SY='T'; M= -8, 7,-20, 6, 1,-19,-18,-11,-17, 4,-15,-12, 4,-13, -3, 3, 3, 13, -9,-29,-12, -1; /M: SY='I'; M= -8,-25,-14,-31,-24, 5,-31,-21, 23,-23, 18, 16,-22,-24,-19,-21,-16, -2, 19,-21, 1,-23; /M: SY='E'; M= -2, 0,-28, 2, 7,-28, 4,-11,-28, 1,-26,-18, 2, 7, -2, -4, 0, -9,-25,-27,-22, 1; /M: SY='N'; M= -4, 11,-22, 2, -4,-20, -7, -5,-16, 1,-22,-14, 20, -9, -4, 2, 4, 0,-17,-31,-17, -5; /M: SY='T'; M= -4,-12,-18,-17,-13, -6,-20,-15, 2,-16, 7, 7,-10, -8,-10,-14, -2, 10, 0,-27, -9,-12; /M: SY='T'; M= -2, -2, -9, -6, -4,-19,-13,-11,-17, -3,-16,-11, 0,-10, -5, -7, 4, 7,-10,-30,-15, -5; /M: SY='S'; M= 0, 0,-19, -4, 5,-20,-15, -8,-13, 2,-16, -8, 2,-13, 4, 1, 6, 4, -8,-28,-14, 4; /M: SY='L'; M=-10,-19,-10,-23,-15, -4,-29,-11, 10,-18, 13, 8,-15,-24,-11,-16,-17, -9, 5,-23, -1,-15; /M: SY='K'; M=-10, -1,-28, -3, 3,-24, -9, 1,-26, 18,-25,-10, 3,-12, 12, 14, -4, -9,-23,-20, -7, 7; /M: SY='I'; M= -6,-26,-10,-32,-26, -2,-30,-23, 27,-23, 15, 18,-22,-25,-19,-22,-14, -6, 25,-26, -6,-24; /I: I=-26; MD=-27; /M: SY='R'; M= -7, -7,-21, -8, -1,-12,-18, 5,-13, 6, -9, -2, -4,-14, 0, 8, -6, -3, -9,-19, -2, -2; D=-26; /I: I=-26; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='P'; M=-10, -6,-28, -3, 7,-23,-15, 4,-21, 8,-21,-10, -5, 18, 8, 4, -7,-10,-23,-21,-11, 5; D=-26; /I: I=-26; DM=-27; /M: SY='V'; M= -7,-27,-15,-31,-27, 20,-29,-24, 23,-23, 12, 9,-23,-25,-27,-20,-14, -5, 28,-15, 3,-27; D=-26; /I: I=-26; DM=-27; /M: SY='E'; M= -5, -7,-22, -5, 7,-19,-17,-12,-17, 4,-15,-11, -9, 2, -2, -4, -4, -2,-13,-24,-12, 2; /M: SY='G'; M= -8, 9,-27, 9, -2,-27, 20, -8,-29, -3,-23,-13, 10,-16, -6, -6, -2,-12,-24,-27,-21, -4; /M: SY='R'; M=-13,-14,-21,-17, -9, -4,-23, 1, -8, 1, -4, 4, -9,-21, -2, 11,-11, -7, -7,-19, 2, -7; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='L'; M= -9,-29,-22,-33,-24, 5,-32,-22, 30,-27, 34, 23,-26,-26,-19,-22,-24, -9, 19,-21, -1,-23; /M: SY='V'; M= -2,-27,-17,-31,-26, 0,-30,-26, 30,-23, 17, 15,-25,-25,-23,-22,-14, -3, 33,-25, -6,-26; /M: SY='I'; M= 2,-26,-20,-32,-25, -3,-25,-27, 27,-24, 15, 11,-22,-23,-21,-24,-13, -6, 26,-23, -7,-25; /M: SY='I'; M=-10,-27,-20,-33,-25, 6,-30,-22, 26,-26, 17, 13,-21,-24,-18,-23,-19,-10, 17,-17, 3,-24; /M: SY='R'; M=-12, -6,-27, -7, 3,-24,-20, -6,-23, 23,-20, -8, -2,-11, 13, 33, -5, -2,-16,-22,-11, 6; /M: SY='M'; M=-11,-20,-18,-24,-16, -1,-21,-10, 7,-13, 22, 23,-17,-25, -9, -2,-21,-10, 2,-22, -4,-13; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='K'; M= -3, -5,-26, -7, 3,-26,-14,-10,-20, 21,-21, -5, -3, -8, 9, 12, -4, -6,-15,-22,-12, 5; /M: SY='D'; M=-16, 36,-27, 49, 13,-34,-13, -4,-30, -2,-24,-23, 14,-11, 1,-10, 2, -2,-23,-36,-17, 7; /M: SY='F'; M=-14,-28,-16,-35,-27, 41,-29,-17, 11,-26, 14, 10,-22,-28,-29,-19,-19, -9, 11, -7, 14,-26; /M: SY='P'; M= -7,-14,-33, -9, 1,-28,-19,-13,-19, -3,-24,-14,-13, 46, 3, -5, -5, -5,-23,-27,-22, -1; /M: SY='P'; M= -4,-20,-35,-13, -4,-26,-19,-21,-14,-11,-22,-16,-20, 68,-12,-20, -9, -9,-21,-29,-27,-12; /M: SY='F'; M= -9,-25,-19,-32,-23, 39,-25,-17, 0,-18, 7, 3,-18,-26,-26, -7,-15, -8, 4, -5, 12,-22; /M: SY='P'; M=-10,-11,-29, -8, 1,-25,-20,-10,-24, 13,-25,-14, -8, 26, -1, 13, -7, -5,-22,-26,-18, -3; /M: SY='Q'; M= -7, -4,-18, -6, 6,-28,-18, 0,-20, 13,-20, -3, -2,-14, 23, 12, -1, -5,-18,-24,-11, 14; /M: SY='R'; M= -9, -8,-18, -9, -5,-16,-21,-12,-12, 8, -9, -4, -5,-17, -2, 12, -5, -2, -8,-26,-10, -5; /M: SY='L'; M= -1,-17,-20,-20,-12, -7,-22,-16, 7,-11, 13, 9,-14,-21, -8,-11,-12, -6, 4,-23, -7,-11; /M: SY='R'; M= -8, -8, -6,-13, -5,-21,-22, -9,-15, 7,-15, -6, -5,-18, 3, 10, -5, -3, -9,-26,-11, -3; /M: SY='F'; M=-11,-27,-20,-35,-26, 53,-27,-18, 4,-26, 12, 4,-20,-27,-31,-20,-18, -9, 2, 2, 21,-26; /M: SY='R'; M=-17, -8,-28, -8, 4,-16,-19, -2,-27, 21,-19,-11, 0,-18, 9, 51, -6, -8,-19,-21,-10, 3; /M: SY='E'; M= 7, -3,-24, -4, 9,-24, -9,-11,-17, 1,-19,-11, -2, 2, 3, -7, 3, -4,-15,-26,-18, 5; /M: SY='P'; M= -6,-20,-35,-14, -4,-24,-20,-20,-12,-12,-20,-13,-19, 67,-11,-20,-10, -8,-21,-28,-25,-12; /M: SY='K'; M=-11, 0,-22, -1, 1,-20,-22,-11,-11, 9,-15, -7, 1,-15, 0, 7, -6, -4, -8,-27,-11, -1; /M: SY='E'; M= -7, -3,-23, -1, 7,-20,-18, -2,-15, 0,-12, -6, -4, -9, 6, 3, 0, -1,-12,-28,-12, 5; /M: SY='G'; M= -5, 2,-21, 6, -2,-29, 21,-13,-33, -9,-28,-21, 4, -5, -9,-12, 3,-10,-26,-29,-25, -6; /M: SY='E'; M=-11, 15,-27, 23, 35,-27,-18, -2,-24, 3,-17,-14, 3, -7, 9, -5, -1, -6,-21,-32,-17, 22; /M: SY='R'; M=-11, -3,-27, -1, 10,-22,-21, -5,-19, 16,-16, -9, -2,-13, 6, 19, -5, -5,-14,-25,-11, 7; /M: SY='V'; M= 9,-25,-16,-31,-25, -5,-26,-28, 26,-21, 8, 8,-22,-22,-22,-23, -8, -3, 32,-25, -9,-25; /M: SY='C'; M= -8,-17, 25,-22,-18,-14,-27,-17, -4,-15, -8, -2,-15,-27, -9,-13, -8, -5, 4,-31,-11,-14; /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-21, 5,-26,-13, 22,-22, 35, 35,-26,-26,-12,-16,-25,-10, 12,-20, 0,-17; /M: SY='V'; M= -5,-30,-17,-33,-28, 2,-33,-28, 33,-25, 22, 15,-27,-27,-25,-23,-17, -5, 36,-25, -5,-28; /I: I=-26; MD=-27; /M: SY='G'; M= -1, -8,-14,-10,-13,-16, 17,-15,-20,-12,-17,-12, -3,-16,-13,-12, 5, 2,-12,-21,-13,-13; D=-26; /I: I=-26; MD=-27; /M: SY='T'; M= 0,-10, -6,-15,-13, -3,-12,-15, -2,-14, -4, -1, -6,-16,-12,-13, 5, 10, 3,-23, -8,-13; D=-26; /I: I=-26; MD=-27; /M: SY='N'; M= -6, 11,-19, 6, 5,-18,-10, 3,-17, 8,-17,-10, 16,-12, 4, 6, 0, -2,-17,-24,-11, 4; D=-26; /I: I=-26; MI=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='F'; M=-18,-22,-24,-26,-18, 34,-27, -6, -7, -9, 1, -2,-15,-27,-18, 7,-16, -9, -6, 2, 26,-18; /M: SY='Q'; M= -7, 5,-24, 5, 9,-28,-18, -3,-16, 3,-18, -8, 4,-12, 22, 0, 5, 3,-16,-27,-12, 15; /M: SY='E'; M= -8, 10,-25, 12, 15,-27,-14, -7,-24, 6,-22,-16, 5, 1, 7, -2, 3, 4,-21,-29,-17, 10; /M: SY='K'; M= 0, 4,-25, 0, 1,-26, -2, -4,-25, 15,-27,-14, 10, -8, 1, 5, 2, -6,-21,-26,-16, 0; /M: SY='G'; M= -4, -6,-23, -8, -9,-17, 8, 1,-22, -8,-19,-11, 1,-18, -5, -4, 5, -3,-16,-24, -9, -8; /M: SY='I'; M= -6,-15,-24,-20,-19, -5,-11,-19, 6,-19, 2, 3,-10,-22,-16,-18,-10, -7, 3,-10, -7,-18; /M: SY='S'; M= -2, -5,-19, -8, -5,-16,-15, -7,-11, 1,-15, -7, 1,-17, 0, 5, 6, 3, -5,-28,-10, -3; /M: SY='T'; M= -2, -7,-14,-11, -8, -9,-13,-11,-12, -7,-12, -7, -2,-16, -4, -5, 9, 12, -7,-25, -7, -6; /M: SY='T'; M= -6, -9,-15,-11, -1,-16,-22,-13, -6, 1, -8, 0, -8,-16, 1, -1, -2, 4, -2,-27,-11, -1; /M: SY='V'; M= -5,-25,-17,-29,-23, 11,-29,-24, 17,-18, 10, 7,-23,-26,-22,-17,-12, -3, 24,-20, -1,-22; /M: SY='S'; M= 7, -1,-11, -3, -3,-17, -5,-11,-16,-10,-24,-14, 7,-11, -2,-10, 33, 24, -7,-37,-17, -2; /M: SY='E'; M= -5, 11,-25, 17, 28,-29,-16, -4,-26, 4,-22,-17, 3, -2, 12, -3, 5, -1,-23,-30,-18, 20; /M: SY='S'; M= 1, -4,-15, -5, -1,-14,-13,-14,-13, -8,-17,-13, -1, -8, -4, -8, 17, 17, -5,-31,-14, -3; /M: SY='S'; M= 7, -6, -8, -9, -8,-12, -5,-16,-13,-13,-19,-14, 0,-14, -9,-13, 24, 18, -2,-33,-16, -8; /M: SY='T'; M= -3, -5,-22, -8, -4,-12,-20, -8, -3, -5, -7, -3, -4,-16, -4, -6, -2, 1, -2,-23, -4, -6; /M: SY='I'; M= 0,-19,-12,-28,-22, -5,-29,-26, 21,-22, 7, 6,-15,-19,-18,-22, -5, 8, 19,-25, -7,-22; /M: SY='Y'; M= -3,-12,-20,-16,-13, 11,-18, -7, -8,-10, -5, -5, -9,-20,-12, -6, -2, 1, -5, -9, 14,-13; /M: SY='P'; M=-10, -9,-32, -5, 6,-23,-18, -4,-21, 6,-22,-13, -7, 21, 3, 4, -8,-10,-22,-23,-13, 1; /M: SY='H'; M= -4, -7,-24, -8, 1,-18,-13, 4,-16, 4,-13, -5, -5,-16, 2, 3, -5, -7,-12,-22, -5, 0; /M: SY='G'; M= -5, 1,-26, 2, 1,-23, 4, -4,-25, -4,-24,-16, 4, -1, -4, -9, 3, -5,-22,-26,-15, -3; /M: SY='N'; M= -8, 19,-26, 18, 3,-29, 13, -4,-31, 1,-29,-20, 22,-15, -2, -4, 4, -8,-28,-31,-21, 1; /M: SY='S'; M= -1, 4,-17, 1, 1,-22, 0,-10,-23, -2,-23,-16, 7,-13, 0, -3, 13, 10,-17,-31,-18, 0; /I: I=-24; MD=-25; /M: SY='H'; M= -8, -3,-17, -6, -7, -9, 0, 11,-19, -5,-15, -8, 3,-16, -4, -2, -2, -6,-16,-14, 3, -7; D=-24; /I: I=-24; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='F'; M=-14,-25,-20,-30,-23, 36,-27,-15, 6,-19, 13, 7,-19,-26,-24, -9,-19, -9, 6, -4, 15,-22; D=-24; /I: I=-24; DM=-25; /M: SY='W'; M=-19,-38,-47,-39,-29, 12,-18,-28,-18,-20,-17,-15,-37,-29,-20,-20,-37,-28,-27,130, 27,-20; /M: SY='K'; M= -8, -6,-22, -7, 1,-21,-16,-10,-19, 19,-20, -8, -4,-15, 3, 14, -4, -5,-11,-22, -8, 1; /M: SY='H'; M=-20, -3,-30, -3, -3,-12,-22, 87,-25,-10,-17, 0, 5,-22, 7, -2,-12,-18,-27,-20, 30, -3; /M: SY='W'; M=-12,-22,-36,-24,-17, -3,-15,-14,-17, -9,-17,-10,-20,-23, -7,-10,-22,-19,-20, 62, 11,-10; /M: SY='I'; M= -9,-29,-20,-37,-29, 1,-38,-28, 41,-28, 18, 16,-21,-23,-21,-28,-19, -9, 27,-20, 1,-29; /M: SY='S'; M= 0, 9,-18, 11, 5,-24,-10,-10,-23, -2,-25,-19, 7, -4, -1, -7, 18, 14,-15,-35,-18, 2; /M: SY='T'; M= 1, 0,-11, -9, -9,-12,-14,-19,-12,-10,-13,-12, 1,-10, -9,-10, 22, 43, -2,-31,-12, -9; /M: SY='K'; M= -4, -2,-22, -4, -1,-20,-18,-12,-13, 14,-17, -8, 0,-16, -1, 9, -2, -2, -4,-27,-13, -1; /M: SY='E'; M= -7, 2,-27, 6, 7,-19,-14, 4,-20, -4,-15,-12, -1, -1, -1, -6, -5, -9,-20,-24, -7, 1; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='H'; M=-16, 9,-21, 13, 1,-18,-18, 19,-18, -6,-14, -1, 3,-18, 5, -7, -7,-11,-17,-28, -2, 2; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='L'; M= -1,-13, -4,-16,-15,-10, -2,-17, -9,-21, 3, -4, -8,-23,-15,-18, -3, -5, -7,-29,-15,-15; /M: SY='P'; M= -7,-20,-35,-15, -4,-24,-22,-18, -9,-12,-18, -9,-19, 59, -7,-19,-11,-10,-19,-27,-23,-10; /M: SY='I'; M= -6,-27,-20,-33,-25, 8,-29,-21, 27,-23, 22, 22,-24,-24,-20,-21,-18, -7, 22,-19, 0,-23; /M: SY='V'; M= -5,-30,-16,-32,-28, 6,-29,-26, 25,-21, 14, 14,-28,-28,-25,-20,-16, -5, 34,-16, -3,-27; /M: SY='S'; M= 15, 3, -4, 1, -3,-22, -4,-13,-20,-10,-23,-18, 6,-13, -5,-14, 21, 9,-10,-35,-20, -4; /M: SY='V'; M= -4,-17,-10,-19,-13, -7,-25,-21, 6,-15, 3, 2,-17,-15,-15,-14, -4, 8, 14,-29,-11,-15; /I: I=-30; MD=-32; /M: SY='S'; M= 0, 3,-19, 2, 6,-22,-11, -9,-22, 10,-23,-14, 4,-10, 3, 8, 11, 7,-14,-28,-14, 4; D=-30; /I: I=-30; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='D'; M=-14, 35,-25, 48, 15,-33,-12, -4,-32, -2,-26,-25, 14,-10, -1,-10, 6, 1,-22,-38,-18, 7; /M: SY='G'; M= -7, -5,-27, -9,-12,-21, 24,-10,-24, -6,-17, -7, 4,-20, -8, 0, -5,-13,-21,-23,-19,-11; /M: SY='K'; M= -5, -6, -4, -9, -4,-16,-19, 1,-22, 7,-19, -9, -4,-19, 1, 1, -6, -9,-15,-23, -4, -2; /M: SY='I'; M= -8,-30,-26,-38,-30, 0,-38,-30, 45,-28, 19, 18,-22,-22,-22,-28,-18, -8, 33,-22, -2,-30; /M: SY='V'; M= -3,-25,-15,-26,-26, -1,-30,-27, 27,-21, 13, 10,-26,-27,-26,-21,-12, -2, 38,-28, -8,-26; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='F'; M=-13,-30,-25,-39,-29, 29,-35,-25, 28,-30, 19, 13,-21,-25,-27,-25,-21,-10, 18,-10, 10,-29; /M: SY='H'; M=-20, 2,-30, 1, 0,-20,-19, 96,-30,-10,-20, -1, 12,-20, 10, 0, -9,-19,-30,-30, 18, 0; /M: SY='S'; M= 5, -3,-14, -5, -7,-17, 0,-13,-12,-12,-22,-14, 6,-14, -7,-12, 24, 12, -4,-35,-18, -7; /M: SY='L'; M= 2,-22,-20,-24,-18, -4, -7,-19, 4,-24, 21, 8,-19,-24,-17,-20,-15, -9, 1,-21, -9,-18; /M: SY='G'; M= 7, -9,-16,-14,-12,-18, 9,-13,-18,-10,-16, -8, -5,-17, -7, -8, 5, 0,-10,-22,-13,-10; /M: SY='S'; M= 5, 3,-20, -1, -3,-21, -2, -1,-17, -7,-19,-12, 9,-12, -1, -7, 10, -1,-15,-30,-15, -3; /I: I=-26; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='T'; M= -9, 0,-20, -1, -4,-12,-19, -4, -5, -4, -7, -2, -1,-16, -1, -5, -3, 1, -4,-22, -2, -4; D=-26; /I: I=-26; DM=-27; /M: SY='N'; M= -3, 6,-18, 1, -5,-16, -9, -6,-10, -4,-13, -7, 8,-15, -5, -5, 2, 4, -6,-27,-13, -6; D=-26; /I: I=-26; DM=-27; /M: SY='K'; M= -6, 3,-23, -1, -2,-21, -8, -8,-19, 8,-21,-11, 7,-15, 0, 7, 2, 1,-14,-26,-12, -2; /M: SY='N'; M= -4, 6,-23, 4, 3,-20, -7, -6,-21, 5,-18,-11, 7,-14, 0, 2, 1, -2,-17,-25,-11, 1; /M: SY='R'; M= -9, -7,-16, -8, -1,-18,-14, -8,-12, -2,-11, -5, -5,-18, 0, 4, -4, -6, -7,-27,-13, -2; /M: SY='N'; M= -9, 33,-20, 18, 2,-20, -3, 5,-19, -1,-27,-19, 47,-18, -1, -2, 10, 2,-24,-39,-19, 0; /M: SY='Y'; M=-14,-14,-25,-16,-10, 18,-26, 0, -4, -7, -1, -1,-13,-23,-11, -8,-13, -6, -6, 2, 31,-12; /M: SY='F'; M=-16,-27,-22,-34,-26, 52,-21,-15, 0,-26, 11, 3,-19,-29,-31,-19,-19,-11, -2, 4, 24,-26; /M: SY='T'; M= 11, -6,-15,-10, -3,-18,-13,-14,-11, -5,-14, -9, -4,-12, 0, -5, 12, 13, -3,-27,-15, -2; /M: SY='P'; M= 9,-10,-18,-11, -7,-22, -5,-12,-16,-10,-20,-14, -6, 13, -8,-16, 6, 1,-13,-28,-20, -9; /M: SY='F'; M=-13,-30,-19,-37,-29, 43,-31,-23, 17,-27, 13, 8,-23,-28,-32,-21,-18, -8, 18, -6, 14,-29; /M: SY='P'; M= -8, -4,-24, -5, -6,-11,-17,-15,-16,-11,-18,-14, -5, 20,-12,-14, 2, 14,-15,-25,-11,-10; /M: SY='E'; M= -5, 2,-19, 6, 11,-26,-13,-10,-25, 1,-22,-17, -1, 4, 3, -2, 3, -1,-20,-30,-19, 6; /M: SY='D'; M=-10, 18,-26, 24, 10,-25,-11, -3,-23, -4,-22,-19, 10, 0, -3,-10, -1, -7,-20,-33,-18, 3; /M: SY='F'; M= -8,-22,-16,-30,-25, 30,-26,-21, 10,-22, 8, 5,-17,-26,-28,-18,-11, -1, 15,-12, 7,-24; /M: SY='E'; M= -9, 0,-24, -1, 2,-15,-17, -9, -5, -7, -5, -3, 2,-12, -5, -9, -6, -5, -7,-29,-13, -2; /M: SY='E'; M= -5, 10,-24, 14, 20,-27,-14, -6,-23, 5,-20,-16, 3, -9, 8, -2, 4, 1,-18,-30,-17, 14; /M: SY='E'; M= -6, -4,-22, -4, 2, -4,-21,-12,-10, -6, -4, -6, -7,-16, -6, -8, -5, 1, -7,-20, -4, -2; /M: SY='L'; M=-11,-26,-22,-30,-24, 16,-31,-16, 21,-24, 23, 12,-23,-28,-21,-20,-21, -8, 14,-10, 15,-24; /I: I=-28; MD=-29; /M: SY='L'; M= -7, -4,-21, -8, -5, -6,-19,-11, 3,-14, 8, 1, -1,-19, -8,-13, -9, -6, -3,-25, -8, -7; D=-28; /I: I=-28; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='E'; M= -1, -4,-22, -2, 7,-20, -9,-10,-18, -2,-12,-11, -3,-13, 1, 2, 4, -1,-14,-27,-15, 3; /M: SY='K'; M= -7, -2,-23, -5, 0,-19,-18, -9,-12, 3,-13, -5, 1, -1, 2, -2, -1, 2,-13,-28,-14, 1; /M: SY='L'; M= -2,-11, -9,-12,-10,-13,-12,-17, -5,-17, 2, -3,-11,-19,-11,-17, -8, -6, -4,-27,-14,-11; /M: SY='D'; M= -4, 8,-23, 12, 11,-24,-11, -3,-22, -4,-21,-17, 5, -1, 0, -8, 7, 1,-18,-33,-17, 5; /I: I=-19; MD=-19; /M: SY='E'; M= -4, 7,-19, 8, 11,-21,-12, -3,-20, 10,-20,-13, 6, -9, 4, 4, 5, 1,-15,-25,-12, 7; D=-19; /I: I=-19; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='L'; M= -5, -7,-16, -7, -2, -9,-10, -4, -6, -8, 1, -2, -4,-15, -5, -4, -3, -3, -5,-22, -8, -4; D=-19; /I: I=-19; DM=-19; /M: SY='E'; M=-10, -2,-26, 1, 16,-23,-13, -6,-17, -1,-15,-10, -3, -4, 8, -6, -5, -9,-20,-24,-12, 11; /M: SY='W'; M=-11,-27,-39,-27,-16, -4,-18,-16,-17,-12,-17,-11,-26, -8,-11,-12,-25,-20,-23, 69, 10,-12; /M: SY='L'; M= -7, -8,-18,-11, -8, -8,-22,-12, 0, -9, 2, -1, -5,-20, -8, -9, -7, 0, -1,-24, -5, -9; /M: SY='K'; M=-10, -3,-18, -5, -3,-14,-16,-11,-18, 11,-18, -9, -2,-18, -2, 8, -6, -8,-11,-23, -9, -3; /M: SY='D'; M=-11, -1,-28, 1, -5,-14, -3, -2,-23, -6,-21,-14, 1, 1, -8, -8, -5,-10,-20,-24,-12, -7; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='K'; M= -7, -7,-23, -8, 1,-18,-21,-11,-14, 18,-15, -6, -7,-15, 1, 11, -5, -2, -6,-22, -7, 1; /M: SY='F'; M=-19,-26,-24,-32,-25, 55,-30, -4, 0,-23, 8, 1,-20,-30,-27,-16,-21,-11, -4, 16, 43,-25; /M: SY='N'; M= -7, 25,-11, 13, -2,-20, -5, 1,-18, -4,-26,-18, 38,-19, -3, -5, 12, 4,-20,-39,-19, -2; /M: SY='P'; M= -3, -4,-28, -1, 1,-25,-13,-15,-18, -5,-20,-15, -7, 23, -4,-10, -2, -2,-17,-28,-20, -4; /M: SY='D'; M=-10, 25,-27, 31, 21,-28,-12, 0,-28, 2,-25,-22, 15, -5, 4, -6, 1, -8,-27,-31,-15, 12; /M: SY='M'; M= -3, -7,-21,-12, -4,-12,-18, -4, -4, -5, 3, 8, -5,-17, 0, -5, -7, -2, -7,-24, -8, -2; /M: SY='V'; M= -6,-25,-12,-30,-25, -2,-31,-21, 26,-24, 12, 10,-21,-25,-22,-22,-12, -3, 28,-27, -5,-25; /M: SY='S'; M= 1, 5,-10, 5, 2,-26, 2,-10,-26, -6,-24,-18, 5,-14, -2,-10, 10, -2,-19,-32,-21, 0; /M: SY='W'; M=-18,-34,-43,-34,-26, 7,-23,-18,-12,-19,-13,-12,-33,-23,-17,-19,-32,-24,-20, 98, 26,-19; /M: SY='G'; M= -3, 5,-20, 6, -6,-29, 25,-12,-33, -5,-28,-20, 7,-17, -9, -7, 3,-11,-25,-28,-23, -8; /M: SY='G'; M= 5, -1,-20, -4, -8,-23, 19,-13,-26,-10,-26,-18, 7,-12, -8,-10, 15, 4,-18,-29,-22, -8; /M: SY='L'; M= -6,-22,-19,-27,-20, 3,-25,-11, 17,-21, 23, 21,-20,-25,-15,-17,-18, -8, 14,-22, -2,-18; /M: SY='K'; M= -8, 1,-26, -2, 1,-20,-19, -3,-13, 6,-15, -7, 4,-10, 2, 4, -3, -2,-13,-27,-10, 0; /M: SY='L'; M= 1,-20,-21,-22,-14, -6,-22,-19, 7,-17, 13, 4,-17,-11,-13,-14,-10, -3, 4,-24, -9,-15; /M: SY='T'; M= -1, -6,-20,-11, -8,-14,-19,-15, -3, -3, -7, -3, -4,-17, -5, -6, -2, 3, 0,-22,-10, -7; /M: SY='N'; M= -7, 8,-22, 7, 5,-16,-12, -6,-19, -2,-18,-12, 9, -9, -1, 0, 6, 2,-17,-30,-14, 1; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 38 in 38 different sequences |
| Number of true positive hits | 38 in 38 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Peptidase C4 |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
38 sequences
POL1_BAMMN (P90245), POL1_BAYMG (Q04574), POL1_BAYMJ (Q01206), POL1_BAYMY (Q9YJW3), POLG_BCMNN (Q65399), POLG_BSTV1 (Q65730), POLG_BSTVG (Q65729), POLG_BTMV (Q6XW15), POLG_BVY3 (A0AUJ5), POLG_BYMV (P17765), POLG_LMV0 (P31999), POLG_LMVE (P89876), POLG_OMV(P20234), POLG_PEMVC (Q01500), POLG_PEMVM (O56075), POLG_PPVD (P13529), POLG_PPVEA (Q01681), POLG_PPVNA (P17766), POLG_PPVRA (P17767), POLG_PPVSK (Q84934), POLG_PRSVH (Q01901), POLG_PSBMV (P29152), POLG_PVMA (Q85197), POLG_PVYHU (Q02963), POLG_PVYN (P18247), POLG_RGMVD (O11436), POLG_SBMVG (Q90069), POLG_SBMVN (P21231), POLG_SPMMV (P89201), POLG_TEV(P04517), POLG_TRMVU (A4KZ49), POLG_TUMVJ (P89509), POLG_TUMVQ (Q02597), POLG_TVMV (P09814), POLG_WMV2U (P18478), POLG_ZYMVC (P18479), POLG_ZYMVR (Q89330), POLG_ZYMVS (O36979)» more
|
| PDB [Detailed view] |
5 PDB
1LVB; 1LVM; 1Q31; 3MMG; 6SUQ |