Entry: PS51486

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] REKLES
Accession [info] PS51486
Entry type [info] MATRIX
Date [info] APR-2010 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); APR-2010 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51486
Associated ProRule [info] PRU00819

Name and characterization of the entry

Description [info] REKLES domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=96;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=91;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3533337; R2=0.0063739; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=10576.90380; R2=18.27405; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=965; N_SCORE=8.5; H_SCORE=25324; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=651; N_SCORE=6.5; H_SCORE=22473; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-23; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
...
                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-380; BD=-380;
/M: SY='A'; M= 56,-42,-39, -7,-46,-18,-42,-39,-38,  4,  9,  2,-44,-34,-43, 41, 18,-33,-56,-44;
/M: SY='A'; M= 56,-45, -2,-38,-48,  6, 16,-12,-38,-18, 15,-34,-15,-36, -6, 19, 14,-33,-57,-43;
/M: SY='L'; M= -2,-49,-53,-47,  2, -7,-46, 29,-11, 48, 24,-47,  2,-42, -7,  5,-36,-22,-49,-34;
/M: SY='E'; M=-18,-54,-21, 76,-55, 19,-36,-54, 14,-21,-45,-33,-38,-20,  2, -8,  7,-49,-56,-48;
/M: SY='Q'; M= 29,-51,-29, 27,-58,-11,  1,-53,-26,-52,-43, 29,  0, 64,  1, 30,-31,-47,-57,-45;
/M: SY='H'; M=-24,-49,-43, -5,-35, -4, 55, -2,-18, 38,-24,-38,-50,-36, -6, 15, 15, 11,-57,-35;
/M: SY='R'; M=-13,-55, -2,-32,-49, 18,-36,-47, -1,  8,-37, -2, 31, 27, 57,  4,-37,-46,-54,-44;
/M: SY='H'; M= 15,-52, 22, 59,-55,-42, 63,-57,-26,-52,-45,-28,-41,-21, 16, 35,-32,-50,-62,-40;
/M: SY='R'; M=  2,-53,  1, 18,-55,-17,-33,-55, 32,-53,-44, 23,-45,-23, 69,-30, 20,-48,-57,-44;
/M: SY='H'; M=-41,-52, -6,-41,-31,-16, 63,-29,-41, 48, 20,-40, 21,-37, -2, 13,-37,-33,-52,  9;
/M: SY='E'; M= 28,-47,-25, 60,-53, -6,-38,-49,-30,-21,-43, -7,-40,-24,-38, 44, 14,-42,-58,-47;
/M: SY='S'; M=  7,-46, -1, -4,-49,-37,-39,-43,-32,-20,-41,-29, 15,-30, 14, 65, 34,-16,-60,-45;
/M: SY='G'; M= 27,-50,-38,  2,-53, 50,-46, -9,-40,-49,-42,  4, 46,-39,-48,-27, 27,-16,-56,-51;
/M: SY='E'; M= 19,-53,  4, 67,-55,-12,-38,-40,-28,-45,-41,-36,  8, 41,-35,-32,-36, 21,-58,-48;
/M: SY='P'; M=-11, 19,-41,-35,-58,-14,-42,-53,-32,-57,-47,-38, 89,-35, 27, 45,-30,-51,-58,-52;
/M: SY='P'; M= 15,-54,-42, -6,-54,-14,-48,-38,-40,-48,-41,-43, 92,-42,-49,-32, 33, 11,-59,-53;
/M: SY='E'; M=-11,-53,-23, 70,-55, 11,-37,-49, 31,-50,-45,-33,-39,-21,  1, 13,-34,  1,-56,-48;
/M: SY='K'; M=-41,-56,-30, 18,-56,-48, 49,-58, 86,-54,-42,-26,-41, 12, 10,-35,-37,-54,-53,-39;
/M: SY='K'; M=-42,-58,-36,-21,-57,-50,-32,-58, 74,-54,-42,-29,-45, 43, 68,-35,-39,-53,-51,-42;
/M: SY='M'; M= 51,-45,-44,-39,  0, -1, 48,-37,-40,-14, 55,-36,-47,  4,-42, 27,-32,-21,-53,-35;
/M: SY='S'; M= 27,-45,-43,-39,-44,  7,-42,-33,-38, 11, -5,-34,-47,  5, -6, 57,-10, 12,-56,-42;
/I:         I=-25; MD=-63;
/M: SY='R'; M= -8,-55,-49,-43,-48,-19,-45,-41,-31, 18,-36,-42,-55,  4, 52, 20, 17,-13,-61,-46; D=-25;
/I:         I=-25; MI=0; MD=-63; IM=0; DM=-63;
/M: SY='M'; M=-12, 19,-51,-48,-39,-38,-47,-30,  4, 36, 37, -1,-55,-44,-46,  2, 31,-11,-61,-44; D=-25;
/I:         I=-25; DM=-63;
/M: SY='S'; M= 42,-46,-38, -2, -5,  6,-42,-15, 16,-48,-42,-31,  1,-31,-36, 56,-26,-38,-53,-43;
/M: SY='E'; M=-37,  4, 33, 61,-59,-44, -2,-58, 31,-55,-48, 24,  5, 27,-26, 12,-21,-54,-61,-47;
/M: SY='E'; M=-19,-54, 17, 65,-53,  5, 23,-49, 18,-22,  9,-31,-14,-23,-31,  7, -4,-27,-59,-44;
/M: SY='Q'; M=-34, 18, 14, 41,-58,-12, 24,-56,-10,-53,-45, 37,-43, 59,-31, 33, -2,-52,-61,-44;
/M: SY='Q'; M=-33,  7,-10,  0,-55, 27, 23,-48,-30,-23,-39,  4, -1, 77,-33, 27,-34,-17,-56,-42;
/M: SY='R'; M= -3,-55,-40,-32,-55, 18,-36,-56, 26,-54,-43,-32, 14,-11, 77, -6,  7,-50,-54,-45;
/M: SY='L'; M=  9,-50, 13,-39,-35,-13,-40, 10,  3, 46,-23, 20,-53,-36, 26,-39,-37,-28,-54,-39;
/M: SY='M'; M=  2,-47,-52,-47,-32,-18, 17,  7,-27, 39, 57,-14, -3,-42,-46,  0,-34, 28,-55,-36;
/M: SY='Q'; M=-34, -6,-14,  2,-59,  2, 18,-49,-26,-49,-39, -5,  0, 92,-28, 24, -3,-18,-56,-41;
/M: SY='Q'; M= 21, 16,-36,-30,-53, -5, 32,-47,-27,-18, -7, 31,  2, 66, 24, -1,-35,-29,-57,-41;
/M: SY='A'; M= 51,-45,  0, 12,-55, -8,-41,-48,-35,-50,-44,-32, 24, 11,-41, 40, 20,-40,-57,-48;
/M: SY='F'; M=  3,-50, -7,-42, 43, 13,-44,  0,-41,  8,-30,  0, 13,  7, -7,-15,  3, 13,-47,-31;
/M: SY='Q'; M=-12,-57,-32,  9,-61,-20,-30,-55, 26,-51,-40,-28,-44, 91, 33, 20,-35,-52,-52,-42;
/I:         I=-14; MD=-36;
/M: SY='Q'; M=-16,-62,  7, 25,-61, -5, 37,-59,-25,-53, 14,-34,-49, 60, 40, -2,-43,-56,-62,-44; D=-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-36; IM=0; DM=-36;
/M: SY='N'; M=-15,-55,  8,-40,-63,  8,-39,-62,  2,-65,-55, 65,-54,-37, -5, 32, -3,-58,-71,-55; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-36;
/M: SY='S'; M=  7, 18,-53,-51, 42,-48,-49,-36,-50, 26,-33,-44,-56,-47,-52, 43, 14,-36,-51,-33; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-36;
/M: SY='S'; M= -3,-51,-54,-52, 39, 11,-49,-34,-51, 27,-33,-44,-57,-47,-53, 44,-36, -8,-51,-34; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-36;
/M: SY='S'; M= 24,-48,-39,-43,-56,  3,-42,-52,-41,-54, 15, 30,-49,-36,-46, 65,  1,-46,-65,-51; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-36;
/M: SY='M'; M=-37,-52, 10,-42,-47,  9,-37,-38,-41,-15, 84, 33, 28,-37,-46, 33,-33,-41,-61,-44; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-36;
/M: SY='A'; M= 45,-47, 17, -6,-54, -2,-45,-46,-10,-30,-44,-33,-46,-36,-43, 31, 32,-21,-62,-49; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-36;
/M: SY='R'; M= 12,-51,-38,-35,-54,-14,-39,-52, 36,-25,-44, 22,-48,-29, 41, 37,  8,-47,-59,-47; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-36;
/M: SY='Q'; M=-39,-55, 18, -1,  8,  2, 60,-42, -4, 11, 13,-30,-48, 71,-31, -8,-39,-45,-53,-31;
/M: SY='I'; M=-43,-49,-47,-51,  4,-55, 16, 48,-48, 47,-16, 45,-56,-45,-49,-44,-36, 11,-54,-32;
/M: SY='P'; M=-14,-57,-38,-32,-59,-40,-42,-51, 14,-58,-47, 18, 97,-36,-40, 28, -4,-51,-58,-54;
/M: SY='M'; M=-14,-50,-51,-47,-34,  2,-42, 22,-42, 31, 75, -3, 20,-40,  4,-12,-36, -1,-53,-37;
/M: SY='N'; M=-14,-50,  1, 29,-50, 13,-34,-47, 28,-11, 12, 51,-44,-27,  0,  4, 14,-45,-59,-45;
/M: SY='T'; M=-12,-49, -2,-39,-37,  2,-39, 25,  3, -2,-32, 19,-47,-35, 15, 14, 39,-30,-51, 21;
/M: SY='R'; M= -2,-51,-50,-41,  2,-17,-43,-24, 16, 38,-24,-45, -2,-36, 47,-42,-38, 23,-51,-36;
/M: SY='S'; M=-11,-51,-44,-38, 12,  7,-43, 24, 31,-10,-34,-35, 14,-34, 16, 40,-31,-18,-50,-37;
/M: SY='N'; M=  3,-49,  0,-44,-38,-47,-38,-31,-40, 44, 12, 62,-56,-40, -7,-37, -4,-35,-62,-43;
/M: SY='H'; M=-16,-53,-40,-10,-44, 23, 44,-41,-38, 31,-32, 36,-54,  5,  5,  1,-39,-43,-60,-41;
/I:         I=-29; MD=-75;
/M: SY='N'; M=-14,-57,-35,  5,-60,-44,-38,-56, 12,-29,-48, 43, 24, 34, 15, 33,-35,-54,-63,-51; D=-29;
/I:         I=-29; MI=0; MD=-75; IM=0; DM=-75;
/M: SY='E'; M=-41,-64, 13, 80,-67, 28,-40,-69,-30,-62,-57,-36,-42,  9,-39,-38,-45,-62,-63,-57; D=-29;
/I:         I=-29; DM=-75;
/M: SY='M'; M=-15,-54, 29,-11,-51,-24,-39,-41,-36,-39, 72, 24,-52,-36, 20,  6, 10,-15,-66,-46; D=-29;
/I:         I=-29; DM=-75;
/M: SY='Q'; M=-43, 19,-43,-33,-49,-12,-38,-46, 23, 18,-35,  2,-54, 53, 51, -9,-41,-46,-57,-44;
/M: SY='Q'; M= -6,-54, 23,-35, 52,-14,-40,-42,-39,-16, 18,-36,-52, 56,-41, 20, -6,-43,-47,-29;
/M: SY='Q'; M=-41,-60, 35, 25,-56, 22,-39,-13,-35, -9,-41,  1,  5, 61,-39,-36,-41,-16,-60,-48;
/I:         I=-13; MD=-33;
/M: SY='V'; M=-17,-57,-57,-57,-47,-20,-57,-31,-56, 22,-37, -5, -8,-53,-59, 21,  2, 27,-70,-52; D=-13;
/I:         I=-13; MD=-33;
/M: SY='A'; M= 48,-56,-57,-53,-64,-45,-59,-16,-54,-57,-53,-48,-59,-49,-58, 45,-38,-14,-71,-60; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-33; IM=0; DM=-33;
/M: SY='R'; M=-12,-74,-62,-54,-73,-64, 12,-69,-40,-71,-62,-54,  9,-47, 52, 17,-54,-29,-79,-62; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-33;
/M: SY='N'; M=-53,-59,-45,-55,-50,-56,-46,-41,-47, 24, 13, 63,-65,-48,-10,-35, 11,-25,-74,-53; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-33;
/M: SY='N'; M=-46,-64,-43,-52,-67, 48,-49,-69, 19,-36,-59, 53,-60,-46,-46,-14,-47,-67,-70,-62; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-33;
/M: SY='T'; M=-20,-56, -9,-53,  1,-62, 11, 19,-54, 18,-34,-46,-57,-53,-58,-40, 56,-32,-65,-43; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-33;
/M: SY='G'; M= 15,-53,-44, -8,-59, 41,-51,-56,-46,-28,-51,-10,-51,-43,-53, 30, 32,-49,-65,-56; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-33;
/M: SY='D'; M= 21,-55, 35, 18,-62, -3,-45,-56,-42,-56, 14,  1,-16,-39,-49, 20, 18,-50,-69,-55; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-33;
/M: SY='N'; M=-43,-53,  4,-38,-57,-21,-33,-56, -4,-29,-50, 84,-54,-33, 17, 16, -2,-56,-72,-52; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-33;
/M: SY='G'; M= -9,-54,-42,-52,-60, 79,-48,-59,-47,-61,-52, 14,-50,-44,-54, 16,-41,-19,-58,-56;
/M: SY='E'; M=  2,-56, 35, 55,-54,-50,-42, 22, 11,-46,-44,-34,-43,-29,-37,  5,  7,-37,-62,-49;
/M: SY='Q'; M=  2,-53,  1,-31,-61,  0,-35,-56,-33,-58,-48, 52, 11, 57,-38, 39, -3,-52,-63,-50;
/M: SY='S'; M=-27,-51,-36,-29,-60,-36,-36,-56,-31,-56,-47,-27,-46, 73,-34, 78,-24,-51,-60,-45;
/M: SY='I'; M=-46,-54,-66,-60,-26,-67,-53, 62,-58, 50, 56,-59,-59,-51,-57,-56,-42,-11,-54,-35;
/M: SY='N'; M=-37,-49,-39,-48,-43,-47,-45, 40,-43,-34,-33, 59,-52,-42,-49, 22, 26, 31,-66,-45;
/M: SY='M'; M=-36,-49,-65,-57,-34,-63,-54, 11,-53,-16, 82,-57,-57,-51,-53,-49,-35, 73,-64,-39;
/M: SY='S'; M=  0, 22,-31,-39,-56,-32,-36,-54,-36,-58,-50, 61,-48,-32,-42, 70,  4,-48,-68,-50;
/M: SY='M'; M=-42,-50,-65,-58,-28,-64,-51, 26,-55, 43, 73,-59,-59,-50,-54,-53,-39, 43,-57,-36;
/M: SY='E'; M=-42,-62, 19, 96,-65,-56,-34,-66,-23,-58,-55,-36,-37,-16,-33,-38,-41,-58,-63,-54;
/M: SY='I'; M=-46,-54,-66,-61,  5,-69,-57, 62,-59, 49, 10,-60,-60,-55,-59,-56,-41, 15,-52,-34;
/M: SY='N'; M=-44,-49, 17,-35,-59,-32,-24,-58,-29,-65,-52,108,-54,-31,-38,-26,-28,-60,-78,-53;
/M: SY='G'; M=-30,-57,-45,-56,-64, 91,-51,-71,-50,-67,-56,-31,-49,-47,-57, -2,-47,-64,-55,-58;
/M: SY='I'; M=-40,-52,-59,-58,-35,-65,-63, 71,-54,-20,-22,-50,-53,-54,-58,-42, 40, 42,-61,-41;
/M: SY='M'; M=-39,-51,-47,-39,-43,-55,-46, -6, 46,-10, 56,-39,-49,  5,-31,-37, 40, 28,-59,-42;
/M: SY='Y'; M=-53,-63,-52,-55,  0,-59,-18,-38,-47,-34,-31,-53,-65,-42,-44,-47,-47,-43, -8,121;
/M: SY='Q'; M=-10,-50,-36, -3,-56,-42,-39,-49,-32,-30,-42,-30,-44, 67,-36, 48, 51,-44,-61,-45;
/M: SY='G'; M=-30,-58,-45,-57,-64, 93,-52,-72,-51,-67,-56,-31,-49,-48,-58,-30,-49,-65,-55,-59;
/M: SY='V'; M=-33,-48,-60,-56,-37,-20,-62, 18,-54,-23,  8,-53,-57,-54,-56,  3,-32, 79,-66,-43;
/M: SY='L'; M=-48,-51,-64,-56,-23,-67,-49,-14,-54, 78,-10,-63,-65,-50,-11,-58,-44,-22,-52,-35;
/M: SY='F'; M=-18,-51,-63,-59, 84,-61,-49,-20,-55,-24,-30,-55,-62,-60,-55,-47, -7, 41,-32, 34;
/M: SY='A'; M= 79,-45, -7,-40, -7,-33,-50,-47,-44,-48,-43,-43,  6,-41,-49,-25,-34,-35,-55,-48;
/M: SY='Q'; M=-24,-56,-33,-32,-53,-13, 20,-49,-26,  4,-38, 63,-53, 66, 30,-33,-39,-51,-61,-43;
/M: SY='P'; M= 22,-55, 29,-34,-57,  8,-45,-44, 19,-51,-45, -9, 40,-38,  6, -7,-36, 14,-62,-51;
/M: SY='P'; M= -1,-63,-41, 11, -9, 16, 18,-58,-40,-59,-50, -3, 73, 27,-47,-13,-42,-57,-59,-50;
/M: SY='P'; M=  8,-55,-46,-47,-53, 31,-50,-14,-44,-15,-42, 13, 38,-45, -7, -7, 23, -5,-63,-53;
/M: SY='S'; M=-20,-53,-49,-46,-48,-50, 15, 16,-42,-25,-37,-41, 18,-42, 10, 44, 13, 26,-65,-46;
/I:         E1=0; IE=-380; DE=-380;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 13 in 13 different sequences
Number of true positive hits 13 in 13 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] REKLES
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
13 sequences

ARI3A_DANRE (A2BEA6), ARI3A_HUMAN (Q99856), ARI3A_MOUSE (Q62431), 
ARI3A_XENLA (Q6GQD7), ARI3A_XENTR (Q5XGD9), ARI3B_HUMAN (Q8IVW6), 
ARI3B_MOUSE (Q9Z1N7), ARI3C_HUMAN (A6NKF2), ARI3C_MOUSE (A6PWV5), 
CFI1_CAEEL  (O02326), DRI_CIOIN   (Q4H3P5), DRI_DROME   (Q24573), 
DRI_STRPU   (Q8MQH7)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission