 |
|
| Entry: PS51488 |
General information about the entry
| Entry name [info] | KBD |
| Accession [info] | PS51488 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] | 01-APR-2010 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 05-JUL-2017 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51488 |
| Associated ProRule [info] | PRU00821 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | KBD domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6565362; R2=0.0132355; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3196.4665527; R2=4.2466488; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=518; H_SCORE=5396; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=366; H_SCORE=4751; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-30; I=-30; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='F'; M= -8,-21,-23,-20,-13, 8,-21,-18, -3,-21, 4, -3,-17, 5,-17,-18, -8, -4, -7,-21, -6,-15; /M: SY='P'; M= -8,-18,-29,-17,-12, -6,-23,-10, 0,-14,-12, -6,-14, 15,-10,-17, -4, -4, -8,-14, 7,-15; /M: SY='R'; M=-20,-16,-27,-20,-10, 12,-23, -6,-20, 11,-10, -7, -6,-23, -6, 41,-13,-10,-14,-10, 3,-10; /M: SY='H'; M= -9, 8,-22, 1, 2,-22,-16, 20,-19, -3,-19, -7, 15,-14, 14, -1, 6, 9,-20,-29, -6, 7; /M: SY='V'; M= -2,-24,-18,-24,-25, -8, 2,-25, 5,-22, 5, 2,-20,-27,-25,-20,-11, -8, 16,-25,-14,-25; /M: SY='S'; M= -3,-16,-18,-21,-16, 7,-19,-18, 7,-21, -6, -3, -6,-17,-15,-18, 8, 4, 5,-23, -3,-16; /M: SY='P'; M=-15,-25,-31,-24,-14, 22,-25,-20,-11,-19,-11,-11,-20, 33,-24,-20,-15,-10,-16,-11, -2,-19; /I: I=-9; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M=-15, 10,-28, 16, 22,-12,-19, -2,-24, -1,-16,-14, 1,-11, 11, -5, -4,-10,-24,-22, -8, 18; /M: SY='D'; M=-15, 19,-33, 34, 22,-35,-15, -6,-32, -1,-28,-25, 3, 24, 1,-11, -3,-10,-30,-35,-23, 10; /M: SY='D'; M= -8, 25,-24, 37, 22,-31, -9, -3,-31, -1,-28,-25, 13, -8, 4, -8, 13, 0,-24,-38,-20, 13; /M: SY='E'; M=-12, 19,-30, 31, 51,-32,-18, 0,-32, 8,-22,-22, 4, -2, 16, -2, 0,-10,-30,-32,-20, 34; /M: SY='E'; M= -4, 7,-24, 14, 41,-27,-14, -3,-27, 4,-23,-20, 3, -3, 14, -3, 13, 0,-24,-33,-20, 27; /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27, 3,-37,-27, 40,-30, 30, 20,-23,-23,-20,-27,-23,-10, 24,-20, 0,-27; /M: SY='V'; M= 16,-24,-10,-27,-24, -6,-20,-27, 17,-17, 4, 4,-24,-24,-24,-20, -4, 0, 34,-27,-13,-24; /M: SY='R'; M=-14,-10,-30,-10, -6,-23, 9, -6,-33, 14,-23,-13, 0,-20, 0, 41, -7,-13,-23,-20,-16, -6; /M: SY='I'; M= 9,-24,-24,-34,-24, -6,-27,-27, 31,-24, 10, 10,-17,-17,-17,-27,-10, -7, 20,-20, -6,-24; /M: SY='N'; M= -7, 24,-23, 10, -6,-23, 22, 0,-26, -6,-30,-20, 41,-20, -6, -6, 7, -6,-30,-34,-23, -6; /M: SY='P'; M= -4,-14,-30, -7, 0,-27,-14,-17,-20,-10,-30,-20,-10, 58, -7,-17, 6, 0,-24,-33,-27, -7; /M: SY='R'; M=-17, -7,-30, -7, 6,-26,-20, 3,-27, 24,-20, -7, 0,-17, 26, 51, -7,-10,-23,-20,-10, 13; /M: SY='E'; M= -9, 12,-30, 21, 26,-32, 11, -6,-35, -2,-25,-22, 4, -9, 3, -9, 0,-13,-30,-29,-23, 14; /M: SY='W'; M=-15,-21,-36,-23,-13, -9,-24,-19,-10, 6,-14, -7,-17,-21, -6, 9,-22,-16,-12, 35, 5,-10; /M: SY='W'; M= -9,-26,-32,-28,-25, -5, 2,-25, 0,-25, 2, -1,-20,-24,-20,-23,-20,-17, -6, 15, -3,-23; /I: I=-9; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='I'; M= -4,-18,-21,-25,-18, -6,-22,-16, 20,-18, 4, 17,-10,-17, -8,-18, -1, 0, 12,-26, -6,-15; /M: SY='R'; M=-11, -5,-21,-10, -5,-15,-20, -9,-21, 11,-15,-10, 0,-15, 1, 33, 4, 18,-11,-25,-10, -5; /M: SY='G'; M= -4,-10,-30,-10,-16,-28, 51,-16,-38, -9,-28,-18, 0,-20,-14, -1, -2,-18,-28,-20,-26,-16; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='E'; M= 3, 6,-26, 11, 45,-28,-16, -4,-26, 6,-18,-18, -2, -2, 14, -4, 2, -8,-24,-28,-20, 29; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='H'; M=-20, -7,-30, -7, -4,-10,-22, 51,-24, 3,-16, -3, 1,-22, 6, 20,-12,-15,-23,-14, 23, -4; /M: SY='A'; M= 24, -9,-16,-11, -5,-22, -4,-17,-15,-10,-21,-15, -6, 11, -7,-17, 15, 4,-10,-29,-22, -7; /M: SY='G'; M= 3, 0,-28, 5, -4,-30, 15,-16,-29,-11,-26,-20, -3, 13,-11,-18, -1,-11,-24,-27,-26, -9; /M: SY='V'; M= -5,-25,-22,-24,-18,-10,-25,-20, 12,-15, -1, 11,-25, 11,-17,-18,-12, -5, 16,-28,-14,-19; /M: SY='P'; M=-15,-22,-40,-16, -6,-19,-20,-17,-23, -2,-25,-17,-19, 36, -7, 3,-16,-14,-27, 11,-12,-10; /M: SY='P'; M= -9, 1,-33, 9, 1,-32, 5,-14,-31, 2,-30,-20, -2, 20, -6, -7, -5,-13,-28,-27,-24, -4; /M: SY='K'; M=-10, 2,-31, 1, 5,-28,-16, -9,-25, 20,-30,-15, 6, 20, 1, 8, -6, -8,-25,-28,-19, 1; /M: SY='P'; M=-17, -7,-31, -2, -7, 6,-23, -5,-15,-12,-14,-13,-11, 13,-14,-15,-13,-10,-19, -8, 13,-12; /M: SY='L'; M=-10,-27,-27,-27,-17, -2,-29,-22, 16,-25, 23, 10,-25, 3,-17,-22,-23,-10, 4,-23, -8,-19; /I: I=-7; MD=-25; /M: SY='D'; M= -9, 15,-20, 22, 22,-25,-11, 2,-21, 4,-16,-12, 5, -5, 17, -1, 0, -7,-20,-21,-12, 19; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='E'; M= -9, -4,-22, 1, 15,-18,-14, -4,-18, 7,-16,-11, -4, 14, 5, 11, -4, -7,-18,-18,-14, 8; D=-7; /I: I=-7; DM=-25; /M: SY='D'; M= 5, 22,-24, 31, 19,-32, -9, -6,-28, -1,-22,-22, 6, -8, 1,-11, 3, -7,-20,-32,-20, 10; /M: SY='D'; M= 1, 9,-22, 15, -1,-19,-14,-12,-13,-12, 1, -9, -4,-16, -9,-16, -7, -7, -9,-28,-14, -5; /M: SY='S'; M= 0, 13,-15, 16, 3,-23, -7,-10,-23, -7,-26,-20, 10,-10, -2,-10, 25, 19,-13,-38,-18, 0; /M: SY='D'; M= -6, 21,-18, 26, 5,-25,-11, -9,-25, -6,-24,-21, 11,-10, -3,-10, 17, 17,-15,-37,-17, 1; /M: SY='C'; M= 4, -6, 32,-10,-10,-20,-10,-16,-23,-16,-27,-20, 0,-20,-10,-16, 24, 10,-10,-43,-23,-10; /M: SY='Y'; M= -7,-19,-19,-19,-19, 10,-24, -2, 5,-13, -3, -1,-17,-26,-14,-13, -4, 0, 9, -4, 30,-19; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='R'; M=-16,-10,-32, -8, 4,-26,-20, -2,-26, 17,-22,-10, -4, 6, 16, 38, -8,-10,-24,-22,-14, 6; /M: SY='F'; M=-18,-30,-22,-40,-30, 63,-32,-22, 10,-30, 12, 4,-20,-28,-36,-22,-20,-10, 6, 4, 24,-30; /M: SY='A'; M= 33, -6,-10,-12, -6,-20, 0,-16,-14,-10,-18,-14, -2,-10, -6,-16, 23, 8, -4,-28,-20, -6; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='N'; M= -4, 6,-22, -2, -4,-24, 7, -7,-22, -6,-21,-13, 12,-15, 5, -6, 8, 9,-20,-27,-17, 0; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 11 in 11 different sequences |
| Number of true positive hits | 11 in 11 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | KBD |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
11 sequences
SPRE1_HUMAN (Q7Z699 ), SPRE1_MOUSE (Q924S8 ), SPRE1_XENTR (Q66JG9 ), SPRE2_DANRE (Q6NYK3 ), SPRE2_HUMAN (Q7Z698 ), SPRE2_MOUSE (Q924S7 ), SPRE2_PONAB (Q5RDN2 ), SPRE2_RAT (Q3C2P8 ), SPRE2_XENTR (Q5Y171 ), SPRE3_HUMAN (Q2MJR0 ), SPRE3_MOUSE (Q6P6N5 )» more
|
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission