Entry: PS51488

General information about the entry

Entry name [info] KBD
Accession [info] PS51488
Entry type [info] MATRIX
Date [info] APR-2010 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); APR-2010 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51488
Associated ProRule [info] PRU00821

Name and characterization of the entry

Description [info] KBD domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6565362; R2=0.0132355; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-657.83951; R2=22.35802; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=518; N_SCORE=8.5; H_SCORE=9202; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=366; N_SCORE=6.5; H_SCORE=7525; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-30; I=-30; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='F'; M= -8,-21,-23,-20,-13,  8,-21,-18, -3,-21,  4, -3,-17,  5,-17,-18, -8, -4, -7,-21, -6,-15;
/M: SY='P'; M= -8,-18,-29,-17,-12, -6,-23,-10,  0,-14,-12, -6,-14, 15,-10,-17, -4, -4, -8,-14,  7,-15;
/M: SY='R'; M=-20,-16,-27,-20,-10, 12,-23, -6,-20, 11,-10, -7, -6,-23, -6, 41,-13,-10,-14,-10,  3,-10;
/M: SY='H'; M= -9,  8,-22,  1,  2,-22,-16, 20,-19, -3,-19, -7, 15,-14, 14, -1,  6,  9,-20,-29, -6,  7;
/M: SY='V'; M= -2,-24,-18,-24,-25, -8,  2,-25,  5,-22,  5,  2,-20,-27,-25,-20,-11, -8, 16,-25,-14,-25;
/M: SY='S'; M= -3,-16,-18,-21,-16,  7,-19,-18,  7,-21, -6, -3, -6,-17,-15,-18,  8,  4,  5,-23, -3,-16;
/M: SY='P'; M=-15,-25,-31,-24,-14, 22,-25,-20,-11,-19,-11,-11,-20, 33,-24,-20,-15,-10,-16,-11, -2,-19;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E'; M=-15, 10,-28, 16, 22,-12,-19, -2,-24, -1,-16,-14,  1,-11, 11, -5, -4,-10,-24,-22, -8, 18;
/M: SY='D'; M=-15, 19,-33, 34, 22,-35,-15, -6,-32, -1,-28,-25,  3, 24,  1,-11, -3,-10,-30,-35,-23, 10;
/M: SY='D'; M= -8, 25,-24, 37, 22,-31, -9, -3,-31, -1,-28,-25, 13, -8,  4, -8, 13,  0,-24,-38,-20, 13;
/M: SY='E'; M=-12, 19,-30, 31, 51,-32,-18,  0,-32,  8,-22,-22,  4, -2, 16, -2,  0,-10,-30,-32,-20, 34;
/M: SY='E'; M= -4,  7,-24, 14, 41,-27,-14, -3,-27,  4,-23,-20,  3, -3, 14, -3, 13,  0,-24,-33,-20, 27;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,  3,-37,-27, 40,-30, 30, 20,-23,-23,-20,-27,-23,-10, 24,-20,  0,-27;
/M: SY='V'; M= 16,-24,-10,-27,-24, -6,-20,-27, 17,-17,  4,  4,-24,-24,-24,-20, -4,  0, 34,-27,-13,-24;
/M: SY='R'; M=-14,-10,-30,-10, -6,-23,  9, -6,-33, 14,-23,-13,  0,-20,  0, 41, -7,-13,-23,-20,-16, -6;
/M: SY='I'; M=  9,-24,-24,-34,-24, -6,-27,-27, 31,-24, 10, 10,-17,-17,-17,-27,-10, -7, 20,-20, -6,-24;
/M: SY='N'; M= -7, 24,-23, 10, -6,-23, 22,  0,-26, -6,-30,-20, 41,-20, -6, -6,  7, -6,-30,-34,-23, -6;
/M: SY='P'; M= -4,-14,-30, -7,  0,-27,-14,-17,-20,-10,-30,-20,-10, 58, -7,-17,  6,  0,-24,-33,-27, -7;
/M: SY='R'; M=-17, -7,-30, -7,  6,-26,-20,  3,-27, 24,-20, -7,  0,-17, 26, 51, -7,-10,-23,-20,-10, 13;
/M: SY='E'; M= -9, 12,-30, 21, 26,-32, 11, -6,-35, -2,-25,-22,  4, -9,  3, -9,  0,-13,-30,-29,-23, 14;
/M: SY='W'; M=-15,-21,-36,-23,-13, -9,-24,-19,-10,  6,-14, -7,-17,-21, -6,  9,-22,-16,-12, 35,  5,-10;
/M: SY='W'; M= -9,-26,-32,-28,-25, -5,  2,-25,  0,-25,  2, -1,-20,-24,-20,-23,-20,-17, -6, 15, -3,-23;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='I'; M= -4,-18,-21,-25,-18, -6,-22,-16, 20,-18,  4, 17,-10,-17, -8,-18, -1,  0, 12,-26, -6,-15;
/M: SY='R'; M=-11, -5,-21,-10, -5,-15,-20, -9,-21, 11,-15,-10,  0,-15,  1, 33,  4, 18,-11,-25,-10, -5;
/M: SY='G'; M= -4,-10,-30,-10,-16,-28, 51,-16,-38, -9,-28,-18,  0,-20,-14, -1, -2,-18,-28,-20,-26,-16;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='E'; M=  3,  6,-26, 11, 45,-28,-16, -4,-26,  6,-18,-18, -2, -2, 14, -4,  2, -8,-24,-28,-20, 29;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='H'; M=-20, -7,-30, -7, -4,-10,-22, 51,-24,  3,-16, -3,  1,-22,  6, 20,-12,-15,-23,-14, 23, -4;
/M: SY='A'; M= 24, -9,-16,-11, -5,-22, -4,-17,-15,-10,-21,-15, -6, 11, -7,-17, 15,  4,-10,-29,-22, -7;
/M: SY='G'; M=  3,  0,-28,  5, -4,-30, 15,-16,-29,-11,-26,-20, -3, 13,-11,-18, -1,-11,-24,-27,-26, -9;
/M: SY='V'; M= -5,-25,-22,-24,-18,-10,-25,-20, 12,-15, -1, 11,-25, 11,-17,-18,-12, -5, 16,-28,-14,-19;
/M: SY='P'; M=-15,-22,-40,-16, -6,-19,-20,-17,-23, -2,-25,-17,-19, 36, -7,  3,-16,-14,-27, 11,-12,-10;
/M: SY='P'; M= -9,  1,-33,  9,  1,-32,  5,-14,-31,  2,-30,-20, -2, 20, -6, -7, -5,-13,-28,-27,-24, -4;
/M: SY='K'; M=-10,  2,-31,  1,  5,-28,-16, -9,-25, 20,-30,-15,  6, 20,  1,  8, -6, -8,-25,-28,-19,  1;
/M: SY='P'; M=-17, -7,-31, -2, -7,  6,-23, -5,-15,-12,-14,-13,-11, 13,-14,-15,-13,-10,-19, -8, 13,-12;
/M: SY='L'; M=-10,-27,-27,-27,-17, -2,-29,-22, 16,-25, 23, 10,-25,  3,-17,-22,-23,-10,  4,-23, -8,-19;
/I:         I=-7; MD=-25;
/M: SY='D'; M= -9, 15,-20, 22, 22,-25,-11,  2,-21,  4,-16,-12,  5, -5, 17, -1,  0, -7,-20,-21,-12, 19; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='E'; M= -9, -4,-22,  1, 15,-18,-14, -4,-18,  7,-16,-11, -4, 14,  5, 11, -4, -7,-18,-18,-14,  8; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-25;
/M: SY='D'; M=  5, 22,-24, 31, 19,-32, -9, -6,-28, -1,-22,-22,  6, -8,  1,-11,  3, -7,-20,-32,-20, 10;
/M: SY='D'; M=  1,  9,-22, 15, -1,-19,-14,-12,-13,-12,  1, -9, -4,-16, -9,-16, -7, -7, -9,-28,-14, -5;
/M: SY='S'; M=  0, 13,-15, 16,  3,-23, -7,-10,-23, -7,-26,-20, 10,-10, -2,-10, 25, 19,-13,-38,-18,  0;
/M: SY='D'; M= -6, 21,-18, 26,  5,-25,-11, -9,-25, -6,-24,-21, 11,-10, -3,-10, 17, 17,-15,-37,-17,  1;
/M: SY='C'; M=  4, -6, 32,-10,-10,-20,-10,-16,-23,-16,-27,-20,  0,-20,-10,-16, 24, 10,-10,-43,-23,-10;
/M: SY='Y'; M= -7,-19,-19,-19,-19, 10,-24, -2,  5,-13, -3, -1,-17,-26,-14,-13, -4,  0,  9, -4, 30,-19;
/M: SY='V'; M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='R'; M=-16,-10,-32, -8,  4,-26,-20, -2,-26, 17,-22,-10, -4,  6, 16, 38, -8,-10,-24,-22,-14,  6;
/M: SY='F'; M=-18,-30,-22,-40,-30, 63,-32,-22, 10,-30, 12,  4,-20,-28,-36,-22,-20,-10,  6,  4, 24,-30;
/M: SY='A'; M= 33, -6,-10,-12, -6,-20,  0,-16,-14,-10,-18,-14, -2,-10, -6,-16, 23,  8, -4,-28,-20, -6;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='N'; M= -4,  6,-22, -2, -4,-24,  7, -7,-22, -6,-21,-13, 12,-15,  5, -6,  8,  9,-20,-27,-17,  0;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2015_07 which contains 548'872 sequence entries.


Total number of hits 11 in 11 different sequences
Number of true positive hits 11 in 11 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] KBD
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
11 sequences

SPRE1_HUMAN (Q7Z699), SPRE1_MOUSE (Q924S8), SPRE1_XENTR (Q66JG9), 
SPRE2_DANRE (Q6NYK3), SPRE2_HUMAN (Q7Z698), SPRE2_MOUSE (Q924S7), 
SPRE2_PONAB (Q5RDN2), SPRE2_RAT   (Q3C2P8), SPRE2_XENTR (Q5Y171), 
SPRE3_HUMAN (Q2MJR0), SPRE3_MOUSE (Q6P6N5)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission