PROSITE entry PS51505
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | SCA7 |
| Accession [info] | PS51505 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JUL-2010 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51505 |
| Associated ProRule [info] | PRU00838 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | SCA7 domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=68; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=63; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.2111027; R2=0.0134640; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4200.6962891; R2=7.1421571; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=430; H_SCORE=7272; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=245; H_SCORE=5951; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='R'; M=-12,-17,-24,-19, -9, -8,-24,-11, -3, 5, 8, 10,-15,-22, -4, 15,-18, -9, -1,-21, -5, -8; /M: SY='E'; M= -3, 2,-26, 1, 10,-27, -5, -6,-25, 9,-25,-15, 6, -3, 8, 6, 3, -5,-23,-27,-18, 8; /M: SY='T'; M= -9, -6,-24, -9, 1,-15,-22,-11, -6, -1, -7, -2, -4, -4, -2, -1, -4, 3, -8,-26,-11, -2; /M: SY='A'; M= 1, -7,-22, -5, 0,-17,-17,-13,-11, -2, -7, -8, -9, -8, -5, -2, -3, -5, -5,-27,-15, -4; /M: SY='E'; M=-12, 13,-27, 17, 30,-27,-17, -1,-29, 13,-22,-18, 8, -8, 11, 12, 0, -4,-25,-30,-17, 19; /M: SY='R'; M=-13, 9,-26, 10, 1,-22,-10, -6,-25, 7,-17,-13, 8,-17, -1, 16, -3, -3,-19,-28,-14, -2; /M: SY='E'; M= -9, 0,-29, 5, 27,-26,-20, -8,-25, 10,-21,-16, -4, 11, 8, 5, -1, -1,-23,-28,-18, 16; /M: SY='F'; M=-11,-20,-12,-22,-12, 14,-26,-15, 0,-19, 2, -2,-17,-15,-18,-17,-11, -6, -1,-15, 5,-15; /M: SY='D'; M=-17, 31,-26, 38, 7,-17,-13, -3,-26, -7,-17,-20, 17,-16, -7,-10, -4, -8,-22,-32,-12, 0; /M: SY='P'; M= -9,-25,-28,-20,-13, -8,-26,-18, 2,-17, 3, -1,-25, 24,-16,-19,-17, -8, -4,-21, -7,-17; /M: SY='D'; M=-13, 26,-23, 27, 8,-22,-12, -2,-21, -5,-15,-16, 21,-15, -2, -8, 1, -1,-21,-35,-16, 3; /M: SY='R'; M=-11, -6,-25,-10, -2,-19,-22,-10,-18, 21,-17, -7, -2,-15, 2, 30, -3, 5,-11,-23, -9, -2; /M: SY='H'; M=-14, -2,-30, -2, 9,-26,-21, 38,-21, 2,-18, 0, 1,-15, 37, 5, -5,-13,-28,-17, 10, 21; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='G'; M= -2,-11,-30,-11,-20,-23, 58,-15,-35,-19,-27,-18, -2,-21,-19,-19, -2,-19,-28,-14,-17,-20; /M: SY='V'; M= -2,-28, 10,-30,-30, -3,-30,-30, 21,-22, 5, 5,-28,-32,-30,-22,-10, -2, 41,-33,-13,-30; /M: SY='I'; M= -4,-28,-26,-32,-23, -1,-30,-26, 24,-25, 17, 10,-24,-15,-19,-24,-20,-10, 14, -8, -3,-23; /M: SY='B'; M= -7, 15,-20, 15, 9,-21,-11, -4,-18, -5,-16,-12, 13,-13, 1, -8, 8, 4,-16,-34,-16, 5; /M: SY='P'; M=-10, -7,-28, -1, 8,-20,-21,-11,-11, -3,-10, -2,-12, 14, -2, -9,-10, -9,-12,-28,-16, 2; /M: SY='D'; M=-16, 24,-29, 32, 15,-31,-14, 20,-33, 9,-27,-18, 15,-12, 6, 2, -4,-11,-28,-33, -9, 9; /M: SY='T'; M= -5, 4,-20, 2, -7,-21, 6,-15,-24, -8,-19,-16, 3,-14,-10, -6, 9, 17,-14,-28,-17, -9; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='K'; M= -4, -2,-20, -2, 0,-20, 8, -9,-22, 17,-20, -9, 0, -9, 0, 8, -4, -9,-16,-13,-11, 0; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='R'; M= -8, -8,-28,-11, -3,-22,-14, -2,-17, 17,-18, -5, -3,-15, 1, 18, -9,-11,-13,-21, -8, -3; /M: SY='H'; M=-12,-12,-31,-13, -4,-20,-24, 10, -7, 2,-12, 4, -7, 3, 3, -3,-12,-12,-12,-24, -4, -3; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='T'; M= 2, -6,-19,-13, -7,-16,-19, -4,-10, 0,-11, -5, -3,-13, -4, -1, 3, 12, -5,-25, -7, -7; /M: SY='R'; M=-16, 3,-28, -2, 1,-21,-15, 1,-28, 25,-24,-12, 14,-19, 8, 49, -5, -8,-22,-25,-12, 1; /M: SY='S'; M= 10, -5,-14, -7, -4,-17, -7,-14,-15,-12,-19,-15, 1, -2, -5,-13, 24, 16, -8,-34,-18, -5; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22, 8,-32,-22, 25,-30, 45, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 13,-20, 0,-22; /M: SY='T'; M= -8, 0,-18, -8, -8,-11,-18,-10,-11, -3, -6, -7, 6,-17, -5, 8, 4, 19, -8,-28,-10, -8; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='K'; M= -8, -4,-29, -4, 5,-27,-20,-14,-25, 28,-27,-12, -4, 12, 3, 13, -5, -1,-19,-24,-14, 3; /M: SY='T'; M= -3, -8,-19,-10, 1,-17,-20,-12, -3, -8, -7, -3, -7,-14, 6, -8, 5, 8, -1,-28,-11, 3; /M: SY='H'; M=-19, 0,-30, 0, 1,-21,-20, 87,-30, -3,-21, -1, 9,-19, 10, 3,-10,-19,-29,-29, 17, 1; /M: SY='T'; M= 8, -3,-12, -8, -6,-16,-11,-17,-14,-10,-18,-14, 1, -2, -7,-12, 23, 29, -6,-32,-16, -7; /M: SY='I'; M= -2,-14,-23,-16,-10, -9,-26,-19, 16,-17, 8, 8,-15,-18,-12,-19,-11, -7, 14,-25, -8,-13; /M: SY='E'; M= -6, 1,-25, 4, 18,-25, 0, 1,-28, 0,-23,-16, 2,-10, 5, 2, 7, -2,-23,-29,-17, 10; /M: SY='Q'; M= -2, 4,-24, 7, 17,-29,-14, -1,-20, 0,-16, -9, 1,-10, 23, -3, 6, -4,-20,-27,-15, 20; /M: SY='R'; M= -9, -7,-28, -8, 2,-23,-18, -6,-28, 32,-22,-10, -1,-16, 8, 46, -8, -9,-18,-20,-11, 2; /M: SY='R'; M=-15,-10,-29, -9, 0,-21,-18, -4,-28, 21,-22,-12, -1, -6, 6, 50, -4, -6,-20,-24,-14, -1; /M: SY='A'; M= 14, -1,-15, -8, -1,-19, -9,-12,-17, -2,-16,-13, 2,-12, -3, 0, 12, 11, -9,-27,-16, -3; /M: SY='V'; M= -1,-27,-12,-27,-25, -3,-29,-28, 23,-12, 5, 8,-27,-28,-25,-14,-10, -1, 42,-29,-10,-25; /M: SY='Q'; M=-11,-10,-29, -9, 3,-17,-19, -6,-21, 6,-21, -9, -6, 9, 12, 12, -4, -7,-22,-21,-11, 5; /M: SY='G'; M= -8, -3,-30, 0, -4,-27, 25,-13,-28, -7,-22,-16, 0,-16, -8, -4, -4,-15,-23,-24,-22, -7; /M: SY='R'; M=-14, -7,-28, -7, 2,-19,-19, 1,-24, 21,-20, -9, -1,-17, 15, 39, -4, -7,-19,-17, -2, 5; /M: SY='F'; M= -3,-12,-17,-16,-13, 6,-18, 1,-10,-12, -9, -6, -5,-19,-12, -6, 3, 6, -2,-22, 1,-13; /M: SY='K'; M=-14, -5,-28, -2, -1,-10,-21,-12,-18, 10,-10, -8, -7, -5, -5, 7,-13,-10,-15,-21, -7, -3; /M: SY='A'; M= 3, -9,-24, -9, -9,-20, 3,-17,-18,-11,-11,-11, -9, 2,-11,-11, -3, -5,-14,-24,-19,-11; /M: SY='F'; M=-15,-21,-24,-24,-17, 33,-24, -9, -9,-13, -5, -6,-13,-14,-19, -3,-10, -6, -9, -1, 21,-18; /M: SY='D'; M=-13, 27,-24, 38, 8,-27,-13, -6,-25, -7,-15,-19, 9,-13, -4,-12, 2, 0,-18,-36,-16, 2; /M: M= -2,-15,-24,-15, -6,-15,-10,-16, -7, -5, -4, 0,-14, -6, -9, -5,-10, -9, -3,-24,-14, -8; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='L'; M=-10,-23,-19,-26,-18, 9,-24, -8, 16,-19, 31, 27,-23,-24,-11,-14,-23, -9, 7,-12, 9,-15; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='L'; M= -8,-22,-20,-22,-16, 2,-25,-14, 7,-15, 18, 7,-20,-26,-14, -4,-14, -5, 8,-19, 2,-16; /M: SY='E'; M= 4, 0,-19, 1, 7,-19,-13,-10,-14, -8, -7, -9, -3,-12, 1,-10, 6, 3,-11,-29,-14, 4; /M: SY='E'; M= 4, 9,-24, 15, 23,-28,-11, -8,-25, -1,-22,-20, 1, 3, 4,-10, 6, -4,-21,-31,-21, 13; /M: SY='H'; M=-13, -8,-29, -7, 3,-15,-19, 12,-21, 4,-15, -7, -5,-17, 8, 10, -7,-10,-20, -4, 5, 4; /M: SY='K'; M= 0, -4,-23, -5, 4,-26,-16,-10,-19, 22,-22, -7, -3,-12, 11, 11, 0, -4,-11,-23,-12, 8; /M: SY='K'; M= -4, 3,-23, 2, 11,-23,-14, 6,-25, 12,-23,-13, 7,-11, 6, 10, 4, 0,-19,-28,-11, 8; /M: SY='Q'; M= -9, -5,-25, -6, 5,-22,-17, -5,-14, 6,-16, -2, -2, -3, 10, 9, -2, -5,-13,-27,-14, 6; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='M'; M= -6, -7,-19,-12, -8,-12,-18, 4, 2, -8, -4, 11, -3,-16, 4, -7, -2, -1, 0,-24, -5, -3; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='Q'; M= -1, -6,-22,-12, -5,-18,-15, -6, -5, -2,-11, 2, 1,-15, 7, 3, 3, -2, -7,-26,-11, -1; /M: SY='T'; M= -1,-13,-20,-14, -4, -2,-18,-16, -7,-11, -1, -5,-11, -7,-10,-12, -1, 2, -7,-23, -8, -7; /M: SY='R'; M=-10, 3,-25, 4, 5,-22, -9, -6,-24, 10,-18,-12, 6,-16, 2, 16, -2, -6,-19,-27,-14, 2; /M: SY='Q'; M=-10, 3,-24, 4, 11,-15,-17, -2,-18, -1,-12, -9, 4,-14, 12, 1, -1, -5,-19,-25,-10, 11; /M: SY='D'; M= -5, 5,-24, 12, 2,-24,-16,-11,-15, -3,-15,-12, -3, -3, -2, -9, -2, -5, -9,-30,-16, -1; /M: SY='P'; M= -5, 0,-24, -3, 1,-19,-12, -8,-10, -8,-19, -7, 6, 10, -2,-11, 6, 0,-15,-33,-18, -2; /M: SY='N'; M=-12, 3,-27, -1, 1,-11, -9, -1,-20, 2,-20,-12, 11, -8, 3, 3, -4, -8,-24,-20, -5, 1; /M: SY='T'; M= -8, -5,-25, -5, -5,-15,-12, -5,-11,-12,-13, -9, -6, -4, -9,-14, -2, 3, -8,-24, -6, -9; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 11 in 11 different sequences |
| Number of true positive hits | 11 in 11 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | SCA7 |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
11 sequences
AT7L1_HUMAN (Q9ULK2), AT7L2_HUMAN (Q5T6C5), AT7L3_DANRE (A1L209), AT7L3_HUMAN (Q14CW9), AT7L3_MOUSE (A2AWT3), ATX7_HUMAN (O15265), ATX7_MOUSE (Q8R4I1), SGF73_SCHPO (O94397), SGF73_YEAST (P53165), Y3132_SELML (P0DH68), Y3925_SELML (P0DH66)» more
|
| PDB [Detailed view] |
8 PDB
2KKR; 2KKT; 6T9I; 6T9K; 6T9L; 7KTR; 7KTS; 8H7G |