PROSITE

Home | Contact

	Home ScanProsite ProRule Documents Downloads Links Funding
	Entry: PS51533

General information about the entry
Entry name	ADD
Accession number	PS51533
Entry type	MATRIX
Date	APR-2011 (CREATED); APR-2011 (DATA UPDATE); MAR-2013 (INFO UPDATE).
PROSITE Documentation	PDOC51533
Associated ProRule	PRU00865
Name and characterization of the entry
Description	ADD domain profile.
Matrix / Profile	/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=135; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=130; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6150928; R2=0.0029831; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1973; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=1303; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= -3, -5, -9, -3, 10,-17,-13, -2,-20, 8,-14, -3, -5, 4, 2, 3, -1,-11,-18,-23,-17, 5; /M: SY='V'; M= 0, -4,-22, -1, -7, -6,-17, -7, 0, -4, 1, -1, -5,-11, -9, -6, -6, -2, 2,-28, -2, -9; /M: SY='Y'; M= -8, -8,-22, -5, -6, -6, -6,-18, -3, -4, 1, -4,-13, -9, -9, -6, -9,-10, -4, -2, 4, -9; /M: SY='S'; M= 6, 3,-16, 6, 7,-17,-11,-13, -8, 3,-10, -7, 1,-10, 0, -6, 9, 3, -6,-29,-15, 2; /M: SY='D'; M= 0, 5,-21, 7, 5,-19, -4,-14,-14, 5,-10, -3, 2, -3, -2, -7, -3, -4,-16,-16,-11, 1; /M: SY='I'; M= 3,-11,-13,-13, -4,-12, -5,-18, 6, -4, 0, 1, -9,-17, -7, -6, -6, -7, 5,-17,-10, -6; /M: SY='M'; M= 0,-14,-12,-14, -8, -5,-18, -8, -1, -3, 1, 7,-12,-20, -2, 7, -7, -5, 3,-20, -2, -7; /M: SY='D'; M= -4, 1,-24, 9, -3,-13,-14, -5,-16, -1, -5,-11, -4, 0, -5, -4, 3, 1,-11,-24, -1, -6; /M: SY='K'; M= 0, -9,-22,-11, -5, -5,-10,-17, -1, 5, -3, 4, -7,-14, -4, 5, -5, -9, 1,-17, -5, -6; /M: SY='E'; M= -8, -7,-15, -2, 12,-12,-16, -9,-19, 8, -9, -6,-10, -1, 9, 10, -6,-15,-16, -3, -1, 10; /M: SY='F'; M= -4, -8,-22, -8,-14, 15,-20,-21, 10, -6, 11, -2, -9,-24,-18,-12, -9, -5, 13,-18, 10,-17; /M: SY='M'; M= 2, -8,-27,-11, -7,-10, -8, 0, 0, -1, -4, 4, -5, -6, -3, -7, -2, -2, -3,-27,-10, -8; /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30, 0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60, 0; /M: SY='T'; M= 2, -6,-17,-15,-20, 2,-20,-19, 6,-12, 10, 1, 1,-12, -8,-25, 9, 29, 10,-36, 2,-14; /M: SY='A'; M= 16, -4,-18, -7, -1,-13, -3,-20, 1, 2,-10, 3, -2,-11, -4, -9, 10, 5, 3,-34,-25, -6; /M: SY='C'; M=-28,-15,157,-22, 10,-31,-38,-48,-21,-28, -1,-21, -9,-29,-19,-19,-19,-19,-20,-21,-57, 0; /M: SY='G'; M= -3, 2,-25, -4,-13,-23, 37,-24, -7, -8,-11,-14, 2, -8,-16,-18, -2,-10,-18, -9,-20,-15; /M: SY='E'; M= 2, -4, -9, -2, 9,-19,-15, -7,-13, 7, -7, 1, -3,-12, 4, 2, 3, -2,-10,-22,-13, 6; /M: SY='H'; M= -2, -6,-13,-10, -2,-11,-16, 7, -5, -6, -2, 2, -1,-13, 3, -8, -3, 0,-10,-28, -7, -1; /M: SY='I'; M= 1,-12,-18,-20,-15, 11,-17,-16, 19,-10, 11, 4, -5,-26,-10,-12, -6, 1, 14,-24, 2,-15; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='N'; M= -3, 2,-12, -5, -5, -8, -1, -8, -8, 1,-13, -5, 13, -8, -2, 0, -1, -4,-13,-23,-16, -5; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='H'; M= 0, -7,-19, -7, -4,-10, -8, 9, -3, -4, -4, -1, -6, 4, -5, -6, -1, 1, -5,-24, -6, -5; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='S'; M= -1, -4, -1, -8, -1, -3, -6, -5, -5, -2, -5, -6, 0, -4, -3, -6, 2, -2, -7,-14,-11, -3; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='D'; M= 1, 7,-21, 11, 3,-18, -1,-14,-15, 6,-13, -5, 3, 1, 1, -2, 0, -3,-14,-17,-12, 0; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='E'; M= 2, -1,-19, 1, 4,-16,-15,-15, 0, 4, -7, -2, -1, -8, 0, -4, -4, -3, -1,-27,-10, 1; /M: SY='V'; M= -4,-18,-13,-20,-22, 8,-24,-22, 19,-13, 11, 1,-15,-32,-20, -9,-11, -1, 24,-12, 9,-22; /M: SY='F'; M= -6,-10,-23,-15,-10, 10,-18, 2, -2, -3, 6, 5, -2,-19, -8, -5, -5, -4, -2,-20, 5,-10; /M: SY='R'; M= 1,-11, -8,-12, 2, -8,-18,-15, -5, 3, -6, -2, -8,-13, 3, 6, -1, -6, -2,-18,-10, 1; /M: SY='H'; M=-20,-20,-50,-20, 0,-30,-30,140,-20,-20,-10, 20,-10, 10, 0,-10,-10,-20,-30,-50, 0, 0; /M: SY='P'; M=-10,-19,-28,-10, 9,-35,-11, 8,-26, 9,-25,-34,-28, 97, -1,-10,-10, 0,-36,-29,-16, 0; /M: SY='L'; M= -3,-12,-16,-14,-15, 9,-16, -7, 13,-14, 15, 8,-14,-24,-17,-12,-10, 1, 11,-23, 12,-15; /M: SY='F'; M=-11,-17, 2,-23,-16, 30,-24,-14, 12,-13, 30, 13,-15,-34,-21,-15,-18, -6, 7,-14, 19,-16; /M: SY='K'; M= 0, 5,-19, 7, 9,-16, -6,-15,-14, 10,-12, -5, 4, -7, 0, -1, 0, -9,-14,-21,-13, 5; /M: SY='I'; M= 4,-13,-15,-18,-24, -3, -3,-28, 22,-17, 4, -4,-12,-28,-24,-16, -6, 4, 22,-21, -4,-23; /M: SY='I'; M= 0, -6,-19,-14,-14, -4, 6,-10, 15,-13, 7, 3, -2,-21,-16,-20, -3, -1, 3,-24, -6,-16; /M: SY='I'; M= 1,-16,-15,-21,-15, 2,-20, -7, 26,-13, 18, 14,-12,-29, -9,-12,-14, 2, 18,-25, 7,-13; /M: SY='C'; M=-28,-19,160,-27, 13,-31,-39,-47,-21,-27, -1,-19,-10,-27,-17,-19,-19,-20,-21,-19,-57, 3; /M: SY='K'; M= 7, -2,-23, 1, 7,-18, -7,-15,-15, 12,-15, 1, -3, 1, 7, 8, 1, -5,-11,-24,-17, 5; /M: SY='E'; M= -1, 7,-18, 7, 12,-21,-11, -3,-19, 12,-17, -4, 10, 4, 2, -1, 3, -3,-20,-32,-18, 7; /M: SY='C'; M=-29,-19,159,-29, 9,-27,-39,-47,-17,-29, 3,-17,-11,-30,-20,-20,-20,-19,-18,-20,-54, -1; /M: SY='K'; M=-10,-11,-13,-11, 1, -6,-16, -8,-14, 5,-10, 0, -9, -9, -4, 3, -3,-10,-11, -2, 0, -2; /M: SY='F'; M= -6, -1,-23, -6, -2, 8,-15, -9,-12, 3, -3, -6, 6,-16, 0, -5, -5, -8,-12,-17, -1, -3; /M: SY='F'; M=-14,-17,-24,-20,-17, 28,-19,-11, -4, -8, 10, -6,-12,-23,-12, -5, -9, -9, 1, -1, 20,-17; /M: SY='Y'; M=-25,-25,-34,-23,-24, 39,-22,-14, -2,-11, 22, -9,-24,-28,-18, -7,-15,-12, 8, 22, 48,-24; /M: SY='N'; M= -2, 3,-23, -1, -6, -8, 0,-10, -5, -1, -3, -1, 5,-13,-11,-13, 0, -2, -9,-25, -8, -8; /M: SY='E'; M= 3, 9,-14, 17, 21,-31, -5, -8,-23, 6,-16,-18, 0, 2, 7, -7, 9, -4,-23,-23,-19, 15; /M: SY='G'; M= -3, 1, -3, -5, -6,-25, 20,-19,-11, -7,-13,-11, 4,-11,-10,-14, 0, -8,-20,-17,-27, -8; /M: SY='N'; M= 0, 1,-16, 0, 0,-12,-14, -6, -6, 2, 0, 0, 3, -4, -6,-10, -5, -1, -9,-31,-10, -3; /M: SY='F'; M=-18,-26,-31,-33,-26, 54,-24,-14, -3, -9, 14,-12,-18,-21,-18, -5,-12,-15, 4, 10, 29,-26; /M: SY='A'; M= 3, 0, -4, 3, 0,-16,-16,-16, -5, -6, -1, -4, -4,-15, 1, -5, 0, 3, -2,-29,-10, 0; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='Y'; M= -9, -8,-28, -4, 0, 3,-20, -7,-11, 7, 1, 3,-11, -9, -2, 3, -7, -8, -6,-10, 13, -2; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='D'; M= 2, 39,-30, 65, 4,-43, 5,-21,-31, -2,-12,-25, 13,-11,-11,-12, 0, -9,-20,-35,-16, -4; /M: SY='D'; M= 6, 10,-15, 21, 21,-32, -9, -8,-23, 7,-15,-16, 0, 6, 5, -9, 8, -2,-19,-30,-21, 13; /M: SY='D'; M= 2, 32,-25, 61, 12,-39,-12,-16,-30, 1, -8,-23, 3, -9, -3, -8, 0, -8,-15,-32, -8, 5; /M: SY='G'; M= 1, 3,-26, -7,-13,-27, 56,-26,-10, -7,-18,-16, 7,-12,-16,-19, 2,-14,-26, -5,-32,-14; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='Y'; M= -6,-11,-29, -8, -2, -1,-15, 2, -9, 1, -2, -3,-11, -9, -4, -3, 6, 0, -5, -9, 10, -6; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='E'; M= -3, 5, -8, 17, 25,-33,-15, -2,-26, 3, -9,-14, -7, -2, 20, -1, -5,-13,-25,-13, -9, 23; /M: SY='E'; M= 3, -1, -8, 1, 13,-17,-10,-12,-13, 7, -5, -1, -3, -8, -2,-10, 3, -3,-12,-22,-15, 7; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='Y'; M=-28,-22,-46,-10,-10, 15,-27, 8,-13, -7, 15, -7,-26,-15, 2, 4,-16,-11, -1, 25, 56, -8; /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30, 0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60, 0; /M: SY='R'; M= -4,-12,-23,-10,-13,-12,-16,-14,-18, 3,-11, 0, -9, -6, 15, 34, 0, -2, -4,-15, -1, -5; /M: SY='W'; M=-33,-40,-20,-38,-16, 7, 1,-40, -5,-18, -8,-16,-49,-31,-14, -6,-24,-33, -8,126, 33,-16; /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30, 0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60, 0; /M: SY='G'; M= 4, -4, -6,-11,-11,-23, 34,-29, -5,-11,-11,-11, -3,-15,-14,-17, -1,-10,-14,-11,-31,-13; /M: SY='D'; M= 5, 12,-18, 22, 20,-32, -9,-10,-24, 7,-15,-12, 1, -3, 19, 1, 2, -6,-22,-24,-16, 18; /M: SY='G'; M= 1, 3,-36, -4,-16,-29, 60,-25,-11, -8,-19,-20, 3, -5,-17,-19, 3,-12,-27, -2,-28,-17; /M: SY='G'; M= -1, -2,-34, -9,-11,-25, 49,-21,-12, -3,-15,-11, -1,-10, -9,-10, -3,-17,-25, 3,-20,-10; /M: SY='E'; M= 5, 13,-13, 14, 15,-27,-12,-11,-17, 6,-12, -7, 13, -4, 9,-10, 6, 5,-17,-35,-19, 13; /M: SY='I'; M= -3,-13, -9,-15,-18, 14,-18,-17, 27,-20, 27, 12,-18,-32,-23,-18,-16, 2, 22,-22, 19,-18; /M: SY='Y'; M= -8,-18,-23,-23,-22, 20,-22,-16, 20,-15, 20, 2,-15,-27,-14,-14,-11, 2, 20,-11, 22,-20; /M: SY='C'; M= -8,-12, 45,-19, -2,-15,-15,-24, 0,-13, 3, -3, -6,-23,-15,-17, -4, -3, -4,-23,-25, -7; /M: SY='C'; M=-29,-17,161,-25, 10,-31,-39,-49,-21,-29, 0,-20, -9,-29,-20,-20,-19,-20,-20,-21,-58, 0; /M: SY='D'; M= 2, 23,-24, 38, 6,-32, 4,-17,-25, 2,-15,-20, 8, -9, -7, -8, 9, -5,-19,-28,-17, -1; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='S'; M= 0, 2,-26, 5, 0, -7, -8,-16,-14, 6,-11,-11, 0, -4, -6, -6, 7, 0,-11,-22, -7, -5; /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30, 0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60, 0; /M: SY='P'; M= -3, -8, -6, -5, 1,-17,-17,-10, -9, -2, -9,-14,-10, 7, -3, -6, -2, -1, -9,-25,-13, -3; /M: SY='R'; M= -9,-10, -7,-11, -2, 2,-19,-16,-16, 7, -8, -1, -5,-12, 3, 20, -5,-13,-10,-12, -3, -2; /M: SY='V'; M= 8,-10, 5,-12,-11, -7,-15,-25, 9,-13, 0, -4, -9,-24,-15,-13, 3, 8, 13,-31,-15,-14; /M: SY='F'; M=-23,-30,-35,-42,-36, 83,-29,-24, 0,-10, 22,-17,-15,-36,-26, -9,-12,-17, 11, 16, 40,-36; /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30, 0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60, 0; /M: SY='K'; M= -1, -6,-19, -8, 1, -5,-13,-19, -8, 10, -7, 5, -3, -6, 0, 1, -2, -1, -7,-19, -4, 0; /M: SY='K'; M= 5, 1,-22, 4, 15,-20,-10,-12,-17, 17,-17, -1, -2, 11, 5, 1, 2, -4,-16,-27,-18, 9; /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30, 0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60, 0; /M: SY='I'; M= -1,-18,-15,-30,-25, 6,-15,-19, 48,-20, 24, 11, -7,-31,-21,-25,-12, 1, 34,-28, 2,-25; /M: SY='K'; M= 0, 1,-21, 8, 11,-17,-11,-14,-18, 16,-11, 4, -5, -4, 4, 11, -2,-10,-15,-19, -7, 7; /M: SY='R'; M= -3,-16,-20,-14, -8, -4,-18,-11,-11, 5, -7, 6,-12,-13, 16, 36, -9,-15, -3,-12, -1, -3; /M: SY='N'; M= -3, 26, -9, 4,-10, -4, -6, -4, 4, -5, -6, 5, 53,-28,-12,-20, -5, 7,-13,-58,-22,-10; /M: SY='F'; M= -7,-20,-15,-28,-24, 41,-23,-23, 15,-15, 21, -1,-13,-33,-22,-14,-11, -6, 17,-12, 17,-24; /M: SY='G'; M= 1, 0,-26, -9,-16,-27, 58,-28, -9,-10,-18,-17, 2,-11,-17,-19, 3,-12,-24, -2,-31,-17; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='P'; M= -5, -7,-13, -3, 8,-15,-12, -4,-16, 9,-11, -5, -8, 18, 5, 10, -6, -9,-16,-17, -7, 5; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='G'; M= 6, -2,-23, -3, 2,-18, 12,-16,-11, 6,-15, -5, -2, -2, -2, -3, 4, -6,-13,-17,-20, -1; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='T'; M= 5, -5,-13, -9, -4, -8, -9,-15, 1, -4, 4, 3, -2,-14, -6,-16, 0, 6, 1,-26, -8, -4; /M: SY='L'; M= -2,-10,-17, -8, -8, 6,-18,-13, 7, -8, 12, 1,-14,-23,-12, -9, -3, 1, 9,-17, 11,-10; /M: SY='E'; M= -1, -1,-16, 2, 15,-18,-14, -4,-16, 9, -5, 2, -5, -3, 7, -2, -3, -6,-15,-20, -6, 13; /M: SY='Q'; M= 3, 0,-19, 4, 9,-19, -8,-11,-15, 5,-11, -6, -4, -7, 11, 6, 4, -5,-13,-19,-11, 8; /M: SY='I'; M= 2,-17,-13,-26,-15, -7,-16, -7, 25, -8, 11, 16, -6,-25, -9,-11,-11, -2, 17,-28, -8,-15; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='A'; M= 2, -4,-21, -2, 1,-14,-15, -6, 0, -1, -3, -1, -4, -8, 1, -6, -3, -1, 0,-26, -6, 0; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='E'; M= 8, 7, -8, 7, 11,-21, -8,-13,-13, 5,-13, -4, 10, -6, 1, -8, 5, 0,-13,-36,-26, 6; /M: SY='D'; M= 8, 7,-19, 10, 4,-19, -5,-13, -9, 3, -9, -4, 5,-13, -4, -6, 6, 0, -7,-31,-18, 0; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='D'; M= 2, 19,-25, 33, 6,-29, -7, -8,-20, 1, -9,-13, 4, -7, -5,-11, 5, -2,-13,-31,-12, 0; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='P'; M= -2, 2,-13, 5, 11,-25, -9, -6,-18, 8,-16,-10, -1, 17, -1, -6, 0, -3,-20,-27,-17, 5; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='W'; M=-49,-49,-20,-40,-11, 14, 8,-49,-29,-20,-18,-30,-67,-30,-11, 0,-29,-49,-28,191, 49,-11; /M: SY='K'; M= 4, -3,-21, -6, 0, -9,-14,-14, -3, 6, -9, 3, 2,-11, 6, 3, 0, 1, -4,-26, -9, 1; /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30, 0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60, 0; /M: SY='F'; M=-29,-29,-21,-32,-26, 56,-29,-21, -6,-13, 21,-15,-24,-31,-21, -7,-16,-17, 5, 29, 44,-27; /M: SY='C'; M= -8,-17, 26,-26,-14, 8,-25,-23, 10,-15, 13, 1,-10,-30,-19,-13,-10, -4, 9,-21, -7,-16; /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30, 0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60, 0; /M: SY='D'; M= 5, 19,-21, 23, 1,-22, -4,-10,-14, 0, -9, -6, 16,-14, -5, -8, 2, -1,-13,-39,-18, -2; /M: SY='P'; M= -4, -9,-29, 1, 7,-34, -6, 6,-24, 5,-22,-26,-18, 60, 2, -8, -4, -1,-30,-29,-17, 1; /M: SY='K'; M= 3, -1,-21, -3, 11,-12, -6,-14,-15, 14,-15, -3, 1, -1, 2, -3, 12, 2,-16,-22,-14, 6; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='P'; M= -3,-10,-27, -6, 2,-28, -4, -3,-16, 3,-19,-23,-14, 50, 1, -9, -5, 1,-24,-26,-16, -2; /M: SY='L'; M= -1, -9,-12,-11,-12, 2,-16,-11, 16,-11, 20, 12,-11,-22,-13,-14,-10, 2, 11,-26, 8,-12; /M: SY='W'; M=-12,-16,-14,-13, 1, -7,-11,-15,-14, -5, -7, -8,-19,-14, 4, 1, -7,-12,-13, 27, 7, 1; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='G'; M= -2, -2,-30, -1, -3,-22, 6, 1,-15, 2,-13, -6, -2, 5, -2, -5, 2, -3,-19,-20,-12, -5; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='L'; M= -4,-10, -9, -9, -6, 8,-18, 0, 12,-16, 26, 15,-17,-18,-11,-16,-15, 0, 4,-26, 16, -6; /M: SY='R'; M= -3,-16,-16,-15,-14, -1,-21,-14, 4, -6, 3, 5,-16,-21, 6, 24,-11, -8, 9,-15, 6, -8; /M: SY='Q'; M= 7, -1,-25, 1, 3,-19, -8, 1,-12, 1,-12, -1, -1, -6, 9, 1, 5, -1,-11,-30,-16, 3; /M: SY='Q'; M= -1,-12,-22, -9, -3,-11,-16,-12, -6, -2, -7, -9,-14, -3, 10, 9, -6, -6, -3,-11, -3, -1; /M: SY='C'; M=-12,-17, 42,-18, -4,-10,-24,-21,-12,-11, -1, -4,-13,-20, -2, 10,-11,-15, -6,-16,-19, -5; /M: SY='Q'; M= -3, -2,-22, 5, 6,-19,-12, -7,-17, 3,-11, -7, -8, -2, 7, 1, -2, -6,-15, -9, -4, 5; /M: SY='D'; M= 8, 4,-24, 12, 4,-18, -7,-16,-15, 8, -9, 0, -3, -9, 2, 5, 0, -7, -7,-26,-14, 1; /M: SY='W'; M= -8,-22,-22,-23,-16, 15,-11,-27, 5,-13, 4, -4,-23,-28,-12, -8,-12,-12, 7, 29, 15,-16; /M: SY='K'; M= -1,-11,-13,-13, 1, -6,-18,-12, -5, 6, -3, 4, -8, -8, 1, 2, -4, -2, -5,-20, -5, 0; /M: SY='E'; M= 2, 3,-18, 5, 18,-27, -2, 1,-16, 7,-12, -4, 2, -2, 2,-10, 3, -9,-19,-25,-20, 12; /M: SY='K'; M= -4, -7,-19, -8, 0, 0,-12,-15,-13, 5, -5, -3, -3,-11, 2, 2, -2, -7, -9,-11, -1, -2; /M: SY='I'; M= 3,-13,-12,-16,-17, 3,-15,-21, 22,-15, 11, 1,-13,-28,-19,-15, -4, 5, 22,-24, 3,-19; /M: SY='E'; M= 2, -3,-19, -1, 16,-20,-15, -4,-15, 15,-11, 5, -4, 0, 11, 4, 0, -6,-15,-22,-11, 13; /M: SY='E'; M= 3, 1,-16, 5, 8,-16,-13,-12, -9, 6, -3, 2, -3, -7, 0, -6, 3, 3, -8,-27, -8, 4; /M: SY='L'; M= -2,-10,-18,-14, -5, 0,-15, -1, 0, -4, 6, 6, -4,-20, 3, -3, -9, -4, -5,-18, 2, -2; /M: SY='F'; M= -5, -4,-20, -6, -1, 5,-19, -3, -6, 0, 3, 1, -3,-15, -7, -9, -5, -7, -6,-22, 2, -4; /M: SY='A'; M= 6, -1,-21, 4, 1,-17,-11,-13, -9, 1, -7, -4, -6, -4, 5, 3, 3, 0, -6,-27,-11, 0; /M: SY='Q'; M= 2, 0,-20, 1, 2,-19,-10, -6, -9, 0,-10, -6, 1, -6, 4, -3, 3, -1,-10,-24,-13, 1; /M: SY='N'; M= 2, 4,-17, 1, -2,-13,-10,-10, -1, -1, -4, -1, 9, -6, -4, -9, -3, 2, -7,-36,-14, -4; /M: SY='D'; M= 4, 2,-22, 7, 7,-20, -7, -8,-14, 7,-12, -4, -2, -4, 3, 0, 7, -2,-12,-25,-14, 3; /M: SY='N'; M= 6, 12,-19, 12, 5,-16, -9,-13,-14, 7,-12, -2, 15,-13, 0, -3, 3, -3,-12,-35,-20, 1; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
Numerical results
UniProtKB/Swiss-Prot release number: 2013_05, total number of sequence entries in that release: 540052. Total number of hits in UniProtKB/Swiss-Prot: 15 hits in 15 different sequences Number of hits on proteins that are known to belong to the set under consideration: 15 hits in 15 different sequences Number of hits on proteins that could potentially belong to the set under consideration: 0 hits in 0 different sequences Number of false hits (on unrelated proteins): 0 hits in 0 different sequences Number of known missed hits: 0 Number of partial sequences which belong to the set under consideration, but which are not hit by the pattern or profile because they are partial (fragment) sequences: 0 Precision (true hits / (true hits + false positives)): 100.00 % Recall (true hits / (true hits + false negatives)): 100.00 %
Comments
MATRIX_TYPE: protein_domain Scaling database: UniProtKB/Swiss-Prot: reversed Matrix author: CJA_Sigrist Taxonomic range: Eukaryotes Maximum known number of repetitions of the pattern in a single protein: 1 FT_KEY: DOMAIN FT_DESC: ADD VERSION: 1
Cross-references
UniProtKB/Swiss-Prot	True positive hits: ATRX_HUMAN (P46100), ATRX_MACEU (P82798), ATRX_MOUSE (Q61687), ATRX_PANTR (Q7YQM4), ATRX_PONPY (Q7YQM3), ATRY_MACEU (P83946), DNM3A_CHICK (Q4W5Z4), DNM3A_HUMAN (Q9Y6K1), DNM3A_MOUSE (O88508), DNM3A_RAT (Q1LZ53), DNM3B_HUMAN (Q9UBC3), DNM3B_MOUSE (O88509), DNM3L_HUMAN (Q9UJW3), DNM3L_MOUSE (Q9CWR8), DNM3L_RAT (Q1LZ50) Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
PDB [Detailed view]	2JM1; 2LBM; 2LD1; 2PV0; 2PVC; 3A1A; 3A1B; 3QL9; 3QLA; 3QLC; 3QLN;

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)

If you would like to retrieve all the Swiss-Prot entries referenced in the DR lines of this entry (with the exception of false positive hits) , you can enter a file name. These entries will then be saved to a file under this name. (Please note that this temporary file will only be kept for 1 week.)

SIB Swiss Institute of Bioinformatics | Disclaimer

Back to the Top