PROSITE entry PS51537

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	NV_3CL_PRO
Accession [info]	PS51537
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-MAY-2011 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51537
Associated ProRule [info]	PRU00870

Name and characterization of the entry

Description [info]

Norovirus 3C-like protease (NV 3CLpro) domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=181;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=176;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.8717422; R2=0.0085379; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-59128.3281250; R2=42.6196518; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=660; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=425; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-34; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='A';  M= 80,-40,-20,-50,-30,-50,-10,-40,-40,-20,-40,-30,-40,-20,-20,-30, 10,-10,-20,-60,-50,-20;
/M: SY='P';  M=-20,-50,-80,-50,-40,-70,-60,-50,-70,-30,-70,-50,-50,120,-40,-50,-30,-40,-60,-80,-70,-40;
/M: SY='P';  M=-20,-50,-80,-50,-40,-70,-60,-50,-70,-30,-70,-50,-50,120,-40,-50,-30,-40,-60,-80,-70,-40;
/M: SY='T';  M= -1,-15,-30,-31,-25,-50,-36,-35,-39,-25,-49,-29, -5,-35,-25,-30, 52, 58,-24,-70,-50,-25;
/M: SY='I';  M=-38,-78,-39,-80,-67,-11,-83,-63, 46,-57, 44, 35,-67,-67,-50,-61,-52,-32, 18,-53,-42,-61;
/M: SY='W';  M=-60,-90,-70,  0,-80,  0,-70,-50,-60,-80,-50,-40,-80,-80,-50,-70,-70,-70,-50,170, 20,-70;
/M: SY='S';  M= 10,-10,-30,-20,-20,-50,-20,-30,-50,-20,-60,-40,  0,-30,-20,-30, 90, 20,-40,-70,-50,-20;
/M: SY='R';  M=-30,-40,-80,-50,-20,-60,-60,-10,-70, 30,-60,-40,-20,-50,  0,100,-30,-30,-60,-70,-50,-10;
/M: SY='V';  M=-29,-75,-30,-37,-59,-25,-85,-70, 58,-55,  9,  5,-70,-65,-55,-65,-45,-19, 62,-55,-45,-59;
/M: SY='V';  M=-16,-52,-30,-14,-43,-37,-69,-59, 15,-43,-14, -7,-49,-53,-43,-49,-19, 25, 48,-57,-50,-43;
/M: SY='N';  M=-33,  5,-66,-19,-16,-65,-40, -9,-68, 25,-65,-45, 42,-46, -1, 31,-14,-21,-63,-77,-50,-13;
/M: SY='F';  M=-50,-70,-40,-80,-80,110,-80,-40,-20,-60,  0,-10,-70,-70,-60,-60,-50,-50,-30,  0, 40,-70;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='S';  M= 10,-10,-30,-20,-20,-50,-20,-30,-50,-20,-60,-40,  0,-30,-20,-30, 90, 20,-40,-70,-50,-20;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='W';  M=-60,-90,-70,  0,-80,  0,-70,-50,-60,-80,-50,-40,-80,-80,-50,-70,-70,-70,-50,170, 20,-70;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='F';  M=-50,-70,-40,-80,-80,110,-80,-40,-20,-60,  0,-10,-70,-70,-60,-60,-50,-50,-30,  0, 40,-70;
/M: SY='W';  M=-60,-90,-70,  0,-80,  0,-70,-50,-60,-80,-50,-40,-80,-80,-50,-70,-70,-70,-50,170, 20,-70;
/M: SY='V';  M=-20,-70,-30,  0,-50,-30,-80,-70, 40,-50,  0,  0,-70,-60,-50,-60,-40,-10, 80,-50,-50,-50;
/M: SY='S';  M= 10,-10,-30,-20,-20,-50,-20,-30,-50,-20,-60,-40,  0,-30,-20,-30, 90, 20,-40,-70,-50,-20;
/M: SY='P';  M=-20,-50,-80,-50,-40,-70,-60,-50,-70,-30,-70,-50,-50,120,-40,-50,-30,-40,-60,-80,-70,-40;
/M: SY='T';  M= -1,-15,-30,-31,-25,-50,-36,-35,-39,-25,-49,-29, -5,-35,-25,-30, 52, 58,-24,-70,-50,-25;
/M: SY='V';  M=-29,-75,-39,-37,-59,-16,-80,-65, 31,-55, 37, 14,-70,-65,-50,-60,-49,-24, 43,-50,-45,-55;
/M: SY='F';  M=-50,-70,-40,-80,-80,110,-80,-40,-20,-60,  0,-10,-70,-70,-60,-60,-50,-50,-30,  0, 40,-70;
/M: SY='I';  M=-37,-78,-30,-68,-67,-22,-88,-70, 74,-58, 17,  8,-70,-68,-58,-68,-48,-27, 46,-58,-42,-67;
/M: SY='T';  M=-10,-20,-30,-40,-30,-50,-50,-40,-30,-30,-40,-20,-10,-40,-30,-30, 20, 90,-10,-70,-50,-30;
/M: SY='T';  M= -1,-15,-30,-31,-25,-50,-36,-35,-39,-25,-49,-29, -5,-35,-25,-30, 52, 58,-24,-70,-50,-25;
/M: SY='T';  M=-10,-20,-30,-40,-30,-50,-50,-40,-30,-30,-40,-20,-10,-40,-30,-30, 20, 90,-10,-70,-50,-30;
/M: SY='H';  M=-40,-20,-80,-30,-20,-40,-60,130,-70,-30,-60,-50,  0,-50, 10,-10,-30,-40,-70,-50, 10,-10;
/M: SY='V';  M=-20,-70,-30,  0,-50,-30,-80,-70, 40,-50,  0,  0,-70,-60,-50,-60,-40,-10, 80,-50,-50,-50;
/M: SY='I';  M=-40,-80,-30,-80,-70,-20,-90,-70, 80,-60, 20, 10,-70,-70,-60,-70,-50,-30, 40,-60,-40,-70;
/M: SY='P';  M=-20,-50,-80,-50,-40,-70,-60,-50,-70,-30,-70,-50,-50,120,-40,-50,-30,-40,-60,-80,-70,-40;
/M: SY='Q';  M=-19,-30,-48,-37,-13,-50,-56,-22,-26,-12,-35,-15,-20,-45, 30,-23,-10, 16,-20,-59,-44,  0;
/M: SY='G';  M= -6,-26,-62,-36,-52,-74, 69,-54,-82,-44,-76,-64,-16,-54,-44,-54,  1,-37,-72,-70,-74,-44;
/M: SY='A';  M= 51,-43,-23,-39,-34,-46,-28,-46,-24,-27,-32,-23,-42,-30,-27,-36,  2,  1,  0,-59,-50,-27;
/M: SY='Q';  M=-22,-24,-75,-29,  5,-60,-52, -8,-62, 50,-55,-31,-12,-38, 58, 29,-22,-30,-52,-64,-45, 21;
/M: SY='E';  M=-30,  0,-90, 20,100,-80,-60,-20,-70,  0,-70,-50,-20,-40, 20,-20,-20,-30,-50,-80,-70, 70;
/M: SY='F';  M=-50,-70,-40,-80,-80,110,-80,-40,-20,-60,  0,-10,-70,-70,-60,-60,-50,-50,-30,  0, 40,-70;
/M: SY='F';  M=-50,-70,-40,-80,-80,110,-80,-40,-20,-60,  0,-10,-70,-70,-60,-60,-50,-50,-30,  0, 40,-70;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='E';  M=-25,-32,-62, 11, 31,-57,-69,-43,-19,-23,-38,-27,-43,-49,-12,-38,-29,-21, 10,-66,-61, 15;
/M: SY='P';  M=-12,-39,-67,-42,-35,-65,-49,-45,-65,-27,-67,-47,-37, 80,-35,-45,  2,-24,-55,-77,-65,-35;
/M: SY='I';  M=-38,-79,-37,-70,-68,-14,-85,-66, 54,-59, 39, 16,-70,-69,-55,-65,-52,-31, 31,-55,-41,-64;
/M: SY='K';  M=-25, -3,-72, -2, 16,-65,-50,-30,-59, 36,-61,-44, -9,-37,  4, -4,-12, -9,-34,-65,-57,  7;
/M: SY='Q';  M= -4,-15,-48,-20, -2,-55,-34,-12,-55, -2,-55,-31, -5,-35, 40,-16, 39, -3,-45,-61,-45, 12;
/M: SY='I';  M=-40,-80,-30,-80,-70,-20,-90,-70, 80,-60, 20, 10,-70,-70,-60,-70,-50,-30, 40,-60,-40,-70;
/M: SY='Q';  M= 34,-31,-43,-36, -7,-55,-28,-17,-49, -2,-45,-25,-26,-29, 40,-16, -4,-19,-34,-55,-45, 12;
/M: SY='I';  M=-40,-80,-30,-80,-70,-20,-90,-70, 80,-60, 20, 10,-70,-70,-60,-70,-50,-30, 40,-60,-40,-70;
/M: SY='H';  M=-40,-20,-80,-30,-20,-40,-60,130,-70,-30,-60,-50,  0,-50, 10,-10,-30,-40,-70,-50, 10,-10;
/M: SY='R';  M=-25,-31,-80,-41,-11,-60,-55,-19,-65, 62,-60,-40,-15,-41,  9, 68,-25,-30,-55,-75,-50, -5;
/M: SY='A';  M= 48,-26,-25,-36,-25,-50,-15,-35,-45,-20,-49,-35,-22,-25,-20,-30, 47,  4,-29,-65,-50,-20;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='E';  M=-30,  0,-90, 20,100,-80,-60,-20,-70,  0,-70,-50,-20,-40, 20,-20,-20,-30,-50,-80,-70, 70;
/M: SY='F';  M=-50,-70,-40,-80,-80,110,-80,-40,-20,-60,  0,-10,-70,-70,-60,-60,-50,-50,-30,  0, 40,-70;
/M: SY='C';  M=-15,-43, 48,-58,-58,-45,-59,-58,-30,-53,-45,-29,-28,-58,-48,-53, -3, 35,-19,-70,-55,-53;
/M: SY='R';  M=-28,-41,-71,-45,-16,-49,-60,-13,-49,  9,-30,-20,-26,-50, 29, 35,-32,-32,-45,-59,-45,  1;
/M: SY='F';  M=-45,-75,-45,-80,-75, 59,-80,-49, -2,-60, 37,  8,-70,-70,-55,-60,-55,-45,-16,-23,  3,-65;
/M: SY='R';  M=-30,-40,-80,-50,-20,-60,-60,-10,-70, 30,-60,-40,-20,-50,  0,100,-30,-30,-60,-70,-50,-10;
/M: SY='F';  M=-50,-70,-40,-80,-80,110,-80,-40,-20,-60,  0,-10,-70,-70,-60,-60,-50,-50,-30,  0, 40,-70;
/M: SY='P';  M= -4,-28,-53,-34,-29,-59,-38,-39,-59,-25,-65,-45,-23, 39,-29,-39, 35, -8,-49,-75,-59,-29;
/M: SY='K';  M=-23,-27,-80,-37, -7,-60,-53,-23,-63, 76,-60,-40,-13,-37, 13, 54,-23,-30,-53,-77,-50, -3;
/M: SY='K';  M=-20,-34,-80,-39,-18,-65,-55,-39,-65, 40,-65,-45,-28, 39, -8, -7,-25,-35,-55,-80,-59,-18;
/M: SY='I';  M=-36,-78,-30,-65,-66,-22,-88,-70, 72,-58, 16,  8,-70,-68,-58,-68,-48,-26, 48,-58,-42,-66;
/M: SY='R';  M=-30,-40,-80,-50,-20,-60,-60,-10,-70, 30,-60,-40,-20,-50,  0,100,-30,-30,-60,-70,-50,-10;
/M: SY='P';  M=-15,-36,-57,-45,-35,-61,-55,-45,-52,-30,-56,-36,-32, 46,-35,-41, -7, 20,-37,-75,-61,-35;
/M: SY='D';  M=-50, 60,-80,100, 20,-80,-40,-30,-80,-30,-80,-80, 10,-50,-20,-50,-20,-40,  0,  0,-70,  0;
/M: SY='L';  M=-31,-75,-41,-43,-61,-14,-80,-65, 29,-55, 43, 16,-70,-65,-50,-60,-51,-26, 37,-50,-45,-55;
/M: SY='T';  M=-10,-20,-30,-40,-30,-50,-50,-40,-30,-30,-40,-20,-10,-40,-30,-30, 20, 90,-10,-70,-50,-30;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='M';  M=-30,-70,-40,-80,-50,-10,-70,-50, 10,-40, 30,120,-50,-50,-20,-40,-40,-20,  0,-40,-50,-40;
/M: SY='I';  M=-33,-77,-30,-52,-63,-23,-87,-70, 66,-57, 13,  7,-70,-67,-57,-67,-47,-23, 54,-57,-43,-63;
/M: SY='L';  M=-40,-80,-50,-80,-70,  0,-80,-60, 20,-60, 80, 30,-70,-70,-50,-60,-60,-40,  0,-50,-40,-60;
/M: SY='E';  M=-30,  0,-90, 20,100,-80,-60,-20,-70,  0,-70,-50,-20,-40, 20,-20,-20,-30,-50,-80,-70, 70;
/M: SY='E';  M=-30,  0,-90, 20,100,-80,-60,-20,-70,  0,-70,-50,-20,-40, 20,-20,-20,-30,-50,-80,-70, 70;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='C';  M= 26,-56, 66,-66,-62,-45,-42,-62,-35,-52,-45,-35,-45,-52,-47,-57,-12,-21,-25,-65,-55,-52;
/M: SY='P';  M=-20,-50,-80,-50,-40,-70,-60,-50,-70,-30,-70,-50,-50,120,-40,-50,-30,-40,-60,-80,-70,-40;
/M: SY='E';  M=-30,  0,-90, 20,100,-80,-60,-20,-70,  0,-70,-50,-20,-40, 20,-20,-20,-30,-50,-80,-70, 70;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='T';  M=-13,-37,-30,-26,-37,-43,-60,-50, -6,-37,-26,-13,-31,-47,-37,-40, -1, 55, 21,-63,-50,-37;
/M: SY='V';  M=-20,-70,-30,  0,-50,-30,-80,-70, 40,-50,  0,  0,-70,-60,-50,-60,-40,-10, 80,-50,-50,-50;
/M: SY='C';  M= 14,-60, 65,-60,-65,-42,-51,-65,-25,-56,-40,-32,-49,-57,-51,-61,-18,-21,-13,-64,-55,-56;
/M: SY='S';  M=  1,-15,-30,-29,-25,-50,-34,-35,-41,-25,-51,-31, -5,-35,-25,-30, 58, 52,-26,-70,-50,-25;
/M: SY='I';  M=-36,-78,-39,-65,-66,-13,-83,-65, 45,-58, 44, 17,-70,-68,-53,-63,-53,-31, 29,-53,-42,-62;
/M: SY='L';  M=-40,-80,-50,-80,-70,  0,-80,-60, 20,-60, 80, 30,-70,-70,-50,-60,-60,-40,  0,-50,-40,-60;
/M: SY='I';  M=-40,-80,-30,-80,-70,-20,-90,-70, 80,-60, 20, 10,-70,-70,-60,-70,-50,-30, 40,-60,-40,-70;
/M: SY='K';  M=-20,-20,-80,-30,  0,-60,-50,-30,-60,100,-60,-40,-10,-30, 20, 30,-20,-30,-50,-80,-50,  0;
/M: SY='R';  M=-30,-40,-80,-50,-20,-60,-60,-10,-70, 30,-60,-40,-20,-50,  0,100,-30,-30,-60,-70,-50,-10;
/M: SY='D';  M=-32, 14,-74, 35, -5,-73,-44,-37,-73,-29,-74,-65,-11, 10,-27,-48,-10,-33,-25,-36,-68,-16;
/M: SY='S';  M=  1,-15,-30,-29,-25,-50,-34,-35,-41,-25,-51,-31, -5,-35,-25,-30, 58, 52,-26,-70,-50,-25;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='E';  M=-30,  0,-90, 20,100,-80,-60,-20,-70,  0,-70,-50,-20,-40, 20,-20,-20,-30,-50,-80,-70, 70;
/M: SY='L';  M=-40,-80,-50,-80,-70,  0,-80,-60, 20,-60, 80, 30,-70,-70,-50,-60,-60,-40,  0,-50,-40,-60;
/M: SY='M';  M=-35,-75,-45,-80,-61, -5,-75,-55, 15,-51, 57, 71,-61,-61,-36,-51,-51,-31,  0,-45,-45,-51;
/M: SY='P';  M=-20,-50,-80,-50,-40,-70,-60,-50,-70,-30,-70,-50,-50,120,-40,-50,-30,-40,-60,-80,-70,-40;
/M: SY='L';  M=-40,-80,-50,-80,-70,  0,-80,-60, 20,-60, 80, 30,-70,-70,-50,-60,-60,-40,  0,-50,-40,-60;
/M: SY='A';  M= 80,-40,-20,-50,-30,-50,-10,-40,-40,-20,-40,-30,-40,-20,-20,-30, 10,-10,-20,-60,-50,-20;
/M: SY='V';  M= 26,-56,-25,-23,-41,-39,-48,-56,  3,-36,-18,-14,-56,-42,-36,-46,-17,-10, 34,-55,-50,-36;
/M: SY='R';  M=-30,-40,-80,-50,-20,-60,-60,-10,-70, 30,-60,-40,-20,-50,  0,100,-30,-30,-60,-70,-50,-10;
/M: SY='M';  M=-30,-70,-40,-80,-50,-10,-70,-50, 10,-40, 30,120,-50,-50,-20,-40,-40,-20,  0,-40,-50,-40;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='A';  M= 39,-31,-25,-45,-30,-50,-28,-40,-35,-25,-40,-25,-26,-29,-25,-30, 15, 36,-15,-65,-50,-25;
/M: SY='H';  M=-37,-51,-53,-44,-44,-31,-75, 22,  5,-45,-20,-19,-38,-59,-26,-41,-39,-31, -4,-54,-19,-39;
/M: SY='A';  M= 80,-40,-20,-50,-30,-50,-10,-40,-40,-20,-40,-30,-40,-20,-20,-30, 10,-10,-20,-60,-50,-20;
/M: SY='S';  M=  1,-15,-30,-29,-25,-50,-34,-35,-41,-25,-51,-31, -5,-35,-25,-30, 58, 52,-26,-70,-50,-25;
/M: SY='M';  M=-30,-70,-40,-80,-50,-10,-70,-50, 10,-40, 30,120,-50,-50,-20,-40,-40,-20,  0,-40,-50,-40;
/M: SY='K';  M=-23,-27,-80,-37, -7,-60,-53,-23,-63, 76,-60,-40,-13,-37, 13, 54,-23,-30,-53,-77,-50, -3;
/M: SY='I';  M=-40,-80,-30,-80,-70,-20,-90,-70, 80,-60, 20, 10,-70,-70,-60,-70,-50,-30, 40,-60,-40,-70;
/M: SY='Q';  M=-20,-20,-70,-20, 20,-60,-50, 10,-60, 20,-50,-20,-10,-40,110,  0,-20,-30,-50,-50,-40, 50;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='R';  M=-30,-40,-80,-50,-20,-60,-60,-10,-70, 30,-60,-40,-20,-50,  0,100,-30,-30,-60,-70,-50,-10;
/M: SY='L';  M=-26,-52,-41,-62,-52,-23,-66,-51, -3,-46, 25,  7,-42,-56,-41,-46,-23, 20, -5,-59,-45,-46;
/M: SY='V';  M=-20,-70,-30,  0,-50,-30,-80,-70, 40,-50,  0,  0,-70,-60,-50,-60,-40,-10, 80,-50,-50,-50;
/M: SY='H';  M=-26,-25,-75,-35,-38,-58,  9, 43,-79,-39,-69,-59, -9,-55,-18,-33,-25,-45,-75,-59,-31,-28;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='Q';  M=-20,-20,-70,-20, 20,-60,-50, 10,-60, 20,-50,-20,-10,-40,110,  0,-20,-30,-50,-50,-40, 50;
/M: SY='M';  M= -8,-38,-35,-48,-34,-32,-43,-39,-22,-29,-19, 34,-23,-39,-20,-35, 30,  2,-22,-56,-50,-29;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='M';  M=-30,-70,-40,-80,-50,-10,-70,-50, 10,-40, 30,120,-50,-50,-20,-40,-40,-20,  0,-40,-50,-40;
/M: SY='L';  M=-40,-80,-50,-80,-70,  0,-80,-60, 20,-60, 80, 30,-70,-70,-50,-60,-60,-40,  0,-50,-40,-60;
/M: SY='L';  M=-40,-80,-50,-80,-70,  0,-80,-60, 20,-60, 80, 30,-70,-70,-50,-60,-60,-40,  0,-50,-40,-60;
/M: SY='T';  M=-10,-20,-30,-40,-30,-50,-50,-40,-30,-30,-40,-20,-10,-40,-30,-30, 20, 90,-10,-70,-50,-30;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='A';  M= 48,-26,-25,-36,-25,-50,-15,-35,-45,-20,-49,-35,-22,-25,-20,-30, 47,  4,-29,-65,-50,-20;
/M: SY='N';  M=-40, 50,-50, 10,-20,-70,-20,  0,-70,-10,-70,-50,110,-50,-10,-20,  0,-10,-70,-80,-50,-20;
/M: SY='A';  M= 80,-40,-20,-50,-30,-50,-10,-40,-40,-20,-40,-30,-40,-20,-20,-30, 10,-10,-20,-60,-50,-20;
/M: SY='K';  M=-20,-20,-80,-30,  0,-60,-50,-30,-60,100,-60,-40,-10,-30, 20, 30,-20,-30,-50,-80,-50,  0;
/M: SY='G';  M= -1,-21,-52,-31,-42,-66, 39,-46,-72,-36,-71,-56,-11,-46,-36,-46, 31,-18,-62,-70,-66,-36;
/M: SY='M';  M=-30,-70,-40,-80,-50,-10,-70,-50, 10,-40, 30,120,-50,-50,-20,-40,-40,-20,  0,-40,-50,-40;
/M: SY='D';  M=-50, 60,-80,100, 20,-80,-40,-30,-80,-30,-80,-80, 10,-50,-20,-50,-20,-40,  0,  0,-70,  0;
/M: SY='L';  M=-40,-80,-50,-80,-70,  0,-80,-60, 20,-60, 80, 30,-70,-70,-50,-60,-60,-40,  0,-50,-40,-60;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='T';  M=-10,-20,-30,-40,-30,-50,-50,-40,-30,-30,-40,-20,-10,-40,-30,-30, 20, 90,-10,-70,-50,-30;
/M: SY='T';  M=-26,-52,-37,-62,-52,-27,-68,-53,  8,-46, 13,  3,-42,-56,-43,-48,-21, 22,  3,-61,-45,-48;
/M: SY='P';  M=-20,-50,-80,-50,-40,-70,-60,-50,-70,-30,-70,-50,-50,120,-40,-50,-30,-40,-60,-80,-70,-40;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='D';  M=-50, 60,-80,100, 20,-80,-40,-30,-80,-30,-80,-80, 10,-50,-20,-50,-20,-40,  0,  0,-70,  0;
/M: SY='C';  M=-20,-70,140,-80,-90,-40,-70,-80,-30,-80,-50,-40,-50,-80,-70,-80,-30,-30,-30,-70,-60,-80;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='C';  M= 34,-54, 54,-64,-58,-45,-38,-58,-35,-48,-45,-35,-45,-48,-43,-53, -8,-19,-25,-65,-55,-48;
/M: SY='P';  M=-20,-50,-80,-50,-40,-70,-60,-50,-70,-30,-70,-50,-50,120,-40,-50,-30,-40,-60,-80,-70,-40;
/M: SY='Y';  M=-50,-60,-60,-70,-70, 40,-80, 10,-40,-50,-40,-50,-50,-70,-40,-50,-50,-50,-50, 20,120,-60;
/M: SY='V';  M=-29,-75,-30,-37,-59,-25,-85,-70, 58,-55,  9,  5,-70,-65,-55,-65,-45,-19, 62,-55,-45,-59;
/M: SY='Y';  M=-50,-60,-60,-70,-70, 40,-80, 10,-40,-50,-40,-50,-50,-70,-40,-50,-50,-50,-50, 20,120,-60;
/M: SY='K';  M=-20,-20,-80,-30,  0,-60,-50,-30,-60,100,-60,-40,-10,-30, 20, 30,-20,-30,-50,-80,-50,  0;
/M: SY='R';  M=-30,-40,-80,-50,-20,-60,-60,-10,-70, 30,-60,-40,-20,-50,  0,100,-30,-30,-60,-70,-50,-10;
/M: SY='N';  M= -7,  2,-57,-13,-10,-71,  4,-28,-70,-21,-67,-52, 21,-45,-17,-33, -7,-25,-59,-73,-62,-11;
/M: SY='N';  M=-40, 50,-50, 10,-20,-70,-20,  0,-70,-10,-70,-50,110,-50,-10,-20,  0,-10,-70,-80,-50,-20;
/M: SY='D';  M=-50, 60,-80,100, 20,-80,-40,-30,-80,-30,-80,-80, 10,-50,-20,-50,-20,-40,  0,  0,-70,  0;
/M: SY='W';  M=-55,-76,-65,-32,-75, 18,-75,-22,-51,-66,-45,-45,-66,-75,-45,-61,-61,-61,-50,101, 66,-65;
/M: SY='V';  M=-20,-70,-30,  0,-50,-30,-80,-70, 40,-50,  0,  0,-70,-60,-50,-60,-40,-10, 80,-50,-50,-50;
/M: SY='V';  M=-20,-70,-30,  0,-50,-30,-80,-70, 40,-50,  0,  0,-70,-60,-50,-60,-40,-10, 80,-50,-50,-50;
/M: SY='C';  M=-29,-75, 62,-80,-81,-31,-79,-75, 21,-71,-18,-17,-59,-75,-65,-75,-39,-30,  2,-65,-51,-75;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='V';  M=-20,-70,-30,  0,-50,-30,-80,-70, 40,-50,  0,  0,-70,-60,-50,-60,-40,-10, 80,-50,-50,-50;
/M: SY='H';  M=-40,-20,-80,-30,-20,-40,-60,130,-70,-30,-60,-50,  0,-50, 10,-10,-30,-40,-70,-50, 10,-10;
/M: SY='A';  M= 39,-31,-25,-45,-30,-50,-28,-40,-35,-25,-40,-25,-26,-29,-25,-30, 15, 36,-15,-65,-50,-25;
/M: SY='A';  M= 80,-40,-20,-50,-30,-50,-10,-40,-40,-20,-40,-30,-40,-20,-20,-30, 10,-10,-20,-60,-50,-20;
/M: SY='A';  M= 80,-40,-20,-50,-30,-50,-10,-40,-40,-20,-40,-30,-40,-20,-20,-30, 10,-10,-20,-60,-50,-20;
/M: SY='T';  M= 31,-29,-25,-45,-30,-50,-32,-40,-35,-25,-40,-25,-24,-31,-25,-30, 15, 44,-15,-65,-50,-25;
/M: SY='K';  M=-25,-29,-80,-39, -9,-60,-55,-21,-65, 68,-60,-40,-15,-39, 11, 62,-25,-30,-55,-75,-50, -5;
/M: SY='S';  M=  1,-19,-48,-29,-38,-64, 31,-44,-68,-34,-69,-54, -9,-44,-34,-44, 39,-12,-58,-70,-64,-34;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='N';  M=-40, 50,-50, 10,-20,-70,-20,  0,-70,-10,-70,-50,110,-50,-10,-20,  0,-10,-70,-80,-50,-20;
/M: SY='T';  M=-10,-20,-30,-40,-30,-50,-50,-40,-30,-30,-40,-20,-10,-40,-30,-30, 20, 90,-10,-70,-50,-30;
/M: SY='V';  M=-20,-70,-30,  0,-50,-30,-80,-70, 40,-50,  0,  0,-70,-60,-50,-60,-40,-10, 80,-50,-50,-50;
/M: SY='V';  M=-29,-75,-30,-37,-59,-25,-85,-70, 58,-55,  9,  5,-70,-65,-55,-65,-45,-19, 62,-55,-45,-59;
/M: SY='C';  M=-20,-70,140,-80,-90,-40,-70,-80,-30,-80,-50,-40,-50,-80,-70,-80,-30,-30,-30,-70,-60,-80;
/M: SY='A';  M= 80,-40,-20,-50,-30,-50,-10,-40,-40,-20,-40,-30,-40,-20,-20,-30, 10,-10,-20,-60,-50,-20;
/M: SY='V';  M=-15,-47,-30,-18,-41,-39,-66,-56,  8,-41,-18, -9,-42,-51,-41,-46,-12, 36, 39,-59,-50,-41;
/M: SY='Q';  M=-20,-20,-70,-20, 20,-60,-50, 10,-60, 20,-50,-20,-10,-40,110,  0,-20,-30,-50,-50,-40, 50;
/M: SY='A';  M= 39,-35,-43,-45,-44,-64, 36,-49,-63,-34,-58,-48,-31,-38,-34,-44, -4,-28,-48,-65,-64,-34;
/M: SY='S';  M=  3,-17,-44,-27,-34,-60, 18,-40,-64,-30,-67,-50, -7,-40,-30,-40, 52, -4,-54,-70,-60,-30;
/M: SY='E';  M=-30,  0,-90, 20,100,-80,-60,-20,-70,  0,-70,-50,-20,-40, 20,-20,-20,-30,-50,-80,-70, 70;
/M: SY='G';  M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='E';  M=-30,  0,-90, 20,100,-80,-60,-20,-70,  0,-70,-50,-20,-40, 20,-20,-20,-30,-50,-80,-70, 70;
/M: SY='T';  M= 31,-29,-25,-45,-30,-50,-32,-40,-35,-25,-40,-25,-24,-31,-25,-30, 15, 44,-15,-65,-50,-25;
/M: SY='T';  M=-12,-28,-30,-34,-33,-47,-55,-45,-19,-33,-34,-17,-19,-43,-33,-35, 11, 74,  4,-67,-50,-33;
/M: SY='L';  M=-40,-80,-50,-80,-70,  0,-80,-60, 20,-60, 80, 30,-70,-70,-50,-60,-60,-40,  0,-50,-40,-60;
/M: SY='E';  M=-30,  0,-90, 20,100,-80,-60,-20,-70,  0,-70,-50,-20,-40, 20,-20,-20,-30,-50,-80,-70, 70;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.

Total number of hits	4 in 4 different sequences
Number of true positive hits	4 in 4 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Peptidase C37
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

4 sequences

POLG_LORDV  (P54634), POLG_MNV1   (Q80J95), POLG_NVN68  (Q83883),

POLG_SOUV3  (Q04544)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

37 PDB

2FYQ; 2FYR; 2IPH; 2LNC; 3UR6; 3UR9; 4ASH; 4IMQ; 4IMZ; 4IN1; 4IN2; 4INH; 4X2V; 4X2W; 4X2X; 4X2Y; 4XBB; 4XBC; 4XBD; 5DG6; 5DGJ; 5E0G; 5E0H; 5E0J; 5T6D; 5T6F; 5T6G; 5TG1; 5TG2; 5WEJ; 6BIB; 6BIC; 6BID; 6W5H; 6W5J; 6W5K; 6W5L
» more