Entry: PS51633

General information about the entry
Entry name CXC
Accession number PS51633
Entry type MATRIX
Date JAN-2012 (CREATED); JAN-2012 (DATA UPDATE); MAR-2013 (INFO UPDATE).
PROSITE Documentation PDOC51633
Associated ProRule PRU00970
Name and characterization of the entry
DescriptionCXC domain profile.
Matrix / Profile 
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=103;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=98;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.1430850; R2=0.0046269; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1158; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=726; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='C'; M=-14,-16, 66,-23,-19,-20,-26,-19,-30, -9,-20,-16,-13,-33,-16,  6,-10,-10,-14,-39,-23,-19;
/M: SY='R'; M=-16, -6,-30, -6,  4,-24,-20, -4,-30, 37,-24,-10,  0,-16, 10, 56,-10,-10,-20,-20,-10,  4;
/M: SY='R'; M=-14, -4,-30, -4,  6,-26,-20, -6,-30, 43,-26,-10,  0,-14, 10, 44,-10,-10,-20,-20,-10,  6;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='Q'; M= -6,  0,-23, -4,  9,-29,-20, -1,-16,  3,-16, -4,  0,-10, 35,  3,  7, 11,-19,-24,-10, 22;
/M: SY='L'; M=-10,-19,-23,-17,  1, -1,-27,-15,  7,-19, 31,  9,-22,-22, -9,-15,-22,-10, -1,-23, -5, -4;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='D'; M=-15, 37,-25, 49, 12,-32,-13, -5,-32, -3,-25,-25, 15,-10, -3,-10,  5,  5,-22,-37,-17,  5;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='G'; M= -2,  1,-25, -1, -3,-30, 24, -6,-28, -7,-27,-15, 10,-16,  8, -7,  8, -8,-27,-26,-22,  2;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='P'; M= -1,  0,-17,  0,  0,-18, -5, -7,-15, -6,-22,-15,  7, 18, -3, -9, 12,  4,-16,-27,-18, -3; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='C'; M=  0, -3, 19, -3,  7,-23,-13,-13,-25,-10,-25,-20, -1,-15, -3,-13, 16,  4,-15,-40,-23,  2;
/M: SY='N'; M=  4,  8,-19, -2, -4,-19, -8, -5,-19,  4,-19,-13, 18,-16, -1, 12,  6,  4,-15,-28,-16, -4;
/M: SY='H'; M=-13,  0,-30,  0, 11,-31,-20, 35,-26, 14,-23, -3,  3,-13, 30, 12, -6,-13,-27,-23,  0, 19;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='V'; M= -5,-22,-10,-25,-22, 21,-22,-19, 14,-17,  7,  5,-19,-22,-25,-15,-10, -3, 24,-12,  3,-22; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='Y'; M=-15,-15,-22,-15,-15, 22,-22, 15,  0, -7,  0,  0,-15,-22, -7, -7,-15, -7, -7, 22, 59,-15; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='N'; M= -7, 19,-17, 10,  3,-17, -5,  2,-17, 13,-22,-12, 29,-12,  3,  8,  2, -3,-19,-24,-12,  3; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-25,-23, 43,-30,  9,  0,-15,  3,  0,-20,-30,-18,-13,-20,-10, -7, 25, 67,-23;
/M: SY='T'; M= -6, 11,-19,  1,  2,-22,-15, -3,-16, -1,-18,-10, 16,-13, 14, -1, 11, 18,-17,-30,-13,  8;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='D'; M=-12, 34,-22, 36,  7,-27,-10, -2,-27, -3,-25,-22, 26,-13, -3, -7,  8,  8,-22,-37,-17,  2;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='C'; M=-10,-20, 44,-20,-16,-25,-25,-25,-25,-20,-25,-20,-20, 22,-20,-25,-10,-10,-20,-40,-30,-20;
/M: SY='K'; M=-11,  4,-30,  7,  5,-30, -3, -9,-33, 28,-28,-15,  3,-13,  3, 22, -7,-12,-23,-23,-15,  3;
/M: SY='H'; M= -8, -9,-25,-12, -5,-18,-20,  8, -5, -6,-12, -1, -1,-16,  8,  1,  2, -4, -7,-27, -5, -1;
/M: SY='P'; M=  6,-12,-29,-10,  0,-27,-15,-17,-20,  5,-25,-15,-12, 38, -5, -7, -5, -7,-19,-25,-22, -5;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='G'; M=-10, 19,-30, 28, -1,-35, 32,-10,-40,-10,-30,-25, 10,-15,-10,-15,  0,-15,-30,-30,-25, -6;
/M: SY='Q'; M= -4, -3,-22, -5,  4,-24,-14, -3,-16, 11,-19,  1,  0,-12, 18,  6,  6, -1,-14,-26,-11, 11;
/M: SY='E'; M= -5,  9,-22,  7, 20,-26,-13,  0,-21,  2,-22,-13, 12, -9, 19,  0, 11,  5,-22,-31,-16, 20;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P'; M= -7,-17,-35, -8,  0,-28,-17,-18,-20,-10,-30,-20,-15, 73, -8,-18, -1, -5,-27,-32,-28, -8;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-21,-33,-25,  5,-33,-25, 31,-28, 34, 18,-27,-27,-22,-23,-24, -8, 23,-22, -2,-25;
/M: SY='M'; M= -7,-16,-21,-21,-12, -7,-26,-14, 10,-15, 13, 15,-14,-18, -1,-13, -9,  5,  4,-23, -4, -7;
/M: SY='H'; M=  0,  9,-18, -1, -5,-17,-11, 19,-18, -7,-18,-10, 17,-15, -2, -6,  8, 10,-16,-31, -7, -5;
/M: SY='Q'; M= -7,  0,-30,  2, 20,-35,  4, -1,-28,  2,-23,-10,  0,-10, 28, -1,  0,-13,-30,-23,-18, 24;
/M: SY='N'; M= -7, 29,-17, 12, -3,-17, -5,  2,-17, -3,-25,-17, 44,-17, -3, -3, 13, 13,-22,-37,-17, -3;
/M: SY='C'; M=-15,-25, 53,-35,-30, 28,-30,-25,-16,-30, -6,-10,-20,-35,-35,-25,-15,-10, -5,-21, -1,-30;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-30,-25, 54,-30,  1,  0,-20,  5,  0,-20,-30,-24,-15,-20,-10, -5, 20, 56,-25;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='G'; M= -5,  2,-28, -2, -4,-31, 30, -6,-30, -7,-27,-14, 10,-17,  8, -7,  2,-14,-30,-23,-22,  2;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='S'; M=  5, -5,-18, -3,  0,-23, -5,-13,-20,-10,-30,-20,  2, 17, -3,-13, 27, 12,-15,-37,-23, -3;
/M: SY='K'; M= -3, -3,-25, -1,  5,-27,-13,-11,-25, 21,-30,-15,  1,  4,  4, 10,  7,  0,-18,-28,-16,  4;
/M: SY='D'; M=-10, 30,-25, 43, 21,-33, -9, -3,-33, -1,-28,-26, 14, -8,  3, -8, 11, -2,-25,-38,-20, 12;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Q'; M=-10, 10,-27,  5, 12,-32,-15,  5,-23, 18,-25, -8, 15,-13, 31, 13,  0, -7,-27,-25,-13, 22;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='P'; M=-10,-15,-35,-10, -5,-27,  3,-15,-28, -2,-27,-17,-10, 32, -7,  4, -7,-13,-27,-25,-25,-10;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='R'; M=-17,  6,-27,  0,  0,-20,-15, 29,-27, 12,-23,-10, 18,-20,  7, 33, -5,-10,-25,-28, -5,  0;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='A'; M= 26, -5, -5,-10, -5,-10,  0,-10, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5,-10,  5,  0,  0,-10,-10, -5; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='K'; M=-10, -8,-30,-10,  0,-22,-25,-15, -9, 29,-17, -2, -5,-13,  2, 15,-13,-10, -7,-20, -7,  0;
/M: SY='A'; M= 19, -6,-15,-11,-10,-21, 15,-17,-20,-13,-20,-15, -1,-13,-10,-16, 17,  7,-10,-27,-21,-10;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='N'; M=-10, 16,-20,  4, -3,-17,-10,  0,-20,  5,-22,-15, 29,-17,  0, 16,  7, 10,-20,-32,-15, -3;
/M: SY='T'; M=  0, 10,-13,  0, -5,-15,-10,-10,-15, -7,-20,-15, 18,-13, -5, -7, 23, 29,-10,-35,-15, -5;
/M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5,  5,-25,-20, -5,-30, 40,-25,-10,  0,-15, 10, 51,-10,-10,-20,-20,-10,  5;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25, 56,-30, -1,  0,-20,  5,  0,-20,-30,-26,-15,-20,-10, -5, 20, 54,-25;
/M: SY='A'; M= 21,-20,-15,-25,-15, -6,-14,-20,  4,-20, 19,  4,-20,-20,-15,-20, -9, -5,  5,-20,-10,-15;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='B'; M= -8,  9,-18,  9, -9,-16,-17,-12, -1,-10,-11, -8,  6,-22,-14,-12, -2, -3,  8,-35,-15,-12;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='L'; M= -7,-30,-17,-30,-23,  7,-30,-23, 23,-27, 39, 17,-30,-30,-23,-20,-25, -7, 21,-23, -3,-23;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='R'; M=-15,-14,-27,-14, -3,-14,-23, -4,-13,  8,  1,  1, -9,-21,  9, 32,-14,-10,-13,-20, -7,  1;
/M: SY='S'; M=  8,  9,-13, -1, -5,-17, -6, -9,-15, -7,-20,-15, 17,-13, -5, -9, 21, 20,-11,-34,-17, -5;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='G'; M= -8,-21,-38,-18,-18,-19, 23,-23,-30,-17,-27,-20,-16,  6,-17,-20,-13,-20,-30, 23,-14,-17;
/M: SY='A'; M= 21,-20,-13,-25,-18, -7,-16,-23,  8,-18, 11,  3,-20,-20,-18,-20, -6, -3, 16,-23,-12,-18;
/M: SY='S'; M=  6, -1,-19, -2, -6,-18,-12,-15, -3,-14,-13, -9,  0,-13, -7,-17, 12,  4, -1,-31,-15, -8;
/M: SY='C'; M= -9,  2,  9,  4,  2,-31,  3,-11,-33,-10,-24,-18, -2,-19,  0,-13, -3,-13,-25,-32,-24,  1;
/M: SY='G'; M=-10,-10,-28,-12,-16, -8, 25, 17,-30,-19,-20,-10,  0,-22,-14,-14, -6,-18,-25,-18, -4,-16;
/M: SY='D'; M=-18, 14,-36, 24,  3,-23,-15,-11,-32,  2,-27,-24, -2,-16, -4, -6,-14,-16,-28, 22, -3,  1;
/M: SY='G'; M= -8,  5,-28, 11, -8,-26, 28,-14,-30,-16,-16,-16,  1,-19,-14,-17, -5,-15,-23,-26,-22,-11;
/M: SY='T'; M=  3, -3,  8, -9, -9,-16,-13,-17,-17,-13,-20,-16,  1,-14, -9,-13, 24, 29, -6,-37,-17, -9;
/M: SY='L'; M=-10,-16,-25,-16, -6, -9,-25,-15, -4,  8, 12,  6,-16,-20, -6,  4,-20,-10, -4,-20, -5, -6;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='G'; M= -2, -3,-20, -6,-15,-19, 32,-13,-20,-13,-19,-12,  6,-18,-15,-13,  0,-10,-14,-21,-20,-15; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='V'; M= -4,-20,-19,-19, -7, -8,-29,-22, 18,-14,  4,  4,-21,-21,-15,-17, -9, -4, 26,-28,-11,-12;
/M: SY='T'; M=  0, -5,-18, -7, -4,-18,-14,-17,-16,-10,-21,-16, -2, 17, -7,-13, 18, 25,-11,-33,-18, -7;
/M: SY='C'; M= -5,-15, 44,-17,-14,-23,-19,-22,-25,-20,-25,-20,-12,  1,-17,-22,  3, -2,-15,-42,-27,-17;
/M: SY='K'; M= -7, -8,-25, -8,  2,-25,-23,-10,-12, 21,-17, -2, -8,-15, 13, 12, -7, -7, -5,-23,-10,  8;
/M: SY='N'; M=-13, 16,-25,  7,  5,-25,-10,  7,-23, 11,-25,-12, 29,-17, 18, 21,  2, -5,-27,-30,-15, 10;
/M: SY='C'; M= -6,-22, 19,-27,-27,-14, -6,-27, -2,-26, -7, -5,-16,-28,-25,-26,-10,-11,  5,-31,-19,-27;
/M: SY='D'; M= -7, 10,  2, 13,  5,-30,-13, -6,-27, -6,-26,-18,  5,-15, 10, -8, 11, -1,-20,-37,-19,  8;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
Numerical results
  • UniProtKB/Swiss-Prot release number: 2013_05, total number of sequence entries in that release: 540052.
  • Total number of hits in UniProtKB/Swiss-Prot: 19 hits in 19 different sequences
  • Number of hits on proteins that are known to belong to the set under consideration: 19 hits in 19 different sequences
  • Number of hits on proteins that could potentially belong to the set under consideration: 0 hits in 0 different sequences
  • Number of false hits (on unrelated proteins): 0 hits in 0 different sequences
  • Number of known missed hits: 0
  • Number of partial sequences which belong to the set under consideration, but which are not hit by the pattern or profile because they are partial (fragment) sequences: 0
  • Precision (true hits / (true hits + false positives)): 100.00 %
  • Recall (true hits / (true hits + false negatives)): 100.00 %
Comments
  • Scaling database: UniProtKB/Swiss-Prot: reversed
  • Matrix author: CJA_Sigrist
  • Taxonomic range: Eukaryotes
  • Maximum known number of repetitions of the pattern in a single protein: 1
  • FT_KEY: DOMAIN
  • FT_DESC: CXC
  • VERSION: 1
Cross-references
UniProtKB/Swiss-Prot True positive hits:
CLF_ARATH   (P93831), EZ1_MAIZE   (Q8S4P6), EZ2_MAIZE   (Q8S4P5), 
EZ3_MAIZE   (Q8S4P4), EZA1_ARATH  (Q9ZSM8), EZH1_BOVIN  (A7E2Z2), 
EZH1_HUMAN  (Q92800), EZH1_MOUSE  (P70351), EZH1_PONAB  (Q5RDS6), 
EZH2A_XENLA (Q98SM3), EZH2B_XENLA (Q4V863), EZH2_DANRE  (Q08BS4), 
EZH2_HUMAN  (Q15910), EZH2_MACFA  (Q4R381), EZH2_MOUSE  (Q61188), 
EZH2_XENTR  (Q28D84), EZ_DROME    (P42124), MEDEA_ARATH (O65312), 
MES2_CAEEL  (O17514)
Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:

[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format]

Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]		 2C6V;

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)

If you would like to retrieve all the Swiss-Prot entries referenced in the DR lines of this entry (with the exception of false positive hits) , you can enter a file name. These entries will then be saved to a file under this name. (Please note that this temporary file will only be kept for 1 week.)

File name:

Format: Swiss-Prot Fasta

or