PROSITE entry PS51707
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | CYTH |
| Accession [info] | PS51707 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-FEB-2014 CREATED;
01-FEB-2014 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51707 |
| Associated ProRule [info] | PRU01044 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | CYTH domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=174; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=169; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1656740; R2=0.0258347; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8411.4609375; R2=5.7652025; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=246; H_SCORE=9830; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=168; H_SCORE=9380; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M= -1, -3,-22, -7, 1,-17, -9, 1,-11, -4, -8, 5, -1,-12, 1, -6, -3, -6,-12,-26,-11, 0; /M: SY='M'; M=-10,-18,-26,-21,-12, -4,-26, -9, 5, -6, 3, 9,-14,-11, -5, -4,-15, -8, -1,-17, 1,-11; /M: SY='E'; M= -9, 10,-28, 17, 50,-27,-19, -1,-26, 7,-19,-17, 2, -3, 16, -1, 1, -7,-26,-30,-19, 33; /M: SY='I'; M= -6,-27,-22,-32,-26, 1,-33,-23, 31,-21, 13, 13,-22,-24,-21,-21,-15, -4, 29,-19, 2,-26; /M: SY='E'; M= -9, 6,-29, 14, 50,-27,-22, -3,-22, 6,-16,-16, -3, -3, 15, -3, -2, -9,-22,-29,-18, 32; /M: SY='L'; M=-10,-20,-17,-23,-17, 3,-26,-15, 4,-12, 8, 3,-16,-24,-14, 0,-11, -3, 6,-20, -1,-17; /M: SY='K'; M=-11, -1,-30, -1, 9,-29,-20, -9,-30, 48,-29,-10, 0,-11, 10, 35,-10,-10,-20,-20,-10, 9; /M: SY='F'; M= -5,-18,-19,-25,-20, 26,-20,-15, 2,-21, 4, -1,-12,-24,-22,-17, -9, -3, 1, -9, 11,-20; /M: SY='L'; M=-10,-17,-25,-18, -9, -4,-24,-12, -1, -4, 8, 4,-15,-17, -8, 4,-15, -8, -3,-19, -2,-10; /M: SY='V'; M= -2,-22,-19,-23,-20, -4,-26,-22, 16,-16, 10, 6,-21,-20,-19,-15,-13, -5, 20,-23, -5,-21; /M: SY='S'; M= -4, -2,-23, -3, -1,-19,-12, -9,-14, -5,-17,-10, 0, -3, -3, -7, 4, 3,-12,-26,-14, -3; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='D'; M= -7, 5,-23, 6, 2,-20, -8, -4,-20, -3,-18,-13, 3, -3, -4, -7, -1, -5,-17,-27,-13, -2; D=-10; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='S'; M= 0, -2,-11, -2, 0,-11, -4, -6, -8, -3, -8, -6, -1, -4, -1, -4, 2, 0, -5,-15, -9, -1; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='E'; M= -3, 3,-17, 6, 11,-14,-11, -7,-12, -1,-11,-10, -1, -3, 0, -5, 1, -2,-10,-19,-10, 5; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='E'; M= -1, 7,-25, 10, 13,-26,-11, -7,-22, 1,-19,-15, 2, -5, 5, -5, 1, -4,-19,-27,-16, 8; /M: SY='L'; M= -7,-11,-20,-13, -5, -7,-17,-15, -1,-14, 3, 0,-10,-19, -8,-12, -9, -6, -3,-23, -9, -7; /M: SY='Y'; M=-13,-18,-28,-19,-10, 4,-24, -7, -8, -6, -3, -3,-15,-20, -9, 0,-17,-11, -9, 8, 9,-10; /M: SY='E'; M= -9, 4,-24, 6, 14,-24,-16, -2,-24, 10,-17,-13, 3,-11, 6, 14, -4, -7,-20,-27,-14, 8; /M: SY='R'; M= -3, -7,-25, -9, -4,-19,-10, -7,-16, 3,-15, -8, -3,-16, 3, 7, -3, -5,-13,-15, -9, -2; /M: SY='L'; M= -2,-25,-20,-28,-19, 5,-27,-19, 18,-25, 30, 13,-24,-24,-19,-20,-20, -8, 12,-20, -2,-20; /M: SY='A'; M= 5, -7,-19,-10, -3,-17,-13,-12, -9, -3, -8, -5, -5,-15, -2, -3, -2, -3, -6,-25,-13, -4; /M: SY='E'; M= -1, 2,-22, 3, 10,-22, -8, -5,-21, 2,-19,-12, 2, -9, 3, -3, 6, 0,-17,-28,-15, 6; /M: SY='L'; M= -4,-11,-19,-12, -7, -9,-17,-11, -4,-11, 3, 0,-11,-18, -7,-11, -9, -6, -3,-23, -7, -7; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='G'; M= -2, 0,-19, -1, -7,-14, 5,-10,-15, -7,-12,-10, 1,-11, -9, -9, -1, -5,-12,-20,-13, -8; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='F'; M= 1,-12,-15,-16,-12, 3,-11,-13, 1,-11, 0, 0, -8,-12,-12,-12, -5, -4, 1,-13, -3,-12; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='E'; M= -3, -4,-18, -4, 2,-14,-12, -5,-11, 2,-12, -6, -3,-12, 1, -1, 1, 0, -7,-20, -6, 1; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='E'; M= -8, -4,-21, -4, 1, -6,-15, 1,-12, -5, -8, -5, -3, -6, -3, -5, -5, -5,-11,-19, -4, -1; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: M= -3,-10,-17,-10, -4, -7,-14, -6, -2, -9, -3, -1, -9, -9, -7, -9, -4, -3, 0,-18, -6, -7; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='K'; M= -3, 0,-19, 0, 1,-18, -6, -8,-16, 2,-15,-10, 0, -9, 0, 0, 2, 1,-11,-22,-12, 0; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: M= -8, -8,-19,-10, -5, -7,-19,-10, -4, -4, -7, -4, -5, -6, -7, -3, -6, -1, -3,-20, -6, -8; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='E'; M= -9, -8,-24, -9, 6,-11,-23, -8, -4, -2, -4, -2, -7,-15, 1, -1, -7, -4, -4,-23, -7, 2; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='E'; M= -8, -4,-25, -5, 9,-14,-21, -3,-11, -1, -7, -5, -4,-10, 4, -2, -6, -6,-12,-24, -9, 5; /M: SY='Q'; M=-11,-10,-26,-12, 3,-12,-24, -2, -5, -5, 1, 4, -9,-17, 17, -3, -9, -7,-12,-18, -1, 10; /M: SY='R'; M= -6, -3,-23, -2, 3,-16,-16, -1,-18, 2,-14,-10, -2,-15, 1, 7, 0, 2,-12,-24, -6, 0; /M: SY='D'; M=-10, 35,-26, 38, 13,-32, -8, 3,-29, 1,-27,-21, 26,-13, 8, -5, 4, -6,-28,-36,-19, 10; /M: SY='V'; M= -6,-15,-22,-19,-19, -3,-17,-13, 7,-17, 0, 3,-12,-20,-15,-16, -6, 0, 8,-20, -1,-18; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-29,-24,-22, 35,-30, 13, 2,-14, 2, 1,-20,-30,-14,-12,-20,-10, -7, 25, 70,-22; /M: SY='F'; M=-16,-27,-23,-32,-25, 38,-31,-10, 11,-24, 17, 7,-22,-29,-25,-18,-22,-10, 5, 2, 30,-25; /M: SY='D'; M= -8, 24,-25, 32, 15,-28,-11, -2,-26, -2,-21,-19, 12,-11, 3, -7, 2, -6,-22,-32,-15, 8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='T'; M= -1, -4,-13, -9, -9,-10,-15, -9,-12,-12,-13,-10, -2, -6,-10,-12, 9, 21, -6,-27, -8,-10; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='P'; M= -4,-10,-27, -5, 2,-23,-16,-14,-14, -4,-20,-13,-11, 42, -4,-11, -5, -5,-17,-24,-20, -4; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='D'; M= -7, 12,-11, 14, 3,-21, -3, -3,-23, -1,-19,-15, 8,-13, -3, -5, 0, -6,-17,-24,-12, 0; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='R'; M=-10, -7,-20, -9, -3, 0,-14, 4,-13, 0, -7, -3, -2,-15, -1, 9, -8, -8,-12,-10, 2, -3; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='D'; M= -5, 11,-19, 16, 4,-19, -5, -6,-20, 1,-16,-14, 3,-10, -2, -3, -1, -6,-14,-17,-11, 1; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='L'; M= -8,-20,-17,-21,-14, 12,-21,-14, 8,-19, 22, 9,-18,-14,-14,-13,-17, -7, 3,-12, 2,-13; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='R'; M= 5, -6,-16, -8, 0,-14, -8, -8,-12, 5, -9, -3, -4,-10, 0, 6, 0, -2, -8,-18,-10, -1; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='E'; M= -2, 2,-21, 4, 8,-22,-11, -6,-19, 8,-16,-10, 0, -7, 6, 7, 0, -4,-15,-22,-13, 6; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='Q'; M= -3, 1,-13, -2, 3,-21,-14, 1,-19, 5,-17, -9, 3,-11, 7, 4, 2, 1,-16,-25,-11, 4; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='D'; M=-11, 10,-29, 14, 5,-30, 2, 0,-31, 6,-26,-16, 7,-10, 4, 4, -2,-11,-26,-28,-16, 4; /M: M= -1, -7,-23,-10, -1,-13, -9, -9,-11, -4,-11, -5, -4,-15, -4, -5, 0, -3, -9,-23, -9, -3; /M: SY='A'; M= 9,-13,-19,-17,-13, -7, -7,-12,-11,-10,-10, -8,-10,-18,-10, -9, 2, 2, -6, -7, 1,-13; /M: SY='L'; M= -5,-28,-18,-30,-21, 7,-28,-21, 21,-27, 38, 18,-28,-28,-20,-20,-24, -8, 16,-21, -2,-21; /M: SY='R'; M=-19,-10,-29,-10, 0,-20,-20, -2,-28, 29,-20, -9, -1,-20, 9, 64,-10,-10,-18,-20,-10, 0; /M: SY='I'; M= -9,-27,-23,-33,-25, 0,-33,-23, 31,-21, 21, 20,-22,-24,-18,-17,-19, -8, 25,-22, -3,-24; /M: SY='R'; M=-20, -9,-30, -8, 0,-20,-20, 0,-30, 29,-20,-10, 0,-20, 10, 68,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='R'; M= -9, -6,-22, -9, -4,-14,-18,-10, -8, 1,-10, -5, -2,-16, -1, 5, -3, 1, -6,-23, -8, -4; D=-12; /I: I=-12; MD=-25; /M: M= -4,-10,-21,-11, -6, -7,-14,-10, -6, -6, -5, -1, -8,-18, -7, -6, -5, -6, -3,-22, -6, -7; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='D'; M= -9, 6,-26, 8, 3,-23, 4, 1,-25, -5,-20,-14, 5,-13, -4, -7, -1, -9,-20,-28,-15, -1; /M: SY='G'; M= -3, 5,-25, 3, -1,-25, 12, -9,-26, -3,-22,-16, 9,-12, -4, -6, 2, -6,-23,-27,-20, -3; /M: SY='Q'; M= -9, 0,-28, 2, 7,-26, -8, -1,-23, 8,-21,-11, 1,-14, 10, 10, -3, -9,-19,-23,-13, 8; /M: SY='Y'; M= 2,-16,-19,-19,-14, 0,-14, -7, -7, -9, -5, -4,-13,-20,-10,-10, -6, -6, -5, -6, 12,-13; /M: SY='Y'; M=-10,-12,-25,-15, -7, 1,-18, -9, -5,-11, -5, -5, -8,-20, -9, -8, -8, -4, -7, -6, 3, -8; /M: SY='L'; M=-11,-26,-21,-29,-20, 3,-28,-16, 13,-22, 22, 15,-25,-26,-13,-17,-23,-10, 6, -2, 3,-17; /M: SY='T'; M= -4, -2,-15,-10, -8, -8,-20, -8, -7,-10, -8, -3, -1,-13, -7, -9, 11, 31, -3,-26, -3, -8; /M: SY='L'; M=-12,-24,-22,-26,-22, 19,-30,-13, 15,-23, 22, 10,-23,-27,-20,-19,-21, -8, 10, -8, 18,-22; /M: SY='K'; M=-11, -1,-30, 0, 11,-28,-20, -8,-29, 45,-28,-10, -1,-11, 10, 30,-10,-10,-20,-19, -8, 10; /I: I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='E'; M= -2, 1,-15, 1, 5,-11,-10, -6, -8, -1, -6, -5, -1, -9, 0, -3, -2, -3, -7,-16, -8, 3; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='P'; M= -5,-12,-21,-10, -7,-12, -1,-13, -9, -9,-10, -6,-10, 9, -9,-12, -7, -8, -9, -7,-11, -9; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='A'; M= 1, -5,-14, -6, -3,-11, -5, -6, -6, -5, -4, -1, -5,-10, -2, -5, -2, -2, -3,-16, -8, -3; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='G'; M= 0, -7,-22, -8, -9,-16, 12,-16,-18,-11,-15,-10, -4,-15,-11,-13, 2, -3,-11,-23,-16,-10; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='P'; M= -5, -4,-25, 1, 4,-22, -9, -9,-17, -1,-18,-12, -7, 18, -3, -7, -5, -7,-17,-23,-16, -1; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='K'; M= 0, 0,-19, -3, -1,-18, -2, -8,-17, 5,-16,-10, 3,-10, -2, 3, 1, -3,-13,-21,-13, -2; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='G'; M= 0, -9,-19,-11,-10,-12, 4,-14, -9,-12, -7, -5, -5, -7,-11,-12, -2, -5, -7,-20,-14,-11; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: M= -4, -4,-18, -4, -4, -7, -5,-10, -8,-11, -5, -6, -4,-15, -8,-11, -2, -4, -5,-21, -9, -6; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='H'; M= -8, -9,-22,-11, -7, -4,-20, 2, -7, -1, -6, -1, -5,-18, -6, -2, -8, -7, -4,-20, -1, -7; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='S'; M= 0, -5,-20, -9, -5,-18, -4,-11,-11, -6,-13, -8, 0,-14, -3, -6, 4, 4, -7,-26,-14, -5; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='R'; M=-14,-10,-25,-12, -5,-11,-19, -5,-17, 13,-10, -4, -2,-21, 1, 37, -8, -7,-12,-22, -8, -5; /M: SY='E'; M=-10, -7,-19, -5, 5,-16,-18, -7,-15, -6,-10, -7, -8, -1, -2, -7, -7, -7,-15,-26,-11, 0; /M: SY='E'; M= -9, 9,-29, 17, 50,-29,-19, -1,-29, 10,-21,-19, 0, 0, 17, 3, 0, -9,-28,-30,-19, 33; /M: SY='Y'; M= -9,-21,-23,-26,-22, 14,-28,-13, 12,-20, 7, 5,-18,-24,-19,-18,-14, -3, 9, -2, 16,-22; /M: SY='E'; M= -8, 10,-24, 10, 22,-23,-16, 0,-21, 1,-19,-15, 9, -8, 7, -3, 4, 0,-20,-29,-15, 14; /M: SY='F'; M= -4,-14,-21,-18,-12, 7,-19,-10, -2,-13, -4, -2,-10,-21,-10,-12, -5, -2, -1,-11, 7,-11; /M: SY='E'; M= -6, -6,-28, -3, 12,-18,-21,-12,-12, -2,-13,-10, -8, 9, 0, -8, -4, -5,-14,-25,-14, 4; /M: SY='I'; M= -7,-23,-21,-26,-20, 0,-31,-22, 25,-24, 21, 12,-21,-24,-19,-21,-17, -5, 21,-24, -4,-21; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='S'; M= -3, 2,-23, 6, 4,-23, -8, -9,-19, -8,-20,-14, 0, 6, -2,-12, 7, 1,-17,-31,-18, 0; D=-4; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='D'; M= -6, 7,-22, 11, 6,-18, -7, -7,-15, -6, -7, -9, 1,-13, -3, -8, -4, -7,-13,-25,-12, 2; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: SY='A'; M= 2, -4,-17, -5, -1,-15, -7, -8, -8, -5, -8, -5, -3,-11, -3, -7, 0, -3, -4,-21,-12, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: M= -5, -6,-24, -6, -2,-15,-19,-13, -7, -1, -4, -3, -7,-13, -5, -3, -8, -5, -5,-24,-11, -4; /M: M= -2, -7,-19, -7, -5, -7,-14,-12,-10, -9, -4, -5, -8,-16,-10, -8, -5, -2, -6,-22, -8, -7; /M: SY='A'; M= 5, -8,-22, -9, 2,-15,-17,-13, -8, -3, -4, -5,-10,-11, -3, -7, -5, -6, -6,-23,-11, -1; /M: SY='E'; M= -4, -6,-24, -7, 1,-14, -7, -8,-14, -5, -8, -6, -4,-16, -1, -3, -3, -5,-13,-22,-10, -1; /M: SY='L'; M= -5,-14,-23,-15,-12, -9, -9,-17, 1,-17, 4, 2,-12,-19,-12,-16,-10, -7, 0,-22, -9,-13; /M: SY='L'; M= -8,-20,-21,-24,-17, 6,-26,-16, 12,-21, 18, 10,-16,-22,-14,-15,-15, -6, 6,-20, -1,-16; /M: SY='Q'; M= -4, -4,-25, -4, 0,-20, -8, -8,-16, 1,-10, -3, -3,-13, 2, -1, -5, -8,-15,-22,-13, 1; /M: SY='A'; M= 5, -3,-20, -4, -2,-17,-11, -8,-17, -3,-16,-12, -2, -7, -3, -3, 5, 2,-12,-25,-13, -3; /M: SY='L'; M= -7,-12,-22,-11, -2, -6,-22,-13, -1,-15, 14, 3,-13,-16, -7,-11,-11, -4, -4,-25, -8, -5; /M: SY='G'; M= 0,-13,-20,-14,-15,-17, 19,-19,-16,-18, -4, -6, -9,-21,-16,-18, -8,-12,-12,-22,-18,-16; /M: SY='F'; M=-10,-23,-14,-27,-20, 17,-27,-15, 4,-18, 7, 3,-20,-20,-18,-15,-15, -7, 3, -8, 11,-19; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='P'; M= -8, -7,-25, -4, 3,-20,-18, -7,-15, 3,-17, -9, -6, 12, 3, 0, -3, -1,-14,-23,-12, 2; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='I'; M= -5,-15,-15,-16, -8, -5,-21,-12, 8,-10, 6, 4,-14,-11, -9,-11,-10, -5, 7,-17, -3, -9; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='S'; M= 4, -8,-17,-10, -6,-17, -4,-11,-14, -5,-15, -9, -4,-11, -3, -5, 5, 0, -7,-24,-13, -5; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='L'; M= 0,-17,-20,-21,-15, -3,-12,-19, -1,-17, 5, -1,-15,-14,-15,-14, -7, 0, 0,-20, -7,-15; /M: SY='T'; M= -5, -5,-21, -6, -4,-14,-20,-13, -5, -3, -6, -3, -6,-15, -6, -4, -2, 3, 0,-27,-10, -6; /M: SY='I'; M= -7,-19,-20,-26,-20, 4,-29,-22, 18,-20, 10, 8,-14,-21,-16,-18, -9, 4, 16,-22, -2,-19; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='K'; M= -8, -1,-25, -1, 8,-18,-20, -6,-14, 11,-16, -9, 0,-13, 2, 6, -3, -3,-11,-23, -7, 4; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 5,-25,-20, -5,-30, 40,-25,-10, 0,-15, 10, 50,-10,-10,-20,-20,-10, 5; /M: SY='R'; M= -6, -6,-23, -9, 0,-13,-20, -2,-13, 3,-11, -5, -3,-15, 2, 6, -2, 3,-11,-18, -1, -1; /M: SY='R'; M=-11, -9,-25, -8, 4,-17,-19, -6,-18, 13,-15, -8, -3,-17, 5, 32, -3, -5,-11,-24,-12, 1; /M: SY='Y'; M=-13,-12,-29,-12, -2, -6,-21, 2,-15, -2,-11, -7, -9,-18, -1, 2,-10, -7,-16, 6, 8, -2; /M: SY='I'; M= -8,-12,-17,-14, -8,-10,-24,-10, 2, -9, 0, 1, -9,-18, -7, -9, -8, -4, 1,-25, -5, -9; /M: SY='Y'; M=-13,-26,-24,-28,-24, 21,-30, -9, 13,-20, 12, 6,-23,-28,-20,-17,-19, -7, 9, 6, 29,-24; /M: SY='K'; M= -5, -3,-25, -3, 2,-16,-17, -6,-17, 5,-15,-10, -4, -7, -1, 3, -4, -6,-13,-21, -6, -1; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='Y'; M= -6, -7,-15, -6,-10, -3,-15, -2, -4,-12, 1, -2, -9,-19,-11,-12, -9, -6, -3,-12, 4,-11; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='D'; M= -3, 7,-14, 8, 3,-15, 5, -2,-16, 0,-14,-10, 7, -8, 0, -2, 0, -6,-14,-15,-11, 2; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='G'; M= -4, 0,-23, 0, -2,-25, 27,-10,-29, -1,-23,-15, 4,-13, -5, -5, -1,-12,-23,-19,-20, -3; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='Q'; M= -6, -3,-19, -2, 1,-15, -6, -6, -8, -1, -8, -4, -2, -9, 2, -3, -4, -6, -9,-17,-10, 1; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='V'; M= 1,-17,-18,-21,-19, -1,-12,-16, 3,-17, -2, -1,-13,-18,-18,-17, -4, -2, 8,-21, -6,-19; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='E'; M= -9, -7,-23, -7, 5,-12,-24, -8, -6, -6, 0, -2, -8,-13, -2, -5, -6, 1, -6,-26, -9, 1; /M: SY='I'; M= -7,-30,-23,-34,-26, 9,-29,-25, 22,-25, 18, 11,-26,-26,-23,-22,-21, -9, 18, 0, 3,-25; /M: SY='E'; M= 3, -5, -6, -6, 6,-19,-15, -7,-17, -4,-15,-12, -6,-14, -3, -8, 3, 1, -9,-29,-13, 1; /M: SY='L'; M= -9,-25,-20,-27,-22, 7,-30,-22, 20,-21, 23, 12,-23,-26,-21,-17,-19, -6, 18,-21, -2,-22; /M: SY='D'; M=-19, 48,-29, 66, 20,-39,-10, 1,-39, 0,-30,-29, 22,-10, 1, -9, 1, -9,-30,-40,-20, 10; /M: SY='E'; M= -9, -7,-25, -6, 4,-15,-21, 1,-13, 0,-10, -6, -7,-17, 3, 2, -9, -8,-12,-12, -1, 2; /M: SY='V'; M= -6,-17,-18,-21,-21, 7,-12,-19, 5,-20, 1, 0,-11,-25,-23,-17, -6, -4, 11,-21, -5,-22; /M: SY='E'; M= -9, 4,-25, 7, 16,-17,-17, -6,-20, 5,-14,-11, 0,-10, 3, 1, -3, -4,-18,-25,-11, 9; /M: SY='G'; M= -4, -9,-27, -9,-11,-14, 11,-10,-16,-12,-13, -9, -6,-18, -9,-13, -6,-11,-14,-14, -3,-12; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='A'; M= 4, 1,-11, -2, -4, -7, -3, -6, -7, -7, -5, -6, 2, -9, -6, -8, 1, -2, -7,-14, -7, -5; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='L'; M= -2,-13,-22,-15,-11, -5, -3,-15, -7,-18, 5, -1,-10,-21,-12,-15,-10, -9, -7,-20,-10,-11; /M: SY='G'; M= -4, -2,-21, -3, -6,-26, 27,-12,-29,-13,-24,-17, 2,-14,-11,-15, 1,-10,-23,-26,-23, -9; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='R'; M= -5, -5,-13, -5, 1, -5,-10, -5, -6, 1, 1, -1, -6, -9, 0, 2, -7, -5, -6,-10, -2, 0; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='E'; M= -5, -1,-22, 0, 2,-17,-19, -7,-12, -6,-13,-10, -3, -2, -3,-10, -2, -2,-10,-27,-11, -2; /M: SY='F'; M=-16,-18,-22,-20,-20, 26,-28,-12, 3,-21, 5, 0,-17,-26,-23,-18,-18,-10, 2, 1, 19,-21; /M: SY='V'; M= 1,-18, -9,-22,-19, -2,-16,-15, 2,-16, 1, 2,-15,-21,-16,-16, -8, -6, 4,-18, 0,-18; /M: SY='E'; M=-11, 11,-30, 21, 52,-30,-20, 1,-29, 9,-20,-19, 1, -2, 21, 0, 0,-10,-30,-29,-17, 37; /M: SY='I'; M= -7,-30,-22,-34,-26, 5,-33,-26, 31,-27, 25, 15,-26,-26,-22,-24,-21, -8, 24,-15, -1,-26; /M: SY='E'; M= -8, 8,-29, 17, 54,-30,-19, 0,-29, 10,-20,-18, 0, -1, 21, 1, 0,-10,-29,-29,-19, 37; /M: SY='L'; M= -5,-23,-15,-27,-21, 8,-18,-21, 7,-20, 13, 6,-20,-25,-21,-17,-14, -5, 9,-18, -2,-21; /M: SY='E'; M= -8, 0,-20, 2, 21,-21,-21, -5,-15, 0,-11, -7, -4, -7, 5, -5, -3, -5,-15,-29,-14, 12; /M: SY='L'; M= -4,-10,-19,-11,-12, -6,-20,-16, 1,-15, 6, 0,-12,-21,-14,-13, -6, 1, 5,-24, -7,-13; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='E'; M= -4, 5,-24, 8, 13,-24,-14, -5,-23, 11,-20,-14, 2, -8, 5, 8, 2, -3,-17,-27,-14, 8; D=-7; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='D'; M= -6, 18,-23, 21, 12,-26,-10, -3,-24, -1,-23,-18, 13, -7, 3, -4, 7, 1,-20,-33,-17, 7; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='G'; M= -3, -1,-19, 2, 5,-17, 10, -5,-19, -3,-16,-11, -1, -7, -1, -6, -1, -8,-17,-13,-10, 1; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='E'; M= -4, 7,-17, 8, 11,-17,-10, -2,-15, 0,-14,-11, 5, -3, 4, -3, 3, 2,-13,-22,-11, 7; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='E'; M= -3, -1,-15, 1, 8,-15,-12, -3,-11, -1, -8, -6, -3, -4, 4, -3, 0, 1, -9,-18, -9, 6; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='A'; M= 3,-12,-17,-13,-13,-10, 2,-14, -4,-15, 0, -2,-11,-17,-14,-15, -5, -6, 0,-19,-11,-14; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='K'; M= -7, -8,-20, -9, 1, -9,-19,-10, -8, 6, -4, -2, -7,-13, 1, 4, -7, -4, -6,-17, -5, 1; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='E'; M= -1, 3,-20, 4, 10,-19,-12, -7,-17, 6,-15,-10, 1, -9, 4, 2, 0, -3,-12,-22,-12, 7; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='E'; M= -7, -9,-24, -9, 1,-11,-24,-13, -1, -4, 0, 1,-10,-14, -3, -8, -9, -6, -2,-23, -7, -2; /M: SY='L'; M= 7,-18,-16,-24,-17, 3,-19,-20, 6,-18, 8, 3,-15,-20,-17,-17, -9, -4, 6,-18, -5,-17; /M: SY='E'; M=-13, -1,-28, 2, 8,-10,-20, 1,-17, -2,-12, -9, -2,-13, 2, 0, -8,-10,-17,-15, -3, 4; /M: SY='E'; M= -5, 5,-24, 7, 15,-23,-13, -3,-23, 7,-21,-13, 4,-11, 8, 4, 3, -3,-19,-27,-13, 11; /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-23, 14,-30,-21, 19,-26, 29, 14,-26,-25,-22,-20,-23, -9, 12,-11, 4,-23; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='L'; M= 1,-17,-19,-17, -9, -8,-18,-14, 0,-15, 8, 3,-16, -1,-10,-14,-10, -5, -3,-22,-10,-11; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='E'; M= -4, 4,-20, 3, 6,-18,-12, -5,-17, 5,-16,-10, 4,-10, 2, 4, 3, 0,-14,-26,-13, 3; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='E'; M=-10, -4,-27, -3, 9,-16,-17, -3,-18, 4,-15, -8, -5,-13, 7, 2, -8, -9,-18, 3, -4, 8; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='L'; M=-10,-17,-15,-20,-15, 9,-22,-10, 5,-19, 17, 5,-16,-24,-15,-14,-16, -6, 0,-12, 9,-16; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='G'; M= -3, -2,-27, -4,-10,-26, 27,-12,-28, -8,-25,-16, 4,-14, -9, -9, 0,-11,-23,-22,-21,-10; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='I'; M= -5,-23,-22,-26,-19, -1,-28,-19, 20,-20, 20, 12,-21,-23,-15,-15,-17, -7, 15,-20, -2,-18; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='E'; M= -3, 1,-25, 4, 19,-24,-14, -5,-23, 5,-20,-14, -1, 0, 7, 2, 4, -2,-19,-27,-16, 12; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: M= -6, -9,-24, -8, -1,-13, -7,-11,-10, -8, -9, -6, -8,-11, -5,-10, -6, -9, -7,-22,-11, -3; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='S'; M= 0, 3,-17, -1, 1,-19, -8, -7,-20, -1,-19,-13, 6,-13, 0, -1, 9, 8,-14,-28,-14, 0; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='D'; M=-10, 8,-25, 12, 5,-17,-10, -1,-21, -4,-18,-14, 4, -7, 0, -5, -2, -8,-19,-24, -8, 2; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='I'; M= 1,-11,-11,-13, -9, -2,-13,-12, 4,-11, 4, 1,-10, -7, -8,-11, -3, 2, 4,-14, -5, -9; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='V'; M= 0, -6,-20, -6, -3,-11,-20,-14, 0,-12, -2, -2, -9,-13, -9,-15, -4, -3, 3,-26,-11, -7; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='P'; M= 2, -6,-24, -6, 3,-22,-13,-11,-17, -1,-16,-11, -6, 4, -1, -1, 1, -1,-13,-26,-17, 0; /M: SY='R'; M=-15, -6,-28, -6, 3,-22,-16, -1,-27, 24,-21, -9, 0,-17, 9, 45, -6, -8,-19,-22,-11, 3; /M: SY='F'; M= -1,-13,-17,-18,-15, 6, -5,-15,-13,-15, -9, -9, -8,-17,-16,-14, 2, 4, -8,-13, 1,-15; /M: SY='Y'; M=-13,-21,-26,-24,-21, 26,-28, 4, 5,-16, 5, 2,-18,-27,-15,-14,-16, -8, -3, 12, 49,-21; /M: SY='L'; M= -9, -9,-23,-14,-11, -6,-18, -5, -1,-10, 2, 2, -3,-22, -7, -4,-10, -7, -4,-22, -3,-10; /M: SY='E'; M= -7, -3,-22, 0, 12,-12,-17, -5,-15, -5, -5, -8, -7,-14, 1, -7, -5, -7,-14,-22, -6, 7; /M: SY='L'; M= 1,-17,-17,-21,-13, -6,-19,-12, 2,-11, 10, 9,-15,-21, -7, -9,-11, -6, 1,-21, -5,-11; /M: SY='L'; M= -6,-17,-20,-19,-10, -5,-22,-13, 4,-14, 14, 5,-15,-22, -7,-10,-14, -7, 0,-20, -2, -9; /M: SY='N'; M= -1, -2,-22, -6, -4,-16, -6, -9,-15, -1,-14, -9, 2,-15, -4, -2, -1, -3,-11,-25,-13, -4; /M: SY='E'; M= -4, -1,-23, -2, 3,-13,-13, -8,-15, -2, -9, -7, 0,-15, 1, -3, -2, -4,-14,-24,-10, 2; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 19 in 19 different sequences |
| Number of true positive hits | 19 in 19 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | CYTH |
| Version [info] | 2 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
19 sequences
3PASE_ACET2 (A3DIJ8), 3PASE_ECOLI (P30871), 3PASE_HAEIN (P45267), 3PASE_NITEU (Q82UI9), CYAB_AERHY (O69199), THTPA_BOVIN (Q8MKF1), THTPA_HUMAN (Q9BU02), THTPA_MACFA (Q9BGW0), THTPA_MOUSE (Q8JZL3), THTPA_RAT (Q8CGV7), TTM1_ARATH (Q9C9B9), TTM2_ARATH (Q9C664), TTM3_ARATH (Q9SIY3), UCKC_DICDI (Q54R62), UCKD_DICDI (Q9GNF0), Y2226_MYCTO (P9WLH8), Y2226_MYCTU (P9WLH9), Y240_METJA (Q57692), YJBK_BACSU (O31609)» more
|
| PDB [Detailed view] |
16 PDB
2FBL; 2JMU; 3BHD; 3TVL; 3TYP; 3V85; 5A5Y; 5A60; 5A61; 5A64; 5A65; 5A66; 5A67; 5A68; 7Z66; 7Z67 » more |