PROSITE entry PS51749
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | HNH_CAS9 |
| Accession [info] | PS51749 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-MAR-2015 CREATED;
26-FEB-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51749 |
| Associated ProRule [info] | PRU01085 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Cas9-type HNH domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=156; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=151; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0493281; R2=0.0167008; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=12884.3740234; R2=4.5284553; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=686; H_SCORE=15991; N_SCORE=13.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=267; H_SCORE=14093; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-7; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='T'; M= 1, 5,-14, 0, 3,-17,-11,-11,-17, -6,-20,-16, 9,-10, -2, -8, 23, 28,-10,-34,-16, 1; /M: SY='E'; M=-13, 9,-27, 10, 16,-10,-11, 7,-24, -4,-18,-14, 9,-14, 3, -5, -3,-10,-25,-24, -7, 10; /M: SY='K'; M= -8, 5,-25, 8, 9,-29,-14, -4,-27, 20,-27,-14, 5,-12, 14, 18, 5, -3,-20,-27,-14, 10; /M: SY='G'; M= -8, 6,-27, 5, 8,-26, 11, -4,-24, -4,-19, -7, 7,-14, 4, -7, -2,-11,-24,-27,-19, 6; /M: SY='R'; M= 5, -6,-24, -9, 1,-24,-14, -8,-23, 22,-20, -9, -3,-13, 8, 27, -3, -7,-15,-20,-13, 3; /M: SY='K'; M= -7, 4,-24, 3, 1,-11,-15, -8,-24, 13,-21,-13, 4,-15, -2, 13, -3, -6,-17,-22, -8, -1; /M: SY='E'; M= -2, 15,-24, 13, 28,-26,-11, -1,-24, 8,-23,-18, 17, -8, 9, 0, 3, -6,-25,-31,-19, 19; /M: SY='I'; M= -7,-18,-23,-23,-16, 3,-24,-18, 9,-15, -3, 1, -8,-19,-12, -7, -1, -1, 6,-22, -3,-16; /M: SY='Q'; M=-13, 9,-30, 16, 30,-34,-18, 4,-28, 11,-22,-13, 3, -8, 31, 13, -1,-10,-29,-26,-15, 29; /M: SY='K'; M=-10, -4,-32, -1, 13,-31,-20, -8,-26, 28,-28,-11, -4, 13, 14, 14, -8,-10,-24,-23,-15, 12; /M: SY='R'; M= 4,-10,-24,-13, 1,-20,-17, -9,-13, 6,-12, -6, -6,-14, 6, 17, -3, -7, -9,-21,-13, 1; /M: SY='Q'; M=-11, -6,-25,-10, -1,-14,-21, 1, -4, -6, 4, 7, -3,-20, 17, -3,-10, -8,-14,-19, -1, 8; /M: SY='K'; M= -3, 3,-26, 1, 13,-26,-15, -6,-26, 26,-24,-13, 4,-11, 8, 21, -3, -8,-20,-24,-14, 10; /M: SY='R'; M= -6, 9,-26, 14, 13,-27, -7, -5,-30, 8,-23,-18, 4,-12, 4, 15, 1, -7,-22,-28,-18, 7; /M: SY='N'; M=-10, 1,-21, -8,-11, -9,-17, -7, 0, -7, -1, -2, 11,-24, -9, 1, -7, -5, -3,-29,-11,-11; /M: SY='K'; M=-14, -4,-29, -3, 11,-12,-22, 1,-21, 18,-17,-10, -5,-14, 6, 17, -8, -6,-18,-11, 10, 6; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='N'; M= -6, 11,-18, 10, 0,-19, 4, -5,-20, 5,-19,-13, 12,-10, -2, 0, 2, -1,-16,-21,-13, -1; D=-12; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='D'; M= -2, 12,-15, 17, 12,-18, -7, -3,-17, 5,-13,-11, 4, -4, 3, -1, 0, -5,-13,-17,-10, 8; D=-12; /I: I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='R'; M= -7, 4,-15, 1, 2,-13, -8, -1,-15, 17,-15, -7, 9, -9, 4, 19, -2, -4,-13,-14, -7, 2; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='E'; M= -7, 8,-17, 13, 17,-19,-10, 1,-16, 8,-13, -8, 3, -4, 14, 3, -1, -6,-16,-15, -9, 15; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='E'; M= -2, 9,-25, 13, 20,-29,-14, -7,-28, 19,-25,-17, 3, -8, 7, 6, 1, -6,-20,-28,-16, 13; /M: SY='A'; M= 34, -7,-12,-13, -8,-21, 5,-17,-15,-11,-17,-14, -3,-11, -8,-17, 18, 4, -5,-26,-21, -8; /M: SY='M'; M= -4,-22,-21,-27,-15, -2,-26,-16, 20,-18, 20, 24,-21,-21,-11,-17,-17, -8, 14,-22, -4,-14; /M: SY='K'; M= -5, -8,-26, -8, 3,-21,-21,-11,-16, 23, -9, -2, -8,-14, 7, 13,-12, -9,-13,-20, -9, 5; /M: SY='E'; M=-11, 11,-30, 18, 31,-31,-19, -5,-31, 27,-26,-17, 3, -6, 12, 12, -5,-10,-25,-27,-15, 22; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='F'; M= -2,-15, -2,-20,-14, 7,-17,-14, -1,-10, -1, -2,-10,-16,-13, -3, -8, -6, 1,-12, -2,-14; D=-10; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='R'; M= -1, -3,-18, -3, 8,-19,-11, -2,-17, 13,-14, -6, -1, -8, 13, 18, -2, -6,-14,-15, -9, 10; D=-10; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='K'; M= -9, 5,-20, 5, 13,-18,-11, -1,-20, 19,-18,-10, 8, -8, 7, 18, -3, -6,-17,-18,-10, 9; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='D'; M= -6, 6,-17, 7, 3,-20, 4, -2,-19, 6,-17, -9, 7, -8, 6, 2, -1, -7,-17,-16,-11, 5; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='F'; M= -6,-21,-21,-26,-17, 24,-24,-13, -1,-12, 10, 2,-18,-24,-19,-11,-17, -9, -2, -4, 15,-17; /M: SY='G'; M= -3, -4,-24, -5, -4,-19, 18,-13,-20,-13,-14,-12, 2,-18,-10,-13, 0, -9,-16,-27,-20, -7; /M: SY='G'; M= 2, -5,-21, -4, 0,-22, 19,-13,-25,-13,-21,-16, 1,-14, -6,-13, 13, -2,-18,-29,-22, -3; /M: SY='K'; M=-13, -3,-30, -1, 15,-21,-22, 2,-23, 22,-20, -8, -3,-13, 19, 20, -8,-10,-22,-14, 2, 16; /M: SY='I'; M= -2,-26,-29,-32,-22, -8,-31,-27, 30,-24, 7, 9,-19, 1,-17,-27,-14, -9, 16,-22, -8,-24; /M: SY='E'; M= -4, -4,-20, -4, 4,-14,-15,-10,-11, -2, -5, -6, 0,-16, -2, -4, 2, 0,-10,-29,-12, 1; /M: SY='K'; M= -6, -8,-25, -7, 0,-21,-16,-11,-19, 11,-18,-10, -4, 1, 0, 11, 1, -2,-15,-27,-14, -1; /M: SY='E'; M= -8, 0,-31, 6, 26,-30, -6, -8,-30, 14,-26,-17, -3, 6, 7, 2, -4,-12,-27,-26,-20, 16; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='H'; M= -9, 9,-15, 5, 0,-11, -7, 37,-15, -3,-14, -5, 17,-11, 3, 0, -1, -7,-17,-20, 2, 0; D=-7; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='P'; M= -3,-11,-17,-11, -7, -9,-13,-12, 5,-10, -6, -2, -8, 14, -7,-12, -2, -2, -1,-16, -9, -9; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='L'; M= -7,-13,-13,-15, -8, 10,-16, -8, 3,-12, 14, 6,-12,-15, -4, -8,-12, -6, -1, -7, 3, -5; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='D'; M=-14, 16,-28, 20, 10,-29,-16, -1,-24, 8,-17,-11, 8,-14, 13, 6, -5, -9,-23,-29,-13, 11; /M: SY='N'; M= -4, 5,-24, -3,-11,-14,-18,-12, 8,-14, -6, -3, 11,-17,-10,-17, -4, -6, -1,-29,-11,-13; /M: SY='L'; M= -9, -2,-21, -1, -2,-13,-21,-13, -5, -4, 1, -3, -5,-18, -8, -7, -8, 0, -1,-28,-10, -5; /M: SY='R'; M=-14, 2,-29, -1, 5,-25,-17, -3,-29, 35,-26,-11, 9,-15, 9, 41, -7, -9,-21,-23,-11, 5; /M: SY='L'; M=-11,-20,-21,-25,-19, 11,-27,-17, 16,-26, 30, 12,-14,-27,-19,-18,-22, -9, 6,-20, 0,-19; /M: SY='R'; M=-20, -4,-29, -2, -4, -5,-21, 3,-23, 12,-15,-10, -3,-21, 0, 33,-11,-10,-18,-10, 12, -5; /M: SY='L'; M= -1,-27,-20,-30,-20, 4,-27,-21, 20,-27, 36, 15,-25,-25,-18,-21,-22, -8, 11,-20, -3,-20; /M: SY='Y'; M=-17,-22,-30,-23,-18, 20,-27, -1, -4, -7, 2, -1,-21,-27,-13, -8,-23,-13,-10, 29, 43,-17; /M: SY='E'; M=-14, -1,-30, 4, 24,-11,-23, 18,-21, 5,-15,-11, -5,-12, 9, 0, -8,-11,-23,-11, 16, 14; /M: SY='L'; M=-11,-17,-24,-18, -2, 1,-26, -9, 0,-14, 16, 7,-16,-21, 5, -9,-16,-10, -8,-17, -1, 3; /M: SY='Q'; M= -1, -1,-27, -3, 16,-37,-17, 6,-19, 7,-19, -1, -1,-10, 50, 6, 1, -9,-26,-20,-11, 33; /M: SY='N'; M= -9, 9,-27, 3, -3,-25, 11, 12,-30, 5,-28,-14, 20,-18, -1, 2, -1,-12,-28,-28,-13, -3; /M: SY='G'; M= -4, -7, -7, -6, -4,-28, 34,-17,-36,-15,-26,-20, -3,-19,-13,-17, -2,-16,-27,-27,-28, -8; /M: SY='R'; M= -4,-12,-26,-16, -6,-11,-21,-13,-12, 16,-13, -5, -6,-16, -2, 20, -9, -8, -8,-17, -6, -6; /M: SY='C'; M=-10, 4, 56, 4,-11,-26,-20,-18,-31,-18,-24,-23, -4,-27,-17,-21, 0, -6,-16,-46,-26,-14; /M: SY='L'; M= 5,-22,-18,-28,-18, 0,-20,-14, 13,-19, 27, 25,-22,-22,-12,-17,-17, -8, 8,-20, -5,-15; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='T'; M= 3, -5, 10,-10,-10,-15,-14,-18,-14,-14,-18,-14, -1,-16,-10,-14, 21, 24, -2,-37,-17,-10; /M: SY='G'; M= -2, -5,-30, -4,-17,-31, 64,-18,-40,-18,-30,-21, 2,-19,-18,-19, 0,-19,-30,-22,-29,-18; /M: SY='K'; M= 0, 4,-24, 4, 14,-28,-16, -8,-23, 15,-21,-12, 0, -8, 12, 5, 1, 1,-18,-25,-14, 13; /M: SY='E'; M= -9, 17,-23, 17, 20,-24,-16, -5,-24, 5,-21,-18, 12, -8, 5, -2, 6, 9,-21,-32,-16, 12; /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26, 4,-36,-26, 37,-30, 33, 20,-24,-24,-20,-26,-24,-10, 21,-20, 0,-26; /M: SY='D'; M= -7, 20,-23, 21, 2,-27, 3, -7,-29, -1,-27,-21, 18,-13, -4, -6, 9, 3,-22,-34,-19, -1; /M: SY='I'; M=-13,-17,-29,-20,-20, -1,-33,-17, 27,-22, 12, 10,-15,-21,-16,-23,-18,-10, 13,-15, 9,-22; /M: SY='H'; M=-12, 8,-27, 10, -2,-25, 5, 41,-32,-10,-25,-12, 13,-18, 0, -7, 0,-13,-28,-31, -4, -3; /M: SY='D'; M=-16, 17,-26, 21, 5,-23,-16, -1,-28, 8,-22,-17, 10,-15, 1, 17, -1, 0,-21,-27, -8, 1; /M: SY='L'; M=-11,-28, 2,-31,-23, 16,-30,-22, 9,-30, 33, 11,-27,-32,-24,-22,-25,-10, 5,-20, 0,-23; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='B'; M= -7, 11,-15, 9, 1,-13, -9, -1, -5, -3, -9, -5, 11, -9, 3, -4, -1, -4, -9,-17, -7, 1; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='K'; M= -1, -1,-14, 0, 5,-15, 5, -6,-17, 6,-16, -9, 1, -6, 1, 1, 3, -3,-12,-15,-11, 3; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='S'; M= 8, 2,-15, -2, -4,-20, 10, -9,-20, -3,-22,-14, 9,-12, -4, -7, 14, 1,-14,-25,-18, -4; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='Q'; M=-11, 5,-23, 2, 2,-13,-15, 6,-13, 7,-13, -1, 5,-14, 12, 3, -5, -7,-17,-13, 6, 6; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='Y'; M=-11,-16,-20,-16, -8, 16,-24, -4, 3,-12, 5, 1,-17,-21,-12,-11,-13, -7, 2, -1, 23,-11; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='E'; M=-13, 20,-30, 32, 42,-35,-17, 2,-31, 7,-23,-20, 6, -5, 20, -1, 0,-10,-30,-31,-18, 31; /M: SY='I'; M= -8,-30,-23,-35,-27, 3,-35,-27, 37,-28, 27, 18,-25,-25,-22,-25,-21, -8, 28,-22, -2,-27; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='I'; M= 1,-26,-26,-36,-26, -4,-33,-28, 39,-26, 15, 15,-18,-18,-18,-28,-15, -8, 25,-20, -4,-26; /M: SY='I'; M= -8,-29,-21,-32,-26, 6,-33,-22, 30,-25, 24, 15,-26,-27,-22,-22,-20, -7, 26,-18, 5,-26; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='Q'; M=-14,-13,-27,-14, -1, -3,-24, 0,-11, -1, -4, 1, -9,-19, 18, 8,-11,-10,-16,-10, 7, 8; /M: SY='S'; M= 22, -3,-10, -6, -3,-20, 0,-13,-17,-10,-24,-17, 4,-10, -3,-13, 31, 14, -7,-34,-20, -3; /M: SY='F'; M=-16,-17,-27,-21,-16, 11,-12, 2,-12, -9, -7, -3, -7,-23,-13, 6,-13,-13,-11,-13, 5,-16; /M: SY='T'; M= -5,-12,-22,-15, -9,-12,-22,-19, -2, -7, -4, -4,-10, 1, -9,-10, -1, 11, -3,-26,-11,-10; /M: SY='W'; M=-12,-15,-30,-18,-12, 3, -8,-18,-22, 5,-18,-11,-12,-20,-13, -1,-14,-11,-17, 16, 3,-10; /M: SY='D'; M=-15, 32,-27, 46, 11,-27,-11, 1,-31, -3,-26,-24, 13,-13, -1,-10, 3, -5,-24,-30, -5, 4; /M: SY='D'; M=-13, 37,-26, 39, 7,-31, 6, 1,-33, -3,-30,-25, 32,-15, -3, -8, 4, -8,-30,-37,-21, 2; /M: SY='S'; M= 5, 6,-12, 2, -1,-19, -3, -8,-19, -8,-27,-19, 16,-12, -1, -8, 32, 21,-12,-39,-19, -1; /M: SY='L'; M=-14,-26,-25,-31,-22, 17,-31,-16, 16,-19, 19, 10,-20,-25,-18, -8,-21,-10, 8,-10, 11,-22; /M: SY='B'; M= -7, 23,-23, 20, 3,-24, -8, 1,-22, 2,-21,-13, 22,-16, 0, 4, 1, -5,-21,-32,-17, 1; /M: SY='N'; M=-10, 34,-23, 23, 0,-24, 9, 4,-26, -3,-30,-21, 45,-19, -3, -5, 7, -5,-30,-37,-22, -2; /M: SY='K'; M=-11, 5,-28, 3, 13,-25,-18, -5,-25, 29,-22,-11, 7,-12, 8, 20, -7, -8,-21,-25,-12, 10; /M: SY='V'; M= 6,-27,-12,-29,-26, -1,-26,-27, 23,-20, 13, 9,-27,-27,-26,-20,-10, -2, 36,-27,-10,-26; /M: SY='L'; M= -8,-20,-18,-23,-19, 4,-26,-17, 16,-24, 32, 13,-17,-29,-19,-17,-21, -7, 10,-24, -4,-19; /M: SY='V'; M= 6,-20,-11,-24,-21, -4,-23,-25, 14,-18, 9, 4,-20,-23,-21,-18, -3, 9, 26,-27,-10,-21; /M: SY='I'; M= -7,-21,-20,-23,-18, 7,-24,-14, 9,-17, 6, 3,-15,-23,-15,-11, -6, -2, 9,-17, 7,-18; /M: SY='C'; M= 11, -9, 28,-15,-14,-20, -6,-20,-21,-17,-21,-17, -5,-20,-14,-19, 13, 6, -8,-36,-23,-14; /M: SY='S'; M= 5, -1,-18, 0, 5,-20,-14,-13,-14, 2,-17,-12, -3,-11, -3, -5, 8, 6, -5,-29,-16, 1; /M: SY='E'; M= 0, -1,-23, -1, 13,-24, -9, -8,-23, 7,-20,-13, 0,-10, 9, 8, 5, 2,-18,-26,-16, 10; /M: SY='N'; M=-11, 23, 0, 8, -5,-20, -8, 2,-23, 0,-27,-19, 39,-23, -3, 6, 4, -3,-25,-39,-20, -5; /M: SY='Q'; M=-11, 2,-28, -1, 5,-29, -4, 3,-26, 10,-23, -9, 9,-16, 24, 22, -1,-10,-27,-23,-14, 13; /M: SY='D'; M=-11, 14,-28, 16, 16,-28, 5, -3,-32, 3,-25,-20, 14,-13, 3, 5, 0,-10,-28,-29,-21, 9; /M: SY='K'; M= -7, 6,-25, 3, 7,-27,-14, -7,-27, 33,-30,-13, 10,-11, 7, 19, 1, -4,-20,-26,-13, 7; /M: SY='G'; M= -2, -7,-25, -7, -6,-24, 18,-15,-27, 2,-22,-13, -1,-16, -6, -3, 3, -7,-19,-25,-19, -6; /M: SY='N'; M=-10, 32,-23, 29, 9,-29, -6, 4,-26, 0,-29,-20, 33,-14, 8, -3, 10, -1,-27,-37,-19, 8; /M: SY='B'; M=-14, 19,-28, 19, 11,-31,-13, 4,-27, 14,-26,-14, 18,-14, 19, 14, 0, -8,-27,-29,-15, 15; /M: SY='T'; M= -1,-10,-13,-16,-17, -6,-10,-23, -4,-15, -7, -6, -8,-17,-18,-14, 8, 24, 8,-27,-11,-17; /M: SY='P'; M=-10,-11,-37, -6, 0,-29,-17,-16,-20, -9,-30,-20, -8, 74, -9,-17, -7, -9,-30,-31,-29, -9; /M: SY='Y'; M=-13,-17,-24,-18,-14, 19,-21, -3,-10, -9, -9, -7,-10,-15,-12, -1, -4, -3,-10, -2, 24,-14; /M: SY='E'; M= -1, -7,-25, -7, 15,-19,-21,-10, -6, -2, -2, -3, -9,-11, 8, -7, -7, -8,-10,-23,-12, 11; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='W'; M= -9,-15,-29,-16, -3, 16,-20,-17,-16,-14,-10,-13,-16,-19,-15,-15,-15,-14,-17, 29, 9, -6; /M: SY='V'; M= 2,-18, 3,-23,-21, -8,-14,-22, 4,-21, 5, 0,-15,-26,-21,-21,-10, -6, 9,-28,-14,-21; /M: SY='Q'; M= -8, -4,-22, -3, -6,-18,-14,-10, -3, -9, -4, -1, -5,-21, 2, -9, -6, -7, 0,-27,-12, -2; /M: SY='R'; M=-10, 1,-27, 3, 4,-27, -8, -7,-31, 25,-27,-14, 3,-14, 5, 28, -2, -7,-21,-24,-14, 3; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='K'; M=-10, 8, 0, 11, 4,-24,-15, -9,-26, 15,-22,-14, 1,-12, -1, 5, -6, -8,-16,-25,-13, 2; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='R'; M=-11, -2,-18, -8, -5,-10,-12, 2, -7, 6, -6, 10, 5,-15, 3, 19, -7, -6, -9,-19, -7, -3; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='K'; M= -4, -3,-20, 0, -2,-18,-16,-13,-12, 5,-12, -8, -4,-16, -5, -1, 2, 0, -3,-30,-13, -3; /M: SY='R'; M= 4, 4,-20, 2, 3,-21,-12, -9,-19, 3,-17,-14, 3,-14, -1, 7, 4, 1,-11,-28,-16, 0; /M: SY='Y'; M= -6, -3,-26, -2, -3, -4, -5, -7,-21, -2,-15,-12, -4,-18, -8, -2, -7,-10,-17,-12, 2, -6; /M: SY='W'; M=-19,-28,-46,-31,-26, 6,-17,-24,-20,-17,-21,-20,-25,-29,-17,-17,-33,-26,-30,122, 23,-17; /M: SY='R'; M=-11, -6,-26, -5, 4,-14,-18, 3,-19, 10,-18, -9, -3,-16, 13, 17, 0, -4,-18,-13, 8, 6; /M: SY='K'; M=-11, 1,-28, -2, 9,-16,-19, -5,-24, 25,-22, -9, 3,-13, 11, 15, -7, -9,-21,-19, -7, 11; /M: SY='L'; M=-13,-23,-24,-25,-14, 10,-28,-14, 7,-16, 20, 10,-19,-25, -7, -5,-20,-10, 0,-15, 2,-11; /M: SY='E'; M= -8, -9,-23, -8, 5,-11,-24,-11, -8, 2, -1, -3,-11,-16, -3, -2, -8, 0, -5,-21, -4, 1; /M: SY='Q'; M= 3, -9,-23,-10, -2,-21,-16,-11, -9, -4,-10, -5, -6, 0, 5, -7, -2, -4,-10,-25,-15, 1; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='N'; M= 0, -4,-19,-10, -8, -2, -6,-10,-13, -2,-10, -8, 3,-17, -9, -1, -2, -4,-11,-18, -7, -8; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='K'; M= 2, -2,-17, -5, 3,-17,-16,-12,-10, 6,-13, -8, -2,-12, -3, -1, 1, 4, -2,-24,-13, 0; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='L'; M= -7,-18,-18,-20,-11, 8,-23,-17, 3,-21, 18, 4,-16,-22,-15,-15, -8, 3, 1,-21, -2,-12; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='T'; M= 2,-11,-15,-17,-14, 11, -7,-17,-13,-17,-12,-11, -4,-17,-17,-15, 11, 12, -6,-19, -4,-14; /M: SY='D'; M=-11, 24,-26, 34, 20,-33,-12, -4,-33, 11,-28,-22, 11, -8, 5, 1, 5, -5,-24,-34,-18, 13; /M: SY='B'; M=-13, 26,-24, 24, 5,-23,-11, 3,-24, 1,-23,-18, 24,-15, 5, 1, 4, 1,-24,-30,-10, 4; /M: SY='L'; M=-11,-29, -6,-31,-22, 12,-30,-21, 14,-30, 40, 14,-28,-31,-23,-21,-27,-10, 7,-21, -1,-22; /M: SY='T'; M= -1, -2,-18, -3, 4,-19,-15,-15,-17, -7,-19,-15, -1, 9, -3,-10, 16, 24,-12,-32,-17, 0; /M: SY='R'; M= -5, -3,-25, -9, -3,-19,-18,-10,-13, 15,-16, -7, 4,-15, 0, 18, -4, -2,-10,-24,-11, -3; /M: SY='A'; M= 15, -7,-19,-10, 4,-19,-12,-14,-14, 3, -8, -8, -8,-12, -2, -5, 0, -4, -8,-23,-15, 1; /M: SY='K'; M=-10, 3,-30, 6, 25,-30,-20, -7,-30, 38,-27,-13, 0, -7, 13, 21, -7,-10,-23,-23,-13, 19; /M: SY='K'; M=-13, -3,-30, -3, 8,-28,-20, -5,-29, 40,-26, -9, 0,-13, 15, 40, -9,-10,-21,-20,-10, 10; /M: SY='E'; M= -7, -5,-30, -3, 11,-27, 4,-10,-19, -1,-18,-10, -3,-12, 8, -6, -4,-13,-20,-23,-17, 9; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='R'; M= -8,-10,-14,-10, -7, -2,-14, -2, -4, 4, -4, -1, -7,-14, -3, 15, -7, -4, 1, -6, 6, -7; D=-10; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='I'; M= -6,-17,-14,-20,-14, 2,-20,-14, 21,-17, 18, 11,-13,-13,-11,-14,-13, -6, 12,-11, 0,-14; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='A'; M= 12, 3,-11, 2, 6,-15, -6, -8,-12, -3, -9, -9, -1, -5, -1, -8, 5, 3, -7,-17,-12, 2; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='D'; M=-11, 12,-19, 18, 8,-21,-10, 0,-21, 10,-16,-11, 6, -8, 8, 12, -2, -6,-16,-18, -9, 8; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='G'; M= -5,-13,-22,-18,-19,-10, 3,-19, -1,-20, 2, -1, -7,-22,-18,-18, -7, -2, -1,-24,-13,-19; /M: SY='L'; M=-10,-22,-24,-25,-17, 1,-27,-14, 13,-16, 17, 8,-17,-23,-12, -6,-14, -6, 6,-18, 3,-17; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='R'; M= -8, -9,-24,-10, -3,-15,-16,-11,-19, 10,-17, -9, -6,-14, 3, 12, -4, 0,-15, 3, -4, 0; D=-13; /I: I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='D'; M=-12, 11,-23, 17, 10,-13,-16, -8,-22, -1,-17,-16, 2, -2, -4, -7, -1, 0,-18,-24,-10, 4; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='E'; M= 1, 4,-21, 6, 7,-17,-13, -7,-17, 0,-11, -9, -2,-11, 5, -5, -3, -7,-14,-20,-10, 6; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='D'; M=-13, 28,-26, 37, 21,-29,-14, -2,-25, 0,-22,-21, 14,-12, 1, -7, 0, -7,-20,-36,-19, 11; /M: SY='K'; M=-14, 12,-30, 18, 16,-32,-17, -4,-32, 28,-27,-15, 5,-11, 13, 21, -6,-10,-24,-26,-13, 14; /M: SY='K'; M= 7, 2,-25, 0, 2,-27,-11,-12,-22, 14,-24,-14, 1, 4, -1, 1, -1, -6,-17,-25,-18, 0; /M: SY='D'; M= -9, 9,-29, 12, 8,-30, 11, -7,-34, 9,-28,-18, 9,-13, 0, 4, -2,-12,-27,-26,-20, 4; /M: SY='F'; M=-18,-30,-22,-40,-30, 68,-32,-22, 8,-30, 12, 3,-20,-28,-37,-22,-20,-10, 5, 5, 25,-30; /M: SY='I'; M=-12, -8,-30,-10,-10,-16,-29,-19, 11, 0, -4, 3, -7,-15, -7, -8,-14,-10, 5,-23, -6,-11; /M: SY='E'; M=-14, 9,-29, 15, 24,-16,-20, 4,-27, 6,-19,-14, 2,-10, 8, 0, -5,-11,-24,-24, -7, 17; /M: SY='R'; M=-17,-10,-30,-10, -3,-21, -7, -3,-31, 23,-21,-11, 0,-20, 6, 57, -9,-11,-21,-20,-13, -3; /M: SY='N'; M= -7, 22,-21, 11, 6,-26, -6, 7,-20, 1,-27,-14, 34,-15, 18, 1, 12, 0,-27,-34,-17, 12; /M: SY='L'; M=-11,-27,-21,-29,-20, 11,-28,-11, 17,-24, 38, 23,-27,-28,-15,-17,-27,-10, 7,-13, 12,-18; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 14 in 14 different sequences |
| Number of true positive hits | 14 in 14 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | HNH Cas9-type |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]