PROSITE entry PS51766
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | DOCKERIN |
| Accession [info] | PS51766 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JUN-2015 CREATED;
01-JUN-2015 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51766 |
| Associated ProRule [info] | PRU01102 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Dockerin domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=69; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=64; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5402966; R2=0.0211013; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=401; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=188; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-11; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='P'; M= -5,-12,-21,-12, -9,-23,-19,-17,-12,-10,-17,-15,-11, 14, -9,-16, -4, -7,-10,-32,-20,-10; /M: SY='T'; M= -6, -8,-21, -7, -3,-20,-19,-15, -8, -4,-12, -5, -8,-14, -2,-11, -3, 1, -4,-30,-18, -3; /M: SY='I'; M= -7,-27,-14,-29,-23, 3,-31,-21, 16,-21, 9, 11,-25,-26,-17,-23,-16, -5, 15,-18, -3,-21; /M: SY='I'; M=-12,-27,-16,-30,-21, -7,-31,-24, 7,-14, 3, 1,-27,-25,-15,-19,-19, -8, 7, -2, -7,-18; /M: SY='Y'; M=-11,-29,-15,-31,-21, 11,-28, 0, -3,-19, -3, -4,-24,-27,-17,-19,-18,-15, -3, 6, 30,-20; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-30,-30,-20; /M: SY='D'; M=-20, 40,-40, 60, 20,-40,-10,-10,-30,-10,-40,-30, 10,-20, 0,-20, 0,-10,-30,-50,-30, 10; /M: SY='V'; M= -2,-30, -5,-31,-28, -7,-30,-27, 22,-22, 11, 11,-29,-23,-20,-27,-18, -4, 26,-25, -8,-23; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='N'; M=-16, 21,-27, 10, -2,-28,-13, 1,-21, -4,-32,-17, 39,-19, -3, -7, 5, 2,-19,-39,-20, -2; /M: SY='G'; M= -5, -3,-18, -6, -8,-22, 11,-10,-28, -9,-30,-20, -1,-19, -4,-12, 2,-11,-23,-27,-19, -8; /M: SY='D'; M=-20, 39,-39, 57, 19,-39,-10, -9,-30, -9,-40,-29, 13,-20, 0,-19, 1, -9,-30,-49,-29, 9; /M: SY='G'; M= -4, -3,-29, -8,-14,-27, 37,-14,-35,-10,-37,-26, 2,-19,-14,-13, 2,-15,-28,-30,-25,-14; /M: SY='S'; M= 2, 0,-20, -7, -3,-25, -5, -8,-22, 5,-27,-16, 9,-14, 0, 0, 10, 0,-16,-32,-20, -2; /M: SY='V'; M= -4,-30,-10,-30,-30, -6,-34,-30, 33,-24, 15, 10,-30,-24,-23,-30,-20, -4, 35,-26,-10,-24; /M: SY='N'; M=-19, 30,-33, 18, 4,-32,-11, 5,-30, -1,-39,-22, 46,-20, 1, 0, 7, -3,-30,-41,-22, 2; /M: SY='S'; M= 4,-15, -9,-15,-12,-13,-14,-18, -3,-12, -7, -3,-10,-17, -8,-15, 12, 1, -4,-26,-16,-12; /M: SY='T'; M= -6, -8,-15, -8, -8,-18,-21,-17, -5,-11, -8, -7, -2,-17, -9,-13, 3, 16, -3,-30,-18, -8; /M: SY='D'; M=-20, 40,-40, 60, 20,-40,-10,-10,-30,-10,-40,-30, 10,-20, 0,-20, 0,-10,-30,-50,-30, 10; /M: SY='V'; M= -3,-30,-12,-31,-24, 8,-27,-16, 10,-22, 4, 2,-28,-25,-20,-23,-16, -9, 11,-12, 9,-22; /M: SY='V'; M= 6,-23,-10,-23,-19,-13,-15,-24, 4,-18, 0, 3,-21,-19,-15,-18, -6, 4, 9,-27,-16,-18; /M: SY='M'; M= -7,-23,-19,-22,-10, -4,-23,-16, -1,-16, 1, 3,-23,-23,-10,-15,-14,-10, -2,-16, -4,-11; /M: SY='L'; M=-14,-34,-12,-34,-28, -1,-37,-28, 24,-27, 28, 25,-32,-29,-19,-24,-24, -9, 18,-21,-10,-27; /M: SY='K'; M= -8, -8,-21,-16, 0,-25,-21,-11,-21, 26,-20,-12, -5,-16, 4, 16, -3, -9,-16,-28,-19, 0; /M: SY='R'; M=-11, -3,-36, -9, 7,-31,-19, -2,-30, 26,-24,-18, 1,-16, 16, 37, -5,-10,-26,-30,-21, 7; /M: SY='Y'; M=-11,-28,-11,-30,-22, 19,-26, 4, -6,-21, -9, -9,-22,-28,-20,-22,-15,-16, -7, 9, 37,-21; /M: SY='I'; M=-14,-34,-12,-36,-30, 9,-36,-26, 23,-28, 22, 12,-34,-30,-24,-26,-24,-10, 17,-16, -3,-28; /M: SY='L'; M=-12,-25,-14,-28,-23, -8,-26,-23, 8,-21, 15, 9,-21,-26,-16,-17,-18, -8, 3,-24,-14,-22; /M: SY='K'; M= -2, -4,-26,-10, -5,-28, 6,-12,-28, 7,-29,-21, 2,-15, -4, 4, 2, -3,-21,-31,-23, -5; /M: SY='S'; M= -2,-11,-19,-14, -8,-19,-15,-14,-10, -5,-13, -5, -5,-11, -5, -7, 2, 0, -8,-29,-18, -8; /M: SY='I'; M= -6,-14,-16,-16,-16,-15,-22,-20, 6,-14, -5, -5,-11,-16,-16,-18, -6, -2, 5,-28,-16,-16; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='N'; M= -2, 2,-23, 0, 3,-25, -3, -5,-24, 2,-27,-18, 5,-10, -1, -3, 5, -2,-19,-30,-19, 2; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='D'; M= -9, 12,-21, 19, 12,-17, -9, -2,-17, -3,-21,-15, 4,-11, 1, -8, 2, -4,-16,-22, -9, 7; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='F'; M= -7,-18,-11,-19,-15, 3,-16,-11, 0,-14, 0, -2,-16,-16,-13,-14, -8, -4, -1,-10, 2,-15; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='E'; M= -2, 0,-20, 2, 8,-23, -6, -8,-20, -2,-23,-17, -1, 6, 1, -8, 6, -1,-17,-26,-18, 5; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='T'; M= -4, -7,-14, -8, -9,-10,-14, -6, -4,-10,-11, -8, -2,-16,-10,-12, -1, 1, -3,-19, -4,-10; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='N'; M= -7, 9,-22, 9, -2,-23, 6, -6,-22, -7,-27,-18, 11, -8, -5,-10, 3, -4,-19,-28,-19, -3; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='M'; M= -9,-23,-17,-24,-15,-11,-29,-20, 6, -7, 8, 12,-21,-20, -4,-12,-15, -5, 9,-24,-13,-12; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='K'; M= 1, -8,-20, -8, 0,-22,-17,-15,-13, 7,-18,-11,-12,-15, -1, -5, -4, -7, -8,-25,-17, 0; /M: SY='A'; M= 10, -1,-17, -6, -1,-25, -3, -9,-19, -5,-27,-15, 7,-14, -4, -5, 6, -3,-14,-33,-20, -2; /M: SY='A'; M= 19,-23, -8,-23,-16,-17, 2,-22, -9,-16,-10, -7,-23,-16,-14,-14, -1, -6, -3,-28,-20,-16; /M: SY='D'; M=-20, 40,-40, 60, 20,-40,-10,-10,-30,-10,-40,-30, 10,-20, 0,-20, 0,-10,-30,-50,-30, 10; /M: SY='V'; M= -6,-32,-10,-32,-29, -7,-33,-29, 26,-23, 17, 13,-31,-23,-20,-27,-21, -1, 30,-27,-10,-23; /M: SY='N'; M=-19, 26,-23, 18, 1,-30,-12, 2,-28, -6,-37,-22, 38,-21, -3, -9, 5, -4,-28,-39,-19, -1; /M: SY='R'; M= -2,-11,-28,-12, -5,-25, 2,-13,-23, -1,-21,-13, -9,-18, -3, 6, -5,-11,-19,-29,-21, -5; /M: SY='D'; M=-19, 33,-36, 40, 13,-35,-10, 2,-30, -7,-39,-26, 23,-20, 1,-13, 3, -7,-30,-45,-23, 6; /M: SY='G'; M= -3, -5,-30, -7,-15,-30, 49,-16,-39,-17,-40,-29, -2,-20,-16,-17, 1,-17,-30,-31,-29,-16; /M: SY='S'; M= 2, -3,-21, -8, 0,-24,-12, -8,-19, 7,-23,-12, 6,-14, 3, 5, 8, -1,-15,-31,-19, 0; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='I'; M= -8,-30,-10,-31,-29, -1,-36,-29, 32,-26, 16, 10,-30,-27,-25,-29,-20, -6, 29,-22, -8,-26; /M: SY='N'; M=-15, 23,-28, 14, 3,-30,-11, 1,-27, 1,-35,-20, 39,-18, 0, -4, 10, 4,-25,-39,-22, 1; /M: SY='S'; M= 3, -8,-13, -6, -3,-17,-11,-14,-10, -7,-15, -8, -4,-15, -4,-13, 17, 2,-11,-28,-18, -4; /M: SY='T'; M= -9, -5,-19, -4, -5,-13,-21,-14, -8,-12,-12, -9, -3,-18, -6,-14, 0, 12, -7,-27,-14, -6; /M: SY='D'; M=-20, 40,-40, 60, 20,-40,-10,-10,-30,-10,-40,-30, 10,-20, 0,-20, 0,-10,-30,-50,-30, 10; /M: SY='I'; M= -4,-31, -7,-32,-25, 4,-29,-21, 11,-24, 11, 10,-29,-27,-19,-23,-17, -9, 9,-16, -1,-24; /M: SY='A'; M= 10,-20,-10,-21,-16,-13,-15,-19, 0,-14, -5, 6,-15,-18,-10,-16, -2, 3, 6,-27,-14,-14; /M: SY='I'; M=-10,-29,-12,-29,-25, 1,-32,-20, 18,-24, 11, 6,-26,-27,-21,-24,-15, -8, 13,-12, 1,-24; /M: SY='L'; M=-12,-35,-12,-35,-28, -3,-36,-28, 23,-26, 27, 23,-33,-27,-18,-24,-25, -7, 20,-23,-10,-26; /M: SY='K'; M= -7, -4,-28,-12, 3,-25,-19, 0,-24, 23,-24,-16, 0,-14, 9, 18, -1, -9,-19,-28,-16, 4; /M: SY='R'; M=-11, -3,-36,-10, 6,-31,-19, -3,-30, 27,-24,-19, 1,-16, 14, 37, -5,-10,-26,-30,-21, 7; /M: SY='Y'; M=-20,-24,-22,-27,-16, 20,-28, 28,-15,-16,-15,-13,-15,-28,-13,-16,-18,-20,-15, 15, 55,-16; /M: SY='L'; M=-14,-34,-13,-36,-29, 9,-35,-25, 19,-27, 23, 17,-34,-30,-21,-25,-24,-10, 14,-16, -3,-27; /M: SY='L'; M=-17,-28,-14,-30,-25, -6,-30,-24, 13,-25, 22, 12,-23,-28,-18,-19,-21, -9, 5,-23,-12,-25; /M: SY='R'; M= -2, -8,-29,-14, -4,-28, 4, -7,-30, 13,-29,-21, -5,-16, -1, 15, -2,-12,-23,-30,-21, -4; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='M'; M= 1,-19,-13,-20,-13,-12,-20,-20, 3,-11, -1, 6,-15,-19, -9,-14, -5, 0, 5,-26,-15,-13; D=-12; /I: I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='I'; M= -6,-25,-11,-25,-24, -6,-32,-26, 26,-23, 9, 3,-23,-19,-23,-26,-11, -6, 20,-23,-12,-23; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='S'; M= 0, 2,-19, 4, 4,-18, -7, -9,-20, -2,-26,-18, 4,-13, -1, -8, 20, 6,-20,-29,-17, 2; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='E'; M= -9, 3,-30, 5, 16,-27,-18, -8,-23, 15,-23,-16, -1,-13, 9, 4, 1, -6,-20,-30,-20, 13; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='F'; M=-19,-34,-16,-38,-28, 28,-34,-13, 8,-28, 15, 6,-32,-34,-24,-24,-24,-16, 0, -2, 20,-28; /M: SY='P'; M=-10,-15,-31,-14, -8,-40,-16,-19,-30,-10,-31,-30,-17, 69,-10,-20, -9,-10,-21,-40,-30, -9; /M: SY='V'; M= 0,-17,-17,-17,-10,-11,-18, -8, -2,-10,-11, -6,-16,-18, -8,-15, -6, -7, 2,-21, -3, -8; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 32 in 32 different sequences |
| Number of true positive hits | 32 in 32 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Dockerin |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
32 sequences
CELE_ACET2 (P10477), CELK_ACET2 (A3DCH1), CELK_ACETH (P0C2S1), CESA_RUMFL (Q9RLB8), CIPA_ACET2 (Q06851), CIPB_ACETH (Q01866), ENG1_ACET2 (A3DD66), GUB_ACET2 (A3DBX3), GUB_ACETH (Q84C00), GUN2_RUMJO (P37701), GUNA_ACET2 (A3DC29), GUNA_RUMCH (P17901), GUNB_ACET2 (P04956), GUNB_CLOC7 (P28621), GUNC_RUMCH (P37699), GUND_ACET2 (A3DDN1), GUND_ACETH (P0C2S4), GUND_RUMCH (P25472), GUNF_ACET2 (P26224), GUNF_RUMCH (P37698), GUNG_ACET2 (Q05332), GUNG_RUMCH (P37700), GUNH_ACET2 (P16218), GUNS_ACET2 (A3DH67), GUNS_ACETH (P0C2S5), GUNX_ACETH (P15329), NAGH_CLOPE (P26831), XG74_ACET2 (A3DFA0), XG74_ACETH (Q70DK5), XYND_RUMFL (Q53317), XYNY_ACETH (P51584), XYNZ_ACET2 (P10478)» more
|
| PDB [Detailed view] |
16 PDB
1CLC; 1DAQ; 1DAV; 1OHZ; 2B59; 2CCL; 2JNK; 2MTE; 2OZN; 2VN5; 2VN6; 3KCP; 4CJ0; 4CJ1; 4FL4; 5G5D » more |