PROSITE entry PS51822
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | HV_PV_NS3_PRO |
| Accession [info] | PS51822 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
15-FEB-2017 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51822 |
| Associated ProRule [info] | PRU01166 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Hepacivirus/Pegivirus NS3 protease domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=182; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=177; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8278402; R2=0.0132351; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-8411.0546875; R2=37.0461884; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=656; H_SCORE=15891; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=354; H_SCORE=4703; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='A'; M= 48,-10,-10,-19,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-11,-10, -9,-10,-10,-20, 11, 1, 0,-21,-20,-10; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='I'; M=-13,-30,-27,-40,-30, 20,-37,-27, 37,-30, 17, 15,-20,-23,-25,-27,-20,-10, 22,-12, 8,-30; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-19,-20,-10,-10,-11,-10, 0,-10,-10,-10, 21, 49, 0,-30,-10,-10; /M: SY='A'; M= 35,-15,-13,-23,-13,-12, -8,-20, -2,-15, 5, -2,-15,-15,-13,-20, 0, -3, 3,-20,-15,-13; /M: SY='Y'; M=-17,-14,-30,-14, -9, 10,-27, 22, -7, -5, -6, 0,-13,-24, 9, -4,-14,-11,-16, 14, 54, -4; /M: SY='A'; M= 28,-11, 26,-21,-15,-19, -9,-22,-16,-15,-14,-13,-11,-18,-15,-21, 7, 2, -3,-30,-22,-15; /M: SY='Q'; M=-10, -8,-27, -8, 10,-27,-23, 2,-10, 0, -2, 5, -8,-15, 40, 2, -8,-10,-20,-20, -7, 25; /M: SY='Q'; M= -5, 0,-25, 0, 15,-35,-15, 5,-20, 5,-23, -5, 3,-10, 45, 5, 10, -2,-25,-25,-13, 30; /M: SY='T'; M= -3, 3,-15, -2, 8,-15,-20,-15,-15, -5,-13,-13, 0, -7, -2, -7, 15, 35, -8,-30,-13, 3; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='L'; M= -7,-22,-17,-25,-18, 4,-28,-21, 14,-24, 31, 12,-22,-25,-18,-18,-16, 6, 11,-23, -3,-18; /M: SY='L'; M=-10,-30,-19,-31,-22, 19,-30,-21, 18,-29, 40, 16,-29,-30,-24,-20,-27, -9, 12,-17, 3,-22; /M: SY='G'; M= 3, -7,-24, -7,-14,-27, 48,-17,-34,-17,-30,-20, 3,-17,-14,-17, 13, -7,-24,-26,-27,-14; /M: SY='A'; M= 20, -8, 12,-18,-13,-16,-13,-22,-13,-13,-12,-12, -8,-15,-13,-18, 11, 19, -2,-29,-18,-13; /M: SY='I'; M=-10,-27,-27,-37,-27, 0,-35,-22, 42,-25, 20, 30,-20,-20,-15,-25,-20,-10, 25,-20, 0,-25; /M: SY='V'; M= 11,-25,-13,-29,-25, -5,-24,-27, 23,-19, 6, 6,-23,-23,-23,-21, -6, -1, 34,-26,-11,-25; /M: SY='T'; M= 0,-15,-10,-20,-19, -5,-25,-25, 9,-15, 1, 0,-15,-20,-19,-15, 5, 25, 23,-30,-10,-19; /M: SY='S'; M= 7, -8,-10, -8, -8,-15, -8,-15, -7,-13,-20,-12, 0,-15, -8,-13, 27, 15, 5,-37,-17, -8; /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20, 6,-26,-13, 20,-23, 39, 35,-26,-26,-13,-16,-26,-10, 10,-20, 0,-16; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='R'; M=-17,-15,-30,-18, -8,-15,-25, -8,-10, 15,-10, -2, -5,-20, 2, 45,-13,-10, -7,-20, -7, -8; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='K'; M=-10, -6,-32, -4, 6,-29,-20,-12,-27, 31,-29,-13, -5, 15, 4, 18, -9, -8,-22,-23,-15, 4; /M: SY='N'; M=-11, 23,-21, 9, -1,-19, -7, 4,-21, 6,-25,-16, 38,-19, 1, 16, 6, 4,-24,-34,-16, -1; /M: SY='E'; M= -7, 0,-23, 2, 20,-22,-22, -8,-13, -1,-12, -9, -4, -9, 11, -5, 3, 6,-10,-28,-14, 15; /M: SY='W'; M= -1,-22,-24,-24,-17, -8,-21,-20, 2,-13, -7, -3,-21,-24, -8,-14,-13, -9, 6, 18, -1,-11; /M: SY='T'; M= 8, 1,-12, -2, 13,-20,-15,-14,-18, -4,-14,-14, -3, -8, -1,-10, 10, 15,-11,-28,-17, 6; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='E'; M= -7, 7,-25, 11, 40,-26,-20, -4,-24, 5,-17,-16, 0, -3, 15, -2, 5, 5,-22,-29,-17, 27; /M: SY='I'; M= -5,-30,-20,-35,-30, 0,-35,-30, 40,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 40,-25, -5,-30; /M: SY='Q'; M=-13, -8,-27,-10, 7,-10,-23, 2,-15, 0,-12, 0, -5,-15, 35, 2, -5,-10,-22,-12, 0, 22; /M: SY='V'; M= -7,-25,-18,-27,-22, -2,-29,-22, 17, -9, 4, 6,-21,-26,-19, 1,-12, -4, 28,-25, -7,-22; /M: SY='L'; M= -7,-30,-17,-30,-23, 7,-30,-23, 23,-27, 40, 17,-30,-30,-23,-20,-25, -7, 20,-23, -3,-23; /M: SY='S'; M= 7, -3,-15, -3, -5,-23, 18,-13,-25,-13,-30,-20, 7,-13, -5,-13, 30, 10,-15,-35,-23, -5; /M: SY='T'; M= 3, 0,-10, -7, -7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13, 3,-10, -7,-10, 26, 41, -3,-33,-13, -7; /M: SY='A'; M= 22,-17,-13,-21,-15, -9,-13,-21, 4,-17, 7, 0,-17,-19,-15,-19, -2, -2, 10,-23,-13,-15; /M: SY='T'; M= 14, -3,-10,-12,-10,-13,-14,-20,-10,-10,-11,-10, -2,-10,-10,-13, 18, 35, 0,-28,-13,-10; /M: SY='Q'; M= -7, 0,-25, -3, 12,-32,-20, 2,-17, 5,-17, -3, 0,-10, 42, 5, 5, 5,-22,-23,-10, 27; /M: SY='S'; M= 7, 0,-10, -3, -3,-17, -7,-13,-17,-10,-23,-17, 7,-10, -3,-10, 33, 30, -7,-37,-17, -3; /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-35,-27, 67,-30,-10, 0,-25, 7, 0,-20,-30,-32,-17,-20,-10, -3, 15, 43,-27; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20, 7,-27,-15, 20,-25, 41, 30,-27,-27,-15,-17,-27,-10, 11,-20, 0,-18; /M: SY='G'; M= 15,-10,-24,-13,-17,-27, 48,-20,-31,-17,-24,-17, -3,-17,-17,-20, 3,-14,-21,-20,-27,-17; /M: SY='T'; M= -5, -9,-13,-19,-16, 13,-23,-20, -6,-16, -4, -6, -6,-15,-18,-13, 9, 33, 1,-20, 0,-16; /M: SY='C'; M= 4,-14, 24,-19,-19,-13,-20,-23, -7,-18,-11, -9,-12,-23,-19,-19, 7, 12, 8,-36,-18,-19; /M: SY='V'; M= -7,-27, 15,-34,-30, -5,-34,-30, 23,-27, 6, 6,-23,-29,-26,-27,-14, -7, 27,-31,-11,-30; /M: SY='N'; M= -7, 28,-22, 25, 2,-26, 8, -1,-28, -5,-30,-23, 32,-16, -3, -7, 11, -2,-26,-37,-21, 0; /M: SY='G'; M= -3, 3,-27, -2,-15,-27, 52,-12,-35,-15,-30,-20, 15,-20,-15,-15, 3,-15,-30,-25,-27,-15; /M: SY='V'; M= 2,-29,-11,-30,-29, -1,-29,-30, 29,-20, 9, 9,-29,-29,-29,-20, -9, 0, 47,-29,-10,-29; /M: SY='L'; M=-10,-25, 9,-30,-22, 1,-28,-17, 10,-25, 27, 22,-25,-29,-17,-20,-23,-10, 6,-26, -6,-20; /M: SY='W'; M=-20,-35,-45,-35,-27, 15,-23,-17,-15,-17,-15,-15,-35,-30,-17,-17,-35,-25,-25,120, 43,-20; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='V'; M= 12,-25,-10,-27,-25, -5,-22,-27, 20,-18, 6, 5,-25,-25,-25,-20, -6, 0, 36,-27,-12,-25; /M: SY='Y'; M=-20,-16,-29,-18,-16, 25,-27, 34, -8,-13, -4, 0,-12,-27, -9, -9,-17,-13,-14, 12, 57,-16; /M: SY='H'; M=-20, -1,-30, -1, -1,-19,-20, 98,-29,-10,-19, 0, 9,-20, 9, 0,-10,-20,-29,-28, 22, -1; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='A'; M= 38, -8,-11,-15, -7,-20, -1,-17,-13,-10,-16,-13, -5, -7, -7,-17, 17, 5, -3,-25,-20, -7; /M: SY='G'; M= -3, -7,-30, -7,-12,-30, 47,-17,-37, -2,-30,-17, 0,-17,-12, -7, -3,-17,-27,-20,-25,-12; /M: SY='S'; M= 5, 3,-17, -1, -7,-20, 16,-10,-24,-11,-27,-19, 14,-15, -7,-12, 20, 6,-17,-32,-21, -7; /M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 5,-25,-20, -5,-30, 40,-25,-10, 0,-15, 10, 49,-10,-10,-20,-20,-10, 5; /M: SY='T'; M= -5, -2,-15, -9, -7,-13,-20,-14,-15, 0,-13,-10, 1,-13, -5, 10, 12, 34, -6,-28,-10, -7; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21, 9,-31,-21, 24,-30, 46, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 12,-20, 0,-21; /M: SY='A'; M= 48,-10,-10,-19,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-11,-10, -9,-10,-10,-20, 11, 1, 0,-21,-20,-10; /M: SY='G'; M= -3, -6,-28, -6,-13,-26, 39, 11,-35,-16,-27,-15, 4,-19,-10,-14, 2,-15,-27,-25,-16,-13; /M: SY='P'; M= -4,-12,-32, -8, -2,-25,-16,-16,-17,-10,-25,-17,-10, 57, -9,-17, -3, -6,-23,-31,-26, -9; /M: SY='K'; M= -9, -2,-24, -4, 3,-23,-19,-11,-25, 29,-23,-10, 0,-12, 5, 26, 0, 6,-15,-23,-10, 3; /M: SY='G'; M= -3,-10,-30,-10,-17,-29, 57,-12,-39,-15,-29,-18, 0,-20,-16,-10, -1,-19,-29,-20,-26,-17; /M: SY='P'; M= -5,-15,-32, -7, 0,-27,-15,-17,-20,-10,-30,-20,-12, 65, -7,-17, 3, -2,-25,-33,-27, -7; /M: SY='V'; M= 4,-27,-17,-32,-27, -3,-29,-29, 31,-22, 11, 11,-24,-24,-24,-24,-11, -4, 36,-25, -8,-27; /M: SY='H'; M= -9,-10, 3,-16,-14,-10,-24, 8, -8,-18, -3, -2, -6,-23,-11,-14, -4, 5, -3,-32, -4,-14; /M: SY='Q'; M=-10, -5,-33, -3, 14,-37,-20, 2,-20, 5,-23, -5, -5, 15, 41, 4, -3,-10,-30,-23,-15, 26; /M: SY='M'; M=-10,-22,-22,-32,-22, 0,-25, -8, 27,-15, 19, 49,-20,-20, -5,-15,-19, -9, 15,-20, 0,-15; /M: SY='Y'; M=-15,-15,-25,-17,-17, 20,-27, 10, -3,-10, -3, -3,-15,-25,-10,-10,-10, 5, -7, 15, 57,-17; /M: SY='T'; M= 1, -8,-10,-14,-14, -9,-20,-21, -1,-13, -7, -6, -6,-15,-14,-13, 15, 34, 11,-31,-11,-14; /M: SY='N'; M= -9, 35,-21, 29, 5,-25, -3, 4,-25, -2,-30,-23, 41,-16, 0, -4, 13, 1,-26,-40,-20, 3; /M: SY='V'; M= 22,-21,-10,-26,-21, -9,-17,-26, 13,-16, 1, 1,-21,-21,-21,-20, -1, 0, 28,-26,-14,-21; /M: SY='D'; M= -1, 28,-25, 38, 20,-33, -9, -5,-31, -1,-23,-23, 9, -8, 1,-11, 3, -7,-22,-33,-20, 10; /M: SY='Q'; M= -8, 6,-27, 1, 5,-30, 1, 2,-22, 2,-21, -8, 13,-16, 22, 1, 0, -9,-27,-25,-16, 14; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='L'; M=-10,-22,-23,-22,-10, -3,-27,-11, 10,-19, 30, 17,-22,-24, 1,-12,-22,-10, 0,-20, -3, -4; /M: SY='V'; M= -5,-10,-15, -5,-17,-10,-25,-22, 12,-15, 0, 0,-17,-25,-22,-17, -7, -3, 30,-33,-13,-20; /M: SY='G'; M= -3,-15,-30,-18,-23,-22, 42,-23,-17,-23,-17,-10, -5,-20,-20,-23, -5,-17,-15,-20,-22,-23; /M: SY='W'; M=-20,-35,-45,-35,-27, 15,-23,-17,-15,-17,-15,-15,-35,-30,-17,-17,-35,-25,-25,120, 43,-20; /M: SY='P'; M=-10,-14,-37, -7, 6,-33,-20, -9,-20, -4,-27,-14,-13, 58, 11,-11, -7,-10,-30,-27,-23, 5; /M: SY='A'; M= 21, -9,-18,-11, -4,-22, -6,-17,-16, -9,-21,-16, -6, 15, -7,-16, 14, 4,-11,-29,-22, -7; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='P'; M= -3,-17, 5,-16, -7,-26,-20,-20,-20,-14,-22,-16,-17, 34, -9,-20, -7, -9,-21,-33,-26,-11; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='A'; M= 28, -7,-11,-16,-10,-16, -8,-20,-10, -8,-11,-10, -6,-11,-10,-15, 13, 16, 1,-25,-16,-10; /M: SY='R'; M=-12, -7,-30, -7, -3,-25, 6, -8,-33, 21,-25,-13, 0,-17, 1, 34, -7,-13,-23,-20,-16, -3; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20, 11,-30,-18, 19,-29, 47, 20,-29,-30,-19,-19,-29,-10, 9,-18, 3,-20; /M: SY='T'; M= -1, 6,-16, 4, 3,-17,-18,-15,-15, -6,-13,-13, 1,-10, -6,-10, 12, 28, -6,-31,-13, -2; /M: SY='P'; M=-13,-17,-37,-10, 0,-27,-20,-14,-23, 1,-27,-17,-14, 59, -4, 6,-10,-10,-27,-27,-24, -7; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='T'; M= 4, 1,-11, -6, -6,-14,-13,-16,-14, -8,-17,-13, 4,-10, -6, -9, 24, 37, -4,-33,-13, -6; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='S'; M= 16, 0,-15, -1, 12,-23, -5,-10,-20, -5,-22,-17, 2, -7, 2,-10, 21, 7,-12,-32,-20, 7; /M: SY='S'; M= 12, -7,-10,-11,-10,-14,-10,-18, -7,-12,-14,-10, -3,-14,-10,-13, 21, 21, 5,-32,-16,-10; /M: SY='D'; M=-17, 37,-30, 52, 17,-37,-13, -3,-37, 13,-30,-25, 15,-10, 3, 0, -3,-10,-27,-35,-17, 10; /M: SY='L'; M= -7,-25,-23,-25,-20, 0, -5,-20, 5,-27, 30, 10,-22,-27,-20,-20,-22,-13, 0,-20, -8,-20; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='V'; M= -1,-30,-12,-31,-30, 0,-31,-30, 32,-21, 11, 11,-29,-29,-29,-21,-11, -1, 48,-29, -9,-30; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='H'; M=-13, 8,-25, 6, 2,-16,-15, 23,-16, -9, -6, -5, 12,-20, 1, -6, -8,-10,-20,-30, -4, 0; /M: SY='A'; M= 37,-10,-15,-17,-13,-23, 18,-20,-18,-13,-15,-13, -7,-13,-13,-20, 7, -5, -8,-20,-23,-13; /M: SY='D'; M=-12, 37,-25, 52, 15,-35, -7, -3,-35, -3,-30,-27, 17,-10, 0,-10, 10, -2,-25,-40,-20, 7; /M: SY='V'; M= -3,-30,-13,-30,-27, 3,-30,-27, 27,-23, 20, 13,-30,-30,-27,-20,-15, -3, 40,-27, -7,-27; /M: SY='I'; M= -7,-30,-23,-36,-29, 1,-36,-29, 41,-27, 20, 17,-24,-24,-23,-26,-18, -7, 34,-23, -3,-29; /M: SY='P'; M=-10,-12,-37, -2, 15,-30,-20,-15,-23, -5,-27,-20,-15, 67, -2,-15, -7,-10,-30,-30,-27, 3; /M: SY='V'; M= 24,-20,-10,-25,-20,-10,-16,-25, 11,-15, 0, 0,-20,-20,-20,-20, 0, 0, 26,-25,-15,-20; /M: SY='R'; M=-17, 3,-27, -2, 0,-20,-15, 3,-27, 22,-23,-13, 15,-20, 7, 52, -5, -7,-23,-25,-13, 0; /M: SY='R'; M=-17, -7,-30, -7, 3,-23,-20, -3,-30, 35,-23,-10, 0,-17, 10, 60,-10,-10,-20,-20,-10, 3; /M: SY='R'; M=-11, -6,-25, -6, 1,-21,-15, -3,-27, 20,-23,-12, 3,-16, 9, 45, 3, -2,-18,-25,-13, 2; /M: SY='G'; M= -6, 9,-30, 15, -7,-33, 45,-14,-40,-14,-30,-23, 6,-17,-14,-17, 0,-17,-30,-26,-27,-11; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='P'; M= -4, -2,-23, -3, -1,-22,-11,-11,-21, -1,-26,-17, 5, 13, -2, 1, 11, 9,-18,-32,-19, -4; /M: SY='R'; M=-17,-11,-27,-13, -6, -6,-23, 2,-20, 14,-14, -7, -5,-21, 2, 38, -8, -1,-15, -9, 13, -6; /M: SY='W'; M= 13,-18,-28,-21,-19,-16, 22,-23,-24,-16,-20,-16,-14,-19,-16,-20, -6,-15,-19, 23,-11,-16; /M: SY='C'; M= 17, -9, 21,-15,-12,-21, -3,-19,-21,-16,-21,-17, -5,-18,-12,-19, 15, 4, -8,-35,-23,-12; /M: SY='L'; M= -7,-30,-17,-30,-23, 7,-30,-23, 23,-27, 40, 17,-30,-30,-23,-20,-25, -7, 20,-23, -3,-23; /M: SY='L'; M=-10,-27, 15,-30,-23, 2,-30,-23, 9,-30, 31, 10,-27,-32,-23,-23,-25,-10, 6,-28, -8,-23; /M: SY='S'; M= 7, -3,-15, -3, -5,-23, 18,-13,-25,-13,-30,-20, 7,-13, -5,-13, 30, 10,-15,-35,-23, -5; /M: SY='P'; M= 6,-17,-31,-13, -3,-27,-15,-20,-17,-10,-24,-17,-17, 60,-10,-20, -4, -5,-21,-27,-27,-10; /M: SY='R'; M=-17,-15,-27,-15, -5,-12,-23, -5,-17, 15, -2, -2, -8,-23, 2, 47,-15,-10,-12,-20, -7, -5; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='I'; M= -9,-27,-23,-34,-24, 3,-31,-19, 32,-24, 29, 29,-24,-24,-16,-21,-22, -9, 20,-21, -1,-22; /M: SY='S'; M= 24, -3,-10, -7, -3,-20, 0,-13,-17,-10,-23,-17, 3,-10, -3,-13, 30, 13, -7,-33,-20, -3; /M: SY='T'; M= -6,-16, 0,-20,-20, 0,-25,-14, 1,-15, -4, -3,-15,-24,-17,-14, -1, 11, 9,-19, 7,-20; /M: SY='L'; M= 5,-25,-17,-27,-17, 2,-22,-20, 12,-25, 35, 12,-25,-25,-17,-20,-20, -7, 7,-20, -5,-17; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='G'; M= 13,-10,-25,-13,-17,-27, 52,-20,-32,-17,-25,-17, -3,-17,-17,-20, 3,-15,-22,-20,-27,-17; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='I'; M= -7,-30,-21,-34,-27, 3,-33,-26, 34,-26, 26, 19,-26,-26,-22,-23,-20, -7, 29,-23, -3,-26; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20, 7,-27,-14, 20,-24, 42, 31,-27,-27,-14,-17,-27,-10, 10,-20, 0,-17; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='P'; M= -4,-14,-32, -7, 0,-27,-14,-17,-20,-10,-30,-20,-12, 62, -7,-17, 4, -2,-24,-33,-27, -7; /M: SY='S'; M= 3, -4,-15, -5, -2,-17, -6, -8,-18, -3,-23,-11, 5,-13, 1, 4, 24, 12,-10,-34,-16, -2; /M: SY='G'; M= -1, -9,-30, -8,-19,-30, 66,-19,-40,-18,-30,-20, 0,-20,-19,-18, 0,-20,-30,-20,-29,-19; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='V'; M= 11,-24,-11,-27,-24, -6,-22,-26, 18,-16, 4, 4,-24,-25,-24,-16, -5, 0, 35,-27,-12,-24; /M: SY='V'; M= 8,-26,-15,-30,-26, -4,-26,-28, 27,-20, 8, 8,-23,-23,-23,-23, -8, -3, 35,-25,-10,-26; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='I'; M= -9,-27,-23,-34,-25, 2,-32,-20, 34,-24, 26, 29,-23,-23,-16,-22,-21, -9, 22,-21, -1,-23; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='R'; M=-15, -7,-25,-10, -3,-17,-20, -5,-25, 20,-17,-10, 0,-17, 5, 50, -2, 5,-15,-23,-10, -3; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='V'; M= -5,-25,-16,-25,-22, -5,-28,-22, 16, -8, 3, 5,-22,-27,-20, 2,-10, -3, 32,-27,-10,-22; /M: SY='C'; M=-10, -5, 85,-17,-22,-20,-22,-20,-27,-22,-23,-20, 0,-35,-22,-22, -5, -7,-15,-47,-27,-22; /M: SY='T'; M= 6, -1,-10, -7, -7,-14,-12,-17,-13,-10,-17,-13, 3,-10, -7,-11, 26, 37, -3,-33,-14, -7; /M: SY='R'; M=-15,-10,-30,-10, -5,-23, 3, -5,-33, 17,-23,-13, 0,-20, 2, 47, -7,-13,-23,-20,-15, -5; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= 4,-22,-10,-22,-22, -6,-21,-25, 16,-17, -1, 2,-19,-24,-22,-17, 3, 5, 33,-32,-13,-22; /M: SY='A'; M= 37,-15,-10,-23,-15,-15, -8,-23, 0,-13, -5, -5,-15,-15,-15,-20, 5, 0, 13,-23,-17,-15; /M: SY='K'; M= -5, 0,-25, 0, 7,-27,-15,-10,-27, 35,-30,-13, 3,-10, 7, 20, 3, -2,-17,-25,-13, 7; /M: SY='A'; M= 24, -5,-15, -9, 0,-25, -5,-10,-15, -5,-18,-10, -2,-10, 10,-10, 16, 3,-10,-26,-17, 5; /M: SY='I'; M= -8,-30,-22,-34,-26, 4,-34,-26, 35,-28, 29, 18,-26,-26,-22,-24,-22, -8, 27,-22, -2,-26; /M: SY='D'; M=-18, 26,-30, 38, 16,-35,-14, 1,-34, 9,-26,-20, 11,-12, 12, 13, -3,-10,-27,-32,-16, 13; /M: SY='F'; M=-15,-30,-17,-37,-30, 60,-30,-23, 8,-27, 10, 3,-23,-30,-37,-20,-17, -7, 13, 0, 20,-30; /M: SY='I'; M= -9,-24,-25,-30,-22, -6,-32,-22, 24,-12, 7, 9,-17,-22,-14, -2,-14, -8, 21,-22, -5,-22; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='V'; M= -3,-30, -8,-30,-27, 2,-30,-27, 26,-23, 19, 12,-29,-30,-27,-21,-15, -3, 37,-28, -8,-27; /M: SY='E'; M= -7, 0,-25, 7, 37,-22,-23, -8,-15, 2,-12,-12, -8, -8, 7, -5, -3, -7,-10,-30,-17, 22; /M: SY='C'; M= 2, 1, 21, -6, -9,-18,-11,-13,-21,-13,-24,-18, 9,-19, -9,-14, 18, 13,-12,-40,-21, -9; /M: SY='L'; M= 5,-22,-17,-27,-17, 0,-20,-15, 12,-20, 27, 22,-22,-22,-12,-17,-17, -7, 7,-20, -5,-15; /M: SY='D'; M= -7, 13,-27, 21, 20,-31, 8, -6,-33, -3,-26,-22, 6, -9, 4, -9, 6, -8,-27,-31,-22, 12; /M: SY='T'; M= -1,-11,-16,-17,-16, 1,-22,-11, 0,-12, -4, -4,-10,-18,-13,-13, 4, 19, 5,-14, 12,-16; /M: SY='H'; M= -4, -4,-19, -9, -5,-17,-20, 14,-11, -9,-12, -4, -1,-15, 3, -7, 5, 13, -7,-28, -3, -2; /M: SY='M'; M= -4,-15,-23,-19,-11,-13,-20,-13, 1, -9, -3, 13,-15, 10, -5,-11, -6, 3, -2,-25,-12,-10; /M: SY='R'; M=-17, -7,-30, -7, 5,-25,-20, 3,-27, 25,-20, -7, 0,-17, 23, 55, -7,-10,-23,-20,-10, 10; /M: SY='S'; M= 2, -5,-15, -6, -6, -7, -9, -3,-14,-10,-21,-14, 2,-15, -3,-10, 24, 14, -9,-22, 6, -6; /M: SY='P'; M= -7,-15,-32,-10, -3,-25,-20,-20,-17,-10,-25,-17,-15, 65,-10,-17, -2, 5,-22,-30,-25,-10; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 33 in 33 different sequences |
| Number of true positive hits | 33 in 33 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Peptidase S29 |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
33 sequences
POLG_GBVB (Q69422), POLG_HCV1 (P26664), POLG_HCV6A (Q5I2N3), POLG_HCV77 (P27958), POLG_HCVBB (Q68749), POLG_HCVBK (P26663), POLG_HCVCO (Q9WMX2), POLG_HCVED (O39929), POLG_HCVEU (O39927), POLG_HCVEV (O39928), POLG_HCVH9 (Q81754), POLG_HCVIN (Q913D4), POLG_HCVJ1 (Q03463), POLG_HCVJ4 (O92972), POLG_HCVJ6 (P26660), POLG_HCVJ8 (P26661), POLG_HCVJA (P26662), POLG_HCVJF (Q99IB8), POLG_HCVJK (Q68801), POLG_HCVJL (Q68798), POLG_HCVJP (Q9DHD6), POLG_HCVJT (Q00269), POLG_HCVK3 (Q81495), POLG_HCVNZ (Q81258), POLG_HCVR6 (Q913V3), POLG_HCVSA (O91936), POLG_HCVT5 (O92529), POLG_HCVTR (Q81487), POLG_HCVTW (P29846), POLG_HCVVA (Q9QAX1), POLG_HCVVN (O92530), POLG_HCVVO (O92531), POLG_HCVVP (O92532)» more
|
| PDB [Detailed view] |
80 PDB
1A1Q; 1A1R; 1A1V; 1BT7; 1CU1; 1DXP; 1DY8; 1DY9; 1JXP; 1N1L; 1NS3; 1RGQ; 1RTL; 1W3C; 2A4G; 2A4R; 2F9V; 2GVF; 2O8M; 2OBO; 2OBQ; 2OC0; 2OC1; 2OC7; 2OC8; 2OIN; 2P59; 2QV1; 2XNI; 2ZJO; 3EYD; 3KN2; 3MRG; 3MRH; 3MRJ; 3MRL; 3OYP; 3P8N; 3P8O; 3RC4; 3RC5; 3RVB; 3SU4; 4A1T; 4A1V; 4A1X; 4A92; 4B6E; 4B6F; 4B71; 4B73; 4B74; 4B75; 4B76; 4I31; 4I32; 4I33; 4JMY; 4K8B; 4KTC; 4U01; 5FPS; 5FPT; 5FPY; 6BQJ; 6BQK; 6N4N; 6P6S; 6P6Z; 6VDO; 7MM3; 7MM4; 7MM9; 7MMA; 7MMB; 7MMC; 7MMD; 7MME; 7MMK; 7MML » more |