Due to maintenance work, this service will be unavailable from
Mon Nov 11 17:30 until
Tue Nov 12 09:00
CET.
Apologies for the inconvenience.
PROSITE entry PS51852
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | PG1 |
| Accession [info] | PS51852 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
28-FEB-2018 CREATED;
28-FEB-2018 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51852 |
| Associated ProRule [info] | PRU01199 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | pG1 pseudoGTPase domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=175; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=170; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2622278; R2=0.0134794; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=649; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=315; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='D'; M=-11, -2,-27, 4, -4,-16,-21,-15, -4,-16, 0, -6, -8, 1,-10,-18, -9, -7, -8,-30,-13, -9; /M: SY='T'; M= 7,-11,-20,-16,-12,-16, -8,-20, -5,-15,-12, -8, -7, 2,-11,-18, 7, 10, -3,-27,-16,-13; /M: SY='N'; M= -9, 17,-19, 10, -4,-18,-13, -5,-13, -2,-18,-13, 21,-19, -6, 0, 5, 6, -9,-34,-15, -6; /M: SY='I'; M= 8,-12,-18,-22,-20, -9,-20,-20, 17,-17, 1, 3, -6,-20,-16,-19, -4, -3, 17,-26,-11,-20; /M: SY='D'; M=-15, 32,-26, 47, 15,-32,-15, -5,-26, -3,-22,-22, 9,-13, -3,-11, -2, -8,-16,-37,-18, 6; /M: SY='R'; M=-11, -4,-27, -4, 6,-26,-17, -2,-27, 26,-24,-10, 1,-14, 18, 36, -1, -6,-20,-23,-11, 10; /M: SY='V'; M= -5,-26,-21,-29,-24, -4,-32,-27, 29,-13, 8, 11,-22,-23,-20,-16,-14, -5, 32,-25, -6,-24; /M: SY='N'; M= -8, 19,-25, 11, 7,-25, 6, -1,-27, 7,-29,-18, 29,-15, 1, 2, 3, -7,-28,-31,-20, 4; /M: SY='L'; M= -9,-25,-20,-25,-14, 0,-28,-16, 14,-21, 31, 15,-25,-26, -7,-15,-22, -9, 9,-21, -3,-11; /M: SY='L'; M= -9,-29,-18,-30,-25, 16,-30,-18, 19,-23, 23, 11,-28,-30,-24,-19,-20, -6, 22,-13, 11,-25; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='I'; M=-10,-26,-24,-34,-26, 14,-32,-24, 34,-26, 15, 13,-17,-19,-21,-24,-17, -9, 20,-12, 5,-26; D=-12; /I: I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='L'; M= 1,-22,-15,-26,-17, 16,-20,-17, 8,-22, 24, 8,-20,-22,-19,-17,-16, -7, 5,-12, 2,-17; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='G'; M= -2,-10,-24,-12,-17,-20, 43,-13,-23,-15,-17, -3, -4,-17,-13,-15, -4,-15,-18,-17,-20,-15; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='R'; M=-11, 5,-24, 1, 4,-21,-13, -2,-24, 28,-23,-10, 11,-13, 7, 31, -5, -7,-19,-21,-10, 4; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='D'; M=-17, 36,-30, 48, 13,-35,-10, -2,-33, -2,-30,-27, 19, 6, -2,-10, 0, -9,-30,-38,-22, 5; /M: SY='G'; M= -4,-10,-32, -8,-11,-30, 37,-18,-35, -6,-30,-18, -4, 2,-13,-11, -4,-16,-28,-22,-26,-13; /M: SY='L'; M=-12,-25,-22,-25,-16, 5,-28, 2, 11,-26, 37, 16,-23,-28,-15,-16,-26,-12, 3,-22, 4,-16; /M: SY='A'; M= 27,-17,-15,-27,-17, 2,-13,-22, 3,-17, -1, -3,-14,-15,-17,-22, -1, -4, 5,-15, -7,-17; /M: SY='R'; M=-18,-11,-30,-11, -2, -7,-24, 10,-17, 11,-13, -4, -7,-21, 15, 26,-11,-10,-19, -2, 23, 3; /M: SY='E'; M= -6, 6,-26, 13, 42,-30,-16, 0,-26, 6,-22,-16, 2, -4, 24, 0, 7, -5,-26,-30,-18, 33; /M: SY='L'; M=-10,-27,-22,-32,-22, 5,-29,-16, 25,-24, 36, 31,-25,-25,-14,-19,-25,-10, 14,-20, 0,-19; /M: SY='A'; M= 28,-12,-17,-20, -8,-20,-11,-16, -1,-10, -6, -3,-10,-12, 1,-16, 3, -4, 0,-20,-15, -4; /M: SY='N'; M= -8, 24,-20, 11, 0,-20, -4, 5,-22, 4,-28,-18, 40,-18, 2, 11, 12, 2,-25,-36,-18, 0; /M: SY='E'; M=-12, 3,-28, 9, 44,-10,-22, -4,-25, 3,-15,-16, -4, -5, 9, -4, -4,-10,-25,-23,-11, 27; /M: SY='I'; M= -8,-25,-25,-33,-25, 11,-31,-25, 28,-26, 9, 9,-15,-20,-20,-25, -9, -5, 17,-18, 2,-25; /M: SY='R'; M=-16, -6,-30, -6, 7,-27,-20, 4,-26, 23,-20, -6, 0,-16, 28, 48, -6,-10,-24,-20,-10, 14; /M: SY='A'; M= 28,-11,-10,-19,-14,-14,-10,-22, -3,-12, -6, -6,-11,-14,-14,-18, 9, 12, 9,-24,-16,-14; /M: SY='M'; M=-12,-18,-24,-21,-10, -2,-25, 0, 6,-11, 15, 23,-18,-22, 7, -8,-18,-10, -4,-11, 12, -2; /M: SY='C'; M= -5,-17, 62,-23,-21,-15,-23,-23,-18,-25,-10,-13,-14,-31,-21,-23, -1, -3, -6,-42,-22,-21; /M: SY='T'; M= 0, -4,-15, -8, -6,-15,-16,-18,-14,-10,-17,-14, -2, 8, -8,-12, 18, 34, -7,-32,-15, -8; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='D'; M=-13, 34,-26, 48, 24,-35,-10, -2,-35, 0,-28,-26, 15, -8, 4, -8, 7, -5,-26,-38,-20, 14; /M: SY='D'; M=-15, 25,-28, 37, 6,-29, 1, -7,-29, -9,-16,-19, 7,-15, -7,-14, -5,-12,-23,-33,-18, -1; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='E'; M=-10, -2,-24, 2, 24,-18,-19, -5,-17, 9, -6, -7, -5, -9, 7, 8, -8, -9,-16,-22,-11, 15; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='Y'; M=-15,-15,-24,-17,-12, 22,-24, 8, -4, -9, -2, 0,-14,-22, -2, -7,-14, -9,-10, 13, 44, -8; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='D'; M= 5, 8,-16, 13, -3,-19,-11,-12, -9, -7,-11,-11, -3,-14,-10,-14, 0, -4, 2,-27,-15, -6; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='L'; M= -9,-11, 7,-18,-17, -4,-22,-15, 5,-20, 11, 3, -6,-24,-15,-17,-14, -7, 1,-26, -9,-17; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='D'; M=-15, 21,-28, 33, 10,-29,-12, 15,-29, -4,-24,-19, 8, 8, 0, -9, -4,-10,-26,-31,-12, 3; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='G'; M= -4, -9,-26, -9,-14,-24, 44,-14,-33, -8,-24,-15, 0,-17,-12, -1, -2,-15,-24,-17,-22,-14; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='K'; M= -5, -5,-22, -7, 0,-19,-17,-12,-10, 18,-17, -5, -2,-10, 1, 8, -1, -3, -6,-21, -9, 0; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='M'; M= -7,-12,-20,-19,-11, -9,-22, -9, 12,-10, 5, 18,-10,-14, 4,-10, -6, 2, 5,-19, -4, -5; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='Y'; M=-15,-19,-24,-19,-17, 22,-26, 10, 4,-12, 9, 4,-19,-26,-10,-10,-19, -9, -5, 17, 54,-17; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='E'; M= -5, 7,-22, 14, 41,-24,-14, -2,-24, 5,-19,-17, 2, -2, 14, -2, 7, -3,-22,-28,-17, 27; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='L'; M= -7,-26,-15,-26,-19, 7,-26,-19, 19,-24, 36, 15,-26,-26,-19,-17,-22, -7, 16,-19, -2,-19; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='E'; M= -2, 15,-21, 23, 26,-26,-10, -3,-25, 1,-20,-19, 6, -5, 6, -6, 7, -3,-20,-29,-17, 16; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='L'; M=-10,-26,-19,-29,-21, 20,-28,-19, 19,-26, 30, 14,-22,-24,-21,-19,-22, -9, 10,-12, 5,-21; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='R'; M= -3, -7,-22, -9, 2,-21,-14, -2,-20, 15,-15, -7, -2,-14, 14, 33, -3, -7,-15,-17,-10, 5; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='P'; M= -9,-17, -5,-12, -5,-24,-19,-19,-19,-12,-24,-17,-17, 54,-12,-19, -9, -9,-22,-29,-26,-12; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='V'; M= -1,-20,-14,-23,-20, -4,-23,-22, 22,-18, 4, 6,-16,-20,-18,-18, -2, 1, 27,-25, -8,-20; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='E'; M= 11, 11,-19, 15, 16,-25, -7, -7,-21, -1,-16,-16, 1, -6, 1,-10, 4, -5,-15,-25,-17, 9; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='G'; M= 7, 6,-21, 9, 7,-25, 12,-10,-25, -6,-19,-17, 1, -9, -4,-12, 2, -9,-18,-23,-20, 2; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='N'; M= -9, 14, 6, 3, -3,-20,-10, -4,-22, 7,-24,-15, 22,-18, -3, 2, 0, -4,-20,-31,-17, -3; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='V'; M= -1, -4,-12, 0, -9,-12,-15,-15, 1,-11, -9, -6, -7,-17,-13,-13, 6, 3, 14,-30,-13,-11; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='P'; M=-11,-15,-27,-14, -9, -3, -3,-12,-20, -4,-16,-11, -9, 8,-11, 5, -9,-10,-18,-14,-10,-12; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6; /M: SY='Y'; M= -6,-13,-15,-13,-11, 7,-16, -1, 1,-12, 7, 1,-11,-18, -8,-10, -6, -2, -2, -4, 19,-11; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='P'; M=-10,-13,-25,-10, -3, -8,-15,-11,-14, -2,-16,-10,-11, 32, -7, 2, -8, -7,-17,-16,-12, -7; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='F'; M= -8,-21,-12,-25,-20, 30,-21,-17, 10,-19, 11, 5,-18,-21,-24,-14,-13, -5, 14, -6, 8,-20; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='N'; M= -9, 3,-15, -4, -5, 4, -9, -2,-12, -1,-12, -9, 12,-15, -5, 8, 1, -2,-12,-16, -3, -5; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='S'; M= 2, -4,-15, -2, 2,-18, -6, -7,-14, -5,-20,-12, 1, 11, 4, -7, 15, 6,-13,-25,-15, 2; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='F'; M=-11,-21,-16,-27,-20, 35,-23,-16, 11,-21, 13, 6,-15,-20,-23,-16,-15, -7, 6, -1, 13,-20; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='Q'; M= -7, -9,-20, -9, -2,-14,-16, 5, -6, -3, -9, 0, -8,-14, 13, -2, -7, -8, -7, 0, 0, 6; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='N'; M= -4, 14,-11, 4, -4,-11, -7, -3,-11, -4,-14,-11, 22,-11, -4, -4, 11, 18,-11,-25,-11, -4; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='E'; M= 1, 5,-18, 4, 10,-18, -7, -4,-15, -2,-18,-13, 7, 10, 1, -6, 4, -2,-17,-23,-16, 5; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='T'; M= 7, -1, -7, -6, -5,-10, -9,-12, -9, -7,-11, -9, 1, -7, -5, -8, 17, 25, -2,-22,-10, -5; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='F'; M= -9,-14,-11,-19,-14, 28,-14, -7, 4,-12, 7, 11,-11,-14,-14, -9,-11, -5, 2, 0, 11,-12; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='Q'; M= -6, 2,-19, 3, 18,-23,-14, 0,-16, 9,-14, -6, 0, -5, 23, 5, 1, -1,-17,-17, -9, 20; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='P'; M= 7, -9,-18, -7, -2,-18, -7,-12,-12, -7,-18,-12, -7, 28, -5,-12, 5, 0,-12,-21,-18, -5; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='H'; M=-11, 9,-20, 7, 11,-16,-11, 37,-20, -2,-16, -7, 14,-11, 7, 0, -2, -9,-21,-23, 0, 7; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='G'; M= 9, -7,-18, -9,-12,-20, 37,-14,-23,-12,-18,-12, -2,-12,-12,-14, 2,-11,-16,-14,-20,-12; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='C'; M= -7,-16, 35,-20,-20, -2,-21,-12, -5,-16, -5, -5,-16,-25,-18,-16, -9, -5, 4,-18, 2,-20; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='L'; M= -8,-21,-16,-24,-17, 12,-23,-16, 18,-21, 26, 12,-19,-20,-16,-16,-19, -7, 10,-11, 3,-17; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='C'; M= -5,-16, 62,-21,-21,-11,-21,-21,-10,-20, -9, -9,-16,-27,-21,-20, -7, -5, 4,-32,-18,-21; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='I'; M= -6,-20,-19,-20,-13, -3,-21,-17, 13,-17, 12, 6,-18, 2,-13,-16,-14, -6, 7,-17, -6,-15; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='Y'; M=-14,-15,-20,-16,-15, 26,-21, 10, 0, -9, 1, 0,-14,-21,-10, -8,-14, -7, -6, 19, 52,-15; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='N'; M= 0, 14,-11, 7, 0,-14, 0, 0,-14, -4,-21,-14, 25,-11, 0, -4, 18, 7,-14,-28,-14, 0; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='S'; M= 3, -4, 17, -5, -5,-14, -5,-11,-16,-11,-20,-14, 2,-13, -5,-11, 19, 9, -7,-30,-16, -5; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='K'; M= -9, -5,-21, -6, 1,-17,-16, -7,-13, 24,-15, -4, -2,-10, 4, 23, -8, -7, -9,-14, -6, 1; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='E'; M= 4, 9,-16, 7, 19,-18, -7, -2,-16, 2,-14,-12, 9, -5, 5, -4, 4, -4,-16,-21,-14, 12; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='S'; M= 7, 0, -7, 0, 0,-14, 0, -7,-14, -7,-21,-14, 7, -7, 0, -7, 28, 14, -7,-28,-14, 0; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='L'; M= -9,-21,-14,-23,-16, 20,-21,-14, 11,-21, 28, 11,-20,-21,-18,-14,-20, -7, 5, -9, 5,-16; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='S'; M= 13, -2, -5, -4, -2,-11, 0, -7, -9, -5,-12, -9, 2, -5, -2, -7, 16, 7, -4,-18,-11, -2; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='Y'; M=-10,-16,-16,-17,-16, 20,-20, 1, 5,-11, 3, 2,-15,-20,-13,-10,-12, -5, 5, 8, 33,-16; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='I'; M= -4,-19,-12,-21,-17, 1,-20,-14, 19,-14, 16, 18,-18,-18,-12,-13,-13, -4, 19,-16, -2,-15; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='V'; M= -5,-15,-15,-16,-14, -7,-10,-14, 5, -6, -1, 2,-10,-16,-11, 1, -7, -5, 10,-16, -7,-14; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='E'; M=-10, 5,-26, 11, 33,-24,-17, 17,-26, 11,-19,-12, 2, -5, 14, 4, -3,-10,-24,-24, -8, 23; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='F'; M=-10, -6, 2,-13,-13, 8,-17, 7,-18,-17,-15,-11, 4,-23,-14,-13, 2, -3,-14,-26, 0,-13; /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27, 3,-37,-27, 42,-30, 28, 20,-23,-23,-20,-27,-23,-10, 24,-20, 0,-27; /M: SY='E'; M= -9, -9,-26, -7, 9, -3, -1,-12,-18,-12, -4, -9, -9,-16, -8,-12, -9,-12,-17,-18,-10, 2; /M: SY='K'; M=-12, 0,-30, 0, 8,-28,-20, 10,-30, 39,-28, -8, 2,-12, 10, 25,-10,-12,-22,-22, -5, 8; /M: SY='I'; M= -2,-16,-20,-22,-17, -7,-24,-21, 16,-21, 3, 3, -9,-16,-12,-20, 4, 10, 11,-28, -8,-17; /M: SY='R'; M=-15,-14,-26,-16, -6,-12,-22, -5,-12, 14, -1, 8, -9,-21, 3, 35,-15,-10, -9,-20, -6, -4; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M=-12, 17,-30, 29, 53,-32,-18, 0,-32, 8,-22,-22, 4, -2, 16, -2, 0,-10,-30,-32,-20, 35; /M: SY='S'; M= 13, -8,-17,-12, -4,-20,-11,-13, -5,-10,-14, -7, -2,-12, 5,-13, 14, 4, -4,-28,-15, -1; /M: SY='T'; M= 0, 9,-14, 8, -1,-19,-12,-13,-19, -8,-20,-17, 7,-10, -5,-10, 23, 29, -9,-35,-15, -3; /M: SY='L'; M=-10,-23,-23,-24,-11, -3,-28,-14, 13,-20, 30, 15,-22,-24, 0,-14,-22,-10, 2,-20, -2, -6; /M: SY='L'; M= -5,-21,-24,-24,-21, -7, -1,-22, 6,-25, 11, 4,-15,-23,-18,-22,-12,-10, 1,-22,-11,-21; /M: SY='R'; M= -4,-10,-26,-12, -5,-22, 0, -7,-28, 14,-20,-12, -2,-18, 1, 37, -5,-10,-18,-20,-15, -5; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='R'; M=-13, 4,-26, 8, 5,-25,-15, -4,-30, 21,-25,-15, 5,-15, 6, 34, 1, -5,-20,-27,-14, 4; /M: SY='D'; M=-16, 28,-28, 43, 20,-29,-15, -4,-27, -4,-14,-19, 7,-12, 0,-10, -5,-10,-23,-35,-16, 10; /M: SY='N'; M= -8, 16,-22, 6, 4,-24,-12, 0,-21, 12,-25,-12, 23,-14, 11, 7, 5, 5,-22,-30,-14, 8; /M: SY='Y'; M= -4,-10,-24,-12,-10, 1,-19, 33,-12,-10,-11, -4, -7,-21, -3, -9, -6, -8,-14, -3, 34,-10; /M: SY='L'; M= 1,-24,-18,-28,-18, 2,-22,-15, 15,-21, 32, 25,-24,-24,-13,-18,-20, -8, 8,-20, -4,-16; /M: SY='V'; M= 15,-21,-17,-24,-18,-12,-18,-25, 9,-15, -3, -2,-20, 0,-19,-21, -4, -3, 16,-26,-16,-19; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='N'; M=-12, 28,-23, 14, 2,-22, -6, 29,-22, -1,-27,-14, 44,-19, 8, 1, 5, -5,-30,-36,-11, 4; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22, 8,-32,-22, 25,-30, 45, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 14,-20, 0,-22; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='L'; M= -2,-26,-18,-31,-21, 22,-25,-20, 10,-26, 29, 10,-24,-26,-23,-20,-20, -8, 6,-13, 4,-21; /M: SY='T'; M= 1,-11,-10,-16,-16, -7,-22,-23, 3,-14, -5, -4,-10,-17,-16,-14, 11, 29, 17,-31,-11,-16; /M: SY='L'; M= -8,-30,-18,-30,-22, 8,-30,-22, 22,-28, 43, 18,-30,-30,-22,-20,-26, -8, 17,-22, -2,-22; /M: SY='I'; M= -8,-30,-24,-35,-27, 3,-35,-27, 38,-28, 27, 18,-25,-25,-22,-25,-21, -8, 28,-22, -2,-27; /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22, 23,-30,-20, 16,-30, 43, 16,-28,-30,-24,-20,-28,-10, 8,-15, 5,-22; /M: SY='A'; M= 31,-18,-10,-24,-18,-12,-12,-24, 6,-14, -2, -2,-18,-18,-18,-20, 2, 0, 19,-24,-16,-18; /M: SY='N'; M= -7, 16, 4, 3,-10,-21, 5, -6,-24,-10,-26,-19, 29,-23,-10,-10, 6, 0,-23,-37,-23,-10; /M: SY='K'; M=-13, 5,-32, 10, 12,-34,-18, -4,-28, 19,-27,-13, 0, 7, 17, 12, -6,-10,-26,-25,-15, 13; /M: SY='R'; M=-16,-14,-34,-10, 0,-24,-20, -7,-26, 16,-24,-14, -7, 20, 3, 37,-10,-10,-24,-24,-17, -4; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='G'; M= 9, -6,-13, -8,-10,-15, 27,-11,-17,-10,-13,-10, -2,-10,-10,-11, 2, -8,-12,-11,-15,-10; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='D'; M=-18, 43,-30, 61, 27,-38,-12, 0,-38, 2,-28,-28, 16, -8, 4, -8, 0,-10,-30,-38,-20, 15; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='T'; M= 2, -3,-10, -9, -8,-10,-13,-15, -5,-10,-10, -8, 1, -9, -7,-10, 17, 27, 0,-26,-10, -8; D=-11; /I: I=-11; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23; /M: SY='S'; M= 4, -8,-12,-10, -9,-12, -2,-14, -4,-13,-14, -8, -2,-13, -8,-13, 15, 6, 3,-27,-14, -9; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='G'; M= 1, -7,-20, -5, -6,-21, 18,-13,-23,-11,-25,-16, 0, 7, -8,-13, 11, -1,-18,-25,-21, -8; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='E'; M= -8, 4,-25, 8, 28,-25,-16, -4,-25, 25,-21,-12, 0, -4, 12, 13, -4, -8,-20,-20,-12, 20; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='T'; M= -4, 12,-14, 5, 7,-14,-11, -5,-14, -2,-15,-12, 15, -9, 0, -4, 10, 18,-13,-27,-12, 3; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='L'; M= -1,-21,-20,-25,-15, -3,-21,-13, 6,-12, 21, 17,-19,-23, -9, -2,-17, -8, 3,-20, -5,-13; /M: SY='P'; M=-13, -1,-33, -1, 2,-26,-16, 23,-23, -6,-26,-12, 5, 29, 5, -8, -5,-11,-30,-31,-12, 0; /M: SY='F'; M= -5,-18,-19,-24,-18, 9,-23,-20, 9,-22, 6, 2,-11,-20,-17,-19, -1, 5, 6,-21, -1,-18; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='R'; M=-14,-16,-30,-20, -8,-16,-28,-10, 3, 3, -4, 3, -8,-18, 7, 20,-12,-10, -2,-20, -6, -4; /M: SY='Q'; M=-12, 2,-30, 4, 22,-33,-20, 31,-24, 5,-20, -4, 2,-11, 40, 6, -2,-12,-30,-24, -4, 30; /M: SY='Q'; M=-11, 2,-30, 4, 26,-37,-20, 15,-23, 8,-20, -4, 1, -9, 49, 7, -1,-11,-30,-23, -9, 37; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='Q'; M= 1, -7,-26,-11, 6,-29,-20, -3, -6, -1,-11, 2, -5,-12, 33, -3, -2, -8,-14,-20,-10, 18; /M: SY='Q'; M=-12, 5,-28, 2, 13,-33,-16, 8,-22, 12,-22, -5, 11,-14, 40, 19, 0, -8,-28,-24,-12, 26; /M: SY='L'; M=-12,-26,-22,-30,-22, 13,-30,-20, 15,-17, 17, 9,-21,-26,-20, -6,-19, -8, 14,-16, 2,-22; /M: SY='A'; M= 39,-12, 14,-22,-14,-20, -5,-22,-14,-14,-12,-12,-12,-15,-14,-22, 6, -2, -2,-25,-22,-14; /M: SY='N'; M= -3, 11,-22, 8, 13,-26, 0, -1,-24, -1,-26,-16, 18,-12, 12, -3, 14, 0,-24,-33,-19, 12; /M: SY='K'; M=-10, -7, -5, -7, 1,-28,-22,-15,-28, 25,-28,-14, -7, 3, -1, 10,-10,-10,-20,-27,-17, -1; /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22, 23,-30,-20, 16,-30, 43, 16,-28,-30,-24,-20,-28,-10, 8,-15, 5,-22; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='C'; M= -8,-22, 96,-30,-30,-16,-30,-30,-19,-28,-15,-15,-22,-38,-30,-28,-10, -8, 1,-46,-26,-30; /M: SY='P'; M= 6,-15,-21,-15, -7,-20,-17,-16, -4, -9,-13, -6,-14, 9, -2,-14, 0, -2, 0,-27,-18, -6; /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29, 75,-30,-16, 0,-28, 9, 0,-20,-30,-37,-19,-20,-10, -1, 12, 35,-29; /M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-34,-26, 18,-32,-24, 24,-28, 27, 14,-26,-28,-26,-22,-21, -8, 22,-17, 3,-26; /M: SY='D'; M=-16, 39,-30, 55, 13,-38, 5, -4,-40, -4,-30,-28, 16,-12, -4,-12, 0,-12,-30,-36,-22, 5; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='P'; M= -1,-18,-19,-16,-10, -9,-17,-17, 2,-13, 1, -2,-18, 16,-13,-15,-10, -5, 2,-20,-13,-13; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='A'; M= 18, -4,-11,-10, -2,-17, -7,-10, -9, -4, -9, -6, -4, -8, 5, -8, 7, 7, -5,-17,-11, 2; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='S'; M= 2, -7,-14, -7, -7,-15,-11, 5, -9,-12,-18, -9, 0,-17, -6,-11, 18, 8, 1,-36,-10, -7; /M: SY='P'; M= 5, -9,-24, -8, -3,-23,-12, 4,-19,-10,-22,-13, -5, 23, -5,-14, 6, 0,-18,-30,-15, -6; /M: SY='G'; M= 7, -5,-25, -5, 1,-26, 20, 5,-29,-10,-21,-14, -1,-14, -5,-13, 1,-13,-23,-24,-17, -3; /M: M= -8,-18,-29,-18,-16,-16, -3, -1, -4,-19, -7, -2,-11, -2,-14,-18,-11,-13, -6,-25,-10,-18; /M: SY='G'; M= -7, -2,-28, -2, 4,-28, 15, 10,-30, -7,-23,-12, 2,-14, 7, -7, 0,-10,-27,-24,-14, 4; /M: SY='Y'; M= 0, -9,-24,-11, -4, -8,-17, 2,-13, 3,-14, -6, -7,-17, 7, -2, -1, -4,-13, -5, 18, 0; /M: SY='R'; M= -9, -8,-28, -8, -3,-26, 2, -8,-27, 4,-22,-12, -2, -6, 7, 16, -2, -4,-23,-22,-17, 0; /M: SY='R'; M=-14,-10,-25,-12, -2, -6,-19, -3,-21, 10,-16, -8, -2,-19, 9, 32, -3, -6,-17,-17, -4, 2; /M: SY='K'; M= -9, 9,-25, 4, 6,-26,-12, 0,-24, 19,-27,-12, 16,-14, 15, 19, 4, -3,-23,-28,-14, 10; /M: SY='I'; M= -6,-19,-23,-25,-16, -3,-27,-18, 18,-18, 2, 6,-12,-18, -5,-17, -5, -4, 11,-22, -3,-12; /M: SY='N'; M=-12, 23,-26, 20, 12,-32,-11, 5,-25, 10,-27,-14, 25,-14, 21, 6, 2, -6,-29,-31,-15, 16; /M: SY='E'; M=-11, 8,-30, 14, 34,-29,-22, -3,-18, 3,-15,-12, 0, -6, 19, -4, -3,-10,-21,-28,-15, 25; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='R'; M=-14, -6,-25, -8, -1,-19,-20, -6,-25, 23,-19,-10, 0,-16, 5, 44, -3, 5,-15,-22,-10, -1; /M: SY='Q'; M= -1, -1,-26, -2, 0,-25,-20, -9, -2, -7, -9, -1, -4,-13, 13,-11, -4, -8, -7,-24,-11, 5; /M: SY='I'; M=-10,-30,-22,-35,-27, 18,-34,-25, 28,-29, 27, 15,-25,-26,-25,-24,-22, -9, 21,-16, 4,-27; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='S'; M= 0, 1,-13, -4, -4,-13, -8, -7,-10, -1,-14, -2, 6,-11, -1, -3, 13, 13, -7,-26,-11, -2; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='Q'; M= -8,-10, -3,-11, -7,-14, -4, -4,-15, -9,-10, -5, -8,-19, 5, -8, -7,-10,-16,-13, 0, -2; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='L'; M= -2,-22, 5,-27,-22, -7,-12,-21, 2,-24, 11, 7,-20,-27,-20,-22,-15,-10, 4,-26,-13,-21; /M: SY='L'; M=-10,-29,-18,-32,-24, 19,-29,-19, 18,-25, 31, 20,-27,-29,-23,-19,-23, -8, 15,-16, 4,-22; /M: SY='R'; M= -8,-16, -4,-18,-14,-15, -8,-18,-14, -2, -6, -5,-13,-24,-12, 3,-12,-10, -5,-26,-15,-14; /M: SY='G'; M= 8, -5,-21, -7, -6,-28, 24,-12,-26,-10,-25,-15, 1,-14, 2,-12, 13, -4,-20,-26,-22, -2; /M: SY='D'; M= -9, 1,-21, 2, 1,-12,-20,-11, -2,-11, 2, -4, -1,-20, -9,-11, -8, -6, 0,-31,-13, -4; /M: SY='H'; M= -7,-13,-21,-13, -9, -9,-20, 4, -6,-17, 3, -1,-10, -5, -8,-13, -4, 3, -8,-28, -6,-10; /M: SY='E'; M=-12, 6,-25, 14, 23,-12,-21, -8,-17, -3,-13,-14, -4,-12, -2, -9, -5, -8,-11,-27,-11, 11; /M: SY='S'; M= -2, -6, 8,-13,-13,-13,-16,-15, -5,-18,-11, -9, 2,-21,-11,-17, 9, 3, -4,-36,-16,-13; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='R'; M=-15,-13,-26,-15, -6, -5,-23,-10,-17, 19,-14, -6, -7,-20, -3, 34,-11, -9, -7,-17, -4, -6; /M: SY='R'; M=-19, 2,-30, 7, 12,-24,-19, 10,-31, 19,-21,-13, 4,-16, 10, 41, -7,-11,-24,-25,-10, 7; /M: SY='N'; M=-10, 27,-21, 20, 3,-23, -5, 21,-25, -4,-28,-18, 36,-17, 2, -3, 10, -1,-26,-38,-13, 1; /M: SY='L'; M=-10,-17,-26,-16, 4, -6,-29,-16, 11,-17, 20, 7,-18,-18, -7,-16,-18,-10, 2,-23, -7, -3; /M: SY='G'; M= 3, -3,-21, -5,-13,-17, 9,-15,-12,-15, -9, -9, 0,-21,-15,-16, -3, -8, -6,-27,-18,-14; /M: SY='M'; M= -5,-22,-21,-25,-21, -5, -9,-18, 11,-22, 14, 15,-17,-23,-15,-19,-12, -8, 8,-23, -8,-19; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
| PROMOTED_BY | PS51853 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 8 in 8 different sequences |
| Number of true positive hits | 8 in 8 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | pG1 pseudoGTPase |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
8 sequences
RG190_DROME (Q9VX32), RHG05_HUMAN (Q13017), RHG05_MOUSE (P97393), RHG35_CANLF (P83509), RHG35_HUMAN (Q9NRY4), RHG35_MOUSE (Q91YM2), RHG35_RAT (P81128), RHG35_XENLA (Q6NU25)» more
|
| PDB [Detailed view] |
2 PDB
5U4U; 5U4V |