PROSITE entry PS51980

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	OCEL
Accession [info]	PS51980
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	23-FEB-2022 CREATED; 23-FEB-2022 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51980
Associated ProRule [info]	PRU01324

Name and characterization of the entry

Description [info]

Occludin/ELL (OCEL) domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=110;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=105;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.0077865; R2=0.0053106; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1317; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=658; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-22; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;

...

                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-380; BD=-380;
/M: SY='P';  M=  4,  3, 19, 11,-34,-68,-34,-26, 17,-57,-29,-19, 76,-23,  4, -9, -3,-30,-80,-36;
/M: SY='D';  M=-29,-34, 89, 26,-58,-43, -9,-52, -7,-42,-71, -2,-56,-26,-43, -1,-15,-27,-86,  2;
/M: SY='W';  M=-39,-48,-11,-16, 36,-44,-40,-18,-30,  0,-36,-13,-39,-29,-40,-25,-33,-61, 92, 89;
/M: SY='L';  M= -7,-17, 25, 12,  5,-51,  4, -1,-41, 27,-16,-38, 26,-61,-36,  5,-11,  9,-76,-10;
/M: SY='R';  M= -1,-28, -4,  4,-69,-32,-63,-26,  9,  1,-15,-40, -5,-17, 43, 31, 14,  3,-25,-65;
/M: SY='K';  M=-50, -6, -9, 29,-68,-55,-28,-49, 53, 10, -3,  2,-38, 34, 10,  5,-10,-29,-76,-18;
/M: SY='Y';  M=-42,-79,-20,-70, 53,-61,-14,-44,-24,-33,-52,-55,-54,-64,-10,-66,-32,-22,-38,112;
/M: SY='P';  M=-22,-35,-53,-34,-29, 25,-20,-29,-26,-66,-66,-29, 88,-62,-12,  2, 31,-20,-79,-72;
/M: SY='P';  M= 19,-75, -4, 27,-76,-67,-44,-53, 17,-62,-29,-27, 68, -8,  3,-27, 28,  4,-81,-71;
/M: SY='I';  M=-34,-77,-84,-82,-37,-72,-84, 99,-78,-24,-38,-50,-23,-75,-81,-49,-58, 14,-16,-42;
/M: SY='T';  M=-11, 12,-36, -9,-48,-41, -8,-37, 29,-28,-34,-21,-46,  6, 40, 17, 57,-23,-80,-47;
/M: SY='S';  M=-40,  8, 27,-32,-50,-56,-59,-71,-57,-63,-69, 35,-43,-42,-52, 81, 40,-47,-37,-50;
/M: SY='D';  M=  0,-46, 35, 11, -2,-26, 22,-27,-13,-10, 11,-20,  6,-22,-19, 15, -1,  8, -1,  6;
/M: SY='E';  M= -7,-77, 36, 78,-79,-28,-23,-51,-22,-39,-68,-35,-48, 23, -2, 12,-14,-71, -8,-69;
/M: SY='Q';  M=-32,-47, -8, 58,-85,-49,-52,-64,-21,-61,-35,-52,-64,107,-39,-31,-19,-75,-76,-65;
/M: SY='R';  M=  7, 10,-65,-29,-39,-56, -3,-71,-10,-49,-40,-32,-76,-36, 91,-60,-63,-28,-66, 53;
/M: SY='Q';  M=-14,-18, -1, 43,-47,-69, -4,-46, 23,-21,-33,  4,-67, 60, 40, -5, -9,-44,-79,-64;
/M: SY='R';  M=  6,-27,-17, 26,-77,-32,-56,-51, 29,-36,-34, -1,-68, 51, 57,  8,-18,-50,-78,-66;
/M: SY='Y';  M=-71,-82,-71,-73, -8,-78,-39,-56,-66,-18,-49,-72,-83,-26,-63,-55,-47,-61,-30,130;
/M: SY='K';  M=-28,-31,-59,  0,-28,-60, -6,-46, 83,-54,-22,-54,-68,-29, 44,-47,-33,-18,-71,  7;
/M: SY='Q';  M= 35,-18,  5, 14,-74,-34,-29,-67, 25,-27,-17, 15,-67, 35, 24,  2,  6,-20,-79,-50;
/M: SY='E';  M=-22,-77, 62, 63,-52,-73,-60,  8,-22,-21,-21,-39,-66, -4,-21,-43,-20, 19,-84,-67;
/M: SY='F';  M=-75,-73,-86,-82,116,-82,-64,-50,-77,-34,-51,-77,-86,-85,-75,-55,-67,-40, -4, 45;
/M: SY='N';  M=-19, 11, 46, 27,-75,-53,-23,-39, -6,-55,-35, 75,-42, 30,-14,-11,-10,-72,-27,-13;
/M: SY='D';  M= 32,-18, 38, 31,-61,-30,-30,-52, 17,-54,-35, -6,-66, 13, 29, 11, -3,-36,-81,-68;
/M: SY='D';  M=-62,-34, 61, 53,-78,-35,-20,-64, 28,-25,-67,  5,-40, 54,-22,-37,-22,-51,-16,-45;
/M: SY='Y';  M=-71,-80,-71,-72, 18,-78, 59,-55,-67,  4,-32,-69,-82,-62,-63,-67,-66,-46,-36,120;
/M: SY='P';  M= 24,-76, 19, 15,-61, -3,  2,-49,  6,-58,-36,-18, 57, 23, -9, 15,-10,-39,-31,-69;
/M: SY='E';  M=-48,  4,-25, 91,-78,-43,-22,-38, -3,-38,-67,-38,-41, -1, 17,-28,-16,-31,-80,-70;
/M: SY='Y';  M=-71,-82,-71,-73,  1,-78,-18,-56,-45,-45,-50,-72,-83,-61,-62,-67,-66,-47,-29,131;
/M: SY='R';  M=-26, -3,-62,-17,-38,-57,  8,-32, 47,  7, 27,-27,-71, 31, 63,-13,-21,-48,-76,-61;
/M: SY='E';  M=  1,-75, 23, 48,-37,-24,-13,-51, 17,-43,-29,  2,-37, 21, 39,  7, -1,-56,-77,-18;
/M: SY='L';  M=-42, 30,-82,-76,-43,-84,-28,-21,-76, 83, 11,-80,-83,-70,-74,-73,-26,-16,-72,-22;
/M: SY='H';  M=-58, 33,  7,-55,-13,-56,107,-31,-13,-20,-55, -1,-73, 33,-34,-33,-50,-70,-18, 63;
/M: SY='A';  M= 51,-36, 10, 21,-76,-25,  0,-36, 29,-65,-64, 19,-66, 18,  3,  6,-11,-37,-80,-67;
/M: SY='E';  M=-41,-39,  2, 54,-53,-72,  8,-14, 26,-33,-12, -3,-43, 34, 46,-29,-15,-30,-19, -7;
/M: SY='L';  M=-61,-48,-82,-76,-16,-84,-72, 47,-42, 50, 50,-76,-78,-36,-73,-48,-25, 47,-74,-20;
/M: SY='D';  M= -7,-76, 56, 49,-78,-14, -9,-64,-10,-38,-33,  1,-65, 41, 11, 10, -7,-46,-82,-42;
/M: SY='K';  M= 26,-29, 31, 18,-76,  5,-39,-58, 35,-32,-65, -2,-26, 17, -1, 22, -6,-39,-80,-68;
/M: SY='V';  M=  7,-70,-53,-32,-23,-76,-39, 54,-49,-13,  9,  1,-74,-52,-53,-50,  0, 61,-10, -5;
/M: SY='S';  M= 28, -7,-61,-29,-52,-45,-24,-36, -7,-22,-13, 15,-68, -7, 33, 47, 28,-12, 34,-63;
/M: SY='Q';  M=  6,-41, 21,  8,-51,-17,-16,-48, 34,-53,-29, 33,-67, 44, 39,  7, -6,-48,-79,-65;
/I:         I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106;
/M: SY='K';  M=-53,-79, 18, 33,-45,-37, 12,-34, 53,-46,-12,-34,-30, 43, 45,-18, -8,-70,-77,-42;
/M: SY='F';  M=-58,-71,-86,-65,108,-60,-68,-12,-78, 18, 18,-77,-84,-83,-75,-74,-65,-13,-48,-18;
/M: SY='E';  M= 15,-40, -4, 24,-54,-41, 18,  3, 12,-13, 23,  0,-54, 13, 17, 15, 10,-20,-80,-63;
/M: SY='Q';  M=-25,-77, 25, 52,-48,-18, -2,-62, 30,-72,-28,-10,-64, 61,  3, -4, -1,-29,-78,-25;
/M: SY='L';  M=-51,-70,-83,-76, -2,-84,-29,-34,-57, 81, 40,-81,-82,-69,-73,-59,-63, -9, 10,  3;
/M: SY='D';  M=-21,-78, 54, 46,-60, 18,  5,-80, 22,-77,-70,  3,-51, 41,-12,  6,-49,-67,-80,-18;
/M: SY='E';  M= 35,-73, -5, 44,-75,-52,-25,-43, 17,-70, -9,  2,-66,  4, 38, 21,-13,-29, -8,-67;
/M: SY='Q';  M=-35,-78, 18, 54,-75,-70,-12,-36, 16,-14, 16,-28,-48, 69, 19, -3,-25,-42,-78,-64;
/M: SY='L';  M=-57,-32,-52,-73,  9,-82,-66, 18,-29, 68, 59,-76,-80,-21,-25,-41,-62,-35, 13, -3;
/M: SY='D';  M=-26,-75, 42, 13,-45,-49, -3,-55, 40,-23,-34, 32,-68, 22, 35, 12,-21,-43,-31,-36;
/M: SY='Q';  M= -7,-35,-19, 18,-19,-18, -7,-53, 26,-28,-30, 15,-68, 42, 39, 20, 11,-34,-77,-40;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-70; IM=0; DM=-70;
/M: SY='L';  M= 10, 13,-69, -6, -4,-74, 10,-26,  4, 44,-18,-47,-37,-29, -4,-20,  3,  8,-25, 10;
/M: SY='P';  M=-28,-76, -3, 16,-77,-18,-13,-54,  6,-52,-42,  3, 60, 24, 22, 36, 12,-33,-81,-69;
/M: SY='P';  M=-28,-39, 14, 48,-79,-29,  2,-57, 29,-45,-66, -6, 49, 32, 33,-13,-48,-63,-79,-53;
/M: SY='G';  M=-19,-77, 46,  7,-82, 67, 18,-82, -5,-80,-42, 13,  1,-19,-22,-31,-35,-55,-82,-71;
/M: SY='S';  M=-33,-25,-16,-12,-50,-32,-15,-45,-10,-49, -9, 14,-13,-34,  3, 74, 36,-32,-82,-44;
/M: SY='E';  M=-17,-14, 16, 45,-46,-55, -6,-43, 31,-30,  0,-13, 34, 14,  9, 13,-14,-34,-80,-51;
/M: SY='E';  M=  2,-77, 20, 69,-81,-31, -6,-68, 11,-67,-68, -3,-63, 46, 16, 10,-39,-63,-31,-68;
/M: SY='Y';  M= -7,-30,-32,-13, 13,-62, 62,-26,  3,-51,-35,-48,-53, 15,  5,-62,-47,-40, 46, 91;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='Q';  M=-17,-95,-38, 26,-92,-57, -8,-93, 37,-69,-40,-40,-46, 39, -8,-35,-28,-89,-33,-22; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='Q';  M=-17,-44,-16, 23,-85,-56,-36,-30, 11,-50, -2,-23,-78, 36, 22, -1,  5,-52,-90,-40; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='I';  M=-25,-51,-39,-50,-27,-90,-35, 54,-60, 23, 16,-80,-85,-48, -8,-38,-33, 13,-31,-41; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='E';  M=  8,-24,-23, 32,-78,-39, 16,-21,  4,-14, -1,-23,-75, 25,  3, -7,-15,-30,-87,-46; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='K';  M=  5,-48, 18, 17,-59,-50, -6,-43, 45,-40,-11, 32,-71, 27, 10,-10,-26,-57,-81,-20; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='Q';  M= -2,-80, -3, 19,-61,-45,-26,-36, 28,-45,-35,  9,-70, 72, 28, -7,-19,-72,-33,-43; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='I';  M=-20,-35,-84,-54,-39,-86,-82, 79,-65, 12,-28,-47,-50,-75,-40,-59,-60, 43,-79,-43; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='Q';  M= -3,  7,-37,-14,  7,-77, -6, -6,-17, 22,  6,-20,-50, 27, 14,-45,-15, 11, 24,  5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='Q';  M= -7,-44, 14, 38,-54,-63, -4,-51,  8,-33,-19, 12,-70, 53, 36,-11,-10,-51,-82,-36; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='E';  M=-22,-80,  1, 70,-31,-75,-23,-37, 26,-14,-65,-23,-67, 14, 24,-25,-20,-51,-79,-37; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='Y';  M=-74,-25,-63,-78, 48,-83,-18,-10,-60,  5,-50,-76,-52,-69,-39,-71,-47,-42, -6,108; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='N';  M=-25,-79,  7, 23,-34,-57, 27,-57, 27,-36,-10, 41,-71, 32, 37, -9,-15,-73,  2,-17; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='K';  M=-23,-21,  5, 28,-58,-44, 37,-62, 55,-50,-67, -9,-70, 24, 44,-24,-40,-54,-82,-66; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='Y';  M=-66, 22,-55,-44, 10,-79,-31, 28, 16, 10, 26, -1,-78,-12,-18,-22,-13, 15,-16, 41; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='K';  M=-51,-80,-44, -5,-73,-56,-11,-64, 68,-43,-34, -5,-70, 46, 40, -3,-19,-43,-17,  6;
/M: SY='K';  M=-11,-41, -9,  1,-77,-38, 17,-74, 49,-46,-17, 29,-14, 32, 29, -3,  6,-40,-81,-42;
/M: SY='D';  M=-32,-27, 71, 11,-59,-71,-33,-22,-17, -7,-46, -2,-20, -4, -2,  4, -2,  4,-89,-68;
/I:         I=-24; MI=0; MD=-60; IM=0; DM=-60;
/M: SY='P';  M=-15,-34,-41,-27,-44,-52,-29,-31, -2,-46,-40,-75, 67, 13,-15, -8,-29,-36, -9,-42; D=-24;
/I:         I=-24; DM=-60;
/M: SY='E';  M=-27,-85, 15, 26,-56, -6,-23,-84, 19,-84,-77, 18,-36, 12, 11,  4, -5,-34,-90,-47; D=-24;
/I:         I=-24; DM=-60;
/M: SY='Y';  M=-36,-39,-29,-60, 63,-80, 47,-26,-54,-16,  6,-70,-30,-47, -7,-41,-30,-15, 10, 79;
/M: SY='Q';  M=-39, -3,-27, -8,-22,-48,  4, -8, 13, 15, 24,-20,-38, 50, 23,  4,-37,-15,-11,-42;
/M: SY='E';  M=-12, -7, -7, 49,-56,-31,-17,-37, 21,-36,-43, -9,-36, 33, 35, -9, -1,-62,-80,-30;
/M: SY='M';  M=-23,  3, 11, 15,-27,-32,-62,-46, 39,  1, 48,-10,-71, 20,  4,-21,  7,-47,-19,-50;
/M: SY='K';  M=-54,-82,-43,  7,-55,-58,-25,-44, 61,-42,-41,-57,-37, 46, 53,-17,-14,-53,-19,-11;
/M: SY='Q';  M= -8,-50,-29, 13,-21,-49,-27,-20, 43,-44,-64, -4,-25, 50, 42,-21,-10,-31,-79,-66;
/M: SY='R';  M=-34,-41,-44,  9,-56,-52,-60,-26, 23,-54,-36,-23,-50,  2, 83,-52,-25, -4,-31,-26;
/M: SY='C';  M=-30, 87,-78,-58, 60,-37, 40,-59,-73,  9,-33,-49,-85,-24,-33,-23,-52,-21,  9, 32;
/M: SY='E';  M=-23,-78, 22, 23,-25,-40, 10,-22, 10, -6,-27,  9,-15, 16, 16,  1,  2,-23,  1,-52;
/M: SY='Y';  M=-21,-79, 20, -3,  1,-57,-25,-22,-31, -9,-57,-23,-40, -8, -7,-10, -6,  3,-59, 80;
/M: SY='L';  M=-48,-21,-86,-64,-26,-87,-38,-10,-79, 78, 35,-83,-62,-73,-56,-77,-34,-16,-76,-57;
/M: SY='H';  M=-43,-82,-33,-28,-29,-74,118,-79, 14,-53,-60,-52,-52, -8, 29,-19,-30,-40,-87,  3;
/M: SY='N';  M= 15,-15,  1, 24,-22,-16, 27,-43,-20,-37,-25, 28,-40, 14, -4, 17,-17,-20,-81, -9;
/M: SY='K';  M=-44,-42,-39, 41,-26,-59,-62,-48, 82,-43,-68,-26,-68,-28,  7,-25,-38,-51,-78,-68;
/M: SY='L';  M=-59,-74,-86,-78,-37,-57,-34,-31,-65, 80,  1,-84,-43,-44,-44,-78,-51,-15,-76,-38;
/M: SY='S';  M= 19,-23,-20,  0,-30,-11,-65,-35, 12,-39,-36, -6,-71, 20, 12, 39, 10,-32,-33,-69;
/M: SY='H';  M=-22,-40,-65,-37,-21,-76,108, -8,-25,-13,-21,-27,-35,-16,-15, -8,-12, -6,-87, -2;
/M: SY='I';  M=-46,-23,-86,-49,-27,-75,-81, 80,-62, 33,-12,-50,-81,-76,-49,-58,-33, -7,-24,-42;
/M: SY='K';  M=-38,-19,-40,-29,-61,-36,-26,-51, 91,-43,-45,-38,-49,-29, 17,-41,-63,-64,-78,-69;
/M: SY='Q';  M= -3,-80,-15,-11,-77,-53,-14,-37, 34,-31,-25,  2,-34, 54, 40,  1, -6,-58,-32,-22;
/M: SY='R';  M= -7,-11,-77,-54,-34,-62, -6,-22,-32, 43, 42,-71,-30, 15, 49,-32,-66,-37,-24,-40;
/M: SY='I';  M=-41,-39,-85,-48,-21,-49,-83, 66,-62, 11,-28,-58,-30,-52,-15,-54,-62, 47,-22,-62;
/M: SY='Q';  M=  6,-44, -8,  6,-22,-12,  2,-14, 20,-15,-28, -9,-74, 28, 12,  1, -9,-18,-81,-44;
/M: SY='E';  M= -4,-43, 51, 55,-36,-58,-20,-32,-12,-56,-48, 11,-70,  1,-18,  3,-30,-40,-89,-72;
/M: SY='Y';  M=-37,-42,-50,-30, 67,-65,-59,-42,-74,-46,-59,-79,-43,-73,-51,-47,-57,-57, 81, 93;
/M: SY='D';  M=  6,-81, 79, 12,-81,-48,-23,-52,-25,-36,-73,-15,-55,-12,-28,-22,-17, -9,-93,-32;
/M: SY='Q';  M=  9,-53, -9, 16,-36,-38, -2,-60, 23,-34,-68,-20,-19, 45, 32,  3,-17,-58,-83,-70;
/M: SY='S';  M=-12,-48, -5,  1,-76, -9,  0,-74, 14,-13,-29,  2,-75, 17, 21, 26, -2,-37,-32,-14;
/M: SY='H';  M=-28, 11,-39,-17,-22,-41, 42,-31,-22,-22, 20, 17,-21, 33, 12,-17, -9,-19,  0, 15;
/M: SY='S';  M=-15,-50,-15, -5,-38,  5, -8,-38,-11,-17,  8,  5,-24,-30,  7, 19,  2,-23,-85,-16;
/I:         E1=0; IE=-380; DE=-380;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_02 which contains 571'282 sequence entries.

Total number of hits	22 in 22 different sequences
Number of true positive hits	22 in 22 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	OCEL
Version [info]	1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

22 sequences

ELL2_HUMAN  (O00472), ELL2_MOUSE  (Q3UKU1), ELL3_BOVIN  (F1MGG3),

ELL3_HUMAN  (Q9HB65), ELL3_MOUSE  (Q80VR2), ELL3_RAT(Q5XFX8), 
ELL_DROME   (Q9VW51), ELL_HUMAN   (P55199), ELL_MOUSE   (O08856), 
MALD2_HUMAN (Q8N4S9), MALD2_MOUSE (Q3UZP0), MALD2_XENTR (Q0IHQ3), 
OCEL1_HUMAN (Q9H607), OCEL1_MOUSE (Q8VCR9), OCLN_CANLF  (Q28269), 
OCLN_CHICK  (Q91049), OCLN_HUMAN  (Q16625), OCLN_MOUSE  (Q61146), 
OCLN_PONAB  (Q5RFS5), OCLN_POTTR  (Q28793), OCLN_RAT(Q6P6T5), 
OCLN_XENLA  (Q9PUN1)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

9 PDB

1WPA; 1XAW; 3G7C; 5JW9; 5N7H; 5N7I; 5N7K; 7OKX; 7OKY