PROSITE entry PS52007
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | PADR1 |
| Accession [info] | PS52007 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
PADR1 domain profile.
CREATED;
DATA UPDATE; INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC52007 |
| Associated ProRule [info] | PRU01351 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | PADR1 domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=136; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=131; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0736284; R2=0.0120261; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=784; N_SCORE=11.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=369; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='K'; M= -9, -9,-23,-11, -4,-14,-23,-14,-12, 13, -2, -1, -9,-16, -3, 10, -9, 3, -7,-22, -7, -4; /M: SY='S'; M= 1, -1,-20, -1, 2,-25, 0,-11,-26, 12,-30,-16, 5,-11, 2, 5, 16, 4,-16,-30,-17, 2; /M: SY='D'; M=-11, 16,-30, 26, 26,-33, 2, -5,-35, 5,-26,-22, 6, -8, 5, -4, -1,-12,-29,-30,-21, 15; /M: SY='T'; M= 5, 3,-19, 0, 0,-22,-15,-15,-20, 10,-19,-12, 0,-10, -3, 1, 6, 14,-10,-26,-13, -1; /M: SY='D'; M=-12, 16,-25, 17, 13,-20,-15, -3,-18, 1,-11,-12, 14,-15, 1, -3, -5, -7,-20,-31,-15, 7; /M: SY='E'; M=-10, 4,-30, 8, 32,-32,-20, -2,-28, 26,-24,-12, 0, -6, 25, 14, -4,-10,-26,-24,-14, 28; /M: SY='E'; M=-10, 5,-30, 14, 30,-26,-17, -4,-26, 1,-23,-20, -2, 15, 7, -7, 1, -7,-26,-28,-15, 17; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='S'; M= -4, 5,-19, 8, 9,-22,-15,-11,-17, 2,-20,-14, 1,-12, -1, -4, 10, 6, -7,-33,-16, 4; /M: SY='K'; M=-10, -8,-28, -8, 7,-20,-24,-10,-11, 15, -6, -1, -8,-14, 10, 8,-12,-10,-12,-21, -8, 8; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M=-10, 5,-30, 10, 38,-32,-20, -2,-28, 23,-23,-14, 0, -5, 23, 11, -3,-10,-27,-25,-15, 30; /M: SY='K'; M=-10, -2,-29, -1, 13,-29,-21, -5,-23, 31,-20, -6, -3,-11, 20, 19, -9,-10,-20,-21,-10, 17; /M: SY='R'; M= -4, -2,-26, -4, 7,-22,-16, -6,-23, 21,-18,-10, 1,-14, 6, 27, -5, -8,-17,-23,-13, 5; /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20, 6,-26,-12, 20,-22, 38, 36,-26,-26,-12,-16,-26,-10, 10,-20, 0,-16; /M: SY='K'; M= -3, 0,-28, 0, 14,-29,-18,-10,-28, 38,-27,-11, -1, -9, 9, 21, -7, -9,-19,-21,-12, 11; /M: SY='E'; M= 4, 13,-25, 18, 23,-30,-12, -7,-27, 8,-21,-18, 2, -7, 5, -3, 1, -7,-20,-28,-18, 14; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='N'; M= 0, 13,-15, 5, 1,-21, -6, -3,-18, -5,-25,-16, 23,-13, 5, -5, 22, 16,-17,-36,-17, 3; /M: SY='D'; M=-15, 29,-30, 41, 23,-36,-15, -2,-35, 14,-28,-22, 11, -9, 10, 2, -2,-10,-28,-32,-17, 17; /M: SY='L'; M= 8,-15,-17,-18, -6, -6,-19,-18, 1,-16, 15, 2,-16,-18,-11,-16, -7, 2, 1,-23,-10, -8; /M: SY='L'; M=-12,-27,-25,-30,-23, 13,-33,-12, 22,-24, 27, 14,-25,-27,-18,-20,-24,-10, 11, -6, 22,-23; /M: SY='W'; M=-20,-36,-43,-38,-29, 24,-23,-23,-14,-20,-13,-14,-34,-30,-22,-19,-34,-24,-23,113, 36,-22; /M: SY='E'; M= -6, 10,-26, 10, 11,-26, -7, 2,-28, 11,-24,-16, 11,-13, 4, 11, -1, -9,-23,-28,-15, 6; /M: SY='I'; M=-13,-28,-26,-34,-26, 21,-34,-18, 26,-27, 23, 14,-23,-26,-22,-22,-23,-10, 13, -7, 18,-26; /M: SY='R'; M=-14, -4,-30, -4, 6,-26,-20, -6,-30, 41,-26,-10, 0,-14, 10, 48,-10,-10,-20,-20,-10, 6; /M: SY='D'; M=-18, 42,-30, 59, 20,-40,-12, 2,-37, 2,-28,-25, 17,-10, 9, -7, 0,-10,-30,-37,-18, 15; /M: SY='D'; M=-12, 11,-30, 18, 18,-28,-12, -8,-21, 6,-19,-15, 3,-10, 3, -4, -5,-11,-19,-28,-16, 9; /M: SY='L'; M=-12,-30,-22,-33,-23, 19,-32,-22, 22,-30, 39, 17,-27,-28,-23,-22,-27,-10, 12,-15, 5,-23; /M: SY='K'; M=-10, 2,-30, 3, 18,-30,-20, -8,-30, 44,-28,-12, 0, -8, 12, 25, -8,-10,-22,-22,-12, 15; /M: SY='K'; M= -8, 5,-24, 1, 4,-24,-14, -6,-25, 26,-27,-13, 11,-13, 5, 23, 2, 0,-19,-26,-13, 4; /M: SY='M'; M= -7,-16,-22,-19,-13, 1,-23, 7, -1, -5, 2, 11,-14,-22, -8, -6,-14, -9, 0,-15, 10,-12; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='C'; M= -6,-24, 21,-27,-24,-10,-27,-23, 3,-20, -3, 5,-24,-12,-22,-21,-12, -6, 14,-34,-17,-24; /M: SY='S'; M= -2, -3,-19, -4, -2,-14,-13, -6,-18, 7,-23,-13, 1,-13, 0, 1, 14, 10,-12,-22, 0, -2; /M: SY='T'; M= 2, -3,-17, -9, -5,-17,-17,-17,-12, 5,-16, -9, -1,-11, -4, -1, 10, 21, -4,-27,-11, -5; /M: SY='N'; M= 7, 17,-19, 11, 2,-25, -5, -5,-22, 4,-24,-17, 19,-13, -1, -3, 9, -1,-18,-31,-18, 0; /M: SY='D'; M=-15, 26,-30, 39, 34,-35,-15, -2,-35, 12,-26,-23, 9, -6, 9, 0, -2,-10,-28,-33,-18, 22; /M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-33,-23, 6,-32,-22, 30,-28, 38, 23,-26,-26,-18,-22,-26,-10, 16,-20, 0,-22; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='R'; M=-13, 2,-25, 4, 3,-21,-17, -6,-18, 19,-17, -8, 1,-12, 3, 23, -8, -8,-13,-20, -9, 1; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='E'; M= -8, 7,-26, 11, 28,-24,-18, -6,-15, -1,-17,-14, 4, -7, 7, -7, 4, -5,-17,-31,-17, 17; /M: SY='L'; M=-10,-27,-23,-33,-23, 5,-30,-17, 28,-24, 34, 31,-25,-25,-14,-20,-25,-10, 15,-20, 0,-20; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='E'; M= -9, -7,-28, -7, 10,-19,-23,-11, -6, 6,-11, -5, -5,-12, 3, 6, -4, -7, -7,-25,-11, 4; /M: SY='F'; M= 5,-18,-17,-22, -9, 16,-20,-18, -2,-17, 4, -3,-16,-19,-18,-17, -8, -6, 2,-13, -1,-12; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='E'; M= -7, 8,-27, 7, 18,-28, -1, -4,-28, 12,-26,-16, 11,-10, 10, 4, 2, -8,-26,-28,-18, 14; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='D'; M=-13, 22,-27, 32, 21,-36,-13, 3,-28, 4,-24,-16, 9, -9, 24, -1, 2, -8,-27,-29,-15, 22; D=-12; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='I'; M= -3,-12,-13,-12, -9, -6,-14,-13, 8,-10, -2, 0,-10, 7, -9,-11, -4, -2, 6,-15, -8,-11; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='V'; M= -3,-17,-20,-20,-19,-12,-11,-24, 3,-17, -6, -3,-14, -5,-19,-18, -1, 8, 10,-27,-15,-20; /M: SY='P'; M= -5, -6,-23, -5, -2,-21,-14, 4,-21, -5,-24,-14, -1, 13, -1, -1, 10, 7,-18,-32,-13, -4; /M: SY='G'; M= -3, 3,-27, 8, -2,-30, 37,-13,-36,-12,-29,-22, 5,-15, -9,-15, 6,-12,-27,-27,-26, -5; /M: SY='P'; M= -7, 1,-31, 9, 7,-30, 7,-13,-30, -8,-29,-22, -2, 20, -5,-14, 2, -9,-28,-30,-26, -1; /M: SY='E'; M= -5, 9,-20, 7, 21,-20,-16, -7,-20, 0,-18,-16, 8, -7, 5, -5, 12, 17,-17,-32,-16, 13; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='E'; M= 1, 1,-19, 3, 8,-18,-11, -7,-16, 0,-10,-10, -1,-11, 1, 3, 2, -3,-12,-24,-13, 4; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='H'; M= -4, 8,-27, 7, 6,-28,-13, 12,-24, 6,-24,-12, 8, -1, 10, 0, -2, -9,-24,-28,-12, 7; /M: SY='I'; M= -7,-30,-20,-33,-26, 4,-33,-26, 31,-27, 31, 17,-27,-27,-23,-23,-22, -7, 27,-23, -3,-26; /M: SY='L'; M=-12,-28,-21,-31,-22, 15,-30,-21, 17,-21, 25, 12,-23,-27,-21,-11,-22, -9, 13,-16, 2,-22; /M: SY='D'; M=-18, 44,-30, 62, 26,-38,-12, 0,-38, 2,-28,-28, 17, -8, 3, -8, 0,-10,-30,-38,-20, 15; /M: SY='R'; M=-17, -7,-30, -7, 4,-24,-20, 0,-28, 29,-21, -8, 0,-17, 18, 55, -8,-10,-22,-20,-10, 8; /M: SY='C'; M= -5,-22, 24,-27,-24, -5,-28,-26, 4,-23, 8, 1,-22,-29,-24,-21,-10, 3, 16,-33,-13,-24; /M: SY='A'; M= 30,-13, 5,-20,-14,-17, -8,-21, -7,-14,-11, -9,-12,-17,-14,-20, 9, 2, 5,-28,-20,-14; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='G'; M= -4, -5,-13,-10,-16,-19, 24,-16,-23,-18,-14,-12, 3,-22,-16,-16, -2, -6,-18,-27,-21,-16; /M: SY='M'; M= -1,-21,-18,-28,-18, 0,-20, -9, 15,-16, 24, 38,-21,-21, -7,-14,-18, -8, 8,-20, -3,-13; /M: SY='L'; M= 5,-18,-15,-25,-17, -3,-19,-16, 9,-17, 17, 17,-18,-20,-12,-16, -9, 3, 9,-22, -7,-14; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='A'; M= 30,-12, 7,-19,-11,-21, -7,-21,-15,-13,-16,-14,-11, -3,-12,-21, 7, -1, -6,-27,-23,-12; /M: SY='L'; M=-10,-28,-25,-28,-18, 2,-30,-22, 19,-27, 32, 14,-27, -9,-18,-22,-25,-10, 7,-22, -5,-20; /M: SY='E'; M= -1,-11,-26,-11, 4,-16, -9,-15, -6, -9, 0, -3,-11,-15, -5,-12, -9,-10, -8,-23,-13, -1; /M: SY='P'; M= -7,-17,-28,-15, -8,-16,-21,-18, -5,-11,-10, -7,-13, 22, -9, -9, -4, -1, -9,-28,-16,-12; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='P'; M= -4, -4,-27, 1, 16,-29,-14, -8,-23, 2,-26,-16, -3, 20, 12, -4, 8, -2,-24,-30,-20, 12; /M: SY='E'; M= -6, -3,-21, -3, 14,-17,-22,-11,-10, 3, -9, -2, -7,-11, 2, -3, 0, 6, -4,-28,-13, 8; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='S'; M= 9, 1,-15, -1, -2,-22, 7,-10,-22, -6,-28,-18, 11,-12, -2, -8, 26, 10,-14,-34,-20, -2; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='G'; M= -2, -7, -3,-10,-19,-27, 43,-18,-35,-19,-28,-20, 3,-23,-19,-19, 2,-14,-25,-28,-28,-19; /M: SY='Q'; M=-11, -3,-29, -4, 9,-27,-13, 13,-23, 9,-20, -3, 0,-13, 32, 7, -4,-12,-26,-19, -5, 20; /M: SY='L'; M=-13,-28,-23,-33,-24, 25,-31,-15, 18,-26, 28, 17,-24,-28,-22,-20,-24,-10, 9, -8, 16,-23; /M: SY='V'; M= 2,-23,-16,-25,-23, 0,-25,-19, 18,-18, 3, 4,-20,-24,-19,-19, -5, -1, 24,-19, 3,-23; /M: SY='F'; M=-17,-27,-21,-32,-27, 51,-30, -9, 5,-22, 7, 2,-22,-30,-29,-17,-18, -8, 5, 10, 39,-27; /M: SY='N'; M= -9, 11,-24, 5, 3,-21,-12, 9,-22, 13,-26,-12, 19,-16, 10, 8, 3, -4,-23,-25, -4, 6; /M: SY='S'; M= 0, 1,-21, -1, -2,-25, 12,-11,-28, 5,-30,-17, 9,-13, -2, 0, 14, 0,-19,-29,-20, -2; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='D'; M= -6, 10,-24, 16, 0,-28, 13, -8,-33, -4,-28,-21, 9,-14, -4, 0, 10, -4,-23,-31,-21, -3; /M: SY='A'; M= 17, -9,-18,-15, -8,-20, 2,-15,-13,-11, -8, -6, -8,-14, -2,-14, 4, 2, -8,-22,-16, -5; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='Y'; M=-12,-20,-25,-22,-17, 1,-29, 0, 9, -9, 1, 5,-17,-25, -7, -4,-14, -8, 9, -9, 19,-15; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='T'; M= -4, 7,-16, -1, -2,-18,-14, 4,-17, -6,-19,-11, 13,-13, 4, -5, 16, 22,-14,-32,-10, 0; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='D'; M=-17, 23,-27, 26, 1,-11,-14, 9,-21, -3,-20,-17, 16,-19, -3, -7, -4, -7,-23,-16, 15, -3; /M: SY='V'; M= 1,-22,-19,-25,-20, -5,-26, -5, 16,-20, 11, 9,-18,-23,-17,-19,-12, -7, 18,-25, -3,-20; /M: SY='S'; M= 7, 0,-10, -3, -3,-17, -6,-13,-17,-10,-24,-17, 7,-10, -3,-10, 34, 29, -7,-37,-17, -3; /M: SY='E'; M= 14, 2,-22, 4, 32,-26,-12, -8,-22, 2,-16,-16, -4, -4, 8, -8, 4, -6,-18,-26,-20, 20; /M: SY='W'; M=-20,-37,-47,-37,-28, 13,-22,-22,-17,-18,-17,-17,-37,-30,-18,-18,-37,-27,-27,131, 38,-20; /M: SY='T'; M= 4, -3,-10, -8, -8,-13,-12,-17,-10,-11,-16,-12, 1,-12, -8,-11, 25, 31, 1,-34,-14, -8; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='T'; M= -3, -3,-14,-12,-13, -9,-16,-10, 1,-10, -5, 8, 2,-17, -7,-10, 6, 15, 3,-30,-10,-10; /M: SY='Y'; M=-10, -9,-24,-13,-12, 5,-22, 11, -7, -2, -9, -3, -5,-23, -8, -4,-10, -8, -6, -7, 23,-12; /M: SY='E'; M= -3, -3,-21, -3, 8,-18,-16,-11,-17, 7,-13, -9, -2,-12, 2, 1, 6, 5,-12,-28,-13, 5; /M: SY='T'; M= 3, -5,-14, -9, -2,-11,-17,-16, -9,-11, -4, -8, -4,-12, -7,-11, 12, 24, -3,-29,-12, -4; /M: SY='K'; M= -8, -4,-26, -5, 6,-25,-21, -7,-18, 20,-14, -4, -4,-12, 18, 12, -5, -1,-16,-22, -9, 12; /M: SY='E'; M= -2, 18,-21, 15, 19,-24,-12, -4,-22, 0,-20,-18, 16, -9, 3, -6, 8, 6,-21,-32,-18, 11; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='T'; M= -7, 3,-22, 2, -7,-17,-19,-15, -3,-12,-13, -9, 2, -4,-11,-15, 2, 5, -1,-32,-15,-10; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='K'; M= -3, -1,-19, -3, 0,-21, -3,-11,-22, 15,-23,-11, 2,-10, 0, 7, 6, 5,-14,-22,-13, 0; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='K'; M= -1, 3,-28, 8, 14,-30,-15,-10,-26, 18,-25,-16, -2, 7, 4, 4, -4, -8,-21,-26,-18, 8; /M: SY='W'; M=-16,-31,-13,-35,-28, 14,-23,-27,-17,-22,-14,-16,-29,-29,-24,-20,-25,-14,-19, 74, 16,-22; /M: SY='K'; M= -7,-12,-24,-12, 1,-17,-26,-16, 1, 7, -8, 0,-12,-16, 0, -1, -9, -7, 6,-24,-10, -1; /M: SY='V'; M= -4,-21,-18,-28,-24, -3,-31,-27, 26,-21, 8, 8,-18,-20,-20,-21, -5, 10, 28,-26, -6,-24; /M: SY='P'; M= -7,-17,-35, -8, 0,-28,-17,-18,-20,-10,-30,-20,-15, 74, -8,-18, -2, -5,-27,-32,-28, -8; /M: SY='K'; M=-14, 11,-30, 15, 15,-29,-18, 20,-32, 21,-26,-12, 6,-11, 9, 12, -7,-12,-25,-27, -6, 11; /M: SY='E'; M=-11, 5,-30, 13, 43,-28,-12, -2,-31, 11,-21,-18, 0, -5, 15, 9, -2,-11,-28,-28,-19, 28; /M: SY='F'; M=-11,-23,-18,-29,-21, 25,-27,-19, 8,-24, 24, 11,-20,-25,-22,-17,-16, 3, 5,-14, 6,-20; /M: SY='K'; M=-10, 3,-25, 4, 11,-25,-18, -2,-27, 21,-24,-13, 3,-11, 7, 19, 0, 1,-19,-26,-11, 8; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='E'; M= 4, 12,-17, 8, 16,-20, -6, -2,-18, 0,-19,-15, 16, -8, 4, -4, 9, -1,-18,-28,-17, 10; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='L'; M= -7,-13,-17,-11, 0, -5,-20,-12, 2, -4, 12, 4,-14,-16, -6, -5,-14, -7, 2,-18, -6, -3; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='Y'; M=-12,-18,-24,-22,-17, 3,-27, 7, 13,-17, 10, 13,-13,-21, -9,-15,-15, -7, 4,-11, 18,-17; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='K'; M= -5, 4,-24, 2, 4,-26,-11, -8,-24, 18,-30,-16, 10, 2, 3, 8, 7, 0,-20,-30,-17, 3; /M: SY='W'; M=-18,-31,-30,-34,-26, 39,-27,-14, -2,-23, 6, -2,-27,-30,-25,-18,-27,-16, -9, 48, 36,-24; /M: SY='L'; M=-12,-17,-22,-21,-13, 9,-25,-12, 6,-20, 23, 9,-13,-26, -8,-13,-19, -9, -3,-18, 1,-10; /M: SY='K'; M=-12, 15,-28, 14, 10,-30,-15, -5,-30, 34,-30,-15, 13,-12, 7, 19, -5, -8,-23,-26,-13, 8; /M: SY='K'; M= -4, -6,-21, -9, -4,-18,-18,-14,-11, 9,-18, -8, 0,-13, -1, 7, 7, 8, -6,-27,-11, -4; /M: SY='V'; M= -9,-21,-21,-22,-14, 5,-27,-10, 7,-13, 7, 6,-19,-24, -3,-11,-13, -7, 8,-13, 7, -8; /M: SY='K'; M=-12, -5,-28, -6, 4,-13,-22,-12,-25, 37,-24, -8, -3,-13, 2, 22,-12,-10,-17,-15, -4, 4; /M: SY='S'; M= 0, -4,-17, -8, -2, -3,-15,-12, -6,-11,-12, -9, 2,-17,-10,-12, 6, 1, -1,-28,-11, -5; /M: SY='K'; M= -8,-12,-25,-14, -4,-20,-26,-15, -1, 14,-11, 1,-10,-16, 4, 5,-10, -8, 3,-22, -8, -1; /M: SY='K'; M=-11,-11,-30,-12, -2,-20,-22,-11,-11, 19,-15, 3, -9, 2, 2, 14,-13,-10,-11,-22,-11, -2; /M: SY='P'; M= -2, -6,-24, -3, 5,-27,-11, -2,-21, -5,-27,-14, -1, 17, 11, -8, 14, 3,-21,-32,-18, 6; /M: SY='D'; M=-12, 23,-27, 33, 26,-31,-16, -4,-31, 7,-24,-21, 8, -7, 6, -2, 2, 0,-24,-33,-17, 16; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='I'; M= -3,-29,-20,-33,-27, 1,-32,-28, 34,-25, 20, 15,-25,-25,-23,-24,-17, -6, 31,-23, -5,-27; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='F'; M=-15,-28,-20,-33,-26, 44,-30,-15, 9,-26, 19, 7,-24,-30,-29,-18,-22, -9, 7, 0, 25,-26; /M: SY='P'; M=-12,-14,-34,-12, -5,-22,-21,-14,-11, -3,-20,-11, -9, 38, -6, 1,-10, -9,-18,-27,-20,-10; /M: SY='P'; M=-10,-12,-35, -8, -5,-22, -5,-12,-22, -6,-27,-17, -9, 42, -9,-13, -8,-11,-27,-22,-15,-10; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 18 in 18 different sequences |
| Number of true positive hits | 18 in 18 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | PADR1 zinc-binding |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
18 sequences
PARP1_ARATH (Q9ZP54), PARP1_BOVIN (P18493), PARP1_CAEEL (Q9N4H4), PARP1_CHICK (P26446), PARP1_CRIGR (Q9R152), PARP1_DANRE (Q5RHR0), PARP1_HUMAN (P09874), PARP1_MAIZE (Q9ZSV1), PARP1_MOUSE (P11103), PARP1_ORYSJ (Q7EYV7), PARP1_RAT (P27008), PARP1_XENLA (P31669), PARP3_ARATH (Q9FK91), PARP3_MEDTR (Q1SGF1), PARP3_ORYSJ (Q0E0Q3), PARP3_SOYBN (Q9SWB4), PARP_DROME (P35875), PARP_SARPE (Q11208)» more
|
| PDB [Detailed view] |
11 PDB
2JVN; 2RIQ; 4DQY; 4OPX; 4OQA; 4OQB; 7S68; 7S6H; 7S6M; 7S81; 8G0H |