 |
|
| Entry: PS01124 |
General information about the entry
| Entry name [info] | HTH_ARAC_FAMILY_2 |
| Accession [info] | PS01124 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-NOV-1995 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 10-FEB-2021 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00040 |
| Associated ProRule [info] | PRU00593 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Bacterial regulatory proteins, araC family DNA-binding domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=99; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=94; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5162; R2=0.0218; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=321; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=229; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-70; E1=-70; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='D'; M=-10, 11,-25, 14, 13,-25,-12, 2,-25, 4,-22,-15, 7,-13, 8, 4, 0, -7,-23,-25,-10, 10; /M: SY='R'; M= -7, -1,-26, -1, 5,-24,-15, -3,-24, 15,-19,-11, 0,-11, 8, 20, -3, -6,-18,-22,-11, 5; /M: SY='V'; M= 8,-24,-17,-29,-22, -2,-24,-25, 21,-21, 15, 9,-22,-22,-20,-22,-11, -3, 22,-23, -8,-22; /M: SY='V'; M= -7,-18,-10,-21,-13, -7,-25,-14, 4,-11, 5, 4,-15,-23,-10, -5,-11, -2, 6,-23, -5,-13; /M: SY='Q'; M= -2, -1,-20, -3, 2,-23,-10, 1,-19, 0,-14, -7, 0,-15, 7, 1, -1, -4,-16,-26,-12, 3; /M: SY='Y'; M=-12,-25,-25,-28,-22, 20,-27, -9, 3,-16, 5, 1,-22,-27,-18,-13,-20,-10, -2, 19, 30,-21; /M: SY='I'; M= -8,-28,-20,-35,-26, 2,-34,-24, 34,-27, 24, 21,-23,-23,-19,-25,-20, -9, 22,-21, -2,-25; /M: SY='E'; M= -8, 3,-25, 6, 20,-21,-19, 2,-19, 1,-13,-11, 0,-11, 7, 2, -1, -5,-17,-28,-12, 13; /M: SY='E'; M= -3, 6,-24, 8, 12,-22,-10, -4,-23, 3,-18,-14, 4,-12, 4, 1, 2, -3,-18,-28,-15, 7; /M: SY='N'; M=-12, 21,-22, 17, 3,-23,-10, 20,-24, -1,-23,-14, 26,-17, 3, 0, 2, -4,-24,-34,-10, 2; /M: SY='L'; M= -8,-25,-24,-26,-17, 7,-28,-16, 14,-22, 20, 10,-23,-14,-17,-19,-20, -9, 5,-14, 6,-18; /M: SY='E'; M= 3, 0,-20, 0, 9,-24,-12, -1,-21, 1,-18,-11, 0,-10, 9, -3, 5, -1,-17,-27,-13, 9; /M: SY='R'; M= -9, 4,-24, 5, 13,-26,-15, 4,-26, 12,-22,-12, 5,-12, 14, 16, 1, -5,-22,-27,-12, 12; /I: MD=-25; /M: SY='P'; M= -4, -1,-25, 1, 5,-23, -6, -7,-22, 4,-23,-15, 1, 7, 0, 1, 3, -3,-20,-26,-17, 1; D=-5; /I: I=-7; MI=0; IM=0; DM=-25; /M: SY='W'; M=-13,-31,-27,-34,-26, 10,-27,-25, 8,-24, 10, 2,-28,-26,-22,-20,-26,-14, 2, 33, 9,-23; /M: SY='T'; M= -3, 3,-17, -1, -1,-18,-12, -5,-20, 1,-20,-13, 7,-13, -2, 3, 12, 15,-13,-30,-12, -2; /M: SY='L'; M= -8,-29,-22,-32,-23, 4,-31,-24, 25,-26, 30, 16,-27,-24,-20,-21,-23, -8, 17,-16, -2,-23; /M: SY='E'; M= 0, 12,-24, 15, 17,-27, -9, -5,-26, 3,-21,-17, 6, -8, 3, -2, 4, -4,-20,-30,-18, 10; /M: SY='D'; M= -6, 11,-22, 14, 8,-24,-14, -6,-20, 1,-18,-13, 5,-12, 4, 0, 3, -3,-16,-30,-15, 5; /M: SY='I'; M= -7,-29,-18,-32,-26, 9,-32,-24, 27,-26, 26, 16,-27,-28,-24,-21,-20, -6, 27,-21, -1,-26; /M: SY='A'; M= 38,-11, -1,-19,-12,-19, -3,-20,-11,-12,-11,-10,-10,-13,-12,-20, 10, 2, 0,-24,-20,-12; /M: SY='E'; M= -5, 9,-25, 13, 16,-27,-10, -1,-26, 6,-21,-15, 6,-11, 9, 5, 2, -6,-22,-28,-16, 12; /M: SY='H'; M= -4, -4,-20, -5, 5,-17,-17, 9,-16, -2,-11, -6, -3,-15, 5, -2, -3, -6,-15,-24, -4, 4; /M: SY='V'; M= 5,-21,-11,-26,-19, 6,-21,-19, 8,-20, 9, 4,-19,-23,-19,-19, -8, -3, 11,-19, -2,-19; /M: SY='G'; M= -4, -5,-15, -9,-13,-15, 14, -3,-23,-13,-18,-11, 2,-20,-10,-12, -3,-11,-20,-21, -9,-13; /M: SY='M'; M= -7,-23,-14,-28,-22, 3,-26,-15, 17,-18, 16, 18,-22,-25,-17,-17,-15, -3, 17,-18, 4,-20; /M: SY='S'; M= 7, 1,-12, -1, -2,-19, 0, -8,-20,-10,-27,-18, 10,-11, -2,-10, 33, 20,-11,-37,-18, -2; /M: SY='P'; M= -7, -9,-29, -5, 9,-23,-18,-11,-18, 5,-17,-12,-10, 15, 1, 3, -7, -8,-17,-25,-17, 3; /M: SY='R'; M= -5, -9,-23,-12, -6,-11,-15,-10,-16, 1,-17,-11, -2,-17, -2, 13, 4, 1,-11,-11, -6, -6; /M: SY='Y'; M= -6, -9,-18,-12,-10, -5,-20, 10,-10, -9, -7, -4, -5,-20, -5, -5, -1, 5, -8,-16, 11,-10; /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-32,-23, 21,-30,-20, 18,-29, 38, 16,-27,-29,-23,-20,-26,-10, 11,-14, 6,-23; /M: SY='R'; M= -8, -5,-22, -7, 2,-19,-18, 8,-20, 9,-18, -7, -1,-16, 12, 15, -1, -5,-17,-20, -1, 5; /I: I=-10; MI=-35; MD=-35; IM=-35; /M: SY='R'; M= -9, -4,-26, -5, 3,-22,-16, 0,-22, 17,-19, -9, 1,-14, 5, 24, -4, -5,-16,-24,-10, 2; D=-6; /I: DM=-35; /M: SY='L'; M= -8,-15,-22,-18, -9,-10,-21, -8, -2, -5, 8, 6,-12,-21, -3, 4,-13, -7, -3,-22, -6, -7; /M: SY='F'; M=-15,-28,-12,-35,-26, 51,-29,-20, 3,-29, 17, 5,-22,-30,-32,-20,-20, -9, 2, -3, 17,-26; /M: SY='R'; M=-10, -2,-28, -1, 12,-25,-16, -4,-26, 23,-21,-10, 0,-13, 12, 25, -5, -8,-21,-23,-12, 11; /M: SY='K'; M= -2, 2,-24, 2, 11,-26,-14, -5,-24, 16,-22,-12, 2,-11, 13, 13, 3, -2,-18,-25,-14, 11; D=-6; /M: SY='E'; M= -2, -6,-22, -6, 7,-13,-19, 1,-10, -7,-10, -7, -6,-14, 2, -9, -1, -3, -8,-21, -3, 3; /M: SY='T'; M= -3, -8,-17,-13,-11, -7,-14,-13, -5,-10, -2, -2, -6,-19,-10, -9, -2, 7, -2,-23, -5,-11; /M: SY='G'; M= -1, -7,-25,-10,-17,-23, 40,-16,-28,-16,-21,-15, 1,-19,-16,-15, 1, -8,-20,-23,-23,-16; /I: I=-7; MI=-30; MD=-30; IM=-30; /M: SY='M'; M= -4,-12,-14,-16, -9, -8,-18, -8, 3, -7, 2, 7,-10,-15, -3, -6, -6, 0, 3,-18, -4, -7; D=-6; /I: DM=-29; /M: SY='T'; M= 2, 0,-14, -4, -5,-18, -4,-14,-18, -7,-22,-15, 6, -6, -6, -9, 19, 22,-11,-32,-17, -6; D=-6; /M: SY='P'; M=-10,-25,-26,-25,-16, 8,-26,-20, 1,-19, -2, -3,-22, 18,-20,-19,-15, -9, -3,-16, -3,-20; /M: SY='N'; M= -5, -3,-19, -8, -5,-17, -8, -6,-15, 2,-13, -4, 3,-17, -1, 2, -1, -3,-13,-26,-12, -4; /M: SY='Q'; M= -3, 4,-25, 4, 16,-29,-11, 0,-24, 7,-21,-12, 5,-10, 21, 7, 3, -5,-23,-26,-15, 18; /M: SY='Y'; M=-16,-25,-31,-27,-21, 15,-29, -4, 7,-17, 5, 3,-23,-27,-12,-15,-23,-13, -3, 28, 37,-18; /M: SY='L'; M= -9,-27,-23,-31,-22, 4,-32,-21, 26,-24, 27, 16,-23,-25,-17,-17,-21, -8, 17,-19, 1,-22; /M: SY='R'; M=-10, -5,-23, -9, -2,-13,-18, -3,-12, 3, -6, -1, 1,-18, 2, 15, -5, -1,-11,-25, -9, -1; /M: SY='D'; M= -7, 9,-25, 10, 10,-25,-14, -1,-22, 5,-19,-13, 7,-13, 9, 8, 1, -4,-19,-28,-13, 8; /M: SY='R'; M= -8,-18,-17,-20,-12, -8,-22,-12, -6, -5, -5, -2,-14,-22, -6, 5,-11, -6, -3, -6, -1,-10; D=-6; /M: SY='R'; M=-18, -9,-30, -9, 2,-22,-20, -1,-29, 32,-21, -9, 0,-18, 11, 62,-10,-10,-20,-20,-10, 2; /M: SY='M'; M= -8,-26,-21,-32,-22, 3,-28,-16, 25,-22, 29, 31,-24,-24,-14,-18,-22, -9, 16,-20, -1,-19; /M: SY='E'; M= -5, -2,-17, -2, 6,-20,-14, -5,-16, -3,-13, -9, -1,-13, 3, -2, 2, -1,-13,-29,-14, 3; /M: SY='R'; M=-10, -5,-21, -6, 2,-16,-18, 4,-18, 7,-13, -5, -3,-17, 6, 8, -7, -8,-16,-20, -1, 2; /M: SY='A'; M= 36,-13,-13,-21,-13,-17, -4,-21, -3,-13, -6, -6,-11,-13,-12,-20, 6, 0, 4,-22,-17,-13; /M: SY='R'; M= 0,-10,-22,-13, -3,-18,-17, -4,-16, 10,-10, -5, -6,-17, 2, 18, -7, -7,-10,-22,-10, -3; /M: SY='R'; M= -3, -5,-23, -7, 1,-17,-17, -4,-13, 4, -8, -4, -3,-16, 5, 7, -5, -6,-11,-22, -8, 2; /M: SY='L'; M= -8,-13,-18,-13, -7, -3,-23,-12, 0,-15, 15, 5,-16,-22, -9,-12,-16, -9, -3,-19, -2, -8; /M: SY='L'; M= -8,-29,-20,-30,-20, 8,-29,-20, 21,-28, 43, 19,-28,-28,-19,-20,-26, -9, 12,-21, -1,-20; /M: SY='R'; M= -5,-12,-18,-14, -5,-10,-21,-12, -5, -5, -1, -1, -8,-19, -3, 3, -5, -2, -4,-24, -9, -5; /M: SY='B'; M= -9, 4,-23, 3, 3,-14,-16, 0,-16, -3,-11, -7, 3,-15, 0, -2, -1, -1,-14,-26, -7, 1; /M: SY='S'; M= -1, 1,-20, -1, -2,-21, -3, -7,-21, -6,-22,-15, 5, -3, -3, -8, 13, 12,-16,-30,-16, -3; /I: MD=-23; /M: SY='N'; M= -7, 15,-24, 15, 9,-26, -2, -2,-27, 2,-25,-18, 16,-12, 3, 1, 5, -4,-23,-29,-18, 5; D=-4; /I: MD=-23; /M: SY='M'; M= -5,-10,-21,-12, -5, -8,-14, -3, -8, -3, -3, 2, -8,-15, -1, -2, -9, -8,-10,-13, 1, -4; D=-4; /I: I=-7; MI=0; IM=0; DM=-23; /M: SY='S'; M= 1, -1,-20, -3, 0,-21, -9, -8,-18, -3,-24,-14, 5, 3, 2, -6, 15, 9,-16,-31,-16, 0; /M: SY='I'; M= -5,-29,-21,-35,-29, 1,-34,-28, 38,-25, 17, 16,-24,-24,-23,-25,-16, -6, 35,-24, -4,-28; /M: SY='T'; M= 4, -6,-17,-11, -8, -9,-12,-14, -8, -9, -8, -7, -2,-16, -9,-10, 6, 10, -3,-25,-10, -8; /M: SY='E'; M= -7, 12,-25, 17, 21,-29,-14, -2,-25, 4,-21,-15, 5, -9, 15, 0, 4, -2,-22,-29,-15, 17; /M: SY='I'; M= -2,-27,-23,-34,-27, -2,-32,-27, 36,-25, 15, 15,-20,-21,-20,-25,-13, -5, 28,-23, -4,-26; /M: SY='A'; M= 38, -9,-10,-16, -9,-20, 3,-18,-12,-11,-14,-12, -6,-11, -9,-18, 14, 2, -3,-24,-20, -9; /M: SY='H'; M= -9, -8,-22,-11, -5, -8,-19, 5, -7, -6, -2, 5, -5,-20, 0, -2, -9, -7, -9,-18, 2, -4; /M: SY='R'; M= -8, 3,-22, 2, 6,-21,-15, -3,-18, 7,-14, -6, 4,-15, 7, 11, -1, -4,-16,-27,-13, 5; /M: SY='C'; M= -4,-22, 10,-26,-23, -1,-26,-17, 2,-20, 1, -2,-20,-29,-21,-20,-13, -7, 8,-13, 2,-23; /M: SY='G'; M= -1,-10,-29,-10,-18,-27, 62,-18,-38,-18,-28,-19, 0,-20,-18,-17, 0,-19,-29,-20,-27,-18; /M: SY='F'; M=-18,-27,-24,-33,-26, 52,-31, -8, 6,-23, 9, 3,-20,-29,-27,-18,-20,-10, 1, 12, 42,-26; /M: SY='S'; M= 0, 3,-21, 4, 1,-20, -2, -8,-21, -7,-20,-15, 4, -9, -4, -8, 8, 0,-16,-28,-16, -2; /I: I=-10; MI=-35; MD=-35; IM=-35; /M: SY='D'; M= -4, 15,-19, 20, 7,-24, -6, 7,-26, -6,-27,-19, 13,-11, 2, -8, 19, 5,-19,-37,-14, 4; D=-6; /I: DM=-35; /M: SY='Q'; M= -1, -6,-21, -8, 0,-20,-14, -9,-12, -6,-12, -7, -4, -3, 6, -6, 5, 5,-11,-28,-14, 2; /M: SY='S'; M= 6, -3,-18, -6, -4,-17, 2,-10,-17,-10,-19,-13, 5,-11, -1,-11, 15, 4,-14,-29,-16, -2; /M: SY='Y'; M= -9,-10,-25,-12,-10, 3,-20, 15,-12, -4, -9, -5, -7,-22, -3, 0, -6, -2,-13, -2, 31,-10; /M: SY='F'; M=-19,-29,-20,-38,-28, 69,-30,-19, 2,-29, 14, 3,-21,-30,-36,-19,-21,-10, 1, 7, 27,-28; /M: SY='S'; M= 7,-10, -8,-15,-12,-12,-15,-16, -3,-14,-11, -8, -4,-15, -9,-15, 13, 11, 1,-28,-10,-12; /M: SY='R'; M= -9, -2,-23, -3, 3,-21,-16, -4,-22, 14,-19,-10, 2,-16, 6, 23, -1, -2,-15,-25,-10, 2; /M: SY='V'; M= 2,-10,-17,-12, -5,-11,-16,-14, -2,-10, -3, -3, -9,-18,-10,-11, -3, -2, 4,-26,-12, -8; /M: SY='F'; M=-17,-28,-20,-35,-28, 62,-30,-13, 2,-26, 8, 1,-20,-29,-32,-19,-19,-10, 0, 10, 35,-28; /M: SY='R'; M=-12, 0,-28, -2, 5,-25,-17, -6,-28, 33,-25,-11, 3,-13, 8, 35, -6, -7,-19,-22,-12, 5; /M: SY='R'; M= -9, 0,-27, -1, 8,-25,-17, -3,-26, 24,-23,-11, 2,-13, 12, 27, -2, -5,-20,-23,-11, 9; /M: SY='Y'; M=-11,-10,-20,-13, -6, -6,-23, 5,-10, -2, -7, -3, -7,-20, -2, 2, -8, -3, -9,-13, 10, -6; /M: SY='F'; M=-13,-21,-21,-27,-20, 35,-27,-11, 2,-20, 8, 2,-17,-25,-22,-15,-13, -1, 0, -1, 25,-20; /M: SY='G'; M= -2, -1,-28, -3,-13,-29, 51,-14,-36,-14,-29,-20, 9,-19,-14,-15, 3,-15,-29,-24,-27,-14; /M: SY='M'; M= -6,-16,-13,-19, -8, -4,-24,-11, 3,-11, 1, 7,-15,-20, -7,-11,-10, -5, 5,-17, -1, -8; /M: SY='T'; M= 5, -3,-12, -9, -7,-13,-13,-16,-11,-11,-12,-11, 0, -9, -7,-11, 19, 28, -4,-32,-14, -7; /M: SY='P'; M= -7,-20,-38,-11, -1,-28,-19,-20,-18,-10,-27,-18,-19, 80,-10,-19, -9, -9,-27,-29,-29,-10; /M: SY='S'; M= 3, -4,-17, -5, -2,-20, -5, -8,-19, 1,-22,-12, 3,-13, 1, 2, 17, 8,-12,-31,-15, -1; /M: SY='E'; M= -7, 6,-27, 11, 22,-28,-16, 1,-24, 7,-19,-12, 1,-10, 19, 4, -1, -8,-23,-26,-12, 20; /M: SY='Y'; M=-14,-19,-23,-23,-20, 29,-27, -6, 0,-17, 3, -1,-17,-25,-19,-15,-13, -1, -3, 10, 35,-20; /M: SY='R'; M=-13,-14,-25,-15, -6, -9,-21, -7,-13, 8, -3, -2, -7,-21, 0, 32,-11, -8, -9,-20, -6, -6; /M: SY='R'; M= -4, -4,-24, -6, 2,-20,-16, -1,-17, 9,-14, -6, -1,-15, 7, 11, -3, -4,-14,-22, -9, 3; /M: SY='R'; M= -9, -7,-26, -8, -3,-17,-10, -2,-13, 0,-12, -4, -2,-17, 3, 5, -4, -5,-12,-21, -6, -2; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 262 in 262 different sequences |
| Number of true positive hits | 260 in 260 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 2 in 2 different sequences |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 99.24 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | K_Hofmann |
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
260 sequences
AARP_PROST (P43463 ), ADAA_BACSU (P19219 ), ADA_ECOLI (P06134 ), ADA_SALTY (P26189 ), ADIY_ECOLI (P33234 ), AGGR_ECOLX (P43464 ), ALKA_MYCTO (P9WJW2 ), ALKA_MYCTU (P9WJW3 ), ALKR_ACIAD (O31249 ), ANDR_BURCE (Q84BZ4 ), APPY_ECOLI (P05052 ), ARACL_STRAT (Q03320 ), ARACL_STRLI (P35319 ), ARAC_CITFR (P11765 ), ARAC_DICCH (P07642 ), ARAC_ECO57 (P0A9E1 ), ARAC_ECOLI (P0A9E0 ), ARAC_SALTY (P03022 ), ARGR_PSEAE (G3XCU2 ), BTR_BACSU (P40408 ), CAF1R_YERPE (P26950 ), CDHR_PSEAE (Q9HTH5 ), CFAD_ECOLX (P25393 ), CHBR_ECOLI (P17410 ), CSVR_ECOLX (P43460 ), ENVY_ECOLI (P10805 ), EUTR_ECOLI (P36547 ), EUTR_SALTY (Q9ZFU7 ), EXSA_PSEAE (P26993 ), FAPR_ECOLX (P23774 ), FEAR_ECOLI (Q47129 ), GADW_ECO57 (P63202 ), GADW_ECOL6 (Q8FCI7 ), GADW_ECOLI (P63201 ), GADW_SHIFL (P63203 ), GADX_ECO27 (Q9EYV5 ), GADX_ECO57 (P58230 ), GADX_ECOL6 (Q8FCI6 ), GADX_ECOLI (P37639 ), GADX_SHIFL (Q83PR0 ), GLXA_RHIME (O87389 ), HILD_SALTS (E1WAC0 ), HILD_SALTY (P0CL08 ), HPTR_STAA3 (Q2FK47 ), HPTR_STAA8 (Q2G1E1 ), HPTR_STAAB (Q2YV56 ), HPTR_STAAC (Q5HJF7 ), HPTR_STAAM (Q99X00 ), HPTR_STAAN (Q7A7X9 ), HPTR_STAAR (Q6GK93 ), HPTR_STAAS (Q6GCQ3 ), HPTR_STAAW (Q8NYJ9 ), HRPB_RALSO (P31778 ), INVF_SALTI (P69342 ), INVF_SALTY (P69343 ), LACR_STAXY (O33813 ), LCRF_YERPE (P28808 ), LUMQ_PHOLE (Q51872 ), MARA_ECO57 (P0ACH6 ), MARA_ECOLI (P0ACH5 ), MARA_SALEN (P0A2S6 ), MARA_SALTI (P0A2S5 ), MARA_SALTY (P0A2S4 ), MARA_SHIFL (P0ACH7 ), MELR_ECOL6 (P0ACH9 ), MELR_ECOLI (P0ACH8 ), MMSR_PSEAE (P28809 ), MSMR_STRMU (Q00753 ), MTRA_NEIGO (Q9WW32 ), MXIE_SHIFL (P0A2S7 ), MXIE_SHISO (P0A2S8 ), NIMR_ECOLI (P76241 ), NPHR_RHOSO (B1Q2A8 ), ORUR_PSEAE (P72171 ), PCHR_PSEAE (P40883 ), PERA_ECO27 (P43459 ), PLH4_FORAG (T2KMF4 ), POCR_SALTY (Q05587 ), PQRA_PROVU (Q52620 ), RAFR_PEDPE (P43465 ), RAMA_ENTCL (P55922 ), RAMA_KLEPN (Q48413 ), RCLR_ECOLI (P77379 ), RHAR_CROS8 (A7ML57 ), RHAR_ECO24 (A7ZUB8 ), RHAR_ECO57 (Q8X7B3 ), RHAR_ECOBW (C5A074 ), RHAR_ECOHS (A8A710 ), RHAR_ECOK1 (A1AI83 ), RHAR_ECOL5 (Q0TAF7 ), RHAR_ECOL6 (Q8FBD7 ), RHAR_ECOLI (P09378 ), RHAR_ECOUT (Q1R413 ), RHAR_ENT38 (A4WG90 ), RHAR_KLEP7 (A6TGB0 ), RHAR_MANSM (Q65Q30 ), RHAR_PECAS (Q6DA21 ), RHAR_PECCP (C6DJR5 ), RHAR_SALA4 (B5F0N0 ), RHAR_SALAR (A9MI63 ), RHAR_SALCH (Q57HG7 ), RHAR_SALDC (B5FPP6 ), RHAR_SALEP (B5QWY5 ), RHAR_SALHS (B4TBY4 ), RHAR_SALNS (B4SZZ4 ), RHAR_SALPA (Q5PKG1 ), RHAR_SALPB (A9MZC9 ), RHAR_SALPK (B5BJG9 ), RHAR_SALSV (B4TPR0 ), RHAR_SALTI (Q8Z2V5 ), RHAR_SALTY (P40865 ), RHAR_SHIBS (Q31U83 ), RHAR_SHIDS (Q32A71 ), RHAR_SHIF8 (Q0SZ96 ), RHAR_SHIFL (Q83PD9 ), RHAR_YERP3 (A7FN79 ), RHAR_YERPA (Q1C0W2 ), RHAR_YERPB (B2K1W6 ), RHAR_YERPE (Q8ZIZ9 ), RHAR_YERPG (A9QYR6 ), RHAR_YERPN (Q1CEB6 ), RHAR_YERPP (A4TRS7 ), RHAR_YERPS (Q66FF1 ), RHAR_YERPY (B1JNC4 ), RHAS_CITK8 (A8AL27 ), RHAS_ECO24 (A7ZUB7 ), RHAS_ECO27 (B7UNM6 ), RHAS_ECO45 (B7MI37 ), RHAS_ECO55 (B7L9G1 ), RHAS_ECO57 (Q8X897 ), RHAS_ECO5E (B5YZ43 ), RHAS_ECO7I (B7NUA1 ), RHAS_ECO81 (B7N2P7 ), RHAS_ECO8A (B7M6V7 ), RHAS_ECOBW (C5A073 ), RHAS_ECODH (B1XB72 ), RHAS_ECOHS (A8A709 ), RHAS_ECOK1 (A1AI82 ), RHAS_ECOL5 (Q0TAF8 ), RHAS_ECOL6 (Q8CXW5 ), RHAS_ECOLC (B1IVH3 ), RHAS_ECOLI (P09377 ), RHAS_ECOLU (B7NFK3 ), RHAS_ECOSE (B6I4P8 ), RHAS_ECOSM (B1LMU6 ), RHAS_ECOUT (Q1R414 ), RHAS_ENT38 (A4WG91 ), RHAS_ESCF3 (B7LVD8 ), RHAS_KLEP3 (B5XZ49 ), RHAS_KLEP7 (A6TGA9 ), RHAS_MANSM (Q65Q31 ), RHAS_PECAS (Q6DA22 ), RHAS_PECCP (C6DJR4 ), RHAS_SALA4 (B5F0M9 ), RHAS_SALAR (A9MI64 ), RHAS_SALCH (Q57HG8 ), RHAS_SALDC (B5FPP5 ), RHAS_SALEP (B5QWY4 ), RHAS_SALG2 (B5RFC3 ), RHAS_SALHS (B4TBY3 ), RHAS_SALNS (B4SZZ3 ), RHAS_SALPA (Q5PKG2 ), RHAS_SALPB (A9MZC8 ), RHAS_SALPC (C0Q3L4 ), RHAS_SALPK (B5BJG8 ), RHAS_SALSV (B4TPQ9 ), RHAS_SALTI (P0A2T0 ), RHAS_SALTY (P0A2S9 ), RHAS_SHIB3 (B2TVP7 ), RHAS_SHIBS (Q31U84 ), RHAS_SHIDS (Q32A70 ), RHAS_SHIF8 (Q0SZ95 ), RHAS_SHIFL (Q83PE0 ), RHAS_SHISS (Q3YV71 ), RHAS_YERP3 (A7FN80 ), RHAS_YERPA (Q1C0W1 ), RHAS_YERPB (B2K1W5 ), RHAS_YERPE (Q8ZJ00 ), RHAS_YERPG (A9QYR8 ), RHAS_YERPN (Q1CEB5 ), RHAS_YERPP (A4TRS8 ), RHAS_YERPS (Q66FF2 ), RHAS_YERPY (B1JNC5 ), RHRA_RHIME (Q9Z3Q6 ), RIPA_CORDI (Q6NI56 ), RIPA_COREF (Q8FQS2 ), RIPA_CORGL (Q8NRR3 ), RNS_ECOLX (P16114 ), ROB_ECO57 (P0ACI1 ), ROB_ECOLI (P0ACI0 ), ROB_SHIFL (P0ACI2 ), SIRC_SALTI (Q8Z4A6 ), SIRC_SALTS (E1WAB2 ), SIRC_SALTY (P0CL09 ), SOXS_ECO57 (P0A9E4 ), SOXS_ECOL6 (P0A9E3 ), SOXS_ECOLI (P0A9E2 ), SOXS_SALTY (Q56143 ), TCPN_VIBC3 (A5F384 ), TCPN_VIBCH (P0C6D6 ), TETD_ECOLX (P28816 ), THCR_RHOER (P43462 ), URER_ECOLX (P32326 ), URER_PROMH (Q02458 ), VIRF_SHIDY (P0A2T2 ), VIRF_SHIFL (P0A2T1 ), VIRF_SHISO (P0A2T3 ), VIRF_YERE8 (A1JU91 ), VIRF_YEREN (P0C2V5 ), VIRS_MYCTO (P9WMJ2 ), VIRS_MYCTU (P9WMJ3 ), VQSM_PSEAE (Q9I1P2 ), XYLR_ECO57 (P0ACI5 ), XYLR_ECOL6 (P0ACI4 ), XYLR_ECOLI (P0ACI3 ), XYLR_HAEIN (P45043 ), XYLS1_PSEPU (Q04710 ), XYLS2_PSEPU (Q05092 ), XYLS3_PSEPU (Q05335 ), XYLS4_PSEPU (Q04713 ), XYLS_PSEPU (P07859 ), Y077_STAAW (Q8NYT6 ), Y078_STAAS (Q6GD21 ), Y084_STAAC (Q5HJR8 ), Y097_STAAN (Q7A882 ), Y101_STAAM (Q99XB1 ), Y1052_HAEIN (P45008 ), Y107_STAAR (Q6GKK1 ), Y1395_MYCTO (P9WMJ0 ), Y1395_MYCTU (P9WMJ1 ), Y1430_MYCBO (P68912 ), Y165_STAES (Q8CQE3 ), Y1931_MYCTU (P95283 ), Y2406_STAEQ (Q5HKE0 ), Y4FK_SINFN (P55449 ), YBCM_ECOLI (P77634 ), YBFI_BACSU (O31449 ), YBFP_BACSU (O31456 ), YCGK_PSEVC (P43461 ), YDEC_BACSU (P96660 ), YDEE_BACSU (P96662 ), YDEO_ECO57 (Q8X4Z9 ), YDEO_ECOL6 (Q8FHG0 ), YDEO_ECOLI (P76135 ), YDEO_SHIFL (Q83RF4 ), YDIP_ECOLI (P77402 ), YESN_BACSU (O31517 ), YESS_BACSU (O31522 ), YFIF_BACSU (P54722 ), YHTH1_STAAU (Q936F1 ), YIDL_ECOLI (P31449 ), YIJO_ECOLI (P32677 ), YISR_BACSU (P40331 ), YKGA_ECOLI (P77601 ), YMCR_STRLA (P43458 ), YNEL_ECOLI (P76138 ), YOBQ_BACSU (O34901 ), YPDC_ECOLI (P77396 ), YQHC_ECOLI (Q46855 ), YTDP_BACSU (O32071 )» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences |
2 sequences
ETR1_CANGA (Q6FXN7 ), GLNE_RHILO (Q985F6 ) |
| PDB [Detailed view] |
12 PDB
1BL0; 1D5Y; 1U8B; 1WPK; 1XS9; 1ZGW; 2K9S; 3GBG; 3MKL; 4FE4; 4FE7; 5SUW |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission