PROSITE entry PS51029
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | MADF |
| Accession [info] | PS51029 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-OCT-2004 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51029 |
| Associated ProRule [info] | PRU00372 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | MADF domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=87; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=87; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1081318; R2=0.0117999; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=627; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=457; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='R?'; /DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='Q'; M= -1, -3,-14, -1, 9,-15,-16, -8,-18, 7,-10, -1, -4, -6, 15, 13, -4,-10,-15,-19, -9, 9; /M: SY='F'; M=-12,-18,-12,-26,-22, 45,-23,-17, 16,-16, 31, 6,-15,-34,-23,-17,-16, -7, 12,-11, 27,-22; /M: SY='I'; M= -1,-18,-12,-33,-26, 3,-14,-20, 49,-20, 21, 10, -5,-31,-21,-26,-11, 1, 34,-28, -3,-26; /M: SY='E'; M= 0, 3,-14, 9, 19,-26,-15, -1,-22, 6,-12, -7, -1, -3, 15, 3, 0, -9,-19,-20,-13, 17; /M: SY='L'; M= 5, -6, -9, -6, 4, -8,-15,-10, 2, -3, 8, 7, -8,-15, 0,-12, -4, 1, 0,-26, -5, 3; /M: SY='Y'; M= -9,-23,-33,-19,-25, 16,-26,-17, 23,-15, 19, -1,-23,-31,-20, -9,-14, 1, 31, -2, 34,-25; /M: SY='R'; M= 1, -8,-22, -4, 11,-17,-13, -6,-22, 16,-18, 3, -8, 0, 18, 26, 0,-13,-17,-16,-11, 11; /M: SY='Q'; M= 0, 2,-16, 4, 9,-19,-12, -7,-18, 8,-14, -3, 2, -5, 11, 9, 1, -6,-16,-24,-13, 8; /M: SY='H'; M=-11, -8,-29, -8, -1, -8,-20, 21,-15, -2, -5, 1, -2,-10, 10, 9, -8, -9,-14,-17, 6, 2; /M: SY='P'; M= -6,-14,-26, -5, 11,-35,-11, 5,-27, 9,-25,-29,-22, 74, 6, -4, -6, -1,-33,-27,-17, 4; /M: SY='C'; M= -6,-14, 51,-20, -2,-12,-22,-30, 1,-15, 1, -7, -9,-24,-14,-15, -7, -6, 1,-24,-27, -7; /M: SY='L'; M= -8,-12, -5,-16,-15, 17,-19,-13, 28,-20, 35, 17,-16,-30,-20,-21,-18, 0, 16,-22, 22,-15; /M: SY='W'; M=-44,-42,-35,-29,-15, 20, -6,-31,-21,-16, 0,-22,-56,-27,-11, 0,-25,-33,-13,136, 63,-15; /M: SY='D'; M= -1, 35,-20, 46, 5,-31, -9,-11,-23, 1,-13,-13, 27,-14, -5, -9, -1, -4,-20,-45,-19, 0; /M: SY='R'; M= -1,-10,-24, -8, -2,-15,-14, -3,-12, 4,-12, -4,-10, 8, 6, 10, -1, -2,-10,-22, -7, -2; /M: SY='Q'; M= 2, 0,-23, -1, -3,-14,-11, -7,-13, 3,-12, -2, 5, -8, 6, 6, 5, 3,-10,-28,-11, -1; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='H'; M= -6, 5,-18, 8, 0,-20,-15, 23,-12, -7, -3, 1, 4, -9, -6,-10, -5, -6,-14,-35, -7, -3; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='P'; M= -3, -7,-21, -1, 8,-23,-10, -2,-19, 8,-16,-15,-11, 33, 2, -2, -2, -4,-20,-24,-13, 3; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='D'; M= -2, 11,-21, 15, 0,-15, -4,-10,-15, -1, -8, -9, 9,-13, -5, -8, -1, -6,-14,-26,-10, -3; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='Y'; M=-23,-21,-41,-16,-15, 22,-21, 6,-10, -7, 12, -8,-21,-17,-10, -4, -9,-10, -1, 13, 40,-16; /M: SY='R'; M= -3, -9,-20, -9, -2, -7,-10,-10,-13, 6,-10, 2, -7,-10, 7, 17, -5,-11,-10,-14, -5, -2; /M: SY='N'; M= -2, 13,-15, 12, 1,-16, -9, -9,-13, 3,-12, -4, 18,-14, -4, -3, 1, -2,-14,-35,-15, -3; /M: SY='K'; M= 0, -4,-23, -5, 2,-13,-10, -9,-14, 11,-13, 3, -1, -2, 5, 10, 0, -5,-12,-23,-11, 1; /M: SY='E'; M= 5, 0,-17, 6, 13,-24,-14, -7,-15, 6,-11, -7, -4, 4, 9, -4, 3, 1,-13,-27,-14, 11; /M: SY='M'; M= -2, -8,-14, -6, -3, -6,-17,-12, -4, -2, 1, 2, -7,-14, 1, 1, -6, -3, -1,-19, 0, -3; /M: SY='R'; M= -4,-11,-21, -9, -3, -7,-16,-14,-14, 11,-11, 5, -9, -8, 8, 27, -5,-11, -6,-14, -3, -1; /M: SY='Q'; M= 2, 3,-22, 6, 6,-20,-11, -3,-16, 5,-11, -3, 1, -4, 7, 1, 1, -4,-14,-27,-13, 5; /M: SY='E'; M= 1, 1,-16, 6, 14,-23,-14, -5,-20, 10,-14, -4, -2, 2, 13, 9, 0, -8,-18,-23,-14, 12; /M: SY='A'; M= 18, -6,-21, -9, -8, -7, -6,-19, 7, -6, 0, 5, -4,-18, -2,-12, 2, 5, 10,-34,-19, -8; /M: SY='W'; M=-39,-39,-24,-32,-13, 17, -1,-36,-18,-17, -4,-20,-54,-28,-11, -3,-24,-35,-17,134, 48,-12; /M: SY='E'; M= 4, 3,-17, 7, 10,-22, -8,-11,-15, 5,-11, -5, -2, -6, 10, 1, 1, -5,-13,-23,-14, 9; /M: SY='E'; M= 4, -5,-13, -1, 18,-20,-13, -7,-16, 9,-10, 0, -7, -4, 17, 8, -1, -8,-15,-17,-12, 17; /M: SY='I'; M= 2,-18,-17,-29,-24, 5,-17,-17, 42,-16, 21, 13, -8,-32,-21,-21,-12, 2, 32,-28, 1,-24; /M: SY='A'; M= 16, -3,-20, -4, -3,-15, -1,-18, 0, -4, -7, -2, -4,-14, -2,-11, 8, 5, 3,-29,-21, -5; /M: SY='E'; M= 3, 1,-18, 4, 9,-21,-10, -7,-11, 5, -9, -2, 0, -6, 6, -1, 0, -4,-12,-26,-14, 6; /M: SY='E'; M= 3, 2,-11, 6, 17,-22,-15,-10,-14, 9, -9, -2, -2, -5, 7, -2, 0, -6,-12,-24,-14, 13; /M: SY='L'; M= -5,-15, -8,-20,-16, 14,-21,-12, 19,-14, 25, 12,-14,-29,-18,-16,-14, 0, 15,-20, 14,-16; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='G'; M= 0, 6,-24, -3, -1,-23, 22,-12,-13, 2,-18, -7, 14, -9, 0, -6, -2,-10,-25,-17,-24, -1; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='L'; M= -3,-11,-10,-12, -9, -1,-17,-16, 9,-10, 12, 4,-11,-21,-10,-13, -8, 1, 8,-17, 6,-10; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='S'; M= 8, 8,-24, 12, -1,-25, -6,-12,-14, -1,-12,-13, 4, 3, -3,-13, 14, 13, -9,-37,-18, -4; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='I'; M= 7,-10,-19,-13,-11,-10, -8,-17, 13, -6, -2, 0, -7,-14,-11,-11, -3, 1, 12,-27,-11,-12; /M: SY='E'; M= 2, 4,-16, 12, 17,-28,-13, -8,-21, 8,-12, -9, -3, 4, 10, 0, 2, -5,-17,-23,-14, 13; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='E'; M= 1, 1,-17, 6, 7,-18,-14, -4,-13, 2, -5, -4, -3, -6, 2, -7, 0, -3,-11,-26, -9, 5; /M: SY='C'; M= -6,-13, 33,-21,-12, -5,-23,-26, 15,-19, 10, 0, -7,-28,-20,-18,-11, -1, 12,-27,-13,-15; /M: SY='K'; M= 0, -8,-18, -7, 8, -8,-14,-13,-12, 12, -7, 5, -9, -6, 4, 8, -3, -9, -8,-16, -5, 5; /M: SY='R'; M= 2, -7,-17, -7, 4,-12,-14,-13,-10, 10, -8, 7, -6, -8, 5, 12, -1, -6, -7,-19, -9, 3; /M: SY='R'; M= 0, -9,-20, -6, 5,-14,-15,-13,-19, 16,-17, 6, -8, -1, 15, 29, -3,-11,-12,-17,-10, 6; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='W'; M=-31,-38,-21,-36,-16, 12, -2,-34, -4,-18, -3,-13,-45,-30,-14, -8,-23,-30, -7,109, 33,-16; /M: SY='K'; M= 0, 1,-23, -2, 4,-10,-11,-10,-13, 14,-13, 6, 7, -6, 5, 7, 1, -2,-14,-26,-10, 2; /M: SY='N'; M= 4, 7,-18, -2, -2,-14, -6, -8, -4, 1,-13, -2, 19,-13, 0,-10, 6, 6,-11,-37,-20, -2; /M: SY='L'; M= -5,-11, -8,-13,-11, 11,-19, -5, 18,-13, 30, 21,-15,-29,-17,-17,-17, 0, 10,-24, 18,-11; /M: SY='R'; M= -7,-17,-22,-10, -7, -9,-19, -5,-22, 8,-14, 4,-17,-10, 21, 57, -9,-23, -8, -7, 0, -1; /M: SY='D'; M= 0, 10,-12, 17, -1,-19,-13,-17,-15, -3, -6,-11, 4,-11, -5,-11, 4, 4, -8,-30,-10, -4; /M: SY='Q'; M= 0, -5,-13, -5, 1,-14,-11,-11,-15, 2,-13, -5, -3,-10, 11, 10, 1, -3,-13,-15,-11, 3; /M: SY='Y'; M=-31,-28,-48,-21,-24, 44,-29, -8, -5,-10, 27, -9,-30,-26,-15, -3,-17,-11, 10, 32, 67,-24; /M: SY='R'; M= -2,-10,-22, -9, -7,-10,-14, 1, -9, 0, -8, 3, -7,-12, 3, 16, -3, -7, -4,-21, -4, -5; /M: SY='R'; M= -2,-10,-22, -5, 0,-13,-16, -8,-18, 10,-15, 3,-10, -7, 15, 33, -3,-13,-10,-13, -6, 3; /M: SY='E'; M= -1, -7,-11, -2, 25,-19,-18, -2,-16, 7, -4, -5,-11, -2, 15, -5, -2, -9,-15,-10, -4, 22; /M: SY='L'; M= -7,-12,-14,-14, -6, 8,-20,-10, 3, -4, 10, 7,-11,-19, -6, -1,-10, -6, 2,-15, 10, -7; /M: SY='R'; M= 0, -5,-20, -5, 1,-12,-13, -8,-13, 11,-11, 9, -2, -7, 7, 18, -4, -9,-10,-23,-10, 1; /M: SY='R'; M= -1, -9,-22, -7, 1,-12,-14, -8,-14, 9,-12, 5, -9, -6, 13, 23, -4,-10,-10,-15, -5, 4; /M: SY='I'; M= 1,-12,-19,-14, -9, -5,-14,-10, 8, -5, 3, 5, -9,-19, -5, -6, -6, -2, 7,-18, -2, -9; /M: SY='Q'; M= -1, -5,-17, -5, 3,-15,-13, -4, -9, 3, -7, 1, -3, -5, 9, 6, -4, -6,-11,-23, -9, 4; /M: SY='K'; M= 1, -3,-19, -4, 4,-13,-12, -8,-10, 5, -8, 0, -1, -5, 5, 1, 1, 0, -9,-24, -8, 3; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='Q'; M= 0, -4,-19, -3, -1,-10, -1, 0, -8, -2, -6, -2, -5, -7, 2, 0, 0, -5, -9,-10, -5, -1; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='G'; M= 2, -1,-18, -2, 0,-15, 5, -8, -7, 1, -9, -6, -1, 0, -3, -7, 3, -2,-10,-16,-12, -2; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='E'; M= 1, 2,-13, 3, 4,-17, -1,-13,-11, 2,-10, -7, 2, -5, 1, -5, 1, -3,-12,-18,-13, 2; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='K'; M= -2, -3,-16, -1, 0,-13, -6,-10, -7, 1, -4, -4, -6, 0, -3, -5, -2, -1, -9,-18, -5, -2; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='Y'; M= -6, -9,-19, -9, -1, 0,-15, -9, -7, 1, -1, -4, -7, -5, -1, -3, -3, -3, -5, -9, 5, -2; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='Q'; M= 1, -6,-18, -7, 2,-14, -7, -7, -9, 3, -9, -4, -5, 4, 5, 0, -2, -3,-11,-21,-11, 1; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='P'; M= 2, -5,-19, -4, 1,-16, -8, -9, -8, 2,-12,-10, -5, 11, -2, -7, 6, 5,-10,-27,-14, -3; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='K'; M= -2, -7,-19, -6, 3,-14,-15, -8,-14, 9,-10, 2, -7, 0, 4, 7, 1, -2,-10,-19, -6, 1; /M: SY='W'; M=-27,-30,-20,-26,-13, 15, -7,-28,-10,-14, 1,-12,-38,-24,-11, -3,-19,-23, -9, 78, 33,-13; /M: SY='W'; M=-14,-14,-19, -8, 1, -3,-13,-15,-17, 0, -7,-13,-19, -3, 0, 2, -7,-13,-14, 16, 9, -2; /M: SY='Y'; M=-23,-24,-36,-21,-18, 28,-24, 5, -5,-12, 18, -4,-24,-22,-12, -7,-14,-11, 2, 17, 43,-18; /M: SY='F'; M=-10,-16,-25,-18,-16, 27,-21,-14, -2, -8, 12, -7,-13,-21,-12, -9, -6, -5, 5, -4, 20,-17; /M: SY='E'; M= 0, 7,-19, 16, 18,-26,-11, -7,-23, 12,-13, -6, -1, 2, 8, 3, -1,-10,-21,-22,-12, 13; /M: SY='E'; M= 2, -3,-21, 1, 8,-17,-14, -1,-13, 5, -8, 0, -6, -4, 6, 3, 1, -4,-11,-24, -8, 5; /M: SY='M'; M= -2,-13, -5,-18, -9, -1,-21, 3, 11, -3, 24, 29, -8,-31,-14,-11,-17, -1, 3,-25, 6,-10; /M: SY='D'; M= 0, -1,-21, 4, 3,-15, -9, -5,-14, 2, -8, -5, -6, -8, 0, 0, 3, -5,-12,-18, -7, 0; /M: SY='F'; M=-21,-30,-26,-47,-37, 89,-28,-30, 0,-11, 19,-18,-13,-39,-28,-10,-11,-20, 9, 15, 30,-37; /M: SY='L'; M= -4,-11, -9,-14,-11, 10,-17, -8, 17,-11, 29, 22,-13,-28,-16,-17,-15, 2, 9,-23, 17,-11; /M: SY='Q'; M= -1, 1,-22, 9, 7,-20,-13, -7,-18, 4, -9, -6, -7, -2, 10, 8, -3, -7,-13,-20, -5, 6; /M: SY='P'; M= 2, 6,-18, 12, 10,-28,-11, -6,-18, 4,-14,-13, 0, 13, 4, -7, 1, -1,-18,-32,-17, 6; /M: SY='H'; M= -5,-13,-25,-14, -7, -4,-17, 10, 0, -7, 0, 0, -9,-11, -8, -8, -5, -5, 0,-21, 0, -9; /M: SY='I'; M= -1, -8,-18,-10, -8, -2,-13,-12, 10, -7, 9, 2, -7,-18,-10,-13, -5, -1, 7,-21, 1, -9; /M: SY='Q'; M= 3, -2,-20, 1, 5,-20, -9, -8,-13, 3,-11, -5, -4, 0, 7, 1, 3, 0,-12,-24,-11, 4; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 1 |
| Number of true positive hits | 1 |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 2 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 33.33 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | MADF |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
1 sequence
ADF1_DROME (P05552)
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
2 sequences
ENAP1_ARATH (Q8VZI9), ENAP2_ARATH (Q9FFG0) |