PROSITE entry PS51284
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | DOC |
Accession [info] | PS51284 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-JAN-2007 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC51284 |
Associated ProRule [info] | PRU00614 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | DOC domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=183; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=178; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.6782188; R2=0.0115543; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=418; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=245; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='P'; M= -4,-18,-23,-22,-14, 5,-20,-16, -2,-16, -5, 3,-14, 9,-14,-17, -5, 0, -5,-19, -6,-15; /M: SY='T'; M= -6, -1, -5, -3, -8,-18,-21,-16, -6,-13,-11, -8, -4,-17, -7,-15, 4, 9, 0,-33,-13, -8; /M: SY='G'; M= -2, -4,-26, -9, -8,-20, 8,-15,-12,-13,-16,-11, 3, -6,-10,-16, -1, -6,-14,-26,-19,-10; /M: SY='E'; M= -4, -6,-26, -7, 4,-21, -8,-11,-14, -2,-16,-11, -1, -5, -1, 2, 0, -6,-14,-26,-17, -1; /M: SY='P'; M= -6, -3,-27, -5, 1,-21,-17,-10, -6, -9,-17,-10, 4, 10, 1,-12, 3, -2,-13,-31,-17, -1; /M: M=-11,-14,-27,-14, -4, -4, -6,-12,-15, -6, -4, -5,-11,-13, -5, -2,-12,-12,-15,-17, -8, -5; /M: SY='T'; M= -1,-10,-21,-14, -7, -3,-16,-15,-15, -6,-16,-11, -7, -8, -5, -8, 5, 7,-12, -7, -4, -5; /M: SY='D'; M= -8, 5,-25, 12, 1,-25, -6, 1,-21, -9,-17,-13, 1, -7, 0,-11, 1, -6,-16,-31,-14, 0; /M: SY='T'; M= -5,-17,-20,-18,-12, -2,-21,-17, -1,-11, -4, 1,-14, -1,-13,-12, -3, 3, 2,-24, -9,-13; /M: SY='R'; M= -9, -8,-24, -9, 3, 1,-11,-11,-21, 3,-17,-12, -3,-15, -6, 4, 0, -5,-16,-18, -5, -1; /M: SY='A'; M= 1,-14,-25,-17, -7,-15,-13, -4, -3,-11, 0, 1,-10,-18, -2, -6, -9,-10, -5,-22, -8, -7; /M: SY='R'; M=-14, -7,-15, -6, -5,-18,-21,-10,-18, 0,-11, -4,-10,-11, 0, 3,-14,-12,-17,-11, -9, -3; /M: SY='H'; M= -8, -2,-25, 0, -4,-18, -7, 12,-20,-10,-19, -7, -1, 0, -3,-11, 3, -2,-18,-26, -4, -6; /M: SY='Q'; M= -8, -5,-23, -4, 3,-17,-19, -9, -9, -3, -4, -4, -5,-16, 4, 0, -2, -4, -9,-27,-11, 2; /M: SY='E'; M= -4, 2, -1, 3, 13,-24,-19,-11,-19, -6,-17,-14, -2,-13, 3,-11, 3, -1,-15,-33,-18, 8; /M: SY='Q'; M=-12, -2,-26, -4, 3,-12,-22, -4, -6, -7, -2, 0, -1,-17, 13, -6, -9, -9,-14,-22, -6, 8; /M: SY='K'; M= -8, -8,-12, -7, 2,-23, -6,-13,-25, 3,-19,-13, -6, -6, -4, 2, -5, -9,-19,-28,-19, -2; /M: SY='R'; M= -8, -6,-24, -6, -8, -6, -9, -9,-15, -3,-16,-10, -2,-18, -7, 1, 1, -4,-11,-19, -1, -9; /M: SY='T'; M= -2, -8,-16, -8,-10,-13,-17,-16, -2,-13, -7, -2, -8, -7,-10,-14, 7, 10, 4,-32,-14,-11; /M: SY='A'; M= 2,-12,-19,-14, -8,-14, -5,-16, -6, -7, -5, 1,-10,-17, -9,-10, -1, -1, 0,-25,-14, -8; /M: SY='E'; M=-10, -4,-10, -5, 6,-14,-13,-11,-20, -6,-12,-13, -3, -8, -5, -4, -5, -5,-18,-28,-16, 0; /M: SY='L'; M= -9,-19,-18,-20,-20, 6,-26,-17, 15,-20, 19, 18,-22,-26,-19,-17,-18, -7, 17,-23, -3,-19; /M: SY='R'; M= -9,-11,-25,-12, -3,-18,-22,-12,-12, 18,-12, -4, -6,-17, 0, 21, -7, -6, -5,-23, -9, -3; /M: SY='D'; M=-16, 27,-31, 38, 25,-30,-13, -2,-33, 1,-26,-25, 11,-10, 4, -7, -3,-11,-30,-17,-15, 15; /M: SY='I'; M= -8,-14,-24,-15,-18, -8,-28,-22, 22,-21, 8, 6,-13,-20,-16,-22,-10, -5, 17,-27, -7,-19; /M: SY='T'; M= -3, -3,-20, -8, -7,-20, 3,-15,-23, 2,-21,-13, 1,-13, -6, 3, 9, 15,-13,-26,-16, -7; /M: SY='S'; M= -2, -2, 3, -6, -1,-20,-13, 0,-20, -4,-20, -8, 3,-17, -1, -7, 7, -1,-14,-34,-15, -2; /M: SY='W'; M=-12,-21,-28,-22, -8, 0,-26,-15, 1,-14, 4, 2,-19,-21, -1,-12,-17,-12, -4, 9, 3, -3; /M: SY='A'; M= 29, -8,-15,-12, 1,-21, -9,-17,-11, -1,-12, -9, -9,-11, -5,-11, 4, -3, -2,-23,-18, -2; /M: SY='D'; M= -9, 0,-24, 3, -1,-20,-20,-11,-10, 2,-10, -6, -4,-17, 0, 2, -4, -5, -4,-28,-11, -2; /M: SY='W'; M=-13,-34,-34,-37,-29, 5,-29,-29, 14,-24, 5, 2,-31,-27,-22,-23,-28,-17, 6, 50, 11,-25; /M: SY='S'; M= 2, 5,-18, 2, 9,-22,-11, -9,-21, 6,-23,-15, 8, -9, 2, 0, 14, 11,-15,-31,-16, 6; /M: SY='L'; M= 0,-23, -5,-25,-19, -5,-25,-24, 8,-21, 13, 3,-23,-15,-20,-20,-11, 0, 13,-27,-11,-20; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='C'; M=-10, -5, 12,-11, -8, -9,-19,-11,-19, -6,-17,-13, 1,-24,-10, 3, -2, -4,-10,-31,-14, -9; /M: SY='K'; M= -3,-10,-29, -8, 2,-27,-19,-14,-18, 16,-23, -9,-10, 15, 4, 4, -7, -8,-14,-24,-16, 2; /M: SY='H'; M= 4, -4,-22, -7, -4,-19,-11, 16,-17,-11,-15, -9, 3, -1, -3,-11, 3, -4,-16,-30, -9, -6; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='G'; M= -8,-12,-27,-12, -7,-20, 3, -7,-16, -3,-14, 3, -8, 3, 1, 2, -8,-11,-17,-20,-15, -4; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='V'; M= 9,-25,-17,-31,-25, 2,-25,-26, 22,-21, 7, 6,-21,-22,-23,-23, -8, -4, 26,-21, -6,-25; /M: SY='D'; M= -8, 14,-25, 20, 6,-27, -3, -8,-23, -5,-23,-18, 8,-12, -2, -6, 8, -3,-17,-33,-18, 1; /M: SY='R'; M=-11, -8,-10, -8, 6,-13,-21, -9,-21, 6,-14,-10, -6,-17, 3, 10, -5, -7,-16,-24,-10, 4; /M: SY='L'; M= -3,-28,-18,-29,-20, 6,-27,-21, 18,-27, 41, 16,-28,-28,-20,-20,-24, -8, 13,-21, -3,-20; /M: SY='T'; M= -9,-14,-20,-19,-13, -6,-25,-16, 0, -8, 8, 2,-10,-19, -9, 4, -5, 13, 1,-24, -6,-13; /M: SY='D'; M=-17, 41,-28, 57, 16,-36,-10, 9,-37, -2,-29,-26, 18,-11, 1, -9, 2, -8,-28,-39,-16, 8; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='D'; M=-13, 21,-26, 29, 17,-28, -3, 15,-31, -2,-23,-18, 13,-10, 4, -6, -1,-11,-27,-30,-12, 10; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='N'; M= -1, 14,-18, 5, -4,-20, 5, -4,-18, -8,-27,-17, 28,-16, -3, -8, 19, 5,-18,-37,-20, -4; /M: SY='T'; M= -4,-15,-22,-16,-13,-10,-11,-15, -3,-15, -7, -2,-11, -2,-12,-16, 0, 2, -3,-23, -6,-14; /M: SY='E'; M=-12, 18,-30, 29, 42,-32,-18, -2,-32, 14,-24,-21, 5, -4, 13, 2, -2,-10,-28,-31,-18, 28; /M: SY='T'; M= -3, -5,-16,-11, -8,-12,-21,-19,-10, -7, -8, -8, -5, -1, -9, -9, 9, 33, -4,-28,-11, -9; /M: SY='Y'; M=-12,-22, -9,-27,-23, 35,-27, -2, -4,-18, 0, -3,-19,-29,-21,-16,-16, -9, -6, 10, 43,-23; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='Q'; M=-11, 3,-30, 7, 33,-34,-20, 5,-25, 12,-20, -9, 0, -7, 40, 12, -1,-10,-29,-24,-14, 36; /M: SY='S'; M= 9, 0,-10, -1, -1,-19, -2,-11,-19,-10,-28,-19, 9,-10, -1,-10, 38, 23, -9,-39,-19, -1; /M: SY='D'; M=-10, 29,-25, 32, 4,-31, 11, -3,-33, -5,-30,-24, 25,-15, -4,-10, 7, -6,-28,-36,-22, 0; /M: SY='G'; M= -4, -2,-29, 0, -7,-28, 43,-14,-33,-14,-24,-13, 0,-17,-12,-16, -2,-17,-26,-23,-25, -9; /M: SY='S'; M= 2, -1,-20, 3, 12,-25, -1, -8,-24, -5,-27,-19, 4, 0, 5, -8, 21, 5,-19,-34,-21, 8; /M: SY='Q'; M= -6, 6,-27, 10, 11,-32,-17, -2,-20, 0,-17, -9, 0, -2, 24, -3, -1, -4,-23,-26,-14, 17; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='P'; M= -4,-10,-28, -6, 0,-25,-15,-16,-20, -4,-28,-18, -8, 42, -5,-11, 7, 5,-20,-32,-23, -5; /M: SY='H'; M=-19, -1,-30, -1, 1,-21,-20, 77,-30, 1,-21, -2, 8,-19, 10, 11,-10,-18,-28,-28, 14, 1; /M: SY='Y'; M=-10, -9,-24,-13, -9, -4,-19, -6,-10, -7, -7, -6, -4,-20, -2, -2, -4, 3,-12, 0, 8, -6; /M: SY='I'; M= -3,-28,-23,-35,-26, 0,-33,-27, 35,-27, 22, 16,-23,-23,-21,-25,-18, -8, 26,-21, -3,-26; /M: SY='T'; M= -8, 4,-19, 0, -4,-14,-16, 0,-14, -7, -8, -8, 7,-17, -4, -1, 4, 10,-11,-31, -9, -5; /M: SY='I'; M=-10,-30,-23,-35,-26, 11,-34,-25, 32,-29, 29, 17,-25,-26,-23,-24,-22, -9, 22,-18, 2,-26; /M: SY='Q'; M=-11, 4,-26, 2, 15,-25,-18, 17,-20, 5,-17, -2, 6,-12, 21, 3, -1, -5,-22,-27, -7, 17; /M: SY='F'; M=-15,-27, -6,-36,-27, 40,-29,-19, 7,-27, 14, 12,-21,-28,-28,-21,-20,-10, 5, -8, 12,-26; /M: SY='H'; M= -9, -5,-21, -4, -5, -9,-18, 5,-13, -5,-14, -7, -2,-19, -2, 3, 0, -4, -6,-26, -4, -5; /M: SY='K'; M=-12, -4,-31, -1, 12,-28,-20, -8,-29, 34,-26,-12, -2, -1, 9, 31, -9,-10,-22,-22,-13, 9; /M: SY='R'; M= -9, 0,-28, 2, -1,-28, 7, -9,-33, 14,-28,-16, 3,-15, 0, 18, -1, -9,-23,-24,-18, -2; /M: SY='V'; M= 3,-17,-15,-24,-20, -5,-24,-23, 15,-17, 4, 8,-15,-18,-16,-18, -1, 14, 20,-26, -8,-19; /M: SY='D'; M=-11, 13,-22, 14, -1,-17,-15, 5,-15,-11, -6, -9, 10,-18, -5,-10, -2, -2,-15,-33, -9, -3; /M: SY='I'; M= 1,-26,-21,-31,-27, -5,-20,-28, 27,-23, 8, 9,-20,-22,-22,-24,-11, -6, 27,-24, -9,-27; /M: SY='R'; M= -5, -4,-11, -5, 5,-23,-16, 3,-27, 11,-22,-13, 0,-16, 4, 18, 1, -5,-18,-28,-12, 2; /M: SY='Y'; M=-12,-15,-26,-18,-10, -3,-26, 0, 1, -4, -3, 6,-13,-21, 6, 0,-10, -4, -3, -7, 18, -5; /M: SY='L'; M= -7,-28,-18,-31,-24, 5,-29,-20, 25,-23, 31, 24,-28,-28,-19,-19,-22, -7, 23,-23, -3,-22; /M: SY='T'; M= 3, -8, -4,-13, -9,-13,-14,-10,-11, -5,-13, 0, -5,-16, -5, -8, 9, 10, -5,-27, -8, -7; /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-33,-24, 11,-30,-20, 27,-25, 29, 25,-25,-26,-19,-20,-23, -9, 18,-19, 1,-22; /M: SY='Y'; M=-17,-24,-25,-28,-22, 33,-30, 5, 5,-21, 11, 5,-18,-28,-20,-16,-21,-11, -2, 4, 37,-22; /M: SY='V'; M= -1,-26,-16,-30,-24, 8,-28,-25, 21,-23, 19, 10,-24,-26,-24,-20,-14, -2, 25,-22, -3,-24; /M: SY='D'; M= -5, 31,-25, 43, 13,-35, -8, -3,-31, -2,-26,-23, 12,-10, 4,-10, 5, -6,-23,-35,-19, 8; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='Y'; M=-12, -3,-18, -9,-11, 13,-15, 7, -2, -7, -4, 1, 3,-19, -7, -6, -8, -5, -9, 0, 25,-10; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='S'; M= 5, -6,-20, -8, -2,-21,-12,-15,-14, 2,-21,-12, -1, 0, -3, -5, 12, 7, -9,-29,-16, -4; /M: SY='R'; M= 1, -5,-22, -7, 5,-17,-14, -7,-17, 4, -9, -9, -1,-15, 1, 14, -1, -5,-13,-25,-14, 1; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='E'; M= -5, 3,-24, 9, 35,-23,-16, -5,-22, 0,-15,-16, -1, -6, 10, -5, 7, -2,-20,-32,-18, 23; /M: SY='S'; M= 8, -2,-14, -2, -4,-22, 15,-12,-24,-12,-30,-20, 8,-12, -4,-12, 31, 11,-14,-36,-22, -4; /M: SY='Y'; M=-19,-14,-29,-16,-18, 25,-27, 19, -2, -9, -3, -2,-11,-29, -9, -9,-17, -9,-12, 22, 69,-18; /M: SY='T'; M= -2, -9, -4,-17,-11,-12,-19,-12, -8, -1, -6, 8, -8,-17, -5, 0, -1, 10, -3,-26,-10, -9; /M: SY='P'; M= -9,-22,-36,-15, -6,-24,-23,-22, -7,-13,-20,-12,-21, 65,-13,-21,-11, -9,-15,-29,-25,-14; /M: SY='S'; M= 13, -2,-12, -4, -1,-21, -4,-11,-17, -8,-24,-15, 5,-10, 3,-10, 29, 17, -9,-34,-18, 1; /M: SY='R'; M= -7, -7,-22, -7, 3,-16,-18,-10,-16, 7, -9, -7, -4,-15, 1, 14, 0, 2,-11,-26,-11, 1; /M: SY='I'; M= -5,-29,-19,-33,-28, 1,-32,-26, 35,-23, 18, 20,-25,-25,-22,-22,-16, -5, 35,-25, -5,-27; /M: SY='R'; M= 1,-11,-17,-13, -8,-16,-18,-14, -7, 2,-12, -5, -8,-17, -2, 7, 4, 5, 4,-27,-13, -6; /M: SY='V'; M= -7,-30,-17,-35,-30, 17,-33,-28, 29,-25, 13, 10,-25,-28,-30,-23,-15, -5, 34,-19, 1,-30; /M: SY='R'; M=-10, -6,-12, -5, -5, -8,-19, -8,-18, 3,-13,-10, -4,-20, -5, 6, -3, -4,-12,-21, -2, -6; /M: SY='A'; M= 13,-13,-17,-18,-16,-15, 9,-18,-10,-15, -7, -3, -9,-17,-14,-17, 2, -1, -3,-23,-17,-15; /M: SY='G'; M= -1,-12,-30,-13,-21,-27, 58,-21,-30,-21,-25,-16, -2,-20,-20,-21, -2,-19,-24,-20,-27,-21; /M: SY='B'; M=-10, 17,-22, 17, 3,-21,-13, 4,-21, -1,-17,-14, 15,-15, -2, -4, 3, 3,-18,-33,-11, 0; /M: SY='S'; M= 7, 4,-17, 1, 2,-23, 11, -9,-24, -8,-27,-19, 12,-12, -3,-10, 21, 4,-18,-33,-22, 0; /M: SY='F'; M=-11,-10,-20,-12,-13, 9,-23, -9, -6,-17, -2, -5,-10,-10,-18,-15, -6, 6, -2,-21, 0,-15; /M: SY='N'; M= -5, 11,-22, 6, 8,-26, 0, 8,-24, -3,-26,-15, 20,-14, 11, -3, 12, -2,-25,-32,-16, 9; /M: SY='D'; M=-15, 32,-15, 38, 8,-31,-10, -1,-33, 0,-28,-24, 22,-15, -1, -1, 3, -6,-26,-39,-20, 3; /M: SY='L'; M= -6,-27,-25,-30,-20, 2,-27,-20, 13,-21, 25, 10,-24,-25,-16,-12,-23,-11, 5, -3, 0,-19; /M: SY='Q'; M=-13,-13,-15,-15, -4,-12,-17, -4,-17, -3,-15, -7, -9,-20, 1, 0,-12,-14,-17, -6, -4, -2; /M: SY='E'; M=-12, -4,-24, -4, 6, 0,-23,-11,-11, -7, -4, -7, -6,-15, -6, -3, -6, 0, -9,-21, -5, 0; /M: SY='L'; M=-11,-18,-25,-18, -5, -4,-28,-13, 8, -8, 11, 5,-17,-20, -8, -5,-17, -9, 4,-18, 2, -9; /M: SY='K'; M= -9, -8,-23,-11, -1,-17,-22, -9,-12, 12, -6, 3, -7,-15, 8, 11, -7, 2,-10,-22, -7, 3; /M: SY='T'; M= -5, 1,-18, -6, -5,-13,-16, -3, -8, -5,-12, -2, 5,-16, 6, -5, 7, 12, -8,-24, -3, 0; /M: SY='L'; M= -7,-20,-19,-23,-15, -5,-25,-16, 11,-14, 13, 10,-17,-22, -8, -7,-10, -1, 11,-24, -6,-13; /M: SY='D'; M= -9, 9,-22, 10, 9,-22,-18, -7,-16, 0,-16,-12, 5,-13, 3, 1, 2, 4,-10,-31,-15, 6; /M: SY='L'; M= -8,-19,-18,-24,-22, 7,-26,-19, 18,-22, 19, 9,-14,-27,-21,-18,-16, -6, 16,-23, -3,-22; /M: SY='D'; M=-10, 12,-22, 13, 8,-20,-17, -7,-14, -1,-16,-13, 8,-16, -3, -1, 0, -2, -7,-33,-16, 2; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='E'; M= -4, 2,-22, 0, 17,-20,-14, 0,-15, 5,-11, -1, 1, -9, 12, 5, -2, -7,-16,-23,-13, 14; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='P'; M=-10,-17,-31,-11, -5,-16,-20, -2,-12,-10,-19,-11,-16, 44, -9,-15,-10, -9,-17,-20, -8,-11; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='S'; M= -4, -2, -5, -7, -3,-21,-16,-10,-13, -4,-19, -9, 4,-15, 6, -6, 10, 8,-11,-32,-14, 1; /M: SY='G'; M= 8, -9,-25,-12,-17,-26, 49,-20,-32,-17,-25,-17, -2,-17,-17,-19, 4, -9,-22,-21,-26,-17; /M: SY='W'; M=-15,-24,-41,-22,-20, 0,-16,-24,-22,-16,-23,-21,-26,-25,-15,-17,-23,-20,-27, 99, 17,-14; /M: SY='V'; M= -5,-21,-16,-24,-20, -4,-27,-22, 13,-12, 6, 5,-19,-24,-18, -4, -7, 6, 23,-26, -8,-20; /M: SY='T'; M= -3, -8,-20,-12, -7, -9,-21, 3,-11, 0,-12, -4, -6,-17, -4, -2, -2, 4, -3,-23, -2, -6; /M: SY='I'; M= -5,-26, -5,-31,-26, -3,-31,-27, 25,-25, 10, 9,-21,-25,-22,-24,-11, -4, 25,-28, -8,-26; /M: SY='P'; M=-12,-11,-17, -5, 2,-22,-22,-15,-18, -9,-14,-13,-14, 28, -8, -9,-11,-10,-20,-30,-21, -6; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-34,-25, 13,-33,-24, 27,-29, 35, 17,-26,-27,-23,-23,-25, -9, 18,-18, 2,-25; /M: SY='E'; M=-10, -8,-27, -7, 5,-18,-14, -2,-18, 2, -9, -7, -7, -4, -1, 2, -9, -7,-17,-25,-11, 0; /M: SY='D'; M=-13, 37,-26, 46, 10,-34, 1, -2,-35, -3,-30,-26, 23,-13, -2, -9, 6, -6,-28,-38,-21, 4; /M: SY='N'; M= -4, -1,-24, -5,-11, -9, -3,-13,-10,-11, -6, -7, 3,-20,-12,-12, -7, -9,-11,-23,-11,-12; /M: SY='N'; M=-10, 8, -7, 2, -7,-13, -6, 1,-24, -8,-22,-16, 14,-20, -8, -3, 3, -1,-19,-31,-12, -8; /M: SY='R'; M= -5, -2,-25, -4, 0,-22, 0, 3,-25, 6,-21,-11, 5,-17, 0, 13, -3,-10,-18,-25,-14, -2; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='N'; M=-13, 8,-23, 6, 6, -7,-15, 7,-21, 7,-18,-11, 11,-14, -1, 3, -5, -8,-20,-21, -3, 3; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='P'; M=-10,-13,-31,-10,-10,-11,-11,-14,-12,-13,-17,-12,-14, 11,-11,-16,-11,-11,-17, 9, 0,-12; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='H'; M= -8, -7,-21, -9, -5,-11,-17, 2, -4,-10, -2, -1, -4, 2, -1, -9, -7, -3,-10,-21, -6, -4; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='R'; M=-12,-15,-22,-16, -9, -7,-21, -9, -1, 3, 4, 2, -9,-18, -2, 22,-13, -8, -2,-16, -4, -9; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='V'; M= -5, -6,-11, -6, -9, -1,-15, -8, 2, -9, 2, 0, -9,-14,-10, -9, -4, 5, 6,-12, 3,-10; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='F'; M= -7,-12,-10,-15,-11, 16,-14, -8, 2, -5, 2, 6, -9,-13,-11, -5, -8, -4, 3, -4, 5,-10; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='M'; M= -5, -8, 1,-11, -8, -5, -9, 2, -6, -8, -5, 3, -6,-12, -4, -7, -4, -5, -6, -1, 0, -6; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28, 2,-38,-28, 43,-30, 27, 20,-22,-22,-20,-28,-22,-10, 25,-20, 0,-28; /M: SY='Q'; M=-11, 0,-30, 1, 21,-36,-20, 6,-23, 16,-21, -4, 0,-10, 46, 17, -2,-10,-28,-21,-11, 33; /M: SY='I'; M= -9,-29,-26,-37,-28, 1,-36,-26, 43,-27, 22, 23,-22,-22,-19,-26,-20, -9, 28,-21, -1,-27; /M: SY='Q'; M= 5, -6,-22, -8, 6,-22,-16, -8,-16, 6,-11, -6, -5,-12, 11, 8, -1, -2,-13,-22,-13, 8; /M: SY='I'; M=-10,-30,-22,-37,-29, 17,-35,-27, 32,-28, 19, 14,-23,-25,-26,-25,-19, -8, 26,-16, 4,-29; /M: SY='K'; M=-10,-14,-28,-15, -5,-16,-25,-15, -4, 13, -4, 6,-12, -6, -3, 4,-16,-10, -5,-21, -8, -5; /M: SY='R'; M= 3, -8,-23,-10, -4,-25, 3,-10,-20, 3,-19, -9, -4,-16, 5, 6, 1, -8,-13,-22,-17, 0; /M: SY='N'; M=-10, 11, 13, 0, -8,-22,-12, -7,-23,-10,-27,-20, 21, -2,-10,-12, 0, -5,-25,-41,-25,-10; /M: SY='H'; M=-16, 4,-29, 3, 10,-24,-18, 54,-27, 1,-21, -5, 12,-16, 18, 9, -5,-14,-29,-28, 3, 11; /M: SY='Q'; M= -8, 4,-28, 5, 21,-33,-16, 3,-22, 5,-23,-10, 5, 2, 32, 2, 4, -6,-28,-27,-16, 26; /M: SY='N'; M= 3, 11,-18, 2, -4,-22, 7, -7,-22, -2,-26,-17, 21,-15, -4, -5, 13, 5,-19,-32,-20, -4; /M: SY='G'; M= 0,-11,-27,-11,-18,-25, 52,-19,-31,-20,-21,-16, -2,-20,-18,-19, 1,-15,-24,-22,-26,-18; /M: SY='R'; M=-15,-14,-30,-16, -6,-16,-25,-10, -9, 18,-11, -2, -5,-18, 2, 36,-13,-10, -7,-20, -7, -6; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='D'; M=-16, 39,-24, 55, 16,-31, -8, 0,-31, 0,-24,-24, 16, -8, 0, -8, 0, -8,-24,-31,-16, 8; D=-5; /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='T'; M= -1, -4, 19,-11,-11,-11,-16,-17,-13,-12,-12,-11, -3,-14,-11,-12, 11, 24, -3,-28,-13,-11; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='H'; M=-13, -5,-22, -5, -2,-15,-17, 38,-18, 4,-14, -2, 1,-16, 4, 13, -8,-11,-13,-21, 5, -2; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='I'; M= -6,-29,-20,-34,-28, 1,-32,-25, 35,-23, 19, 22,-25,-25,-21,-22,-17, -6, 33,-24, -4,-26; /M: SY='R'; M=-20, -9,-30, -9, 0,-20,-20, 11,-30, 26,-20, -9, 1,-20, 10, 63,-10,-11,-21,-21, -7, 0; /M: SY='Q'; M= -8, -6,-29, -6, -2,-28, 12, 13,-26, -8,-17, -6, -1,-17, 15, -5, -4,-15,-26,-22,-11, 6; /M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-34,-27, 11,-33,-26, 31,-27, 25, 15,-26,-27,-25,-23,-20, -7, 27,-20, 0,-27; /M: SY='R'; M=-13, -7,-29, -8, 7,-20,-22, -6,-16, 22,-14, -1, -4,-14, 7, 28,-11,-10,-13,-22, -9, 5; /M: SY='I'; M= -6,-30,-21,-34,-28, 2,-34,-28, 37,-26, 22, 16,-26,-26,-24,-24,-18, -6, 33,-24, -4,-28; /M: SY='L'; M=-13,-25,-23,-25,-19, 13,-29, -2, 11,-23, 32, 13,-25,-29,-15,-16,-26,-11, 2, -7, 23,-19; /M: SY='G'; M= 8,-11,-23,-13,-19,-24, 42,-21,-26,-18,-21,-15, -4,-19,-19,-19, 2, -9,-15,-22,-25,-19; /M: SY='P'; M=-13,-21,-39,-14, -5,-18,-21,-15,-19, -7,-25,-17,-20, 52, -9, -9,-14,-12,-27, -3, -9,-11; /M: SY='K'; M= -8,-12,-25,-12, -1,-12,-23,-15, -7, 4,-13, -5,-10, -4, -2, -2, -6, -6, -4,-22, -9, -2; /M: SY='R'; M= -7, 1,-28, 2, 7,-23,-17, -7,-19, 5,-19,-14, 2, 3, 1, 11, -4, -8,-19,-27,-17, 2; /M: SY='E'; M= 3, 0,-21, 0, 11,-24, 1,-12,-25, 0,-22,-16, 1, -9, 0, -6, 11, 4,-17,-28,-19, 6; /M: SY='E'; M=-11, -6,-25, -6, 9, -8,-20, -8,-20, 4,-17,-11, -4, -3, 4, 9, -1, -1,-18,-21, -8, 6; /M: SY='H'; M= -8,-12,-26,-11, -4, -9,-18, 5,-15,-10,-17,-11, -9, -9, -5,-11, -2, -2,-14, 3, 5, -5; /M: SY='P'; M= -2, -3,-26, -1, 2,-22, -8,-10,-16, -8,-18,-12, -4, 4, 0,-12, 2, -1,-16,-24,-13, -1; /M: SY='T'; M= -6, 0,-22, 2, -5,-19,-12,-16,-11, -7,-12,-10, -3, -8, -9,-11, 1, 5, -6,-29,-14, -8; /M: SY='L'; M= -5,-18,-21,-23,-15, 5,-24,-18, 3,-14, 6, 6,-16, -8,-15,-14,-10, 2, 1,-18, -3,-15; /M: SY='R'; M= -1, -2,-21, -8, -3,-10,-14, 3,-16, 1,-14, -9, 5,-18, -3, 11, -2, -6,-11,-24, -8, -5; /M: SY='E'; M= -5, -4,-27, 0, 10,-21, -9, -9,-20, -1,-10,-11, -6, -5, -1, 2, -7,-10,-18,-25,-17, 4; /M: SY='Q'; M= -5,-15,-26,-17, -3,-11,-21, -9, -4, -4, -6, 3,-13,-17, 8, -2,-10,-10, -6, -4, -4, 3; /M: SY='I'; M= -4,-24,-15,-27,-19, -4,-21,-24, 8,-23, 4, 1,-19, 0,-19,-24,-14,-10, 1,-22,-10,-22; /M: SY='T'; M= -5,-11, 3,-15, -9, -8,-19,-16,-15,-12,-12,-10, -8,-10, -7,-12, 4, 7,-10,-29,-12, -8; /M: SY='T'; M= -2,-11,-20,-16,-13, -5, -4,-13,-14, -9, -7, -7, -7,-19,-12, -2, -1, 7, -9,-17, -3,-13; /M: SY='S'; M= 1, -9,-22,-10, -3,-17,-10, -6,-12, -9,-12, -8, -5, -4, -4, -7, 4, 1,-10,-28,-13, -5; /M: SY='S'; M= -3, -3,-19, -1, -4,-19,-14, -3,-15,-10,-20,-13, -1, 5, -6,-12, 12, 12, -9,-34,-14, -6; /M: SY='H'; M= -2, -5,-11, -6, -3,-11,-18, 7,-16, -9, -8, -7, -6,-19, -7, -7, -6, -9,-10,-26, -6, -6; /M: SY='M'; M= -8, -6,-22, -9, -7,-13,-13, -9, -3,-12, 4, 5, -5,-20, 1,-10, -8, -3, -5,-25,-10, -3; /M: SY='F'; M=-14,-14,-24,-19, -8, 23,-23,-10, -5,-15, 1, 1, -9,-13,-11,-12,-13, -9,-10,-11, 5, -8; /M: SY='Y'; M=-15, -9,-28,-11, 0, 3,-25, -1, -4, -5, -6, -4, -5,-19, -1, -2,-11, -9,-10, -8, 15, -3; /M: SY='S'; M= 1, -3,-20, -5, 1,-18,-13,-10,-13, 0,-17, -7, 1, -5, -2, -1, 7, 4, -8,-30,-16, -1; /M: M=-13, -3, -9, -1, -3, -6,-21,-12,-15, -6,-12,-11, -5,-20,-10, 0, -5, -7, -8,-26, -9, -7; /M: SY='E'; M= -8, 3,-27, 3, 7,-24,-18, -7,-18, 6,-19,-12, 3, -3, 6, 7, -1, -2,-17,-27,-15, 5; /M: SY='B'; M= 5, 9,-22, 8, 3,-28, -2, -6,-24, -1,-21,-14, 7,-13, 7, -2, 4, -4,-19,-26,-18, 5; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 27 in 27 different sequences |
Number of true positive hits | 27 in 27 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | CJA_Sigrist |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | DOC |
Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
27 sequences
APC10_ARATH (Q9ZPW2), APC10_BOVIN (Q2YDH1), APC10_CAEEL (H2L2B8), APC10_DICDI (Q55ER5), APC10_DROME (Q9V831), APC10_HUMAN (Q9UM13), APC10_MOUSE (Q8K2H6), APC10_SCHPO (O42971), APC10_YEAST (P53068), CUL7_HUMAN (Q14999), CUL7_MOUSE (Q8VE73), CUL7_PONAB (Q5RCJ3), CUL7_RAT(D3ZEF4), CUL9_HUMAN (Q8IWT3), CUL9_MOUSE (Q80TT8), HECD3_HUMAN (Q5T447), HECD3_MOUSE (Q3U487), HERC2_DROME (Q9VR91), HERC2_HUMAN (O95714), HERC2_MOUSE (Q4U2R1), HIW_DROME (Q9NB71), MYCB2_DANRE (F1RD40), MYCB2_HUMAN (O75592), MYCB2_MOUSE (Q7TPH6), RPM1_CAEEL (Q17551), ZZEF1_HUMAN (O43149), ZZEF1_MOUSE (Q5SSH7)» more
|
PDB [Detailed view] |
28 PDB
1GQP; 1JHJ; 4UI9; 5A31; 5G04; 5G05; 5KHR; 5KHU; 5L9T; 5L9U; 5LCW; 6Q6G; 6Q6H; 6TLJ; 6TM5; 6TNT; 7RGW; 7Z8B; 8A3T; 8A5Y; 8A61; 8PKP; 8Q7E; 8Q7H; 8RHZ; 8TAR; 8TAU; 9GAW » more |