PROSITE entry PS51411
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | PSP1_C |
| Accession [info] | PS51411 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-NOV-2008 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51411 |
| Associated ProRule [info] | PRU00744 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | PSP1 C-terminal domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=87; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=82; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.6299697; R2=0.0119932; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7327.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=657; H_SCORE=7327; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=490; H_SCORE=7327; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='G'; M= 0, -8,-26, -9, -4, -8, 2,-11, -6, 1, -4, -1, -9, 2, -7, -8, -4, -4,-10,-18, -5, -7; /M: SY='K'; M= 1, -6,-18, -3, 6,-16,-11, -8,-15, 7,-14, -6, -8, 6, 3, 5, 4, -3,-13,-23,-13, 2; /M: SY='I'; M= 4,-18,-16,-29,-27, 6,-18,-24, 41,-18, 14, 4, -7,-31,-21,-20, -8, 4, 36,-29, -4,-26; /M: SY='I'; M= -3,-14, -7,-18,-14, 6,-19, -9, 24,-15, 23, 14,-13,-27,-16,-17,-14, -1, 16,-24, 9,-14; /M: SY='R'; M= -8,-17,-22, -9, -7,-13,-11, -8,-26, 8,-19, -3,-17, -5, 21, 58, -7,-25,-13, -4, -4, -1; /M: SY='M'; M= -3,-10,-10,-12, -3, -4,-12,-14, 1, -2, 1, 2,-10, -8, -6, -3, -8, -6, -2,-20, -4, -5; /M: SY='A'; M= 30, -3,-27, -6, -4,-16, -5,-17, 5, 0, -4, 13, -1,-13, 4,-11, 6, 10, 11,-45,-30, -4; /M: SY='T'; M= 7, 7,-21, 4, -7,-22, -9,-13, -8, -5, -8, -5, 11, -6, 1,-16, 12, 21, -4,-40,-16, -4; /M: SY='P'; M= 5, 3,-22, 10, 11,-29, -6, -5,-18, 4,-14,-12, -4, 14, 4, -9, 3, 0,-18,-30,-18, 7; /M: SY='E'; M= 3, 3, -6, 7, 22,-28,-14, -6,-18, 8,-10, -4, 1, 0, 12, -5, -1, -6,-19,-26,-19, 19; /M: SY='D'; M= 2, 27,-18, 50, 21,-41, -6,-14,-31, 5,-10,-21, 2, -5, -2,-11, 2,-11,-21,-27,-15, 12; /M: SY='I'; M= 2, -7,-17, -7,-11, -2,-16,-14, 15,-10, 12, 6, -8,-21,-13,-15, -6, 2, 14,-28, 2,-12; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='A'; M= 4, -1,-18, 2, 3,-18,-10, -5, -5, -2, -4, -1, -4,-11, 2, -6, -2, -4, -5,-26,-11, 1; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='Q'; M= 2, -8,-22, -6, 1,-13,-16, -4, -7, 2, -6, 4, -8, -9, 14, 10, -6, -5, -6,-21, -4, 5; /M: SY='Y'; M= -5,-13,-22,-15,-12, 4,-14,-13, 6, -9, 8, 3,-11,-24, -7, -9,-10, -5, 5, -1, 9,-11; /M: SY='E'; M= 4, 0,-15, 2, 13,-20,-14, 2,-13, 3, -8, 0, -2, -6, 8, -4, 2, -3,-13,-29,-13, 10; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='Q'; M= 2, -2,-16, 1, 6,-21, -8, -5,-17, 3,-12, -4, -4, -3, 16, 10, -1, -6,-14,-17,-12, 9; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='N'; M= 3, 2,-10, -1, -4, -5, -8, -9, 2, -3, 1, 1, 6,-10, -3, -8, -1, 3, 1,-23, -7, -4; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='M'; M= -2, 5,-17, 6, 1,-12,-15, 2, -7, -1, 1, 7, 5,-15, -3, -4, -6, -4,-10,-33, -5, 0; /M: SY='R'; M= 3, -7,-21, -5, 1,-13,-11,-13,-12, 5,-10, 0, -7, -8, 11, 14, -1, -6, -7,-18, -8, 3; /M: SY='R'; M= 1, -4,-17, 3, 9,-19,-14,-10,-17, 7,-11, -5,-10, -5, 12, 15, -1, -9,-11,-17, -8, 8; /M: SY='R'; M= 1, -6,-19, -3, 3, -9,-16, -6,-12, 5, -4, 4, -7, -9, 7, 9, -3, -6, -8,-22, -5, 3; /M: SY='E'; M= 2, -4, -7, 1, 28,-28,-12, -2,-21, 10,-12, -6, -7, 1, 17, 2, 1,-12,-21,-15,-16, 25; /M: SY='E'; M= 5, -1,-18, 3, 8,-19,-11,-12,-15, 7,-12, -3, -3, -3, 8, 7, 2, -5,-11,-24,-15, 7; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='E'; M= 2, 1,-13, 3, 15,-18,-12, -9,-15, 10,-10, 0, 1, -5, 9, 4, 0, -7,-13,-21,-12, 12; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='A'; M= 24, -2,-24, -4, -4,-13, -4,-18, 6, -4, -2, 7, -2,-13, 1,-13, 6, 9, 10,-40,-24, -5; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='L'; M= -3,-13, -9,-15, -8, 5,-17,-14, 4, -4, 10, 9,-12,-20, -9, -3,-10, -5, 4,-16, 4, -8; /M: SY='Q'; M= 1, -2,-19, 1, 4,-19,-14, -7,-14, 4,-13, -3, -2, -6, 13, 13, -3, -7,-11,-21,-11, 5; /M: SY='F'; M= -3,-12,-16,-16, -9, 11,-20,-17, 4, -6, 9, -3, -9,-16, -9,-13, -4, 1, 7,-17, 5, -9; /M: SY='C'; M= -6,-14, 64,-20, -4,-11,-25,-33, -2,-18, 2, -7, -8,-28,-16,-15, -9, -6, 0,-26,-31, -9; /M: SY='R'; M= 0,-10,-20, -8, -2,-11,-17,-11,-13, 4,-10, 2, -8,-10, 23, 30, -6, -8, -9,-15, -3, 5; /M: SY='E'; M= 7, 1,-19, 4, 16,-23, -8, -8,-18, 10,-14, -2, -1, -3, 16, 5, 1, -6,-16,-23,-18, 15; /M: SY='M'; M= -3,-11, -9,-13, -2, -3,-18,-11, -1, 3, 3, 11,-10,-14, -3, 2, -8, -6, -2,-18, -2, -3; /M: SY='I'; M= 8,-13,-15,-20,-18, 3,-16,-21, 23,-13, 9, 5, -7,-25,-14,-16, -3, 6, 23,-31, -6,-18; /M: SY='R'; M= 6, -4,-21, 0, 3,-17,-12,-12,-12, 7,-12, 0, -4, -8, 10, 15, 1, -6, -6,-24,-14, 3; /M: SY='E'; M= 2, 1,-15, 6, 20,-24,-12, -4,-21, 10,-11, -5, -3, 0, 12, 1, -1, -9,-20,-20,-14, 17; /M: SY='H'; M= -5,-10,-24, -9, -4, -9,-20, 26, -4, -8, 3, 9, -9,-11, -1, -2, -8, -6, -7,-28, 4, -3; /M: SY='G'; M= 2, 4,-26, -3, -3,-22, 15, -6,-12, 1,-16, -4, 10, -6, 0, -6, 0, -6,-20,-23,-22, -2; /M: SY='L'; M= -8,-12, -3,-14,-12, 17,-18,-14, 18,-17, 27, 11,-18,-29,-20,-17,-13, 0, 11,-15, 20,-14; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='P'; M= -2, 0,-19, 9, 17,-32,-10, 0,-25, 8,-18,-19, -8, 33, 6, -5, -1, -5,-26,-27,-17, 10; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='M'; M= 8,-17,-19,-25,-15, -7,-20, 1, 17, 4, 18, 36, -5,-35,-14, -8,-14, 4, 13,-30, -4,-15; /M: SY='K'; M= 0, -3,-17, -4, 10,-12,-16,-12,-13, 15,-10, 6, -1, -2, 4, 3, -1, -4,-11,-24,-10, 8; /M: SY='I'; M= -4,-16,-10,-23,-21, 20,-20,-19, 27,-18, 24, 8,-14,-32,-20,-16,-14, -1, 22,-21, 13,-20; /M: SY='I'; M= 2,-15,-15,-21,-19, 7,-18,-20, 33,-16, 18, 7,-12,-30,-20,-18,-10, 2, 28,-26, 5,-20; /M: SY='D'; M= -1, 23,-25, 39, 1,-34, 7,-19,-26, -1,-12,-18, 6,-10, -7, -7, 0,-10,-19,-25,-15, -4; /M: SY='V'; M= 10,-13, 15,-16,-12, -9,-21,-29, 15,-15, 3, 0, -9,-26,-13,-15, -5, 5, 20,-35,-21,-13; /M: SY='E'; M= 1, 2, -9, 14, 29,-30,-20, 1,-19, 7, -6, -7, -8, -3, 7, -8, -3,-12,-14,-20,-10, 22; /M: SY='Y'; M=-24,-25,-37,-23,-20, 37,-25, -4, -5,-10, 18, -9,-22,-23,-11, -4,-13,-12, 4, 16, 44,-19; /M: SY='Q'; M= 6, -8,-19,-11, 3,-17,-17, -4, -8, -3, -9, -5, -5, -4, 32, 6, -2, 8,-13,-23, -8, 12; /M: SY='F'; M=-10,-20,-21,-30,-24, 46,-14,-22, 5,-10, 17, -3,-12,-32,-21,-13,-11,-12, 5, -1, 16,-24; /M: SY='D'; M= 1, 41,-27, 72, 9,-45, -8,-18,-34, 0,-11,-25, 11, -9, -6,-10, 1, -7,-19,-38,-13, 2; /M: SY='R'; M= -3, -7,-21, -6, -3,-19, 11,-17,-19, 3,-15, -7, -8, -9, 5, 15, -3,-16,-18, -2,-13, -2; /M: SY='K'; M= 3, 0,-23, 0, 6,-17, -6,-11,-16, 12,-15, 0, 0, -1, 4, 5, 6, -1,-15,-24,-14, 3; /M: SY='K'; M= 0, -5,-30, -4, 10, -9,-11,-12,-14, 23,-13, 13, -4, 3, 2, 7, -1, -8,-13,-19, -6, 5; /M: SY='I'; M= -2,-14, -7,-17,-17, 12,-20,-17, 25,-17, 24, 10,-15,-30,-20,-17,-13, 2, 21,-23, 13,-17; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='T'; M= 3,-10,-22,-17,-20, -2,-19,-19, 15,-12, 8, 0, -3,-16,-10,-21, 5, 21, 19,-30, 1,-16; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='F'; M= -9,-24,-24,-38,-33, 53,-25,-26, 22,-15, 19, -7,-11,-37,-27,-14,-11, -8, 25, -9, 18,-33; /M: SY='Y'; M=-29,-24,-49,-15,-18, 24,-27, 8, -8, -9, 19, -5,-26,-18,-10, -3,-13, -8, 4, 22, 58,-18; /M: SY='Y'; M=-29,-29,-45,-26,-28, 55,-29,-13, -3,-11, 26,-12,-27,-29,-19, -5,-16,-13, 12, 29, 61,-28; /M: SY='T'; M= 3, -3,-18, -7, -8, -9,-13,-14, -4, -4, -4, -6, 1,-10, -1, -9, 12, 16, -1,-30, -7, -7; /M: SY='A'; M= 23, -3,-19, -4, -3,-17, -2,-19, -3, -2,-11, 1, -1,-11, 4, -6, 13, 9, 3,-39,-31, -4; /M: SY='D'; M= -1, 11,-17, 24, 19,-35,-12, -3,-27, 7,-14,-17, -1, 12, 4, -5, 1, -8,-24,-28,-16, 13; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='S'; M= 2, 1,-22, 2, 3,-24, -4, -3,-15, 3,-13, -5, 2, 0, 3, -4, 5, 1,-14,-28,-16, 2; /M: SY='R'; M=-10,-16,-22, -6, -4,-10,-20, -9,-26, 9,-15, -3,-18, -7, 23, 57, -9,-24,-10, -1, 4, 2; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='V'; M= 7,-15,-20,-22,-26, 3,-22,-24, 37,-17, 9, 2, -8,-30,-23,-16, -8, 8, 38,-33, 0,-26; /M: SY='D'; M= -1, 40,-23, 66, 9,-39,-10,-17,-30, 0, -8,-21, 15,-12, -8,-10, -1, -8,-19,-40,-12, 2; /M: SY='F'; M=-18,-27,-28,-43,-36, 84,-25,-28, 2,-11, 20,-16,-12,-38,-28,-11,-11,-17, 10, 7, 29,-36; /M: SY='R'; M= -5,-14,-20, -9,-10,-10,-17,-11,-22, 7,-18, 0,-11,-11, 22, 59, -5,-20, -7,-10, -5, -2; /M: SY='E'; M= 4, 1,-13, 6, 17,-27,-13, -8,-19, 7,-13, -9, -3, 4, 16, 3, 1, -4,-18,-23,-16, 16; /M: SY='L'; M= -8,-13, -5,-15,-13, 21,-21,-10, 20,-16, 36, 19,-17,-32,-20,-18,-19, -1, 11,-19, 25,-13; /M: SY='V'; M= 8,-14,-18,-17,-19, 1,-22,-21, 26,-15, 8, 3,-12,-28,-10, -8, -8, 8, 28,-29, 2,-16; /M: SY='R'; M= -3, -7,-24, -2, 4,-16,-10,-14,-24, 18,-19, 2, -9, 4, 14, 31, -3,-14,-17,-13, -8, 5; /M: SY='D'; M= 2, 10,-17, 24, 16,-29,-12,-12,-21, 5, -7,-12, -4, -2, 2, -7, 0, -8,-14,-23,-11, 10; /M: SY='L'; M= -9,-12, -5,-15,-13, 20,-20,-11, 23,-19, 36, 17,-18,-30,-20,-20,-19, -1, 14,-18, 27,-13; /M: SY='F'; M= 6,-10,-29,-16,-12, 12,-12, -6, -1, -6, -1, -3, -3,-19, -5, -8, -1, -4, 3,-24, -6,-12; /M: SY='R'; M= 1, -8,-24, -5, 0,-11,-11, -9,-20, 11,-17, 2, -6, -6, 15, 30, -1,-12,-12,-17,-10, 2; /M: SY='Q'; M= 0,-10,-18,-12, -3, -8,-18, -8, -1, -2, -1, 1, -6,-11, 5, 1, -3, -1, 2,-22, -4, -1; /M: SY='F'; M=-23,-24,-32,-27,-26, 54,-27,-15, 3,-13, 28, -6,-21,-30,-21,-10,-15,-10, 11, 13, 47,-26; /M: SY='R'; M= -4, -7,-26, -6, 5,-16, -5, -4,-20, 15,-18, 5, -5, -1, 10, 25, -4,-17,-18,-14,-10, 5; /M: SY='C'; M= 5, -9, 22,-16, -9,-17,-17,-27, 3,-12, 0, -1, -2,-17, -8,-18, 2, 11, 7,-36,-26, -9; /M: SY='R'; M= -9,-18,-20, -9, -6,-11,-19,-10,-29, 12,-20, 1,-18, -8, 28, 73, -9,-28,-11, -2, -1, 2; /M: SY='I'; M= 3,-19,-21,-34,-28, 1,-15,-19, 52,-19, 16, 8, -5,-31,-21,-24, -9, 2, 40,-31, -6,-28; /M: SY='W'; M=-18,-18,-10, -9, 21,-17, -7,-17,-28, 1,-15,-15,-30, -8, 9, -1,-12,-28,-27, 65, 8, 18; /M: SY='M'; M= -1,-16,-13,-23,-13, 9,-20, 1, 14, -1, 27, 32, -9,-35,-16,-10,-17, -1, 6,-22, 10,-13; /M: SY='R'; M= 0,-12,-10, -9, -1,-14,-17, -8,-12, 4,-11, 2,-11,-10, 9, 24, -4,-13, -5,-20,-12, 0; /M: SY='Q'; M= 8, -9,-23, -7, 10,-20,-15, -6,-16, 2,-13, -4, -9, -5, 42, 18, -6, -3,-16,-12, -8, 20; /M: SY='I'; M= -1,-13,-15,-19,-18, 4,-18,-16, 29,-14, 20, 10, -9,-28,-17,-18,-11, 1, 22,-25, 6,-18; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 5 in 5 different sequences |
| Number of true positive hits | 5 in 5 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | PSP1 C-terminal |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
5 sequences
PSP1_YEAST (P50896), TPL_TREPA (P45685), YAAT_BACSU (P37541), YL177_YEAST (Q06251), YOM2_SCHPO (Q9C0V4)» more
|