PROSITE entry PS51519
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | RWP_RK |
| Accession [info] | PS51519 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JAN-2011 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51519 |
| Associated ProRule [info] | PRU00852 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | RWP-RK domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=85; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=80; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.3212302; R2=0.0113737; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6738.0327148; R2=6.0326085; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=808; H_SCORE=11612; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=544; H_SCORE=10020; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='Q'; M= 5, -4,-22, -4, -1,-17, -5,-10,-10, 1,-11, -4, -4, -5, 7, 2, 4, 2, -9,-23,-14, 0; /M: SY='P'; M= 4, -4,-24, -2, 5,-21, -4, -8,-16, 8,-17, -6, -4, 10, 5, 2, 4, -2,-15,-25,-18, 3; /M: SY='A'; M= 10, -1,-22, -3, -1,-17, 0,-15, -5, 1,-11, -5, 2, -3, -2,-12, 8, 6, -6,-32,-21, -4; /M: SY='G'; M= 5, -3,-23, -7, -2,-19, 8,-10, -7, 2,-11, -2, 1, -2, -4, -9, 2, 0,-13,-25,-19, -5; /M: SY='I'; M= 1, -8,-18,-10, -6, -8,-12, -9, 4, -4, 1, 1, -7, -8, -6, -8, -4, 1, 2,-26, -5, -7; /M: SY='A'; M= 7, 0,-24, -2, 0,-17, 2,-15, -7, 4,-11, -1, 1, -7, 0, -6, 3, 0, -9,-26,-17, -2; /M: SY='R'; M= 3, -6,-24, -5, 5,-15, -6,-13,-16, 13,-17, 2, -5, 0, 10, 15, 0, -8,-14,-17,-13, 4; /M: SY='R'; M= -2, -8,-21, -4, 3,-17,-12, -6,-21, 11,-16, 0, -9, 3, 11, 24, -3,-12,-15,-18,-11, 3; /M: SY='S'; M= 5, -2,-20, -5, -3,-13, 5,-16, -9, -1,-12, -8, 0, -9, 0, -5, 8, 1,-11,-21,-17, -4; /M: SY='R'; M= -1, -7,-22, -6, -3,-11,-10, -9,-13, 6,-13, 0, -4, -7, 8, 20, -3,-10,-10,-20, -9, -2; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='T'; M= 8, -4,-17, -9, -8,-11, -9,-14, -1, -3, -6, -2, 1, -7, -4,-11, 7, 11, 1,-33,-16, -8; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='E'; M= 0, -3,-18, 1, 14,-21, -8, -4,-18, 12,-13, -3, -6, 8, 7, 5, -1, -9,-18,-18,-12, 10; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='K'; M= 1, -4,-16, -2, 1,-13, -4,-10,-11, 3,-10, -5, -5, -2, 1, 3, 3, -3, -9,-16,-10, -1; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='A'; M= 1, -2,-15, -3, -1,-12, -4, -6, -3, -1, -4, -2, -1, -4, -4, -9, -1, 0, -5,-20, -9, -3; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='A'; M= 1, -3,-15, -2, -4, -7, -3, -3, -3, -2, -3, -2, -5, -3, -2, -1, -1, -1, -2,-13, -3, -4; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='A'; M= 3, -2,-19, -3, -1, -9, -6,-10, -6, 2, -7, -1, -1, -7, -3, -4, 2, -2, -6,-22,-12, -4; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='D'; M= 2, 1,-22, 6, 2,-21,-12, -5,-14, 1,-11, -8, -2, -1, 5, -1, 4, 1,-10,-28,-11, 2; /M: SY='I'; M= -3,-17,-13,-25,-21, 12,-18,-17, 31,-15, 22, 10,-11,-29,-20,-18,-12, 0, 24,-23, 8,-21; /M: SY='T'; M= 8, 0,-22, -3, -6,-22, -9,-15, -9, -2,-10, -7, 3, 5, 3,-14, 13, 23, -5,-36,-15, -3; /M: SY='L'; M= -6,-15,-16,-18,-12, 13,-19,-13, 10, -6, 15, 9,-13,-23,-10, -7,-12, -4, 7,-12, 13,-11; /M: SY='E'; M= 2, 6,-10, 14, 24,-27,-15, -3,-21, 9,-10, -7, -1, -2, 8, -6, 3, -8,-19,-24,-16, 18; /M: SY='D'; M= 3, 12,-13, 25, 14,-29,-13,-12,-18, 3, -5,-10, -1, -9, 1, -7, 0, -6,-12,-27,-13, 9; /M: SY='I'; M= -5,-14,-10,-20,-17, 11,-17,-10, 30,-17, 30, 17,-12,-30,-19,-21,-16, 0, 19,-24, 13,-17; /M: SY='R'; M= 5, -8,-21, -6, 3,-14,-12,-11,-12, 5,-12, -2, -8, -8, 14, 16, 4, -4, -7,-18,-11, 4; /M: SY='Q'; M= 4, -7,-19, -6, 7,-18,-11, -8,-13, 5,-12, -4, -8, 2, 21, 10, -1, -3,-15,-20,-12, 10; /M: SY='Y'; M=-21,-22,-32,-16,-14, 11,-27, 15, -4,-12, 13, -1,-21,-18,-10, -5,-14, -9, 3, 3, 36,-14; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='F'; M=-17,-26,-31,-37,-31, 68,-27,-20, 1, -9, 21, -9,-14,-35,-23, -9,-11,-14, 9, 8, 33,-31; /M: SY='H'; M= -7, -2,-29, 0, 2,-22,-18, 45,-14, -7, -7, 3, 1, -3, -4,-11, -2, -6,-17,-38, -7, -1; /M: SY='L'; M= -6,-14,-11,-15,-10, 7,-18, -7, 10, -7, 23, 20,-15,-28,-12, -8,-16, -2, 5,-14, 17,-10; /M: SY='P'; M= -4,-12,-27, -7, 4,-31,-10, 2,-22, 6,-23,-27,-16, 67, 0,-10, 0, 7,-27,-32,-18, -2; /M: SY='I'; M= 4,-12, -8,-18, -6, -6,-16,-14, 15, -9, 8, 6, -7,-20, 4, -8, -8, 0, 8,-24, -7, -3; /M: SY='K'; M= 7, 0,-20, 2, 7,-19,-14,-12,-11, 8,-11, 2, 0, -6, 8, 4, 1, 0, -7,-28,-14, 6; /M: SY='E'; M= 5, 9,-14, 21, 22,-31,-15,-11,-21, 8,-10, -9, -3, -2, 10, -3, 0, -6,-15,-25,-14, 18; /M: SY='A'; M= 34, -3,-28, -3, -5,-15, -5,-21, 5, -3, -7, 8, -3,-14, 4, -9, 7, 10, 15,-46,-32, -4; /M: SY='A'; M= 31, -2,-14, -2, 1,-19, -3,-21, -3, -2,-10, 4, -1,-11, 5,-10, 11, 9, 5,-45,-38, -1; /M: SY='R'; M= -1, -5,-22, -3, 5,-14,-14,-12,-17, 16,-14, 6, -3, -4, 11, 22, -2,-10,-12,-20, -9, 5; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='E'; M= 7, -1,-12, -1, 10,-19,-12, -9, -8, 4, -6, 2, -1, -8, 8, -4, 0, -2, -8,-29,-16, 8; /M: SY='L'; M= -8,-13, -5,-16,-13, 22,-21,-10, 20,-16, 36, 19,-17,-32,-20,-18,-19, -1, 11,-19, 25,-13; /M: SY='G'; M= -1, 4,-31, -5,-13,-25, 50,-21,-11, -4,-19,-12, 10,-11,-13,-13, -1,-15,-26, -7,-27,-14; /M: SY='I'; M= 4,-20,-17,-27,-27, 9,-23,-22, 37,-16, 15, 6,-11,-35,-24,-16,-10, 5, 36,-27, 3,-27; /M: SY='S'; M= 0, -5, 13, -8, -2,-20, 8,-20,-13, -8,-15,-18, -3,-11,-12,-12, 14, 0,-17,-20,-30, -9; /M: SY='I'; M= 5,-10,-17,-11, -8, -5,-15,-13, 8, -8, 6, 3,-11,-12, -8,-12, -2, 8, 8,-26, -1, -8; /M: SY='T'; M= 9, -1,-21, -8,-14,-17,-12,-16, -2, -6, -6, -4, 6, -4, -3,-20, 21, 35, 3,-41,-13,-10; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='T'; M= 5, -7,-14, -9,-11, -9,-18,-17, 5, -7, 0, 0, -4,-15, -6,-11, 5, 14, 9,-32, -6,-10; /M: SY='L'; M= -7,-13, -8,-18,-15, 26,-21,-12, 18,-15, 32, 15,-15,-32,-20,-17,-17, -2, 12,-19, 23,-15; /M: SY='K'; M= -1, -1,-30, 1, 16,-10,-11,-18,-19, 35,-17, 18, -2, 7, 0, 11, -1,-10,-18,-18, -6, 8; /M: SY='R'; M= -5,-10,-22, -6, 2,-10,-14,-13,-21, 16,-15, 6, -9, -5, 15, 38, -5,-16,-13,-11, -4, 3; /M: SY='I'; M= -1,-15,-16,-17,-14, -3,-17,-12, 11, -7, 4, 7,-10,-19, -1, 9, -9, -6, 11,-21, -1,-11; /M: SY='C'; M=-25,-19,128,-28, 4,-17,-35,-42,-16,-24, 2,-16,-10,-29,-19,-16,-16,-17,-15,-17,-44, -4; /M: SY='R'; M=-11,-18,-25, -8,-10, -8,-20, -4,-26, 6,-15, -1,-18,-10, 24, 62, -9,-24, -9, -1, 6, -2; /M: SY='Q'; M= 2, -6,-17, -1, 13,-20,-16, -6,-20, 10,-14, -1, -9, -3, 22, 22, -2,-11,-15,-16,-10, 15; /M: SY='L'; M=-11,-11,-19,-16,-13, 16,-20, 10, 7,-13, 19, 11, -8,-24,-15,-13,-13, -5, 1,-21, 18,-13; /M: SY='G'; M= -1, 3,-37, -6,-16,-27, 61,-23,-11, -7,-19,-16, 6,-10,-15,-16, 0,-16,-28, 0,-27,-16; /M: SY='I'; M= 0,-19,-18,-30,-25, 5,-17,-19, 45,-17, 20, 10, -8,-32,-21,-22,-11, 2, 34,-26, 2,-25; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='P'; M= 1, -5,-24, -2, 4,-21, -4, -5,-15, 6,-14, -7, -7, 16, 1, -2, 0, -3,-17,-23,-13, 1; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='R'; M= -9,-18,-21,-10, -7,-11,-18,-10,-28, 10,-20, 0,-18, -9, 27, 69, -9,-27,-11, 0, -1, 1; /M: SY='W'; M=-49,-50,-20,-40,-10, 10, 10,-49,-30,-20,-20,-30,-69,-30, -9, 1,-30,-50,-30,197, 49,-10; /M: SY='P'; M=-10,-20,-30,-10, 10,-40,-10, 10,-30, 10,-30,-40,-30,110, 0,-10,-10, 0,-40,-30,-20, 0; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-46,-15,-12, 8,-19, 28,-12,-10, 6, -2,-19,-11, -4, -3,-10,-11, -7, 2, 32,-12; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='R'; M= -8,-18,-21,-10, -7,-11,-19, -8,-26, 9,-18, 1,-18, -9, 28, 68, -9,-26,-10, -4, -1, 1; /M: SY='K'; M= 2, -5,-24, -5, 12,-14,-14,-12,-16, 20,-16, 9, -4, 4, 15, 13, -1, -4,-16,-20,-10, 11; /M: SY='I'; M= -2,-16,-11,-21,-17, 7,-19,-15, 24,-13, 20, 13,-12,-29,-16,-13,-12, 1, 19,-21, 9,-17; /M: SY='Q'; M= 5, -3,-18, -3, 4,-15,-11,-14,-13, 9,-13, 2, -3, -4, 11, 10, 2, -1,-11,-24,-13, 4; /M: SY='S'; M= 8, -1,-15, -2, 0,-15, -1,-14,-11, 2,-16,-10, 0, -8, -3, -6, 20, 10,-11,-28,-20, -5; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='L'; M= -4,-11, -8,-15,-11, 9,-18,-14, 19,-12, 22, 12,-13,-23,-14,-15,-12, 1, 12,-23, 12,-11; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='D'; M= -1, 9,-21, 13, 5,-20,-10, -5,-16, 3,-11, -6, 6, -8, 5, 1, -1, -5,-16,-28,-11, 4; /M: SY='R'; M= -1, -2,-22, -5, -3,-10, -6,-10,-12, 7,-14, 1, 5,-10, 3, 13, 3, -5,-11,-23,-12, -4; /M: SY='M'; M= 2, -7,-11, -9, -1,-11,-13, -7, -1, 2, 3, 11, -5,-15, -3, -5, -3, 1, -4,-25, -7, -2; /M: SY='I'; M= 0,-14,-20,-20,-15, -3,-14,-12, 19, -8, 8, 7, -7,-20, -7, -6, -7, -2, 15,-23, -2,-13; /M: SY='E'; M= 4, 5,-22, 8, 9,-25,-10, 2,-17, 3,-13, -4, 3, -3, 9, -4, 4, -1,-17,-29,-15, 8; /M: SY='D'; M= 2, 3,-25, 6, 2,-18,-11, -5,-11, 2, -8, -3, 1, -8, 4, -4, 3, 0,-10,-26, -9, 1; /M: SY='L'; M= -3,-12,-14,-15,-11, 7,-15,-11, 15,-11, 18, 10,-13,-23,-13,-13,-10, -1, 9,-17, 11,-12; /M: SY='E'; M= 2, -4,-12, -2, 15,-17,-12, -9,-15, 6, -8, -2, -5, -5, 15, 4, -3, -8,-15,-18,-11, 15; /M: SY='E'; M= 2, -1,-14, 1, 10,-19,-11, -9,-11, 4, -8, -4, -1, -7, 6, -3, 1, -3,-11,-22,-12, 8; /M: SY='L'; M= 1, -3,-20, 0, -2,-11,-13, -9, -4, -2, 2, 2, -7,-16, 0, -3, -4, 0, -2,-21, 0, -3; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='M'; M= 4, -7,-15,-12, -5, -8,-11, -9, 5, -2, 4, 10, -2,-16, -3, -8, -7, 0, 0,-28, -8, -5; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M= 4, 2,-18, 6, 10,-22, -7,-10,-14, 6,-11, -5, -1, -3, 6, 1, 1, -6,-13,-24,-16, 7; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='D'; M= 2, 3,-16, 4, 2,-19,-10, -8,-10, 2, -7, -2, 4, -9, -2, -7, 3, 2, -9,-30,-14, -1; /M: SY='A'; M= 4, -5,-14, -5, -4,-13,-11,-16, -3, -4, -5, -7, -5, -8, -4, -7, 3, 4, 0,-26,-11, -6; /M: SY='E'; M= 4, -1,-20, 4, 9,-22, -8, -7,-15, 4,-13, -9, -6, 7, 6, -4, 3, -1,-16,-24,-15, 6; /M: SY='G'; M= 8, 3,-23, 3, -2,-22, 9,-18, -9, -1,-11, -7, 1, -8, 0, -6, 3, -3,-11,-24,-21, -3; /M: SY='E'; M= 6, 0,-15, 0, 8,-22, -9, -9, -7, 2, -7, -3, 1, -4, 7, -9, 2, 1, -9,-29,-17, 7; /M: SY='A'; M= 3, 0,-18, 1, 2,-16, -6,-14,-12, 3,-10, -7, -1, -4, 0, -2, 3, -2, -9,-24,-14, -1; /M: SY='Q'; M= 4, -3,-16, -2, 13,-21,-11, -9,-14, 7,-11, -4, -4, 2, 14, 0, 0, -3,-15,-22,-15, 13; /M: SY='A'; M= 5, -2,-18, 0, 5,-17,-11,-11, -8, 3, -8, -3, -4, -5, 5, -1, -1, -3, -7,-26,-12, 4; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 17 in 17 different sequences |
| Number of true positive hits | 17 in 17 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | RWP-RK |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
17 sequences
NLP1_ARATH (Q8H111), NLP1_ORYSJ (Q10S83), NLP2_ARATH (Q7X9B9), NLP2_ORYSJ (Q0JC27), NLP3_ARATH (Q9SVF1), NLP3_ORYSJ (Q5NB82), NLP4_ARATH (Q9LE38), NLP5_ARATH (Q9SFW8), NLP6_ARATH (Q8RWY4), NLP7_ARATH (Q84TH9), NLP8_ARATH (O22864), NLP9_ARATH (Q9M1B0), RKD1_ARATH (Q9M9U9), RKD2_ARATH (Q9CA66), RKD3_ARATH (Q9FGD1), RKD4_ARATH (Q9LVU8), RKD5_ARATH (O81791)» more
|