Home  |  Contact
Entry: PS51796

General information about the entry

Entry name [info] MSS4
Accession [info] PS51796
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-APR-2016 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE;
11-DEC-2019 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51796
Associated ProRule [info] PRU01132

Name and characterization of the entry

Description [info] MSS4 domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=115;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=110;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6293807; R2=0.0197207; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9228.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=425; H_SCORE=9228; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=197; H_SCORE=9228; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-10; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='E';  M= -8,  6,-33,  4, 19,-28,-15,  1,-28,  9,-28,-18, 11,-14, 15, 14,  6, -5,-27,-30,-20, 17;
/M: SY='L';  M=-14,-32,-10,-32,-25, -3,-33,-27, 15,-25, 27, 12,-31,-27,-18,-19,-18, -7,  7,-22,-12,-25;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='V';  M= -1,-24, -9,-24,-22, -9,-24,-24, 17,-16,  7,  6,-22,-18,-15,-22,-10,  0, 22,-25,-11,-16; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='N';  M= -3, 13,-18, 10,  2,-23, -4, -3,-22, -1,-31,-19, 23,-13,  0, -7, 23,  4,-22,-32,-19,  1; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='R';  M=  7, -4,-21, -8,  3,-26,-11, -7,-21,  2,-24,-16,  3,-14,  1, 10,  4,  1,-17,-32,-20,  2;
/M: SY='N';  M=-15, 22,-36, 20, 25,-31,-15,  3,-30,  4,-35,-21, 27,-15,  9, -2,  4, -6,-30,-36,-21, 20;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='G';  M= -6,  3,-26, -3,-11,-26, 31, -8,-31,-11,-34,-23, 11,-17,-11,-11,  3,-11,-26,-28,-23,-11; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='R';  M= -7,-11,-24,-16, -7,-21, -6,-10,-19,  4,-13,-13, -6,-16, -2, 16, -6, -3,-16,-24,-17, -7; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='N';  M=-14, 19,-28,  3,  3,-29,-12,  2,-29, 14,-36,-20, 38,-16,  3,  5, 10, -2,-26,-36,-20,  3;
/M: SY='R';  M=-11, -9,-30,-17, -4,-25,-22, -9,-18, 11,-17,-10, -2, -6,  1, 15, -8, -9,-15,-30,-19, -4;
/M: SY='K';  M= -5,-15,-17,-19, -9,-15,-22, -9, -6,  2, -7, -6,-12,-18, -5, -5, -2, -7, -6,-26,-13, -9;
/M: SY='A';  M=  6, -7,-18,-10,  0,-22,-13,-12,-14,  6,-21,-13, -3,-14, -2,  1,  6, -4,-11,-30,-19, -1;
/M: SY='I';  M= -6,-34, -9,-34,-28, -5,-33,-29, 23,-25, 22, 13,-34,-25,-20,-24,-22, -5, 22,-25,-11,-25;
/M: SY='L';  M=-10,-23,-18,-26,-17, -3,-26,-13, -2,-12,  2, -2,-18,-24,-11, -3,-10, -3, -4,-18, -2,-16;
/M: SY='C';  M=  0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-33,  2, 23,-31,-20,  1,-30, 12,-25,-12, -3,  2, 33,  4, -1,-10,-23,-27,-21, 25;
/M: SY='R';  M= -6, -6,-31,-10,  7,-20,-12,  1,-26,  9,-25,-18, -4,-17,  4, 15, -4,-12,-24,-26,-13,  5;
/M: SY='C';  M=  0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
/M: SY='G';  M= -7,  4,-28,  1, -7,-29, 16, -3,-32,-10,-37,-26, 10,-10, -8,-13,  6,-10,-28,-34,-22, -8;
/M: SY='C';  M=  5,-14, 31,-18,-18,-20,-15,-20,-15,-14,-19,-19, -8,-18,-14,-22, 16,  7,-13,-26,-20,-18;
/M: SY='R';  M= -5,-19,-23,-24,-12,-19,-24,-15, -3,  2, -5, -6,-15,-20, -5, 14,-12, -7, -2,-28,-16,-10;
/M: SY='I';  M= -7,-32,-11,-32,-29, -5,-35,-29, 29,-25, 19, 16,-31,-25,-21,-27,-22, -5, 29,-25,-10,-25;
/M: SY='L';  M=-17,-36,-11,-37,-30,  5,-39,-28, 24,-30, 30, 15,-36,-31,-24,-24,-26,-11, 14,-17, -6,-30;
/M: SY='Q';  M= -9, -3,-30, -8,  3,-30,-11, -4,-29, 11,-26,-16,  2, -2, 16,  9, -1, -5,-21,-29,-22,  6;
/M: SY='P';  M= -8,-11,-27,-13, -1,-22,-20, -8,-20, -1,-22,-18, -7,  9, -4, -4, -6, -9,-16,-27,-11, -2;
/M: SY='N';  M= -8,  7,-28, -1, -1,-29,  8, -3,-32,  1,-34,-19, 18,-16,  6, -3,  8, -7,-26,-31,-23,  1;
/M: SY='T';  M= -9,  0,-24, -3,  0,-23,-19, -1,-18, -1,-20,-15,  6,-15, -1, -1,  1, 12,-12,-31,-15, -1;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='A';  M= 16,-12,-10,-13, -8,-20,  8,-16,-17, -4,-21,-13,-11,-10, -8, -7,  5,  0, -8,-25,-19, -8; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='E';  M=-11,-12,-20, -8,  8,-13,-24,-13, -5, -8,  2, -1,-15,-16,  0, -8,-10, -4, -8,-21,-13,  4; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='Y';  M=-16,-23,-17,-28,-17, 19,-25, -5, -4,-19, -5, -4,-22,-27,-11,-19,-16,-16, -9, 19, 20,-16; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='S';  M= -2, -6,-12, -9, -7,-13,-12, -2, -8, -7,-13, -8,  2,-13, -4,-10,  9,  5, -7,-24,-10, -6; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='R';  M=-10, -2,-29,  0,  4,-27,-19, -9,-21,  0,-18,-15, -3, -9,  5,  7, -2, -1,-19,-32,-21,  2;
/M: SY='R';  M= -5, -2,-28, -2,  7,-27,-18, -6,-19,  3,-20,-13,  0,-15,  8,  9, -2, -2,-15,-31,-20,  7;
/M: SY='Q';  M= -9, -5,-26, -4,  9,-21,-25, -7, -6, -4,-12, -4, -5,-16, 12, -8, -6, -7, -4,-26,-16, 10;
/M: SY='L';  M=-13,-24,-19,-27,-17,-13,-30,-12,  2,-10,  5,  0,-22,-14,-10, -8,-18,-10,  2,-26,-11,-16;
/M: SY='N';  M=-14,  5,-27,  3,  2, -7,-17, -6,-20, -5,-24,-16,  6,-21, -5,-11,  1, -4,-21,-25, -9, -1;
/M: SY='L';  M= -9,-32,-11,-33,-24, -7,-31,-26, 11,-21, 22, 10,-30,-24,-16,-12,-20, -3,  7,-24,-13,-23;
/M: SY='P';  M=-10,-17,-31,-16, -5,-39,-20,-18,-30, -8,-30,-29,-18, 72, -7,-18, -9,-10,-21,-39,-29, -6;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='E';  M=-10,  8,-19,  7,  9,-16,-11, -2,-13, -2,-14, -9,  9,-11,  2, -4, -1, -4,-14,-20,-12,  6; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='S';  M=  4, -8,-10, -8, -4,-17, -8,-12,-12, -1,-15,-12, -3,  0, -3, -7, 12,  5,-10,-23,-16, -4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='M';  M=-10,-24,-15,-25,-16, -3,-25,-16,  6,-14, 17, 28,-19,-22, -4, -8,-17, -8,  4,-16, -9,-16; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='R';  M= -5, -9,-18,-13, -4,-10,-14, -6,-13,  0,-10, -8, -4,-14,  3, 10,  1, -1,-13,-18,-10, -3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='K';  M= -4, -2,-22, -5, 10,-22,-14, -4,-21, 21,-20,-11, -2, -9, 15, 13,  0, -7,-15,-21,-15, 11; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='K';  M= -7, -3,-19, -9,  0,-17,-15, -9,-13, 17,-15, -6,  1,-12,  2,  3,  1, -5, -9,-22,-14,  0; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='D';  M=  1,  8,-12, 13,  4,-16, -2, -6,-12, -3,-18,-12,  3, -8, -1, -8,  9,  0,-11,-21,-13,  2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='R';  M=-11,-18,-22,-21, -7,-15,-24,-12, -7, -3,  3, -3,-14,-20, -2, 13,-11, -7,-11,-23,-14, -8; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='S';  M=  9,-10,-12,-11, -8,-21, -4,-17,-15, -2,-21,-14, -5,-12, -7, -9, 13, 11, -7,-30,-20, -7;
/M: SY='A';  M=  4, -5,-17,  0, -5,-21,-16,-17, -6,-12,-14, -5,-11,-17, -4,-16, -2, -1, -1,-33,-20, -5;
/M: SY='D';  M= -9,  2,-31,  8, -2,-30,  2,-16,-22,-10,-28,-21, -7, -8, -7,-14, -5,-11,-16,-37,-25, -4;
/M: SY='D';  M= -7, 11,-27, 18,  4,-29,  0, -3,-28, -8,-35,-26,  5, -8, -2,-15, 11, -6,-26,-37,-22,  0;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='N';  M= -3,  7,-14,  0, -3,-19, -8, -3,-16, -3,-21,-12, 21,-11, -3, -4, 10, 11,-13,-26,-15, -3; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='P';  M= -7,-22,-16,-23,-18,-12,-25,-22, -1,-17, -4, -6,-19,  4,-15,-20, -7,  3,  1,-27,-14,-17;
/M: SY='D';  M=-13, 13,-35, 20,  8,-36, -1, -9,-32, -7,-35,-26,  3,  1,  2,-14, -1,-11,-27,-39,-27,  5;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='S';  M=  1, -9,-18,-10, -9,-19,  6,-14,-19, -8,-19, -9, -2,-15, -6, -7,  9,  4,-14,-26,-20, -9; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='D';  M=-13, 20,-33, 30, 22,-31,-14, -8,-26,  3,-30,-22,  5,-14,  5, -7,  1, -4,-23,-36,-23, 15; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='P';  M= -8,-18,-18,-19,-11,-21,-21,-18, -9, -6, -7,-10,-16, 19, -9,-12, -9,  0, -4,-27,-18,-10; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='L';  M=-14,-30,-10,-32,-25,  6,-31,-23, 17,-24, 24, 12,-30,-25,-19,-20,-22, -9, 11,-14, -4,-24; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='R';  M= -6, -6,-25, -9,  4,-22,-19, -6,-17,  7,-15,-10, -3,-14, 11, 14, -1,  0,-14,-25,-17,  5; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='E';  M=-11, 13,-35, 16, 17,-32,  5, -5,-33, -3,-36,-24, 10,-16,  2, -9,  2,-11,-30,-35,-24, 11;
/M: SY='F';  M=-20,-22,-23,-32,-22, 42,-27, 13, -8,-25, -8, -5,-20,-35,-20,-22,-17,-20,-15,  2, 27,-22;
/M: SY='W';  M=-23,-36,-18,-43,-29, 18,-31,-16, -6,-28, -7, -9,-35,-36,-22,-28,-26,-22,-13, 50, 21,-28;
/M: SY='L';  M=-12,-22,-20,-24,-15,-13,-21,-10, -4,-14,  5,  1,-19,-22, -4, -5,-15, -6, -4,-24,-13,-13;
/M: SY='V';  M= -5,-32,-10,-32,-30, -7,-33,-30, 29,-23, 16, 12,-32,-23,-21,-28,-22, -3, 34,-27,-10,-23;
/M: SY='N';  M=-13,  8,-30,  3,  5,-31,-17, -7,-25,  9,-30,-20, 12,  0,  1, -3, -1, -6,-20,-37,-22,  4;
/M: SY='D';  M=-16, 32,-36, 48, 15,-37, -3,-11,-30,-10,-39,-29,  8,-19, -2,-19,  4, -9,-29,-46,-29,  6;
/M: SY='M';  M= -8,-27,-19,-27,-21,-12,-29,-23,  7,-19,  5, 21,-23,  0,-10,-23,-17, -8, 10,-27,-15,-19;
/M: SY='F';  M=-20,-33,-19,-39,-27, 32,-31,-12, -2,-27,  2,  7,-30,-36,-21,-26,-23,-19, -9, 21, 23,-27;
/M: SY='D';  M=  0,  1,-19,  8, -4,-24, -8,-18,-11,-13,-20,-15, -6,-17,-10,-17,  4,  2, -9,-35,-22, -7;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 60,-30,-10,  0,-30,  0,  0,-30,-40,-30,-30,-20,-20,-10, 10, 30,-30;
/M: SY='E';  M=-14, 21,-40, 34, 39,-34,-16, -4,-30,  3,-34,-24,  4,-14, 13, -7,  0,-10,-30,-37,-24, 29;
/M: SY='N';  M=-20, 30,-30, 10,  0,-30,-10, 10,-30,  0,-40,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-10,-30,-30, -6,-34,-30, 34,-24, 14, 10,-30,-24,-24,-30,-20, -4, 36,-26,-10,-24;
/M: SY='G';  M=  4,-10,-26,-10,-17,-28, 50,-19,-36,-17,-37,-27, -9,-18,-17,-18,  4,-16,-27,-30,-28,-17;
/M: SY='F';  M=-15,-30,-17,-37,-30, 41,-30,-15,  8,-27,  3,  3,-30,-35,-27,-30,-20,-15,  4, -1, 19,-27;
/M: SY='S';  M=  6, -4,-10, -4, -4,-20, -7,-14,-16, -4,-23,-16,  6,-10, -4,-10, 29, 24,-13,-30,-20, -4;
/M: SY='R';  M=-11, -3,-35,-13,  4,-30,-19, -4,-30, 31,-26,-20,  5,-16,  9, 38, -4, -9,-26,-31,-20,  4;
/M: SY='D';  M=-13, 18,-32, 27, 11,-35,-13,-10,-28, -7,-34,-26,  6,  2, -1,-15,  3, -3,-25,-42,-27,  5;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='V';  M=  3,-20, -8,-20,-18,-10,-19,-21, 12,-14,  1,  1,-18,-16,-13,-20, -3,  1, 16,-25,-12,-14; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='G';  M=  0,  1,-24,  2,  3,-26,  8,-10,-26, -7,-29,-20,  0, -6, -4,-10,  2, -9,-21,-30,-22,  0; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='N';  M=-11,  0,-23, -8,-11,-19,  9, -7,-27,-11,-31,-21, 11,-21, -9,-12,  1,-10,-26, -7,-14,-11; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4;
/M: SY='V';  M= -8,-18,-17,-19,-11, -9,-26,-15,  7, -7,  1, -1,-18,-19,-10,-10,-13, -7,  8,-20, -5, -9; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-4;
/M: SY='K';  M=-10, -2,-32,-11,  9,-30,-20, -5,-30, 39,-27,-18,  0,-12, 16, 27, -2,-10,-22,-29,-20, 10;
/M: SY='Y';  M=-20,-32,-18,-35,-25, 34,-32,  0, -1,-25,  3, -1,-27,-33,-23,-23,-22,-18, -6,  9, 41,-25;
/M: SY='L';  M=-18,-38,-10,-38,-30,  0,-40,-30, 24,-30, 36, 18,-38,-30,-22,-22,-28,-10, 14,-20,-10,-30;
/M: SY='V';  M= -3,-32, -9,-32,-28, -7,-31,-29, 25,-23, 17, 11,-32,-23,-20,-25,-21, -4, 27,-26,-11,-23;
/M: SY='C';  M=  0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
/M: SY='A';  M= 28,-17, -7,-17,-10,-23,  4,-19,-16,-10,-24,-15,-16, -3,-10,-12, 11, -2, -7,-31,-22,-10;
/M: SY='D';  M=-10, 24,-35, 38, 25,-35,-12, -8,-28, -4,-35,-25,  3,-16,  5,-13,  1, -9,-26,-42,-26, 16;
/M: SY='C';  M=  0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
/M: SY='E';  M=-12, 17,-39, 29, 35,-33,-10, -5,-31,  2,-34,-24,  2,-14, 11, -7,  0,-11,-30,-36,-24, 26;
/M:         M= -8,-19, -3,-24,-15,-17,-29,-17,  0, -4, -5, -7,-17,-23, -7, -3,-11,-10, -1,-23,-16,-14;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-30,-30,-20;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-30,-20,-10,-40,-20,-20,-30,-10,-30,-30,-20, 80,-10,-20,-10,-10,-20,-40,-30,-10;
/M: SY='I';  M=-13,-35,-10,-35,-30, -2,-38,-30, 28,-28, 28, 15,-35,-28,-23,-25,-25, -8, 22,-22,-10,-28;
/M: SY='G';  M=  0,-11,-29,-11,-21,-29, 54,-21,-35,-20,-36,-27,-11,-20,-20,-21, -1,-19,-25,-30,-29,-20;
/M: SY='F';  M=-21,-33,-19,-39,-27, 31,-31, -7, -4,-27, -5, -3,-29,-36,-23,-27,-23,-21,-11, 31, 31,-27;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='H';  M= -6,-10,-21,-15, -6,-11,-19, 22,-14, -3,-19,-13, -4,-18, -2, -6, -4,-11,-11,-21,  4, -5;
/M: SY='D';  M= -8,  7,  7, 13, -6,-30, -8,-18,-23,-17,-29,-26, -6,-22,-12,-26,  0, -9,-22,-36,-26,-11;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='P';  M= -3,-10,-11,-11, -7,-12,-12,-11, -2, -3, -7, -7, -9,  8, -6, -9, -3, -3,  0,-17,-11, -6; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='L';  M=-12,-29,-16,-30,-24,-11,-25,-26,  8,-19, 13,  4,-29,-13,-17,-19,-20, -9,  7,-26,-15,-22;
/M: SY='D';  M=-10, 16,-28, 17, 11,-30,-13, -5,-26,  2,-31,-20, 16,-15,  6, -6,  9,  4,-22,-36,-23,  8;
/M: SY='D';  M=-12, 15,-33, 22, 15,-32, -7, -5,-29, -3,-31,-20,  7,-15, 11, -8,  2, -3,-24,-36,-24, 12;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='K';  M= -5, -5,-25, -9,  8,-24,-17, -8,-22, 25,-20, -8, -4,-12, 11, 12, -2, -8,-15,-26,-17,  8; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='N';  M=-13, 13,-25,  8,  9,-22,-13,  6,-21, -2,-24,-14, 21,-14,  3, -3,  2, -1,-20,-29,-14,  6; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='S';  M=  5, -7,  8,-10, -8,-15, -9,-12,-12, -3,-16,-13, -3,-11, -6,-10, 12,  6, -9,-20,-15, -8; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='Y';  M=-16,-23,-17,-24,-15, 24,-24, 13, -9,-16, -8, -6,-16,-25,-12,-16,-15,-16, -9, 13, 47,-14; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='V';  M= -8,-26,-10,-27,-22, -6,-28,-24, 17,-15, 16, 10,-26,-19,-14,-18,-19, -4, 18,-21, -9,-18; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='A';  M= 21,-12, -5,-13, -8,-17, -4,-15,-10, -8,-17,-10, -7,-12, -7, -9, 12,  1, -6,-27,-17, -8; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='L';  M= -9,-23,-16,-24,-12,-12,-25,-19, -1,-13,  9,  1,-23,-11, -9, -6,-14, -7, -4,-23,-14,-13; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='E';  M=-10,  0,-20,  3, 15,-12,-20, -7,-18, -1,-20,-15, -8,-17,  1,-10, -5,-10,-18,-22,-11, 10; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='R';  M= -5, -6,-31,-11,  4,-25,-14, -2,-25, 14,-21,-18,  2,-16,  8, 37,  1, -5,-25,-27,-18,  3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='V';  M= -6,-28,-12,-29,-26, -9,-31,-23, 22,-17, 11,  8,-28,-22,-17,-23,-20, -4, 26,-27, -9,-20;
/M: SY='S';  M= -6, -3,-23, -2,  3,-21,-18,-12,-11,  0,-16,-12, -2,-17, -2, -5,  4, -4,-11,-31,-18,  1;
/M: SY='H';  M=-13,-12,-24,-17, -8, -7,-22, 29,-16, -8,-20,-15, -5,-11, -3, -9, -9,-13,-13,-17, 15, -7;
/M: SY='D';  M=-15, 10,-32, 15, 13,-28,-14, -9,-22, -3,-23,-17,  3,-18,  1, -9, -4, -9,-22,-35,-22,  7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH PS51797

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2019_11 which contains 561'568 sequence entries.


Total number of hits 7 in 7 different sequences
Number of true positive hits 7 in 7 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] MSS4
Version [info] 3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
7 sequences

DSS4_YEAST  (P32601    ), MSS4_CAEEL  (Q9U1X4    ), MSS4_DROME  (Q9VLP3    ), 
MSS4_HUMAN  (P47224    ), MSS4_MOUSE  (Q91X96    ), MSS4_RAT    (Q08326    ), 
MSS4_SCHPO  (O43057    )
» more

PDB
[Detailed view]
3 PDB

1FWQ; 1HXR; 2FU5

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission