PROSITE entry PS51875
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | HAV_P48_PRO |
| Accession [info] | PS51875 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
05-DEC-2018 CREATED;
26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51875 |
| Associated ProRule [info] | PRU01223 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Hypovirus-associated virus (HAV) papain-like protease p48 domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=148; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=143; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7943066; R2=0.0114709; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=33681.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=803; H_SCORE=33681; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=411; H_SCORE=33681; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20, 7,-27,-13, 20,-23, 40, 34,-27,-27,-13,-17,-27,-10, 10,-20, 0,-17; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='A'; M= 29, -5,-10,-10, -5,-20, 0,-15,-15,-10,-20,-15, 0,-10, -5,-15, 25, 10, -5,-30,-20, -5; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23, 7,-33,-23, 29,-30, 41, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 16,-20, 0,-23; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='H'; M=-14, 0,-24, -3, -3,-17,-20, 66,-24,-10,-17, -3, 7,-17, 4, -3, -1, 0,-21,-30, 11, -3; /M: SY='R'; M= 8, -9,-20,-10, 5,-19,-15,-11,-13, 4,-12, -9, -8,-14, -1, 10, -1, -5, -4,-24,-15, 1; /M: SY='A'; M= 39, -7,-10,-14, -7,-20, 0,-17,-13,-10,-16,-13, -4,-10, -7,-17, 19, 6, -3,-26,-20, -7; /M: SY='A'; M= 25,-15,-10,-21,-16,-12,-13,-23, 3,-13, -4, -4,-15,-16,-16,-18, 5, 9, 16,-25,-15,-16; /M: SY='S'; M= 7, -6,-16, -4, 8,-18,-11,-13,-11, -7,-15,-12, -5,-12, -3,-11, 12, 4, -1,-32,-18, 3; /M: SY='E'; M=-11, 11,-30, 21, 55,-30,-20, 0,-30, 11,-20,-20, 1, -2, 18, 3, -1,-10,-29,-30,-19, 36; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='V'; M= 0,-29,-13,-31,-29, 0,-30,-29, 30,-21, 13, 11,-29,-29,-28,-21,-12, -2, 44,-28, -9,-29; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='A'; M= 32,-14,-11,-20,-11,-15,-10,-22, 0,-12, -5, -5,-15,-15,-14,-19, 4, -1, 12,-23,-17,-13; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='R'; M=-16, -6,-30, -6, 4,-24,-20, -4,-30, 37,-24,-10, 0,-16, 10, 56,-10,-10,-20,-20,-10, 4; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='D'; M=-17, 47,-27, 53, 13,-33, -7, 3,-33, 0,-30,-27, 34,-13, 0, -7, 3, -7,-30,-40,-20, 7; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='T'; M= 23, -5,-10,-15,-10,-15,-11,-20,-10,-10,-10,-10, -5,-10,-10,-15, 15, 27, 0,-25,-15,-10; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='V'; M= -1,-21,-13,-26,-24, -3,-29,-27, 21,-19, 6, 6,-20,-23,-23,-19, -3, 13, 33,-29, -9,-24; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20, 0,-20, 0, 20,-10, 20, 60,-20,-20, 0,-10,-20,-10, 10,-20, 0,-10; /M: SY='E'; M= -4, 7,-24, 14, 43,-27,-14, -3,-27, 4,-23,-20, 3, -3, 14, -3, 11, -1,-24,-33,-20, 29; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='A'; M= 28,-14,-14,-24,-14,-13, -7,-13, 1,-10, 1, 16,-14,-14, -6,-16, -1, -4, 4,-20,-13,-10; /M: SY='K'; M=-10, 0,-29, 0, 12,-32,-20, -5,-26, 37,-26, -7, 0,-10, 24, 23, -6, -8,-22,-20,-10, 18; /M: SY='E'; M=-10, 1,-33, 11, 43,-30,-20, -6,-27, 4,-23,-20, -6, 26, 11, -6, -3,-10,-30,-30,-23, 26; /M: SY='A'; M= 33, -8,-10,-18,-11,-16, -8,-21, -7,-11, -9, -9, -8,-11,-11,-17, 12, 14, 3,-23,-17,-11; /M: SY='P'; M=-10,-14,-37, -7, 3,-30,-20,-17,-23, 7,-30,-17,-14, 61, -4, -6,-10,-10,-27,-27,-24, -4; /M: SY='R'; M=-17, -5,-29, -3, 16,-22,-20, 0,-27, 22,-17, -8, -1,-14, 12, 45, -8,-10,-21,-23,-12, 11; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='Q'; M=-14, -7,-30, -7, 6,-17,-23, 11,-16, 7,-14, -2, -6,-17, 32, 13, -7,-10,-23, -6, 16, 17; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='V'; M= -3,-19,-16,-16, -4, -9,-27,-21, 13,-11, 1, 1,-21,-21,-16,-14, -7, -3, 27,-30,-13,-10; /M: SY='P'; M= 7,-17,-31,-13, -3,-27,-14,-20,-17,-10,-24,-17,-17, 61,-10,-20, -4, -7,-21,-27,-27,-10; /M: SY='R'; M= 0,-10,-24,-13, -3,-20,-14, -6,-24, 19,-17,-10, -3,-17, 4, 44, -4, -7,-14,-20,-13, -3; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='S'; M= 7, -3,-16, -3, -6,-23, 20,-13,-26,-13,-30,-20, 7,-13, -6,-13, 29, 9,-16,-34,-23, -6; /M: SY='T'; M= -3, -9,-16,-19,-16, -7,-26,-23, 7,-16, -1, -1, -6,-13,-13,-16, 9, 33, 9,-27, -7,-16; /M: SY='F'; M=-20, -7,-23, -9,-16, 46,-24,-14,-11,-21, -1, -9, -9,-24,-29,-17,-14,-10, -9, -4, 16,-19; /M: SY='V'; M= -2,-30,-14,-32,-30, 0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30; /M: SY='D'; M=-10, 11,-24, 21, 19,-25,-17, -9,-16, -3,-15,-15, -2,-12, -2, -9, -3, -7, -7,-33,-17, 9; /M: SY='N'; M= -9, 35,-21, 30, 5,-25, -4, 3,-25, -2,-29,-23, 39,-15, 0, -5, 12, 2,-26,-40,-20, 3; /M: SY='H'; M=-17, 2,-30, 5, 16,-20,-21, 67,-28, -4,-19, -6, 6,-15, 12, -1, -8,-17,-29,-27, 12, 10; /M: SY='E'; M=-10, 1,-33, 11, 43,-30,-20, -6,-27, 4,-23,-20, -6, 26, 11, -6, -3,-10,-30,-30,-23, 26; /M: SY='E'; M= -7, 3,-30, 10, 32,-30, 6, -7,-33, 5,-24,-19, 0, -7, 8, -3, -1,-13,-29,-26,-22, 20; /M: SY='E'; M=-13, 18,-30, 29, 35,-32, -7, -2,-34, 5,-24,-22, 6, -7, 9, 1, -1,-11,-29,-31,-20, 22; /M: SY='V'; M= -3,-30,-14,-30,-27, 3,-30,-27, 28,-23, 22, 13,-30,-30,-27,-20,-16, -3, 38,-27, -7,-27; /M: SY='E'; M=-10, 11,-30, 22, 56,-30,-17, 0,-31, 9,-21,-20, 1, -1, 18, -1, 0,-10,-30,-30,-20, 37; /M: SY='V'; M= -5,-30,-17,-32,-27, 3,-32,-27, 32,-25, 24, 15,-28,-28,-25,-22,-18, -5, 34,-25, -5,-27; /M: SY='D'; M=-16, 25,-33, 41, 19,-36,-14, -6,-33, -2,-29,-26, 6, 20, -1,-12, -3,-10,-30,-36,-23, 8; /M: SY='P'; M= -5, -5,-23, -3, 11,-20,-20,-15,-14, -5,-16,-13, -7, 14, -3,-11, 5, 13,-10,-30,-18, 3; /M: SY='L'; M=-10,-17,-23,-15, 3, -3,-27,-15, 5,-18, 26, 7,-20,-20, -8,-14,-19, -7, -1,-23, -6, -3; /M: SY='R'; M=-17, -6,-31, -3, 16,-21,-20, -1,-30, 22,-20,-13, -2,-15, 11, 46, -9,-11,-23,-15,-11, 10; /M: SY='L'; M= -6,-30,-16,-30,-24, 6,-30,-24, 24,-26, 34, 16,-30,-30,-24,-20,-22, -6, 26,-24, -4,-24; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='V'; M= 1,-16,-12,-22,-20, -5,-26,-25, 13,-16, 2, 2,-15,-19,-19,-17, 3, 21, 24,-28, -9,-20; /M: SY='E'; M=-10, 7,-30, 14, 46,-30,-20, -3,-30, 21,-23,-17, 0, -3, 17, 9, -3,-10,-27,-27,-17, 31; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='R'; M=-17, -4,-30, -1, 17,-23,-20, 0,-30, 24,-20,-13, 0,-14, 13, 50, -7,-10,-23,-23,-13, 11; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27, 66,-30, -9, 0,-24, 7, 0,-20,-30,-31,-17,-20,-10, -3, 16, 44,-27; /M: SY='E'; M=-10, -1,-27, 6, 37,-19,-23, -6,-16, -1, 0, -9, -9, -9, 9, -6, -9,-10,-19,-27,-14, 23; /M: SY='L'; M=-13,-27,-23,-27,-20, 16,-30, -9, 14,-24, 36, 14,-27,-30,-17,-17,-27,-10, 4, -6, 23,-20; /M: SY='L'; M=-13, -7,-23, -1, -9, -4,-24,-14, 3,-21, 27, 6,-16,-24,-14,-17,-21,-10, -1,-26, -6,-11; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='N'; M=-10, 29,-23, 14, 3,-23, -6, 4,-23, 14,-30,-17, 43,-17, 3, 9, 4, -3,-27,-34,-17, 3; /M: SY='N'; M=-10, 23,-26, 11, 0,-23, -6, 1,-20, -3,-30,-20, 37, 11, -3, -6, 4, -3,-30,-37,-23, -3; /M: SY='Q'; M= -4, 0,-24, 0, 14,-34,-14, 4,-20, 4,-23, -6, 3,-10, 43, 4, 11, -1,-24,-26,-13, 29; /M: SY='F'; M= -5,-24,-18,-32,-25, 20,-29,-25, 17,-23, 8, 5,-19,-23,-26,-21, -9, 2, 19,-15, 3,-25; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='P'; M=-10,-11,-37, -1, 17,-30,-20,-14,-23, -4,-27,-20,-14, 64, -1,-14, -7,-10,-30,-30,-27, 4; /M: SY='A'; M= 30,-16,-13,-26,-16, 9, -9,-20, -7,-16, -4, -7,-13,-16,-19,-20, 1, -3, 0,-11, -6,-16; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='F'; M=-20,-24,-23,-31,-21, 51,-27,-14, -9,-13, 1, -3,-14,-27,-26, 6,-17,-10, -6, 1, 19,-21; /M: SY='D'; M=-14, 22,-32, 34, 8,-34, -3, -7,-33, -5,-30,-25, 9, 17, -5,-13, -2,-10,-30,-35,-24, 0; /M: SY='K'; M= -7, 0,-24, -3, 4,-24,-20,-13,-24, 33,-24,-10, 0,-10, 4, 19, -1, 7,-14,-23,-10, 4; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='L'; M= -4,-21,-17,-21,-14, 1,-21,-17, 9,-24, 27, 9,-19,-24,-14,-17,-10, -1, 4,-26, -6,-14; /M: SY='L'; M=-10,-27,-26,-24,-14, -1,-27,-20, 9,-24, 27, 9,-27, 4,-17,-20,-24,-10, -1,-23, -9,-17; /M: SY='R'; M=-13, -6,-24, -9, -2,-18,-20, -7,-24, 21,-18,-10, 0,-16, 4, 42, -1, 7,-14,-23,-10, -2; /M: SY='D'; M=-17, 39,-30, 56, 31,-37,-13, 0,-37, 3,-27,-27, 14, -7, 6, -7, 0,-10,-30,-37,-20, 19; /M: SY='V'; M= -3,-30,-13,-30,-27, 3,-30,-27, 27,-23, 21, 13,-30,-30,-27,-20,-16, -3, 39,-27, -7,-27; /M: SY='L'; M=-11,-30,-23,-34,-24, 13,-33,-23, 27,-30, 38, 18,-26,-27,-22,-23,-26,-10, 15,-18, 2,-24; /M: SY='G'; M= -2, 13,-28, 20, 6,-32, 22,-10,-35, -8,-26,-22, 5,-13, -6,-14, 1,-13,-26,-28,-24, 0; /M: SY='V'; M= -3,-27,-13,-30,-27, 0,-27,-21, 27,-17, 13, 24,-27,-27,-21,-17,-13, -3, 39,-27, -7,-24; /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26, 50,-30,-20, 9,-30, 27, 9,-24,-30,-31,-20,-24,-10, 4, -3, 17,-26; /M: SY='E'; M= -7, 6,-24, 8, 33,-25,-20, -7,-24, 9,-18,-15, 0, -4, 12, 1, 5, 7,-20,-28,-16, 22; /M: SY='E'; M= -7, -1,-24, 6, 34,-21,-23, -9,-13, 1,-11,-11, -9, -9, 6, -6, -3, -7, -7,-30,-17, 20; /M: SY='N'; M= -8, 27,-18, 13, -1,-19, -7, 0,-19, 0,-24,-17, 37,-16, -2, -2, 11, 13,-21,-36,-17, -2; /M: SY='V'; M= -3,-10,-13,-16,-21, -6,-21,-19, 16,-14, -1, 1, -4,-27,-21,-14, -4, 0, 27,-33,-13,-21; /M: SY='C'; M= -7,-23, 83,-30,-30,-14,-30,-30,-13,-27,-11,-11,-23,-37,-30,-27,-10, -7, 7,-44,-24,-30; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='M'; M=-13,-21,-23,-24,-14, -2,-24, -7, 6, -6, 20, 25,-18,-24, -4, 9,-21,-10, 1,-20, -3,-11; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='D'; M=-15, 31,-30, 46, 39,-35,-15, 0,-35, 5,-25,-25, 10, -5, 10, -5, 0,-10,-30,-35,-20, 24; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='S'; M= 7, 0,-10, -3, -3,-17, -6,-13,-17,-10,-24,-17, 7,-10, -3,-10, 34, 29, -7,-37,-17, -3; /M: SY='H'; M=-20, -3,-30, -3, 0,-20,-20, 71,-30, 1,-20, -3, 7,-20, 10, 20,-10,-17,-27,-27, 11, 0; /M: SY='S'; M= 0, 10,-18, 14, 19,-25, -7, -5,-25, -3,-27,-21, 11, -8, 6, -7, 23, 7,-19,-37,-20, 13; /M: SY='D'; M= 0, 33,-24, 44, 11,-34, -7, -6,-31, -3,-24,-24, 11,-10, -3,-13, 3, -7,-21,-34,-20, 4; /M: SY='K'; M= -9, 1,-30, 4, 3,-31, 7, -8,-33, 17,-28,-14, 2,-14, 6, 14, -5,-13,-25,-22,-17, 4; /M: SY='C'; M=-10,-23, 80,-30,-27,-11,-30,-27,-16,-30, 0, -9,-23,-37,-27,-27,-16,-10, -4,-41,-21,-27; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='I'; M= -8,-27, 16,-36,-30, -6,-36,-30, 24,-28, 7, 7,-22,-27,-24,-28,-16, -8, 22,-30,-10,-30; /M: SY='V'; M= -3,-19,-16,-16, -4, -9,-27,-21, 13,-11, 1, 1,-21,-21,-16,-14, -7, -3, 27,-30,-13,-10; /M: SY='P'; M= 4,-16,-31,-12, -2,-27,-15,-19,-18,-10,-25,-18,-16, 61, -9,-19, -2, -4,-22,-28,-27, -9; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='E'; M=-13, 21,-30, 34, 49,-33,-17, 0,-33, 7,-23,-23, 6, -3, 14, -3, 0,-10,-30,-33,-20, 31; /M: SY='T'; M= 0, 11,-13, -2, -7,-13,-13,-11,-13, -7,-16,-13, 17,-13, -7, -8, 17, 33, -9,-32,-13, -7; /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27, 66,-30, -9, 0,-24, 7, 0,-20,-30,-31,-17,-20,-10, -3, 16, 44,-27; /M: SY='R'; M=-14, -7,-24,-10, -3,-17,-20, -6,-24, 19,-17,-10, 0,-17, 4, 47, -1, 7,-14,-23,-10, -3; /M: SY='N'; M= -5, 15,-23, 5, -9,-23, 27, -5,-27, -9,-28,-19, 29,-19, -9, -9, 7, -4,-27,-31,-23, -9; /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-27,-24, 48,-30, 5, 0,-17, 4, 0,-20,-30,-21,-14,-20,-10, -6, 23, 62,-24; /M: SY='H'; M=-15, 11,-30, 16, 10,-30,-18, 25,-31, 18,-26,-11, 7,-13, 12, 11, -7,-13,-26,-27, -4, 10; /M: SY='E'; M=-10, 7,-30, 14, 49,-33,-20, 3,-27, 10,-20,-14, 0, -3, 31, 3, 0,-10,-30,-27,-17, 40; /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-40,-30, 0,-40,-30, 49,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 31,-20, 0,-30; /M: SY='K'; M= -7, -9,-24, -9, -1,-21,-23,-16,-13, 30,-19, -4, -9,-16, -1, 16,-10, -7, 0,-23,-10, -1; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='V'; M= -6,-24,-16,-24,-21, -6,-27,-21, 13, -6, 1, 4,-21,-27,-19, 6,-10, -3, 30,-27,-10,-21; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M=-10, 6,-30, 13, 42,-30,-20, -4,-30, 25,-24,-16, 0, -4, 16, 11, -4,-10,-26,-26,-16, 29; /M: SY='V'; M= -4,-27, 26,-30,-28, -4,-30,-28, 11,-24, 8, 3,-27,-33,-28,-23,-13, -4, 27,-34,-14,-28; /M: SY='I'; M=-10,-17,-29,-22, -3, -9,-32,-18, 24,-16, 9, 13,-14,-14, -6,-19,-14,-10, 11,-23, -6, -8; /M: SY='L'; M= -7,-24,-24,-25,-21, -3, -2,-21, 6,-27, 23, 8,-20,-26,-20,-21,-20,-13, 1,-20, -9,-21; /M: SY='W'; M=-15,-26,-40,-26, -9, -2,-26,-23, -2,-16, -9, -9,-25,-20,-11,-18,-25,-20,-13, 60, 10, -9; /M: SY='N'; M= -5, 29,-17, 15, 0,-20, 0, 4,-20, -3,-30,-20, 45,-17, 0, -3, 18, 5,-24,-40,-20, 0; /M: SY='E'; M= -7, 23,-27, 32, 34,-31,-14, -1,-30, 3,-22,-22, 8, -6, 8, -6, 1, -8,-26,-32,-18, 21; /M: SY='P'; M=-10,-11,-37, -1, 17,-30,-20,-14,-23, -4,-27,-20,-14, 64, -1,-14, -7,-10,-30,-30,-27, 4; /M: SY='D'; M=-12, 16,-32, 25, 21,-32,-11, -5,-29, -1,-27,-23, 7, 20, 1,-10, -2, -9,-30,-34,-23, 10; /M: SY='I'; M=-10,-27, 14,-37,-30, -6,-37,-30, 26,-30, 8, 8,-20,-26,-23,-30,-17,-10, 19,-29, -9,-30; /M: SY='L'; M= -7,-30,-17,-30,-23, 7,-30,-23, 23,-27, 39, 17,-30,-30,-23,-20,-24, -7, 21,-23, -3,-23; /M: SY='V'; M= -3,-30,-15,-33,-30, 0,-33,-30, 35,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 45,-27, -7,-30; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 2 in 2 different sequences |
| Number of true positive hits | 2 in 2 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Peptidase C8 |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
2 sequences
POLB_CHPVE (Q04350), POLB_CHPVU (Q9YTU2)
|