PROSITE entry PS51877
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | HAV_P29_PRO |
| Accession [info] | PS51877 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
16-JAN-2019 CREATED;
16-JAN-2019 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51875 |
| Associated ProRule [info] | PRU01225 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Hypovirulence-associated virus (HAV) papain-like protease p29 domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=228; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=223; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6430479; R2=0.0250260; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=374; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=195; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-10; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M= 14,-25,-10,-25,-15,-10,-15,-20, 0,-15, 1, 26,-20,-20, -5,-15, -5, -5, 5,-25,-15,-15; /M: SY='A'; M= 32,-15, -3,-15, -7,-20, 0,-17,-13, -7,-23,-13,-12,-10, -7,-10, 18, 3, -5,-30,-20, -7; /M: SY='K'; M= -7, -8, 1,-15, 0,-27,-23,-10,-25, 19,-22,-15, -8,-15, 13, 2, -3,-10,-17,-25,-20, 2; /M: SY='I'; M=-15,-35,-10,-35,-30, 0,-40,-30, 30,-30, 30, 15,-35,-30,-25,-25,-25,-10, 20,-20,-10,-30; /M: SY='R'; M=-10,-10,-40,-20, 0,-30,-20, 0,-30, 20,-20,-20, 0,-20, 10, 60,-10,-10,-30,-30,-20, 0; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='H'; M=-15, 0,-30,-10, 5,-20,-20, 34,-30, 21,-30,-20, 5,-15, 10, 10, -5,-15,-25,-25, -1, 5; /M: SY='P'; M=-10,-23,-27,-23,-13,-28,-23,-20,-18,-13,-15, -3,-20, 47, -7,-20,-13,-10,-11,-34,-24,-13; /M: SY='S'; M= 9, 7,-17, 14, 4,-27, -3,-13,-20, -6,-30,-20, 1,-13, -3,-13, 17, 0,-17,-37,-23, 0; /M: SY='Q'; M= 7, -7,-20, -7, 10,-27,-13, 0,-23, 3,-20, -3, -7,-10, 36, 3, 3, -7,-13,-23,-20, 17; /M: SY='S'; M= 0,-13,-10,-13,-10,-13,-13,-17, -7,-10, -6, -7, -7,-17, -7,-13, 16, 3,-10,-27,-17,-10; /M: SY='I'; M=-11,-28,-10,-28,-24, -6,-34,-27, 18,-24, 18, 8,-25,-24,-20,-20,-15, 8, 14,-23,-13,-24; /M: SY='Q'; M= -3,-14,-23,-14,-12,-23, 3,-15,-12,-11,-16, -7,-14,-17, 4,-15, -7,-10, -2,-27,-20, -5; /M: SY='F'; M=-13,-27,-20,-30,-27, 8, -3,-21, -6,-27, 1, -3,-27,-30,-23,-23,-17,-16,-10,-14, -5,-27; /M: SY='S'; M= 7, -3,-10, -3, -3,-20, -7,-13,-17, -3,-23,-17, 7,-10, -3,-10, 30, 23,-13,-30,-20, -3; /M: SY='E'; M=-13, 9,-37, 19, 21,-36,-17,-10,-30, -3,-33,-26, -4, 17, 4,-13, -3,-10,-27,-39,-26, 14; /M: SY='A'; M= 14,-16, -7,-16,-12,-14,-12,-19, 2,-12,-12, -8,-12,-16,-12,-16, 12, 1, 2,-27,-17,-12; /M: SY='D'; M= -4, 3,-20, 9, -4,-23,-14,-17, -5,-11,-19,-13, -4,-17, -7,-21, 5, 0, -2,-37,-20, -4; /M: SY='D'; M=-20, 19,-34, 30, 5,-10,-16,-10,-21,-16,-28,-21, -2,-26, -9,-23, -6,-13,-24,-32,-12, -2; /M: SY='P'; M=-13, 0,-33, 7, 0,-40,-17,-17,-30,-10,-33,-30,-10, 46, -7,-20, -7,-10,-23,-43,-30, -3; /M: SY='L'; M=-13,-29,-10,-29,-23, -7,-33,-26, 9,-23, 22, 9,-26,-23,-16,-16,-16, 12, 6,-24,-14,-23; /M: SY='S'; M= 3, -7,-17, -7,-10,-23, 13,-17,-23,-10,-26,-20, 0,-13,-10,-13, 16, 14,-16,-30,-23,-10; /M: SY='V'; M= 0,-23,-10,-23,-23,-13,-27,-27, 17,-17, 3, 3,-20,-17,-17,-23,-10, 17, 27,-30,-13,-17; /M: SY='D'; M=-17, 25,-40, 36, 14,-37,-13, -7,-30, -1,-34,-27, 7,-20, 3, 4, -3,-10,-30,-44,-27, 7; /M: SY='P'; M=-13,-18,-26,-15, 1,-23,-27,-17,-13,-11, -6,-10,-21, 16, -4,-14,-14,-10,-13,-30,-20, -2; /M: SY='W'; M=-23,-36,-17,-43,-30, 25,-33,-20, 1,-30, 7, 1,-36,-37,-24,-27,-26,-20, -9, 27, 13,-30; /M: SY='T'; M= -6,-23,-13,-23,-20, -1,-27,-12, 4,-17, -3, -3,-17,-20,-17,-20,-10, 11, 11,-15, 11,-17; /M: SY='D'; M= -9, 12, 5, 19, -2,-30,-14,-16,-22,-14,-29,-25, -2,-21, -9,-24, 4, -6,-22,-37,-25, -7; /M: SY='T'; M= 13,-21, -7,-21,-17,-16,-17,-24, 4,-14, -6, -3,-18,-14,-14,-17, -1, 15, 14,-30,-16,-14; /M: SY='R'; M= 5, -6,-28, -7, 14,-27,-14, -6,-24, 8,-23,-17, -6,-14, 7, 19, -1, -7,-21,-30,-20, 10; /M: SY='T'; M= 4,-19,-17,-22,-14,-20,-20,-17, -3, -4, -8, -6,-14,-16, -7, 4, -6, 6, 4,-30,-17,-10; /M: SY='E'; M=-13, 19,-40, 32, 41,-33,-17, -3,-30, 4,-33,-23, 3,-13, 14, -6, 0,-10,-30,-36,-23, 31; /M: SY='E'; M=-10, 7,-37, 14, 41,-30,-20, 3,-30, 10,-27,-14, 0,-10, 32, 3, 0,-10,-27,-27,-20, 37; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='V'; M= 13,-18, -4,-18,-14,-10,-11,-18, 7,-11, -3, 0,-18,-11,-11,-14, -4, 0, 14,-21,-10,-11; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='V'; M= -3,-21, -7,-21,-21, -4,-24,-21, 24,-17, 10, 7,-21,-17,-17,-21,-14, -3, 25,-18, -7,-17; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; /M: SY='S'; M= 7, 0, -7, 0, 0,-13, 0, -7,-13, 0,-20,-13, 7, -7, 0, -7, 27, 7,-13,-20,-13, 0; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='H'; M=-20, 10,-30, -3, 0,-17,-17, 56,-30, -7,-33,-20, 27,-20, 7, 0, -3,-13,-30,-27, 7, 0; /M: SY='G'; M= 5, 4,-24, 11, -3,-30, 18,-17,-28,-14,-34,-24, -6,-17,-10,-17, 3,-11,-21,-37,-27, -7; /M: SY='D'; M=-17, 31,-40, 48, 29,-37,-13, -7,-30, -4,-37,-27, 7,-17, 6,-14, 0,-10,-30,-44,-27, 19; /M: SY='L'; M=-20,-40,-10,-40,-30, 0,-40,-30, 20,-30, 40, 20,-40,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,-10,-30; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='R'; M= -1, -4,-17, -7, 0,-17, -7, -3,-17, 7,-16,-13, 3,-10, 4, 19, 8, -1,-17,-20,-13, 0; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='R'; M= -7, -4,-23, -7, 6,-20,-13, 3,-20, 10,-13, -7, 0,-10, 22, 25, -4, -7,-17,-17,-13, 9; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='T'; M= 0, -7,-13, -7,-10,-16, 11,-13,-16,-10,-16,-13, -3,-10,-10,-10, 4, 12, -9,-20,-16,-10; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='P'; M=-10, -7,-20,-10, -4,-17,-13, 17,-20, -7,-20,-17, -4, 23, -1, -7, -7,-10,-16,-20, -5, -4; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='D'; M=-10, 17,-27, 28, 22,-23,-10, -4,-20, -1,-23,-17, 4,-10, 6, -7, 0, -7,-20,-27,-17, 16; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='M'; M= -7,-25,-20,-25,-22, -8, -8,-22, 3,-22, 4, 24,-20,-27,-12,-22,-15,-13, 4,-23,-15,-22; /M: SY='A'; M= 20,-20, -5,-20,-15,-17,-13,-23, 1,-13, -9, -5,-18,-13,-13,-15, 2, 12, 11,-30,-17,-13; /M: SY='C'; M= 0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40; /M: SY='K'; M=-10, -3,-33,-13, 7,-30,-20, -7,-30, 42,-27,-20, 0,-13, 10, 30, -3,-10,-23,-30,-20, 7; /M: SY='C'; M= 0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40; /M: SY='Q'; M= 3, -3,-25, 0, 19,-27,-15, 0,-25, 5,-22, -7, -5,-10, 32, 2, 3, -7,-17,-25,-20, 22; /M: SY='I'; M=-11,-32,-10,-32,-30, -1,-39,-30, 34,-29, 23, 12,-32,-29,-26,-28,-22, -9, 27,-21,-10,-29; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30,-10, 0,-10,-20, 80,-30,-10,-30,-20, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-20, 20, 0; /M: SY='M'; M=-10,-23,-20,-28,-18, 7,-28,-17, 3, -6, 0, 12,-21,-25,-11,-16,-15,-10, 5,-17, -1,-16; /M: SY='D'; M= -8, 8,-31, 16, 12,-30, 2,-12,-28, -7,-30,-23, 0,-15, -2,-12, 2, 1,-23,-35,-25, 6; /M: SY='F'; M=-13,-29,-18,-33,-25, 11,-29,-20, 4,-23, 1, -2,-29, -6,-21,-26,-19,-11, 3,-16, 0,-23; /M: SY='P'; M=-15, 10,-35, 20, 5,-40,-15,-15,-30,-10,-35,-30, -5, 30, -5,-20, -5,-10,-25,-45,-30, 0; /M: SY='S'; M= 15, -8, -7, -8, -5,-20, -5,-15,-15, -5,-22,-15, 0,-10, -5,-10, 24, 18, -9,-30,-20, -5; /M: SY='V'; M= 0,-23,-13,-23,-20,-10,-23,-23, 13,-15, 3, 16,-18,-20,-10,-23, -6, 0, 18,-27,-12,-15; /M: SY='L'; M=-15,-28,-15,-28,-18, -7,-35,-21, 13,-21, 21, 13,-28,-25, -4,-15,-21,-10, 8,-20,-12,-16; /M: SY='R'; M= 5,-10,-20,-15, -2,-25,-15,-13,-20, 13,-20,-15, -5,-12, 0, 14, 3, 8,-12,-30,-20, -2; /M: SY='S'; M= 2, 13,-20, 13, 3,-28, -5, -8,-23, -5,-33,-20, 15,-15, -2,-10, 16, 0,-20,-38,-23, 0; /M: SY='S'; M= 10, -8,-18,-10, -6,-25, 12,-15,-25, 4,-30,-20, -5,-13, -6, -6, 13, -5,-18,-30,-23, -6; /M: SY='E'; M= -5, -4,-25, -4, 11,-20,-17,-10,-18, 10,-18, -2, -2,-15, 8, -3, 6, -5,-16,-28,-18, 8; /M: SY='T'; M= -5,-18,-13,-20,-18, 5,-23,-18, 2,-18, -5, -5,-13,-22,-18,-20, 2, 8, 0,-17, -5,-18; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-30,-30,-20; /M: SY='C'; M= -5,-11, 35,-20,-23,-22,-23,-18,-15,-18,-17,-17, -1,-22,-18,-23, 0, 9,-12,-27,-20,-23; /M: SY='A'; M= 18,-23,-10,-23,-15,-22,-13,-23, -4,-13,-14, -9,-23, 8,-13,-18, -3, -2, 6,-32,-20,-13; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='L'; M= -1,-24, -5,-24,-17, -5,-20,-19, 8,-17, 15, 8,-24,-17,-12,-12,-13, -5, 5,-17,-10,-17; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='R'; M= -7, -2,-24, -7, 8,-22,-15, 0,-22, 19,-17, -9, 0,-10, 20, 21, -2, -7,-17,-19,-15, 10; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='S'; M= 9, -5,-10, -5, 2,-17, -5, -5,-15, 0,-17, -7, -2, -7, 12, -2, 13, 0,-10,-19,-15, 5; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='P'; M=-10,-20,-30,-20,-10,-40,-20,-20,-30,-10,-30,-30,-20, 80,-10,-20,-10,-10,-20,-40,-30,-10; /M: SY='H'; M= -6, 0,-28, 1, 9,-23, 4, 13,-30, -5,-32,-22, 2,-15, 3, -7, 7,-10,-28,-27,-12, 6; /M: SY='A'; M= 12,-12,-17,-17, -5,-20,-10, 12,-20, -3,-23,-15, -7,-15, 0, 9, 0, -8,-15,-27, -9, -5; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='G'; M= -3,-10,-22,-10,-12,-25, 23,-15,-27,-12,-27,-22,-10, 13,-12,-15, -3,-12,-20,-25,-22,-12; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='P'; M= 6,-15,-14,-15, -7,-24, -9,-15,-17, -7,-20,-17,-15, 35, -7,-12, -2, -5, -9,-27,-20, -7; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='V'; M= -2,-22, -7,-22,-22, -5,-25,-22, 25,-17, 10, 7,-22,-17,-17,-22,-15, -2, 27,-20, -7,-17; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='W'; M=-15,-26,-12,-31,-22, 15,-24,-15, 2,-21, 2, -1,-26,-26,-17,-21,-19,-13, -3, 19, 9,-21; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='C'; M= 20,-17, 22,-20,-15,-15, -7,-17, -7,-12,-12,-10,-17,-12,-12,-15, 3, -2, -2,-20,-15,-15; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='A'; M= 30,-15, 0,-15, -7,-15, 0,-15, -7, -7,-15, -7,-15, -7, -7, -7, 7, 0, 0,-22,-15, -7; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='F'; M= 1,-20,-10,-23,-15, 12,-15,-12, 0,-15, 0, 12,-18,-20,-11,-15, -8, -8, 0, -9, 1,-15; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='W'; M=-14,-10,-16,-17,-14, -5,-19, -9, -5,-14, -9, 0, -2,-22, -9,-14,-10,-10, -9, 8, -3,-14; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='D'; M= -7, 9,-27, 16, 11,-25, 9, -8,-25, -6,-27,-20, 0,-13, -1,-10, 0,-10,-22,-27,-20, 6; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='L'; M= -8,-19,-16,-22,-14,-11,-22,-14, 3, -6, 6, 2,-16,-17, -7, 5,-15, -5, 3,-20,-10,-12; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='H'; M=-12, -5,-22,-10, -3,-16,-15, 32,-22, -7,-22,-18, -1, 13, 2, -5, -7,-12,-20,-20, 1, -3; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='H'; M=-15, -3,-33,-13, 3,-21,-20, 35,-30, 14,-27,-20, 5,-17, 10, 22, -7,-15,-27,-25, -1, 3; /M: SY='R'; M= 4,-18,-16,-21,-10,-18,-16,-15,-10, -5, -7, -7,-13,-18, -5, 7, 1, -3,-10,-27,-17,-10; /M: SY='C'; M= 0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40; /M: SY='S'; M= 3, -3,-15, -3, 2,-22,-10, -8,-20, 0,-23,-13, 5,-10, 11, -5, 23, 16,-15,-28,-20, 4; /M: SY='L'; M= -6,-35, -8,-35,-25, -5,-31,-28, 13,-25, 26, 13,-35,-25,-18,-18,-21, -8, 8,-22,-12,-25; /M: SY='D'; M=-10, 20,-31, 22, 18,-30,-10, -2,-28, 0,-35,-22, 20,-15, 5, -7, 12, -3,-28,-37,-22, 13; /M: SY='E'; M=-12, 12,-35, 12, 30,-30,-18, 5,-30, 8,-30,-15, 14,-12, 26, 3, 2, -8,-27,-30,-20, 28; /M: SY='S'; M= 5, 1,-23, 3, 2,-27, -8,-10,-22, 1,-27,-20, 0,-15, 0, 7, 9, -3,-20,-35,-22, 0; /M: SY='T'; M= 0, -2,-18, 0, 8,-23,-15,-12,-18, -2,-20,-15, 2,-10, 0, -7, 15, 25,-12,-30,-20, 5; /M: SY='R'; M=-10, -7,-37,-17, 3,-30,-20, -3,-30, 28,-23,-20, 0,-17, 10, 49, -7,-10,-27,-30,-20, 3; /M: SY='Q'; M=-10, -9,-28, -6, 6,-23, -4,-10,-21, -7,-14, -9,-12,-17, 10, -7, -7,-13,-18,-25,-20, 6; /M: SY='L'; M= -2,-25,-12,-28,-15,-12,-25,-23, 0, -6, 8, 3,-25,-20,-10, -8,-13, -7, 0,-25,-15,-15; /M: SY='D'; M=-15, 23,-33, 38, 8,-33,-15,-15,-16,-12,-28,-20, 0,-20, -5,-22, -5, -8,-13,-45,-25, 3; /M: SY='Q'; M=-11,-11,-24,-10, 6, -9,-23, -7,-13, -6, -7, -3,-12,-19, 11, -8, -4, -9,-14,-20,-11, 6; /M: SY='R'; M= -5, -5,-30,-10, 5,-28,-15, 0,-28, 13,-22,-15, 2,-15, 20, 30, 5, -5,-25,-27,-20, 8; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 60,-30,-10, 0,-30, 0, 0,-30,-40,-30,-30,-20,-20,-10, 10, 30,-30; /M: SY='A'; M= 12,-23,-12,-25,-13,-17,-16,-18, -7, -8, -4, -4,-21,-18, -8, 4, -6, -5, -4,-27,-17,-13; /M: SY='D'; M=-15, 20,-35, 22, 22,-33,-15, 3,-30, 2,-32,-17, 17,-15, 21, -2, 2, -8,-27,-35,-23, 20; /M: SY='L'; M=-10,-25,-15,-25,-22,-12,-11,-25, -2,-22, 8, 0,-23,-22,-17,-17,-13, 3, -2,-25,-17,-22; /M: SY='V'; M= -5,-30,-12,-32,-30, 6,-30,-25, 23,-22, 8, 8,-30,-25,-22,-30,-20, -5, 28,-21, -1,-22; /M: SY='R'; M=-10,-12,-30,-20, -7,-20,-22, 15,-16, 3,-16,-13, -4,-20, 3, 23,-12,-10,-14,-27, -7, -5; /M: SY='D'; M= -9, 17,-29, 19, 9,-30, 1, -5,-29, -4,-36,-24, 18,-16, 0,-10, 12, -4,-28,-38,-24, 5; /M: SY='G'; M= 4,-20,-18,-20,-20,-20, 21,-23,-18,-20,-15,-13,-20,-20,-18,-18, -5,-13,-13,-27,-23,-20; /M: SY='Q'; M=-15,-19,-22,-19, -4, -6,-28, 2,-11, -9, -1, 3,-16,-21, 18, -6,-13,-13, -9,-10, 6, 1; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='P'; M=-15, 9,-35, 19, 5,-40,-15,-15,-30,-10,-35,-30, -5, 31, -5,-20, -5,-10,-25,-45,-30, 0; /M: M= -6,-28,-16,-31,-22, -1,-26,-21, 0,-21, 0, -3,-28, 0,-18,-22,-16,-10, 0,-21, -7,-21; /M: SY='R'; M=-10, 3,-33, -8, -2,-30, 2, -5,-32, 12,-32,-22, 13,-18, 0, 16, 0,-10,-28,-33,-22, -2; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='P'; M=-13,-23,-16,-23,-15, -4,-23, -8, -5,-15, 0, -5,-21, 7,-13,-15,-15,-10, -5,-11, 6,-15; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='S'; M= 15, -7, -8, -7, -5,-20, -5,-15,-15, -5,-22,-15, 0,-10, -5,-10, 25, 18,-10,-30,-20, -5; /M: SY='Y'; M=-17,-20,-25,-23,-13, 2,-25, 24,-20,-15,-20,-18,-13, 1,-10,-15,-15,-17,-17, -5, 32,-13; /M: SY='M'; M=-10,-18,-25,-23,-15, 0, -5,-15,-14, -6,-12, 4,-15,-25,-10,-13,-10,-15,-12,-18, -8,-15; /M: SY='T'; M= -3, -8,-17, -6, 1,-17,-20,-15, -4, -8,-12, -9, -6,-15, -6,-13, 7, 9, -4,-27,-17, -1; /M: SY='T'; M= 6,-18,-17,-20,-10,-18,-17,-15,-10, -5, -8, 4,-10,-17, -2, 6, -2, 7, -5,-28,-18,-10; /M: SY='R'; M= 2,-12,-31,-20, -2,-28,-15, -5,-25, 13,-20,-18, -5,-18, 5, 44, -5, -8,-23,-30,-20, -2; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='L'; M=-10,-23,-13,-23,-17,-11,-25,-20, 6,-17, 7, -1,-23, 7,-15,-18,-15, -8, 4,-21,-13,-17; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='P'; M=-13, 0,-33, 3, 2,-38,-17,-15,-30, 4,-33,-28, -8, 33, -3,-10, -5,-10,-23,-40,-28, 0; /M: SY='R'; M=-10, -5,-35,-15, 5,-30,-20, -5,-30, 34,-25,-20, 0,-15, 10, 41, -5,-10,-25,-30,-20, 5; /M: SY='P'; M= -8, -8,-30, -8, 6,-30,-20,-10,-25, 2,-23,-20, -5, 12, 2, 8, -3, 4,-20,-33,-23, 4; /M: SY='V'; M= -2,-30,-10,-30,-30, -8,-32,-30, 32,-22, 12, 10,-30,-22,-22,-30,-20, -2, 38,-28,-10,-22; /M: SY='R'; M= 2,-13,-26,-13, 5,-20,-18,-10,-15, 0,-12, 3,-10,-18, 5, 9, -6, -8,-13,-27,-17, 2; /M: SY='G'; M=-10, 0,-35, 2, -3,-35, 4,-12,-33, -5,-33,-27, -5, 3, -5, 1, -5,-13,-28,-37,-27, -5; /M: SY='W'; M=-22,-37,-15,-40,-27, 10,-35,-15, 3,-27, 13, 3,-35,-32,-20,-22,-27,-17, -5, 19, 18,-27; /M: SY='A'; M= 19,-20, 17,-23,-21,-22, 6,-23,-17,-18,-22,-18,-20,-18,-18,-21, 2, -8,-10,-27,-22,-21; /M: SY='S'; M= 11,-14, -7,-14, -9,-15, -9,-17, -8, -9,-11, -8, -9,-15, -7,-12, 16, 3, -8,-28,-18, -9; /M: SY='K'; M= -5, 0,-25, -5, 10,-27,-15, -5,-27, 27,-28,-15, 3,-10, 19, 9, 11, -5,-20,-28,-20, 12; /M: SY='S'; M= 5, -3,-18, -5, 0,-23, -5, -7,-23, 5,-27,-20, 7,-13, 3, 9, 26, 5,-23,-30,-20, 0; /M: SY='N'; M=-10, 14,-29, 7, 3,-29,-10, 0,-28, 4,-32,-21, 26,-18, 3, 10, 11, -2,-28,-36,-21, 1; /M: M=-10,-17,-30,-22,-15,-11, 0,-12,-26,-10,-23,-20,-15, -2,-12, -2,-10,-15,-23,-23,-13,-15; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='Q'; M= -4, 2,-22, 7, 3,-25,-15,-10,-13, -5,-20,-10, -2,-15, 11,-12, 6, -2, -8,-32,-20, 5; /M: SY='I'; M=-10,-26,-15,-26,-18, -9,-33,-20, 15,-18, 14, 10,-26,-23, -3,-18,-18, -8, 15,-22,-12,-13; /M: SY='S'; M= 13, -5,-12, -8, 0,-22, -5,-13,-20, 9,-27,-17, -1,-10, 0, -3, 22, 2,-15,-30,-20, 0; /M: SY='Q'; M=-20, 8,-30, 5, 3,-23,-17, -2,-28, -7,-30,-17, 9,-22, 12, -9, -4,-12,-27, -5,-13, 4; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 60,-30,-10, 0,-30, 0, 0,-30,-40,-30,-30,-20,-20,-10, 10, 30,-30; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-30,-30,-20; /M: SY='K'; M=-10, -7,-28,-12, 6,-23,-22, -7,-21, 23,-16, 4, -5,-15, 21, 8, -5,-10,-13,-25,-18, 9; /M: SY='G'; M= -5, 2,-32, 6,-11,-32, 44,-18,-38,-18,-40,-30, -5,-20,-15,-20, 0,-18,-30,-35,-30,-13; /M: SY='Y'; M=-18,-23,-22,-23,-11, 16,-28, 18,-15,-13,-12, -8,-15,-25, -2,-13,-15,-18,-12, 11, 49, -8; /M: SY='C'; M= 0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40; /M: SY='Y'; M=-22,-32,-20,-35,-22, 25,-30, 11,-12,-22,-12,-12,-25,-32,-20,-22,-22,-22,-15, 38, 58,-22; /M: SY='L'; M= -6,-35, -8,-35,-25, -5,-31,-28, 13,-25, 26, 13,-35,-25,-18,-18,-21, -8, 8,-22,-12,-25; /M: SY='S'; M= -2, 2,-22, 2, 12,-20,-10, 15,-25, 0,-30,-20, 8,-13, 7, -5, 18, -2,-25,-27,-10, 10; /M: SY='A'; M= 18,-15,-13,-12, 1,-20,-12,-17, -6, -7,-15, -8,-17,-12, -5,-12, 0, -3, 2,-30,-18, 0; /M: SY='I'; M=-12,-35,-10,-35,-30, -2,-38,-30, 28,-28, 27, 15,-35,-28,-23,-25,-25, -8, 23,-22,-10,-28; /M: SY='R'; M= -7,-15,-32,-23, -8,-25,-23, -8,-14, 9,-12,-12, -8,-20, 2, 35,-13, -7,-11,-30,-17, -5; /M: SY='P'; M=-15, 12,-35, 22, 6,-40,-15,-15,-30,-10,-35,-30, -4, 27, -5,-20, -5,-10,-25,-45,-30, 1; /M: SY='S'; M= 1, 2,-22, 2, 14,-25, -9, -8,-25, 14,-30,-20, 5,-10, 7, -1, 21, 1,-22,-30,-20, 12; /M: SY='F'; M= -4,-30,-12,-35,-25, 24,-24,-17, 2,-25, 4, 2,-30,-29,-22,-22,-14,-12, -3, -8, 7,-25; /M: SY='R'; M= 2,-10,-28,-18, 0,-28,-15, -7,-25, 20,-22,-18, -5,-15, 5, 34, -3, -8,-21,-30,-20, 0; /M: SY='W'; M=-18,-24,-20,-31,-16, -6,-25,-18,-20, -6,-20,-18,-21,-26,-11,-13,-14, -7,-21, 39, 1,-16; /M: SY='R'; M=-10,-15,-33,-22, -7,-23,-25, -7,-13, 8,-10,-13, -7,-22, 0, 38,-12,-10,-16,-28,-18, -7; /M: SY='V'; M= 12,-20, -8,-20,-18,-15,-15,-23, 8,-13, -7, -2,-17,-15,-13,-20, 2, 3, 15,-30,-15,-13; /M: SY='A'; M= 21,-25, 21,-27,-22,-18,-15,-25, -1,-17,-11, -8,-25,-17,-17,-22, -2, -3, 7,-27,-18,-20; /M: SY='R'; M=-10, -8,-38,-15, 5,-30,-20, 2,-30, 18,-20,-15, 0,-18, 22, 48, -8,-10,-28,-28,-20, 7; /M: SY='A'; M= 20,-20, -5,-20,-15,-18,-12,-22, -1,-12,-10, -5,-17,-12,-12,-15, 3, 14, 9,-30,-18,-12; /M: SY='T'; M= -1,-25,-10,-27,-20, 4,-23,-20, 0,-20, 3, 0,-22,-22,-17,-17, -7, 6, 0,-18, -5,-20; /M: SY='G'; M= 9,-12,-23,-12,-18,-28, 46,-20,-33,-18,-35,-25,-12,-18,-18,-18, 2,-15,-23,-30,-28,-18; /M: SY='P'; M=-18,-28,-25,-31,-18,-10,-25,-11,-23,-18,-23,-23,-25, 22,-15,-23,-18,-18,-20, 12, 7,-18; /M: SY='C'; M= -7,-23, 34,-26,-17,-17,-30,-23, -7,-21, -2,-10,-26,-25,-16,-26,-13,-10, -9,-22,-17,-19; /M: SY='P'; M= -7,-25,-20,-25,-20,-23,-27,-25, 3,-17, -8,-10,-25, 27,-17,-25,-15, -7, 8,-33,-20,-17; /M: SY='T'; M= -7,-22,-18,-24,-17,-16,-27,-19, 1, -9, 4, -1,-16,-20, -9, 2,-12, 8, 4,-28,-15,-14; /M: SY='I'; M= -9,-32,-12,-35,-30, 9,-32,-25, 21,-25, 15, 10,-32,-27,-22,-28,-22, -7, 21,-18, 0,-25; /M: SY='S'; M= 13, -8,-15,-11, -3,-23, -5,-10,-20, 2,-25,-17, -1,-13, 0, 8, 19, 2,-17,-30,-20, -3; /M: SY='D'; M= -5, 25,-30, 39, 12,-35, -7,-13,-25,-10,-35,-25, 2,-17, -3,-17, 3, -7,-22,-45,-27, 5; /M: SY='Y'; M=-15,-30,-18,-32,-25, 27,-30, 1, 2,-22, -3, -3,-25,-30,-22,-25,-20,-15, 2, 6, 42,-22; /M: SY='I'; M=-13,-26,-15,-26,-18, -7,-35,-21, 18,-21, 16, 10,-26,-25, -7,-18,-18,-10, 13,-20,-12,-16; /M: SY='R'; M=-10,-10,-35,-18, 0,-33,-20, -8,-30, 19,-25,-23, -5, 8, 5, 30, -8,-10,-25,-33,-23, 0; /M: SY='L'; M=-15,-35,-13,-35,-27, 5,-35,-17, 15,-25, 20, 10,-32,-28,-20,-22,-25,-10, 12,-12, 11,-25; /M: SY='L'; M=-22,-40,-12,-42,-30, 2,-38,-28, 10,-30, 26, 10,-40,-32,-20,-22,-30,-15, 0, 9, -3,-30; /M: SY='Q'; M=-10, -5,-30, -5, 15,-23,-22, -5,-20, 13,-15, 5, -5,-15, 24, 3, -5,-10,-15,-25,-18, 15; /M: SY='W'; M=-15,-28,-18,-31,-18, -7,-30,-18, 0,-18, 2, 2,-28,-25, -1,-18,-20,-13, 0, 10, -4,-13; /M: SY='V'; M= -5,-30, 11,-35,-32, 4,-30,-25, 14,-25, 3, 1,-30,-27,-25,-32,-18, -7, 17,-18, -3,-27; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-30,-30,-20; /M: SY='K'; M=-12,-12,-28,-20, -2,-23,-25,-12,-18, 23,-11,-10,-10,-18, 3, 21,-10,-10,-16,-28,-18, -2; /M: SY='R'; M=-10,-10, -5,-20, -7,-23,-22, 10,-25, 9,-23,-20, -5,-20, 1, 12, -7,-12,-23,-25,-10, -7; /M: SY='S'; M= -2, -3,-25, -3, 9,-25,-15, -8,-22, 5,-23,-18, 3,-13, 5, 10, 11, 10,-20,-30,-20, 7; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='F'; M=-11,-18, -8,-21,-16, 16,-18,-10, 5,-16, 10, 5,-18,-19,-13,-13,-13, -8, 0, -2, 6,-16; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-30,-30,-20; /M: SY='S'; M= 0, -5,-20, -7, -5,-25, 6,-15,-25, 4,-28,-20, 0,-13, -5, -6, 13, 7,-18,-30,-23, -5; /M: SY='S'; M= 4,-18,-15,-20,-13, -3,-13,-15,-14,-13,-19,-14,-15, 2,-13,-18, 5, -5,-12,-21, -9,-13; /M: SY='Q'; M=-12, -7,-28, -9, 6,-18,-22, 20,-21, -2,-13, 9, -2,-17, 34, 1, -7,-12,-15,-20, -8, 11; /M: SY='I'; M=-10,-16,-24,-16, -4,-14,-31,-16, 7, -9, -1, -4,-16,-23, -9, -2,-13,-10, 2,-25,-15, -6; /M: SY='L'; M= -2,-21,-16,-18, -3,-13,-24,-19, -1,-14, 5, 1,-24,-19, -6,-12,-12, -7, -4,-25,-15, -6; /M: SY='I'; M= -8,-20,-17,-20,-14,-11,-32,-23, 18,-11, 4, 2,-22,-22,-15,-19,-15, -8, 17,-25,-13,-13; /M: SY='P'; M= -7, 5,-27, 8, 5,-32,-12,-12,-27, 7,-33,-25, 1, 9, 0, -8, 9, -5,-23,-38,-25, 2; /M: SY='V'; M= 3,-21,-16,-23,-17,-18,-22,-20, 4, -7, -5, -3,-17,-17,-10, -1, -9, 4, 11,-30,-15,-12; /M: SY='V'; M= -7,-13,-22,-13, -3,-15,-25, 3, 1,-10, -9, -5,-13,-17, -3,-15,-13, -7, 6,-28, -6, 0; /M: SY='D'; M=-12, 24,-31, 28, 14,-31, -9, -3,-28, -2,-36,-24, 21,-16, 3,-10, 12, -3,-28,-40,-24, 9; /M: SY='G'; M= -8, -5,-30,-10, -7,-25, 18, 10,-35, 1,-35,-25, -2,-17, -4, -4, -3,-17,-27,-27,-14, -7; /M: SY='L'; M=-15,-35,-12,-35,-28, 4,-35,-18, 16,-25, 20, 10,-32,-27,-20,-23,-25,-10, 13,-13, 9,-25; /M: SY='Y'; M=-20,-32,-20,-35,-22, 18,-30, 0, -7,-22, -5, 6,-25,-32,-15,-22,-22,-20,-10, 29, 38,-22; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30,-10, 0,-10,-20, 80,-30,-10,-30,-20, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-20, 20, 0; /M: SY='V'; M= -9,-35,-10,-35,-30, -5,-35,-30, 25,-25, 24, 15,-35,-25,-20,-25,-25, -5, 26,-25,-10,-25; /M: SY='C'; M= -4,-16, 9,-16, -9,-18,-27,-21, -2,-15, -8, -9,-16,-19,-12,-21, -6, 6, 0,-26,-17,-10; /M: SY='V'; M= -2,-20,-22,-22,-20,-20, -5,-20, -2,-10,-10, -7,-18,-20,-13, -6,-12, -8, 5,-30,-18,-15; /M: SY='D'; M=-10, 1,-30, 9, 7,-31,-20,-15,-16, -8,-23,-18,-10, 8, -3,-18, -7, -8,-11,-38,-23, 5; /M: SY='K'; M= -4, 4,-23, -6, 2,-27,-15, -8,-25, 21,-28,-17, 13,-13, 2, 7, 5, 2,-17,-33,-20, 2; /M: SY='E'; M=-12, 17,-40, 29, 43,-32,-18, -2,-30, 5,-32,-22, 2,-12, 15, -5, 0,-10,-30,-35,-22, 33; /M: SY='V'; M=-10,-19,-19,-23,-15, -7,-29, -3, 5, -5, -5, -4,-16,-21,-11,-13,-14,-10, 7,-19, 3,-13; /M: SY='K'; M= -7, -3,-30, -7, 5,-30, 1, -7,-33, 21,-30,-17, -3,-13, 16, 7, 0,-13,-23,-27,-23, 8; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='S'; M= 5, 0, -5, 0, 0,-10, 0, -5,-10, 0,-15,-10, 5, -5, 0, -5, 20, 5,-10,-15,-10, 0; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='E'; M= -5, 3,-18, 3, 16,-15,-10, -2,-15, 14,-15,-10, 0, -5, 8, 5, 0, -5,-13,-15,-10, 13; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='Q'; M= 0, 0,-11, 0, 5,-13, -5, 0,-13, 3,-12, -5, 2, -5, 16, 0, 9, 0,-10,-12,-10, 8; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='D'; M= 4, 6,-11, 12, 3,-16, -3, -7,-11, -5,-16,-11, -2, -8, -2, -8, 2, -3, -8,-21,-13, 0; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='G'; M= 3, -7,-25, -7,-15,-27, 45,-17,-35,-15,-37,-27, -5,-17,-15,-17, 10,-12,-27,-30,-27,-15; /M: SY='A'; M= 15,-10,-15,-12, 2,-25,-10,-10,-20, 9,-22,-10,-10,-10, 13, 2, 5, -5,-10,-27,-20, 5; /M: SY='L'; M=-15,-28,-15,-31,-21, -7,-35,-25, 13,-12, 19, 8,-28,-25,-15,-13,-21,-10, 8,-22,-12,-21; /M: SY='I'; M=-12,-30,-18,-33,-25, 4,-30,-22, 5,-23, 5, 0,-30, -4,-20,-25,-20,-10, 5,-19, -4,-23; /M: SY='Y'; M=-20,-32,-18,-32,-22, 23,-32, 8, -3,-22, 2, -3,-25,-30,-20,-20,-22,-18, -5, 10, 51,-22; /M: SY='Q'; M= -8, 8,-30, 11, 11,-30,-13, -2,-28, 5,-28,-17, 5,-15, 19, 9, 7, -5,-25,-32,-23, 11; /M: SY='T'; M= 1, -9,-14, -4, -8,-19,-17,-20, -7,-15, -7, -7,-13,-17,-10,-15, -3, 7, -4,-32,-20,-11; /M: SY='V'; M= -9,-25,-20,-28,-20, -3,-29,-10, 7,-12, -1, -2,-20,-24,-14, -6,-18, -9, 9,-16, 8,-17; /M: SY='H'; M= -9, 5,-22, 8, 1,-20,-13, 9,-19, -9,-23,-17, 3,-18, 0,-12, 8, -5,-21,-31,-12, -2; /M: SY='F'; M=-17,-20,-22,-22,-22, 20,-17,-16, -5,-26, -1, -3,-24,-32,-22,-25,-17,-16,-11,-11, 4,-23; /M: SY='I'; M= 1,-30, -8,-30,-25, -7,-28,-28, 21,-23, 14, 8,-30,-23,-20,-23,-16, -5, 20,-25,-12,-23; /M: SY='C'; M= 13,-20, 18,-23,-20,-18,-15,-22, -3,-15,-13,-10,-18,-17,-15,-22, 5, 0, 2,-27,-18,-18; /M: SY='H'; M= 6, -9,-23,-12, 3,-22,-13, 12,-23, 0,-24,-16, -5,-15, 4, 12, -1, -9,-19,-28,-10, 2; /M: SY='N'; M= -8, -3,-27,-11,-10,-25, -1,-11,-18, 0,-24,-15, 6,-19, -7, -1, -4, -7,-12,-33,-20, -8; /M: SY='Q'; M= -8, 11,-28, 16, 15,-30,-13, 0,-28, 2,-28,-13, 5,-13, 30, -3, 9, -5,-23,-31,-23, 18; /M: SY='P'; M=-15,-27,-23,-27,-17,-12,-27,-12,-13,-17, -8,-13,-25, 25,-15,-20,-17,-13,-10,-20, 0,-17; /M: SY='L'; M=-15,-33,-15,-33,-28, -7,-17,-28, 6,-28, 22, 8,-33,-28,-20,-20,-23,-12, 1,-22,-15,-28; /M: SY='A'; M= 13,-20,-10,-23,-10,-17,-15,-20, -7, -1, -7, -5,-20,-15, -8, -5, -3, -5, -2,-27,-17,-10; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='R'; M=-10, -8,-38,-18, 2,-30,-20, -2,-30, 27,-22,-20, 0,-18, 10, 50, -8,-10,-28,-30,-20, 2; /M: SY='I'; M= -7,-30,-10,-30,-30, -3,-37,-30, 37,-27, 17, 10,-30,-27,-27,-30,-20, -7, 33,-23,-10,-27; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-30,-30,-20; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 2 in 2 different sequences |
| Number of true positive hits | 2 in 2 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Peptidase C7 |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
2 sequences
POLA_CHPVE (P10941), POLA_CHPVU (Q9YTU3)
|