PROSITE logo

PROSITE entry PS51877


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] HAV_P29_PRO
Accession [info] PS51877
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 16-JAN-2019 CREATED;
16-JAN-2019 DATA UPDATE;
29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51875
Associated ProRule [info] PRU01225

Name and characterization of the entry

Description [info] Hypovirulence-associated virus (HAV) papain-like protease p29 domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=228;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=223;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6430479; R2=0.0250260; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=374; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=195; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-10; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='M';  M= 14,-25,-10,-25,-15,-10,-15,-20,  0,-15,  1, 26,-20,-20, -5,-15, -5, -5,  5,-25,-15,-15;
/M: SY='A';  M= 32,-15, -3,-15, -7,-20,  0,-17,-13, -7,-23,-13,-12,-10, -7,-10, 18,  3, -5,-30,-20, -7;
/M: SY='K';  M= -7, -8,  1,-15,  0,-27,-23,-10,-25, 19,-22,-15, -8,-15, 13,  2, -3,-10,-17,-25,-20,  2;
/M: SY='I';  M=-15,-35,-10,-35,-30,  0,-40,-30, 30,-30, 30, 15,-35,-30,-25,-25,-25,-10, 20,-20,-10,-30;
/M: SY='R';  M=-10,-10,-40,-20,  0,-30,-20,  0,-30, 20,-20,-20,  0,-20, 10, 60,-10,-10,-30,-30,-20,  0;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='H';  M=-15,  0,-30,-10,  5,-20,-20, 34,-30, 21,-30,-20,  5,-15, 10, 10, -5,-15,-25,-25, -1,  5;
/M: SY='P';  M=-10,-23,-27,-23,-13,-28,-23,-20,-18,-13,-15, -3,-20, 47, -7,-20,-13,-10,-11,-34,-24,-13;
/M: SY='S';  M=  9,  7,-17, 14,  4,-27, -3,-13,-20, -6,-30,-20,  1,-13, -3,-13, 17,  0,-17,-37,-23,  0;
/M: SY='Q';  M=  7, -7,-20, -7, 10,-27,-13,  0,-23,  3,-20, -3, -7,-10, 36,  3,  3, -7,-13,-23,-20, 17;
/M: SY='S';  M=  0,-13,-10,-13,-10,-13,-13,-17, -7,-10, -6, -7, -7,-17, -7,-13, 16,  3,-10,-27,-17,-10;
/M: SY='I';  M=-11,-28,-10,-28,-24, -6,-34,-27, 18,-24, 18,  8,-25,-24,-20,-20,-15,  8, 14,-23,-13,-24;
/M: SY='Q';  M= -3,-14,-23,-14,-12,-23,  3,-15,-12,-11,-16, -7,-14,-17,  4,-15, -7,-10, -2,-27,-20, -5;
/M: SY='F';  M=-13,-27,-20,-30,-27,  8, -3,-21, -6,-27,  1, -3,-27,-30,-23,-23,-17,-16,-10,-14, -5,-27;
/M: SY='S';  M=  7, -3,-10, -3, -3,-20, -7,-13,-17, -3,-23,-17,  7,-10, -3,-10, 30, 23,-13,-30,-20, -3;
/M: SY='E';  M=-13,  9,-37, 19, 21,-36,-17,-10,-30, -3,-33,-26, -4, 17,  4,-13, -3,-10,-27,-39,-26, 14;
/M: SY='A';  M= 14,-16, -7,-16,-12,-14,-12,-19,  2,-12,-12, -8,-12,-16,-12,-16, 12,  1,  2,-27,-17,-12;
/M: SY='D';  M= -4,  3,-20,  9, -4,-23,-14,-17, -5,-11,-19,-13, -4,-17, -7,-21,  5,  0, -2,-37,-20, -4;
/M: SY='D';  M=-20, 19,-34, 30,  5,-10,-16,-10,-21,-16,-28,-21, -2,-26, -9,-23, -6,-13,-24,-32,-12, -2;
/M: SY='P';  M=-13,  0,-33,  7,  0,-40,-17,-17,-30,-10,-33,-30,-10, 46, -7,-20, -7,-10,-23,-43,-30, -3;
/M: SY='L';  M=-13,-29,-10,-29,-23, -7,-33,-26,  9,-23, 22,  9,-26,-23,-16,-16,-16, 12,  6,-24,-14,-23;
/M: SY='S';  M=  3, -7,-17, -7,-10,-23, 13,-17,-23,-10,-26,-20,  0,-13,-10,-13, 16, 14,-16,-30,-23,-10;
/M: SY='V';  M=  0,-23,-10,-23,-23,-13,-27,-27, 17,-17,  3,  3,-20,-17,-17,-23,-10, 17, 27,-30,-13,-17;
/M: SY='D';  M=-17, 25,-40, 36, 14,-37,-13, -7,-30, -1,-34,-27,  7,-20,  3,  4, -3,-10,-30,-44,-27,  7;
/M: SY='P';  M=-13,-18,-26,-15,  1,-23,-27,-17,-13,-11, -6,-10,-21, 16, -4,-14,-14,-10,-13,-30,-20, -2;
/M: SY='W';  M=-23,-36,-17,-43,-30, 25,-33,-20,  1,-30,  7,  1,-36,-37,-24,-27,-26,-20, -9, 27, 13,-30;
/M: SY='T';  M= -6,-23,-13,-23,-20, -1,-27,-12,  4,-17, -3, -3,-17,-20,-17,-20,-10, 11, 11,-15, 11,-17;
/M: SY='D';  M= -9, 12,  5, 19, -2,-30,-14,-16,-22,-14,-29,-25, -2,-21, -9,-24,  4, -6,-22,-37,-25, -7;
/M: SY='T';  M= 13,-21, -7,-21,-17,-16,-17,-24,  4,-14, -6, -3,-18,-14,-14,-17, -1, 15, 14,-30,-16,-14;
/M: SY='R';  M=  5, -6,-28, -7, 14,-27,-14, -6,-24,  8,-23,-17, -6,-14,  7, 19, -1, -7,-21,-30,-20, 10;
/M: SY='T';  M=  4,-19,-17,-22,-14,-20,-20,-17, -3, -4, -8, -6,-14,-16, -7,  4, -6,  6,  4,-30,-17,-10;
/M: SY='E';  M=-13, 19,-40, 32, 41,-33,-17, -3,-30,  4,-33,-23,  3,-13, 14, -6,  0,-10,-30,-36,-23, 31;
/M: SY='E';  M=-10,  7,-37, 14, 41,-30,-20,  3,-30, 10,-27,-14,  0,-10, 32,  3,  0,-10,-27,-27,-20, 37;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='V';  M= 13,-18, -4,-18,-14,-10,-11,-18,  7,-11, -3,  0,-18,-11,-11,-14, -4,  0, 14,-21,-10,-11; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='V';  M= -3,-21, -7,-21,-21, -4,-24,-21, 24,-17, 10,  7,-21,-17,-17,-21,-14, -3, 25,-18, -7,-17; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='S';  M=  7,  0, -7,  0,  0,-13,  0, -7,-13,  0,-20,-13,  7, -7,  0, -7, 27,  7,-13,-20,-13,  0; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='H';  M=-20, 10,-30, -3,  0,-17,-17, 56,-30, -7,-33,-20, 27,-20,  7,  0, -3,-13,-30,-27,  7,  0;
/M: SY='G';  M=  5,  4,-24, 11, -3,-30, 18,-17,-28,-14,-34,-24, -6,-17,-10,-17,  3,-11,-21,-37,-27, -7;
/M: SY='D';  M=-17, 31,-40, 48, 29,-37,-13, -7,-30, -4,-37,-27,  7,-17,  6,-14,  0,-10,-30,-44,-27, 19;
/M: SY='L';  M=-20,-40,-10,-40,-30,  0,-40,-30, 20,-30, 40, 20,-40,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,-10,-30;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='R';  M= -1, -4,-17, -7,  0,-17, -7, -3,-17,  7,-16,-13,  3,-10,  4, 19,  8, -1,-17,-20,-13,  0; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='R';  M= -7, -4,-23, -7,  6,-20,-13,  3,-20, 10,-13, -7,  0,-10, 22, 25, -4, -7,-17,-17,-13,  9; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='T';  M=  0, -7,-13, -7,-10,-16, 11,-13,-16,-10,-16,-13, -3,-10,-10,-10,  4, 12, -9,-20,-16,-10; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='P';  M=-10, -7,-20,-10, -4,-17,-13, 17,-20, -7,-20,-17, -4, 23, -1, -7, -7,-10,-16,-20, -5, -4; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='D';  M=-10, 17,-27, 28, 22,-23,-10, -4,-20, -1,-23,-17,  4,-10,  6, -7,  0, -7,-20,-27,-17, 16; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='M';  M= -7,-25,-20,-25,-22, -8, -8,-22,  3,-22,  4, 24,-20,-27,-12,-22,-15,-13,  4,-23,-15,-22;
/M: SY='A';  M= 20,-20, -5,-20,-15,-17,-13,-23,  1,-13, -9, -5,-18,-13,-13,-15,  2, 12, 11,-30,-17,-13;
/M: SY='C';  M=  0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
/M: SY='K';  M=-10, -3,-33,-13,  7,-30,-20, -7,-30, 42,-27,-20,  0,-13, 10, 30, -3,-10,-23,-30,-20,  7;
/M: SY='C';  M=  0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
/M: SY='Q';  M=  3, -3,-25,  0, 19,-27,-15,  0,-25,  5,-22, -7, -5,-10, 32,  2,  3, -7,-17,-25,-20, 22;
/M: SY='I';  M=-11,-32,-10,-32,-30, -1,-39,-30, 34,-29, 23, 12,-32,-29,-26,-28,-22, -9, 27,-21,-10,-29;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,-10,  0,-10,-20, 80,-30,-10,-30,-20, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-20, 20,  0;
/M: SY='M';  M=-10,-23,-20,-28,-18,  7,-28,-17,  3, -6,  0, 12,-21,-25,-11,-16,-15,-10,  5,-17, -1,-16;
/M: SY='D';  M= -8,  8,-31, 16, 12,-30,  2,-12,-28, -7,-30,-23,  0,-15, -2,-12,  2,  1,-23,-35,-25,  6;
/M: SY='F';  M=-13,-29,-18,-33,-25, 11,-29,-20,  4,-23,  1, -2,-29, -6,-21,-26,-19,-11,  3,-16,  0,-23;
/M: SY='P';  M=-15, 10,-35, 20,  5,-40,-15,-15,-30,-10,-35,-30, -5, 30, -5,-20, -5,-10,-25,-45,-30,  0;
/M: SY='S';  M= 15, -8, -7, -8, -5,-20, -5,-15,-15, -5,-22,-15,  0,-10, -5,-10, 24, 18, -9,-30,-20, -5;
/M: SY='V';  M=  0,-23,-13,-23,-20,-10,-23,-23, 13,-15,  3, 16,-18,-20,-10,-23, -6,  0, 18,-27,-12,-15;
/M: SY='L';  M=-15,-28,-15,-28,-18, -7,-35,-21, 13,-21, 21, 13,-28,-25, -4,-15,-21,-10,  8,-20,-12,-16;
/M: SY='R';  M=  5,-10,-20,-15, -2,-25,-15,-13,-20, 13,-20,-15, -5,-12,  0, 14,  3,  8,-12,-30,-20, -2;
/M: SY='S';  M=  2, 13,-20, 13,  3,-28, -5, -8,-23, -5,-33,-20, 15,-15, -2,-10, 16,  0,-20,-38,-23,  0;
/M: SY='S';  M= 10, -8,-18,-10, -6,-25, 12,-15,-25,  4,-30,-20, -5,-13, -6, -6, 13, -5,-18,-30,-23, -6;
/M: SY='E';  M= -5, -4,-25, -4, 11,-20,-17,-10,-18, 10,-18, -2, -2,-15,  8, -3,  6, -5,-16,-28,-18,  8;
/M: SY='T';  M= -5,-18,-13,-20,-18,  5,-23,-18,  2,-18, -5, -5,-13,-22,-18,-20,  2,  8,  0,-17, -5,-18;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-30,-30,-20;
/M: SY='C';  M= -5,-11, 35,-20,-23,-22,-23,-18,-15,-18,-17,-17, -1,-22,-18,-23,  0,  9,-12,-27,-20,-23;
/M: SY='A';  M= 18,-23,-10,-23,-15,-22,-13,-23, -4,-13,-14, -9,-23,  8,-13,-18, -3, -2,  6,-32,-20,-13;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='L';  M= -1,-24, -5,-24,-17, -5,-20,-19,  8,-17, 15,  8,-24,-17,-12,-12,-13, -5,  5,-17,-10,-17; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='R';  M= -7, -2,-24, -7,  8,-22,-15,  0,-22, 19,-17, -9,  0,-10, 20, 21, -2, -7,-17,-19,-15, 10; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='S';  M=  9, -5,-10, -5,  2,-17, -5, -5,-15,  0,-17, -7, -2, -7, 12, -2, 13,  0,-10,-19,-15,  5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-30,-20,-10,-40,-20,-20,-30,-10,-30,-30,-20, 80,-10,-20,-10,-10,-20,-40,-30,-10;
/M: SY='H';  M= -6,  0,-28,  1,  9,-23,  4, 13,-30, -5,-32,-22,  2,-15,  3, -7,  7,-10,-28,-27,-12,  6;
/M: SY='A';  M= 12,-12,-17,-17, -5,-20,-10, 12,-20, -3,-23,-15, -7,-15,  0,  9,  0, -8,-15,-27, -9, -5;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='G';  M= -3,-10,-22,-10,-12,-25, 23,-15,-27,-12,-27,-22,-10, 13,-12,-15, -3,-12,-20,-25,-22,-12; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='P';  M=  6,-15,-14,-15, -7,-24, -9,-15,-17, -7,-20,-17,-15, 35, -7,-12, -2, -5, -9,-27,-20, -7; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='V';  M= -2,-22, -7,-22,-22, -5,-25,-22, 25,-17, 10,  7,-22,-17,-17,-22,-15, -2, 27,-20, -7,-17; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='W';  M=-15,-26,-12,-31,-22, 15,-24,-15,  2,-21,  2, -1,-26,-26,-17,-21,-19,-13, -3, 19,  9,-21; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='C';  M= 20,-17, 22,-20,-15,-15, -7,-17, -7,-12,-12,-10,-17,-12,-12,-15,  3, -2, -2,-20,-15,-15; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='A';  M= 30,-15,  0,-15, -7,-15,  0,-15, -7, -7,-15, -7,-15, -7, -7, -7,  7,  0,  0,-22,-15, -7; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='F';  M=  1,-20,-10,-23,-15, 12,-15,-12,  0,-15,  0, 12,-18,-20,-11,-15, -8, -8,  0, -9,  1,-15; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='W';  M=-14,-10,-16,-17,-14, -5,-19, -9, -5,-14, -9,  0, -2,-22, -9,-14,-10,-10, -9,  8, -3,-14; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='D';  M= -7,  9,-27, 16, 11,-25,  9, -8,-25, -6,-27,-20,  0,-13, -1,-10,  0,-10,-22,-27,-20,  6; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='L';  M= -8,-19,-16,-22,-14,-11,-22,-14,  3, -6,  6,  2,-16,-17, -7,  5,-15, -5,  3,-20,-10,-12; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='H';  M=-12, -5,-22,-10, -3,-16,-15, 32,-22, -7,-22,-18, -1, 13,  2, -5, -7,-12,-20,-20,  1, -3; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='H';  M=-15, -3,-33,-13,  3,-21,-20, 35,-30, 14,-27,-20,  5,-17, 10, 22, -7,-15,-27,-25, -1,  3;
/M: SY='R';  M=  4,-18,-16,-21,-10,-18,-16,-15,-10, -5, -7, -7,-13,-18, -5,  7,  1, -3,-10,-27,-17,-10;
/M: SY='C';  M=  0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
/M: SY='S';  M=  3, -3,-15, -3,  2,-22,-10, -8,-20,  0,-23,-13,  5,-10, 11, -5, 23, 16,-15,-28,-20,  4;
/M: SY='L';  M= -6,-35, -8,-35,-25, -5,-31,-28, 13,-25, 26, 13,-35,-25,-18,-18,-21, -8,  8,-22,-12,-25;
/M: SY='D';  M=-10, 20,-31, 22, 18,-30,-10, -2,-28,  0,-35,-22, 20,-15,  5, -7, 12, -3,-28,-37,-22, 13;
/M: SY='E';  M=-12, 12,-35, 12, 30,-30,-18,  5,-30,  8,-30,-15, 14,-12, 26,  3,  2, -8,-27,-30,-20, 28;
/M: SY='S';  M=  5,  1,-23,  3,  2,-27, -8,-10,-22,  1,-27,-20,  0,-15,  0,  7,  9, -3,-20,-35,-22,  0;
/M: SY='T';  M=  0, -2,-18,  0,  8,-23,-15,-12,-18, -2,-20,-15,  2,-10,  0, -7, 15, 25,-12,-30,-20,  5;
/M: SY='R';  M=-10, -7,-37,-17,  3,-30,-20, -3,-30, 28,-23,-20,  0,-17, 10, 49, -7,-10,-27,-30,-20,  3;
/M: SY='Q';  M=-10, -9,-28, -6,  6,-23, -4,-10,-21, -7,-14, -9,-12,-17, 10, -7, -7,-13,-18,-25,-20,  6;
/M: SY='L';  M= -2,-25,-12,-28,-15,-12,-25,-23,  0, -6,  8,  3,-25,-20,-10, -8,-13, -7,  0,-25,-15,-15;
/M: SY='D';  M=-15, 23,-33, 38,  8,-33,-15,-15,-16,-12,-28,-20,  0,-20, -5,-22, -5, -8,-13,-45,-25,  3;
/M: SY='Q';  M=-11,-11,-24,-10,  6, -9,-23, -7,-13, -6, -7, -3,-12,-19, 11, -8, -4, -9,-14,-20,-11,  6;
/M: SY='R';  M= -5, -5,-30,-10,  5,-28,-15,  0,-28, 13,-22,-15,  2,-15, 20, 30,  5, -5,-25,-27,-20,  8;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 60,-30,-10,  0,-30,  0,  0,-30,-40,-30,-30,-20,-20,-10, 10, 30,-30;
/M: SY='A';  M= 12,-23,-12,-25,-13,-17,-16,-18, -7, -8, -4, -4,-21,-18, -8,  4, -6, -5, -4,-27,-17,-13;
/M: SY='D';  M=-15, 20,-35, 22, 22,-33,-15,  3,-30,  2,-32,-17, 17,-15, 21, -2,  2, -8,-27,-35,-23, 20;
/M: SY='L';  M=-10,-25,-15,-25,-22,-12,-11,-25, -2,-22,  8,  0,-23,-22,-17,-17,-13,  3, -2,-25,-17,-22;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-12,-32,-30,  6,-30,-25, 23,-22,  8,  8,-30,-25,-22,-30,-20, -5, 28,-21, -1,-22;
/M: SY='R';  M=-10,-12,-30,-20, -7,-20,-22, 15,-16,  3,-16,-13, -4,-20,  3, 23,-12,-10,-14,-27, -7, -5;
/M: SY='D';  M= -9, 17,-29, 19,  9,-30,  1, -5,-29, -4,-36,-24, 18,-16,  0,-10, 12, -4,-28,-38,-24,  5;
/M: SY='G';  M=  4,-20,-18,-20,-20,-20, 21,-23,-18,-20,-15,-13,-20,-20,-18,-18, -5,-13,-13,-27,-23,-20;
/M: SY='Q';  M=-15,-19,-22,-19, -4, -6,-28,  2,-11, -9, -1,  3,-16,-21, 18, -6,-13,-13, -9,-10,  6,  1;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='P';  M=-15,  9,-35, 19,  5,-40,-15,-15,-30,-10,-35,-30, -5, 31, -5,-20, -5,-10,-25,-45,-30,  0;
/M:         M= -6,-28,-16,-31,-22, -1,-26,-21,  0,-21,  0, -3,-28,  0,-18,-22,-16,-10,  0,-21, -7,-21;
/M: SY='R';  M=-10,  3,-33, -8, -2,-30,  2, -5,-32, 12,-32,-22, 13,-18,  0, 16,  0,-10,-28,-33,-22, -2;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='P';  M=-13,-23,-16,-23,-15, -4,-23, -8, -5,-15,  0, -5,-21,  7,-13,-15,-15,-10, -5,-11,  6,-15; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='S';  M= 15, -7, -8, -7, -5,-20, -5,-15,-15, -5,-22,-15,  0,-10, -5,-10, 25, 18,-10,-30,-20, -5;
/M: SY='Y';  M=-17,-20,-25,-23,-13,  2,-25, 24,-20,-15,-20,-18,-13,  1,-10,-15,-15,-17,-17, -5, 32,-13;
/M: SY='M';  M=-10,-18,-25,-23,-15,  0, -5,-15,-14, -6,-12,  4,-15,-25,-10,-13,-10,-15,-12,-18, -8,-15;
/M: SY='T';  M= -3, -8,-17, -6,  1,-17,-20,-15, -4, -8,-12, -9, -6,-15, -6,-13,  7,  9, -4,-27,-17, -1;
/M: SY='T';  M=  6,-18,-17,-20,-10,-18,-17,-15,-10, -5, -8,  4,-10,-17, -2,  6, -2,  7, -5,-28,-18,-10;
/M: SY='R';  M=  2,-12,-31,-20, -2,-28,-15, -5,-25, 13,-20,-18, -5,-18,  5, 44, -5, -8,-23,-30,-20, -2;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='L';  M=-10,-23,-13,-23,-17,-11,-25,-20,  6,-17,  7, -1,-23,  7,-15,-18,-15, -8,  4,-21,-13,-17; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='P';  M=-13,  0,-33,  3,  2,-38,-17,-15,-30,  4,-33,-28, -8, 33, -3,-10, -5,-10,-23,-40,-28,  0;
/M: SY='R';  M=-10, -5,-35,-15,  5,-30,-20, -5,-30, 34,-25,-20,  0,-15, 10, 41, -5,-10,-25,-30,-20,  5;
/M: SY='P';  M= -8, -8,-30, -8,  6,-30,-20,-10,-25,  2,-23,-20, -5, 12,  2,  8, -3,  4,-20,-33,-23,  4;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-10,-30,-30, -8,-32,-30, 32,-22, 12, 10,-30,-22,-22,-30,-20, -2, 38,-28,-10,-22;
/M: SY='R';  M=  2,-13,-26,-13,  5,-20,-18,-10,-15,  0,-12,  3,-10,-18,  5,  9, -6, -8,-13,-27,-17,  2;
/M: SY='G';  M=-10,  0,-35,  2, -3,-35,  4,-12,-33, -5,-33,-27, -5,  3, -5,  1, -5,-13,-28,-37,-27, -5;
/M: SY='W';  M=-22,-37,-15,-40,-27, 10,-35,-15,  3,-27, 13,  3,-35,-32,-20,-22,-27,-17, -5, 19, 18,-27;
/M: SY='A';  M= 19,-20, 17,-23,-21,-22,  6,-23,-17,-18,-22,-18,-20,-18,-18,-21,  2, -8,-10,-27,-22,-21;
/M: SY='S';  M= 11,-14, -7,-14, -9,-15, -9,-17, -8, -9,-11, -8, -9,-15, -7,-12, 16,  3, -8,-28,-18, -9;
/M: SY='K';  M= -5,  0,-25, -5, 10,-27,-15, -5,-27, 27,-28,-15,  3,-10, 19,  9, 11, -5,-20,-28,-20, 12;
/M: SY='S';  M=  5, -3,-18, -5,  0,-23, -5, -7,-23,  5,-27,-20,  7,-13,  3,  9, 26,  5,-23,-30,-20,  0;
/M: SY='N';  M=-10, 14,-29,  7,  3,-29,-10,  0,-28,  4,-32,-21, 26,-18,  3, 10, 11, -2,-28,-36,-21,  1;
/M:         M=-10,-17,-30,-22,-15,-11,  0,-12,-26,-10,-23,-20,-15, -2,-12, -2,-10,-15,-23,-23,-13,-15;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='Q';  M= -4,  2,-22,  7,  3,-25,-15,-10,-13, -5,-20,-10, -2,-15, 11,-12,  6, -2, -8,-32,-20,  5;
/M: SY='I';  M=-10,-26,-15,-26,-18, -9,-33,-20, 15,-18, 14, 10,-26,-23, -3,-18,-18, -8, 15,-22,-12,-13;
/M: SY='S';  M= 13, -5,-12, -8,  0,-22, -5,-13,-20,  9,-27,-17, -1,-10,  0, -3, 22,  2,-15,-30,-20,  0;
/M: SY='Q';  M=-20,  8,-30,  5,  3,-23,-17, -2,-28, -7,-30,-17,  9,-22, 12, -9, -4,-12,-27, -5,-13,  4;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 60,-30,-10,  0,-30,  0,  0,-30,-40,-30,-30,-20,-20,-10, 10, 30,-30;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-30,-30,-20;
/M: SY='K';  M=-10, -7,-28,-12,  6,-23,-22, -7,-21, 23,-16,  4, -5,-15, 21,  8, -5,-10,-13,-25,-18,  9;
/M: SY='G';  M= -5,  2,-32,  6,-11,-32, 44,-18,-38,-18,-40,-30, -5,-20,-15,-20,  0,-18,-30,-35,-30,-13;
/M: SY='Y';  M=-18,-23,-22,-23,-11, 16,-28, 18,-15,-13,-12, -8,-15,-25, -2,-13,-15,-18,-12, 11, 49, -8;
/M: SY='C';  M=  0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
/M: SY='Y';  M=-22,-32,-20,-35,-22, 25,-30, 11,-12,-22,-12,-12,-25,-32,-20,-22,-22,-22,-15, 38, 58,-22;
/M: SY='L';  M= -6,-35, -8,-35,-25, -5,-31,-28, 13,-25, 26, 13,-35,-25,-18,-18,-21, -8,  8,-22,-12,-25;
/M: SY='S';  M= -2,  2,-22,  2, 12,-20,-10, 15,-25,  0,-30,-20,  8,-13,  7, -5, 18, -2,-25,-27,-10, 10;
/M: SY='A';  M= 18,-15,-13,-12,  1,-20,-12,-17, -6, -7,-15, -8,-17,-12, -5,-12,  0, -3,  2,-30,-18,  0;
/M: SY='I';  M=-12,-35,-10,-35,-30, -2,-38,-30, 28,-28, 27, 15,-35,-28,-23,-25,-25, -8, 23,-22,-10,-28;
/M: SY='R';  M= -7,-15,-32,-23, -8,-25,-23, -8,-14,  9,-12,-12, -8,-20,  2, 35,-13, -7,-11,-30,-17, -5;
/M: SY='P';  M=-15, 12,-35, 22,  6,-40,-15,-15,-30,-10,-35,-30, -4, 27, -5,-20, -5,-10,-25,-45,-30,  1;
/M: SY='S';  M=  1,  2,-22,  2, 14,-25, -9, -8,-25, 14,-30,-20,  5,-10,  7, -1, 21,  1,-22,-30,-20, 12;
/M: SY='F';  M= -4,-30,-12,-35,-25, 24,-24,-17,  2,-25,  4,  2,-30,-29,-22,-22,-14,-12, -3, -8,  7,-25;
/M: SY='R';  M=  2,-10,-28,-18,  0,-28,-15, -7,-25, 20,-22,-18, -5,-15,  5, 34, -3, -8,-21,-30,-20,  0;
/M: SY='W';  M=-18,-24,-20,-31,-16, -6,-25,-18,-20, -6,-20,-18,-21,-26,-11,-13,-14, -7,-21, 39,  1,-16;
/M: SY='R';  M=-10,-15,-33,-22, -7,-23,-25, -7,-13,  8,-10,-13, -7,-22,  0, 38,-12,-10,-16,-28,-18, -7;
/M: SY='V';  M= 12,-20, -8,-20,-18,-15,-15,-23,  8,-13, -7, -2,-17,-15,-13,-20,  2,  3, 15,-30,-15,-13;
/M: SY='A';  M= 21,-25, 21,-27,-22,-18,-15,-25, -1,-17,-11, -8,-25,-17,-17,-22, -2, -3,  7,-27,-18,-20;
/M: SY='R';  M=-10, -8,-38,-15,  5,-30,-20,  2,-30, 18,-20,-15,  0,-18, 22, 48, -8,-10,-28,-28,-20,  7;
/M: SY='A';  M= 20,-20, -5,-20,-15,-18,-12,-22, -1,-12,-10, -5,-17,-12,-12,-15,  3, 14,  9,-30,-18,-12;
/M: SY='T';  M= -1,-25,-10,-27,-20,  4,-23,-20,  0,-20,  3,  0,-22,-22,-17,-17, -7,  6,  0,-18, -5,-20;
/M: SY='G';  M=  9,-12,-23,-12,-18,-28, 46,-20,-33,-18,-35,-25,-12,-18,-18,-18,  2,-15,-23,-30,-28,-18;
/M: SY='P';  M=-18,-28,-25,-31,-18,-10,-25,-11,-23,-18,-23,-23,-25, 22,-15,-23,-18,-18,-20, 12,  7,-18;
/M: SY='C';  M= -7,-23, 34,-26,-17,-17,-30,-23, -7,-21, -2,-10,-26,-25,-16,-26,-13,-10, -9,-22,-17,-19;
/M: SY='P';  M= -7,-25,-20,-25,-20,-23,-27,-25,  3,-17, -8,-10,-25, 27,-17,-25,-15, -7,  8,-33,-20,-17;
/M: SY='T';  M= -7,-22,-18,-24,-17,-16,-27,-19,  1, -9,  4, -1,-16,-20, -9,  2,-12,  8,  4,-28,-15,-14;
/M: SY='I';  M= -9,-32,-12,-35,-30,  9,-32,-25, 21,-25, 15, 10,-32,-27,-22,-28,-22, -7, 21,-18,  0,-25;
/M: SY='S';  M= 13, -8,-15,-11, -3,-23, -5,-10,-20,  2,-25,-17, -1,-13,  0,  8, 19,  2,-17,-30,-20, -3;
/M: SY='D';  M= -5, 25,-30, 39, 12,-35, -7,-13,-25,-10,-35,-25,  2,-17, -3,-17,  3, -7,-22,-45,-27,  5;
/M: SY='Y';  M=-15,-30,-18,-32,-25, 27,-30,  1,  2,-22, -3, -3,-25,-30,-22,-25,-20,-15,  2,  6, 42,-22;
/M: SY='I';  M=-13,-26,-15,-26,-18, -7,-35,-21, 18,-21, 16, 10,-26,-25, -7,-18,-18,-10, 13,-20,-12,-16;
/M: SY='R';  M=-10,-10,-35,-18,  0,-33,-20, -8,-30, 19,-25,-23, -5,  8,  5, 30, -8,-10,-25,-33,-23,  0;
/M: SY='L';  M=-15,-35,-13,-35,-27,  5,-35,-17, 15,-25, 20, 10,-32,-28,-20,-22,-25,-10, 12,-12, 11,-25;
/M: SY='L';  M=-22,-40,-12,-42,-30,  2,-38,-28, 10,-30, 26, 10,-40,-32,-20,-22,-30,-15,  0,  9, -3,-30;
/M: SY='Q';  M=-10, -5,-30, -5, 15,-23,-22, -5,-20, 13,-15,  5, -5,-15, 24,  3, -5,-10,-15,-25,-18, 15;
/M: SY='W';  M=-15,-28,-18,-31,-18, -7,-30,-18,  0,-18,  2,  2,-28,-25, -1,-18,-20,-13,  0, 10, -4,-13;
/M: SY='V';  M= -5,-30, 11,-35,-32,  4,-30,-25, 14,-25,  3,  1,-30,-27,-25,-32,-18, -7, 17,-18, -3,-27;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-30,-30,-20;
/M: SY='K';  M=-12,-12,-28,-20, -2,-23,-25,-12,-18, 23,-11,-10,-10,-18,  3, 21,-10,-10,-16,-28,-18, -2;
/M: SY='R';  M=-10,-10, -5,-20, -7,-23,-22, 10,-25,  9,-23,-20, -5,-20,  1, 12, -7,-12,-23,-25,-10, -7;
/M: SY='S';  M= -2, -3,-25, -3,  9,-25,-15, -8,-22,  5,-23,-18,  3,-13,  5, 10, 11, 10,-20,-30,-20,  7;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='F';  M=-11,-18, -8,-21,-16, 16,-18,-10,  5,-16, 10,  5,-18,-19,-13,-13,-13, -8,  0, -2,  6,-16; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-30,-30,-20;
/M: SY='S';  M=  0, -5,-20, -7, -5,-25,  6,-15,-25,  4,-28,-20,  0,-13, -5, -6, 13,  7,-18,-30,-23, -5;
/M: SY='S';  M=  4,-18,-15,-20,-13, -3,-13,-15,-14,-13,-19,-14,-15,  2,-13,-18,  5, -5,-12,-21, -9,-13;
/M: SY='Q';  M=-12, -7,-28, -9,  6,-18,-22, 20,-21, -2,-13,  9, -2,-17, 34,  1, -7,-12,-15,-20, -8, 11;
/M: SY='I';  M=-10,-16,-24,-16, -4,-14,-31,-16,  7, -9, -1, -4,-16,-23, -9, -2,-13,-10,  2,-25,-15, -6;
/M: SY='L';  M= -2,-21,-16,-18, -3,-13,-24,-19, -1,-14,  5,  1,-24,-19, -6,-12,-12, -7, -4,-25,-15, -6;
/M: SY='I';  M= -8,-20,-17,-20,-14,-11,-32,-23, 18,-11,  4,  2,-22,-22,-15,-19,-15, -8, 17,-25,-13,-13;
/M: SY='P';  M= -7,  5,-27,  8,  5,-32,-12,-12,-27,  7,-33,-25,  1,  9,  0, -8,  9, -5,-23,-38,-25,  2;
/M: SY='V';  M=  3,-21,-16,-23,-17,-18,-22,-20,  4, -7, -5, -3,-17,-17,-10, -1, -9,  4, 11,-30,-15,-12;
/M: SY='V';  M= -7,-13,-22,-13, -3,-15,-25,  3,  1,-10, -9, -5,-13,-17, -3,-15,-13, -7,  6,-28, -6,  0;
/M: SY='D';  M=-12, 24,-31, 28, 14,-31, -9, -3,-28, -2,-36,-24, 21,-16,  3,-10, 12, -3,-28,-40,-24,  9;
/M: SY='G';  M= -8, -5,-30,-10, -7,-25, 18, 10,-35,  1,-35,-25, -2,-17, -4, -4, -3,-17,-27,-27,-14, -7;
/M: SY='L';  M=-15,-35,-12,-35,-28,  4,-35,-18, 16,-25, 20, 10,-32,-27,-20,-23,-25,-10, 13,-13,  9,-25;
/M: SY='Y';  M=-20,-32,-20,-35,-22, 18,-30,  0, -7,-22, -5,  6,-25,-32,-15,-22,-22,-20,-10, 29, 38,-22;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,-10,  0,-10,-20, 80,-30,-10,-30,-20, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-20, 20,  0;
/M: SY='V';  M= -9,-35,-10,-35,-30, -5,-35,-30, 25,-25, 24, 15,-35,-25,-20,-25,-25, -5, 26,-25,-10,-25;
/M: SY='C';  M= -4,-16,  9,-16, -9,-18,-27,-21, -2,-15, -8, -9,-16,-19,-12,-21, -6,  6,  0,-26,-17,-10;
/M: SY='V';  M= -2,-20,-22,-22,-20,-20, -5,-20, -2,-10,-10, -7,-18,-20,-13, -6,-12, -8,  5,-30,-18,-15;
/M: SY='D';  M=-10,  1,-30,  9,  7,-31,-20,-15,-16, -8,-23,-18,-10,  8, -3,-18, -7, -8,-11,-38,-23,  5;
/M: SY='K';  M= -4,  4,-23, -6,  2,-27,-15, -8,-25, 21,-28,-17, 13,-13,  2,  7,  5,  2,-17,-33,-20,  2;
/M: SY='E';  M=-12, 17,-40, 29, 43,-32,-18, -2,-30,  5,-32,-22,  2,-12, 15, -5,  0,-10,-30,-35,-22, 33;
/M: SY='V';  M=-10,-19,-19,-23,-15, -7,-29, -3,  5, -5, -5, -4,-16,-21,-11,-13,-14,-10,  7,-19,  3,-13;
/M: SY='K';  M= -7, -3,-30, -7,  5,-30,  1, -7,-33, 21,-30,-17, -3,-13, 16,  7,  0,-13,-23,-27,-23,  8;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='S';  M=  5,  0, -5,  0,  0,-10,  0, -5,-10,  0,-15,-10,  5, -5,  0, -5, 20,  5,-10,-15,-10,  0; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='E';  M= -5,  3,-18,  3, 16,-15,-10, -2,-15, 14,-15,-10,  0, -5,  8,  5,  0, -5,-13,-15,-10, 13; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='Q';  M=  0,  0,-11,  0,  5,-13, -5,  0,-13,  3,-12, -5,  2, -5, 16,  0,  9,  0,-10,-12,-10,  8; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='D';  M=  4,  6,-11, 12,  3,-16, -3, -7,-11, -5,-16,-11, -2, -8, -2, -8,  2, -3, -8,-21,-13,  0; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='G';  M=  3, -7,-25, -7,-15,-27, 45,-17,-35,-15,-37,-27, -5,-17,-15,-17, 10,-12,-27,-30,-27,-15;
/M: SY='A';  M= 15,-10,-15,-12,  2,-25,-10,-10,-20,  9,-22,-10,-10,-10, 13,  2,  5, -5,-10,-27,-20,  5;
/M: SY='L';  M=-15,-28,-15,-31,-21, -7,-35,-25, 13,-12, 19,  8,-28,-25,-15,-13,-21,-10,  8,-22,-12,-21;
/M: SY='I';  M=-12,-30,-18,-33,-25,  4,-30,-22,  5,-23,  5,  0,-30, -4,-20,-25,-20,-10,  5,-19, -4,-23;
/M: SY='Y';  M=-20,-32,-18,-32,-22, 23,-32,  8, -3,-22,  2, -3,-25,-30,-20,-20,-22,-18, -5, 10, 51,-22;
/M: SY='Q';  M= -8,  8,-30, 11, 11,-30,-13, -2,-28,  5,-28,-17,  5,-15, 19,  9,  7, -5,-25,-32,-23, 11;
/M: SY='T';  M=  1, -9,-14, -4, -8,-19,-17,-20, -7,-15, -7, -7,-13,-17,-10,-15, -3,  7, -4,-32,-20,-11;
/M: SY='V';  M= -9,-25,-20,-28,-20, -3,-29,-10,  7,-12, -1, -2,-20,-24,-14, -6,-18, -9,  9,-16,  8,-17;
/M: SY='H';  M= -9,  5,-22,  8,  1,-20,-13,  9,-19, -9,-23,-17,  3,-18,  0,-12,  8, -5,-21,-31,-12, -2;
/M: SY='F';  M=-17,-20,-22,-22,-22, 20,-17,-16, -5,-26, -1, -3,-24,-32,-22,-25,-17,-16,-11,-11,  4,-23;
/M: SY='I';  M=  1,-30, -8,-30,-25, -7,-28,-28, 21,-23, 14,  8,-30,-23,-20,-23,-16, -5, 20,-25,-12,-23;
/M: SY='C';  M= 13,-20, 18,-23,-20,-18,-15,-22, -3,-15,-13,-10,-18,-17,-15,-22,  5,  0,  2,-27,-18,-18;
/M: SY='H';  M=  6, -9,-23,-12,  3,-22,-13, 12,-23,  0,-24,-16, -5,-15,  4, 12, -1, -9,-19,-28,-10,  2;
/M: SY='N';  M= -8, -3,-27,-11,-10,-25, -1,-11,-18,  0,-24,-15,  6,-19, -7, -1, -4, -7,-12,-33,-20, -8;
/M: SY='Q';  M= -8, 11,-28, 16, 15,-30,-13,  0,-28,  2,-28,-13,  5,-13, 30, -3,  9, -5,-23,-31,-23, 18;
/M: SY='P';  M=-15,-27,-23,-27,-17,-12,-27,-12,-13,-17, -8,-13,-25, 25,-15,-20,-17,-13,-10,-20,  0,-17;
/M: SY='L';  M=-15,-33,-15,-33,-28, -7,-17,-28,  6,-28, 22,  8,-33,-28,-20,-20,-23,-12,  1,-22,-15,-28;
/M: SY='A';  M= 13,-20,-10,-23,-10,-17,-15,-20, -7, -1, -7, -5,-20,-15, -8, -5, -3, -5, -2,-27,-17,-10;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='R';  M=-10, -8,-38,-18,  2,-30,-20, -2,-30, 27,-22,-20,  0,-18, 10, 50, -8,-10,-28,-30,-20,  2;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-10,-30,-30, -3,-37,-30, 37,-27, 17, 10,-30,-27,-27,-30,-20, -7, 33,-23,-10,-27;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-30,-30,-20;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_06 which contains 572'619 sequence entries.


Total number of hits 2 in 2 different sequences
Number of true positive hits 2 in 2 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Peptidase C7
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
2 sequences

POLA_CHPVE  (P10941), POLA_CHPVU  (Q9YTU3)