Home  |  Contact
Entry: PS51891

General information about the entry

Entry name [info] CENP_V_GFA
Accession [info] PS51891
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 05-JUN-2019 CREATED;
05-JUN-2019 DATA UPDATE;
18-SEP-2019 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51891
Associated ProRule [info] PRU01239

Name and characterization of the entry

Description [info] CENP-V/GFA domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=119;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=114;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5370748; R2=0.0109772; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=589; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=362; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='RR';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='Y';  M=-18,-19,-25,-24,-18, 30,-26, 21, -4,-19,  5,  7,-13,-26,-15,-12,-18,-13, -8, -2, 32,-17;
/M: SY='E';  M=  4, -2,-20, -5, 11,-16,-17,-10,-17,  1,-14,-10, -3, -9,  6, -4,  5,  8,-13,-23,-11,  9;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='G';  M=  1, -1,-21, -4, -4,-23, 11,-12,-23, -3,-24,-15,  5,-14, -4, -6, 10,  3,-16,-28,-19, -4;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='H';  M=-12,-10,-13,-11, -7,-14,-22, 42,-17,-10, -3,  2, -5,-23, -2, -5,-14,-15,-16,-28,  6, -7;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='G';  M=  6, -7,-25,-10, -9,-26, 26,-16,-30,  2,-25,-15, -2,-15, -9, -2,  0,-10,-20,-20,-21, -9;
/M: SY='A';  M= 18, -1,-17, -4,  0,-24, -6,-13,-20,  7,-23,-14,  0,-10, -1, -3, 13,  3,-10,-27,-17,  0;
/M: SY='V';  M= -8,-11,-22,-14,-16,-10,-27,-14, 15,-11, -1,  4, -8,-21,-15,-13,-10, -6, 17,-28, -7,-17;
/M: SY='R';  M=-13, -6,-32, -4,  9,-27,-21,  3,-21, 16,-21, -8, -4,  2, 14, 18, -8,-11,-21,-23,-11,  9;
/M: SY='I';  M=-10,-31,-24,-34,-28, 14,-30,-23, 19,-23, 10,  6,-28,-28,-25,-21,-20,-10, 19, 10, 12,-27;
/M: SY='T';  M= -5, -2,-20, -3,  8,-19,-20,-12,-17, 10,-17,-11, -3,-11,  1,  7,  5, 11, -8,-28,-13,  4;
/M: SY='V';  M=  9,-23,-11,-26,-23,  0,-21,-25, 15,-18,  2,  3,-22,-24,-24,-19, -2,  1, 31,-26,-10,-23;
/M: SY='E';  M=-10, -8,-28, -7,  3,-15,-18,-14,-14,  0, -9, -9, -9,-15, -3,  1, -8, -3,-13, -6, -7,  0;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='I';  M= -4,-20,-16,-23,-20, -2,-14,-20, 19,-18,  9,  8,-16,-18,-17,-17,-11, -6, 19,-17, -6,-20; D=-13;
/I:         I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='A';  M=  8,-10,-20,-12, -6,-18,  2,-13,-14, -2, -7, -5, -7,-15, -1, -6, -3, -7,-11,-19,-14, -4; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='P';  M=  7, -5,-22, -6, -5,-23,  6,-13,-20,-10,-24,-17,  1, 16, -8,-14,  8, -2,-18,-27,-23, -8; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='Q';  M= -5, -1,-28,  1, 13,-25,-10,  0,-23,  8,-19, -9, -2,-12, 19,  6, -3,-10,-23,-17, -5, 15;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='T';  M= -3, -1,-14, -1, -2, -5,-14,-12, -6, -9, -9, -8, -2,-12, -8,-10,  7,  8,  0,-23, -8, -5; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='A';  M= 20,-14,-13,-18,-11,-10,-10,-17,  0,-13,  3, -2,-14, -4,-11,-16, -3, -3,  3,-18,-12,-11; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='H';  M=-18,  5,-30,  7,  2,-23,-20, 52,-25,  0,-19, -5,  7,-17,  6,  6, -9,-16,-23,-29,  6,  0;
/M: SY='N';  M=  2,  1,-18,-10,-13,-12, -6,-10,  0,-12, -5,  0,  9,-21,-11,-13, -2, -4, -2,-29,-14,-12;
/M: SY='H';  M=-12,-10,-16,-12,-10, -8, -8, 25,-25,-12,-20,-10, -1,-22, -6, -4, -3,-11,-21,-13,  3, -9;
/M: SY='A';  M=  5, -4, -6,-10,-11,-17,-15,-14, -8, -6,-13, -9,  0,-19, -9, -3,  1, -3, -2,-29,-16,-11;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='N';  M=-10,  9,-26,  5, -8,-16, 17, 14,-29,-12,-24,-15, 18,-20, -9,-10, -1,-13,-27,-26,-11, -9;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='S';  M=  2, -5,-16, -8, -3,-15,-14,-15, -5,-12,-15,-10,  1,-11, -4,-13, 20, 17, -2,-33,-14, -4;
/M: SY='K';  M=-10,  1,-24,  1, -3,-13,-22,-15,-12,  8,-14, -8, -3,-14, -6,  0, -5,  2, -6,-24, -7, -5;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='W';  M=-14,-13,-32,-12, -9, -9,-16,-13,-23,  4,-20,-15,-12,-19, -4, 13,-14,-11,-21, 39,  4, -6; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='K';  M=-11, -5,-29, -7,  3,-24,-22,-10,-19, 36,-21, -2, -3,-13,  7, 25,-12,-10,-13,-20, -8,  4;
/M: SY='P';  M=-14,-15,-35,-12, -4,-21,-22, -4,-18,  5,-22,-11,-11, 20, -3,  6,-14,-13,-21, -9, -9, -6;
/M: SY='Q';  M=-10,  5,-14,  6, 11,-29,-10,  9,-28,  0,-23,-13,  6,-15, 15,  3,  1, -8,-25,-30,-14, 12;
/M: SY='G';  M= -3,  8,-26,  4,-10,-27, 40,-10,-33,-12,-30,-21, 18,-18,-12,-13,  6,-10,-28,-28,-26,-11;
/M: SY='A';  M= 27, -9,-14,-15, -7,-20, -6,-15,-11, -5,-14, -9, -6,-13, -2, -6, 10,  1, -2,-24,-17, -5;
/M: SY='H';  M=-12,-16,-29,-17,-10,-12,-27, 10,  1,-13,  0,  3,-11, -1, -7,-12,-14,-10, -6,-25, -1,-12;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='F';  M=-17,-26, -9,-34,-26, 61,-27,-15, -2,-25,  6, -2,-18,-28,-33,-18,-17, -9, -2,  6, 27,-26; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='V';  M=  7,-10,-10,-15,-14, -6,-13,-13, 10,-10,  1,  6, -7,-16,-12,-12, -3, -1, 14,-20, -9,-13; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='A';  M= 33, -6, -7,-13, -6,-15,  0,-14, -8, -7, -9, -8, -6, -7, -6,-14, 10,  2, -1,-17,-15, -6; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='V';  M= -6,-25, -8,-30,-25, -5,-32,-26, 23,-19,  6,  7,-20,-24,-21,-16,-11, -1, 26,-27, -8,-25;
/M: SY='V';  M=  4,-24,-15,-30,-25, 11,-25,-25, 16,-21,  6,  4,-20,-23,-25,-21, -7,  1, 23,-19, -2,-25;
/M: SY='P';  M= -2,-13,-32, -9, -1,-28, -8,-14,-23, -1,-26,-15,-10, 36, -1, -5, -3, -8,-24,-26,-23, -4;
/M: SY='R';  M= -5, -9,-24,-10,  3,-17,-18, -8,-18, 10, -8, -7, -5,-16,  2, 24, -5, -4,-12,-23,-11,  0;
/M: SY='D';  M= -4, 14,-21, 21,  6,-28, -5, -8,-27, -6,-27,-21,  9, -1,  0,-10, 16,  7,-19,-36,-20,  2;
/M: SY='N';  M=  0, 15,-20, 10,  2,-23, -6, -2,-23,  5,-25,-17, 21,-15,  1,  8,  9,  0,-19,-32,-18,  0;
/M: SY='V';  M= -8,-30,-17,-34,-28, 23,-31,-26, 23,-26, 18, 10,-26,-29,-30,-21,-17, -6, 28,-16,  4,-28;
/M: SY='K';  M= -5,  3,-21,  1, 10,-22,-15, -9,-23, 13,-23,-14,  5,-10,  4, 10, 10, 11,-16,-29,-14,  7;
/M: SY='V';  M= -6,-27,-20,-27,-19,  1,-29,-25, 20,-21, 16,  8,-27,-26,-21,-19,-18, -7, 23,-10, -4,-20;
/M: SY='L';  M= -7,-13,-18,-17,-13, -3,-24,-17,  4,-13, 15,  5,-11,-22,-13,-10,-10,  7,  4,-25, -6,-13;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='E';  M= -3,  7,-18,  9, 15,-19, -9, -3,-19,  9,-17,-12,  5, -7,  6,  7,  2, -4,-16,-21,-12, 10; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='G';  M= -5,  9,-19,  6, -5,-19, 21,  4,-23, -8,-20,-13, 15,-13, -6, -7,  1, -9,-21,-21,-14, -6; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='A';  M= 11, -4,-15, -4,  4,-18,  6, -9,-16, -5,-14,-11, -3, -2, -1, -9,  5, -4,-12,-18,-16,  1; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='D';  M=-11, 24,-28, 32, 28,-32, -4, -2,-33,  1,-26,-23, 13, -8,  6, -6,  4, -8,-29,-34,-21, 17;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='K';  M= -9,  8,-23,  3,  7,-15,-14,  0,-22, 19,-22,-11, 13,-12,  3, 11, -3, -6,-19,-22, -8,  6; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='L';  M= -8,-26,-21,-27,-19,  2,-28,-21, 22,-24, 27, 13,-24,-14,-18,-20,-21, -8, 13,-20, -4,-20; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='T';  M= -4, -2,-21, -3,  4,-21,-10,-11,-18,  2,-17,-10, -2,  0,  5, -2,  5, 12,-15,-23,-14,  4; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='V';  M= -5,-16,-17,-19,-15, -6,-25,-20, 11, -6,  3,  4,-14,-18,-13, -9, -7,  5, 15,-22, -6,-15; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='Y';  M=-11,-21,-20,-21,-21, 16,-27,  0, 11,-12,  4,  4,-21,-27,-16,-12,-14, -5, 12,  5, 39,-21; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='D';  M=-11, 14,-19, 16,  3,-13,-13, -4,-19, -1,-15,-13,  7,-11,  1, -1,  2,  4,-15,-22, -8,  2; D=-10;
/I:         I=-10; MI=-22; IM=-22; DM=-22;
/M: SY='F';  M= -4,-12,-23,-15,  3, 12,-20,-12,-15, -6, -8,-10,-10,-10,-10, -2, -7, -8,-12,-13, -1, -3;
/M: SY='S';  M=  3,  6,-16,  2, -2,-21,  9, -9,-23, -9,-27,-19, 16,-13, -4, -9, 24, 11,-17,-35,-21, -3;
/M: SY='T';  M= 17, -5,-12,-12, -7,-16, -9,-16,-14, -6,-15,-12, -2,-11, -6, -5, 17, 20, -4,-27,-15, -7;
/M: SY='H';  M= -5,  3,-22,  2, -4,-20, -8, 10,-20, -7,-17,-11,  6,-11, -4, -3,  3,  1,-15,-30,-10, -5;
/M: SY='F';  M=-12,-21,-24,-28,-21, 14,-31,-18, 14,-16,  8,  6,-15,-21,-18,-13,-13,  0,  8,-11, 11,-21;
/M: SY='A';  M= 29, -6,-17,-13,  0,-26, -7,-11,-14,  0,-14, -7, -6,-10, 11, -8,  6, -4,-10,-20,-16,  6;
/M: SY='R';  M=-12, -4,-30, -3, 10,-28,-10, -3,-29, 24,-24,-10,  0,-14, 17, 32, -6,-11,-24,-21,-13, 11;
/M: SY='H';  M=-20, -7,-29, -8, -4, -8,-22, 54,-25,  0,-16, -3,  2,-22,  4, 18,-12,-15,-23,-18, 18, -4;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='T';  M= -5, -9, -1,-13,-12, -8, -8,-15, -8, -8, -9, -7, -8,-13,-10, -9, -4,  2, -5, -2, -6,-11; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='F';  M=  1,-23,-17,-32,-22, 44,-20,-19, -5,-21,  2, -4,-16,-23,-28,-16,-10, -7, -1, -1, 13,-22;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='K';  M= -7, -5,-26, -5,  0,-24,-10,-12,-25, 19,-25,-13, -1, -2,  1, 16,  0,  2,-18,-24,-15, -1;
/M: SY='N';  M= -6, 11,-23,  9, -6,-22,  1,-10,-18, -7,-19,-14, 12,-17, -9, -7,  2,  0,-13,-30,-17, -8;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='V';  M=  0,-18,-13,-22,-20, -6,-24,-24, 16,-18,  0,  2,-14,-20,-18,-18,  4, 12, 25,-30,-10,-20;
/M: SY='H';  M=-12, -4,-26, -6, -1,-18,-21, 32,-19, -6,-17, -5,  0, -5, 10, -4, -1,  2,-20,-23,  7,  2;
/M: SY='M';  M= -3,-17,-15,-20,-15, -4,-18,-13,  8,-16, 11, 16,-14,-20, -9,-14, -2,  5,  8,-27, -7,-12;
/M: SY='Y';  M=-18,-19,-24,-24,-20, 38,-28, 12, -5,-17,  0, -1,-14,-27,-18,-12,-15, -6, -8,  9, 45,-20;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='H';  M=-18, -9,-27, -9, -9,  4,-22, 54,-13, -9, -9,  0, -4,-22,  0, -4,-13,-13,-18,  0, 44, -9; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='T';  M= -5, -3,-18, -7,  0,-15,-19, -5, -9, -7,-11, -7, -3,  0,  1, -8,  6, 18, -8,-25, -9, -1; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='E';  M=-10, -2,-28,  3, 20,-21,-17, -6,-19,  1,-15,-13, -3, 17,  4, -1, -5, -8,-22,-26,-18, 10; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='R';  M= -7,-11,-25,-10, -7,-13,-12,-10,-14,  0,  1, -3, -9,-21, -5, 17,-12,-10,-10,-22,-11, -8;
/M: SY='S';  M=  0, -3,-17, -3,  3,-12, -9, -9,-21,  0,-24,-16,  4,-12,  0,  2, 21,  8,-13,-30,-13,  2;
/M: SY='N';  M= -4, 18,-20,  9,  1,-23, -6,  1,-19,  2,-25,-15, 27,-16,  5,  4, 10,  0,-20,-34,-17,  3;
/M: SY='P';  M= -3, -9,-33, -2, 17,-30,-18,-12,-22, -3,-24,-17,-12, 46,  4,-12, -4, -9,-27,-28,-25,  8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='D';  M=-11, 21,-25, 30, 19,-31, -7, -3,-29,  4,-23,-19,  8, -8,  8, -3,  2, -5,-24,-30,-17, 14; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='G';  M=  3, -4,-24, -3,  0,-26, 34,-13,-30,-11,-24,-17,  0,-13, -8,-13,  4,-11,-23,-22,-24, -4; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='W';  M=-10,-27,-25,-28,-24, 11,-23,-19,  3,-17, -3, -4,-26,-26,-21,-16,-18,-10,  7, 38, 17,-21; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='S';  M= 10, -2,-16, -3,  2,-22, 11,-11,-22, -8,-23,-16,  2,-10,  0,-11, 17,  2,-15,-27,-20,  1; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-17,-34,-30,  0,-34,-30, 37,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 43,-26, -6,-30;
/M: SY='S';  M=  5,  5,-15, -2, -3,-18, -5,  4,-16, -8,-21,-10, 14,-14, -1, -8, 20, 10,-12,-34,-13, -3;
/M: SY='P';  M=  4,-15,-19,-13, -8,-16,-14,-18, -6,-14,-13,-10,-11, 12,-11,-16,  7,  3, -2,-32,-19,-11;
/M:         M= -5,-17,-29,-21,-17,-13, -7, -1, -2,-15, -8, -1,-10,-20,-12,-15,-12,-14, -4, -7, -3,-17;
/M: SY='C';  M= -6,-21, 14,-29,-23, -8,-29,-25, 12,-26,  2,  2,-15,-24,-19,-25, -6, -4, 10,-32,-12,-23;
/M: SY='L';  M=-11,-16,-24,-15,  5,  7,-27,-14,  2,-15, 13,  1,-17,-19,-10,-14,-15, -9, -1,-19, -2, -2;
/M: SY='D';  M= -8, 20,-23, 27, 13,-29,-12, -7,-29,  6,-26,-21, 10, -9,  2, -2,  9,  5,-20,-34,-17,  8;
/M: SY='G';  M=  3,  0,-26,  2, -7,-29, 40,-15,-35,-13,-27,-20,  2,-15,-12,-17,  4,-13,-25,-25,-26, -9;
/M: SY='V';  M= -5,-19,-24,-21,-19,-12, -8,-24, -2,-13,-10, -5,-16,-10,-18,-16, -7, -1,  4,-10,-11,-19;
/M: SY='B';  M= -9, 22,-22, 19,  7,-24,-12, -4,-23,  0,-24,-19, 21, -4, -1, -5,  7,  9,-22,-35,-18,  3;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='P';  M= -7,-16,-25,-13, -9,-14,-20,-17, -2,-13, -6, -6,-14, 28,-14,-16,-10, -6, -5,-26,-17,-14; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='K';  M= -6, -1,-24,  1, 12,-21,-17, -2,-18, 13,-17, -9, -1,-10,  6, 12, -3, -7,-14,-22,-11,  8; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='D';  M= -6,  5,-22,  8,  2,-25,  2,  2,-25, -2,-22,-13,  6,-12,  6,  0,  7, -1,-20,-26,-13,  3; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='M';  M= -9,-19,-19,-24,-14,  5,-23,-10, 16,-14, 15, 27,-18,-19, -9,-13,-16, -8, 11,-17,  0,-12; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='D';  M= -3, 10,-16, 16,  2,-18,  8, -5,-19, -4,-15,-13,  4, -1, -4, -8,  0, -6,-15,-17,-13, -2; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='G';  M=  6, -2,-13, -1,  6,-15, 10, -7,-15, -4,-11, -9, -2, -5, -2, -7,  2, -6,-11,-13,-13,  2; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='I';  M= -4,-13,-13,-16,-12, -4,-18,-13, 17,-11,  5,  7,-11,-12, -5,-11, -7, -4, 14,-13, -3,-10; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='R';  M=-11, -6,-21, -6,  2,-15,-17, -3,-11,  7, -7, -4, -2,-16,  7, 22, -7, -6, -9,-20, -9,  3; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='L';  M= -7,-21,-17,-23,-17,  4,-22,-16, 11,-19, 23, 13,-21,-21,-14,-14,-17, -2,  7, -5,  0,-15; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='K';  M= -7, -2,-19, -4,  6,-17,-16, -6,-14, 12,-12, -1, -2, -9,  7, 11, -1,  5,-11,-20, -8,  6; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='E';  M= -6,  0,-23,  5, 17,-18,-14, -5,-18, -2,-18,-15, -3, 13,  3, -7,  3, -1,-19,-22,-10,  9; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='F';  M= -8,-16,-17,-21,-14, 11,-23,-13,  7,-16, 10,  5,-13,-18,-11,-13, -9,  4,  3,-10,  8,-13; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='G';  M= -5, 12,-19, 12, -4,-21, 23, -5,-25, -7,-21,-16, 15,-13, -7, -9,  2, -9,-21,-21,-18, -5; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='G';  M=  0,-16,-20,-16,-13, -9,  6,-16, -6,-18,  6, -1,-13, -9,-14,-16,-11,-10, -7,-17,-12,-14; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='E';  M= -6,  3,-20,  7, 16,-23,-15, -3,-15,  3,-15, -9, -1, -4, 14, -1,  2, -2,-14,-23,-12, 15; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='P';  M=-10, -7,-19, -2,  3,-22,-17,-14,-21, -8,-24,-18, -8, 32, -7,-14, -8,-10,-25,-14,-19, -4; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='W';  M=-20,-28,-36,-29,-24, 27,-26, -1, -7,-15, -6, -7,-27,-30,-16,-14,-27,-17,-16, 71, 58,-21;
/M: SY='D';  M=-14, 31,-28, 44, 32,-34,-15, -2,-34,  3,-24,-24, 11, -6,  7, -6,  2, -4,-27,-35,-19, 19;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2019_08 which contains 560'823 sequence entries.


Total number of hits 36 in 36 different sequences
Number of true positive hits 36 in 36 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] CENP-V/GFA
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
36 sequences

CENL1_HUMAN (A0A0U1RR11), CENL2_HUMAN (P0DPI3    ), CENL3_HUMAN (A0A0U1RRI6), 
CENPV_HUMAN (Q7Z7K6    ), CENPV_MOUSE (Q9CXS4    ), GFAL_HALED  (E1VBT6    ), 
GFA_ASPFN   (B8NDP1    ), GFA_ASPNC   (A2QBH6    ), GFA_ASPOR   (P0CL54    ), 
GFA_ASPTN   (Q0CMY6    ), GFA_BRADU   (Q89GX9    ), GFA_BRASB   (A5EP16    ), 
GFA_BRASO   (A4YZ37    ), GFA_COLGM   (E3QRY8    ), GFA_EMENI   (C8VDQ3    ), 
GFA_NECH7   (C7Z147    ), GFA_PARDE   (Q51669    ), GFA_PARDP   (A1AXY8    ), 
GFA_PENRW   (B6HE56    ), GFA_PHANO   (Q0V314    ), GFA_PODAN   (B2ACV0    ), 
GFA_PYRTR   (B2W9N9    ), GFA_PYRTT   (E3S405    ), GFA_RHILO   (Q98LU4    ), 
GFA_RHIME   (Q92WX6    ), GFA_RHOP5   (Q07HI5    ), GFA_RHOPB   (Q21D57    ), 
GFA_SORMK   (D1ZK87    ), GFA_TALMQ   (B6QNA1    ), GFA_VERA1   (C9S7Z6    ), 
GFA_XANAC   (Q8PPF1    ), GFA_XANC5   (Q3BXJ3    ), GFA_XANC8   (Q4UYL9    ), 
GFA_XANCB   (B0RNW7    ), GFA_XANCP   (Q8P5F3    ), YEMD_SCHPO  (O14034    )
» more


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission