Due to maintenance work, this service will be unavailable from
Mon Nov 11 17:30 until
Tue Nov 12 09:00
CET.
Apologies for the inconvenience.
PROSITE entry PS51891
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | CENP_V_GFA |
| Accession [info] | PS51891 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
05-JUN-2019 CREATED;
05-JUN-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51891 |
| Associated ProRule [info] | PRU01239 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | CENP-V/GFA domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=119; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=114; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5370748; R2=0.0109772; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=589; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='R'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=362; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='RR'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='Y'; M=-18,-19,-25,-24,-18, 30,-26, 21, -4,-19, 5, 7,-13,-26,-15,-12,-18,-13, -8, -2, 32,-17; /M: SY='E'; M= 4, -2,-20, -5, 11,-16,-17,-10,-17, 1,-14,-10, -3, -9, 6, -4, 5, 8,-13,-23,-11, 9; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='G'; M= 1, -1,-21, -4, -4,-23, 11,-12,-23, -3,-24,-15, 5,-14, -4, -6, 10, 3,-16,-28,-19, -4; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='H'; M=-12,-10,-13,-11, -7,-14,-22, 42,-17,-10, -3, 2, -5,-23, -2, -5,-14,-15,-16,-28, 6, -7; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='G'; M= 6, -7,-25,-10, -9,-26, 26,-16,-30, 2,-25,-15, -2,-15, -9, -2, 0,-10,-20,-20,-21, -9; /M: SY='A'; M= 18, -1,-17, -4, 0,-24, -6,-13,-20, 7,-23,-14, 0,-10, -1, -3, 13, 3,-10,-27,-17, 0; /M: SY='V'; M= -8,-11,-22,-14,-16,-10,-27,-14, 15,-11, -1, 4, -8,-21,-15,-13,-10, -6, 17,-28, -7,-17; /M: SY='R'; M=-13, -6,-32, -4, 9,-27,-21, 3,-21, 16,-21, -8, -4, 2, 14, 18, -8,-11,-21,-23,-11, 9; /M: SY='I'; M=-10,-31,-24,-34,-28, 14,-30,-23, 19,-23, 10, 6,-28,-28,-25,-21,-20,-10, 19, 10, 12,-27; /M: SY='T'; M= -5, -2,-20, -3, 8,-19,-20,-12,-17, 10,-17,-11, -3,-11, 1, 7, 5, 11, -8,-28,-13, 4; /M: SY='V'; M= 9,-23,-11,-26,-23, 0,-21,-25, 15,-18, 2, 3,-22,-24,-24,-19, -2, 1, 31,-26,-10,-23; /M: SY='E'; M=-10, -8,-28, -7, 3,-15,-18,-14,-14, 0, -9, -9, -9,-15, -3, 1, -8, -3,-13, -6, -7, 0; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='I'; M= -4,-20,-16,-23,-20, -2,-14,-20, 19,-18, 9, 8,-16,-18,-17,-17,-11, -6, 19,-17, -6,-20; D=-13; /I: I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='A'; M= 8,-10,-20,-12, -6,-18, 2,-13,-14, -2, -7, -5, -7,-15, -1, -6, -3, -7,-11,-19,-14, -4; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='P'; M= 7, -5,-22, -6, -5,-23, 6,-13,-20,-10,-24,-17, 1, 16, -8,-14, 8, -2,-18,-27,-23, -8; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='Q'; M= -5, -1,-28, 1, 13,-25,-10, 0,-23, 8,-19, -9, -2,-12, 19, 6, -3,-10,-23,-17, -5, 15; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='T'; M= -3, -1,-14, -1, -2, -5,-14,-12, -6, -9, -9, -8, -2,-12, -8,-10, 7, 8, 0,-23, -8, -5; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='A'; M= 20,-14,-13,-18,-11,-10,-10,-17, 0,-13, 3, -2,-14, -4,-11,-16, -3, -3, 3,-18,-12,-11; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='H'; M=-18, 5,-30, 7, 2,-23,-20, 52,-25, 0,-19, -5, 7,-17, 6, 6, -9,-16,-23,-29, 6, 0; /M: SY='N'; M= 2, 1,-18,-10,-13,-12, -6,-10, 0,-12, -5, 0, 9,-21,-11,-13, -2, -4, -2,-29,-14,-12; /M: SY='H'; M=-12,-10,-16,-12,-10, -8, -8, 25,-25,-12,-20,-10, -1,-22, -6, -4, -3,-11,-21,-13, 3, -9; /M: SY='A'; M= 5, -4, -6,-10,-11,-17,-15,-14, -8, -6,-13, -9, 0,-19, -9, -3, 1, -3, -2,-29,-16,-11; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='N'; M=-10, 9,-26, 5, -8,-16, 17, 14,-29,-12,-24,-15, 18,-20, -9,-10, -1,-13,-27,-26,-11, -9; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='S'; M= 2, -5,-16, -8, -3,-15,-14,-15, -5,-12,-15,-10, 1,-11, -4,-13, 20, 17, -2,-33,-14, -4; /M: SY='K'; M=-10, 1,-24, 1, -3,-13,-22,-15,-12, 8,-14, -8, -3,-14, -6, 0, -5, 2, -6,-24, -7, -5; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='W'; M=-14,-13,-32,-12, -9, -9,-16,-13,-23, 4,-20,-15,-12,-19, -4, 13,-14,-11,-21, 39, 4, -6; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='K'; M=-11, -5,-29, -7, 3,-24,-22,-10,-19, 36,-21, -2, -3,-13, 7, 25,-12,-10,-13,-20, -8, 4; /M: SY='P'; M=-14,-15,-35,-12, -4,-21,-22, -4,-18, 5,-22,-11,-11, 20, -3, 6,-14,-13,-21, -9, -9, -6; /M: SY='Q'; M=-10, 5,-14, 6, 11,-29,-10, 9,-28, 0,-23,-13, 6,-15, 15, 3, 1, -8,-25,-30,-14, 12; /M: SY='G'; M= -3, 8,-26, 4,-10,-27, 40,-10,-33,-12,-30,-21, 18,-18,-12,-13, 6,-10,-28,-28,-26,-11; /M: SY='A'; M= 27, -9,-14,-15, -7,-20, -6,-15,-11, -5,-14, -9, -6,-13, -2, -6, 10, 1, -2,-24,-17, -5; /M: SY='H'; M=-12,-16,-29,-17,-10,-12,-27, 10, 1,-13, 0, 3,-11, -1, -7,-12,-14,-10, -6,-25, -1,-12; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='F'; M=-17,-26, -9,-34,-26, 61,-27,-15, -2,-25, 6, -2,-18,-28,-33,-18,-17, -9, -2, 6, 27,-26; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='V'; M= 7,-10,-10,-15,-14, -6,-13,-13, 10,-10, 1, 6, -7,-16,-12,-12, -3, -1, 14,-20, -9,-13; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='A'; M= 33, -6, -7,-13, -6,-15, 0,-14, -8, -7, -9, -8, -6, -7, -6,-14, 10, 2, -1,-17,-15, -6; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='V'; M= -6,-25, -8,-30,-25, -5,-32,-26, 23,-19, 6, 7,-20,-24,-21,-16,-11, -1, 26,-27, -8,-25; /M: SY='V'; M= 4,-24,-15,-30,-25, 11,-25,-25, 16,-21, 6, 4,-20,-23,-25,-21, -7, 1, 23,-19, -2,-25; /M: SY='P'; M= -2,-13,-32, -9, -1,-28, -8,-14,-23, -1,-26,-15,-10, 36, -1, -5, -3, -8,-24,-26,-23, -4; /M: SY='R'; M= -5, -9,-24,-10, 3,-17,-18, -8,-18, 10, -8, -7, -5,-16, 2, 24, -5, -4,-12,-23,-11, 0; /M: SY='D'; M= -4, 14,-21, 21, 6,-28, -5, -8,-27, -6,-27,-21, 9, -1, 0,-10, 16, 7,-19,-36,-20, 2; /M: SY='N'; M= 0, 15,-20, 10, 2,-23, -6, -2,-23, 5,-25,-17, 21,-15, 1, 8, 9, 0,-19,-32,-18, 0; /M: SY='V'; M= -8,-30,-17,-34,-28, 23,-31,-26, 23,-26, 18, 10,-26,-29,-30,-21,-17, -6, 28,-16, 4,-28; /M: SY='K'; M= -5, 3,-21, 1, 10,-22,-15, -9,-23, 13,-23,-14, 5,-10, 4, 10, 10, 11,-16,-29,-14, 7; /M: SY='V'; M= -6,-27,-20,-27,-19, 1,-29,-25, 20,-21, 16, 8,-27,-26,-21,-19,-18, -7, 23,-10, -4,-20; /M: SY='L'; M= -7,-13,-18,-17,-13, -3,-24,-17, 4,-13, 15, 5,-11,-22,-13,-10,-10, 7, 4,-25, -6,-13; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='E'; M= -3, 7,-18, 9, 15,-19, -9, -3,-19, 9,-17,-12, 5, -7, 6, 7, 2, -4,-16,-21,-12, 10; D=-12; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='G'; M= -5, 9,-19, 6, -5,-19, 21, 4,-23, -8,-20,-13, 15,-13, -6, -7, 1, -9,-21,-21,-14, -6; D=-12; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='A'; M= 11, -4,-15, -4, 4,-18, 6, -9,-16, -5,-14,-11, -3, -2, -1, -9, 5, -4,-12,-18,-16, 1; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='D'; M=-11, 24,-28, 32, 28,-32, -4, -2,-33, 1,-26,-23, 13, -8, 6, -6, 4, -8,-29,-34,-21, 17; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='K'; M= -9, 8,-23, 3, 7,-15,-14, 0,-22, 19,-22,-11, 13,-12, 3, 11, -3, -6,-19,-22, -8, 6; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='L'; M= -8,-26,-21,-27,-19, 2,-28,-21, 22,-24, 27, 13,-24,-14,-18,-20,-21, -8, 13,-20, -4,-20; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='T'; M= -4, -2,-21, -3, 4,-21,-10,-11,-18, 2,-17,-10, -2, 0, 5, -2, 5, 12,-15,-23,-14, 4; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='V'; M= -5,-16,-17,-19,-15, -6,-25,-20, 11, -6, 3, 4,-14,-18,-13, -9, -7, 5, 15,-22, -6,-15; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='Y'; M=-11,-21,-20,-21,-21, 16,-27, 0, 11,-12, 4, 4,-21,-27,-16,-12,-14, -5, 12, 5, 39,-21; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='D'; M=-11, 14,-19, 16, 3,-13,-13, -4,-19, -1,-15,-13, 7,-11, 1, -1, 2, 4,-15,-22, -8, 2; D=-10; /I: I=-10; MI=-22; IM=-22; DM=-22; /M: SY='F'; M= -4,-12,-23,-15, 3, 12,-20,-12,-15, -6, -8,-10,-10,-10,-10, -2, -7, -8,-12,-13, -1, -3; /M: SY='S'; M= 3, 6,-16, 2, -2,-21, 9, -9,-23, -9,-27,-19, 16,-13, -4, -9, 24, 11,-17,-35,-21, -3; /M: SY='T'; M= 17, -5,-12,-12, -7,-16, -9,-16,-14, -6,-15,-12, -2,-11, -6, -5, 17, 20, -4,-27,-15, -7; /M: SY='H'; M= -5, 3,-22, 2, -4,-20, -8, 10,-20, -7,-17,-11, 6,-11, -4, -3, 3, 1,-15,-30,-10, -5; /M: SY='F'; M=-12,-21,-24,-28,-21, 14,-31,-18, 14,-16, 8, 6,-15,-21,-18,-13,-13, 0, 8,-11, 11,-21; /M: SY='A'; M= 29, -6,-17,-13, 0,-26, -7,-11,-14, 0,-14, -7, -6,-10, 11, -8, 6, -4,-10,-20,-16, 6; /M: SY='R'; M=-12, -4,-30, -3, 10,-28,-10, -3,-29, 24,-24,-10, 0,-14, 17, 32, -6,-11,-24,-21,-13, 11; /M: SY='H'; M=-20, -7,-29, -8, -4, -8,-22, 54,-25, 0,-16, -3, 2,-22, 4, 18,-12,-15,-23,-18, 18, -4; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='T'; M= -5, -9, -1,-13,-12, -8, -8,-15, -8, -8, -9, -7, -8,-13,-10, -9, -4, 2, -5, -2, -6,-11; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='F'; M= 1,-23,-17,-32,-22, 44,-20,-19, -5,-21, 2, -4,-16,-23,-28,-16,-10, -7, -1, -1, 13,-22; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='K'; M= -7, -5,-26, -5, 0,-24,-10,-12,-25, 19,-25,-13, -1, -2, 1, 16, 0, 2,-18,-24,-15, -1; /M: SY='N'; M= -6, 11,-23, 9, -6,-22, 1,-10,-18, -7,-19,-14, 12,-17, -9, -7, 2, 0,-13,-30,-17, -8; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= 0,-18,-13,-22,-20, -6,-24,-24, 16,-18, 0, 2,-14,-20,-18,-18, 4, 12, 25,-30,-10,-20; /M: SY='H'; M=-12, -4,-26, -6, -1,-18,-21, 32,-19, -6,-17, -5, 0, -5, 10, -4, -1, 2,-20,-23, 7, 2; /M: SY='M'; M= -3,-17,-15,-20,-15, -4,-18,-13, 8,-16, 11, 16,-14,-20, -9,-14, -2, 5, 8,-27, -7,-12; /M: SY='Y'; M=-18,-19,-24,-24,-20, 38,-28, 12, -5,-17, 0, -1,-14,-27,-18,-12,-15, -6, -8, 9, 45,-20; /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='H'; M=-18, -9,-27, -9, -9, 4,-22, 54,-13, -9, -9, 0, -4,-22, 0, -4,-13,-13,-18, 0, 44, -9; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='T'; M= -5, -3,-18, -7, 0,-15,-19, -5, -9, -7,-11, -7, -3, 0, 1, -8, 6, 18, -8,-25, -9, -1; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='E'; M=-10, -2,-28, 3, 20,-21,-17, -6,-19, 1,-15,-13, -3, 17, 4, -1, -5, -8,-22,-26,-18, 10; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='R'; M= -7,-11,-25,-10, -7,-13,-12,-10,-14, 0, 1, -3, -9,-21, -5, 17,-12,-10,-10,-22,-11, -8; /M: SY='S'; M= 0, -3,-17, -3, 3,-12, -9, -9,-21, 0,-24,-16, 4,-12, 0, 2, 21, 8,-13,-30,-13, 2; /M: SY='N'; M= -4, 18,-20, 9, 1,-23, -6, 1,-19, 2,-25,-15, 27,-16, 5, 4, 10, 0,-20,-34,-17, 3; /M: SY='P'; M= -3, -9,-33, -2, 17,-30,-18,-12,-22, -3,-24,-17,-12, 46, 4,-12, -4, -9,-27,-28,-25, 8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='D'; M=-11, 21,-25, 30, 19,-31, -7, -3,-29, 4,-23,-19, 8, -8, 8, -3, 2, -5,-24,-30,-17, 14; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='G'; M= 3, -4,-24, -3, 0,-26, 34,-13,-30,-11,-24,-17, 0,-13, -8,-13, 4,-11,-23,-22,-24, -4; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='W'; M=-10,-27,-25,-28,-24, 11,-23,-19, 3,-17, -3, -4,-26,-26,-21,-16,-18,-10, 7, 38, 17,-21; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='S'; M= 10, -2,-16, -3, 2,-22, 11,-11,-22, -8,-23,-16, 2,-10, 0,-11, 17, 2,-15,-27,-20, 1; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='V'; M= -4,-30,-17,-34,-30, 0,-34,-30, 37,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 43,-26, -6,-30; /M: SY='S'; M= 5, 5,-15, -2, -3,-18, -5, 4,-16, -8,-21,-10, 14,-14, -1, -8, 20, 10,-12,-34,-13, -3; /M: SY='P'; M= 4,-15,-19,-13, -8,-16,-14,-18, -6,-14,-13,-10,-11, 12,-11,-16, 7, 3, -2,-32,-19,-11; /M: M= -5,-17,-29,-21,-17,-13, -7, -1, -2,-15, -8, -1,-10,-20,-12,-15,-12,-14, -4, -7, -3,-17; /M: SY='C'; M= -6,-21, 14,-29,-23, -8,-29,-25, 12,-26, 2, 2,-15,-24,-19,-25, -6, -4, 10,-32,-12,-23; /M: SY='L'; M=-11,-16,-24,-15, 5, 7,-27,-14, 2,-15, 13, 1,-17,-19,-10,-14,-15, -9, -1,-19, -2, -2; /M: SY='D'; M= -8, 20,-23, 27, 13,-29,-12, -7,-29, 6,-26,-21, 10, -9, 2, -2, 9, 5,-20,-34,-17, 8; /M: SY='G'; M= 3, 0,-26, 2, -7,-29, 40,-15,-35,-13,-27,-20, 2,-15,-12,-17, 4,-13,-25,-25,-26, -9; /M: SY='V'; M= -5,-19,-24,-21,-19,-12, -8,-24, -2,-13,-10, -5,-16,-10,-18,-16, -7, -1, 4,-10,-11,-19; /M: SY='B'; M= -9, 22,-22, 19, 7,-24,-12, -4,-23, 0,-24,-19, 21, -4, -1, -5, 7, 9,-22,-35,-18, 3; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='P'; M= -7,-16,-25,-13, -9,-14,-20,-17, -2,-13, -6, -6,-14, 28,-14,-16,-10, -6, -5,-26,-17,-14; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='K'; M= -6, -1,-24, 1, 12,-21,-17, -2,-18, 13,-17, -9, -1,-10, 6, 12, -3, -7,-14,-22,-11, 8; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='D'; M= -6, 5,-22, 8, 2,-25, 2, 2,-25, -2,-22,-13, 6,-12, 6, 0, 7, -1,-20,-26,-13, 3; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='M'; M= -9,-19,-19,-24,-14, 5,-23,-10, 16,-14, 15, 27,-18,-19, -9,-13,-16, -8, 11,-17, 0,-12; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='D'; M= -3, 10,-16, 16, 2,-18, 8, -5,-19, -4,-15,-13, 4, -1, -4, -8, 0, -6,-15,-17,-13, -2; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='G'; M= 6, -2,-13, -1, 6,-15, 10, -7,-15, -4,-11, -9, -2, -5, -2, -7, 2, -6,-11,-13,-13, 2; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='I'; M= -4,-13,-13,-16,-12, -4,-18,-13, 17,-11, 5, 7,-11,-12, -5,-11, -7, -4, 14,-13, -3,-10; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; /M: SY='R'; M=-11, -6,-21, -6, 2,-15,-17, -3,-11, 7, -7, -4, -2,-16, 7, 22, -7, -6, -9,-20, -9, 3; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='L'; M= -7,-21,-17,-23,-17, 4,-22,-16, 11,-19, 23, 13,-21,-21,-14,-14,-17, -2, 7, -5, 0,-15; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='K'; M= -7, -2,-19, -4, 6,-17,-16, -6,-14, 12,-12, -1, -2, -9, 7, 11, -1, 5,-11,-20, -8, 6; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='E'; M= -6, 0,-23, 5, 17,-18,-14, -5,-18, -2,-18,-15, -3, 13, 3, -7, 3, -1,-19,-22,-10, 9; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='F'; M= -8,-16,-17,-21,-14, 11,-23,-13, 7,-16, 10, 5,-13,-18,-11,-13, -9, 4, 3,-10, 8,-13; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='G'; M= -5, 12,-19, 12, -4,-21, 23, -5,-25, -7,-21,-16, 15,-13, -7, -9, 2, -9,-21,-21,-18, -5; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='G'; M= 0,-16,-20,-16,-13, -9, 6,-16, -6,-18, 6, -1,-13, -9,-14,-16,-11,-10, -7,-17,-12,-14; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='E'; M= -6, 3,-20, 7, 16,-23,-15, -3,-15, 3,-15, -9, -1, -4, 14, -1, 2, -2,-14,-23,-12, 15; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='P'; M=-10, -7,-19, -2, 3,-22,-17,-14,-21, -8,-24,-18, -8, 32, -7,-14, -8,-10,-25,-14,-19, -4; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='W'; M=-20,-28,-36,-29,-24, 27,-26, -1, -7,-15, -6, -7,-27,-30,-16,-14,-27,-17,-16, 71, 58,-21; /M: SY='D'; M=-14, 31,-28, 44, 32,-34,-15, -2,-34, 3,-24,-24, 11, -6, 7, -6, 2, -4,-27,-35,-19, 19; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 36 in 36 different sequences |
| Number of true positive hits | 36 in 36 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | CENP-V/GFA |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
36 sequences
CENL1_HUMAN (A0A0U1RR11), CENL2_HUMAN (P0DPI3), CENL3_HUMAN (A0A0U1RRI6), CENPV_HUMAN (Q7Z7K6), CENPV_MOUSE (Q9CXS4), GFAL_HALED (E1VBT6), GFA_ASPFN (B8NDP1), GFA_ASPNC (A2QBH6), GFA_ASPOR (P0CL54), GFA_ASPTN (Q0CMY6), GFA_BRADU (Q89GX9), GFA_BRASB (A5EP16), GFA_BRASO (A4YZ37), GFA_COLGM (E3QRY8), GFA_EMENI (C8VDQ3), GFA_FUSV7 (C7Z147), GFA_PARDE (Q51669), GFA_PARDP (A1AXY8), GFA_PENRW (B6HE56), GFA_PHANO (Q0V314), GFA_PODAN (B2ACV0), GFA_PYRTR (B2W9N9), GFA_PYRTT (E3S405), GFA_RHILO (Q98LU4), GFA_RHIME (Q92WX6), GFA_RHOP5 (Q07HI5), GFA_RHOPB (Q21D57), GFA_SORMK (D1ZK87), GFA_TALMQ (B6QNA1), GFA_VERA1 (C9S7Z6), GFA_XANAC (Q8PPF1), GFA_XANC8 (Q4UYL9), GFA_XANCB (B0RNW7), GFA_XANCP (Q8P5F3), GFA_XANE5 (Q3BXJ3), YEMD_SCHPO (O14034)» more
|
| PDB [Detailed view] |
2 PDB
1X6M; 1XA8 |