PROSITE entry PS51927
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | COV_M |
| Accession [info] | PS51927 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
07-OCT-2020 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51927 |
| Associated ProRule [info] | PRU01275 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Coronavirus membrane (Cov-M) protein profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=229; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=224; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6182563; R2=0.0122128; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-13625.0214844; R2=35.0829544; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=769; H_SCORE=13354; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=318; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20, 0,-20, 0, 20,-10, 20, 60,-20,-20, 0,-10,-20,-10, 10,-20, 0,-10; /I: I=-4; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7; /M: SY='A'; M= 29, -2, -9,-10, -6,-17, 0,-12,-11, -8,-14,-11, 2, -9, -6,-13, 14, 4, -5,-22,-17, -6; D=-4; /I: I=-4; DM=-7; /M: SY='N'; M= -1, 5,-11, 2, -1,-12, 3, -3,-12, -4,-16,-11, 12, -1, -2, -5, 9, 2,-12,-19,-12, -2; D=-4; /I: I=-4; DM=-7; /M: SY='E'; M= -5, 8,-15, 11, 17,-15, -8, 0,-15, 5,-12,-10, 5, -4, 6, 5, 0, -4,-14,-16,-10, 11; D=-4; /I: I=-4; DM=-7; /M: SY='C'; M= -8, -2, 17, -1, -7,-21,-18,-16,-21,-12,-19,-17, -7, 6,-12,-16, -1, 3,-14,-32,-20,-11; D=-4; /I: I=-4; DM=-7; /M: SY='N'; M= -1, 7,-18, 1, 1,-18,-11, -5, -9, -5,-18,-11, 15,-17, 0, -7, 8, 1, -7,-33,-17, 1; /M: SY='C'; M= -6, -4, 5, -9,-14, -9, -3, -6,-20,-14,-20,-15, 3,-23,-12,-14, 4, 1,-15,-22, 0,-14; /M: SY='C'; M= -7, 0, 19, -5,-10,-19,-23,-18,-16,-14,-14,-13, -4,-19,-10,-16, 4, 15, -7,-36,-16,-10; /M: SY='W'; M=-15,-21,-28,-29,-24, 23,-25,-19, 4,-23, 6, -1,-14,-27,-22,-19,-22,-13, -5, 24, 12,-21; /M: SY='T'; M= -8, 12, 2, 10, 5,-21,-17,-11,-23, -7,-19,-18, 7,-14, -5,-10, 7, 14,-15,-36,-18, 0; /M: SY='T'; M= 5,-15,-16,-21,-16, 3,-12,-19, -7,-11, -6, -6,-11,-19,-17, -6, 0, 6, 3,-18, -6,-16; /M: SY='G'; M= -8, 11,-30, 19, 17,-32, 21, -9,-37, -5,-27,-22, 5,-11, -2,-11, 0,-14,-30,-28,-24, 8; /M: SY='D'; M=-14, 25,-30, 38, 36,-36,-16, 2,-32, 6,-24,-21, 9, -6, 19, -2, 0,-10,-30,-32,-18, 27; /M: SY='L'; M= 7,-20,-17,-24,-16, -4,-19,-20, 10,-22, 17, 6,-17,-20,-14,-20, -6, -2, 7,-24, -8,-16; /M: SY='V'; M= -6,-25,-22,-29,-24, -5,-33,-27, 29,-13, 8, 11,-21,-22,-19,-16,-14, -6, 30,-24, -6,-24; /M: SY='W'; M=-11, -9,-32, -9, 8,-18,-20,-10,-22, 5,-20,-12,-11,-14, 12, 0, -9, -6,-24, 23, -1, 11; /M: SY='H'; M=-16,-18,-24,-21,-15, 14,-26, 26, -4,-22, 14, 8,-12,-26,-13,-12,-20,-14, -8,-17, 15,-15; /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22, 23,-30,-20, 16,-30, 43, 16,-28,-30,-24,-20,-28,-10, 8,-14, 6,-22; /M: SY='K'; M= 6, -1,-25, -2, 13,-27,-15,-11,-25, 27,-23,-12, -3, -8, 6, 12, -3, -7,-16,-22,-14, 9; /M: SY='E'; M=-10, 21,-26, 17, 28,-27,-11, 6,-24, 6,-24,-17, 26,-10, 18, 2, 4, -6,-30,-33,-18, 23; /M: SY='W'; M=-20,-36,-46,-36,-28, 14,-22,-21,-16,-18,-16,-16,-36,-30,-18,-18,-36,-26,-26,128, 39,-20; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27, 56,-30,-20, 7,-30, 24, 7,-23,-30,-33,-20,-23,-10, 3, 0, 20,-27; /M: SY='S'; M= 1,-12,-15,-14,-13, 0, 0,-17,-11,-17,-16,-11, -4,-18,-15,-15, 15, 5, -2,-26,-11,-13; /M: SY='W'; M=-14,-34,-36,-38,-28, 7,-29,-28, 13,-26, 10, 3,-31,-27,-20,-23,-31,-19, 0, 53, 13,-23; /M: SY='G'; M= 1, 2,-19, -3,-10,-22, 24,-13,-26,-12,-26,-18, 12,-15,-10,-12, 16, 7,-19,-30,-22,-10; /M: SY='V'; M= 3,-26,-18,-33,-26, 9,-28,-27, 25,-23, 10, 8,-21,-23,-25,-23,-11, -5, 26,-18, -2,-26; /M: SY='I'; M=-12,-30,-27,-38,-28, 16,-37,-27, 36,-30, 23, 16,-22,-23,-24,-27,-22,-10, 21,-14, 6,-28; /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22, 21,-30,-20, 17,-30, 44, 17,-28,-30,-23,-20,-28,-10, 8,-15, 5,-22; /M: SY='L'; M= -8,-25,-21,-30,-21, 4,-31,-23, 24,-27, 33, 15,-23,-24,-18,-21,-20, -1, 14,-22, -2,-21; /M: SY='F'; M= -3,-27,-20,-35,-27, 30,-28,-24, 17,-25, 10, 6,-20,-24,-28,-23,-14, -7, 15, -9, 8,-27; /M: SY='F'; M=-16,-32,-27,-38,-28, 38,-31,-24, 12,-28, 15, 5,-25,-28,-29,-22,-25,-13, 4, 20, 18,-27; /M: SY='I'; M= -6,-18,-22,-28,-22, -4,-32,-26, 25,-22, 8, 8,-12,-16,-16,-22, -4, 15, 18,-24, -4,-22; /M: SY='I'; M= -6,-20,-20,-29,-23, -3,-30,-22, 26,-20, 10, 17,-16,-19,-16,-20, -8, 8, 22,-24, -4,-21; /M: SY='I'; M= -7,-30,-23,-36,-28, 2,-36,-28, 40,-27, 22, 17,-24,-24,-23,-26,-19, -7, 32,-23, -3,-28; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-31,-25, 57,-30, -2, 0,-21, 5, 0,-20,-30,-26,-15,-20,-10, -5, 19, 53,-25; /M: SY='G'; M= 8,-10,-27,-12,-18,-28, 59,-20,-35,-18,-27,-18, -2,-18,-18,-20, 2,-17,-25,-20,-28,-18; /M: SY='Y'; M=-20,-14,-30,-14,-11, 9,-26, 27,-13, 1, -9, -3,-10,-26, -1, 13,-16,-12,-16, 7, 46,-11; /M: SY='P'; M= 5,-10,-21,-12, -7,-13,-15,-12,-13,-10,-17,-13, -9, 14, -8,-15, 7, 10,-11,-20, -5,-10; /M: SY='Q'; M= -4, 6,-20, 1, 5,-25,-12, -3,-20, 6,-24,-11, 12,-12, 16, 3, 13, 9,-18,-30,-14, 11; /M: SY='R'; M=-20,-17,-27,-20,-11, 15,-24, -2,-17, 7, -9, -6, -9,-24, -7, 33,-14,-10,-13, -4, 15,-11; /M: SY='S'; M= 7, 6,-12, 3, 0,-20, 0, -7,-20, -8,-30,-20, 18,-12, 0, -8, 35, 17,-13,-40,-20, 0; /M: SY='W'; M=-16,-19,-33,-21,-11, -9,-20,-10,-16, 11,-13, 3,-15,-21, 0, 20,-20,-15,-16, 26, 3, -6; /M: SY='F'; M=-16,-29,-20,-36,-26, 58,-29,-20, 4,-29, 18, 4,-21,-29,-33,-20,-20, -9, 2, 0, 20,-26; /M: SY='V'; M= -7,-30,-18,-34,-28, 14,-33,-27, 29,-26, 19, 13,-26,-27,-27,-23,-17, -6, 31,-20, 0,-28; /M: SY='Y'; M=-19,-20,-20,-21,-21, 27,-30, 17, -2,-11, -1, -1,-20,-31,-11,-11,-19,-10,-10, 25, 73,-21; /M: SY='G'; M= -3,-21,-25,-25,-26,-13, 9,-26, 7,-23, -4, 1,-14,-22,-22,-23, -9,-12, 9,-22,-15,-26; /M: SY='I'; M= -9,-30,-25,-36,-27, 3,-36,-27, 38,-29, 29, 19,-24,-24,-21,-26,-23, -9, 25,-21, -1,-27; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20, 2,-22, -3, 20,-13, 25, 54,-22,-22, -3,-12,-22,-10, 10,-20, 0,-12; /M: SY='I'; M= -8,-30,-22,-34,-26, 4,-34,-26, 34,-28, 31, 18,-26,-26,-22,-24,-23, -8, 25,-22, -2,-26; /M: SY='I'; M= -8,-30,-22,-37,-30, 13,-35,-28, 35,-27, 15, 13,-23,-25,-27,-25,-17, -7, 32,-19, 1,-30; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20, 7,-27,-15, 20,-25, 42, 31,-27,-27,-15,-17,-27,-10, 10,-20, 0,-17; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='L'; M=-10,-28, 6,-30,-22, 4,-30,-22, 11,-30, 37, 13,-28,-32,-22,-22,-26,-10, 6,-26, -6,-22; /M: SY='L'; M=-12,-28,-20,-32,-22, 21,-28,-15, 16,-25, 36, 25,-26,-28,-19,-18,-26,-10, 8,-14, 6,-20; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='L'; M= -8,-30,-20,-32,-24, 6,-32,-24, 29,-28, 35, 18,-28,-28,-22,-22,-24, -8, 23,-22, -2,-24; /M: SY='T'; M= -2, -5,-12,-13,-17, -8,-21,-19, 5,-12, -5, -3, -2,-20,-17,-12, 5, 19, 16,-32,-12,-17; /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24, 6,-34,-24, 32,-30, 38, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 18,-20, 0,-24; /M: SY='A'; M= 37,-15,-13,-24,-15,-15, -8,-22, 2,-14, -4, -4,-13,-13,-13,-22, 4, -2, 8,-21,-16,-15; /M: SY='L'; M= -8,-28, 5,-30,-23, 3,-30,-23, 14,-28, 31, 12,-28,-32,-23,-22,-23, -8, 14,-27, -7,-23; /M: SY='T'; M= -2, -8, -6,-15,-15, -1, -3,-19,-17,-17,-14,-12, -3,-17,-17,-15, 11, 18, -8,-25,-10,-15; /M: SY='I'; M= -7,-30,-23,-37,-30, 0,-37,-30, 43,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 37,-23, -3,-30; /M: SY='F'; M=-17,-30,-22,-38,-28, 54,-32,-22, 12,-30, 18, 7,-22,-28,-33,-22,-22,-10, 7, 0, 20,-28; /M: SY='N'; M= 2, 26,-18, 18, 1,-23, -2, 0,-21, -3,-27,-20, 33,-15, -2, -7, 14, 2,-21,-37,-20, 0; /M: SY='C'; M= 18,-13, 43,-23,-18,-18,-15,-24,-18,-18,-14,-14,-13,-22,-18,-23, 3, 4, -4,-34,-23,-18; /M: SY='Y'; M=-10,-29,-25,-31,-27, 10,-30,-16, 18,-19, 4, 4,-27,-28,-21,-19,-19, -9, 18, 16, 23,-26; /M: SY='Y'; M= -2,-15,-22,-17,-14, 11,-19, 5, -4,-11, -4, -4,-13,-23, -9,-12, -4, -2, -7, 5, 39,-14; /M: SY='E'; M= 2, 1,-26, 1, 14,-25,-12, -7,-22, 3,-21,-16, 3, 8, 3, 3, 0, -6,-22,-28,-20, 7; /M: SY='Y'; M=-14,-27,-33,-27,-19, 6,-28,-12, 6,-19, 6, 1,-25, -6,-15,-19,-24,-13, -6, 18, 21,-20; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='N'; M=-13, 26,-23, 12, 0,-20, -5, 7,-23, 8,-27,-17, 44,-20, 3, 19, 5, -3,-27,-35,-17, 0; /M: SY='W'; M=-14, -9,-30,-15,-17, 5,-18, -5,-13,-11,-15,-13, -5,-24,-11,-11,-12, -3,-19, 41, 25,-14; /M: SY='V'; M= 8,-23,-14,-25,-25, -9, -7,-27, 11,-18, 0, 1,-21,-25,-25,-20, -5, -4, 28,-27,-15,-25; /M: SY='Y'; M=-10,-16,-22,-22,-20, 12, -7, -5, -4,-15, 0, 11,-13,-22,-14,-13,-10, -2, -5, -6, 16,-17; /M: SY='F'; M=-10,-27,-20,-29,-24, 21,-14,-22, 6,-27, 20, 7,-22,-28,-27,-20,-19,-10, 7,-13, 2,-24; /M: SY='G'; M= 8,-14,-23,-15,-20,-23, 41,-22,-22,-18,-20,-13, -7,-20,-20,-20, 0,-13,-11,-22,-25,-20; /M: SY='F'; M= -4,-26,-19,-35,-26, 41,-26,-22, 9,-26, 11, 3,-19,-25,-29,-22,-15, -8, 7, -4, 12,-26; /M: SY='S'; M= 24, -3,-10, -7, -3,-20, 0,-13,-17,-10,-23,-17, 3,-10, -3,-13, 30, 13, -7,-33,-20, -3; /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-38,-30, 12,-37,-28, 39,-28, 17, 15,-22,-23,-25,-27,-18, -8, 29,-17, 3,-30; /M: SY='A'; M= 18,-21,-15,-27,-20, -7,-19,-24, 15,-19, 9, 5,-19,-19,-18,-22, -6, -3, 18,-22,-11,-20; /M: SY='M'; M=-10,-21,-23,-27,-22, 12, 0,-14, -1,-21, 10, 17,-16,-24,-18,-17,-16,-13, -3,-13, -1,-19; /M: SY='A'; M= 29, -6,-10,-16,-10,-16, -8,-20,-10,-10,-10,-10, -6,-10,-10,-16, 14, 21, 0,-24,-16,-10; /M: SY='V'; M= -5,-26, 4,-32,-29, -4,-33,-29, 24,-24, 7, 7,-23,-27,-25,-24,-11, -2, 30,-30,-10,-29; /M: SY='V'; M= -4,-25,-15,-29,-25, 12,-27,-25, 20,-22, 5, 5,-20,-25,-26,-20, -6, 0, 28,-23, -3,-25; /M: SY='T'; M= 18, -8,-10,-16,-13,-12,-13,-21, -4,-12, -8, -7, -8,-13,-13,-15, 13, 23, 7,-27,-14,-13; /M: SY='F'; M=-11,-25, 2,-32,-27, 15,-16,-24, 2,-28, 6, 1,-18,-28,-27,-24,-16,-12, 2,-17, -2,-27; /M: SY='I'; M= -1,-28,-18,-31,-25, 2,-29,-26, 27,-25, 24, 14,-26,-26,-22,-22,-17, -6, 27,-23, -5,-25; /M: SY='M'; M= -6,-20,-19,-25,-17, -1,-20, -9, 15,-17, 19, 32,-17,-21, -7,-14,-12, -4, 8,-24, -4,-12; /M: SY='W'; M=-20,-38,-44,-40,-30, 23,-22,-28,-16,-22,-14,-16,-36,-30,-24,-20,-36,-26,-24,124, 30,-22; /M: SY='I'; M= -7,-29,-21,-34,-27, 2,-33,-26, 36,-25, 21, 20,-25,-25,-22,-23,-18, -7, 32,-23, -3,-27; /M: SY='M'; M= -3,-16,-19,-21,-18, -9, -2,-10, 4,-13, 1, 25,-13,-20, -8,-13, -5, -5, 6,-25,-10,-13; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='F'; M=-20,-32,-26,-40,-30, 67,-28,-22, -4,-28, 4, -4,-24,-30,-36,-20,-24,-14, -6, 36, 30,-28; /M: SY='V'; M= 6,-27,-14,-30,-27, -3,-27,-28, 27,-20, 9, 9,-25,-25,-25,-22, -9, -2, 39,-27,-10,-27; /M: SY='N'; M= -3, 11,-23, 2, 2,-24, -9, 2,-21, 8,-22,-12, 21,-17, 12, 18, 3, -5,-22,-28,-15, 6; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='I'; M=-12,-30,-25,-39,-30, 25,-36,-27, 32,-29, 16, 13,-21,-24,-27,-26,-19, -9, 22,-11, 9,-30; /M: SY='R'; M=-17, -7,-30, -7, 5,-25,-20, 3,-27, 25,-20, -7, 0,-17, 24, 54, -7,-10,-23,-20,-10, 11; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-35,-27, 66,-30, -9, 0,-25, 7, 0,-20,-30,-32,-17,-20,-10, -3, 15, 44,-27; /M: SY='R'; M= -5,-13,-27,-17, -7,-17,-21,-12, -9, 14,-11, -3, -6,-17, 0, 25, -9, -8, -5,-20, -9, -7; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='T'; M= 6, -5, 14,-15,-14,-13,-19,-22,-14,-14,-12,-12, -5,-16,-14,-15, 13, 31, -2,-32,-15,-14; /M: SY='R'; M=-13, -7,-30, -7, -2,-25, 0, -7,-32, 24,-25,-12, 0,-17, 3, 39, -8,-12,-22,-20,-15, -2; /M: SY='S'; M= 8, 0,-10, -2, -2,-18, -3,-12,-18,-10,-27,-18, 8,-10, -2,-10, 37, 25, -8,-38,-18, -2; /M: SY='W'; M=-18,-34,-38,-38,-28, 25,-22,-23, -9,-21, -7, -2,-32,-28,-21,-18,-32,-22,-17, 90, 25,-21; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='S'; M= 16, -2,-10, -3, -2,-20, 0,-12,-18,-10,-27,-18, 7,-10, -2,-12, 35, 17, -8,-37,-20, -2; /M: SY='F'; M=-20,-32,-25,-40,-30, 69,-28,-22, -3,-28, 5, -3,-23,-30,-37,-20,-23,-13, -5, 32, 30,-28; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='T'; M= 2, -6,-11,-12,-12,-10,-19,-20, -4,-12,-10, -8, -3,-13,-12,-12, 18, 35, 7,-32,-12,-12; /M: SY='N'; M= -9, 36,-20, 18, 0,-20, -1, 8,-20, 1,-30,-20, 54,-19, 0, 1, 11, 1,-28,-39,-20, 0; /M: SY='A'; M= 27, -2,-16,-14,-11,-17, -6,-15, -3,-11,-10, -7, 4,-14, -9,-17, 5, -2, -2,-25,-17,-11; /M: SY='I'; M= -8,-30,-22,-34,-26, 4,-34,-26, 35,-28, 30, 18,-26,-26,-22,-24,-22, -8, 26,-22, -2,-26; /M: SY='L'; M= -7,-19,-20,-23,-18, -3, -8,-15, 4,-21, 19, 17,-18,-23,-14,-16,-14, -3, 1,-22, -7,-16; /M: SY='C'; M= -5, -8, 53,-16,-20,-17,-20,-20,-17,-20,-19,-15, -3,-30,-20,-20, 2, -1, -4,-43,-23,-20; /M: SY='V'; M= -4,-25,-18,-31,-27, -2,-33,-28, 32,-23, 11, 11,-21,-23,-23,-23, -9, 4, 34,-26, -6,-27; /M: SY='D'; M= -7, 6,-22, 9, -1,-19,-14,-11,-16,-10,-12,-13, 3, 2, -7,-13, 4, 6,-14,-33,-16, -5; /M: SY='L'; M= 8,-22,-16,-27,-19, -2,-20,-17, 13,-18, 21, 19,-22,-22,-14,-18,-14, -6, 13,-22, -7,-17; /M: SY='L'; M=-10,-14,-22,-16, -8, -8,-24,-14, -5, 2, 9, 3,-13,-20, -6, 8,-13, 1, -4,-22, -6, -8; /M: SY='G'; M= -2, -1,-28, -4,-16,-28, 57,-14,-36,-16,-30,-20, 11,-20,-16,-16, 2,-16,-30,-24,-28,-16; /M: SY='R'; M= -9, -5,-24, -8, -4,-22, -3, -8,-24, 5,-19,-10, 0,-15, 6, 19, 3, 7,-17,-23,-14, -1; /M: SY='T'; M= -2,-10,-18,-15, -8,-14,-19,-11, 3,-10, -6, 6, -6,-15, 4,-10, 7, 8, 2,-28,-10, -3; /M: SY='Y'; M=-15,-18,-27,-18,-14, 12,-28, 10, 1, -8, -2, 2,-18,-26, 0, -8,-15, -8, -4, 11, 49,-11; /M: SY='V'; M= -5,-22, 11,-25,-25, -1,-28,-21, 8,-19, 0, 0,-22,-29,-24,-19, -7, 5, 22,-24, 0,-25; /M: SY='R'; M=-14, -5,-25, -8, -2,-15,-19, -2,-13, 5, -3, -2, 3,-21, 8, 23,-10, -8,-15,-24, -9, 1; /M: SY='P'; M=-12,-22,-36,-16, -6,-10,-22,-20,-16,-14,-23,-16,-20, 68,-16,-20,-12,-10,-24,-23,-19,-14; /M: SY='L'; M= 1,-26,-22,-32,-22, 1,-28,-24, 26,-26, 28, 14,-23,-23,-18,-24,-19, -8, 16,-20, -4,-22; /M: SY='I'; M=-11, -9,-28,-11, 0,-15,-27,-11, 12,-11, 2, 12,-10,-14, 5,-13,-11,-10, 1,-24, -7, 0; /M: SY='E'; M= -7, 3,-30, 9, 32,-32, 5, -4,-31, 2,-23,-17, 0, -7, 15, -4, 0,-13,-30,-26,-21, 24; /M: SY='S'; M= 7, 4,-15, 6, -3,-20,-10,-14,-13,-10,-18,-14, 1,-14, -8,-13, 15, 9, -1,-34,-17, -6; /M: SY='P'; M=-10,-17,-31,-11, 0,-11,-24,-10, -8, -9,-14,-10,-19, 26, -9,-14,-11, -8,-11,-16, 0, -8; /M: SY='T'; M= -8, -9,-22,-11, -8,-13,-22, 7,-12,-13, -6, -5, -6, 3, -7,-11, 0, 13,-11,-28, -5, -9; /M: SY='G'; M= 0, -9,-19,-13,-18,-17, 17,-22,-16,-16,-15,-11, -5,-18,-18,-16, 7, 12, -5,-26,-19,-18; /M: SY='V'; M= -5,-30,-19,-33,-28, 2,-33,-28, 34,-25, 22, 15,-27,-27,-25,-23,-18, -5, 35,-25, -5,-28; /M: SY='T'; M= -2, -7,-15,-14,-13,-10, -7,-20, -9,-15, -2, -6, -6,-15,-13,-13, 8, 28, -3,-27,-11,-13; /M: SY='V'; M= 11,-20,-13,-22,-17, -6,-17,-21, 9,-19, 9, 3,-18,-22,-17,-18, -2, 1, 16,-27,-11,-17; /M: SY='T'; M= -2, -9,-16,-13,-11,-12,-22,-22, -5,-12,-10, -9, -9, 5,-13,-13, 10, 31, 3,-30,-14,-13; /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26, 4,-36,-26, 37,-30, 33, 20,-24,-24,-20,-26,-24,-10, 21,-20, 0,-26; /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26, 4,-36,-26, 37,-30, 33, 20,-24,-24,-20,-26,-24,-10, 21,-20, 0,-26; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='R'; M= -5, 3,-20, 0, 0,-20, -8, -2,-24, 7,-26,-16, 15,-16, 4, 23, 15, 5,-18,-32,-16, 0; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='H'; M=-14, 1,-22, -7,-10, 1,-18, 33,-12,-13,-13, -4, 12,-23, -8, -7, -6,-10,-12,-25, 6,-10; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='Y'; M=-19,-18,-20,-19,-17, 19,-28, 13, -7, -5, -5, -3,-17,-29, -8, 2,-18,-10,-12, 17, 58,-17; /M: SY='M'; M= 8,-20, 9,-28,-21, -9,-19,-18, 7,-17, 3, 15,-19,-23,-14,-20, -8, -6, 11,-27,-13,-18; /M: SY='E'; M= -2, 11,-27, 17, 33,-32,-15, -1,-26, 5,-20,-15, 1, -5, 21, -3, 2, -8,-25,-28,-18, 27; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='H'; M=-15,-15,-26,-19,-11, 8,-27, 21, -3,-16, -3, 4, -8,-22, -2,-10,-12,-12, -7,-16, 12, -8; /M: SY='K'; M=-10, -9,-30, -9, -1,-19,-17,-12,-27, 24,-27,-13, -6,-15, 3, 21, -7, -9,-20, 8, -4, 1; /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22, 7,-31,-20, 25,-28, 42, 24,-27,-27,-18,-21,-27,-10, 14,-20, 0,-21; /M: SY='A'; M= 31,-10,-18,-16,-14,-24, 27,-20,-22,-14,-18,-14, -6,-14,-14,-20, 6, -8,-12,-20,-24,-14; /M: SY='G'; M= -4, -4,-22, -7, -6,-22, 8,-13,-27, 5,-24,-14, 2,-14, -4, 8, 7, 6,-17,-25,-17, -6; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='G'; M= -2,-10, 0,-11,-18,-23, 41,-18,-31,-18,-23,-16, -3,-20,-18,-18, -2,-15,-21,-21,-24,-18; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='M'; M= -9,-20, 9,-24,-21, 8,-23,-10, 5,-17, 7, 11,-19,-25,-16,-15,-14, -7, 7,-14, 8,-19; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='D'; M= -6, 16,-21, 17, 16,-27,-11, -2,-24, 0,-24,-17, 14,-10, 12, -4, 13, 6,-22,-34,-17, 14; /M: SY='I'; M= -9,-29,-29,-31,-23, -3,-32,-27, 24,-24, 11, 8,-25, -4,-20,-24,-20,-10, 14,-10, -5,-24; /M: SY='D'; M= -8, 18,-25, 26, 14,-30,-12, 11,-31, 5,-26,-18, 10,-11, 4, -2, 4, -6,-23,-33,-12, 8; /M: SY='D'; M=-17, 33,-27, 34, 8,-28, -9, 31,-31, -3,-27,-18, 31,-16, 3, -4, 1, -9,-30,-37, -9, 4; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='K'; M= 4, -1,-25, -1, 13,-28,-15,-11,-25, 30,-24,-12, -2, -8, 7, 14, -4, -8,-17,-22,-14, 10; /M: SY='Y'; M=-18, -2,-30, 3, 0, 7,-25, 13,-12, -5, -9, -9, -9,-21, -3, -8,-13,-10,-17, 7, 45, -5; /M: SY='I'; M= -6,-28,-19,-33,-28, 0,-31,-23, 35,-21, 16, 25,-24,-24,-20,-21,-16, -6, 34,-24, -4,-25; /M: SY='T'; M= -6,-11,-15,-21,-16, 9,-22,-15, 0,-14, 2, 11, -9,-16,-13,-12, 2, 23, 3,-20, 0,-14; /M: SY='V'; M= -1,-30,-12,-31,-30, 0,-31,-30, 32,-21, 11, 11,-29,-29,-29,-21,-11, -1, 48,-29, -9,-30; /M: SY='A'; M= 39,-12, 14,-22,-14,-20, -6,-22,-14,-14,-12,-12,-12,-16,-14,-22, 6, -2, -2,-26,-22,-14; /M: SY='T'; M= -4,-10,-16,-14,-10, -9,-23,-19, -3, -2, -1, -1,-10,-17,-10, -4, 0, 18, 5,-26, -8,-10; /M: SY='P'; M= -4,-19,-28,-13, -7,-22,-19,-21, -9,-12,-21,-13,-17, 47,-13,-18, -2, -3, -9,-32,-24,-13; /M: SY='S'; M= -2, 6,-17, 8, 1,-22, -9, -9,-21, -2,-24,-17, 7,-13, -1, 2, 20, 11,-11,-35,-17, -1; /M: SY='R'; M=-14, -5,-24, -8, -3,-17,-20, 16,-24, 8,-17, -8, 2,-17, 4, 29, 0, 7,-16,-25, -3, -3; /M: SY='T'; M= -8,-14,-18,-18,-12, -4,-24,-16, -2,-10, 11, 2,-12,-20,-10, 1, -5, 16, 0,-24, -6,-12; /M: SY='I'; M= -7,-11, -2,-20,-19, -9,-24,-19, 12,-21, -1, 0, -1,-22,-15,-20, -4, -3, 5,-31,-11,-19; /M: SY='I'; M= -7,-22,-20,-27,-24, 3,-31,-20, 23,-19, 7, 7,-18,-22,-19,-19, -8, 6, 22,-17, 8,-24; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='K'; M= -6, -2,-21, -5, 1,-21,-17,-11,-23, 21,-23,-12, 2,-12, 3, 20, 6, 11,-13,-26,-12, 1; /M: SY='L'; M=-14,-21,-24,-22,-12, -3,-24, -9, 1, -3, 18, 16,-17,-24, -5, 16,-21,-10, -1,-20, -4,-11; /M: SY='V'; M= 4,-22,-16,-23,-25,-11, 4,-26, 5,-19, -4, -1,-19,-25,-25,-20, -5, -6, 21,-26,-17,-25; /M: SY='G'; M= 2,-13,-24,-17,-13, -5, 19,-14,-22,-15,-16,-10, -6,-19, -8,-14, -3,-13,-18,-13,-11,-10; /M: SY='K'; M= -8, -8,-24, -8, 0,-18,-19,-11,-17, 19,-10, -5, -5,-16, 2, 18, -6, -5,-12,-23, -9, 0; /M: SY='Q'; M=-11, 8,-27, 12, 8,-22,-16, 3,-23, 8,-22,-12, 2,-14, 15, 2, 1, -5,-21,-18, 3, 11; /M: SY='R'; M= -9,-15,-21,-17,-10, -8,-24,-15, -3, 2, 4, 1,-13,-21, -8, 11,-10, 3, 3,-23, -7,-10; /M: SY='K'; M= -6, -7,-24,-12,-13,-17, -6,-17, -4, 1,-13, -4, -1,-20,-11, -5, -7, -8, 1,-25,-14,-13; /M: SY='G'; M= 11, 8,-20, 10, -2,-28, 14,-13,-27,-10,-25,-20, 5,-12, -8,-15, 12, -3,-17,-30,-22, -5; /M: SY='Q'; M= -5, 7,-21, 8, 6,-28, -8, -5,-22, -2,-22,-12, 5,-11, 16, -4, 12, 10,-19,-29,-15, 11; /M: SY='S'; M= -1, 12,-15, 10, -1,-19, -9, -9,-17, -8,-22,-17, 14,-13, -5, -9, 20, 18,-10,-37,-17, -3; /M: SY='S'; M= 19, -5,-14, -7, -6,-22, 13,-15,-21,-12,-25,-17, 3,-12, -6,-15, 24, 7,-11,-31,-22, -6; /M: SY='G'; M= -2, 3,-20, -4,-12,-20, 19,-14,-24,-12,-21,-16, 11,-16,-12,-12, 10, 14,-17,-28,-20,-12; /M: SY='G'; M=-10,-16,-26,-20,-18, 13, 15,-18,-23,-11,-14,-10, -8,-22,-22,-11,-10,-14,-16, -8, -3,-18; /M: SY='W'; M= 9,-21,-31,-25,-15, -9,-12,-22,-18, -3,-18,-14,-21,-19,-11,-11,-15,-15,-16, 53, 3,-11; /M: SY='A'; M= 18,-18,-14,-22,-16,-12,-15,-20, 2, -6, -4, -2,-16,-19,-14, -3, -1, -2, 15,-24,-14,-16; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23, 47,-30, 6, 0,-17, 3, 0,-20,-30,-20,-13,-20,-10, -7, 23, 63,-23; /M: SY='Y'; M= -1,-11,-20,-16,-17, 6,-20, 0, 2,-11, -4, -3, -7,-25,-13,-12, -7, -4, 2, -4, 25,-17; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='V'; M= 0,-13, -6,-15,-15, -2,-16,-16, 11,-10, 2, 2,-13,-15,-15,-10, -1, 9, 21,-18, -6,-15; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='R'; M=-15, -9,-28,-11, -1, -7,-22, -9,-24, 29,-19, -8, -4,-17, 1, 33,-12,-10,-16,-14, -3, -1; /M: SY='S'; M= 2,-13,-13,-13,-13, -5,-15,-12, 0,-13,-12, -7, -8,-20,-12,-13, 13, 8, 10,-25, 0,-13; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='K'; M=-10, -2,-24, -2, 7,-23,-16, -7,-24, 38,-23, -8, 0,-10, 8, 31, -8, -8,-16,-16, -8, 7; D=-12; /I: I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='V'; M= 9,-14,-14,-19,-14, -9,-16, -2, 8,-14, 0, 3,-11,-16,-11,-15, -4, -5, 12,-20, -5,-14; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='G'; M= 0, -8,-24, -8,-16,-24, 57,-16,-33,-16,-24,-16, 0,-16,-16,-16, 0,-16,-24,-16,-24,-16; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='D'; M=-12, 37,-21, 38, 9,-25, -4, 4,-25, 0,-24,-21, 32,-12, 0, -4, 4, -4,-24,-33,-16, 4; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22, 38,-30, 14, 0,-13, 2, 0,-20,-30,-15,-12,-20,-10, -8, 27, 72,-22; /M: SY='S'; M= 7, -4,-18, -6, 0,-22, -8,-10,-22, 9,-24,-14, 2,-12, 2, 13, 15, 5,-12,-29,-16, 0; /M: SY='L'; M= 2,-13,-18,-17,-10, -7,-21,-18, -2, -7, 10, 2,-13,-18,-10, -8, -7, 8, 0,-23, -8,-10; /M: SY='E'; M= -9, 4,-28, 7, 11,-27,-17, -6,-16, -2,-20,-13, 3, 10, 8, -7, -2, -7,-18,-31,-19, 8; /M: SY='S'; M= 19, -3,-10, -7, -4,-18, -3,-14,-16,-10,-21,-16, 3,-10, -4,-13, 29, 19, -6,-33,-18, -4; /M: SY='R'; M= -8, 3,-19, 3, -4,-18,-16, -9,-15, 1,-17,-12, 4,-17, -4, 11, 5, 7, -5,-31,-14, -5; /M: SY='D'; M=-11, 6,-26, 9, 5,-26,-18, 8,-23, -1,-21,-12, 2, 4, 7, -4, 2, 5,-21,-30,-10, 5; /M: SY='D'; M= -1, 7,-22, 9, 0,-23,-14,-10,-17, 2,-15, -5, -1, -4, -3, -6, 0, 3,-12,-28,-14, -1; /M: SY='G'; M= 0, 6,-23, 0,-10,-25, 35,-10,-30,-12,-30,-20, 19,-18,-10,-12, 12, -5,-25,-30,-25,-10; /M: SY='S'; M= -3, -1,-19, -2, 4,-14, -7, -8,-12,-11, -6, -9, 4,-16, -3,-10, 6, 0,-13,-31,-15, 0; /M: SY='S'; M= 1, -4,-18,-10,-11,-13, 2, -9, -9,-14, -6, 0, 3,-18, -8,-12, 5, -1, -9,-29,-15, -9; /M: SY='E'; M=-11, 13,-25, 19, 27,-25,-18, -3,-21, 1,-15, -8, 2, -7, 8, -5, 0, -1,-19,-31,-15, 17; /M: SY='D'; M= -9, 16,-23, 17, 14,-26,-12, 15,-26, -1,-24,-15, 16,-12, 11, -3, 9, 0,-24,-34,-12, 12; /M: SY='E'; M= -2, -2,-20, -6, 4,-14,-21,-13, 0, -8, -7, -6, 0,-14, -6,-12, 0, 3, 1,-29,-13, -2; /M: SY='A'; M= 20, -6,-19, -9, 6,-22,-11,-14,-16, 8,-13, -9, -7,-10, -1, -3, 0, -5, -9,-22,-16, 2; /M: SY='L'; M=-10,-21,-20,-23,-15, 2,-27,-17, 7,-17, 28, 10,-20,-25,-14, -4,-18, 1, 4,-22, -3,-15; /M: SY='L'; M= -9,-25,-23,-25,-19, 0,-11,-19, 5,-24, 30, 10,-22,-27,-18,-14,-23,-12, 0,-20, -6,-19; /M: SY='H'; M=-11,-15,-25,-16,-14,-13, -8, 13, -9,-12, -3, 1, -8,-23, -9, -1,-12,-13, -5,-24, -3,-14; /M: SY='H'; M= -8, 1,-21, -5, -2,-18,-13, 18,-10, -5,-12, 10, 8,-16, 12, -3, 2, -4,-14,-29, -6, 4; /M: SY='V'; M= -4, -9,-14,-15,-17, 7,-17,-15, 2,-16, -8, -5, 0,-23,-19,-14, 4, 3, 9,-26, -6,-17; /M: SY='F'; M=-13,-30,-23,-36,-26, 29,-33,-23, 23,-30, 28, 14,-24,-27,-26,-23,-24,-10, 13,-11, 9,-26; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 55 in 55 different sequences |
| Number of true positive hits | 55 in 55 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Version [info] | 2 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
55 sequences
VME1_BC133 (Q0Q4E7), VME1_BC279 (Q0Q472), VME1_BC512 (Q0Q463), VME1_BCHK3 (Q3LZX9), VME1_BCHK4 (A3EXA0), VME1_BCHK5 (A3EXD6), VME1_BCHK9 (A3EXG9), VME1_BCRP3 (Q3I5J2), VME1_CVBEN (Q91A23), VME1_CVBF (P69703), VME1_CVBLS (P69599), VME1_CVBLU (Q8V433), VME1_CVBLY (Q9QAR9), VME1_CVBM (P69704), VME1_CVBOK (P69600), VME1_CVBQ (P69705), VME1_CVCAI (P36299), VME1_CVCBG (Q7T6S9), VME1_CVH22 (P15422), VME1_CVHN1 (Q5MQC7), VME1_CVHN2 (Q14EA7), VME1_CVHN5 (Q0ZME4), VME1_CVHNL (Q6Q1R9), VME1_CVHOC (Q01455), VME1_CVM2 (Q9JEB4), VME1_CVMA5 (P03415), VME1_CVMJH (P08549), VME1_CVP67 (Q8BB24), VME1_CVPFS (P09175), VME1_CVPIA (Q8JSP5), VME1_CVPPU (P04135), VME1_CVPR8 (P33464), VME1_CVPRM (P24412), VME1_CVRNJ (Q9WCD1), VME1_CVRSD (Q9IKC7), VME1_CVTKE (P26021), VME1_FIPV (P25878), VME1_IBV41 (P69605), VME1_IBV6 (P05136), VME1_IBVB (P69601), VME1_IBVB2 (P11222), VME1_IBVBC (P69602), VME1_IBVBU (Q91QS9), VME1_IBVD1 (P69603), VME1_IBVDE (Q9J3N8), VME1_IBVG (Q910E2), VME1_IBVH1 (P69604), VME1_IBVH5 (P69607), VME1_IBVK (P12649), VME1_IBVM (P69606), VME1_MERS1 (K9N7A1), VME1_PEDV7 (P59771), VME1_PEDVB (P59770), VME1_SARS (P59596), VME1_SARS2 (P0DTC5)» more
|
| PDB [Detailed view] |
6 PDB
3I6G; 7VGR; 7VGS; 7Y96; 7Y9B; 8CTK |