Home  |  Contact
Entry: PS51927

General information about the entry

Entry name [info] COV_M
Accession [info] PS51927
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 07-OCT-2020 CREATED;
07-OCT-2020 DATA UPDATE;
07-OCT-2020 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51927
Associated ProRule [info] PRU01275

Name and characterization of the entry

Description [info] Coronavirus membrane (Cov-M) protein profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=229;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=224;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6182563; R2=0.0122128; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=769; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=318; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='M';  M=-10,-20,-20,-30,-20,  0,-20,  0, 20,-10, 20, 60,-20,-20,  0,-10,-20,-10, 10,-20,  0,-10;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
/M: SY='A';  M= 29, -2, -9,-10, -6,-17,  0,-12,-11, -8,-14,-11,  2, -9, -6,-13, 14,  4, -5,-22,-17, -6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-7;
/M: SY='N';  M= -1,  5,-11,  2, -1,-12,  3, -3,-12, -4,-16,-11, 12, -1, -2, -5,  9,  2,-12,-19,-12, -2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-7;
/M: SY='E';  M= -5,  8,-15, 11, 17,-15, -8,  0,-15,  5,-12,-10,  5, -4,  6,  5,  0, -4,-14,-16,-10, 11; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-7;
/M: SY='C';  M= -8, -2, 17, -1, -7,-21,-18,-16,-21,-12,-19,-17, -7,  6,-12,-16, -1,  3,-14,-32,-20,-11; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-7;
/M: SY='N';  M= -1,  7,-18,  1,  1,-18,-11, -5, -9, -5,-18,-11, 15,-17,  0, -7,  8,  1, -7,-33,-17,  1;
/M: SY='C';  M= -6, -4,  5, -9,-14, -9, -3, -6,-20,-14,-20,-15,  3,-23,-12,-14,  4,  1,-15,-22,  0,-14;
/M: SY='C';  M= -7,  0, 19, -5,-10,-19,-23,-18,-16,-14,-14,-13, -4,-19,-10,-16,  4, 15, -7,-36,-16,-10;
/M: SY='W';  M=-15,-21,-28,-29,-24, 23,-25,-19,  4,-23,  6, -1,-14,-27,-22,-19,-22,-13, -5, 24, 12,-21;
/M: SY='T';  M= -8, 12,  2, 10,  5,-21,-17,-11,-23, -7,-19,-18,  7,-14, -5,-10,  7, 14,-15,-36,-18,  0;
/M: SY='T';  M=  5,-15,-16,-21,-16,  3,-12,-19, -7,-11, -6, -6,-11,-19,-17, -6,  0,  6,  3,-18, -6,-16;
/M: SY='G';  M= -8, 11,-30, 19, 17,-32, 21, -9,-37, -5,-27,-22,  5,-11, -2,-11,  0,-14,-30,-28,-24,  8;
/M: SY='D';  M=-14, 25,-30, 38, 36,-36,-16,  2,-32,  6,-24,-21,  9, -6, 19, -2,  0,-10,-30,-32,-18, 27;
/M: SY='L';  M=  7,-20,-17,-24,-16, -4,-19,-20, 10,-22, 17,  6,-17,-20,-14,-20, -6, -2,  7,-24, -8,-16;
/M: SY='V';  M= -6,-25,-22,-29,-24, -5,-33,-27, 29,-13,  8, 11,-21,-22,-19,-16,-14, -6, 30,-24, -6,-24;
/M: SY='W';  M=-11, -9,-32, -9,  8,-18,-20,-10,-22,  5,-20,-12,-11,-14, 12,  0, -9, -6,-24, 23, -1, 11;
/M: SY='H';  M=-16,-18,-24,-21,-15, 14,-26, 26, -4,-22, 14,  8,-12,-26,-13,-12,-20,-14, -8,-17, 15,-15;
/M: SY='L';  M=-12,-30,-20,-32,-22, 23,-30,-20, 16,-30, 43, 16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,  8,-14,  6,-22;
/M: SY='K';  M=  6, -1,-25, -2, 13,-27,-15,-11,-25, 27,-23,-12, -3, -8,  6, 12, -3, -7,-16,-22,-14,  9;
/M: SY='E';  M=-10, 21,-26, 17, 28,-27,-11,  6,-24,  6,-24,-17, 26,-10, 18,  2,  4, -6,-30,-33,-18, 23;
/M: SY='W';  M=-20,-36,-46,-36,-28, 14,-22,-21,-16,-18,-16,-16,-36,-30,-18,-18,-36,-26,-26,128, 39,-20;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='F';  M=-17,-30,-20,-37,-27, 56,-30,-20,  7,-30, 24,  7,-23,-30,-33,-20,-23,-10,  3,  0, 20,-27;
/M: SY='S';  M=  1,-12,-15,-14,-13,  0,  0,-17,-11,-17,-16,-11, -4,-18,-15,-15, 15,  5, -2,-26,-11,-13;
/M: SY='W';  M=-14,-34,-36,-38,-28,  7,-29,-28, 13,-26, 10,  3,-31,-27,-20,-23,-31,-19,  0, 53, 13,-23;
/M: SY='G';  M=  1,  2,-19, -3,-10,-22, 24,-13,-26,-12,-26,-18, 12,-15,-10,-12, 16,  7,-19,-30,-22,-10;
/M: SY='V';  M=  3,-26,-18,-33,-26,  9,-28,-27, 25,-23, 10,  8,-21,-23,-25,-23,-11, -5, 26,-18, -2,-26;
/M: SY='I';  M=-12,-30,-27,-38,-28, 16,-37,-27, 36,-30, 23, 16,-22,-23,-24,-27,-22,-10, 21,-14,  6,-28;
/M: SY='L';  M=-12,-30,-20,-32,-22, 21,-30,-20, 17,-30, 44, 17,-28,-30,-23,-20,-28,-10,  8,-15,  5,-22;
/M: SY='L';  M= -8,-25,-21,-30,-21,  4,-31,-23, 24,-27, 33, 15,-23,-24,-18,-21,-20, -1, 14,-22, -2,-21;
/M: SY='F';  M= -3,-27,-20,-35,-27, 30,-28,-24, 17,-25, 10,  6,-20,-24,-28,-23,-14, -7, 15, -9,  8,-27;
/M: SY='F';  M=-16,-32,-27,-38,-28, 38,-31,-24, 12,-28, 15,  5,-25,-28,-29,-22,-25,-13,  4, 20, 18,-27;
/M: SY='I';  M= -6,-18,-22,-28,-22, -4,-32,-26, 25,-22,  8,  8,-12,-16,-16,-22, -4, 15, 18,-24, -4,-22;
/M: SY='I';  M= -6,-20,-20,-29,-23, -3,-30,-22, 26,-20, 10, 17,-16,-19,-16,-20, -8,  8, 22,-24, -4,-21;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-23,-36,-28,  2,-36,-28, 40,-27, 22, 17,-24,-24,-23,-26,-19, -7, 32,-23, -3,-28;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='F';  M=-20,-25,-25,-31,-25, 57,-30, -2,  0,-21,  5,  0,-20,-30,-26,-15,-20,-10, -5, 19, 53,-25;
/M: SY='G';  M=  8,-10,-27,-12,-18,-28, 59,-20,-35,-18,-27,-18, -2,-18,-18,-20,  2,-17,-25,-20,-28,-18;
/M: SY='Y';  M=-20,-14,-30,-14,-11,  9,-26, 27,-13,  1, -9, -3,-10,-26, -1, 13,-16,-12,-16,  7, 46,-11;
/M: SY='P';  M=  5,-10,-21,-12, -7,-13,-15,-12,-13,-10,-17,-13, -9, 14, -8,-15,  7, 10,-11,-20, -5,-10;
/M: SY='Q';  M= -4,  6,-20,  1,  5,-25,-12, -3,-20,  6,-24,-11, 12,-12, 16,  3, 13,  9,-18,-30,-14, 11;
/M: SY='R';  M=-20,-17,-27,-20,-11, 15,-24, -2,-17,  7, -9, -6, -9,-24, -7, 33,-14,-10,-13, -4, 15,-11;
/M: SY='S';  M=  7,  6,-12,  3,  0,-20,  0, -7,-20, -8,-30,-20, 18,-12,  0, -8, 35, 17,-13,-40,-20,  0;
/M: SY='W';  M=-16,-19,-33,-21,-11, -9,-20,-10,-16, 11,-13,  3,-15,-21,  0, 20,-20,-15,-16, 26,  3, -6;
/M: SY='F';  M=-16,-29,-20,-36,-26, 58,-29,-20,  4,-29, 18,  4,-21,-29,-33,-20,-20, -9,  2,  0, 20,-26;
/M: SY='V';  M= -7,-30,-18,-34,-28, 14,-33,-27, 29,-26, 19, 13,-26,-27,-27,-23,-17, -6, 31,-20,  0,-28;
/M: SY='Y';  M=-19,-20,-20,-21,-21, 27,-30, 17, -2,-11, -1, -1,-20,-31,-11,-11,-19,-10,-10, 25, 73,-21;
/M: SY='G';  M= -3,-21,-25,-25,-26,-13,  9,-26,  7,-23, -4,  1,-14,-22,-22,-23, -9,-12,  9,-22,-15,-26;
/M: SY='I';  M= -9,-30,-25,-36,-27,  3,-36,-27, 38,-29, 29, 19,-24,-24,-21,-26,-23, -9, 25,-21, -1,-27;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='M';  M=-10,-22,-20,-30,-20,  2,-22, -3, 20,-13, 25, 54,-22,-22, -3,-12,-22,-10, 10,-20,  0,-12;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-22,-34,-26,  4,-34,-26, 34,-28, 31, 18,-26,-26,-22,-24,-23, -8, 25,-22, -2,-26;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-22,-37,-30, 13,-35,-28, 35,-27, 15, 13,-23,-25,-27,-25,-17, -7, 32,-19,  1,-30;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-20,-30,-20,  7,-27,-15, 20,-25, 42, 31,-27,-27,-15,-17,-27,-10, 10,-20,  0,-17;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='L';  M=-10,-28,  6,-30,-22,  4,-30,-22, 11,-30, 37, 13,-28,-32,-22,-22,-26,-10,  6,-26, -6,-22;
/M: SY='L';  M=-12,-28,-20,-32,-22, 21,-28,-15, 16,-25, 36, 25,-26,-28,-19,-18,-26,-10,  8,-14,  6,-20;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-20,-32,-24,  6,-32,-24, 29,-28, 35, 18,-28,-28,-22,-22,-24, -8, 23,-22, -2,-24;
/M: SY='T';  M= -2, -5,-12,-13,-17, -8,-21,-19,  5,-12, -5, -3, -2,-20,-17,-12,  5, 19, 16,-32,-12,-17;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-24,-34,-24,  6,-34,-24, 32,-30, 38, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 18,-20,  0,-24;
/M: SY='A';  M= 37,-15,-13,-24,-15,-15, -8,-22,  2,-14, -4, -4,-13,-13,-13,-22,  4, -2,  8,-21,-16,-15;
/M: SY='L';  M= -8,-28,  5,-30,-23,  3,-30,-23, 14,-28, 31, 12,-28,-32,-23,-22,-23, -8, 14,-27, -7,-23;
/M: SY='T';  M= -2, -8, -6,-15,-15, -1, -3,-19,-17,-17,-14,-12, -3,-17,-17,-15, 11, 18, -8,-25,-10,-15;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-23,-37,-30,  0,-37,-30, 43,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 37,-23, -3,-30;
/M: SY='F';  M=-17,-30,-22,-38,-28, 54,-32,-22, 12,-30, 18,  7,-22,-28,-33,-22,-22,-10,  7,  0, 20,-28;
/M: SY='N';  M=  2, 26,-18, 18,  1,-23, -2,  0,-21, -3,-27,-20, 33,-15, -2, -7, 14,  2,-21,-37,-20,  0;
/M: SY='C';  M= 18,-13, 43,-23,-18,-18,-15,-24,-18,-18,-14,-14,-13,-22,-18,-23,  3,  4, -4,-34,-23,-18;
/M: SY='Y';  M=-10,-29,-25,-31,-27, 10,-30,-16, 18,-19,  4,  4,-27,-28,-21,-19,-19, -9, 18, 16, 23,-26;
/M: SY='Y';  M= -2,-15,-22,-17,-14, 11,-19,  5, -4,-11, -4, -4,-13,-23, -9,-12, -4, -2, -7,  5, 39,-14;
/M: SY='E';  M=  2,  1,-26,  1, 14,-25,-12, -7,-22,  3,-21,-16,  3,  8,  3,  3,  0, -6,-22,-28,-20,  7;
/M: SY='Y';  M=-14,-27,-33,-27,-19,  6,-28,-12,  6,-19,  6,  1,-25, -6,-15,-19,-24,-13, -6, 18, 21,-20;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='N';  M=-13, 26,-23, 12,  0,-20, -5,  7,-23,  8,-27,-17, 44,-20,  3, 19,  5, -3,-27,-35,-17,  0;
/M: SY='W';  M=-14, -9,-30,-15,-17,  5,-18, -5,-13,-11,-15,-13, -5,-24,-11,-11,-12, -3,-19, 41, 25,-14;
/M: SY='V';  M=  8,-23,-14,-25,-25, -9, -7,-27, 11,-18,  0,  1,-21,-25,-25,-20, -5, -4, 28,-27,-15,-25;
/M: SY='Y';  M=-10,-16,-22,-22,-20, 12, -7, -5, -4,-15,  0, 11,-13,-22,-14,-13,-10, -2, -5, -6, 16,-17;
/M: SY='F';  M=-10,-27,-20,-29,-24, 21,-14,-22,  6,-27, 20,  7,-22,-28,-27,-20,-19,-10,  7,-13,  2,-24;
/M: SY='G';  M=  8,-14,-23,-15,-20,-23, 41,-22,-22,-18,-20,-13, -7,-20,-20,-20,  0,-13,-11,-22,-25,-20;
/M: SY='F';  M= -4,-26,-19,-35,-26, 41,-26,-22,  9,-26, 11,  3,-19,-25,-29,-22,-15, -8,  7, -4, 12,-26;
/M: SY='S';  M= 24, -3,-10, -7, -3,-20,  0,-13,-17,-10,-23,-17,  3,-10, -3,-13, 30, 13, -7,-33,-20, -3;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-25,-38,-30, 12,-37,-28, 39,-28, 17, 15,-22,-23,-25,-27,-18, -8, 29,-17,  3,-30;
/M: SY='A';  M= 18,-21,-15,-27,-20, -7,-19,-24, 15,-19,  9,  5,-19,-19,-18,-22, -6, -3, 18,-22,-11,-20;
/M: SY='M';  M=-10,-21,-23,-27,-22, 12,  0,-14, -1,-21, 10, 17,-16,-24,-18,-17,-16,-13, -3,-13, -1,-19;
/M: SY='A';  M= 29, -6,-10,-16,-10,-16, -8,-20,-10,-10,-10,-10, -6,-10,-10,-16, 14, 21,  0,-24,-16,-10;
/M: SY='V';  M= -5,-26,  4,-32,-29, -4,-33,-29, 24,-24,  7,  7,-23,-27,-25,-24,-11, -2, 30,-30,-10,-29;
/M: SY='V';  M= -4,-25,-15,-29,-25, 12,-27,-25, 20,-22,  5,  5,-20,-25,-26,-20, -6,  0, 28,-23, -3,-25;
/M: SY='T';  M= 18, -8,-10,-16,-13,-12,-13,-21, -4,-12, -8, -7, -8,-13,-13,-15, 13, 23,  7,-27,-14,-13;
/M: SY='F';  M=-11,-25,  2,-32,-27, 15,-16,-24,  2,-28,  6,  1,-18,-28,-27,-24,-16,-12,  2,-17, -2,-27;
/M: SY='I';  M= -1,-28,-18,-31,-25,  2,-29,-26, 27,-25, 24, 14,-26,-26,-22,-22,-17, -6, 27,-23, -5,-25;
/M: SY='M';  M= -6,-20,-19,-25,-17, -1,-20, -9, 15,-17, 19, 32,-17,-21, -7,-14,-12, -4,  8,-24, -4,-12;
/M: SY='W';  M=-20,-38,-44,-40,-30, 23,-22,-28,-16,-22,-14,-16,-36,-30,-24,-20,-36,-26,-24,124, 30,-22;
/M: SY='I';  M= -7,-29,-21,-34,-27,  2,-33,-26, 36,-25, 21, 20,-25,-25,-22,-23,-18, -7, 32,-23, -3,-27;
/M: SY='M';  M= -3,-16,-19,-21,-18, -9, -2,-10,  4,-13,  1, 25,-13,-20, -8,-13, -5, -5,  6,-25,-10,-13;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='F';  M=-20,-32,-26,-40,-30, 67,-28,-22, -4,-28,  4, -4,-24,-30,-36,-20,-24,-14, -6, 36, 30,-28;
/M: SY='V';  M=  6,-27,-14,-30,-27, -3,-27,-28, 27,-20,  9,  9,-25,-25,-25,-22, -9, -2, 39,-27,-10,-27;
/M: SY='N';  M= -3, 11,-23,  2,  2,-24, -9,  2,-21,  8,-22,-12, 21,-17, 12, 18,  3, -5,-22,-28,-15,  6;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='I';  M=-12,-30,-25,-39,-30, 25,-36,-27, 32,-29, 16, 13,-21,-24,-27,-26,-19, -9, 22,-11,  9,-30;
/M: SY='R';  M=-17, -7,-30, -7,  5,-25,-20,  3,-27, 25,-20, -7,  0,-17, 24, 54, -7,-10,-23,-20,-10, 11;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='F';  M=-20,-27,-23,-35,-27, 66,-30, -9,  0,-25,  7,  0,-20,-30,-32,-17,-20,-10, -3, 15, 44,-27;
/M: SY='R';  M= -5,-13,-27,-17, -7,-17,-21,-12, -9, 14,-11, -3, -6,-17,  0, 25, -9, -8, -5,-20, -9, -7;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='T';  M=  6, -5, 14,-15,-14,-13,-19,-22,-14,-14,-12,-12, -5,-16,-14,-15, 13, 31, -2,-32,-15,-14;
/M: SY='R';  M=-13, -7,-30, -7, -2,-25,  0, -7,-32, 24,-25,-12,  0,-17,  3, 39, -8,-12,-22,-20,-15, -2;
/M: SY='S';  M=  8,  0,-10, -2, -2,-18, -3,-12,-18,-10,-27,-18,  8,-10, -2,-10, 37, 25, -8,-38,-18, -2;
/M: SY='W';  M=-18,-34,-38,-38,-28, 25,-22,-23, -9,-21, -7, -2,-32,-28,-21,-18,-32,-22,-17, 90, 25,-21;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='S';  M= 16, -2,-10, -3, -2,-20,  0,-12,-18,-10,-27,-18,  7,-10, -2,-12, 35, 17, -8,-37,-20, -2;
/M: SY='F';  M=-20,-32,-25,-40,-30, 69,-28,-22, -3,-28,  5, -3,-23,-30,-37,-20,-23,-13, -5, 32, 30,-28;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='T';  M=  2, -6,-11,-12,-12,-10,-19,-20, -4,-12,-10, -8, -3,-13,-12,-12, 18, 35,  7,-32,-12,-12;
/M: SY='N';  M= -9, 36,-20, 18,  0,-20, -1,  8,-20,  1,-30,-20, 54,-19,  0,  1, 11,  1,-28,-39,-20,  0;
/M: SY='A';  M= 27, -2,-16,-14,-11,-17, -6,-15, -3,-11,-10, -7,  4,-14, -9,-17,  5, -2, -2,-25,-17,-11;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-22,-34,-26,  4,-34,-26, 35,-28, 30, 18,-26,-26,-22,-24,-22, -8, 26,-22, -2,-26;
/M: SY='L';  M= -7,-19,-20,-23,-18, -3, -8,-15,  4,-21, 19, 17,-18,-23,-14,-16,-14, -3,  1,-22, -7,-16;
/M: SY='C';  M= -5, -8, 53,-16,-20,-17,-20,-20,-17,-20,-19,-15, -3,-30,-20,-20,  2, -1, -4,-43,-23,-20;
/M: SY='V';  M= -4,-25,-18,-31,-27, -2,-33,-28, 32,-23, 11, 11,-21,-23,-23,-23, -9,  4, 34,-26, -6,-27;
/M: SY='D';  M= -7,  6,-22,  9, -1,-19,-14,-11,-16,-10,-12,-13,  3,  2, -7,-13,  4,  6,-14,-33,-16, -5;
/M: SY='L';  M=  8,-22,-16,-27,-19, -2,-20,-17, 13,-18, 21, 19,-22,-22,-14,-18,-14, -6, 13,-22, -7,-17;
/M: SY='L';  M=-10,-14,-22,-16, -8, -8,-24,-14, -5,  2,  9,  3,-13,-20, -6,  8,-13,  1, -4,-22, -6, -8;
/M: SY='G';  M= -2, -1,-28, -4,-16,-28, 57,-14,-36,-16,-30,-20, 11,-20,-16,-16,  2,-16,-30,-24,-28,-16;
/M: SY='R';  M= -9, -5,-24, -8, -4,-22, -3, -8,-24,  5,-19,-10,  0,-15,  6, 19,  3,  7,-17,-23,-14, -1;
/M: SY='T';  M= -2,-10,-18,-15, -8,-14,-19,-11,  3,-10, -6,  6, -6,-15,  4,-10,  7,  8,  2,-28,-10, -3;
/M: SY='Y';  M=-15,-18,-27,-18,-14, 12,-28, 10,  1, -8, -2,  2,-18,-26,  0, -8,-15, -8, -4, 11, 49,-11;
/M: SY='V';  M= -5,-22, 11,-25,-25, -1,-28,-21,  8,-19,  0,  0,-22,-29,-24,-19, -7,  5, 22,-24,  0,-25;
/M: SY='R';  M=-14, -5,-25, -8, -2,-15,-19, -2,-13,  5, -3, -2,  3,-21,  8, 23,-10, -8,-15,-24, -9,  1;
/M: SY='P';  M=-12,-22,-36,-16, -6,-10,-22,-20,-16,-14,-23,-16,-20, 68,-16,-20,-12,-10,-24,-23,-19,-14;
/M: SY='L';  M=  1,-26,-22,-32,-22,  1,-28,-24, 26,-26, 28, 14,-23,-23,-18,-24,-19, -8, 16,-20, -4,-22;
/M: SY='I';  M=-11, -9,-28,-11,  0,-15,-27,-11, 12,-11,  2, 12,-10,-14,  5,-13,-11,-10,  1,-24, -7,  0;
/M: SY='E';  M= -7,  3,-30,  9, 32,-32,  5, -4,-31,  2,-23,-17,  0, -7, 15, -4,  0,-13,-30,-26,-21, 24;
/M: SY='S';  M=  7,  4,-15,  6, -3,-20,-10,-14,-13,-10,-18,-14,  1,-14, -8,-13, 15,  9, -1,-34,-17, -6;
/M: SY='P';  M=-10,-17,-31,-11,  0,-11,-24,-10, -8, -9,-14,-10,-19, 26, -9,-14,-11, -8,-11,-16,  0, -8;
/M: SY='T';  M= -8, -9,-22,-11, -8,-13,-22,  7,-12,-13, -6, -5, -6,  3, -7,-11,  0, 13,-11,-28, -5, -9;
/M: SY='G';  M=  0, -9,-19,-13,-18,-17, 17,-22,-16,-16,-15,-11, -5,-18,-18,-16,  7, 12, -5,-26,-19,-18;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-19,-33,-28,  2,-33,-28, 34,-25, 22, 15,-27,-27,-25,-23,-18, -5, 35,-25, -5,-28;
/M: SY='T';  M= -2, -7,-15,-14,-13,-10, -7,-20, -9,-15, -2, -6, -6,-15,-13,-13,  8, 28, -3,-27,-11,-13;
/M: SY='V';  M= 11,-20,-13,-22,-17, -6,-17,-21,  9,-19,  9,  3,-18,-22,-17,-18, -2,  1, 16,-27,-11,-17;
/M: SY='T';  M= -2, -9,-16,-13,-11,-12,-22,-22, -5,-12,-10, -9, -9,  5,-13,-13, 10, 31,  3,-30,-14,-13;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-26,-36,-26,  4,-36,-26, 37,-30, 33, 20,-24,-24,-20,-26,-24,-10, 21,-20,  0,-26;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-26,-36,-26,  4,-36,-26, 37,-30, 33, 20,-24,-24,-20,-26,-24,-10, 21,-20,  0,-26;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='R';  M= -5,  3,-20,  0,  0,-20, -8, -2,-24,  7,-26,-16, 15,-16,  4, 23, 15,  5,-18,-32,-16,  0;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='H';  M=-14,  1,-22, -7,-10,  1,-18, 33,-12,-13,-13, -4, 12,-23, -8, -7, -6,-10,-12,-25,  6,-10;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='Y';  M=-19,-18,-20,-19,-17, 19,-28, 13, -7, -5, -5, -3,-17,-29, -8,  2,-18,-10,-12, 17, 58,-17;
/M: SY='M';  M=  8,-20,  9,-28,-21, -9,-19,-18,  7,-17,  3, 15,-19,-23,-14,-20, -8, -6, 11,-27,-13,-18;
/M: SY='E';  M= -2, 11,-27, 17, 33,-32,-15, -1,-26,  5,-20,-15,  1, -5, 21, -3,  2, -8,-25,-28,-18, 27;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='H';  M=-15,-15,-26,-19,-11,  8,-27, 21, -3,-16, -3,  4, -8,-22, -2,-10,-12,-12, -7,-16, 12, -8;
/M: SY='K';  M=-10, -9,-30, -9, -1,-19,-17,-12,-27, 24,-27,-13, -6,-15,  3, 21, -7, -9,-20,  8, -4,  1;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-22,-32,-22,  7,-31,-20, 25,-28, 42, 24,-27,-27,-18,-21,-27,-10, 14,-20,  0,-21;
/M: SY='A';  M= 31,-10,-18,-16,-14,-24, 27,-20,-22,-14,-18,-14, -6,-14,-14,-20,  6, -8,-12,-20,-24,-14;
/M: SY='G';  M= -4, -4,-22, -7, -6,-22,  8,-13,-27,  5,-24,-14,  2,-14, -4,  8,  7,  6,-17,-25,-17, -6;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='G';  M= -2,-10,  0,-11,-18,-23, 41,-18,-31,-18,-23,-16, -3,-20,-18,-18, -2,-15,-21,-21,-24,-18; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='M';  M= -9,-20,  9,-24,-21,  8,-23,-10,  5,-17,  7, 11,-19,-25,-16,-15,-14, -7,  7,-14,  8,-19; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='D';  M= -6, 16,-21, 17, 16,-27,-11, -2,-24,  0,-24,-17, 14,-10, 12, -4, 13,  6,-22,-34,-17, 14;
/M: SY='I';  M= -9,-29,-29,-31,-23, -3,-32,-27, 24,-24, 11,  8,-25, -4,-20,-24,-20,-10, 14,-10, -5,-24;
/M: SY='D';  M= -8, 18,-25, 26, 14,-30,-12, 11,-31,  5,-26,-18, 10,-11,  4, -2,  4, -6,-23,-33,-12,  8;
/M: SY='D';  M=-17, 33,-27, 34,  8,-28, -9, 31,-31, -3,-27,-18, 31,-16,  3, -4,  1, -9,-30,-37, -9,  4;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='K';  M=  4, -1,-25, -1, 13,-28,-15,-11,-25, 30,-24,-12, -2, -8,  7, 14, -4, -8,-17,-22,-14, 10;
/M: SY='Y';  M=-18, -2,-30,  3,  0,  7,-25, 13,-12, -5, -9, -9, -9,-21, -3, -8,-13,-10,-17,  7, 45, -5;
/M: SY='I';  M= -6,-28,-19,-33,-28,  0,-31,-23, 35,-21, 16, 25,-24,-24,-20,-21,-16, -6, 34,-24, -4,-25;
/M: SY='T';  M= -6,-11,-15,-21,-16,  9,-22,-15,  0,-14,  2, 11, -9,-16,-13,-12,  2, 23,  3,-20,  0,-14;
/M: SY='V';  M= -1,-30,-12,-31,-30,  0,-31,-30, 32,-21, 11, 11,-29,-29,-29,-21,-11, -1, 48,-29, -9,-30;
/M: SY='A';  M= 39,-12, 14,-22,-14,-20, -6,-22,-14,-14,-12,-12,-12,-16,-14,-22,  6, -2, -2,-26,-22,-14;
/M: SY='T';  M= -4,-10,-16,-14,-10, -9,-23,-19, -3, -2, -1, -1,-10,-17,-10, -4,  0, 18,  5,-26, -8,-10;
/M: SY='P';  M= -4,-19,-28,-13, -7,-22,-19,-21, -9,-12,-21,-13,-17, 47,-13,-18, -2, -3, -9,-32,-24,-13;
/M: SY='S';  M= -2,  6,-17,  8,  1,-22, -9, -9,-21, -2,-24,-17,  7,-13, -1,  2, 20, 11,-11,-35,-17, -1;
/M: SY='R';  M=-14, -5,-24, -8, -3,-17,-20, 16,-24,  8,-17, -8,  2,-17,  4, 29,  0,  7,-16,-25, -3, -3;
/M: SY='T';  M= -8,-14,-18,-18,-12, -4,-24,-16, -2,-10, 11,  2,-12,-20,-10,  1, -5, 16,  0,-24, -6,-12;
/M: SY='I';  M= -7,-11, -2,-20,-19, -9,-24,-19, 12,-21, -1,  0, -1,-22,-15,-20, -4, -3,  5,-31,-11,-19;
/M: SY='I';  M= -7,-22,-20,-27,-24,  3,-31,-20, 23,-19,  7,  7,-18,-22,-19,-19, -8,  6, 22,-17,  8,-24;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='K';  M= -6, -2,-21, -5,  1,-21,-17,-11,-23, 21,-23,-12,  2,-12,  3, 20,  6, 11,-13,-26,-12,  1;
/M: SY='L';  M=-14,-21,-24,-22,-12, -3,-24, -9,  1, -3, 18, 16,-17,-24, -5, 16,-21,-10, -1,-20, -4,-11;
/M: SY='V';  M=  4,-22,-16,-23,-25,-11,  4,-26,  5,-19, -4, -1,-19,-25,-25,-20, -5, -6, 21,-26,-17,-25;
/M: SY='G';  M=  2,-13,-24,-17,-13, -5, 19,-14,-22,-15,-16,-10, -6,-19, -8,-14, -3,-13,-18,-13,-11,-10;
/M: SY='K';  M= -8, -8,-24, -8,  0,-18,-19,-11,-17, 19,-10, -5, -5,-16,  2, 18, -6, -5,-12,-23, -9,  0;
/M: SY='Q';  M=-11,  8,-27, 12,  8,-22,-16,  3,-23,  8,-22,-12,  2,-14, 15,  2,  1, -5,-21,-18,  3, 11;
/M: SY='R';  M= -9,-15,-21,-17,-10, -8,-24,-15, -3,  2,  4,  1,-13,-21, -8, 11,-10,  3,  3,-23, -7,-10;
/M: SY='K';  M= -6, -7,-24,-12,-13,-17, -6,-17, -4,  1,-13, -4, -1,-20,-11, -5, -7, -8,  1,-25,-14,-13;
/M: SY='G';  M= 11,  8,-20, 10, -2,-28, 14,-13,-27,-10,-25,-20,  5,-12, -8,-15, 12, -3,-17,-30,-22, -5;
/M: SY='Q';  M= -5,  7,-21,  8,  6,-28, -8, -5,-22, -2,-22,-12,  5,-11, 16, -4, 12, 10,-19,-29,-15, 11;
/M: SY='S';  M= -1, 12,-15, 10, -1,-19, -9, -9,-17, -8,-22,-17, 14,-13, -5, -9, 20, 18,-10,-37,-17, -3;
/M: SY='S';  M= 19, -5,-14, -7, -6,-22, 13,-15,-21,-12,-25,-17,  3,-12, -6,-15, 24,  7,-11,-31,-22, -6;
/M: SY='G';  M= -2,  3,-20, -4,-12,-20, 19,-14,-24,-12,-21,-16, 11,-16,-12,-12, 10, 14,-17,-28,-20,-12;
/M: SY='G';  M=-10,-16,-26,-20,-18, 13, 15,-18,-23,-11,-14,-10, -8,-22,-22,-11,-10,-14,-16, -8, -3,-18;
/M: SY='W';  M=  9,-21,-31,-25,-15, -9,-12,-22,-18, -3,-18,-14,-21,-19,-11,-11,-15,-15,-16, 53,  3,-11;
/M: SY='A';  M= 18,-18,-14,-22,-16,-12,-15,-20,  2, -6, -4, -2,-16,-19,-14, -3, -1, -2, 15,-24,-14,-16;
/M: SY='Y';  M=-20,-23,-27,-27,-23, 47,-30,  6,  0,-17,  3,  0,-20,-30,-20,-13,-20,-10, -7, 23, 63,-23;
/M: SY='Y';  M= -1,-11,-20,-16,-17,  6,-20,  0,  2,-11, -4, -3, -7,-25,-13,-12, -7, -4,  2, -4, 25,-17;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='V';  M=  0,-13, -6,-15,-15, -2,-16,-16, 11,-10,  2,  2,-13,-15,-15,-10, -1,  9, 21,-18, -6,-15; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='R';  M=-15, -9,-28,-11, -1, -7,-22, -9,-24, 29,-19, -8, -4,-17,  1, 33,-12,-10,-16,-14, -3, -1;
/M: SY='S';  M=  2,-13,-13,-13,-13, -5,-15,-12,  0,-13,-12, -7, -8,-20,-12,-13, 13,  8, 10,-25,  0,-13;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='K';  M=-10, -2,-24, -2,  7,-23,-16, -7,-24, 38,-23, -8,  0,-10,  8, 31, -8, -8,-16,-16, -8,  7; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
/M: SY='V';  M=  9,-14,-14,-19,-14, -9,-16, -2,  8,-14,  0,  3,-11,-16,-11,-15, -4, -5, 12,-20, -5,-14; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='G';  M=  0, -8,-24, -8,-16,-24, 57,-16,-33,-16,-24,-16,  0,-16,-16,-16,  0,-16,-24,-16,-24,-16; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='D';  M=-12, 37,-21, 38,  9,-25, -4,  4,-25,  0,-24,-21, 32,-12,  0, -4,  4, -4,-24,-33,-16,  4; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='Y';  M=-20,-22,-28,-23,-22, 38,-30, 14,  0,-13,  2,  0,-20,-30,-15,-12,-20,-10, -8, 27, 72,-22;
/M: SY='S';  M=  7, -4,-18, -6,  0,-22, -8,-10,-22,  9,-24,-14,  2,-12,  2, 13, 15,  5,-12,-29,-16,  0;
/M: SY='L';  M=  2,-13,-18,-17,-10, -7,-21,-18, -2, -7, 10,  2,-13,-18,-10, -8, -7,  8,  0,-23, -8,-10;
/M: SY='E';  M= -9,  4,-28,  7, 11,-27,-17, -6,-16, -2,-20,-13,  3, 10,  8, -7, -2, -7,-18,-31,-19,  8;
/M: SY='S';  M= 19, -3,-10, -7, -4,-18, -3,-14,-16,-10,-21,-16,  3,-10, -4,-13, 29, 19, -6,-33,-18, -4;
/M: SY='R';  M= -8,  3,-19,  3, -4,-18,-16, -9,-15,  1,-17,-12,  4,-17, -4, 11,  5,  7, -5,-31,-14, -5;
/M: SY='D';  M=-11,  6,-26,  9,  5,-26,-18,  8,-23, -1,-21,-12,  2,  4,  7, -4,  2,  5,-21,-30,-10,  5;
/M: SY='D';  M= -1,  7,-22,  9,  0,-23,-14,-10,-17,  2,-15, -5, -1, -4, -3, -6,  0,  3,-12,-28,-14, -1;
/M: SY='G';  M=  0,  6,-23,  0,-10,-25, 35,-10,-30,-12,-30,-20, 19,-18,-10,-12, 12, -5,-25,-30,-25,-10;
/M: SY='S';  M= -3, -1,-19, -2,  4,-14, -7, -8,-12,-11, -6, -9,  4,-16, -3,-10,  6,  0,-13,-31,-15,  0;
/M: SY='S';  M=  1, -4,-18,-10,-11,-13,  2, -9, -9,-14, -6,  0,  3,-18, -8,-12,  5, -1, -9,-29,-15, -9;
/M: SY='E';  M=-11, 13,-25, 19, 27,-25,-18, -3,-21,  1,-15, -8,  2, -7,  8, -5,  0, -1,-19,-31,-15, 17;
/M: SY='D';  M= -9, 16,-23, 17, 14,-26,-12, 15,-26, -1,-24,-15, 16,-12, 11, -3,  9,  0,-24,-34,-12, 12;
/M: SY='E';  M= -2, -2,-20, -6,  4,-14,-21,-13,  0, -8, -7, -6,  0,-14, -6,-12,  0,  3,  1,-29,-13, -2;
/M: SY='A';  M= 20, -6,-19, -9,  6,-22,-11,-14,-16,  8,-13, -9, -7,-10, -1, -3,  0, -5, -9,-22,-16,  2;
/M: SY='L';  M=-10,-21,-20,-23,-15,  2,-27,-17,  7,-17, 28, 10,-20,-25,-14, -4,-18,  1,  4,-22, -3,-15;
/M: SY='L';  M= -9,-25,-23,-25,-19,  0,-11,-19,  5,-24, 30, 10,-22,-27,-18,-14,-23,-12,  0,-20, -6,-19;
/M: SY='H';  M=-11,-15,-25,-16,-14,-13, -8, 13, -9,-12, -3,  1, -8,-23, -9, -1,-12,-13, -5,-24, -3,-14;
/M: SY='H';  M= -8,  1,-21, -5, -2,-18,-13, 18,-10, -5,-12, 10,  8,-16, 12, -3,  2, -4,-14,-29, -6,  4;
/M: SY='V';  M= -4, -9,-14,-15,-17,  7,-17,-15,  2,-16, -8, -5,  0,-23,-19,-14,  4,  3,  9,-26, -6,-17;
/M: SY='F';  M=-13,-30,-23,-36,-26, 29,-33,-23, 23,-30, 28, 14,-24,-27,-26,-23,-24,-10, 13,-11,  9,-26;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2020_05 which contains 563'552 sequence entries.


Total number of hits 55 in 55 different sequences
Number of true positive hits 55 in 55 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
55 sequences

VME1_BC133  (Q0Q4E7    ), VME1_BC279  (Q0Q472    ), VME1_BC512  (Q0Q463    ), 
VME1_BCHK3  (Q3LZX9    ), VME1_BCHK4  (A3EXA0    ), VME1_BCHK5  (A3EXD6    ), 
VME1_BCHK9  (A3EXG9    ), VME1_BCRP3  (Q3I5J2    ), VME1_CVBEN  (Q91A23    ), 
VME1_CVBF   (P69703    ), VME1_CVBLS  (P69599    ), VME1_CVBLU  (Q8V433    ), 
VME1_CVBLY  (Q9QAR9    ), VME1_CVBM   (P69704    ), VME1_CVBOK  (P69600    ), 
VME1_CVBQ   (P69705    ), VME1_CVCAI  (P36299    ), VME1_CVCBG  (Q7T6S9    ), 
VME1_CVH22  (P15422    ), VME1_CVHN1  (Q5MQC7    ), VME1_CVHN2  (Q14EA7    ), 
VME1_CVHN5  (Q0ZME4    ), VME1_CVHNL  (Q6Q1R9    ), VME1_CVHOC  (Q01455    ), 
VME1_CVM2   (Q9JEB4    ), VME1_CVMA5  (P03415    ), VME1_CVMJH  (P08549    ), 
VME1_CVP67  (Q8BB24    ), VME1_CVPFS  (P09175    ), VME1_CVPIA  (Q8JSP5    ), 
VME1_CVPPU  (P04135    ), VME1_CVPR8  (P33464    ), VME1_CVPRM  (P24412    ), 
VME1_CVRNJ  (Q9WCD1    ), VME1_CVRSD  (Q9IKC7    ), VME1_CVTKE  (P26021    ), 
VME1_FIPV   (P25878    ), VME1_IBV41  (P69605    ), VME1_IBV6   (P05136    ), 
VME1_IBVB   (P69601    ), VME1_IBVB2  (P11222    ), VME1_IBVBC  (P69602    ), 
VME1_IBVBU  (Q91QS9    ), VME1_IBVD1  (P69603    ), VME1_IBVDE  (Q9J3N8    ), 
VME1_IBVG   (Q910E2    ), VME1_IBVH1  (P69604    ), VME1_IBVH5  (P69607    ), 
VME1_IBVK   (P12649    ), VME1_IBVM   (P69606    ), VME1_MERS1  (K9N7A1    ), 
VME1_PEDV7  (P59771    ), VME1_PEDVB  (P59770    ), VME1_SARS   (P59596    ), 
VME1_SARS2  (P0DTC5    )
» more


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission