Home  |  Contact
Entry: PS51947

General information about the entry

Entry name [info] NIRAN
Accession [info] PS51947
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 10-FEB-2021 CREATED;
10-FEB-2021 DATA UPDATE;
02-JUN-2021 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51947
Associated ProRule [info] PRU01292

Name and characterization of the entry

Description [info] Nidovirus RdRp-associated nucleotidyl transferase (NiRAN) domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=224;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=219;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2497869; R2=0.0103099; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=801; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=510; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D';  M= -9,  6,-23, 19, -7,  4,-17,-14, -9, -9, 13, -9, -9,-21,-15,-12, -5, -4, -2,-15, 19,-12;
/M: SY='F';  M=  2,-15,-16,-20,-17, 22,-20,-14, 15,-10, 21, 13,-12,-32,-17,-12,-12, -1, 15,-22, 10,-17;
/M: SY='N';  M=  0, 26,-18,  5, -6,-13, 11,-15, -5,  6,-20,  1, 52,-19,-10,-14,  0,  2,-22,-48,-33, -8;
/M: SY='R';  M= -6,-14,-20,-10, -3,-15, -6, -8,-17,  0,-10, -7,-18,  7, 18, 27,-11,-14,-17, -9, -3,  2;
/M: SY='I';  M= -5,-16, 19,-17,-15,  8,-27,-24, 22,-22, 22,  6,-18,-34,-24,-16,-16,  1, 21,-24,  8,-16;
/M: SY='R';  M= -6,-14,-12, -7,  5,-12,-20, -7,-21,  6, -9,  0,-17, -9, 27, 44,-10,-20,-12, -6,  0, 11;
/M: SY='G';  M= 13, -1,-35, -7, -9,-27, 44,-23, -8, -6,-17,-10, -1, -9,  1,-11,  2, -9,-18,-10,-31, -7;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='V';  M= 13, -7,-17,-11,-13, -4,-12,-17, 18,-10,  8,  8, -5,-18, -8,-15, -1, 10, 19,-33, -8,-12; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='W';  M=-12,-15,  9,-16, -7, -2,-12,-24, -5,-15,  3, -7,-18,-20,-13,-15, -1,  1, -6, 14,  4, -9;
/M: SY='V';  M=  1,-11,-14, -9,-12,  4,-16,-15,  8, -9,  4, -1,-14,-23,-12,  1,  3,  4, 11,-23,  5,-14;
/M: SY='A';  M= 25, 14,-29, 25,  3,-27, -3,-19,-12,  0,-11, -5,  3,-10,  2,-10, 11,  6, -1,-44,-29, -1;
/M: SY='T';  M=  7, -7, 11,-10, -2,-24,-15,-20,-10, -7,-10,-10, -4,  8, -3,-17,  8, 15, -6,-39,-29, -4;
/M: SY='R';  M=  0,-12,-22, -6,  4,-19,-16, 13,-21,  4,-15,  1,-11, -4, 16, 28,  1,-15,-13,-21,-12,  6;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='H';  M=  2, -7,-21,-11, -7,-12,  3, 16,  4, -8, -3,  4, -2, -5, -4,-10, -2, -5, -2,-20,-11, -7; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='F';  M=-13,-16, -9,-23,-19, 45,-23,-16, 14,-17, 34,  7,-17,-33,-23,-17,-17, -6, 10,-11, 30,-19;
/M: SY='C';  M=-11, -1, 48, -1,  9,-28,-23,-23,-15, -9, -9,-18,  1, -2,-11,-15,-10, -8,-16,-31,-32,  1;
/M: SY='P';  M=-10,-17,-26,-17, -9, -1, -2, -9,-14, -1, -8,-20,-19, 30, -8, -2,-10,-10,-19,-11, -3,-12;
/M: SY='C';  M=-14, -7, 48, -8,  1, -5,-27,-27,-14,-15,  3,-14, -8,-23, -2, -8,-13,-12,-13,-16,-16,  0;
/M: SY='N';  M= 10,  8,-18, -4,-10,-14,-13,-15,  3, -6, -9,  0, 23,-17,  6,-12,  3, 19,  1,-47,-20, -4;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='G';  M=  7, -2,-26, -6,-11,-19, 22,-19, -8, -4,-13, -8, -1, -7, -3, -4,  8,  1,-10,-15,-20,-10; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='G';  M= 11, -3,-34, -7,-12,-24, 39,-24,-10, -4,-17, -7, -3,-10, -3, -1,  2,-12,-14,-11,-29,-10;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='Y';  M= -7, -7,-19, -6,-10,  1,  1, -8, -1, -7,  7, -2, -9, -9, -7, -9, -4,  2,  0,  2, 15, -9; D=-9;
/I:         I=-9; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19;
/M: SY='E';  M= -1,  2, 15,  7, 16,-23,-14,-11,-17, -1, -9,-12, -4, -5, 13, -1,  0, -5,-17,-15,-17, 14; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='T';  M= -3, -7,-22, -5, -7, -7,-11, -6, -7, -3, -3,-10, -8,  9, -3,-11,  8, 15, -3,-14,  6, -8; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='D';  M=  3, 12,-18, 22,  6,-17, -4,-11,-16,  6,-12,-11,  2, -4, -6, -4, 13,  2,-11,-23,-10, -2; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='H';  M=  1,-12,-21, -8, -4,-14,-13, 11, -8, -1,-10, -3,-12, 11,  3,  9, -4, -6, -5,-21, -8, -4; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='S';  M=  6,  3,-16,  9,  0,-13, -7,-10, -6, -2, -9,-12, -2,-10,  1, -3, 11,  7, -3,-21, -8, -3; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='R';  M=  0, -4,-14, -3,  1, -4, -7, -9, -8,  6, -7,  0, -5, -6, -1,  8,  8,  0, -7,-15, -4, -2; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='R';  M= -6,-12,-20, -8, -4,-11,-14, 21,-17,  0,-13,  1,-10, -4, 11, 29,  0,-13,-11,-13, -3, -1; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='G';  M=  1, -9,-30, -4, -1,-15,  9,-14,-14,  0, -7, -6,-12, -9,  3,  3, -3,-12,-10, -2, -4, -1;
/M: SY='F';  M= -9,-18,-19,-32,-27, 42,-22,-21, 16,-14, 22, -1, -8,-29,-21,-19, -8,  0, 16,-14, 16,-26;
/M: SY='D';  M= -7,  9,-32, 25,-12, -2,-20,-20,-13, -7,  5,-17, -5,-19,-15,-11, -4, -2,  3,-18, 15,-15;
/M: SY='I';  M=  6,-15,-18,-26,-22,  2,-13,-19, 41,-17, 18, 11, -6,-28,-17,-23, -9,  3, 31,-31, -5,-22;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='D';  M=  0,  0, -3,  6, -4,-12,-16,-18, -8, -9,  4, -6, -6,-15, -8,-14,  1,  6, -1,-25, -4, -7;
/M: SY='N';  M=  2, 15,-16,  0,-12,-10,  3,-14,  0, -6, -8, -3, 31,-19,-11,-20,  7, 14,-10,-44,-20,-11;
/M: SY='D';  M=  5, 19,-19, 27, 18,-27, -9,-15,-21, 15,-14, -3, 14, -4,  1, -6,  1, -6,-18,-35,-20, 10;
/M: SY='D';  M= -7, 11,-35, 24, -5, -9,-12,-11,-16, -3,  0,-13,  3,-16, -8, -8, -1, -1, -6,-16, 13, -9;
/M: SY='V';  M= 11, -3,-21, -9,-14, -1,-17,-23, 18, -4, -3,  4,  4,-26,-16, -9, -4,  7, 21,-39, -9,-16;
/M: SY='A';  M= 23,  0,-32, -2,  2,-19, 10,-22, -7,  9,-14,  8,  0, -5,  3, -6,  6,  0, -4,-33,-31, -1;
/M: SY='G';  M= -6,-11, -2,-21,-16,  4, 11,-26,  4,-13,  1,-11, -5,-22,-20,-18, -1, -8, -5, -9,-13,-19;
/M: SY='I';  M=  1,-18,-17,-30,-27,  6,-17,-21, 48,-20, 20,  9, -9,-33,-23,-23,-12,  3, 38,-28,  2,-27;
/M: SY='R';  M=  7, -9,-26,-10,-16,-14,  5,-21, -3, -5,-10, -3, -8,-14,  0, 10,  0, -3,  2,-18,-13,-12;
/M: SY='M';  M=-10, -9,-28, -7,  4,  0,-18,  7, -8,  9,  4, 16,-12, -5, -7, -2, -9, -9,-10,-16, 14,  0;
/M: SY='H';  M=-10,-21,-37,-24,-15,  0,-30, 60,  3,-19,  1,  8,-13,-13,-14,-10,-10,-10,  3,-36,  7,-15;
/M: SY='F';  M=  3,  0,-16, -9,-11, 13,-10,-15,  2, -6,  2, -3,  8,-23,-13,-14,  6,  6, -1,-31, -6,-13;
/M: SY='R';  M= -4, -8,-26, -4,  8,-10,-14,-16,-24, 28,-20, 12, -8,  2, 12, 39, -4,-18,-16,-12, -6,  6;
/M: SY='T';  M=  8, -2,-22, -8,-11,-13,-16,-19,  0, -1, -6, -1,  3, -5, -5,-18, 17, 30,  6,-39,-10, -9;
/M: SY='N';  M= -2, 14,-15, -6,-14,  2, -9, -8, -3,  3, -9,  7, 43,-30, -7, -2, -6, -1,-12,-44,-21,-12;
/M: SY='C';  M=  0, -9, 23,-18,-11, -3,-21,-28, -6,-12, -1, -9, -1,-16, -9,-19,  7, 13,  0,-31,-21,-11;
/M: SY='H';  M= -4,-14, -3,-20,-10,  3,-19,  8,  3,-14,  5,  2, -8,-18,-12,-15, -3, -5,  0,-29, -8,-12;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='R';  M=  1, -5,-12, -2, -2, -6, -5, -6,-11,  2,-12, -7, -5, -6,  4, 16, 11,  0, -6,-10, -7, -3; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='F';  M= -3,-14,-14,-22,-20, 26,-14,-16, 17, -9, 10, -3, -6,-22,-16, -9, -6, -3, 18, -8,  7,-20; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='P';  M= -2, -7, -8, -2, 14,-19,-10,  0,-16,  7,-11, -9,-10, 18, 17, 10, -4, -7,-17, -8, -8, 14; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='Y';  M= -7, -3,-18, -2, -6,  2, -8, -4, -7, -1, -2, -5,  0,-10, -1,  5,  2, -1, -3, -4,  9, -7; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='Q';  M=  2, -5, -4, -4,  9, -8,-13, -5, -1, -2,  1, -1, -8, -7, 12,  0, -6, -2, -3, -9,  0, 11; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='D';  M=  2, 18,-13, 23,  1,-16, -2, -8,-12,  0, -9,-11, 15, -9, -6, -7,  7,  3,-10,-26,-13, -3; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='G';  M= 14, -1,-30, -4,  0,-21, 18,-19,-10,  5,-17, -3, -1, -5,  5, -4,  7, -2,-14,-20,-25,  0;
/M: SY='R';  M=  0, -5,-29,  0,-11,  0,-15,-15,-13, -2, -3, -8, -7,-13,  0,  5,  5,  2,  0,-17,  3,-10;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='F';  M=-13,-26,-30,-38,-33, 51,-24,-23, 21,-14, 20, -7,-12,-35,-25,-15,-11, -9, 24, -2, 23,-33;
/M: SY='N';  M=  5,  6,-19, -3,-12,-15,-13, -5, 10,  2,  4, 18, 21,-32,-14,-12, -9,  3,  3,-42,-16,-13;
/M: SY='I';  M= -3,-19,-16,-28,-26, 22,-20,-21, 36,-19, 23,  6,-12,-34,-24,-20,-13,  0, 30,-22, 12,-26;
/M: SY='K';  M=  0,  0,-30,  0, 20,-10,-10,-20,-20, 40,-20, 20,  0, 10,  0, 10,  0,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='R';  M= -5,-10,-23, -3,-17,  6,-23,-20, -9, -2, -4, -8,-14,-22, -1, 28, -8,-15,  7,-13,  6,-14;
/M: SY='V';  M=  5,-14,  4,-20,-20, -7,-27,-24, 18,-14,  7,  5, -8,-28,-18,-16, -4, 16, 24,-34, -7,-18;
/M: SY='G';  M= -2,  3,  1,  2, -2,-25, 11,-26,-16, -1,-13,-11,  1, -8,-11,-13,  5, -3,-18,-19,-25, -6;
/M: SY='D';  M= -2, 11,-24, 25,  2,-26,-14,-13,-22,  4, -8,-11, -4,  8, -2, -1, -2,  0,-13,-31, -5, -2;
/M: SY='Q';  M= 11,  5,-15, 11, 17,-32,-15,-11,-17,  3, -9, -7, -1,  0, 21, -7,  5,  7,-13,-30,-18, 19;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='H';  M=-10,-15,-23,-17,-11, 15,-16, 19, -3, -4,  8,  6, -8,-13, -8, -3, -8, -8, -2, -4, 15,-11; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='E';  M=  7, 11, -5, 18, 34,-34,-13, -7,-22, 11,-11, -8,  5, -1, 11,-11,  2,-10,-20,-28,-25, 28;
/M: SY='F';  M= -8,-18,-28,-21,-16, 15,-20,  4,  6,-11, 12,  5,-14,-20, -8, -3,-10, -9,  7,-14, 14,-15;
/M: SY='A';  M=  4, -8,-23, -6,  4,-18, -6, -8, -9,  3,  1,  4, -7, -9,  1,-11, -1,  1, -6,-14, -4,  4;
/M: SY='R';  M=  1,-12,-23,-11,  1,-10,-18,-12,-10, 15,-11, 13,-10,-10, 12, 26, -8,-10, -5,-16, -4,  2;
/M: SY='T';  M= 14, -2,-18, -7, -9,-19,-18,-19,  1, -6, -2,  0,  2, -5,  0,-22, 12, 30, 10,-43,-13, -4;
/M: SY='C';  M=  5,-10, 19,-11,  4,-20,-16,-24, -8, -2,-10, -5, -9,  3, -5, -9, -4, -2, -5,-32,-31, -2;
/M: SY='Y';  M=-13,-17,-35,-16,-10, 14,-11,-14,-14,  2, -1, -7,-16,-13,  7, 13,-10,-14, -9, 10, 20, -7;
/M: SY='D';  M= -5,  8, -8, 12,  5, -5,-15,-12, -2, -2, 12,  6,  1,-17,-10,-14,-10, -4, -7,-28,  4,  1;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='P';  M= -2, -5,-17, -5,  0,-10,  4, -7, -7,  2, -7, -7, -9, 14, -7, -8,  0, -1,-13,-14, -7, -4; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='P';  M=  2, -9,-20, -9, -2, -5, -6, -5,-11,  2,-12,-17,-10, 25, -4, -7,  5,  3,-11,-20,-11, -7; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='I';  M=  5,-12,-14,-15,-18,  3,-14,-17, 26,-12,  5, -1, -8,-23,-17,-11,  0,  7, 26,-22, -1,-19; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='T';  M=  9, -9,-21,-13, -6,-14,-12,-12,  8, -7,  1,  1, -7,  2,  5,-14, -2, 10,  4,-34,-12, -4;
/M: SY='Q';  M=  0, -8,-14, -5, 18,-26, -6, -3,-17,  2,-10,-12,-14, 17, 23, -1, -8, -7,-26,-13,-10, 20;
/M: SY='H';  M=-17,-18,-39,-17,  0,-24,-26, 99,-15,-16, -5, 12,-14, 18, -3,-12,-12,-14,-25,-43,  2, -2;
/M: SY='D';  M= -1,  3,-10,  7, -4,-29, -2,  4, -9,-12, -6, -6, -1,-11, -9,-16, -4,-10,-10,-32,-22, -7;
/M: SY='F';  M=-12,-23,-26,-27,-22, 26,-23, -9,  6, -4, 18,  9,-14,-30,-11,  4,-15,-11,  9, -2, 22,-20;
/M: SY='F';  M=  0,-18,-20,-24,-13, 33,-24,-23,  5, -6,  8, -8,-11,-27,-15,-10, -5, -8, 14,-13,  6,-15;
/M: SY='N';  M=  7,  3,-21, -2, -4,-14,-10,-15,-10,  7,-14,  2, 12, -7,  3,  1, 10, 11, -6,-37,-18, -4;
/M: SY='F';  M= -5,-12,-33,-18,-10, 15,-20, 10, -8, -7,  0, -3, -1,-16,  6, -3, -7, -7, -7,-17,  6, -6;
/M: SY='D';  M= -4, 17, 10, 21,  4,-21,-13,-20,-16, -2, -7, -9, 14,-17,-12,-12,  0, -3,-15,-36,-20, -3;
/M: SY='G';  M=  1, -1,-26,  4, -4,-26, 15,-19, -8, -4,-12,-18, -9,  4,-13,-13, -4, -8,-11,-15,-15, -8;
/M: SY='D';  M=  2, 13,-19, 22, 12,-37, 11,-17,-22,  2,-11,-16,  1, -2, -2,-16,  3, -6,-21,-19,-19,  8;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='G';  M= -7, -7,-25, -5, -6, -5, 10,-11,-10,  3, -5, -4, -9, -5, -3,  7, -4,-11,-10,  7,  5, -6; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='W';  M=-20,-18,-27,-11,-12,  2,  3,-31,-17,-11,-10,-25,-30,-11,-15, -8,-14,-23,-14, 57, 15,-15;
/M: SY='F';  M=-16,-16,-29,-24,-23, 38,-25,  0,  4,-13, 15, -3, -6,-28,-19,-11,-12, -8,  6,-10, 25,-23;
/M: SY='I';  M= -2,-15,-10,-21,-20, 12,-20,-18, 36,-20, 27, 12,-15,-32,-22,-20,-15,  2, 28,-25, 14,-20;
/M: SY='I';  M=  3,-18,-20,-29,-23, 15,-17,-17, 29,-11, 18, 12, -7,-31,-18,-17,-10, -1, 24,-25,  0,-23;
/M: SY='R';  M=-10,-20,-20,-10,-10,-10,-20,-10,-30, 10,-20,  0,-20,-10, 30, 80,-10,-30,-10,  0,  0,  0;
/M: SY='R';  M=-11,-13,-32, -8, -6, -7, -1,-14,-21, 10,-12, -1,-15, -7,  7, 32, -7,-20,-13,  5,  6, -5;
/M: SY='H';  M=-12, -3,-36,  2, -5,-21,-19, 31,-17, -6, -7, -7, -2, 15, -4,-13, -5,  1,-17,-32,  3, -6;
/M: SY='H';  M= -3, -8,-18, -9, -1,-17,-20, 14, -6, -8,  3,  1, -8, 11, -2,-19, -1, 12, -8,-35, -1,  0;
/M: SY='P';  M=  2, -8,-23, -8, -7,-22,-14, -9,-14,  0,-15,-14, -7, 25,  3, -4, 11, 19,-10,-33,-13, -6;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='P';  M=  0, -5,-16, -3, 10,-14, -8, -3,-13, 11,-13, -3, -7, 20, 15,  6, -3, -2,-17,-11, -7, 10; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='W';  M=-25,-21,-28,-11,-10, 14,-10, -9,-10, -8,  8,-10,-29,-14, -6,  0,-14,-13, -2, 57, 45,-10; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-20, -2, -5,-12, -5,-12, -8, -2,-15,-15,  2, -8, -8,-15, 35, 27, -5,-35,-18,-10;
/M: SY='L';  M= -5,-12, -5,-15,-10, 10,-20, -3, 18,-10, 35, 30,-15,-32,-18,-15,-20,  0,  8,-22, 20,-10;
/M: SY='I';  M=  0,-11,-22,-18,-19, -7, 15,-17, 17,-12, 10,  7, -8,-26,-20,-18,-10, -6,  4,-14, -4,-19;
/M: SY='D';  M=  0, 50,-30, 90, 10,-50,-10,-20,-40,  0,-10,-30, 10,-10,-10,-10,  0,-10,-20,-40,-10,  0;
/M: SY='L';  M=  3,-11,-10,-11,-14, 11,-19,-17, 22,-17, 24, 13,-17,-29,-18,-16,-13,  4, 20,-27, 14,-14;
/M: SY='C';  M=-13,-19, 25,-18,-14,  6,-30,-25, 13,-21, 18, -1,-21,-32,-22,-13,-17, -3, 17,-13, 11,-16;
/M: SY='Y';  M=-31,-27,-41,-15,-17, 19,-21,-12, -8,-13, 19, -8,-35,-20,-10, -7,-16, -7,  4, 51, 63,-16;
/M: SY='A';  M= 25,  8,-29, 13,  2,-23, -5,-20, -9,  4,-10,  4,  3, -6,  4,-10,  8,  9,  1,-44,-28,  0;
/M: SY='I';  M= -6,-12,-29,-18,-19, -2, 10,-17, 15,-13,  7, -4, -9,-20,-17,-18, -2, -4,  6, -6,  4,-20;
/M: SY='W';  M=-10,-22,-14,-19, -2, -9,-14, -7,-11,  5,  2, 15,-22,-23,  2, 15,-17,-19,-10, 24,  8,  0;
/M: SY='D';  M= -3, 11,-16, 19,  4,-19,-18,  3, -7, -6,  1, -3,  3,-16, -9,-13, -6, -5, -6,-35, -4,  0;
/I:         I=-2; MD=-5;
/M: SY='G';  M= -5,-10,  2,-20,-15,  7, 14,-28, -7,-11, -3,-14, -4,-19,-16,-14, -4,-14,-10, -3,-17,-17; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-5;
/M: SY='D';  M=  2, 32,-24, 61,  2,-34,-12,-19,-22, -3, -6,-21,  4,-13,-12, -9, -2, -6, -6,-33, -6, -5; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='F';  M= -7, -9, -5,-12,-11, 24,-13, -9,  9,-10, 20,  5,-10,-19,-13,-10,-10, -3,  6, -7, 18,-11; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='C';  M= -2, -2,  8, -4,  7, -8, -8,-13,-10,  8, -9,  0, -1, -3, -4, -1,  5, -1,-10,-14,-14,  1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='E';  M= -3,  3, -8, 10, 20,-23,-12, 20,-17,  3, -6, -3, -4,  4,  5, -6, -2,-11,-16,-16, -7, 15; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='C';  M= -4,-12, 23,-20, -7, -9,-13,-11, 12, -7,  8,  8, -2,-19,-10,-11, -9, -4,  6,-16,-15, -9; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='L';  M= -4, -4, -7, -6, -8,  2,  7,-10,  6,-10, 12,  4, -8,-14,-12,-12, -8, -4, -2, -6,  6, -8; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='F';  M= -3,-10,-10,-13,-13, 22,-12,-12,  7, -8,  9, -3, -8,-18,-14, -7, -2,  0,  8, -9,  9,-14; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='V';  M=  9, -6,-13,-10,-12, -4, -9,-14, 14, -7,  3,  3, -2,-13, -6,-11,  1, 10, 17,-23, -7,-10; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='F';  M= -9,-13,-15,-15,-15, 26,-16,-11,  7, -9, 15, -2,-12,-20,-14, -6, -9, -4, 11,  1, 22,-15; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='N';  M=  5, 15,-15, 15, -3,-16,  8,-11, -8, -1, -9, -6, 16,-10, -5, -9,  1, -1, -9,-24,-17, -4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='P';  M=  3, -7,-17, -9, -5,-13,  6, -7,  3, -3, -6, -7, -6, 13, -4,-10, -2, -1, -3,-15,-14, -7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='C';  M= -4, -5, 34, -9, -1,-12,-13,-17, -7, -9, -4, -9, -1, -9, -7,-11,  6,  7, -5,-18,-20, -3; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='D';  M= -1,  4,-10, 12,  4,-17,-10, -8,-15,  3, -6, -6, -2, -2,  6,  8,  1, -3, -7,-14, -5,  5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='E';  M=  1,  8, -5, 18, 21,-24,-10, -4,-18,  6, -7,-10, -2,  1, 13, -1, -1, -8,-16,-11, -9, 19; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='E';  M=  3,  0, -2,  2, 15,-17, -9, -4,-10,  5, -5, -5, -2,  2,  5, -9,  8,  4, -9,-15,-10, 13; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='F';  M=-16,-16, 11,-21,-13, 30,-19,-17, -4, -9, 10,-11, -9,-20,-14, -6, -9,-11,  1,  6, 10,-15; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='F';  M= -8,-11, -7,-16,-13, 31,-14,-11,  7, -9, 19,  2, -9,-20,-14, -9, -9, -5,  6, -4, 18,-13; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='D';  M=  1, 17,-11, 31,  9,-25, -8, -9,-18,  1, -5,-12,  3, -2, -1, -8,  2,  0, -9,-21, -7,  5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='D';  M= -2, 11,-15, 16,  5,-18, -5, -6,-15,  6,-11,-10,  7, 13, -3, -5, -2, -2,-15,-23,-11,  0; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='G';  M=  7,  0,-19, -2,  2,-11, 10,-13, -6,  8,-10,  3,  0, -1, -1, -3,  2, -4, -8,-12,-15, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='N';  M=  0, 26,-11, 25, -1,-16, -2, -8,-10,  0, -9, -7, 30,-13, -6, -9,  0,  1,-12,-34,-16, -3; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='W';  M=-17,-19,-18,-13, -2,  2, -6,-12,-13, -6, -4,-11,-25,-10, 11,  6,-12,-14,-11, 54, 25,  2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='F';  M= -7,-11,-18, -9, -9, 12,-11, -7, -8, -1, -1, -7,-10,-11, -1, 12,  1, -6, -1,  2, 11, -9; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='S';  M=  0, -5,-21, -2, -1, -1, -6, -7, -6,  3, -2, -2, -6, -5, -2, -2,  5,  2, -1, -6,  5, -4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='F';  M= -4,  1,-14, -8, -4, 15, -8,-12, -5,  8, -4,  1, 11,-10, -7, -3, -2, -5, -6,-14, -3, -7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='F';  M= -7, -9, -5,-12,-11, 24,-13, -9,  9,-10, 20,  5,-10,-19,-13,-10,-10, -3,  6, -7, 18,-11; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='G';  M=  7,  0,-20, -2, -2,-13, 18,-14, -6,  4,-10,  0,  0, -3, -3, -5,  2, -5, -9,-10,-16, -3; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='P';  M= -2,  3, -7,  1, 10,-18, -6,  1,-12,  6,-13,-11,  6, 23,  1, -8, -2, -1,-18,-22,-15,  6; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='I';  M=  0, -8, -8,-13, -6, -1, -9, -7, 15, -9,  9,  5, -5,-13,  4, -6, -8,  0,  7,-13,  2, -3; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='F';  M= -5, -9, -6,-12,-12, 20,-14,-11, 12,-11, 17,  5,-11,-20,-14, -9, -9, -1, 11, -9, 15,-12; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='Q';  M=  3,  1, -6,  1,  8,-13, -7, -5,-10,  5, -9, -1,  4, -4,  9,  7,  0, -6, -8,-16,-13,  8; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='N';  M= -3,  5,-11,  0, -2,-11, -4, -2, -9,  3,-14, -7, 15, 11,  1,  2, -3, -1,-14,-25,-15, -3; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='A';  M= 17,  0,-18,  0,  3,-10, -2,-12, -3,  6, -7,  7,  0, -3,  4, -3,  4,  3,  1,-25,-19,  2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='I';  M= -2, -9, -6,-14,-10,  3,-10, -4, 18, -7, 17, 15, -6,-19,-10,-11,-10,  0, 10,-15,  5,-10; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='L';  M=  4, -5, -7, -5, -7,  4,-10,-10, 11, -9, 12,  8, -9,-16, -8, -9, -6,  3, 11,-18,  4, -7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='N';  M=  3,  7,-11,  2,  1, -6, -1, -7, -5,  5,-12, -3, 15, -7, -5, -5, 11,  6, -9,-24,-14, -3; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='F';  M= -1,-11,  9,-16,-11, 14,-15,-19,  4, -9,  4, -5, -6,-19,-12, -7, -5, -3,  9,-11, -5,-12; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='I';  M=  4, -6,-12,-10,-11, -3, -8,-11, 13, -7,  1, -2, -1,-12, -9,-11,  7, 11, 12,-20, -5,-12; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='H';  M=  0, -7,-17, -4,  9,-19, -9, 25,-12,  0, -9, -3, -8, 19,  4, -6, -2, -5,-14,-21,-11,  6; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='F';  M= -5, -5,-13,-18,-17, 23, -9,-13, 11, -6,  5, -3, 10,-20,-13,-11, -4, -3,  7,-14, -1,-17; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='V';  M= -5,-11,  3, -9, -7,  1,-15,-13,  2, -9,  6, -3,-12,-15, -8, -5, -7, -2,  9, -4,  6, -8; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='D';  M= -9,  9,-13, 16, -1,-12, -1,-16,-15, -4, -9,-13,  2,-13, -6, -6, -6,-10,-14, 16,  0, -3; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='Q';  M=  7, -2,-16, -2,  9,-11, -6, -8, -9, 11,-10,  5, -2,  2, 16,  7, -1, -2,-10,-14,-10, 10; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='I';  M=  1,-11, -9,-16,-15,  4,-11,-12, 27,-12, 12,  5, -6,-19,-14,-13, -7,  2, 22,-16,  3,-15; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='V';  M=  1, -6,-10, -6, -5,  4,-12,-13,  9, -1,  5,  7, -8,-13,-10, -4, -6,  1, 10,-14,  5, -7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='A';  M= 14, -4,-10, -3, 13,-19, -9, -2, -5,  9, -2, 12, -2, -8,  6, -5, -1, -2, -4,-23,-19, 10; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='C';  M=  3, -6, 18, -9, -2,-12,-15,-21, -2, -4, -3,  0, -3,-11, -6, -9, -1,  5,  3,-25,-19, -4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='E';  M=-12, -9,  0, -8,  6,-13,  2,-19,-13,  0, -1, -5,-12,-10, -8,-10, -8,-14,-16,  0, -3,  1;
/M: SY='V';  M= -1,-15,-21,-14,-16,  7,-19,-15, 15,-12, 15,  7,-17,-25, -9, -2,-11, -2, 18,-16, 14,-14;
/M: SY='P';  M= -3,-13,-16,-11,  3,-16,-14, -5,  0, -2, -4,-13,-17, 25, -8,-14, -4,  1, -7,-26, -7, -3;
/M: SY='P';  M=-13,-15,-33,-10, -6,-15,  6, -5,-13, -3, -5,-20,-23, 35,-10,-12,-11, -7,-20, -4,  6,-10;
/M: SY='T';  M=  9, -6,-21,-11,-10, -7,-15,-20, 11, -3,  4,  9, -2,-12, -7,-16,  2, 15, 13,-35, -7,-10;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='I';  M= -7,-17,-22,-23,-16,  0,-21, 23, 24,-20, 17, 14,-12,-21,-16,-19,-13, -4, 14,-32,  8,-16;
/M: SY='T';  M=  9,  0,-22, -7,-14,-18, -2,-18, -4, -7, -8, -8,  6, -4, -5,-23, 23, 33, -1,-37,-15,-11;
/M: SY='P';  M=-10,-14,-12,-10, -2, -5,-16, -2, -1, -8, 11, -5,-24, 28,-12,-16,-16,  0,-11,-24,  9, -6;
/M: SY='D';  M=  0, 29,-34, 49, -2,-42, 27,-24,-28, -4,-14,-26,  6,-10,-14,-14,  0,-14,-24,-19,-18, -8;
/M: SY='N';  M=  0, 43,-16, 33, -4,-22, -3,-13,-12,  0,-17, -9, 59,-24,-10,-17,  0,  4,-20,-61,-31, -7;
/M: SY='Q';  M=  8,-14,-20,-18,-10,-10,-22,-16, 16,-11, -1, -2, -9,-18, 17,  0, -6,  9, 13,-25, -3, -1;
/M: SY='D';  M=  6, 29,-33, 50,  1,-40, 15,-23,-26, -3,-13,-21,  6,-10, -9,-13,  2, -9,-18,-29,-20, -5;
/M: SY='I';  M= -3,-14, -8,-17,-18, 14,-21,-17, 31,-20, 29, 13,-17,-33,-23,-19,-16,  3, 25,-24, 19,-18;
/M: SY='N';  M= -1, 28,-19, 14, -8,-19, -8,  5, -8, -4,-14, -2, 49,-18, -7,-19,  2, 10,-17,-60,-26, -7;
/M: SY='G';  M=  0,  0,-40,-10,-20,-30, 80,-30,-10,-10,-20,-20,  0,-10,-20,-20,  0,-20,-30, 10,-30,-20;
/M: SY='F';  M= -9, -9,-24,-14,  0, 18,-21,-12,-12,  4,  0, -8, -2,-15,  7,  0, -7,-10,-11, -5, 10,  1;
/M: SY='Y';  M=-14,-18,-12,-18,-15, 19,-18,-18,  1,-13, 16,  4,-21,-25,-10, -2,-14, -7,  2,  9, 23,-12;
/M: SY='W';  M=-44,-38,-43,-22,-16, 22,-13,-21,-18,-14,  9,-18,-52,-24,-10,  0,-24,-27, -7,112, 73,-16;
/M: SY='D';  M=  0, 50,-30, 90, 10,-50,-10,-20,-40,  0,-10,-30, 10,-10,-10,-10,  0,-10,-20,-40,-10,  0;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-30,-50,-40,100,-30,-30,  0,-10, 20,-20,-10,-40,-30,-10,-10,-20, 10, 10, 30,-40;
/M: SY='G';  M=  0,  0,-19, -2, 13,-34, 39,-18,-18,  2,-16,-16, -4, -2, -3,-16,  0,-20,-30,  2,-26,  9;
/M: SY='D';  M= 12, 29,-28, 53,  6,-36, -6,-18,-25,  0,-12,-18,  6,-10, -5,-10,  9,  0,-11,-41,-19, -2;
/M: SY='Y';  M=-25,-26,-44,-15,-10, 10,-22,  0,-17, -2,  4,-24,-32, 31, -8, -5,-15, -7,-11, 12, 37,-14;
/M: SY='P';  M= -5,-17,-32,-14, -6,-25, -4, 12, -9, -4,-16,-19,-20, 41,-10,-12, -8, -3,-15,-27,-12,-10;
/M: SY='C';  M= -1, -6, 11,-15, -8,-18, -3,-26, -2, -7, -6, -6,  1,-11,-11,-19,  6,  9, -5,-26,-24,-10;
/M: SY='P';  M=  4,  9,-27,  8, -1,-26,  6,-14,-15,  5,-17,-10, 10, 13, -5,-13,  2,  3,-18,-35,-23, -5;
/M: SY='N';  M=  7,  3,-17, -1,  0,-16,  4,-14, -8,  0, -9,  0,  8,-13,  2, -1, -2, -6,-11,-27,-21,  1;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='P';  M= -1, -5,-16, -2,  6,-13, -4, -3,-12,  9,-14,-10, -7, 26, -2, -3,  5,  2,-15,-16,-10,  0; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='G';  M=  3, -5,-17, -7, -6,-11, 11,-12,  0, -6, -7, -7, -5, -9,  5, -1, -3, -3, -5, -4, -7, -2; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='C';  M= -3, -6,  9,-11, -7,  4,-12,-15, -4, -6, -1, -9, -1,-10, -8,-10,  7,  7, -1,-15, -9, -8; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='A';  M= 19,  6,-24,  0,  1,-23, 17,-18, -6,  0,-14, -1, 12,-11,  1,-14,  5, -1, -9,-34,-35,  0;
/M: SY='L';  M=-12,-15,  2,-16,-10,  7,-22,-19, 12,-10, 18,  7,-16,-23,-16,-12,-14, -4, 10,-11, 14,-12;
/M: SY='W';  M= -6,-19,-25,-18, -3,  4,-14,  4,-16, -4, -7, -3,-17,-13,  3,  5, -7,-18,-10,  8,  0, -3;
/M: SY='I';  M= -4,-16, 12,-19,-17,  8,-25,-23, 27,-21, 22,  7,-16,-33,-23,-18,-15,  1, 24,-25,  7,-18;
/M: SY='T';  M= 10, -8,-17, -9,-13, -1,-15,-18, 12,-11,  4,  0, -8,-21,-14,-15,  8, 17, 16,-34, -3,-15;
/M: SY='A';  M= 16, 11,-20, 12,  5,-23, -6,-15,-10,  1,-12, -4, 12, -9,  2,-14, 12, 11, -6,-44,-27,  2;
/M: SY='E';  M=  0,  2, 14,  8, 19,-30,-17,-14,-23, -1,-13,-17, -4, -7, 17, -1,  4, -4,-22,-21,-22, 17;
/M: SY='I';  M= -8,-21,-27,-23,-21,  9,-22, -9, 25,-11, 24, 13,-16,-31,-18,-13,-16, -1, 24, -9, 24,-21;
/M: SY='W';  M=-19,-28,-30,-25,-21,  9,-16,-21,  9,-13,  7, -5,-29,-26, -9,  3,-16,-15, 13, 37, 30,-19;
/M: SY='S';  M=  5, -5,-25, -6,  1,-18,-10, 14,-12, -4,-16,-10, -2, -4,  7, -6, 22, 14,-14,-32,-14,  0;
/M: SY='M';  M=  9,-14,-34,-14,-11, -5,-13, -8,  9, -2, 10, 14,-10,-21, -3, -9, -6,  2, 13,-19,  2,-11;
/M: SY='C';  M=  0,-15, 26,-25,-10, -4,-24,-20, -3, -6,  6,  8, -2,-25,-11,-14, -6,  3,  0,-28,-21,-10;
/M: SY='Q';  M= 10,-10,-21,-12, -4,-18,-15, -4, -7,  5, -6, 12, -4,-14, 16, 12,  1,  6, -5,-27,-13,  1;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='F';  M= -5,-11,-17,-16,-15,  9,  3,-14,  0, -4, -1, -5, -5,-13, -5,  6, -5,-12,  0,  0, -1,-13; D=-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='F';  M=-10,-21,  3,-25,-11, 16,-21,-20,-14, -5, -4,-18,-15,  6, -8, -1, -9,-12, -9,-14,-10,-14;
/M: SY='H';  M= -6,-16,-24,-12, -3,-16,-17, 21,-14,  1, -8,  2,-15,  9,  3, 13, -4, -8,-15,-24, -4, -4;
/M: SY='I';  M= -1,-12,-20,-14,-16, -5,  6,-15,  7, -8,  7,  7,-12,-25,-14, -2,-11, -8,  2,-12,  1,-15;
/M: SY='D';  M= 15, 14,-31, 21, -5,-31, 16,-23,-14, -4,-11,-10,  4, -9, -5,-15,  6,  1, -9,-31,-25, -6;
/M: SY='L';  M=  5, -7,-24,-10,-13,  3,-13,-11,  5,  0,  6,  6,  0,-26,-13,-11, -1, -1,  5,-26, -8,-16;
/M: SY='T';  M=  5, -9, -8, -9, -6,-16,-16,-17, -8, -7, -2, -5, -8,  3, -1,-15,  2, 14,  0,-29,-11, -6;
/M: SY='Q';  M=  0,-10,-25, -7,  3,-20,-12, 12,-19,  1,-20,-13,-11, 10, 14, 13, 10,  0,-20,-24,-12,  2;
/M: SY='F';  M=-12,-15, -2,-18,-14, 17,-10,-21,  1,-14, 16, -3,-15,-25,-17,-14,-12, -9,  1, -4, 12,-15;
/M: SY='D';  M=-10,  4, 10, 15,  1,-16,-18,-15,-10,-11, 10, -9,-12, -2,-14,-16,-13, -6,-10,-27, -1, -4;
/M: SY='D';  M=  2,  8,-24, 23,  6,-17,-12,-12,-15, -1,  0,-10, -6,-11, -4,-10,  3, -2, -6,-22,  0,  1;
/M: SY='P';  M= -6, -3, -2, -6,  7,-25,-10, -8,-19,  7,-22,-18,  1, 37, -5,-10, -2,  0,-27,-35,-27, -2;
/M: SY='Y';  M=-10,-12,-14, -3, 14, -5,-24, -6, -6,  0, 11, -4,-21,-12, -2, -9,-10,-10, -1,  1, 21, 10;
/M: SY='M';  M=  7,  0,-24, -7, -2,-13,  4,-12, -3, 10, -4, 17,  8,-15, -7, -7, -4, -3,-10,-28,-17, -5;
/M: SY='Y';  M=-10,-15,-23,-10, -2, 15,-21, -9, -3, -5, 18,  0,-19,-18, -6,-10,-10, -7,  3,  0, 26, -4;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='H';  M= -1,-14,-25,-19,-16, -9,-20, 22, 16,-15,  4,  7, -6,-13,-11,-15, -4,  5, 13,-34, -1,-14; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='P';  M=  3, -7,-26, -6,  1,-22,-10, -7, -9,  6,-18,-14, -7, 39, -4, -9, -4,  3,-13,-37,-19, -5;
/M: SY='V';  M=  7,  4,-20,  5,-16,-10,-18,-22,  9,-10, -2, -7,  5,-23,-16,-15,  5, 15, 16,-40, -6,-17;
/M: SY='R';  M=  2,  7,-24, 24, -1,-24,-11,-14,-26,  4,-16,-11, -5,-10,  9, 28,  3,-11,-11,-23,-11, -2;
/M: SY='G';  M=-14,-15,-42,-14,-16,-10, 21,-13, -4, -8, -2,-16,-17,  4,-14,-14, -9,-11,-11, 11, 10,-18;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2021_03 which contains 565'254 sequence entries.


Total number of hits 42 in 42 different sequences
Number of true positive hits 42 in 42 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] NiRAN
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
42 sequences

R1AB_BC133  (P0C6W1    ), R1AB_BC279  (P0C6V9    ), R1AB_BC512  (P0C6W0    ), 
R1AB_BCHK3  (P0C6W2    ), R1AB_BCHK4  (P0C6W3    ), R1AB_BCHK5  (P0C6W4    ), 
R1AB_BCHK9  (P0C6W5    ), R1AB_BCRP3  (P0C6W6    ), R1AB_BEV    (P0C6V7    ), 
R1AB_BRV1   (P0C6V8    ), R1AB_CVBEN  (P0C6W7    ), R1AB_CVBLU  (P0C6W8    ), 
R1AB_CVBM   (P0C6W9    ), R1AB_CVBQ   (P0C6X0    ), R1AB_CVH22  (P0C6X1    ), 
R1AB_CVHN1  (P0C6X2    ), R1AB_CVHN2  (P0C6X3    ), R1AB_CVHN5  (P0C6X4    ), 
R1AB_CVHNL  (P0C6X5    ), R1AB_CVHOC  (P0C6X6    ), R1AB_CVM2   (P0C6X8    ), 
R1AB_CVMA5  (P0C6X9    ), R1AB_CVMJH  (P0C6Y0    ), R1AB_CVPPU  (P0C6Y5    ), 
R1AB_FIPV   (Q98VG9    ), R1AB_IBVB   (P0C6Y1    ), R1AB_IBVBC  (P0C6Y2    ), 
R1AB_IBVM   (P0C6Y3    ), R1AB_MERS1  (K9N7C7    ), R1AB_PEDV7  (P0C6Y4    ), 
R1AB_SARS   (P0C6X7    ), R1AB_SARS2  (P0DTD1    ), R1AB_WBV24  (Q008X6    ), 
RPOA_EAVBU  (P19811    ), RPOA_LDVC   (Q06502    ), RPOA_LDVP   (Q83017    ), 
RPOA_PRRS1  (Q9YN02    ), RPOA_PRRSB  (Q8B912    ), RPOA_PRRSL  (Q04561    ), 
RPOA_PRRSR  (Q9WJB2    ), RPOA_PRRSS  (A0MD28    ), RPOA_SHFV   (Q68772    )
» more

PDB
[Detailed view]
10 PDB

6M71; 6NUR; 6NUS; 6YYT; 7BTF; 7BV1; 7BV2; 7BZF; 7C2K; 7L1F

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission