PROSITE entry PS52012

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	CFEM
Accession [info]	PS52012
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	22-FEB-2023 CREATED; 22-FEB-2023 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC52012
Associated ProRule [info]	PRU01356

Name and characterization of the entry

Description [info]

CFEM domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=112;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=107;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.1021421; R2=0.0086916; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=737; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=391; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='R?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='M';  M= -7,  4,-20, -8,-11,-12, -3,  1, -3, -7, -7, 17, 12,-19, -2, -7, -2, -5,-10,-29,-12, -7;
/M: SY='P';  M= -6, -5,-27, -7, -1,-22,-16,  4,-17,  7,-20, -2, -1,  9,  1,  0, -5, -7,-18,-27,-12, -2;
/M: SY='Y';  M= -7,-18,-22,-24,-17, 18,-21, -4,  0, -8,  2, 14,-15,-22,-11, -9,-12, -7, -2, -4, 19,-14;
/M: SY='S';  M=  7, -8,-16,-13, -8,-10, -8,-13,-14, -4,-13, -5, -3,-14, -6, -3,  9,  9, -6,-24,-11, -7;
/M: SY='S';  M=  4,-12,-17,-16,-11, -8,-16,-17, -3, -6,-10, -6, -6,-16, -9, -6,  7,  7,  3,-25,-10,-11;
/M: SY='Y';  M= -8,-19,-18,-24,-20, 14,-27,-14,  8,-18,  5,  2,-16,-23,-19,-16, -6,  7, 10,-11, 15,-20;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='P';  M= -2,-10,-18, -9, -4,-15,-14,-13, -7,-10,-11, -8, -8, 12, -4,-11,  6,  6, -6,-26,-15, -5; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='S';  M=  4,-11,-16,-11, -7,-14,-14,-16, -8, -6, -8, -7, -7,-11, -7, -8,  8,  6, -1,-30,-14, -7;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-16,-31,-26,  7,-31,-26, 27,-25, 25, 14,-29,-29,-26,-21,-18, -5, 32,-24, -4,-26;
/M: SY='A';  M= 18,-15,-18,-20,-12,-14,-13,-20,  2,-16, -4, -4,-11, -4,-11,-20,  4,  0,  2,-25,-15,-13;
/M: SY='L';  M= -3,-15,-20,-16, -8, -8,-21,-16, -3, -3, 10,  3,-13,-19, -8, -2,-10, -1, -2,-23, -7, -8;
/M: SY='T';  M=  6,-13,-14,-18,-15, -3, -9,-20, -4,-17,  0, -4,-10,-18,-16,-16,  4, 12,  3,-23,-10,-15;
/M: SY='A';  M= 40,-14,-12,-23,-14,-16, -7,-22, -1,-13, -5, -5,-13,-13,-13,-21,  5, -1,  8,-21,-17,-14;
/M: SY='A';  M= 20, -8, -1,-12, -8,-17, -5,-16,-13,-13,-15,-13, -3,-14, -8,-16, 19,  8, -5,-32,-19, -8;
/M: SY='I';  M= -2,-23,-22,-28,-22, -4,-20,-22, 21,-23, 13, 13,-17,-21,-16,-22,-11, -6, 16,-23, -7,-21;
/M: SY='N';  M=  1,  2, -2, -8,-11,-13,-11, -9, -7,-12,-11, -4,  9,-20, -9,-12,  6,  4, -5,-34,-16,-10;
/M: SY='G';  M=  7,-17,-18,-20,-18,-12,  8,-19, -5,-18,  0,  1,-13,-21,-17,-18, -3, -7,  2,-24,-16,-17;
/M: SY='F';  M=  9,-16,-14,-23,-16, 14,-16,-19, -3,-18, -1, -5,-12,-19,-19,-17,  2,  4,  3,-17, -2,-16;
/M: SY='A';  M= 33, -9,-11,-17, -9,-16, -5,-18, -9,-12, -8, -9, -8,-12, -9,-17, 12,  7, -1,-24,-17, -9;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='D';  M=  5, 12,-18, 14,  5,-24, -9, -7,-20,  2,-17,-13,  3, -8,  3, -5,  3,  0,-13,-23,-14,  4; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='Q';  M= -5, -5,-26, -6,  9,-25,-19, -4,-18,  8,-13, -5, -5, -7, 20, 10, -3, -3,-18,-22,-12, 13;
/M: SY='I';  M= -1,-21,-21,-26,-21, -6,-10,-21, 12,-22, 11, 10,-17,-21,-17,-20,-11, -4, 10,-22, -9,-20;
/M: SY='Y';  M=-10,-19,-25,-16, -8,  2,-25, -6,  0,-14,  5, -1,-19, -7,-11,-14,-12, -6, -4,-11, 14,-12;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='D';  M=  1, 23,-18, 29,  7,-25, -4, -4,-23, -3,-20,-19, 13, -9, -2, -9,  7, -2,-17,-28,-16,  3; D=-14;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='Q';  M=  1, -2,-15, -3,  6,-17, -5, -4,-12, -2, -8, -4, -2, -7, 12, -3,  1, -1,-12,-15, -9,  9; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='L';  M= -7,-28,-22,-27,-19, -1,-29,-23, 16,-24, 23, 10,-28, -7,-21,-21,-21, -7, 14,-24, -8,-21;
/M: SY='P';  M= -8,-18,-37, -9,  0,-29,-18,-19,-20,-10,-30,-20,-17, 80, -9,-19, -5, -7,-28,-31,-29, -9;
/M: SY='E';  M=  7,  5,-24,  6, 14,-30, -6, -7,-25,  7,-21,-14,  0, -9, 11, -2,  1, -8,-20,-24,-18, 13;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='A';  M= 29,-11,-12,-17, -9,-14, -6,-18, -7,-14, -4, -7, -9,-14, -9,-18, 10,  3, -1,-25,-16, -9;
/M: SY='Q';  M=-10,-10,-27,-10,  3,-20,-23, -7,-10,  9,  1,  4,-10,-17, 17,  6,-13,-10,-13,-20, -7, 10;
/M: SY='E';  M=  7,  2,-24,  5,  9,-25,-11,-10,-18, -5,-18,-11, -4,  9, -1,-13,  2, -5,-16,-29,-20,  3;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='V';  M=  3,-25,-15,-30,-23, 11,-24,-21, 15,-21, 15, 12,-24,-25,-23,-19,-13, -5, 21,-19, -3,-22;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='K';  M= -2,-12,-20,-14, -6, -6,-20,-14, -8,  2, -5, -2,-10,-17, -3, -1, -4, -1, -4,-20, -6, -4;
/M: SY='Q';  M=  1,  0,-23, -3,  0,-22, -7, -8,-18,  5,-18, -8,  0,-15,  7, -1, -1, -7,-13,-22,-13,  4;
/M: SY='S';  M=  7, -2,-19, -6, -6,-22,  7,-13,-20,  0,-23,-14,  5,-15, -6, -5, 10, -1,-11,-28,-19, -6;
/M: SY='T';  M=  4,-11,-18,-16, -7, -3,-20,-18, -4, -9,  1, -3,-10,-15,-11,-11, -1,  9, -1,-21, -7, -8;
/M: SY='S';  M=  6, -7,-21, -6, -5,-24,  8,-16,-23, -7,-27,-17, -1,  5, -7,-11, 14,  4,-17,-30,-22, -7;
/M: SY='S';  M=  7,  0,-18, -3,  4,-20, -3,-12,-15, -8,-19,-14,  4,-12, -3,-11, 14,  5,-10,-31,-19,  0;
/M: SY='T';  M= -1,  2,-15,  2, -4,-14,-13,-13,-12,-12, -9,-11,  1,-14, -7,-12, 14, 18, -6,-33,-13, -5;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='P';  M= -4, -9,-26, -7, -7,-23, 15,-16,-23, -6,-23,-15, -6, 17,-10,-11, -2, -6,-21,-20,-21,-10; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='P';  M= -5, -5,-30,  2,  1,-29,  9,-15,-28,-10,-29,-21, -4, 27, -8,-16,  3, -7,-26,-30,-27, -5;
/M: SY='Y';  M=  1,-19,-22,-20,-14,  3,-20, -7,  1,-16,  8,  1,-18,-13,-12,-16,-11, -5, -3, -8, 14,-15;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='W';  M=-10,-12,-26,-15,-14, -4, -7, -5,-14,-13,-10, -9, -8,-19,-10,-11,-11, -6,-16, 28,  4,-11; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='D';  M=-19, 49,-29, 65, 18,-38, -9,  1,-38,  0,-30,-29, 24,-11,  0, -9,  1, -9,-30,-40,-20,  9;
/M: SY='T';  M= -5,-10,-19,-11,-11, -1,-22,-17, -4,-14, -3, -4,-11, -9,-11,-14, -3,  7,  1,-23, -6,-11;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='G';  M=  1, -5,-24, -5, -5,-25, 20,-14,-28,  8,-26,-14,  0,-13, -5,  0,  1, -9,-19,-20,-18, -5; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='C';  M= -9,-21,108,-30,-30,-18,-30,-30,-24,-29,-17,-17,-21,-39,-30,-29,-10, -9, -4,-48,-28,-30;
/M: SY='L';  M=-10,-23,-21,-26,-19,  5,-29, -4, 15,-24, 23, 12,-19,-25,-16,-18,-18, -5, 10,-22,  3,-19;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='T';  M= -1,-11,-15,-14,-12, -8,-19,-14,  0,-12, -9, -5, -7,-17, -7,-12, 11, 16,  7,-26, -3,-10;
/M: SY='M';  M= -9, -4, -9, -8, -5,-18,-19,  2,-11, -1,-11,  7, -4,-17,  4, -4, -3, -2, -9,-28, -8, -1;
/M: SY='P';  M= -2, -7,-31, -4,  6,-27,-15,-13,-21, -2,-27,-18, -5, 44, -4,-11, -1, -6,-25,-30,-24, -2;
/M: SY='N';  M= -8, 16,-23, 14, 14,-26,-11, 11,-24,  0,-25,-15, 19,-12, 14, -2, 10,  0,-25,-33,-14, 14;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='F';  M=-16,-23,-22,-27,-16, 43,-26,-13, -1,-21, 10,  0,-19,-24,-23,-15,-19,-10, -4, 10, 23,-17; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='A';  M=  6, -9,-18,-14,-13,-13, -3,-17, -4,-14, -6, -5, -5, -8,-13,-16,  0,  2, -2,-23,-15,-14; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='G';  M=  2,  3,-21,  2, -7,-20, 16, -8,-25,-11,-26,-18,  8,-16, -8,-13, 13, -1,-19,-26,-13, -8;
/M: SY='A';  M= 18, -1,-20, -5, -8,-24, 15,-15,-22, -8,-17,-14,  1,-15,-10,-14,  3, -8,-14,-23,-21, -9;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-23,-36,-29,  1,-36,-29, 41,-27, 20, 17,-24,-24,-23,-26,-18, -7, 35,-23, -3,-29;
/M: SY='G';  M= -5, -4,-23, -5, -2,-22,  8,-13,-27,  3,-22,-15,  1,-14, -4,  8,  5,  4,-18,-25,-17, -4;
/M: SY='D';  M=-10,  9, -2, 12,  2,-29,-15,-10,-28,  2,-28,-19,  4, -1, -2, -6,  0, -6,-22,-35,-21,  0;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='V';  M= -2,-24,-13,-27,-24,  0,-29,-26, 22,-21, 14,  9,-24,-25,-24,-19, -9,  7, 31,-28, -8,-24;
/M: SY='A';  M= 13, -1,-19, -4,  0,-23,-12,-13,-17,  7,-13, -9, -4,-12,  1, -3,  1,  0,-10,-23,-14,  0;
/M: SY='E';  M= -4,  6,-22,  9, 24,-27,-14, -4,-24,  5,-23,-16,  4, -7, 15, -1, 13,  5,-20,-31,-17, 19;
/M: SY='A';  M= 10, -5,-19,-12, -7,-18,-14,-16, -5,  1,-13, -6, -1,-13, -5, -6,  4,  3, -3,-25,-13, -7;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='P';  M=-10, -6,-32, -4,  3,-28,-18,-12,-22,  9,-27,-15, -4, 34,  2,  1, -5, -3,-24,-27,-20,  0;
/M: SY='G';  M= -1,  3,-25,  0,-10,-24, 19,-12,-20,-12,-20,-13,  9,-18, -8,-14,  1,-10,-16,-27,-21, -9;
/M: SY='E';  M=  2,  9,-25, 10, 20,-29, -5, -5,-26,  4,-22,-16,  6, -9, 10, -4,  2, -8,-23,-27,-19, 15;
/M: SY='D';  M=-17, 39,-29, 53, 28,-36,-12,  1,-36,  2,-28,-27, 19, -8,  5, -7,  1, -9,-30,-38,-20, 16;
/M: SY='A';  M= 14,-15,-18,-20,-10,-17,-18,-16,  6,-10, -3,  2,-14,-16,  1,-14, -2, -4,  9,-22,-12, -5;
/M: SY='D';  M= -6,  3,-23,  7,  1,-21,-16, -5,-11, -4,-14, -9, -2,-15, -6, -9, -1, -3, -4,-30,-12, -3;
/M: SY='S';  M= 11, -2,-17, -5, -1,-22, -7,-13,-19,  2,-24,-15,  3, -3, -2, -5, 17, 10,-12,-31,-18, -2;
/M: SY='V';  M= 13,-21,-11,-26,-22,  3,-20,-25, 10,-17,  2,  1,-20,-22,-23,-19, -2,  4, 24,-22, -8,-22;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='V';  M= -6,-16,-20,-18,-11, -5,-24,-15,  7,-12,  1,  1,-12,-20,-10, -8, -3,  3,  8,-22, -1,-13;
/M: SY='S';  M=  0,  1,-18,  0,  9,-17,-10, -7,-17, -3,-22,-14,  6,-12,  5, -5, 17,  6,-12,-32,-15,  7;
/M: SY='A';  M= 11,-16,-17,-21, -9,  5,-16,-17, -2,-17,  8, -2,-15,-18,-14,-17, -5, -4, -1,-18, -5,-11;
/M: SY='A';  M= 19,-17,-16,-23,-19,  0,  4,-22, -8,-17, -7, -7,-13,-19,-21,-20, -1, -6,  1,-16,-11,-19;
/M: SY='K';  M= -5, -6,-19,-10, -5,-16,-21,-14, -7,  6, -9, -3, -4,-17, -2,  1, -2,  6,  0,-26,-10, -4;
/M: SY='S';  M=  3, -2,-18, -2, -1,-23,  5,-11,-25,  2,-29,-18,  6,-12,  0,  1, 22,  7,-15,-32,-19, -1;
/M: SY='I';  M=  5,-14,-20,-18,-10,-14,-19,-16,  8,-15, -4,  1, -8,-15, -1,-16,  5,  1,  5,-26,-11, -7;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='S';  M=  6, -3,-18, -3, -1,-24,  1,-12,-23, -1,-29,-18,  3, -1, -2, -6, 21,  7,-15,-33,-20, -2;
/M: SY='S';  M=  5, -2,-19,  0,  1,-21,  3,-15,-17, -9,-18,-14, -2,-13, -7,-13,  8,  1, -7,-30,-19, -3;
/M: SY='A';  M= 18, -8,-17,-11, -9,-14,-12,-11, -4, -9, -6,  0,-11,-16, -4,-14, -1, -4,  2,-19, -6, -7;
/M: SY='G';  M=  1, -3,-25, -5,-14,-27, 50,-15,-34,-16,-30,-20,  8,-18,-14,-16,  9,-10,-26,-26,-27,-14;
/M: SY='A';  M= 15,-17,-13,-20,-17,-13, -7,-14,  1,-15, -6, -3,-14,-20,-17,-17,  2, -2, 14,-27,-14,-17;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='W';  M=  5, -2,-17, -7, -5,-12, -2, -8,-13, -6,-15,-11,  2,-12,  0, -8,  1, -4,-14,  6, -6, -2; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='V';  M= -1, -3,-11,  0, -2, -9,-11,-10, -1, -7, -1, -3, -6,-11, -7, -9, -1, -1,  4,-19, -9, -4; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
/M: SY='P';  M= -5,-10,-29, -7, -3,-24, -7,-16,-19,-10,-26,-17, -8, 47, -9,-15,  0, -1,-23,-28,-24, -9; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='Y';  M= -3, -2,-21,  0, -9, -8, -9, -6, -9,-11,-11, -9, -5,-17,-10,-13, -1, -3, -6,-14,  7,-11; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='W';  M=  0,-12,-22,-13,-10,-10, -9,-18,-18,-13,-24,-18, -6,-16, -8,-13, 13, 11,-14, 17, -4, -8;
/M: SY='M';  M=  1, -9,-19,-14, -8,-13, -7,-11,  0,-12, -6,  7, -4,-16, -6,-14,  1, -3,  0,-27,-13, -8;
/M: SY='I';  M=  2,-17,-19,-20,-14,-11,-19,-18,  6,-15, -2,  4,-14, -1,-11,-17,  0,  4,  6,-28,-13,-14;
/M: SY='P';  M= -6,-13,-19, -8, -1,-28, -1,-18,-26,-12,-28,-20,-11, 38,-10,-18, -2, -9,-26,-31,-28, -8;
/M: SY='A';  M= 20,-12,-16,-15, -9,-20, -1,-18,-10,-11,-15,-10, -9, -4, -7,-16,  8,  0, -2,-26,-20, -8;
/M: SY='S';  M=  2,  1,-18,  2,  7,-22, -2,-10,-22, -7,-26,-19,  7,  0,  0, -9, 22, 11,-17,-35,-21,  3;
/M: SY='S';  M=  5,-11,-17,-12, -8,-16, -7,-19, -5,-13,-14, -9, -8, -8,-11,-15, 10,  7,  3,-31,-17,-10;
/M: SY='S';  M= 13, -3,-14, -5, -3,-22,  3,-12,-20, -7,-24,-16,  4,-11,  0, -9, 24, 12,-11,-31,-19, -2;
/M: SY='S';  M=  8, -1, -5, -1, -6,-23, 11,-14,-25,-13,-27,-20,  5,-14, -7,-14, 22,  6,-14,-35,-23, -6;
/M: SY='S';  M= 15, -3,-11, -7, -5,-17, -5,-13,-14,-10,-20,-12,  3,-11, -4,-12, 27, 20, -5,-33,-17, -4;
/M: SY='S';  M= -3, -7,-21, -8, -4,-14,  0,-13,-13,-11, -4, -7, -2,-18, -8,-10,  1, -1,-11,-27,-15, -6;
/M: SY='S';  M= 10,  2,-15,  1,  4,-22, -5,-11,-20, -7,-24,-18,  5, -2, -1,-11, 24, 12,-13,-34,-20,  1;
/M: SY='S';  M=  8, -6,-17, -8, -9,-21, 15,-16,-22, -9,-23,-15,  1,-14, -9,-11, 16,  7,-11,-29,-20, -9;
/M: SY='S';  M= 14, -1,-17, -4,  8,-23, -8,-11,-19,  0,-20,-14,  0, -8,  5, -6, 15,  7,-12,-28,-17,  6;
/M: SY='A';  M= 32, -3,-14, -8, -5,-22, -4,-17,-15, -9,-15,-14, -5, -3, -8,-17, 11,  4, -6,-25,-20, -7;
/M: SY='S';  M= 11,  1,-12, -3, -4,-19, -2,-13,-18,-10,-22,-16,  6,-11, -5,-12, 25, 21, -8,-33,-18, -5;
/M: SY='A';  M= 17, -3,-15, -7, -8,-21,  9,-17,-19,-11,-19,-15,  0,-12,-10,-15, 16, 11, -9,-27,-20, -9;
/M: SY='T';  M= 10, -5,-12,-10, -9,-15, -4,-17,-12,-12,-17,-12, -1,-13, -9,-13, 21, 22,  0,-32,-16, -9;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_01 which contains 572'970 sequence entries.

Total number of hits	22 in 19 different sequences
Number of true positive hits	22 in 19 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	3
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	88.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	4
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	CFEM
Version [info]	1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

19 sequences

CCW14_CANAL (Q5AFN8), CCW14_YEAST (O13547), CFM1_GIBZE  (I1REI8),

CFM1_MARBU  (K1XVG1), CFM5_GIBZE  (I1RET0), CFM6_MARBU  (K1WG73), 
CFM8_MARBU  (K1XW16), CFMA_ARTBC  (D4AZC5), CFMA_ASPFU  (Q4WLB9), 
CFMB_ARTBC  (D4B2Q8), CFMB_ASPFU  (Q4WMA6), CFMC_ARTBC  (D4AXU8), 
CFMC_ASPFU  (Q4WNE1), CFMN1_GIBZE (I1RAQ3), CSA1_CANAL  (G1UB63), 
CSA2_CANAL  (Q5A0X8), PGA10_CANAL (Q59UP6), PGA7_CANAL  (Q59UT5), 
RBT5_CANAL  (Q59UT4)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

3 sequences

CFM9_MARBU  (K1XT82), MAD1_ARTOA  (G1XAA9), MAD1_METAN  (Q2LC49)

PDB
[Detailed view]

1 PDB

4Y7S