PROSITE entry PS52020

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	CRESS_DNA_REP
Accession [info]	PS52020
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	28-JUN-2023 CREATED; 28-JUN-2023 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC52020
Associated ProRule [info]	PRU01364

Name and characterization of the entry

Description [info]

CRESS-DNA virus replication initiator protein (Rep) endonuclease domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=101;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=96;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4021773; R2=0.0249368; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=385; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=165; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='R';  M= -8, -5,-21, -7, -3,-17,-14, -4,-16,  4,-14, -3, -1,-12,  2, 13, -2, -3,-13,-26,-12, -2;
/M: SY='M';  M= -5,-14,-20,-18,-12, -2,-19,-13, -1,-11, -1,  3,-11,-15, -9,-10, -7, -4, -2,-18, -4,-11;
/M: SY='R';  M= -8,  0,-24, -3,  3,-24,-13,  0,-21, 10,-20, -8,  5,-11, 12, 16, -1, -5,-20,-25,-12,  6;
/M: SY='A';  M= 12, -7,-13,-12,-10,-16, -2,-10,-13,-10,-15, -9, -2,-15, -8,-12,  9,  2, -6,-25,-12, -9;
/M: SY='R';  M=-11, -4,-26, -6,  3,-23,-19, -5,-24, 26,-22, -9,  0,-14,  9, 34, -5, -5,-17,-22,-10,  4;
/M: SY='N';  M= -8,  3,-19, -3, -4,-13,-10,  3,-19,  2,-19,-11, 12,-19, -1,  9,  0, -3,-18,-22, -4, -4;
/M: SY='W';  M=-14,-30,-31,-33,-26, 20,-24,-20, -1,-21,  0, -4,-27,-28,-22,-19,-25,-15, -5, 52, 23,-22;
/M: SY='C';  M= -8,-23, 21,-30,-24, 11,-27,-22, -2,-24,  3, -1,-20,-29,-24,-21,-13, -7,  5,-23, -4,-23;
/M: SY='F';  M=-13,-29,-19,-34,-25, 37,-29,-20, 11,-28, 25,  9,-24,-29,-28,-20,-23,-10,  7, -5, 13,-25;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 19, 48,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='Y';  M=-12,-22,-25,-24,-19, 13,-28, -6,  9,-18, 10,  5,-20,-26,-14,-15,-18, -9,  2,  5, 27,-19;
/M: SY='N';  M= -7,  8,-24,  1, -3,-13, -9, -2,-18, -6,-24,-16, 18,  6, -6, -8,  4, -2,-23,-28,-14, -5;
/M: SY='N';  M=-11, 14,-24,  7,  4,-20,-11,  7,-21,  5,-22,-12, 22,-16, 11,  8,  1, -5,-24,-27,-11,  6;
/M: SY='C';  M= -8,-14,  5,-15,-12, -9,-22,-11,-14,-14,-15,-11,-14, -5,-13,-16, -7, -5,-11,-19, -1,-14;
/M: SY='D';  M= -4,  5,-22,  6,  2,-21, -9, -8,-20, -7,-19,-14,  3, -2, -3, -9,  6,  6,-16,-30,-16, -1;
/M: SY='E';  M= -7, -2,-25,  0,  5,-14,-15, -8,-11, -8, -7, -7, -5,-11, -3,-10, -6, -7,-11,-23, -9,  0;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='D';  M= -5,  7,-20,  9,  9,-20, -9, -6,-19, -1,-17,-13,  4, -5,  1, -5,  3, -1,-16,-25,-14,  4; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='E';  M= -7,  1,-20,  5,  6,-16,-10, -6,-15,  2,-13,-10, -2,  0,  0, -2, -3, -5,-13,-16, -9,  3; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M:         M= -5, -6,-14, -7, -5, -4, -9, -2, -4, -7, -1, -1, -5,-11, -5, -6, -6, -5, -4,-11, -1, -6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='E';  M= -4,  2,-17,  4,  6,-14,-12, -4,-12, -2,-10, -8,  0, -6,  2, -5,  0, -2,-12,-19, -8,  4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='E';  M= -3,  0,-17,  0,  3,-11,-12, -1,-13, -2,-10, -7, -2, -9,  0, -4, -3, -5,-12,-14, -5,  1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='L';  M= -6,-18,-17,-21,-15,  4,-21,-13, 10,-17, 14,  7,-16,-18,-14,-13,-14, -6,  6,-12,  1,-15; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M:         M= -7,-14,-22,-15, -8, -4,-19,-11, -1, -8,  0,  0,-12,-15, -7, -7,-10, -7, -2, -9, -1, -9; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='E';  M= -7,  6,-24,  7,  8,-21,-14, -5,-19,  1,-17,-13,  4, -9,  2, -1,  0, -2,-16,-26,-13,  4;
/M:         M= -8,-13,-24,-15, -7, -5,-19,-10, -5, -8, -1, -1,-11,-15, -7, -4,-10, -6, -6,-16, -4, -8;
/M: SY='L';  M= -8,-19,-17,-22,-16,  5,-25,-15,  7,-19, 13,  6,-17,-21,-16,-16,-14, -5,  5,-18, -1,-16;
/M:         M= -5, -6,-21, -7, -3,-10,-15, -8,-11, -8, -7, -6, -5,-14, -5, -8, -4, -3,-10,-19, -7, -5;
/M: SY='E';  M= -4,  0,-23,  0,  6,-22,-10, -6,-21,  0,-19,-13,  1, -4,  2, -2,  2, -2,-18,-26,-15,  3;
/M:         M= -7, -7,-22, -7, -4, -9,-16, -8,-11, -6, -7, -6, -6,-16, -6, -5, -6, -5,-10,-17, -4, -5;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='B';  M= -7,  2,-24,  2,  1,-20, -9, -4,-18, -2,-17,-11,  2,-11, -1, -4, -1, -4,-16,-23,-11, -1;
/M: SY='V';  M= -3,-20, -6,-23,-17, -8,-21,-20,  2,-18, -2, -1,-18, -8,-17,-19,-10, -6,  3,-24,-11,-18;
/M: SY='K';  M= -4, -3,-20, -4,  0,-19,-15, -9,-15,  6,-15, -8, -2,-14,  1,  4, -1, -1,-10,-25,-11,  0;
/M: SY='Y';  M=-16,-16,-25,-18,-14, 18,-25,  6, -6, -8, -5, -3,-15,-26,-10, -7,-16,-10,-10, 15, 43,-14;
/M: SY='I';  M= -3,-22,-13,-27,-21,  2,-22,-16,  8,-20,  8,  5,-19,-24,-17,-19,-14, -7,  7,-10,  3,-20;
/M: SY='V';  M= -5,-23,-12,-27,-21, -5,-27,-22, 15,-16,  6,  6,-18,-23,-17,-12,-12, -5, 16,-23, -6,-21;
/M: SY='V';  M= -7,-25,-18,-29,-25, 10,-22,-18, 12,-21,  5,  5,-21,-26,-22,-20,-15, -8, 13, -4, 10,-24;
/M: SY='G';  M=  6, -8,-12,-11, -8,-27, 18,-13,-25,-11,-22,-12, -3,-17,  0,-13,  4, -8,-18,-25,-22, -4;
/M: SY='R';  M=-11, -6,-26, -5,  4,-18,-20,  0,-18, 10,-13, -5, -3,-15,  6, 16, -8, -9,-15,-20, -6,  3;
/M: SY='E';  M=-10,  9,-30, 19, 58,-30,-20,  1,-30, 10,-20,-19,  0, -1, 21,  1,  0,-10,-30,-29,-19, 39;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='V';  M= -7,-10,-21,-13, -7,-11,-22, -9, -1, -3, -4, -1, -7,-18, -5, -1, -5,  0,  1,-23, -6, -7; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='H';  M= -2, -7, -7, -9,-10,-22,  9, 20,-28,-15,-21,-11,  0,-20, -8,-13, -3,-14,-22,-27, -9,-11; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='E';  M= -2,  4,-23,  4, 15,-25,-13, -6,-21,  6,-18,-12,  2, -9, 11,  1,  4,  1,-18,-27,-15, 13;
/M: SY='D';  M= -6, 16,-19, 17,  5,-24,-10, -8,-23, -4,-21,-17, 10,-11, -1, -8, 10, 12,-16,-34,-16,  1;
/M: SY='G';  M= -2, -5,-29, -5,-12,-29, 49,-15,-36,-14,-28,-18,  2,-17,-13,-15,  0,-16,-28,-21,-26,-13;
/M: SY='T';  M= -5, -3,-20, -7, -6,-15, -5, -9,-19, -3,-17,-11,  1,-15, -5,  2,  7, 14,-12,-24, -9, -6;
/M: SY='P';  M=-10,-13,-30, -9, -1,-15,-22,-10,-11, -6,-12, -8,-12, 19, -6, -7,-10, -7,-14,-23,-11, -6;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-29,  0,  0,-20,-20, 97,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-29,-30, 19,  0;
/M: SY='L';  M=-12,-27,-22,-30,-22, 14,-29,-16, 12,-23, 23,  9,-24,-27,-19,-17,-23, -9,  5,  0, 12,-21;
/M: SY='H';  M=-14,  0,-30,  0, 11,-32,-19, 46,-24,  2,-20,  0,  4,-13, 38,  5, -4,-14,-30,-24,  2, 23;
/M: SY='G';  M=  7,-16,-12,-20,-21,-18, 21,-22,-14,-20,-13, -8,-11,-21,-20,-21, -3,-11, -5,-22,-20,-21;
/M: SY='Y';  M=-13,-23,-21,-27,-22, 30,-28, -3,  5,-18,  8,  4,-20,-28,-19,-14,-18, -9,  1,  7, 37,-22;
/M: SY='I';  M= -3,-27,-12,-32,-26,  6,-29,-25, 23,-24, 17, 11,-24,-26,-23,-22,-16, -6, 23,-21, -3,-25;
/M: SY='Q';  M= -8,  0,-19,  0, 11,-21,-18,  2,-18,  1,-16, -8, -1,-14, 12,  0, -2, -7,-17,-23, -6, 10;
/M: SY='F';  M=-13,-25,-13,-31,-24, 37,-27,-18,  2,-25, 13,  2,-20,-28,-27,-18,-17, -5,  1, -1, 15,-23;
/M: SY='K';  M= -4,  2,-25,  2,  4,-23, -8, -6,-21,  6,-21,-13,  3, -9,  1,  3,  1, -3,-17,-26,-14,  2;
/M: SY='R';  M= -7,  4,-22,  1,  3,-22,-10, -6,-22, 11,-22,-12,  9,-14,  3, 12,  3,  1,-17,-27,-14,  2;
/M: SY='R';  M= -5, -6,-27, -6,  2,-25,-15, -8,-21, 14,-21,-10, -4,  2,  7, 15, -4, -6,-18,-23,-15,  3;
/M: SY='M';  M= -9,-15,-20,-18,-11, -5,-24,-12, -1,  0, -3,  2,-12,-20, -5,  2,-11, -6,  1,-18, -1, -9;
/M: SY='R';  M=-11, -1,-23, -3,  0,-16,-15, -2,-22,  8,-19,-12,  3,-15,  3, 22,  1,  1,-16,-23, -7, -1;
/M: SY='F';  M= -9,-21,-18,-26,-19, 15,-24,-16,  5,-20, 10,  6,-16,-22,-19,-14,-12, -2,  3,-12,  3,-19;
/M: SY='R';  M= -1, -2,-20, -5, -2,-19, -9, -8,-20,  4,-19,-12,  3,-12,  0,  9,  7,  6,-13,-27,-13, -2;
/M: SY='N';  M= -2,  4,-22,  0, -2,-18, -6, -6,-19, -3,-19,-13,  6,-15, -1, -4,  3, -1,-17,-18,-10, -2;
/M: SY='V';  M= -1,-19,-17,-21,-15, -6,-21,-18,  7,-16,  4,  4,-17,-13,-14,-16, -9, -4,  8,-21, -9,-15;
/M: SY='R';  M=-11, -2,-25, -3,  3,-23,-18, -4,-24, 23,-21, -9,  1,-15,  7, 26, -6, -7,-17,-23,-10,  3;
/M: SY='K';  M= -7, -7,-23, -9, -2, -8,-17, -6,-16,  6,-12, -6, -5,-16, -3,  6, -7, -7,-11,-17, -3, -3;
/M: SY='F';  M=-10,-20,-22,-25,-18, 21,-25,-15,  4,-18,  9,  4,-16,-23,-19,-14,-15, -7,  2, -8,  8,-18;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='D';  M=-14,  0,-21,  3, -7,  1,-21,-10, -6,-16,  2, -5, -5,-20,-14,-15,-12, -8, -7,-20, -2,-11; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='F';  M= -5,-10,-11,-11,-11,  4,-10, -9,  2,-10,  2,  1, -8,-13,-11, -9, -8, -5,  2, -9,  1,-11; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='D';  M= -4,  1,-10,  2,  1, -9, -5, -5, -8, -2, -7, -6,  1, -7, -2, -3, -1, -3, -7,-14, -7, -1; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
/M: SY='P';  M=-10, -7,-26, -7, -5, -9,-14, -4,-15, -6,-16,-10, -5,  3, -7, -7, -7, -7,-16,-17, -3, -8;
/M: SY='H';  M=-12, -2,-27, -3, -1,-21, -8, 29,-27,  1,-21, -8,  5,-16,  3, 10, -3, -9,-22,-26, -3, -2;
/M: SY='P';  M= 11,-16,-13,-17,-10,-20,-10,-20,-11,-14,-15,-11,-15, 19,-13,-20, -2, -5, -9,-26,-21,-14;
/M: SY='H';  M=-16, 11,-26,  5, -1,-18,-13, 59,-25, -6,-22, -7, 23,-20,  5,  0, -3,-12,-28,-29,  6, -1;
/M: SY='I';  M=-10,-29,-22,-34,-26,  9,-31,-24, 24,-25, 15, 10,-24,-25,-22,-23,-20,-10, 16, -2,  5,-25;
/M: SY='E';  M= -9,  4,-28, 10, 38,-28,-19, -1,-25,  9,-19,-13, -1, -5, 22,  4,  0, -8,-25,-27,-16, 29;
/M:         M= -2,-12,-21,-13, -7,-16,-15,-14, -9, -2,-14, -6, -9,  0, -7, -4, -2, -2, -5,-25,-13, -9;
/M: SY='A';  M= 13,-14, -8,-20,-13,-13,-15,-17, -4, -8, -6, -2,-12,-15,-10, -7,  0, -1,  3,-25,-14,-12;
/M: SY='R';  M=-13, -4,-27, -6,  2,-21,-17, -4,-25, 25,-21, -9,  1,-16,  7, 35, -7, -8,-18,-20, -9,  2;
/M: SY='G';  M= -1, -1,-23, -3,-10,-25, 29,-12,-29,-10,-26,-17,  6,-17,-10, -9,  6, -8,-22,-26,-22,-11;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='T';  M=  0,  4,-11,  0, -3,-12, -5, -8,-12, -4,-13,-10,  7, -7, -3, -4, 12, 16, -8,-23,-11, -3; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='P';  M= -2,-11,-23,-10, -5,-16,-17,-13,-11, -8,-14, -9,-10,  6, -7, -9, -4, -5,-10,-19,-13, -8; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='E';  M= -3,  0,-25,  1, 10,-22,-15, -4,-20,  7,-17,-10, -1,-10,  7,  5, -1, -5,-17,-24,-11,  8;
/M: SY='Q';  M=  0,  5,-24,  6, 13,-29,-13, -1,-23,  7,-20,-11,  2,-10, 18,  3,  1, -7,-21,-25,-14, 15;
/M: SY='A';  M= 12,  0, -7,-10,-11,-15, -6,-13, -9,-11,-13,-10,  6,-18,-11,-14,  5,  0, -5,-26,-17,-11;
/M: SY='R';  M= -9,-15,-25,-17, -9, -6,-23,-11, -2, -3, -4, -1,-11,-20, -5,  2,-12, -9, -3, -8,  2, -9;
/M: SY='D';  M= -4, 13,-23, 15, 11,-25,-12, -5,-23,  3,-19,-16,  7,-11,  2, -2,  1, -3,-18,-29,-16,  6;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 19,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10, -9, 30, 78,-20;
/M: SY='C';  M= -4,-22, 59,-30,-27,-13,-29,-28, -6,-26, -7, -8,-20,-31,-26,-26,-10, -6,  6,-38,-20,-27;
/M: SY='T';  M= -3, -5,-19, -9, -3,-17,-12,-10,-15,  2,-15, -6, -2,-14, -1,  2,  5,  6,-10,-25,-11, -2;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-29,-19, -9,-29, 46,-29,-10,  0,-10, 10, 28, -9,-10,-20,-21,-10, 10;
/M: SY='D';  M=-11, 20,-27, 29, 27,-31, -9, -1,-31,  1,-24,-21,  8, -6,  6, -6,  2, -7,-26,-32,-18, 16;
/M: SY='G';  M= -5,  7,-28, 11,  3,-30, 23,-10,-33, -7,-26,-20,  5,-10, -6,-11,  1,-12,-26,-27,-23, -2;
/M: SY='B';  M= -7, 12,-21, 12,  3,-22,-11, -8,-19, -1,-19,-14,  9,-12, -2, -5,  5,  6,-14,-31,-14,  0;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='R';  M= -7, -7,-16, -8, -3, -5,-13, -5, -8,  1, -8, -5, -4,-10, -3,  8, -4, -3, -5,-11, -2, -4; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='F';  M=-10,-19,-26,-20,-14,  6,-22,-11, -3,-14, -4, -3,-16, -3,-14,-14,-12, -7, -5, -7,  6,-15;
/M: SY='Y';  M= -9,-17,-22,-20,-14,  4,-22,-14, -2,-14, -3, -3,-15,-21,-14,-13,-12, -7, -3,  4,  5,-13;
/M: SY='E';  M= -8,  6,-26, 11, 31,-25,-17, -3,-23,  5,-18,-15,  0, -5, 11,  1,  1, -5,-22,-27,-15, 20;
/M: SY='Y';  M=-11,-15,-23,-18,-11,  7,-20, -4, -8,-11, -5, -4,-12,-20,-11, -8,-11, -8, -8, -2, 11,-12;
/M: SY='G';  M= -1, -7,-28, -7,-16,-28, 54,-18,-36,-17,-28,-19,  1,-17,-17,-18,  1,-16,-27,-22,-27,-17;
/M: SY='E';  M= -5,  1,-21,  2, 10,-20,-17, -8,-16,  0,-15,-11, -1, -9,  2, -4,  3,  5,-11,-28,-13,  5;
/M:         M=-10,-16,-22,-17,-10,  0,-21,-14, -9, -9, -7, -5,-14, -2,-12, -7,-12, -7, -9,-12, -3,-12;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_02 which contains 571'282 sequence entries.

Total number of hits	74 in 74 different sequences
Number of true positive hits	74 in 74 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Taxonomic range [info]	Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	CRESS-DNA virus Rep endonuclease
Version [info]	1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

74 sequences

MREP_BBTVA  (Q86567), MREP_FBNY1  (Q9WIJ5), MREP_FBNY2  (O39828),

MREP_MDV1   (Q9IR51), MREP_SCSVF  (Q9ICP7), REP10_MDV1  (Q9Z034), 
REP1_FBNY1  (O91254), REP1_FBNY2  (Q66862), REP1_MDV1   (Q9Z0D5), 
REP2_MDV1   (Q9Z0D4), REP2_SCSVF  (Q87009), REP3_MDV1   (Q9Z0D3), 
REP6_SCSVF  (Q87013), REP7_FBNY1  (Q9WIK0), REP7_FBNY2  (O91250), 
REP9_FBNY1  (P0CK60), REP9_FBNY2  (P0CK61), REPA_BEYDV  (O39521), 
REPA_CSMV   (P18921), REPA_MISV9  (Q67591), REPA_MSVK   (P03568), 
REPA_MSVN   (P14980), REPA_MSVPA  (Q91MG1), REPA_MSVRA  (Q91MF7), 
REPA_MSVS   (P14990), REPA_MSVSE  (O40987), REPA_MSVTA  (Q9IGY6), 
REPA_PASVK  (Q00338), REPA_SSVN   (Q89822), REPA_TYDVA  (P31617), 
REPA_WDVS   (P06847), REPE_ONYPE  (P60470), REP_ABMVW   (P21947), 
REP_BCTVC   (P14991), REP_BEYDV   (O39522), REP_BFDV(Q9YUD3), 
REP_BGYMJ   (P0CK40), REP_BGYMV   (P0CK39), REP_CACV(Q912W1), 
REP_CALCV   (Q96704), REP_CLVK(P14982), REP_CLVN(P14972), 
REP_CSMV(P18919), REP_GOCV(Q91EK3), REP_HCYV5   (D4N3P2), 
REP_ICMV(Q82676), REP_MISV9   (Q67590), REP_MSVK(P14988), 
REP_MSVN(P14978), REP_MSVPA   (Q91MG2), REP_MSVRA   (Q91MF8), 
REP_MSVS(P14989), REP_MSVSE   (O40986), REP_MSVTA   (Q9IGY7), 
REP_MYMVV   (Q9YPS2), REP_PASVK   (P0C647), REP_PCV1(Q805H4), 
REP_PCV2(Q8BB16), REP_PHUV(Q06923), REP_PICV(Q9IG45), 
REP_PYMVV   (P27258), REP_SLCV(P29048), REP_SSVN(Q80GM6), 
REP_TGMVY   (P03567), REP_TLCVA   (P36279), REP_TMOV(Q06657), 
REP_TPCTV   (Q88888), REP_TYCS1   (P38609), REP_TYCS2   (Q67620), 
REP_TYCSV   (P27260), REP_TYDVA   (P31618), REP_TYLCC   (Q9DXE5), 
REP_TYLCI   (P27259), REP_WDVS(Q67622)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

11 PDB

1L2M; 1L5I; 2HW0; 2HWT; 6H8O; 6Q1M; 6WDZ; 6WE0; 6WE1; 7KIK; 8H56