PROSITE entry PS52026
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | GL_GHV |
| Accession [info] | PS52026 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
13-SEP-2023 CREATED;
13-SEP-2023 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC52024 |
| Associated ProRule [info] | PRU01370 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Gammaherpesvirus glycoprotein L (gL) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=116; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=111; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4041522; R2=0.0109830; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=783; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=373; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-250; E1=-250; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='L'; M=-11,-10,-21,-16,-15, 4,-22, -9, 5,-13, 11, 5, -4,-25,-13, -8,-14, -4, 0,-19, 2,-14; /M: SY='P'; M= -8,-17,-36, -9, 0,-29,-18,-14,-20,-10,-30,-19,-16, 75, -8,-18, -5, -7,-28,-31,-27, -9; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='H'; M= 6, 11,-22, 9, 1,-25, -9, 16,-24, -1,-21,-13, 11,-14, 0, -4, 1, -7,-19,-29,-10, -1; /M: SY='I'; M= -8,-30,-26,-38,-29, 1,-38,-29, 45,-28, 20, 18,-22,-22,-22,-28,-19, -8, 32,-22, -2,-29; /M: SY='Q'; M= -9, -7,-22,-12, -6, -6,-22, 4, -5, -9, -7, -1, -2,-19, 6, -6, -2, 0, -7,-20, 3, -1; /M: SY='A'; M= 15,-10,-21,-14, -7,-19, -9, -9,-10, -9,-12, -8, -8, 2, -2,-14, 0, -5, -9,-22,-13, -6; /M: SY='L'; M= -4,-13,-19,-14, -9, -9,-13,-14, -5, -8, 4, 1, -9,-19, -8, -5, -2, 2, -4,-26,-10, -9; /I: I=-5; MD=-25; /M: SY='B'; M= 7, 8,-20, 7, 0,-23, -7, -9,-20, -4,-21,-17, 7, 4, -4, -8, 7, 1,-16,-29,-19, -3; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='A'; M= 12, -7,-18, -8, 0,-18, -9,-16, -7, -4,-10, -8, -9,-13, -7,-11, 0, -5, 1,-24,-16, -4; D=-5; /I: I=-5; DM=-25; /M: SY='S'; M= -1, -1,-17, -2, 1,-15,-12, -7,-17, -2,-21,-13, 3,-12, -1, -3, 17, 12, -9,-31,-12, 0; /M: SY='T'; M= -4, 0,-19, -5, -2,-18,-12, -1,-15, -5,-16, -9, 5,-13, 3, -3, 10, 13,-12,-29,-10, 0; /M: SY='L'; M=-11,-29,-25,-31,-22, 7,-31,-19, 21,-27, 28, 16,-25,-20,-19,-21,-25,-11, 11,-12, 1,-22; /M: SY='P'; M= -7,-13,-33, -7, -3,-23,-14,-16,-17,-11,-21,-16,-13, 51,-10,-18, -7, -8,-23,-27,-21,-10; /M: SY='L'; M= 1,-11,-18,-12, -3, -5,-15,-12, -5,-15, 3, -4, -8,-15, -8,-14, 1, 0, -5,-25, -7, -6; /M: SY='F'; M=-13,-28,-25,-33,-24, 26,-31,-23, 14,-26, 11, 5,-22, -8,-27,-22,-19, -9, 8,-11, 5,-25; /M: SY='F'; M=-17,-21,-22,-27,-14, 51,-27,-12, -7,-18, 2, -4,-15,-25,-25,-11,-14, -9, -7, 3, 24,-17; /M: SY='E'; M= 8, 11,-20, 11, 20,-25, -9, -6,-22, -1,-20,-18, 8, -8, 4, -8, 10, 0,-18,-31,-20, 12; /M: SY='V'; M= 0,-28,-18,-33,-28, -2,-31,-29, 34,-23, 12, 12,-24,-24,-24,-24,-12, -4, 38,-25, -7,-28; /M: SY='H'; M= -3, 1,-18, -3, -5,-17,-13, 19,-16, -5,-19, -9, 9,-16, -2, -2, 9, 6,-11,-32, -6, -5; /M: SY='S'; M= -1, 1,-20, 4, 5,-21, -8,-11,-24, 0,-27,-19, 3,-11, 1, -4, 17, 7,-16,-18,-13, 3; /M: SY='I'; M=-11,-30,-28,-40,-30, 10,-38,-28, 43,-29, 19, 19,-20,-21,-22,-28,-20,-10, 26,-16, 4,-29; /M: SY='H'; M=-17,-10,-27,-11,-10, -1,-25, 52,-12,-12, -7, 1, -5,-24, -2, -6,-13,-11,-14,-11, 34,-10; /M: SY='F'; M=-14,-30,-21,-36,-26, 42,-31,-21, 14,-30, 26, 10,-24,-29,-30,-21,-23,-10, 9, -6, 14,-26; /M: SY='T'; M= 11, -2,-13,-11,-11,-11,-12,-13, -5,-10,-11, -9, 2,-16,-11,-13, 10, 14, 2,-26,-10,-11; /M: SY='D'; M= -6, 20,-23, 27, 6,-26,-11, -7,-21, -6,-20,-19, 11, -8, -4,-12, 5, -3,-16,-35,-18, 1; /M: SY='P'; M=-10,-16,-34,-11, -4,-23,-20,-18,-13,-12,-19,-14,-14, 60,-11,-18,-11, -9,-22,-30,-25,-11; /M: SY='N'; M= -1, 12,-23, 7, 8,-25, -7, 1,-20, 3,-23,-13, 18,-13, 9, -1, 5, -4,-21,-30,-16, 8; /M: SY='H'; M= -9, -5,-21, -9, -8,-12,-20, 21,-17,-10,-12, -6, 0,-16, -3, -4, 3, 14,-13,-17, 3, -7; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='N'; M= -9, 14,-27, 10, 2,-30, 8, -2,-28, 3,-28,-16, 20,-10, 7, -1, 1, -9,-29,-29,-20, 4; /M: SY='G'; M= -3, -4,-29, -7,-17,-25, 52,-13,-35,-15,-28,-18, 6,-21,-16,-13, 0,-16,-28,-20,-22,-17; /M: SY='V'; M= -9,-21,-19,-24,-19, 6,-26,-19, 6, -9, 2, 2,-16,-24,-17, 4, -9, 0, 14,-20, -3,-19; /M: SY='C'; M= -4, 6, 28, -3,-10,-20,-11, -6,-24,-13,-26,-19, 16,-23, -9,-13, 12, 2,-17,-43,-22,-10; /M: SY='V'; M= -3,-28,-16,-31,-28, 0,-32,-28, 31,-23, 15, 12,-26,-27,-26,-22,-13, 0, 38,-27, -7,-28; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='K'; M= -7, -3,-23, -6, 2,-20,-19, -6,-18, 12,-16, -7, -2,-13, 12, 9, 3, 7,-14,-21, -5, 6; /M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-32,-25, 14,-31,-24, 24,-28, 33, 16,-28,-29,-24,-21,-23, -8, 20,-19, 1,-25; /M: SY='R'; M=-15, -7,-26,-10, -4, -9,-21, 4,-16, 8,-11, -5, 0,-21, 5, 24, -8, -6,-14,-17, 3, -2; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='Y'; M= -4, -6,-19, -7, -4, -8,-15, 3,-12, -4,-16, -8, -2,-16, 3, -5, 9, 6, -9,-16, 10, -2; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='K'; M= -9, -5,-27, -7, 0,-22,-20,-10,-20, 25,-21, -9, -1, -8, 3, 25, -7, -5,-13,-23,-12, 0; /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='R'; M= -6, -1,-16, -3, 0,-14, -6, -3,-14, 10,-13, -3, 2, -9, 5, 13, -1, -2,-11,-15, -8, 1; D=-4; /I: I=-4; DM=-22; /M: SY='N'; M= -2, 10,-16, 2, -3,-16,-12, -6,-11, -6,-14,-10, 14,-15, 0, -6, 8, 12, -9,-30,-13, -2; D=-4; /I: I=-4; DM=-22; /M: SY='G'; M= -4, 3,-23, 2, -5,-24, 15, 7,-29, -5,-26,-15, 9,-15, -4, -6, 7, -5,-22,-28,-14, -5; D=-4; /I: I=-4; DM=-22; /M: SY='N'; M= -4, 12,-21, 10, 4,-25,-11, -3,-21, 2,-22,-12, 13,-13, 10, 1, 10, 5,-18,-31,-15, 7; /M: SY='V'; M= -3,-20,-19,-24,-21, -6,-21,-23, 18,-21, 5, 5,-14,-18,-18,-20, -5, 0, 19,-28,-10,-21; /M: SY='T'; M= -3, -5,-15,-13,-11, -9,-23,-17, -4, -8, -7, -5, -5,-13, -7, -9, 10, 33, 3,-25, -5,-10; /M: SY='T'; M= -7,-13,-19,-17,-13,-10,-25, -1, 2,-10, -1, 2,-10,-19, -8, -7, -4, 8, 8,-27, -3,-12; /M: SY='E'; M= -7, -4,-23, 0, 15,-14,-21, -9,-11, -6, -6, -9, -8, -8, -1, -9, -1, 0, -9,-26, -8, 7; /M: SY='I'; M= -6,-15,-20,-19,-10, -7,-26,-19, 9,-13, 4, 2,-12,-17,-10, -8, -4, 7, 9,-26, -8,-12; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='V'; M= 13,-20,-12,-23,-21,-10,-11,-25, 9,-17, -3, -1,-18,-22,-21,-19, 1, 0, 25,-28,-15,-21; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 73,-30,-20, 2,-30, 14, 2,-21,-30,-38,-20,-21,-10, 1, 7, 27,-29; /M: SY='N'; M= -6, 28,-21, 13, -2,-20, 1, 19,-22, -3,-27,-16, 44,-19, 0, -3, 7, -4,-28,-36,-15, -2; /M: SY='L'; M= -6,-30,-17,-30,-24, 6,-30,-24, 25,-26, 35, 16,-30,-30,-24,-20,-22, -6, 25,-24, -4,-24; /M: SY='M'; M= -8,-18,-24,-23,-14, -9,-22, -9, 4, 1, 2, 18,-12,-20, -2, 15,-13, -8, 4,-21, -6,-11; /M: SY='S'; M= 17, -2,-11, -4, -3,-20, 3,-12,-19,-10,-26,-18, 6,-10, -3,-12, 32, 14, -9,-35,-20, -3; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-39,-30, 78,-30,-19, 0,-29, 10, 0,-20,-30,-39,-20,-20,-10, 0, 11, 32,-30; /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22, 27,-30,-20, 15,-30, 40, 15,-28,-30,-25,-20,-28,-10, 8,-13, 7,-22; /M: SY='L'; M= -6,-26,-21,-29,-20, 1,-27,-23, 23,-25, 27, 14,-24,-25,-19,-21,-20, -8, 17,-22, -5,-21; /M: SY='A'; M= 28, -4,-15,-13, -7,-20, -5, -8,-15, -4,-14,-11, 0,-13, -5, -4, 8, 0, -7,-23,-16, -7; /M: SY='V'; M= -1,-29,-15,-31,-27, 1,-30,-28, 30,-23, 18, 13,-27,-27,-25,-22,-14, -4, 37,-26, -7,-27; /M: SY='L'; M= -8,-27,-19,-29,-22, 10,-29,-19, 20,-25, 30, 16,-26,-28,-21,-19,-20, -6, 17,-19, 2,-22; /M: SY='R'; M= -8, -1,-25, -1, 5,-24,-16, -1,-20, 12,-20, -9, 1,-15, 17, 18, 1, -5,-17,-22, -7, 9; /M: SY='R'; M=-15, -5,-29, -6, 2,-24,-14, -3,-29, 28,-24,-11, 3,-17, 10, 48, -7, -9,-21,-22,-12, 3; /M: SY='L'; M= -4,-26,-19,-29,-21, 5,-27,-22, 20,-25, 25, 12,-23,-25,-20,-21,-15, -5, 17,-22, -3,-21; /M: SY='G'; M= -3, 1,-24, 3, -1,-26, 13,-12,-28, -6,-28,-19, 6, -2, -5, -7, 10, -1,-22,-30,-22, -4; /M: SY='Y'; M= -7, -4,-20, -4, -5, 1,-17, -4,-10,-13, -5, -8, -3,-19, -8,-12, 2, 2, -9,-17, 8, -7; /M: SY='R'; M= -5, -2,-27, -7, -4,-17,-11, -9,-22, 7,-24,-15, 5,-12, -1, 11, -2, -6,-21, -1, -9, -3; /M: SY='T'; M= 10,-12,-13,-18,-13, -9,-18,-10, -2,-15, 1, -2,-11,-17,-12,-15, 2, 13, 6,-26, -8,-13; /M: SY='P'; M= -5, -3,-25, -1, 9,-21,-16, -5,-17, -6,-21,-15, 0, 16, -1,-10, 7, 5,-18,-30,-15, 2; /M: SY='Q'; M=-10, 4,-28, 7, 15,-30,-10, -3,-25, 7,-23,-13, 3, -3, 16, 7, 0, -8,-24,-27,-17, 14; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='E'; M= -6, 8,-23, 11, 22,-18,-15, 1,-20, 0,-13,-12, 2, -9, 10, -4, -2, -8,-20,-23,-11, 16; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='B'; M= -9, 20,-18, 18, 16,-18, -7, 3,-19, 4,-18,-14, 20, -8, 5, 2, 2, -4,-20,-24,-13, 10; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: SY='L'; M= -7, -7,-17, -6, -7, -4,-17, -6, 0,-12, 7, 1, -7,-18, -5,-10, -7, -3, -1,-17, 1, -6; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: SY='R'; M= -8, 5,-19, 4, 5,-19,-11, -2,-20, 9,-18,-11, 7,-11, 7, 19, 4, 2,-16,-23,-11, 5; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22, 23,-30,-19, 16,-29, 41, 18,-28,-30,-23,-20,-28,-10, 8,-14, 6,-21; /M: SY='L'; M= -8,-21,-22,-23,-15, -3,-26,-17, 6,-10, 19, 8,-18,-24,-11, 2,-17, -5, 5,-21, -5,-15; /M: SY='N'; M= 0, 4,-25, -1, 5,-19,-10, -3,-21, 1,-23,-16, 8,-14, 2, -4, 0, -7,-22, -2, -9, 4; /M: SY='Y'; M=-12, -7,-26, -9, -8, 0,-22, 21,-10, -7, -5, -2, -6,-22, 1, -4,-11, -7,-14, -5, 29, -6; /M: SY='L'; M= -9,-29,-19,-31,-22, 8,-30,-21, 23,-28, 42, 21,-29,-29,-20,-20,-26, -9, 16,-21, -1,-21; /M: SY='Q'; M= -9, -3,-25, -6, 5,-21,-21, -6,-12, 7,-12, -5, 0,-13, 13, 9, -2, 0,-13,-24,-10, 8; /M: SY='R'; M= -3, -9,-21,-12, -4,-14,-20,-10,-10, 3, -9, -5, -6,-15, 0, 8, 0, 6, -6,-21, -5, -3; /M: SY='Y'; M= 0,-14,-17,-15,-11, 0,-16, -7, -3,-16, 2, -3,-10,-20, -9,-14, 4, 3, -3,-18, 7,-11; /M: SY='L'; M=-12,-13,-26,-12, 2,-13,-24, -4, -7, 2, 8, 4,-12,-19, 5, 6,-16,-10,-10,-22, -5, 3; /M: SY='T'; M= -5, 11,-18, 9, 5,-20,-13, -4,-19, -2,-20,-15, 10,-12, -1, -5, 13, 15,-13,-34,-14, 1; /M: SY='Q'; M= 2, 0,-21, 0, 4,-21,-16,-10,-10, -7, -9, -7, -4,-13, 6,-10, 3, 1, -8,-27,-13, 5; /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25, 55,-30, 0, 0,-20, 5, 0,-20,-30,-25,-15,-20,-10, -5, 20, 55,-25; /M: SY='T'; M= 6, -6,-15, -8, -9,-12,-12,-16, -7,-15, -1, -6, -7,-16,-11,-15, 6, 10, -1,-28,-13,-10; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='A'; M= 8, -7,-15, -8, 0,-16,-11, -7, -8, -6,-11, -7, -5,-13, -1, -8, 8, 1, -2,-26,-12, -1; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='N'; M= 0, 5,-22, 1, 3,-23, 1, -9,-22, 5,-24,-15, 11,-13, -2, -1, 6, 0,-17,-29,-18, 1; /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28, 63,-30,-20, 5,-30, 20, 5,-22,-30,-35,-20,-22,-10, 2, 3, 23,-28; /M: SY='S'; M= 1, 10,-16, 4, 2,-20, -3, -7,-21, -2,-26,-18, 19,-12, 0, -4, 22, 14,-16,-36,-18, 1; /M: SY='A'; M= 12, -8,-18,-10,-11,-16,-17,-20, 1,-11, -6, -5,-10,-12,-13,-17, -1, 0, 8,-26,-14,-13; /M: SY='T'; M= -3, -3,-18, -3, 6,-13,-18,-13,-11, -4,-13,-10, -4,-13, -2, -7, 8, 11, -3,-29,-12, 2; /M: SY='T'; M= -6, 9,-17, 4, -3,-16,-16, 1,-18, -5,-17,-12, 10,-13, -4, -6, 12, 24,-12,-31, -7, -4; /M: SY='A'; M= 20, -7,-13,-14,-10,-14,-12,-19, -5,-13, -4, -6, -7,-13,-11,-17, 8, 14, 1,-25,-14,-11; /M: SY='N'; M=-12, 29,-23, 25, 2,-16, -4, 1,-25, -2,-26,-20, 32,-17, -4, -5, 5, -4,-25,-33,-15, -1; /M: SY='S'; M= 5, 1,-15, -1, -3,-20, 5,-13,-21,-10,-24,-17, 6,-12, -6,-11, 23, 18,-12,-33,-19, -5; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='S'; M= 4, 1,-13, 1, 4,-19, -5, -7,-16, -6,-23,-15, 8, -9, 3, -5, 26, 11,-11,-33,-16, 3; D=-4; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='I'; M= -7,-13,-22,-16, -8, -9,-17,-14, 2, -5, -6, -1, -7,-15, -4, -1, -4, -5, 2,-21, -7, -8; D=-4; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='F'; M=-13,-17,-18,-21,-15, 30,-21, 3, -5,-17, 5, 1,-10,-21,-18,-10,-12, -8, -5, -6, 14,-15; D=-4; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='N'; M= -6, 3,-20, -1, -3,-13, 1, -4,-20, 8,-21,-12, 11,-14, -2, 5, 1, -5,-17,-18, -7, -3; D=-4; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='V'; M= -3,-17,-10,-20,-17, 4,-20,-17, 14,-15, 11, 8,-16,-18,-16,-13, -8, 3, 19,-17, -3,-17; D=-4; /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22; /M: SY='N'; M= 1, 5,-15, -1, -6,-13, -6, -9, -7, -6,-10, -7, 9,-13, -6, -8, 3, 2, -6,-23,-12, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-22; /M: SY='A'; M= 7,-11,-18,-18,-13, -8,-18,-15, 1,-13, -5, -4, -8,-11,-11,-14, 2, 7, 2,-20, -3,-14; /M: SY='N'; M= -9, -3,-25, -7, -6,-13,-20,-10, -4, -4,-13, -7, 2,-13, -4, -5, -2, -1, -7,-17, -6, -7; /M: SY='H'; M=-10,-12,-24,-15,-10, -9,-22, 4, -2, -6, -2, 1, -4,-21, -5, 3, -7, -6, -3,-24, -1,-10; /M: SY='G'; M= -4, -5,-26, -9, -9,-21, 3,-13,-11,-13,-18,-10, 3, 0, -6,-15, 2, -6,-15,-28,-19, -9; /M: SY='R'; M= 0, -9,-22,-11, -5,-19,-12,-12,-14, -1,-13, -8, -5, -5, 0, 4, 4, 4,-11,-26,-14, -4; /M: SY='V'; M= -8,-17,-22,-18,-13, -7,-21, -7, 0, -1, 0, 5,-16,-23, -8, -2,-13, -8, 6,-18, 2,-12; /M: SY='A'; M= 10,-11,-22,-14, -8,-19, 3,-17,-11,-10, -9, -7, -8,-11, -8,-14, -2, -8, -7,-23,-18, -8; /M: SY='K'; M= -5, -4,-29, -3, -4,-19,-11,-15,-23, 5,-20,-15, -7,-11, -5, -1, -8, -7,-19, 5, -7, -4; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | gL gammaherpesvirus-type |
| Version [info] | 1 |