PROSITE logo

PROSITE entry PS52094


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS52094

Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] LNS2_IG_C
Accession [info] PS52094
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 10-JUN-2026 CREATED;
10-JUN-2026 DATA UPDATE;
10-JUN-2026 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC52092
Associated ProRule [info] PRU01438

Name and characterization of the entry

Description [info] Lipin/Ned1/Smp2 (LNS2)-associated immunoglobulin (Ig)-like domain C-terminal part profile.
Matrix / Profile [info] 
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1373808; R2=0.0157411; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=436; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=278; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...
 
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='P';  M=  2, -8,-26,-10, -3,-16,-17,-12, -8, -9,-15,-10, -5, 16, -7,-15, -2, -1,-12,-23,-10, -8;
/M: SY='K';  M= -5,  4,-26, -1,  4,-24, -4, -5,-24, 16,-23,-10,  9,-14,  3, 15, -3, -8,-20,-25,-15,  3;
/M: SY='K';  M= -8,  1,-22, -4, -4,-19,-18,-10,-12, 18,-19, -7,  6,-18, -3, 12, -5, -5, -4,-27,-12, -4;
/M: SY='Q';  M=  2, -2,-22, -3,  8,-26, -6, -8,-23,  7,-22,-12,  1,-11, 11,  6,  8,  1,-18,-26,-16,  9;
/M: SY='F';  M=-13,-21, -5,-27,-21, 23,-27,-13, -2,-19,  1, -2,-15,-26,-20,-12,-10, -3, -1, -9, 15,-21;
/M: SY='Q';  M= -5,-13,-25,-15, -1, -9,-24,-13,  0, -2, -6,  0,-11,-15,  4, -5, -8, -8, -1,-19, -5,  1;
/M: SY='R';  M=-14, -8,-28, -8,  0,-22,-21, -7,-23, 32,-20, -8, -4,-17,  5, 44,-10, -9,-12,-21,-10,  0;
/M: SY='T';  M=  2, -1,-17, -7,  2,-17,-17,-14,-17,  4,-15,-11, -1,-10, -2,  4,  9, 22, -8,-26,-13, -1;
/M: SY='L';  M=-12, -7,-22,-14,-14,  3,-21,  2,  4,-19, 13,  5,  2,-25,-12,-13,-15, -8, -5,-24, -1,-14;
/M: SY='R';  M= -5,-11,-20,-15,-11,-11,-19,-12, -5,  1, -4, -3, -5,-22, -8, 16, -6, -2,  3,-25,-11,-11;
/M: SY='P';  M= -3,-21,-31,-16, -6,-19,-20,-20, -9,-15, -8, -9,-21, 48,-13,-20,-13, -9,-16,-26,-21,-13;
/M: SY='T';  M=  1, -4,-12,-11,-10,-11,-18,-19, -5,-12,-11, -9,  0,-11, -9,-12, 19, 36,  1,-31,-11,-10;
/M: SY='S';  M=  5,  3,-16, -1, -2,-20, -6,  3,-19, -8,-24,-15, 12, -5, -2, -9, 20, 10,-15,-35,-15, -3;
/M: SY='E';  M=  5,  8,-23,  9, 13,-27,  7, -8,-27, -4,-23,-19,  8,-10,  0,-10,  8, -5,-22,-29,-22,  7;
/M: SY='Q';  M=-10, -6,-29, -6, 14,-28,-23,  1, -9,  1, -7,  2, -6,-12, 37,  1, -6,-10,-18,-21, -9, 25;
/M: SY='L';  M=-11,-30,-22,-33,-23, 17,-32,-22, 23,-30, 40, 18,-27,-28,-22,-22,-27,-10, 12,-16,  4,-23;
/M: SY='K';  M=  5,  5,-23,  2, 13,-26,-12, -8,-24, 19,-24,-14,  6, -9,  6,  7,  3, -4,-18,-26,-16,  9;
/M: SY='S';  M=  4, -2, -5, -3, -2,-21,-11,-12,-18, -5,-16,-12, -1,-15,  0, -8, 11,  3,-11,-32,-17, -1;
/M: SY='L';  M=-11,-29,-20,-31,-21, 17,-29,-18, 18,-28, 42, 23,-28,-29,-20,-19,-28,-10,  9,-17,  3,-20;
/M: SY='N';  M= -9, 15,-27, 10,  3,-27, -1, -4,-27, 16,-30,-17, 21, -7,  1,  7, -1, -8,-26,-29,-18,  1;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='K';  M= -8, -4,-26, -5,  5,-26,-21,-10,-19, 29,-22, -6, -4,-12, 12, 17, -5, -3,-11,-22,-10,  8;
/M: SY='Y';  M=-15,  7,-29,  9,  9,-10,-18,  8,-18, -1,-17,-13,  5, -8,  5, -6, -6, -8,-23,-12, 13,  5;
/M: SY='G';  M=  1, -9,-28, -9,-18,-29, 62,-19,-38,-19,-30,-20,  1,-19,-18,-19,  5,-15,-28,-22,-29,-18;
/M: SY='Q';  M= -6, -4,-28, -2, 16,-23,-19, -1,-19, 12,-17, -5, -6, -4, 18,  4, -5, -9,-21,-17, -4, 16;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='D';  M= -9, 11, -8, 12,  1,-24,-17,-11,-24,  5,-21,-13,  3,-14, -3, -3,  3,  7,-14,-32,-15, -1;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='I';  M=  1,-22,-18,-27,-20, -2,-24,-22, 22,-22, 15,  9,-17,-19,-16,-21, -9, -4, 18,-21, -6,-20; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='E';  M= -8,  4,-22,  6, 13,-22,-18, -6,-19,  8,-16,-11,  0,-10,  9,  8,  1,  4,-13,-25,-12, 10; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='F';  M=-18,-27,-18,-36,-27, 73,-27,-18,  0,-27,  9,  0,-18,-27,-36,-18,-18, -9,  0,  9, 27,-27; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='S';  M=  1, -7,-13,-10, -8,-12,-13, -4, -4,-13,-13, -7, -1,-14, -6,-12, 16, 13,  2,-30, -9, -8; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='F';  M= -4,-25,-18,-32,-24, 23,-26,-22, 17,-23, 13,  7,-20,-23,-25,-21,-14, -6, 16,-11,  5,-24; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='S';  M=  0,  2,-17,  1,  5,-12,-12, -8,-17, -5,-16,-12,  1,-10,  3, -7, 11,  9,-12,-24,-10,  5; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='T';  M= -3, -3,-18, -5, -5,-17, -7,  7,-19,-10,-19,-11,  2,  0, -4, -9, 11, 13,-14,-28, -9, -6; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='N';  M= -7, 12,-15, 11,  5,-16, -6,  1,-15,  8,-15, -9, 13, -8,  6,  7,  0, -4,-15,-17, -8,  5; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='F';  M= -7,-12,-13,-14,-10,  9,-16, -8,  4, -5,  5,  3,-10,-13,-10, -5,-10, -5,  3, -5,  7,-10; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='Q';  M= -3, -4,-16, -4,  5,-20,-12, -1, -9, -1,-10, -2, -2,-10, 22,  0,  5, -1,-11,-19, -9, 14; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='G';  M=  0, -8,-24, -7,-12,-24, 40,-16,-29,-14,-25,-17, -1, -2,-13,-16,  3,-11,-23,-20,-24,-13; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='T';  M= -3, -5,-16, -8, -5,-14,-17,-15,-10,  3,-13, -8, -5,  2, -6, -2,  4, 17, -3,-23,-11, -6; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='Q';  M=  5,-11, -8,-14, -4,-20,-17, -9, -7, -2,-10, -2,-10,-16, 10,  0, -2, -5, -2,-22,-13,  2; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='R';  M=-11,-15,-27,-17, -9,-12,-12,-11,-11, -2, -7, -4,-10,-18,  1, 10,-11, -7,-12,  1, -4, -5; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='C';  M= -1,-25, 21,-30,-26, -5,-28,-27, 10,-25,  9,  3,-24,-30,-25,-24,-13, -6, 18,-31,-13,-26;
/M: SY='D';  M= -2, 11,-22, 15, 14,-26,-11, -7,-26,  5,-24,-19,  6, -9,  4,  2, 10,  4,-18,-32,-17,  9;
/M: SY='A';  M= 20, -9,  0,-14,-13,-23, 16,-19,-23,-15,-21,-16, -4,-16,-13,-19, 11, -3,-12,-28,-24,-13;
/M: SY='R';  M=-13,-11,-24,-13, -7, -8,-23,  7,-14,  7, -8, -2, -6,-20, -3, 16,-11, -6, -7,-21,  0, -7;
/M: SY='I';  M= -9,-29,-25,-36,-27,  2,-35,-25, 39,-27, 26, 23,-23,-23,-19,-25,-21, -9, 25,-21, -1,-26;
/M: SY='Y';  M=-20,-24,-26,-27,-24, 49,-30,  5,  0,-17,  4,  0,-20,-30,-21,-14,-20,-10, -6, 23, 61,-24;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-20,-29,-20,  5,-28,-16, 18,-22, 37, 24,-26,-28,-16,-13,-25, -9, 12,-21, -2,-18;
/M: SY='W';  M=-16,-35,-38,-35,-27, 11,-24,-22, -5,-21, -1, -7,-35,-30,-20,-19,-33,-21,-12, 84, 26,-21;
/M: SY='R';  M=-11,  7,-27,  4,  3,-23,-14, 11,-27, 17,-23,-12, 13,-17,  6, 28, -4, -9,-22,-27,-10,  2;
/M: SY='W';  M= -7,-27,-35,-29,-22,  4,-17,-20,-16,-16,-17,-16,-26,-24,-15,-17,-18,-12,-19, 81, 21,-16;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH PS52092
PROMOTED_BY PS52093

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] LNS2-associated Ig-like
Version [info] 1