PROSITE entry PS52092
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS52092
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | LNS2_IG |
| Accession [info] | PS52092 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
10-JUN-2026 CREATED;
10-JUN-2026 DATA UPDATE; 10-JUN-2026 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC52092 |
| Associated ProRule [info] | PRU01438 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Lipin/Ned1/Smp2 (LNS2)-associated immunoglobulin (Ig)-like domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=98; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=93; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9140383; R2=0.0117403; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=774; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=391; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='A'; M= 35,-15,-15,-25,-15,-15,-10,-22, 5,-15, -3, -3,-12,-12,-12,-22, 3, -2, 7,-20,-15,-15; /M: SY='N'; M= -4, 29,-17, 14, 0,-20, 0, 4,-20, -3,-30,-20, 46,-17, 0, -3, 19, 6,-24,-40,-20, 0; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='V'; M= 12,-17,-10,-22,-19, -8,-20,-25, 9,-15, -1, -1,-17,-19,-19,-17, 3, 14, 24,-28,-12,-19; /M: SY='I'; M= -6,-30,-21,-35,-29, 1,-35,-29, 38,-26, 20, 16,-25,-25,-24,-25,-17, -6, 35,-24, -4,-29; /M: SY='V'; M= 24,-20,-10,-25,-20,-10,-16,-25, 11,-15, 0, 0,-20,-20,-20,-20, 0, 0, 26,-25,-15,-20; /M: SY='C'; M= 4, 2, 20, -8, -6,-25,-13, -8,-21, -8,-20,-13, 7,-21, 4,-11, 2, -5,-17,-33,-20, -1; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='G'; M=-10, 19,-30, 28, -1,-35, 32,-10,-40,-10,-30,-25, 10,-15,-10,-15, 0,-15,-30,-30,-25, -6; /M: SY='R'; M=-10,-10,-30,-10,-10,-25, 23,-10,-35, 6,-25,-15, 0,-20, -4, 27, -5,-15,-25,-20,-20,-10; /M: SY='P'; M=-10,-13,-38, -3, 14,-30,-20,-15,-22, -5,-28,-20,-15, 68, -3,-15, -8,-10,-30,-30,-28, 2; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='V'; M= -5,-25,-15,-25,-23, -5,-28,-23, 16, -8, 3, 5,-23,-28,-20, 2,-10, -2, 33,-28,-10,-23; /M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21, 9,-30,-21, 21,-29, 45, 19,-30,-30,-21,-20,-28, -9, 15,-21, -1,-21; /M: SY='N'; M= -3, 9,-14, -1, -9,-13,-12, -9, -6, -8,-16,-11, 18,-19, -9, -8, 12, 15, -2,-35,-15, -9; /M: SY='G'; M= 12,-10,-25,-12,-18,-28, 53,-20,-33,-18,-25,-18, -2,-18,-18,-20, 2,-15,-23,-20,-28,-18; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20, 0,-20, 0, 20,-10, 20, 60,-20,-20, 0,-10,-20,-10, 10,-20, 0,-10; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='M'; M= -7,-23,-17,-30,-23, 0,-23, -9, 23,-13, 17, 46,-23,-23, -9,-13,-17, -7, 21,-23, -3,-16; /M: SY='V'; M= -2,-30,-15,-32,-30, 0,-32,-30, 35,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 45,-28, -8,-30; /M: SY='T'; M= 12, -2,-10,-12,-10,-12,-15,-20,-10,-10,-10,-10, -2,-10,-10,-12, 18, 38, 0,-28,-12,-10; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='T'; M= -5, 0,-15, -8, -8,-12,-20, 9,-15,-10,-12, -8, 2,-12, -5, -8, 13, 33, -7,-30, -3, -8; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='V'; M= -2,-30,-15,-32,-30, 0,-32,-30, 35,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 45,-28, -8,-30; /M: SY='H'; M=-18,-13,-28,-13,-10, 1,-25, 49,-10,-15, 2, 5, -8,-25, -3, -7,-17,-15,-15,-11, 32,-10; /M: SY='I'; M= -6,-30,-22,-36,-30, 0,-36,-30, 42,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 38,-24, -4,-30; /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20, 0,-20, 0, 20,-10, 20, 60,-20,-20, 0,-10,-20,-10, 10,-20, 0,-10; /M: SY='T'; M= 3, -1,-15, -9, -5,-16,-18,-18,-15, 4,-15,-10, -1,-10, -5, -2, 12, 30, -5,-26,-11, -5; /M: SY='Q'; M=-12, 14,-30, 21, 29,-38,-18, 5,-27, 8,-22,-12, 5, -8, 36, 3, 0,-10,-30,-27,-15, 33; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='P'; M= -5,-18,-27,-13, -6,-16,-18,-18, -9,-16, -7, -9,-16, 33,-11,-18, -4, -3,-14,-29,-19,-11; /M: SY='S'; M= 20, -2,-10, -5, -2,-20, 0,-12,-18,-10,-25,-18, 5,-10, -2,-12, 33, 15, -8,-35,-20, -2; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='E'; M=-12, 3,-30, 7, 32,-28,-20, -3,-30, 26,-23,-15, 0, -7, 15, 25, -5,-10,-25,-25,-15, 22; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='I'; M= -5,-23,-18,-28,-23, 0,-30,-25, 24,-23, 18, 10,-20,-22,-20,-20,-11, 7, 23,-25, -5,-23; /M: SY='H'; M=-20,-10,-28,-12,-10, 10,-24, 61,-19,-15,-10, 0, -1,-24, -5, -6,-14,-16,-20,-13, 30,-10; /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23, 30,-30,-20, 14,-30, 39, 14,-27,-30,-26,-20,-27,-10, 7,-11, 9,-23; /M: SY='D'; M= -7, 21,-25, 30, 4,-32, 15, -8,-35, -8,-30,-25, 12,-13, -6,-13, 10, -6,-25,-34,-23, -1; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='E'; M=-10, 0,-28, 8, 41,-20,-22, -5,-18, 0, -3,-10, -7, -7, 10, -5, -7,-10,-20,-28,-15, 25; /M: SY='V'; M= -2,-30,-15,-32,-30, 0,-32,-30, 35,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 45,-28, -8,-30; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='N'; M=-12, 42,-22, 32, 5,-25, -2, 8,-25, 0,-30,-22, 50,-18, 0, -2, 8, -2,-30,-40,-20, 2; /M: SY='S'; M= 0, 10,-17, 5, 2,-22, -5, -5,-22, 7,-30,-18, 20,-12, 2, 2, 21, 8,-17,-35,-18, 2; /M: SY='S'; M= 5, 10,-12, 5, 0,-20, 0, -5,-20, -8,-30,-20, 22,-12, 0, -8, 33, 15,-15,-40,-20, 0; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='I'; M= -8,-30,-22,-35,-27, 3,-35,-27, 37,-28, 26, 18,-25,-25,-22,-25,-20, -8, 29,-22, -2,-27; /M: SY='T'; M= 5, 0,-10, -5, -5,-15,-10,-15,-15,-10,-20,-15, 5,-10, -5,-10, 30, 35, -5,-35,-15, -5; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23, 44,-30, 9, 0,-16, 3, 0,-20,-30,-19,-13,-20,-10, -7, 24, 66,-23; /M: SY='P'; M= -3, 4,-21, -1, -2,-20,-11,-11,-18, -8,-25,-18, 11, 16, -5,-11, 14, 14,-18,-35,-20, -5; /M: SY='I'; M= -5,-30,-20,-35,-30, 0,-35,-30, 40,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 40,-25, -5,-30; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='E'; M=-12, 10,-28, 18, 19,-29,-14, -4,-30, 7,-25,-20, 4, 3, 6, 10, 3, -5,-25,-32,-19, 11; /M: SY='E'; M= -6, -2,-27, 2, 21,-29,-17, -6,-22, 0,-22,-14, -3, 16, 17, -5, 5, 1,-24,-29,-19, 17; /M: SY='R'; M=-15,-12,-25,-12, -7,-15,-22, 17,-16, 8,-13, -3, -5,-22, 0, 31,-10,-10, -6,-25, -3, -7; /M: SY='R'; M= 7, -8,-20,-10, -3,-20,-10, -8,-22, 9,-20,-12, 0,-15, 2, 25, 8, 0,-12,-25,-15, -3; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= -8,-28,-20,-30,-28, 7,-33,-18, 28,-20, 10, 10,-25,-27,-22,-20,-15, -5, 30,-13, 14,-28; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= -2,-30,-15,-32,-30, 0,-32,-30, 35,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 45,-28, -8,-30; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='V'; M= -2,-30,-15,-32,-30, 0,-32,-30, 35,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 45,-28, -8,-30; /M: SY='K'; M=-13, -3,-30, -3, 7,-27,-20, -7,-30, 44,-27,-10, 0,-13, 10, 41,-10,-10,-20,-20,-10, 7; /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20, 0,-20, 0, 20,-10, 20, 60,-20,-20, 0,-10,-20,-10, 10,-20, 0,-10; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='H'; M=-18, 0,-30, 0, 5,-25,-20, 79,-28, -5,-20, 0, 8,-18, 22, 2, -8,-18,-30,-28, 13, 9; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='F'; M=-10,-18, 12,-22,-20, 19,-23, -9,-12,-20, -9, -9,-13,-28,-20,-17, -3, -3, -8,-10, 18,-20; /M: SY='A'; M= 38,-15,-10,-22,-15,-15, -7,-22, 0,-12, -5, -5,-15,-15,-15,-20, 5, 0, 12,-22,-18,-15; /M: SY='D'; M=-15, 22,-28, 33, 22,-28,-15, 0,-23, 1,-16, -6, 5, -9, 6, -7, -5,-10,-21,-33,-15, 14; /M: SY='C'; M= 0,-10, 58,-16,-16,-20,-16,-20,-25,-20,-25,-20, -6,-26,-16,-20, 14, 4,-10,-45,-25,-16; /M: SY='Y'; M=-17,-20, 13,-23,-23, 16,-30, 6, -9,-16, -6, -6,-20,-33,-16,-16,-17,-10,-10, 7, 49,-23; /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-32,-22, 5,-30,-18, 27,-25, 35, 30,-25,-25,-15,-20,-25,-10, 15,-20, 0,-20; /M: SY='T'; M= 12, -2,-10,-12,-10,-12,-15,-20,-10,-10,-10,-10, -2,-10,-10,-12, 18, 38, 0,-28,-12,-10; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='V'; M= -5,-30,-15,-30,-25, 5,-30,-25, 25,-25, 29, 15,-30,-30,-25,-20,-20, -5, 31,-25, -5,-25; /M: SY='P'; M= 1,-16,-31,-10, -1,-27,-14,-18,-19,-10,-27,-19,-14, 62, -8,-18, 0, -4,-23,-30,-27, -8; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
| COMPETES_HIT_WITH | PS52093; PS52094 |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | LNS2-associated Ig-like |
| Version [info] | 1 |