PROSITE logo

PROSITE entry PS52093


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS52093

Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] LNS2_IG_N
Accession [info] PS52093
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 10-JUN-2026 CREATED;
10-JUN-2026 DATA UPDATE;
10-JUN-2026 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC52092
Associated ProRule [info] PRU01438

Name and characterization of the entry

Description [info] Lipin/Ned1/Smp2 (LNS2)-associated immunoglobulin (Ig)-like domain N-terminal part profile.
Matrix / Profile [info] 
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2190480; R2=0.0118635; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=699; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=446; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...
 
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='G';  M=  4, -4,-19, -6,-10,-23, 27,-16,-27,-14,-27,-18,  4,-14,-10,-14, 20,  8,-17,-30,-23,-10;
/M: SY='G';  M= -2,  0,-28, -4,-16,-28, 57,-14,-36,-16,-30,-20, 11,-20,-16,-16,  2,-16,-30,-24,-28,-16;
/M: SY='A';  M= 34,-15,  7,-23,-16,-17, -9,-23, -6,-14, -8, -8,-15,-17,-16,-21,  4, -1,  7,-26,-20,-16;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-23,-36,-30,  0,-36,-30, 43,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 37,-24, -4,-30;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-18,-34,-30,  0,-34,-30, 38,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 42,-26, -6,-30;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-12,-30,-28,  2,-30,-28, 28,-22, 18, 12,-30,-30,-28,-20,-14, -2, 42,-28, -8,-28;
/M: SY='V';  M= -1,-30,-13,-31,-30,  0,-31,-30, 33,-21, 11, 11,-29,-29,-29,-21,-11, -1, 47,-29, -9,-30;
/M: SY='R';  M=-15, -2,-30,  0, 20,-29,-20,  3,-27, 19,-20, -9,  0,-12, 28, 35, -5,-10,-25,-22,-12, 22;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='Q';  M=-13,  0,-30,  0, 14,-34,-20, 38,-23,  4,-20,  0,  3,-13, 45,  7, -3,-13,-30,-23, -1, 28;
/M: SY='P';  M= -8,-15,-37, -9, -1,-31, -3,-16,-24, -9,-29,-17,-14, 56, -3,-16, -7,-12,-30,-27,-27, -5;
/M: SY='D';  M=-17, 41,-29, 54, 25,-35,-11,  1,-35,  2,-28,-27, 21, -9,  4, -7,  1, -9,-30,-38,-20, 14;
/M: SY='G';  M=  6,  0,-26,  1,-12,-30, 44,-17,-34,-15,-26,-20,  1,-16,-15,-18,  2,-15,-24,-23,-26,-13;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='T';  M= -1,  4,-12, -1, -3,-13, -8, -7,-15, -2,-18,-12, 11,-11, -2,  3, 17, 18, -9,-27,-12, -3; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='F';  M=-14,-30,-20,-34,-24, 40,-30,-20, 11,-30, 33, 11,-26,-30,-29,-20,-26,-10,  6, -7, 13,-24;
/M: SY='K';  M=  3, -9,-21,-10, -2,-21,-16,-12,-13, 12,-16, -6, -6,-15,  4, 10,  0, -3, -3,-24,-13,  0;
/M: SY='C';  M=  2, -8, 44,-12,-12,-20,-12,-18,-24,-18,-26,-20, -2,-22,-12,-18, 19,  8,-10,-44,-24,-12;
/M: SY='S';  M=  5, -3,-12, -6, -5,-15, -6,-10,-12,-10,-19, -6,  4,-12, -1,-10, 28, 19, -5,-35,-15, -3;
/M: SY='P';  M=-10,-14,-38, -4, 11,-30,-20,-16,-22, -6,-28,-20,-16, 73, -4,-16, -8,-10,-30,-30,-28,  0;
/M: SY='W';  M=-20,-34,-33,-40,-30, 50,-26,-24, -9,-26, -3, -9,-29,-30,-31,-20,-29,-19,-13, 70, 30,-26;
/M: SY='H';  M=-20, -5,-30, -5, -5, -8,-22, 81,-23,-10,-15,  0,  3,-22,  5, -2,-12,-18,-25,-16, 34, -5;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-13,-32,-30,  0,-32,-30, 33,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 47,-28, -8,-30;
/M: SY='R';  M=-18,-12,-28,-14, -4,-16,-20,  0,-20, 22,-12,  3, -4,-20,  8, 55,-12,-10,-14,-20, -8, -2;
/M: SY='F';  M=-18,-30,-20,-38,-28, 68,-30,-20,  3,-30, 17,  3,-22,-30,-37,-20,-22,-10,  2,  5, 25,-28;
/M: SY='G';  M=  0, -8,-27,-10,-18,-27, 55,-20,-35,-18,-27,-18,  0,-18,-18,-18,  3, -8,-25,-22,-27,-18;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='K';  M= -8, -5,-25, -7,  2,-20,-22,-13,-18, 27,-14, -5, -5,-13,  2, 15, -8,  0,-12,-22, -8,  2;
/M: SY='F';  M=-11,-20,-20,-24,-16, 23,-21,-12, -3,-14,  5,  6,-13,-23,-16, -2, -8, -4, -2,-13,  5,-15;
/M: SY='Q';  M= -9,  6,-28,  3,  9,-33, -4,  3,-24, 11,-25, -8, 11,-13, 30,  7,  0, -9,-28,-24,-15, 20;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='V';  M= -1,-25,-11,-26,-25,  0,-26,-25, 27,-18, 10, 10,-24,-24,-24,-18,-10, -1, 39,-24, -7,-25; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='L';  M=-10,-21,-19,-21,-13,  3,-23,-13,  7,-14, 28, 11,-19,-23,-11,  1,-21, -8,  3,-17, -2,-13; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='K';  M=  0,  5,-21,  6,  5,-23,-11, -7,-23, 20,-20,-12,  1,-10,  3, 14, -3, -6,-14,-20,-12,  3; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='G';  M= -3,  5,-21,  1, -6,-21, 20, -7,-23, -9,-25,-17, 15, -2, -8,-10,  7, -5,-22,-26,-21, -8; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='A';  M=  4, -9,-16,-11, -6,-17, -4,-10, -9, -3,-12, -5, -6,-14,  2,  1,  3, -3, -2,-21,-13, -3; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='E';  M= -7,  6,-23,  6, 14,-24,  4, -1,-24,  3,-20,-13, 10,-10,  9,  5,  1, -9,-24,-23,-16, 11; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='K';  M=-10,  9,-24,  9,  3,-21,-16, -8,-13, 14,-17, -8,  7,-11,  1,  5, -6, -7,-12,-23,-10,  1; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='A';  M=  3, -6,-15,-13,-11,  1,-13,-12, -3, -6, -3, -3, -2,-17,-12, -8, -5, -4,  0,-17, -6,-11; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-19,-35,-30,  0,-35,-30, 39,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 41,-25, -5,-30;
/M: SY='D';  M=-12, 14,-27, 20, 12,-32,-13,  1,-29,  8,-25,-15,  8,-12, 19, 14,  4, -5,-24,-30,-15, 14;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-24,-37,-30,  0,-37,-30, 44,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 36,-23, -3,-30;
/M: SY='Y';  M=-10, -6,-21, -5, -2,  5,-21, -6, -9,-12, -2, -7, -8,-18, -9,-12, -3,  4, -9,-15, 10, -6;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-15,-32,-30,  0,-32,-30, 35,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 45,-28, -8,-30;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='G';  M= -8, 13,-30, 22,  3,-34, 31,-11,-39, -9,-29,-24,  7,-14, -8,-14,  0,-15,-30,-28,-25, -2;
/M: SY='H';  M=-10,  5,-24,  2,  6,-21,-18, 12,-20, 10,-20, -9,  9,-14,  3,  5, -1, -1,-15,-29, -7,  4;
/M: SY='R';  M=-10, -2,-28,  3,  9,-23,-18, -9,-22,  9,-17,-13, -3,  4,  2, 10, -3, -6,-19,-28,-16,  4;
/M: SY='I';  M=  4,-21,-18,-25,-19, -5,-23,-22, 18,-22,  9,  6,-15,-20,-16,-21, -3, -1, 16,-26, -8,-19;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='D';  M=-13, 29,-29, 33,  6,-31,  0, -2,-31, -4,-30,-24, 24,  2, -4,-10,  1, -8,-30,-36,-23,  1;
/M: SY='F';  M=-10,-29,-16,-34,-28, 33,-29,-21, 16,-24, 16, 13,-25,-29,-29,-19,-18, -6, 20,-12,  8,-26;
/M: SY='H';  M=-11, -5,-25, -9,-10, -5, -5, 15,-21,-14,-17,-10,  3, -7,-10,-11, -2, -2,-19,-23, -2,-11;
/M: SY='M';  M=-10,-22,-20,-30,-20,  2,-22, -4, 20,-14, 26, 52,-22,-22, -4,-12,-22,-10, 10,-20,  0,-12;
/M: SY='K';  M=-12,-10,-28,-10, -2, -9,-24, -5,-15, 23,-10, -3,-10,-18,  0, 13,-16,-10,-13, -8, 13, -2;
/M: SY='L';  M= -8,-28,-18,-30,-22,  7,-28,-18, 22,-25, 39, 25,-28,-28,-18,-18,-25, -8, 17,-22, -2,-20;
/M: SY='G';  M=  0, -8,-22, -6,-11,-15,  9,-16,-13,-19,  0, -6, -8,-20,-14,-18, -5, -8,-11,-25,-16,-13;
/M: SY='D';  M=-15, 25,-30, 34, 20,-32,-13,  8,-31, -1,-27,-22, 14,  6,  3, -7, -1,-10,-30,-35,-18, 10;
/M: SY='S';  M=  4,  1,-18, -2,  3,-11,-11, -3,-15, -5,-17,-13,  5,-14, -1, -9, 11,  7,-13,-21,  0,  0;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='E';  M= -2,  2,-27,  6, 33,-28,-17, -2,-26, 11,-18,-14, -2, -6, 17, 11,  0, -8,-23,-25,-17, 24;
/M: SY='A';  M= 40,-12, 11,-22,-13,-20, -5,-22,-13,-13,-12,-12,-12,-15,-13,-22,  7, -2, -2,-25,-22,-13;
/M: SY='Y';  M=-16,-19,-23,-24,-21, 37,-28,  1, -2,-16,  1, -2,-16,-26,-19,-13,-12,  1, -5, 13, 48,-21;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='V';  M=  7,-21,-12,-25,-20, -3,-21,-22, 19,-17, 10,  7,-20,-20,-19,-18, -8, -2, 26,-21, -8,-20; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='R';  M=-15, -6,-27,-11, -6,  4,-19, -6,-17, -2,-15, -9,  3, -4, -3,  9, -8, -8,-19,-17, -4, -5;
/M: SY='E';  M=  1,  6,-26, 12, 47,-28,-16, -4,-26,  6,-18,-18, -2, -2, 14, -4,  2, -8,-24,-28,-20, 30;
/M: SY='T';  M= -7, -5,-17, -5,-12, -9,-22,-16,  2,-14,  4,  4,-10,-19,-13,-14, -4, 10,  9,-29, -9,-12;
/M: SY='D';  M=-11, 29,-26, 30, 19,-29,  0,  1,-30,  0,-27,-23, 26,-12,  3, -5,  4, -8,-30,-35,-21, 11;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH PS52092
PROMOTED_BY PS52094

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] LNS2-associated Ig-like
Version [info] 1