Entry: PS01277

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] RIBONUCLEASE_PH
Accession [info] PS01277
Entry type [info] PATTERN
Date [info] NOV-1997 (CREATED); APR-2006 (DATA UPDATE); SEP-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00983

Name and characterization of the entry

Description [info] Ribonuclease PH signature.
Pattern [info]
[CA]-[DE]-[LIVM](2)-[NQV]-[GTA]-D-[GA]-[SG]-x(2,3)-[TAVLC]-[AT].

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_10 which contains 546'790 sequence entries.


Total number of hits 418 in 418 different sequences
Number of true positive hits 418 in 418 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 8
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 98.12 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
418 sequences

EXOS4_CAEBR (A8WQQ5), EXOS4_CAEEL (Q17533), RNPH_ACAM1  (B0CAB9), 
RNPH_ACIAD  (Q6FFX5), RNPH_ACIB3  (B7H2J6), RNPH_ACIB5  (B7IBN8), 
RNPH_ACIBC  (B2I029), RNPH_ACIBS  (B0VMP4), RNPH_ACIBT  (A3M0U3), 
RNPH_ACIBY  (B0V5W8), RNPH_ACTP2  (A3MYC7), RNPH_ACTP7  (B3GZP5), 
RNPH_ACTPJ  (B0BRL3), RNPH_ACTSZ  (A6VLF1), RNPH_AGRRK  (B9J7T9), 
RNPH_AGRT5  (Q8UIG8), RNPH_AGRVS  (B9JZG3), RNPH_ALCBS  (Q0VT66), 
RNPH_ALISL  (B6EPI9), RNPH_ALKEH  (Q0A5V1), RNPH_ALTMD  (B4S201), 
RNPH_ANAD2  (B8J5H5), RNPH_ANADE  (Q2IEX1), RNPH_ANADF  (A7HFW3), 
RNPH_ANASK  (B4UBI2), RNPH_ANAVT  (Q3M9Q2), RNPH_ANOFW  (B7GH12), 
RNPH_AQUAE  (O67069), RNPH_AROAE  (Q5P5J6), RNPH_AZOC5  (A8HV93), 
RNPH_AZOSB  (A1KCM3), RNPH_AZOVD  (C1DI48), RNPH_BACA2  (A7Z7C6), 
RNPH_BACAA  (C3PA74), RNPH_BACAC  (C3L7T5), RNPH_BACAN  (Q81LA9), 
RNPH_BACC0  (B7JQ74), RNPH_BACC1  (Q72ZT1), RNPH_BACC2  (B7IIZ1), 
RNPH_BACC3  (C1ETS9), RNPH_BACC4  (B7HEB3), RNPH_BACC7  (B7HQP4), 
RNPH_BACCN  (A7GTG6), RNPH_BACCQ  (B9IZ73), RNPH_BACCR  (Q817P3), 
RNPH_BACCZ  (Q633V4), RNPH_BACHD  (Q9K8D8), RNPH_BACHK  (Q6HD42), 
RNPH_BACLD  (Q65GG2), RNPH_BACP2  (A8FFY6), RNPH_BACSK  (Q5WEM3), 
RNPH_BACSU  (P28619), RNPH_BACWK  (A9VIV4), RNPH_BDEBA  (Q6MJR9), 
RNPH_BEII9  (B2IH14), RNPH_BIFLO  (Q8G7I0), RNPH_BORBR  (Q7WI90), 
RNPH_BORPA  (Q7W6C1), RNPH_BORPE  (Q7VXY3), RNPH_BRADU  (Q89WK4), 
RNPH_BRASB  (A5E8I9), RNPH_BRASO  (A4YJR3), RNPH_BREBN  (C0ZAF8), 
RNPH_BRUA1  (B2S8G4), RNPH_BRUA2  (Q2YP33), RNPH_BRUAB  (Q57FK3), 
RNPH_BRUC2  (A9M7B8), RNPH_BRUMB  (C0RGM7), RNPH_BRUME  (Q8YEV2), 
RNPH_BRUO2  (A5VNA8), RNPH_BRUSI  (B0CJ32), RNPH_BRUSU  (Q8G2Y5), 
RNPH_BURA4  (B1YUN3), RNPH_BURCA  (Q1BY75), RNPH_BURCC  (B1JXM2), 
RNPH_BURCH  (A0K5H3), RNPH_BURCJ  (B4EBP8), RNPH_BURCM  (Q0BHF7), 
RNPH_BURM1  (A9AEQ7), RNPH_BURM7  (A3MML4), RNPH_BURM9  (A2S9I2), 
RNPH_BURMA  (Q62HZ8), RNPH_BURP0  (A3NY37), RNPH_BURP6  (A3NC95), 
RNPH_BURP8  (B2JEI0), RNPH_BURPP  (B2T6B5), RNPH_BURPS  (Q63RV5), 
RNPH_BURS3  (Q39IL4), RNPH_BURTA  (Q2SY74), RNPH_BURVG  (A4JCC2), 
RNPH_BURXL  (Q13V47), RNPH_CALBD  (B9MQJ8), RNPH_CALS4  (Q8RC30), 
RNPH_CALS8  (A4XI64), RNPH_CARHZ  (Q3AFA0), RNPH_CAUCN  (B8GXP2), 
RNPH_CAUCR  (P0CAW5), RNPH_CAUSK  (B0T369), RNPH_CELJU  (B3PGE8), 
RNPH_CHESB  (Q11B42), RNPH_CHRVO  (Q7MBD4), RNPH_CITK8  (A8ARN1), 
RNPH_CLOBA  (B2UZ31), RNPH_CLOBB  (B2TJ05), RNPH_CLOCE  (B8I1A8), 
RNPH_CLOK1  (B9DWL2), RNPH_CLOK5  (A5N2V9), RNPH_CLOP1  (Q0TN64), 
RNPH_CLOPE  (Q8XI67), RNPH_CLOPS  (Q0SQU1), RNPH_COLP3  (Q48AN3), 
RNPH_CORDI  (Q6NFN6), RNPH_COREF  (Q8FMU8), RNPH_CORGB  (A4QGQ6), 
RNPH_CORGL  (Q8NMR4), RNPH_CORK4  (C4LJY5), RNPH_COXBN  (A9KGR9), 
RNPH_COXBR  (A9NB33), RNPH_COXBU  (Q83EL9), RNPH_CUPNH  (Q0KD27), 
RNPH_CUPTR  (B3R3N0), RNPH_CYAA5  (B1WUL8), RNPH_CYAP4  (B8HPC6), 
RNPH_DECAR  (Q479A2), RNPH_DEHM1  (Q3Z6Z8), RNPH_DEHMB  (A5FQ49), 
RNPH_DEHMC  (Q3ZYH8), RNPH_DEIRA  (Q9RU11), RNPH_DESAP  (B1I4W9), 
RNPH_DESPS  (Q6ANS2), RNPH_DESRM  (A4J7Y7), RNPH_DICNV  (A5EV74), 
RNPH_DICTD  (B8E0G7), RNPH_DINSH  (A8LPD1), RNPH_ECO24  (A7ZTJ4), 
RNPH_ECO27  (B7UM50), RNPH_ECO57  (P66680), RNPH_ECO5E  (B5YWE1), 
RNPH_ECOBW  (P0CG18), RNPH_ECOHS  (A8A6A5), RNPH_ECOK1  (A1AHH4), 
RNPH_ECOL5  (Q0TBG6), RNPH_ECOL6  (P66679), RNPH_ECOLC  (B1IYV7), 
RNPH_ECOLI  (P0CG19), RNPH_ECOSE  (B6I3M0), RNPH_ECOSM  (B1LK80), 
RNPH_EDWI9  (C5B9C9), RNPH_ENT38  (A4W506), RNPH_ERWT9  (B2VF76), 
RNPH_ERYLH  (Q2NAJ7), RNPH_EXIS2  (B1YJW6), RNPH_FRAP2  (B0U040), 
RNPH_FRAT1  (Q14HY4), RNPH_FRATF  (A7NA52), RNPH_FRATH  (Q2A562), 
RNPH_FRATM  (B2SF43), RNPH_FRATN  (A0Q4X5), RNPH_FRATO  (Q0BNH8), 
RNPH_FRATT  (Q5NGI2), RNPH_FRATW  (A4IYU1), RNPH_GEODF  (B9M3E3), 
RNPH_GEOKA  (Q5KWI5), RNPH_GEOLS  (B3E3D2), RNPH_GEOMG  (Q39UG9), 
RNPH_GEOSL  (Q74C79), RNPH_GEOSW  (C5D5M7), RNPH_GEOTN  (A4IRI5), 
RNPH_GEOUR  (A5G3S1), RNPH_HAEDU  (Q7VP10), RNPH_HAEI8  (Q4QNR6), 
RNPH_HAEIE  (A5UAL6), RNPH_HAEIG  (A5UG91), RNPH_HAEIN  (P44444), 
RNPH_HAEPS  (B8F6D8), RNPH_HAHCH  (Q2S8P0), RNPH_HALHL  (A1WVN7), 
RNPH_HAMD5  (C4K3X0), RNPH_HISS1  (Q0I4U1), RNPH_HISS2  (B0UWM2), 
RNPH_HYDS0  (B4U8T3), RNPH_IDILO  (Q5QYL5), RNPH_KLEP3  (B5XTF9), 
RNPH_KLEP7  (A6TFN5), RNPH_LARHH  (C1DCK5), RNPH_LEGPA  (Q5X3P0), 
RNPH_LEGPC  (A5IDJ5), RNPH_LEGPH  (Q5ZTZ6), RNPH_LEGPL  (Q5WV28), 
RNPH_LEGPN  (Q9X528), RNPH_LEIXX  (Q6AEK9), RNPH_LISIN  (Q92CH1), 
RNPH_LISMC  (C1L2E3), RNPH_LISMF  (Q720J1), RNPH_LISMH  (B8DHZ4), 
RNPH_LISMO  (Q8Y7N6), RNPH_LISW6  (A0AHX9), RNPH_MANSM  (Q65W01), 
RNPH_MARHV  (A1TY30), RNPH_MARMM  (Q0AKA6), RNPH_MARMS  (A6W3H7), 
RNPH_METC4  (B7L092), RNPH_METCA  (Q602N9), RNPH_METEP  (A9VZR7), 
RNPH_METFK  (Q1GXA4), RNPH_METNO  (B8IFR7), RNPH_METPB  (B1ZJ73), 
RNPH_METRJ  (B1M4N1), RNPH_METS4  (B0UP55), RNPH_METSB  (B8ERN7), 
RNPH_MOOTA  (Q2RL40), RNPH_MYCA1  (A0QD04), RNPH_MYCA9  (B1MLZ3), 
RNPH_MYCBO  (Q7U076), RNPH_MYCBP  (A1KID0), RNPH_MYCBT  (C1AMY5), 
RNPH_MYCGI  (A4T8F7), RNPH_MYCLB  (B8ZR59), RNPH_MYCLE  (P37939), 
RNPH_MYCPA  (Q73X87), RNPH_MYCS2  (A0R1W8), RNPH_MYCSJ  (A3Q379), 
RNPH_MYCSK  (A1UJV2), RNPH_MYCSS  (Q1B585), RNPH_MYCTA  (A5U240), 
RNPH_MYCTO  (P9WGZ6), RNPH_MYCTU  (P9WGZ7), RNPH_MYCUA  (A0PUG0), 
RNPH_MYCVP  (A1TD14), RNPH_MYXXD  (Q1DAT4), RNPH_NEIG1  (Q5F840), 
RNPH_NEIG2  (B4RL28), RNPH_NEIM0  (A9M0T5), RNPH_NEIMA  (Q9JTN2), 
RNPH_NEIMB  (Q9JYN5), RNPH_NEIMF  (A1KUT9), RNPH_NITEC  (Q0AJ79), 
RNPH_NITEU  (Q82XJ4), RNPH_NITHX  (Q1QRU5), RNPH_NITMU  (Q2YCZ6), 
RNPH_NITOC  (Q3J8F0), RNPH_NITWN  (Q3SW80), RNPH_NOCFA  (Q5Z0V1), 
RNPH_NOCSJ  (A1SGA2), RNPH_NOSP7  (B2J9Q1), RNPH_NOSS1  (Q8Z0M2), 
RNPH_OCEIH  (Q8EPJ5), RNPH_OCHA4  (A6WVA9), RNPH_OLICO  (B6JCH9), 
RNPH_PARL1  (A7HZ45), RNPH_PASHA  (Q9AES0), RNPH_PASMU  (Q9CJW5), 
RNPH_PECAS  (Q6DAW2), RNPH_PECCP  (C6DIC7), RNPH_PERMH  (C0QTN9), 
RNPH_PHEZH  (B4RC87), RNPH_PHOLL  (Q7MAX2), RNPH_PHOPR  (Q6LVN8), 
RNPH_PROAC  (Q6A759), RNPH_PROMH  (B4F0W3), RNPH_PROMM  (Q7V4V8), 
RNPH_PSEA6  (Q15MV7), RNPH_PSEA7  (A6VEE1), RNPH_PSEA8  (B7V5M5), 
RNPH_PSEAB  (Q02E28), RNPH_PSEAE  (P50597), RNPH_PSEF5  (Q4K3R6), 
RNPH_PSEFS  (C3K479), RNPH_PSEHT  (Q3IJI0), RNPH_PSEMY  (A4Y0L7), 
RNPH_PSEP1  (A5WB10), RNPH_PSEPF  (Q3K4M0), RNPH_PSEPG  (B0KQ94), 
RNPH_PSEPK  (Q88C89), RNPH_PSEPW  (B1J4L4), RNPH_PSESM  (Q88BE0), 
RNPH_PSEU2  (Q4ZZY6), RNPH_PSEU5  (A4VGR8), RNPH_PSYA2  (Q4FQJ5), 
RNPH_PSYCK  (Q1Q8S2), RNPH_PSYIN  (A1T097), RNPH_PSYWF  (A5WHJ0), 
RNPH_RALME  (Q1LQ38), RNPH_RALPJ  (B2U8D8), RNPH_RALSO  (Q8XXF5), 
RNPH_RHIE6  (B3PZA2), RNPH_RHIEC  (Q2KDA1), RNPH_RHIL3  (Q1MMD1), 
RNPH_RHILO  (Q98DN6), RNPH_RHILW  (B5ZMW8), RNPH_RHIME  (Q92SK2), 
RNPH_RHISN  (C3MEJ1), RNPH_RHOBA  (Q7URE2), RNPH_RHOE4  (C1A1V2), 
RNPH_RHOP2  (Q2J324), RNPH_RHOPA  (Q6NCY8), RNPH_RHOPB  (Q21CI6), 
RNPH_RHOPS  (Q13E56), RNPH_RHOPT  (B3Q968), RNPH_RHORT  (Q2RN60), 
RNPH_RHOS1  (A3PNR8), RNPH_RHOS5  (A4WVY1), RNPH_RHOSK  (B9KPU4), 
RNPH_RICAE  (C3PP75), RNPH_RICAH  (A8GPB9), RNPH_RICB8  (A8GW25), 
RNPH_RICBR  (Q1RIX6), RNPH_RICCK  (A8EY33), RNPH_RICCN  (Q92GZ7), 
RNPH_RICFE  (Q4UJN4), RNPH_RICPR  (Q9ZCT5), RNPH_RICPU  (C4K2U2), 
RNPH_RICRO  (B0BUM3), RNPH_RICRS  (A8GT33), RNPH_ROSDO  (Q16D02), 
RNPH_RUEPO  (Q5LWF6), RNPH_RUEST  (Q1GCL2), RNPH_SACD2  (Q21EE1), 
RNPH_SACEN  (A4F913), RNPH_SALA4  (B5EXE7), RNPH_SALAI  (A8M4I1), 
RNPH_SALAR  (A9MKN2), RNPH_SALCH  (Q57I99), RNPH_SALDC  (B5FM66), 
RNPH_SALEP  (B5R5G7), RNPH_SALG2  (B5RG80), RNPH_SALHS  (B4T9Y6), 
RNPH_SALNS  (B4SXE4), RNPH_SALPA  (Q5PC25), RNPH_SALPK  (B5BI17), 
RNPH_SALSV  (B4TZY4), RNPH_SALTI  (P0A2C4), RNPH_SALTO  (A4X3X5), 
RNPH_SALTY  (P0A2C3), RNPH_SERP5  (A8GLF0), RNPH_SHEAM  (A1S2C5), 
RNPH_SHEB2  (B8E4I8), RNPH_SHEB5  (A3CZI9), RNPH_SHEB8  (A6WI99), 
RNPH_SHEB9  (A9KXZ7), RNPH_SHEDO  (Q12SG2), RNPH_SHEFN  (Q07WF3), 
RNPH_SHEHH  (B0TQK4), RNPH_SHELP  (A3QIQ6), RNPH_SHEON  (Q8E9L4), 
RNPH_SHEPA  (A8H9B7), RNPH_SHEPC  (A4Y2K5), RNPH_SHEPW  (B8CM22), 
RNPH_SHESA  (A0L1S6), RNPH_SHESH  (A8FQ68), RNPH_SHESM  (Q0HE49), 
RNPH_SHESR  (Q0HZV0), RNPH_SHESW  (A1RET8), RNPH_SHEWM  (B1KL12), 
RNPH_SHIB3  (B2TTV7), RNPH_SHIBS  (Q31UY3), RNPH_SHIDS  (Q329L3), 
RNPH_SHIF8  (Q0SYH0), RNPH_SHIFL  (Q83PN2), RNPH_SHISS  (Q3YW05), 
RNPH_SINMW  (A6U5E0), RNPH_SODGM  (Q2NQT7), RNPH_SOLUE  (Q01NZ9), 
RNPH_SPHAL  (Q1GWJ5), RNPH_SPHWW  (A5V3R9), RNPH_STRAW  (Q82D17), 
RNPH_STRCO  (Q9S2H7), RNPH_STRGG  (B1VVV6), RNPH_STRM5  (B4SU06), 
RNPH_STRMK  (B2FT17), RNPH_SULSY  (B2V890), RNPH_SYMTH  (Q67SL5), 
RNPH_SYNAS  (Q2LTS3), RNPH_SYNE7  (Q31PB6), RNPH_SYNJA  (Q2JRJ9), 
RNPH_SYNJB  (Q2JKT3), RNPH_SYNP6  (Q5N4V3), RNPH_SYNPX  (Q7U9I1), 
RNPH_SYNSC  (Q3AMY6), RNPH_SYNWW  (Q0AZR6), RNPH_TERTT  (C5BLF9), 
RNPH_THEEB  (Q8DLA4), RNPH_THEP3  (B0KBM5), RNPH_THEPX  (B0K3T4), 
RNPH_THISH  (B8GPB2), RNPH_TOLAT  (C4L818), RNPH_TROW8  (Q83HF6), 
RNPH_TROWT  (Q83FT1), RNPH_VIBCH  (Q9KVD6), RNPH_VIBF1  (Q5E8P0), 
RNPH_VIBFM  (B5FFE2), RNPH_VIBPA  (Q87T93), RNPH_VIBSL  (B7VHJ7), 
RNPH_VIBVU  (Q8DDX4), RNPH_VIBVY  (Q7MPT3), RNPH_XANAC  (Q8PH63), 
RNPH_XANC5  (Q3BPR8), RNPH_XANC8  (Q4UY39), RNPH_XANCB  (B0RP96), 
RNPH_XANCP  (Q8P5T5), RNPH_XANOM  (Q2P6N2), RNPH_XANOP  (B2SLL1), 
RNPH_XANP2  (A7IID4), RNPH_XYLF2  (B2IA38), RNPH_XYLFA  (Q9PD74), 
RNPH_XYLFM  (B0U6W7), RNPH_XYLFT  (Q87DG3), RNPH_YERE8  (A1JHW7), 
RNPH_YERP3  (A7FCS9), RNPH_YERPA  (Q1C262), RNPH_YERPB  (B2JYM8), 
RNPH_YERPE  (Q8ZJP8), RNPH_YERPG  (A9R668), RNPH_YERPN  (Q1CCZ7), 
RNPH_YERPP  (A4TSE2), RNPH_YERPS  (Q66GE1), RNPH_YERPY  (B1JQX8), 
RNPH_ZYMMO  (Q5NRL6)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
8 sequences

CER7L_ARATH (Q9LDM2), CER7_ARATH  (Q9M209), MTR3_SCHPO  (Q9P7R3), 
RNPH_CYAP7  (B7KB81), RNPH_DICT6  (B5YEU4), RNPH_FRASC  (Q2JEN8), 
RNPH_FRASN  (A8L766), RNPH_THEYD  (B5YFY8)
» More

PDB
[Detailed view]
11 PDB

1OYP; 1OYR; 1OYS; 1R6L; 1R6M; 1UDN; 1UDO; 1UDQ; 1UDS; 3B4T; 3DD6

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission