PROSITE

Home | Contact

Home

ScanProsite

Entry: PS50235

General information about the entry
Entry name	UCH_2_3
Accession number	PS50235
Entry type	MATRIX
Date	DEC-2001 (CREATED); DEC-2001 (DATA UPDATE); DEC-2011 (INFO UPDATE).
PROSITE Documentation	PDOC00750
Name and characterization of the entry
Description	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolases family 2 profile.
Matrix / Profile	/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=193; TOPOLOGY=LINEAR; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=10; N2=185; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.3922; R2=.00836191; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=910; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=610; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; I=-20; D=-20; A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='T'; M= 0,-14, 2,-19,-16, -9,-21,-18, -6,-10, -5, -5,-12,-21,-15, -6, 0, 9, 6,-29,-11,-16; /M: SY='G'; M= 0,-10,-29,-10,-18,-28, 61,-18,-37,-18,-29,-19, 0,-20,-17,-18, 1,-18,-28,-20,-26,-18; /M: SY='L'; M=-12,-29,-23,-32,-22, 15,-31,-18, 21,-28, 37, 18,-27,-28,-20,-20,-27,-10, 10,-12, 8,-22; /M: SY='K'; M= -7, -9,-25,-10, 1,-17,-19,-11, -5, 3, -9, -3, -6,-15, 1, 1, -5, -5, -4,-23, -9, 0; /M: SY='N'; M=-10, 37,-20, 18, -1,-19, -2, 8,-19, -1,-27,-19, 55,-20, -1, -1, 10, 2,-28,-39,-19, -1; /M: SY='L'; M= -9,-12,-23,-13,-10, -3,-20,-11, -2,-14, 8, 3,-13,-16, -8,-10,-12, -4, -5,-21, -4,-10; /M: SY='G'; M= 1,-11,-26,-11,-19,-28, 57,-20,-34,-20,-27,-18, -1,-19,-19,-20, 1,-17,-25,-21,-28,-19; /M: SY='N'; M= -2, 25,-19, 9, -4,-18, -2, 2,-14, -4,-23,-15, 41,-18, -3, -5, 9, 2,-20,-35,-18, -4; /M: SY='T'; M= -2, -1,-12, -9,-10, -6,-17,-16,-11,-11,-13,-11, 1,-12,-10,-11, 15, 32, -4,-24, -6,-10; /M: SY='C'; M= -9,-19,114,-29,-29,-20,-29,-29,-30,-29,-20,-20,-19,-39,-29,-29, -8, -9,-10,-50,-30,-29; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-29,-26,-23, 40,-29, 8, -1,-15, 1, -1,-21,-30,-17,-13,-21,-11, -9, 33, 66,-22; /M: SY='M'; M= -9,-23, -7,-30,-22, 4,-25,-12, 14,-18, 18, 29,-21,-25,-12,-15,-19, -8, 9,-20, 0,-17; /M: SY='N'; M= -7, 32,-19, 15, -1,-19, -2, 5,-18, -3,-28,-19, 49,-18, -1, -3, 13, 4,-25,-39,-19, -1; /M: SY='S'; M= 17, -4, -2, -7, -5,-20, -3,-14,-17,-12,-24,-17, 3,-12, -5,-14, 29, 13, -6,-36,-20, -5; /M: SY='V'; M= 3,-20, -8,-25,-21, -3,-21,-23, 11,-20, 6, 4,-18,-22,-19,-19, -4, 4, 18,-26, -9,-20; /M: SY='L'; M= -8,-29,-21,-32,-23, 5,-31,-23, 28,-27, 33, 19,-26,-26,-20,-22,-22, -8, 20,-22, -2,-23; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 19,-39,-20, 13,-20, 9,-20, 0, 0,-10, 58, 10, 0,-10,-30,-20, -9, 39; /M: SY='C'; M= 3,-17, 24,-23,-18,-13,-19,-19, -6,-19, -4, -2,-15,-25,-14,-19, -4, -4, 1,-31,-14,-16; /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-22, 9,-30,-20, 21,-27, 37, 17,-28,-29,-20,-20,-26, -9, 13,-13, 4,-22; /M: SY='F'; M= -4,-19,-17,-22,-17, 16,-19,-13, -2,-16, 0, -3,-13,-23,-18,-12, -4, -1, 2,-12, 10,-17; /M: SY='H'; M= -5, 2,-22, -4, -6,-11, -5, 16,-18, -8,-18, -7, 12,-18, -3, -5, 4, -4,-17,-25, -2, -6; /M: SY='V'; M= -3,-17, -1,-25,-23, -7,-26,-25, 14,-21, 1, 2,-13,-23,-20,-21, -4, 6, 18,-30,-11,-23; /M: SY='P'; M= -8, -7,-32, -4, 1,-27,-14, -5,-21, -3,-26,-16, -4, 38, -1, -7, -3, -7,-25,-29,-21, -3; /M: SY='P'; M= -4, -4,-28, 1, 12,-25,-14, -8,-20, -2,-20,-15, -6, 17, 4, -7, 0, -5,-21,-27,-17, 6; /M: SY='F'; M=-14,-30,-21,-34,-25, 37,-30,-21, 13,-29, 28, 12,-25,-26,-28,-20,-24,-10, 8, -8, 11,-25; /M: SY='R'; M= -5, -9,-21,-12, -6,-15,-19, -9,-11, 5,-13, -5, -4,-17, 2, 19, 1, 4, -4,-24, -9, -4; /M: SY='Q'; M=-13, 8,-26, 10, 11,-26,-17, 2,-23, 8,-20,-12, 7,-14, 13, 11, -2, -7,-22,-25,-12, 11; /M: SY='Y'; M= -4,-16,-24,-20,-14, 2,-19, -4, 1, -9, 3, 4,-13,-22, -9, -8,-12, -8, -2, -8, 16,-14; /M: SY='F'; M= -9,-27,-16,-32,-24, 21,-29,-19, 16,-24, 18, 11,-23,-24,-23,-20,-18, -8, 13,-13, 8,-24; /M: SY='L'; M=-10,-16,-24,-18,-14, 3,-26,-12, 9,-14, 13, 6,-14,-23,-13,-11,-16, -8, 4,-16, 6,-15; /M: SY='N'; M= -6, 6,-23, 6, 6,-20,-11, 2,-23, 2,-21,-13, 7,-14, 5, 6, 5, -3,-18,-28,-11, 5; /I: MI=0; MD=-20; IM=0; DM=-20; I=0; /M: SY='Y'; M=-11, -9,-27,-11,-12, 5, -9, -4,-14, -8,-13, -8, -5,-17,-11, -7, -8, -8,-15, -3, 13,-13; /M: SY='Q'; M= -9, 4,-25, 6, 9,-25,-17, -1,-21, 10,-17, -4, 1,-12, 13, 11, -1, -4,-18,-26,-11, 10; /M: SY='Q'; M= -9, 0,-29, -1, 18,-37,-19, 12,-19, 8,-19, 1, 0,-10, 53, 8, 1, -9,-28,-21, -9, 35; /M: SY='Q'; M=-11, 0,-29, 0, 17,-27,-20, 22,-21, 4,-18, -3, 1,-12, 37, 4, -3,-11,-27,-20, -2, 26; /M: SY='D'; M=-19, 46,-29, 66, 18,-38,-11, -1,-37, -1,-28,-28, 18,-11, -1,-10, 0,-10,-26,-40,-20, 8; /M: SY='A'; M= 28,-11, -8,-18,-12,-17, -6,-20, -6,-12,-11, -8, -9,-14,-11,-18, 10, 3, 4,-26,-18,-12; /M: SY='Q'; M=-11, 1,-27, 0, 12,-27,-19, 26,-19, 0,-17, -2, 4,-13, 28, 2, 0, -7,-23,-26, -4, 19; /M: SY='E'; M=-11, 12,-30, 22, 55,-31,-19, -1,-31, 12,-21,-20, 1, -1, 18, 1, -1,-10,-29,-30,-19, 37; /M: SY='F'; M=-10,-26, -7,-33,-25, 41,-27,-18, 1,-26, 13, 3,-21,-29,-29,-20,-18, -9, 1, -4, 16,-25; /M: SY='F'; M=-12,-22, -9,-27,-22, 18,-24,-19, 2,-25, 16, 4,-19,-28,-23,-19,-19, -7, -1, -7, 5,-21; /M: SY='M'; M= -2, -9,-21,-13, -7,-13,-14,-11, -6, -5, 0, 1, -6,-18, -1, -1, -4, -1, -5,-24,-10, -5; /M: SY='F'; M= -8,-15,-21,-21,-15, 20,-23, -7, -1,-16, 0, -1, -8,-22,-15,-13, -8, -5, -2,-11, 10,-15; /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-31,-21, 7,-30,-19, 22,-24, 34, 23,-25,-25,-17,-19,-24, -9, 13,-20, 0,-20; /M: SY='L'; M= -9,-28,-20,-31,-21, 15,-29,-19, 19,-26, 34, 19,-25,-27,-19,-19,-24, -9, 11,-17, 3,-20; /M: SY='D'; M=-10, 26,-25, 31, 12,-27, -5, 0,-30, -1,-25,-21, 18,-12, 1, -5, 4, -4,-25,-34,-17, 6; /M: M= -1, -5,-23, -8, -3,-19, -2,-11,-17, -3,-15, -9, -2,-15, -1, -2, 0, -3,-14,-17,-12, -2; /M: SY='L'; M= -9,-29,-17,-31,-23, 6,-30,-21, 24,-27, 35, 19,-27,-28,-20,-21,-24, -8, 16,-22, -2,-22; /M: SY='H'; M=-12, 10,-28, 16, 21,-27,-16, 28,-29, -1,-23,-13, 6,-11, 15, -2, 1, -9,-27,-28, -6, 17; /M: SY='E'; M=-12, 5,-27, 7, 23,-25,-18, 2,-26, 12,-20,-14, 5,-10, 12, 17, 0, -4,-22,-28,-14, 16; /M: SY='D'; M= -2, 7,-19, 9, 5,-22,-11,-10,-17, -1,-18,-14, 4,-13, -3, -8, 1, -5,-12,-29,-14, 0; /M: SY='L'; M= -8,-23,-15,-26,-18, 10,-24,-15, 6,-20, 17, 10,-20,-25,-16,-14,-16, -7, 3,-12, 4,-17; /I: MD=-26; I=-5; /M: SY='N'; D=-5; M= -9, 3,-25, 1, 1,-19, -9, -7,-15, 2,-17,-10, 6,-12, -3, -1, -3, -7,-13,-27,-13, -2; /I: MD=-26; I=-5; /M: SY='R'; D=-5; M= -3, -1,-23, -1, -1,-20, -7, -6,-19, 3,-18,-11, 1,-10, 3, 5, 1, -2,-15,-23,-11, 0; /I: MD=-26; I=-5; /M: D=-5; M=-3,-9,-13,-11,-4,-12,-18,-10,-3,-7,-2,-1,-8,-17,-5,-8,-4,0,0,-25,-10,-5; /I: MI=0; MD=-20; IM=0; DM=-20; I=0; /M: SY='N'; D=-5; M= -6, 2,-16, -2, -6,-20, -7, -5,-14, -9,-18,-11, 7,-10, -4, -9, 4, 1,-12,-31,-15, -6; /I: DM=-25; I=-5; /M: SY='E'; D=-5; M= -8, -7,-23, -5, 3,-15,-17,-11,-14, -2,-12,-10, -7, -4, -1, -2, -3, -3,-13,-19, -9, 0; /I: DM=-25; I=-5; /M: SY='S'; D=-5; M= 0, 1,-14, -1, 1,-18, -7,-10,-20, -2,-22,-15, 5, -9, -2, -6, 13, 6,-15,-28,-16, -1; /I: DM=-25; I=-5; /M: SY='I'; D=-5; M= -7,-14,-24,-19,-14, -3,-22,-16, 4,-13, 1, 1, -9, -9,-12,-12,-11, -5, 0,-16, -6,-14; /I: DM=-25; I=-5; /M: SY='I'; M= -8,-27,-27,-31,-22, 0,-32,-21, 24,-24, 13, 10,-21, -5,-19,-24,-18, -9, 14,-21, -4,-23; /M: SY='T'; M= -4, -1,-19, -3, -4,-16,-17, -3, -9, -4,-12, -6, 0,-15, -2, -6, 3, 4, -4,-29, -9, -4; /M: SY='D'; M=-10, 19,-26, 26, 15,-28,-11, -1,-30, 7,-25,-19, 10,-11, 6, 3, 1, -6,-24,-30,-15, 10; /M: SY='L'; M= -7,-23,-21,-25,-19, 1,-28,-21, 17,-23, 23, 10,-20,-19,-18,-18,-17, -5, 11,-23, -5,-19; /M: SY='F'; M=-18,-28,-20,-37,-28, 67,-29,-17, 2,-27, 11, 2,-20,-29,-35,-19,-19, -8, 1, 7, 29,-28; /M: SY='R'; M= -9, -6,-20, -6, -2,-21, 0, 3,-25, -1,-20,-10, -2,-18, 3, 5, -3, -9,-20,-23,-10, -1; /M: SY='G'; M= -4,-13,-28,-16,-21,-14, 39,-19,-22,-21,-18,-12, -3,-21,-21,-20, -4,-15,-17,-17,-17,-21; /M: SY='Q'; M= -7, -5,-25, -5, 6,-22,-19, -2,-13, 1,-12, -4, -4, -9, 13, 0, 0, -1,-14,-23,-10, 8; /M: SY='F'; M=-10,-20,-20,-25,-17, 15,-26,-14, 9,-20, 15, 11,-18,-23,-17,-16,-14, -1, 6,-12, 7,-17; /M: SY='K'; M= -5, -3,-19, -3, 12,-21,-18, -8,-21, 13,-16, -9, -3,-12, 5, 13, -2, -4,-15,-26,-14, 8; /M: SY='S'; M= -1, 11,-18, 9, 6,-22, -9, -4,-21, -3,-24,-17, 14,-11, 5, -5, 19, 12,-17,-34,-15, 5; /M: SY='R'; M=-10, -7,-23, -9, -1,-11,-22, -5,-10, 1,-11, -4, -5,-16, 5, 8, -1, 3, -8,-20, -2, 1; /M: SY='I'; M= -8,-25,-22,-29,-21, 1,-32,-20, 26,-19, 17, 15,-22,-24,-17,-18,-18, -6, 21,-19, 2,-21; /M: SY='K'; M= -6,-10,-24,-11, -3,-18,-21,-12, -6, 9,-10, -2, -9,-17, 4, 5, -7, -5, -2,-21, -7, -1; /M: SY='C'; M=-10,-17, 97,-25,-26,-20,-28,-27,-26,-27,-18,-18,-17,-34,-25,-27,-10,-10,-11,-47,-27,-26; /I: MD=-33; I=-6; /M: D=-6; M=-9,-11,-23,-11,-4,-16,-13,-10,-11,-4,-3,-3,-10,-6,-1,-5,-11,-8,-12,-22,-10,-3; /I: MI=-33; IM=-33; DM=-33; I=-6; /M: SY='S'; M= -2, 0,-22, -2, 3,-22, -4,-11,-17, -2,-18,-12, 3,-13, 1, -4, 7, 3,-13,-28,-16, 1; /M: SY='C'; M= -5,-13, 77,-23,-23,-18,-24,-24,-22,-23,-18,-15,-11,-32,-23,-24, -2, -2, -7,-44,-25,-23; /M: SY='G'; M= -6, 5,-28, 8, 6,-29, 12, -8,-32, 0,-27,-18, 4, -9, 0, -5, 0,-10,-26,-23,-20, 3; /M: SY='H'; M=-11, 4,-25, 0, 4,-16,-14, 13,-19, 2,-19, -9, 11,-16, 6, 2, -1, -5,-19,-25, -3, 4; /M: SY='E'; M= -7, -5,-22, -6, 2,-16,-21,-12, -6, 0,-10, -6, -3,-15, -2, 2, -1, 1, -1,-28,-12, -1; /M: SY='S'; M= 2, -4,-18, -4, 1,-16, -8, -5,-17, -3,-21,-13, 2,-13, 0, -4, 17, 8,-11,-27, -7, 0; /I: MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; I=-6; /M: SY='V'; D=-6; M= -3,-11,-19,-12, -9, -8,-21,-14, 0, -5, -6, -3,-11,-15,-10, -8, -2, 1, 6,-21, -2,-10; /I: DM=-29; I=-6; /M: SY='T'; M= -6, -5,-15,-10, -5,-15,-19,-13,-15, 5,-16,-10, -2,-12, -3, 10, 5, 15, -8,-26, -9, -5; /M: SY='Y'; M=-13, -9,-24, -9, -5, 7,-24, -4, -6, -6, -5, -5, -9,-20, -9, -6, -9, -6, -5,-11, 14, -7; /M: SY='E'; M=-11, 18,-27, 27, 31,-32,-13, -1,-31, 6,-25,-20, 7, -7, 13, 1, 4, -6,-27,-32,-19, 22; /M: SY='P'; M= -7, -5,-26, -2, -1,-21,-17, -5,-17, -5,-20,-13, -4, 17, -4, -6, 1, 1,-16,-29,-14, -5; /M: SY='F'; M=-15,-17,-21,-23,-18, 43,-25,-14, -5,-21, 5, -3,-12,-25,-26,-14,-14, -6, -5, -3, 17,-19; /M: SY='Y'; M= -9, -7,-17,-13,-12, 1,-20, -7, -3,-14, -1, -2, -2,-19,-10,-12, -6, 1, -7,-14, 5,-12; /M: SY='D'; M= -6, 2,-19, 5, -6,-12,-14,-12,-10,-11,-11,-10, -3,-17, -9,-14, -1, -2, -5,-25, -7, -8; /M: SY='L'; M=-11,-27,-22,-30,-21, 9,-30,-19, 23,-26, 36, 20,-24,-27,-18,-19,-25,-10, 12,-19, 0,-21; /M: SY='S'; M= -1, 0,-20, 0, 4,-24, -9, -8,-19, -6,-23,-14, 3, 1, 8, -7, 16, 10,-17,-32,-17, 5; /M: SY='L'; M= -8,-29,-11,-31,-24, 5,-31,-24, 23,-28, 34, 16,-28,-29,-22,-22,-24, -8, 19,-24, -4,-24; /M: SY='P'; M= -6, 7,-28, 9, 5,-26,-12, 4,-24, -5,-26,-18, 7, 18, -2, -8, 1, -6,-25,-32,-17, 0; /M: SY='I'; M= -8,-27,-18,-32,-26, 3,-33,-24, 31,-25, 20, 15,-23,-26,-22,-23,-18, -7, 26,-21, 0,-26; /M: SY='P'; M= -7, -8,-24, -6, 2,-22,-13, -9,-19, -1,-21,-13, -4, 16, -1, -4, -3, -7,-19,-28,-18, -2; /M: SY='N'; M= -8, -2,-21, -4, -4,-19, 0, -8,-17, -5,-16, -5, 2,-10, -2, -5, -2, -8,-16,-27,-16, -4; /M: SY='D'; M=-11, 10,-25, 12, 7,-18,-16, 5,-21, 2,-17,-11, 7,-12, 3, -2, -2, -6,-20,-26, -7, 5; /M: SY='S'; M= -4, 3,-18, 2, 1,-24,-10, -9,-19, 1,-21,-13, 4, -8, 2, -4, 5, 2,-15,-30,-16, 1; /M: M= -1, -3,-21, -5, -2,-14,-16,-10, -7, -5, -8, -6, -2,-13, -4, -7, 0, -1, -6,-25, -8, -4; /M: M= -7, -9,-19,-11, -6, -6,-18,-11, -5,-10, -1, -1, -7,-17, -7, -7, -6, -2, -5,-21, -5, -7; /I: MI=0; MD=-20; IM=0; DM=-20; I=0; /M: SY='Y'; M=-16,-20,-28,-23,-19, 22,-20, -3, -6,-10, -2, 0,-16,-26,-14, -9,-19,-12,-10, 18, 33,-17; /M: SY='Y'; M=-12, -9,-27,-10, -4, -3,-20, 9,-13, -3, -9, -4, -7,-20, -1, -3,-10, -9,-15, 0, 14, -3; /M: SY='C'; M= -2,-12, 61,-18,-18,-20,-21,-23,-24,-17,-20,-17,-11,-28,-18,-18, 2, -1, -8,-42,-24,-18; /M: SY='E'; M= -1, 7,-24, 12, 16,-27, -6, -7,-26, -3,-25,-20, 3, 3, 1, -9, 9, -1,-22,-32,-20, 8; /M: SY='K'; M= -5, 1,-24, -2, 2,-18,-13, -3,-19, 9,-20,-11, 5, -9, 1, 4, 0, 0,-16,-22, -6, 0; /M: SY='C'; M= -8,-15, 56,-23,-22,-11,-24,-20,-17,-23, -6, -9,-14,-32,-22,-22,-10, -5, -7,-37,-17,-22; /M: SY='N'; M= -9, 4,-23, 2, 2,-19, -8, -3,-20, 5,-17, -9, 6,-16, 3, 2, -3, -6,-18,-25,-10, 2; /M: SY='K'; M= -1, -5,-23, -5, 5,-21,-12, -6,-19, 12,-18, -8, -3,-13, 4, 10, -1, -5,-12,-24,-12, 4; /M: SY='K'; M=-11, 3,-26, 3, 6,-24,-16, 3,-24, 17,-20, -9, 4,-14, 5, 13, -5, -5,-18,-26, -9, 5; /I: MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; I=-4; /M: SY='Q'; D=-4; M= 0, -8,-10,-10, -5,-19, -5,-10,-12, -6,-12, -5, -6,-15, 5, -6, 3, 0, -7,-23,-14, -1; /I: DM=-23; I=-4; /M: SY='D'; D=-4; M= -7, 7,-24, 11, 8,-20,-17, -9,-15, -3,-14,-10, 0, -2, -1, -9, -2, -3,-13,-29,-15, 3; /I: DM=-23; I=-4; /M: SY='A'; D=-4; M= 18,-13,-15,-19,-13, -7,-10,-17, -7,-10, -9, -8,-11,-16,-12,-13, 4, 3, 1, -9, -5,-13; /I: DM=-23; I=-4; /M: SY='T'; D=-4; M= -3, -9,-20,-11, -6,-13,-20, -7, 0,-11, -4, -2, -6,-13, -4,-11, 0, 3, 1,-27, -8, -7; /I: DM=-23; I=-4; /M: SY='K'; D=-4; M= -9, -3,-26, -4, 3,-23,-20,-10,-20, 32,-20, -7, -1,-14, 4, 23, -9, -6,-12,-21,-10, 3; /I: DM=-23; I=-4; /M: SY='R'; D=-4; M= -7, -4,-24, -6, 1,-22, -9, -5,-20, 9,-18, -8, 0,-14, 9, 13, 1, 0,-16,-23,-12, 4; /I: DM=-23; I=-4; /M: SY='V'; D=-4; M= -4,-14,-12,-16,-14, -6,-20,-17, 4,-16, 3, 2,-11,-14,-13,-15, -2, 4, 6,-28,-10,-14; /I: DM=-23; I=-4; /M: SY='R'; M= -9, -3,-22, -4, -2,-14,-14, -8,-16, 1,-12, -8, -3,-17, -3, 4, -4, -3,-11,-24, -9, -3; /M: SY='I'; M=-11,-29,-24,-36,-27, 23,-33,-22, 26,-27, 19, 13,-22,-25,-24,-23,-20, -9, 17,-10, 11,-27; /M: M= -5, -7,-23, -8, -4,-11,-18, -9,-13, -3,-10, -8, -8,-17, -6, -4, -3, 0, -8,-10, -4, -5; /M: SY='R'; M= -6, -4,-24, -5, 3,-23,-16, -7,-22, 16,-22,-10, 1,-10, 8, 22, 3, 1,-15,-25,-13, 4; /M: SY='L'; M= -8,-27,-20,-30,-20, 18,-27,-19, 12,-27, 33, 13,-26,-22,-22,-20,-24, -9, 6,-15, 2,-20; /M: SY='P'; M= -8,-20,-39,-10, 0,-30,-19,-20,-20,-10,-29,-20,-20, 87,-10,-20, -9,-10,-29,-30,-30,-10; /M: SY='P'; M= -8, 2,-29, 5, 9,-26,-16, -5,-22, 4,-23,-13, -1, 14, 6, -2, -3, -6,-23,-26,-14, 5; /M: SY='I'; M= -8,-23,-13,-28,-24, 5,-30,-19, 20,-20, 10, 9,-20,-25,-20,-19,-12, -1, 20,-18, 5,-24; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21, 9,-31,-21, 23,-30, 46, 21,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 12,-20, 0,-21; /M: SY='I'; M= -3,-17,-16,-23,-18, -1,-25,-15, 10,-18, 4, 3,-13,-17,-15,-17, -5, 4, 10,-24, -5,-17; /M: SY='I'; M= -8,-29,-22,-35,-28, 4,-34,-26, 36,-26, 23, 19,-24,-25,-22,-24,-19, -7, 30,-22, -2,-27; /M: SY='H'; M=-13, 3,-28, 1, 8,-28,-16, 40,-21, -1,-20, -3, 10,-16, 26, 2, -3,-13,-27,-27, -1, 15; /M: SY='L'; M=-11,-28,-22,-31,-22, 12,-31,-20, 21,-28, 35, 17,-25,-24,-20,-21,-24, -7, 11,-17, 3,-22; /M: SY='K'; M= -7, 0,-25, -3, 4,-25,-17, -8,-17, 23,-23, -7, 4,-13, 9, 13, -2, -5,-13,-25,-11, 6; /M: SY='R'; M=-17, -9,-28,-10, -1,-20,-20, -3,-27, 29,-19, -9, -1,-19, 7, 58, -9, -8,-16,-21,-10, -1; /M: SY='F'; M=-16,-25,-20,-33,-25, 58,-27,-16, -1,-22, 4, -1,-17,-27,-31,-16,-14, -7, -1, 4, 27,-25; /M: SY='E'; M= -7, -1,-22, 0, 3,-10,-18, -3,-16, -1,-13, -9, -3,-15, -2, -1, 1, 2,-10,-22, -2, -1; /M: SY='Y'; M=-16,-18,-26,-22,-19, 31,-22, 8, -7,-16, -3, -3,-13,-27,-16,-12,-15,-10,-11, 14, 41,-18; /M: SY='D'; M=-11, 18,-25, 21, 8,-24,-11, -5,-22, 2,-19,-16, 12,-14, 0, -4, 0, -3,-19,-31,-15, 4; /M: M= -6, -7,-25, -8, -1,-11,-10, -3,-15, -5, -9, -7, -3,-13, -4, -1, -4, -6,-15,-18, -5, -3; /M: SY='N'; M=-10, 1,-26, -1, 1, -9,-12, -9,-19, -3,-18,-14, 3,-14, -4, -4, -3, -4,-18, -7, -5, -1; /I: MI=0; MD=-20; IM=0; DM=-20; I=0; /M: M= -6,-11,-17,-14,-12, -8, -7, -9,-10, -9, -8, -5, -6,-20,-10, -7, -5, -4, -6,-20, -4,-12; /M: SY='K'; M= -8,-10,-22,-12, -9,-11,-20,-14, -4, 3, -7, 1, -8,-14, -8, 0, -8, -1, 1,-23, -7, -9; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='E'; M= -8, 14,-25, 18, 19,-27,-14, -3,-23, 6,-22,-16, 10,-11, 8, 2, 3, -5,-19,-32,-17, 13; /M: SY='L'; M=-10,-30,-17,-30,-20, 9,-30,-20, 19,-30, 48, 19,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-21, -1,-20; /M: SY='F'; M=-12,-20,-18,-25,-19, 17,-27, -7, 2,-14, 1, 1,-15,-25,-17, -8,-12, -4, 4,-10, 14,-18; /M: SY='G'; M= 22, -8,-19,-12,-13,-24, 30,-18,-25,-14,-22,-16, -2,-14,-13,-18, 11, -5,-15,-23,-24,-13; /M: SY='V'; M= -2,-27,-15,-31,-28, 6,-30,-28, 26,-22, 11, 9,-24,-26,-27,-21,-10, 1, 36,-24, -5,-28; /M: SY='V'; M= -2,-25,-18,-29,-24, 2,-28,-24, 25,-22, 17, 14,-23,-24,-21,-21,-13, -4, 26,-24, -5,-23; /M: SY='V'; M= -3,-13, 3,-19,-19, -6,-23,-17, 4,-15, -6, -3, -9,-25,-17,-16, -2, 2, 11,-28, -6,-19; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 1, 3,-20,-20, 95,-30, -9,-20, -1, 10,-19, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 18, 2; /M: SY='S'; M= -4, -8,-18, -9, -4,-11,-14, -2,-11, -5,-12, -4, -4,-16, -1, -5, 4, 1,-10,-22, -1, -3; /M: SY='G'; M= -1,-10,-30,-10,-19,-30, 66,-19,-40,-18,-30,-20, 0,-20,-19,-16, 0,-20,-30,-20,-29,-19; /I: MI=0; MD=-33; IM=0; DM=-33; I=-6; /M: SY='S'; M= -1, 9,-18, 5, 2,-21, -3, -7,-18, -6,-23,-16, 15,-12, 1, -8, 18, 12,-15,-34,-18, 1; /M: SY='A'; M= 7,-14,-19,-16,-10,-11,-12,-11, -3,-16, 1, -1,-12, -9,-11,-16, -2, -2, -2,-26,-12,-11; /M: SY='N'; M= -5, 7,-21, 5, 4,-19, -9, 8,-18, -5,-20,-11, 10,-14, 3, -6, 9, 2,-17,-29, -8, 3; /M: SY='G'; M= -4, -5,-13, -6, -7,-15, 7, -7,-24, -9,-21,-15, 0,-18, -9, -8, 4, -4,-17,-23,-10, -8; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-19,-30, 66,-20,-39,-20,-30,-20, -1,-15,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='Y'; M=-20,-21,-30,-22,-21, 33,-30, 15, -1,-12, 0, -1,-21,-30,-13,-11,-21,-11,-10, 33, 75,-21; /M: SY='V'; M= -9,-23,-22,-28,-23, 9,-28,-20, 13,-18, 3, 4,-20,-23,-18,-17,-11, 1, 14, 0, 9,-21; /M: SY='A'; M= 19, -9, 10,-16,-12,-17,-10,-20,-12,-14,-15,-12, -6,-16,-12,-18, 14, 11, -1,-32,-19,-12; /M: SY='Y'; M=-17,-19,-24,-20,-19, 22,-27, 6, -2,-17, 2, 0,-17,-27,-16,-14,-18, -9, -6, 13, 38,-19; /M: SY='V'; M= 1,-22, -6,-29,-23, -8,-26,-25, 16,-18, 5, 6,-18,-22,-18,-17,-10, -3, 18,-26,-10,-22; /M: SY='R'; M=-13, -5,-26, -6, 1,-18,-20, -6,-22, 28,-20, -8, 0,-16, 4, 29, -9, -8,-16,-18, -4, 1; /M: SY='K'; M= -8, 5,-25, 4, 5,-22,-15, 6,-20, 8,-21,-11, 8,-11, 5, 3, 1, -4,-18,-27, -7, 4; /I: MD=-23; /M: SY='R'; D=-4; M= -4, -5,-17, -5, 2,-11, -8, -8,-12, 3, -9, -6, -2,-11, -1, 5, 0, -2, -9,-17, -9, 0; /I: MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; I=-2; /M: SY='D'; D=-4; M= -7, 5,-21, 8, 4,-20, 0, -4,-20, -1,-14,-12, 3, -7, -2, -2, -3, -8,-17,-22,-14, 0; /I: DM=-23; /M: SY='D'; M=-13, 11,-27, 12, 12,-24,-14, 8,-25, 9,-20,-13, 12,-14, 9, 10, -3, -8,-24,-28,-10, 9; /M: SY='N'; M= -7, 11,-21, 7, 0,-21, 10, -5,-26, -6,-25,-18, 16,-17, -4, -8, 3, -8,-25,-25,-16, -2; /M: SY='K'; M=-10, -5,-24, -5, 7,-24,-12, -8,-24, 16,-22,-11, -3, -9, 8, 16, -4, -8,-19,-23,-14, 6; /M: SY='W'; M=-20,-39,-48,-39,-30, 13,-21,-28,-19,-20,-18,-19,-39,-30,-20,-20,-39,-29,-28,142, 31,-20; /M: SY='Y'; M=-14,-23,-23,-25,-18, 17,-28, -4, 3,-15, 7, 2,-20,-27,-16, -8,-19,-10, 0, 5, 26,-18; /M: SY='R'; M=-12,-12,-21,-14, -6,-10,-25, -7, -8, 8, -6, -2, -9,-19, -2, 12,-11, -5, -6,-18, 0, -6; /M: SY='F'; M=-17,-27,-19,-33,-26, 45,-31,-13, 7,-24, 12, 5,-21,-28,-27,-18,-21,-10, 2, 4, 30,-26; /M: SY='D'; M=-13, 40,-24, 41, 9,-30, -3, 3,-30, -1,-30,-25, 36,-14, 0, -6, 8, -3,-28,-40,-20, 4; /M: SY='D'; M=-20, 49,-30, 68, 19,-40, -8, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 9; /M: SY='E'; M= -7, 5,-19, 7, 12,-18,-13, -4,-22, -4,-18,-13, 2,-12, 4, -5, 5, 2,-17,-28,-12, 8; /M: SY='T'; M= -6, -2,-21, -6, -4,-14,-18, -5,-10, 3,-12, -6, 2,-17, -4, 3, 0, 4, -6,-26, -7, -5; /M: SY='V'; M= -2,-29,-13,-31,-29, 1,-31,-26, 29,-21, 11, 10,-27,-28,-26,-21,-12, -3, 40,-24, -3,-29; /M: SY='S'; M= -4, 0,-14, -1, 1,-18,-13,-10,-19, 1,-20,-13, 1,-14, 0, -2, 9, 9,-12,-25, -9, 0; /M: SY='E'; M= -2, -8,-25, -7, 9,-18,-19,-10,-11, -1,-12, -8, -8, -6, 4, 0, -3, -6,-10,-22,-13, 5; /M: SY='V'; M= 0,-20, -7,-24,-20, -8,-25,-17, 13,-18, 3, 4,-18,-22,-17,-17, -6, -2, 20,-29,-10,-20; /M: SY='T'; M= -6, 8,-21, 8, 9,-21,-15, -6,-21, 3,-20,-15, 6, -9, 3, 0, 9, 10,-16,-29,-11, 5; /I: MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24; I=-2; /M: SY='T'; D=-5; M= -4, -4,-17, -5, -3,-12,-12, -5,-12, 0,-11, -7, -4, -2, -3, -1, -1, 2,-10, -7, -5, -3; /I: DM=-24; /M: SY='N'; M= -3, 7,-20, 3, -2,-18, -8, -7,-13, -8,-16,-12, 12,-13, -1, -9, 9, 5,-14,-31,-13, -2; /M: SY='A'; M= 33,-11,-15,-17,-11,-21, 5,-18,-13,-12,-14,-11,-10, -5,-12,-19, 6, -3, -4,-22,-21,-12; /M: SY='Y'; M=-18,-20,-29,-21,-21, 27,-30, 13, 4,-12, 2, 1,-19,-29,-12,-12,-19, -9, -6, 22, 67,-21; /M: SY='I'; M= -8,-26,-21,-32,-25, 4,-30,-19, 29,-22, 21, 26,-23,-24,-17,-20,-18, -7, 23,-21, 0,-22; /M: SY='L'; M=-10,-28,-18,-29,-20, 10,-30,-16, 18,-26, 36, 17,-27,-28,-18,-19,-25, -9, 10,-16, 6,-20; /M: SY='F'; M=-15,-27,-21,-34,-26, 42,-27,-14, 9,-24, 16, 13,-22,-28,-26,-18,-20,-10, 6, -1, 21,-24; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 28,-30, 18, 0,-10, 0, 0,-20,-27,-10,-11,-20,-10,-10, 28, 76,-20; /M: SY='E'; M=-10, -4,-26, -2, 14,-22,-20, -3,-17, 9,-14, -7, -4, -9, 8, 9, -5, -4,-13,-25,-12, 10; /M: SY='R'; M=-13, -9,-29, -9, 1,-20,-15, -4,-24, 20,-18, -8, -3,-15, 8, 40, -8,-10,-18,-20, -9, 1; /M: SY='R'; M=-11, -9,-16,-10, -5,-15,-23,-10, -7, 0, -5, 0, -8,-20, 2, 6, -9, -7, -4,-25, -9, -3; /M: SY='D'; M=-11, 12,-27, 17, 6,-21, -9, -4,-21, -4,-18,-14, 5,-12, 0, -6, -3, -8,-19,-26,-11, 2; /I: E1=0;
Numerical results
UniProtKB/Swiss-Prot release number: 01, total number of sequence entries in that release: 534242. Total number of hits in UniProtKB/Swiss-Prot: 321 hits in 321 different sequences Number of hits on proteins that are known to belong to the set under consideration: 318 hits in 318 different sequences Number of hits on proteins that could potentially belong to the set under consideration: 3 hits in 3 different sequences Number of false hits (on unrelated proteins): 0 hits in 0 different sequences Number of known missed hits: 1 Number of partial sequences which belong to the set under consideration, but which are not hit by the pattern or profile because they are partial (fragment) sequences: 0 Precision (true hits / (true hits + false positives)): 100.00 % Recall (true hits / (true hits + false negatives)): 99.69 %
Comments
MATRIX_TYPE: protein_domain Scaling database: UniProtKB/Swiss-Prot: reversed Matrix author: K_Hofmann Taxonomic range: Eukaryotes, Eukaryotic viruses Maximum known number of repetitions of the pattern in a single protein: 1 VERSION: 1
Cross-references
UniProtKB/Swiss-Prot	True positive hits: CREB_ASPCL (A1CIL1), CREB_ASPFC (B0Y4P5), CREB_ASPFN (B8NSV5), CREB_ASPFU (Q4WQI1), CREB_ASPNC (A2Q9N1), CREB_ASPOR (Q2UUG8), CREB_ASPTN (Q0CT11), CREB_EMENI (Q96V54), CREB_NEOFI (A1CW53), CYLD_BOVIN (Q1RMU2), CYLD_HUMAN (Q9NQC7), CYLD_MOUSE (Q80TQ2), CYLD_PONAB (Q5RED8), CYLD_RAT (Q66H62), FAF_DROME (P55824), NOT_DROME (Q9VVR1), PAN2_ASHGO (Q754X1), PAN2_ASPCL (A1CEK7), PAN2_ASPFU (Q4WHP6), PAN2_ASPNC (A2QW83), PAN2_ASPOR (Q2ULU6), PAN2_ASPTN (Q0CJU7), PAN2_CANAL (Q5APK0), PAN2_CANGA (Q6FS70), PAN2_CHAGB (Q2GSV2), PAN2_CHICK (Q5F450), PAN2_COCIM (Q1E873), PAN2_CRYNB (P0CQ09), PAN2_CRYNJ (P0CQ08), PAN2_DEBHA (Q6BZ78), PAN2_EMENI (Q5BBL5), PAN2_HUMAN (Q504Q3), PAN2_KLULA (Q6CMN5), PAN2_LODEL (A5E1W0), PAN2_MAGO7 (A4RF51), PAN2_MOUSE (Q8BGF7), PAN2_NEOFI (A1DFN6), PAN2_NEUCR (P0C581), PAN2_PHANO (Q0UPL5), PAN2_PICGU (A5DAD0), PAN2_PICST (A3LRV8), PAN2_RAT (Q6IE70), PAN2_SCHPO (Q09798), PAN2_YEAST (P53010), SAD1_YEAST (P43589), SNUT2_HUMAN (Q53GS9), SNUT2_MOUSE (Q3TIX9), SNUT2_PONAB (Q5R761), U17L1_HUMAN (Q7RTZ2), U17L2_HUMAN (Q6R6M4), U17L2_MOUSE (Q7M764), U17L3_HUMAN (A6NCW0), U17L4_HUMAN (A6NCW7), U17L5_HUMAN (A8MUK1), U17L6_HUMAN (Q6QN14), U17L7_HUMAN (P0C7H9), U17L8_HUMAN (P0C7I0), UB10A_XENLA (Q2NL57), UB10B_XENLA (Q7ZXR7), UB12A_XENLA (Q52KZ6), UB12B_XENLA (Q5M981), UB22A_XENLA (Q6GNI6), UB22B_XENLA (Q6DCJ1), UBP10_ARATH (Q9ZSB5), UBP10_BOVIN (A5PJS6), UBP10_CHICK (Q5ZJN4), UBP10_HUMAN (Q14694), UBP10_MOUSE (P52479), UBP10_RAT (Q3KR59), UBP10_SCHPO (Q9USR2), UBP10_XENTR (Q6DIJ4), UBP10_YEAST (P53874), UBP11_ARATH (Q9MAQ3), UBP11_CANFA (Q01988), UBP11_HUMAN (P51784), UBP11_MOUSE (Q99K46), UBP11_SCHPO (Q9UUD6), UBP11_YEAST (P36026), UBP12_ARATH (Q9FPT1), UBP12_BOVIN (A5D9H7), UBP12_DANRE (A4FUN7), UBP12_HUMAN (O75317), UBP12_MOUSE (Q9D9M2), UBP12_SALSA (C0HB46), UBP12_SCHPO (O60079), UBP12_YEAST (P39538), UBP13_ARATH (Q84WU2), UBP13_HUMAN (Q92995), UBP13_YEAST (P38187), UBP14_ARATH (Q8L6Y1), UBP14_BOVIN (Q0IIF7), UBP14_CAEEL (Q17361), UBP14_HUMAN (P54578), UBP14_MOUSE (Q9JMA1), UBP14_PANTR (P60051), UBP14_RABIT (P40826), UBP14_SCHPO (Q11119), UBP14_YEAST (P38237), UBP15_ARATH (Q9FPS9), UBP15_HUMAN (Q9Y4E8), UBP15_MOUSE (Q8R5H1), UBP15_YEAST (P50101), UBP16_ARATH (Q9SB51), UBP16_BOVIN (Q08DA3), UBP16_DANRE (A8HAL1), UBP16_EMENI (P0CAQ1), UBP16_HUMAN (Q9Y5T5), UBP16_MACFA (Q4R6X7), UBP16_MOUSE (Q99LG0), UBP16_RAT (Q2KJ09), UBP16_SCHPO (O74442), UBP16_XENLA (Q6PAW2), UBP16_XENTR (Q0VA64), UBP16_YEAST (Q02863), UBP17_ARATH (Q9FKP5), UBP17_HUMAN (Q0WX57), UBP18_ARATH (Q67XW5), UBP18_HUMAN (Q9UMW8), UBP18_MOUSE (Q9WTV6), UBP18_PONAB (Q5RE63), UBP19_ARATH (Q9SJA1), UBP19_HUMAN (O94966), UBP19_MOUSE (Q3UJD6), UBP19_RAT (Q6J1Y9), UBP1_ARATH (Q9FPT5), UBP1_BOVIN (Q29RP1), UBP1_HUMAN (O94782), UBP1_MOUSE (Q8BJQ2), UBP1_RAT (Q569C3), UBP1_SCHPO (Q9USM5), UBP1_YEAST (P25037), UBP20_ARATH (Q9FPS7), UBP20_BOVIN (A7Z056), UBP20_DANRE (A5PN09), UBP20_HUMAN (Q9Y2K6), UBP20_MOUSE (Q8C6M1), UBP20_PONAB (Q5R5Z6), UBP20_XENLA (B1WBD7), UBP20_XENTR (A0JM59), UBP21_ARATH (Q9FIQ1), UBP21_BOVIN (Q2KJ72), UBP21_HUMAN (Q9UK80), UBP21_MOUSE (Q9QZL6), UBP21_RAT (B2GUX4), UBP21_SCHPO (Q9UTT1), UBP22_ARATH (Q9LEW0), UBP22_BOVIN (P0C8Z3), UBP22_DANRE (A6H8I0), UBP22_HUMAN (Q9UPT9), UBP22_MOUSE (Q5DU02), UBP23_ARATH (Q9FPS4), UBP24_ARATH (Q9FPS3), UBP24_HUMAN (Q9UPU5), UBP24_MOUSE (B1AY13), UBP25_ARATH (Q9FPS2), UBP25_HUMAN (Q9UHP3), UBP25_MOUSE (P57080), UBP26_ARATH (Q9SCJ9), UBP26_HUMAN (Q9BXU7), UBP26_MOUSE (Q99MX1), UBP26_ORYSI (A2XDG4), UBP26_ORYSJ (A3AF13), UBP27_ARATH (Q9FPS0), UBP27_HUMAN (A6NNY8), UBP27_MOUSE (Q8CEG8), UBP28_CHICK (Q5ZID5), UBP28_HUMAN (Q96RU2), UBP28_MOUSE (Q5I043), UBP28_RAT (D3ZJ96), UBP29_HUMAN (Q9HBJ7), UBP29_MOUSE (Q9ES63), UBP2_ARATH (Q8W4N3), UBP2_BOVIN (Q2KHV7), UBP2_CHICK (O57429), UBP2_HUMAN (O75604), UBP2_KLULA (O42726), UBP2_MOUSE (O88623), UBP2_RAT (Q5U349), UBP2_SCHPO (Q9P3U0), UBP2_YEAST (Q01476), UBP30_DANRE (A2BGT0), UBP30_HUMAN (Q70CQ3), UBP30_MOUSE (Q3UN04), UBP30_XENTR (A4QNN3), UBP31_HUMAN (Q70CQ4), UBP32_HUMAN (Q8NFA0), UBP33_BOVIN (A6QNM7), UBP33_DANRE (A5PMR2), UBP33_HUMAN (Q8TEY7), UBP33_MOUSE (Q8R5K2), UBP33_PONAB (Q5REG5), UBP33_XENTR (Q28CN3), UBP34_HUMAN (Q70CQ2), UBP34_MOUSE (Q6ZQ93), UBP35_HUMAN (Q9P2H5), UBP36_DROAN (B3M3M6), UBP36_DROER (B3NC86), UBP36_DROGR (B4IXE0), UBP36_DROME (Q9VRP5), UBP36_DROMO (B4KXJ5), UBP36_DROPS (Q2LZB1), UBP36_DROSE (B4HUI5), UBP36_DROSI (B4QIS3), UBP36_DROVI (B4LG38), UBP36_DROWI (B4MLR8), UBP36_DROYA (B4PIW8), UBP36_HUMAN (Q9P275), UBP36_MOUSE (B1AQJ2), UBP37_BOVIN (F1N5V1), UBP37_CANFA (E2RK09), UBP37_CHICK (E1C213), UBP37_DANRE (E7F6T8), UBP37_HUMAN (Q86T82), UBP37_MOUSE (Q8C0R0), UBP37_PIG (F1SRY5), UBP38_HUMAN (Q8NB14), UBP38_MOUSE (Q8BW70), UBP3_ARATH (O24454), UBP3_HUMAN (Q9Y6I4), UBP3_MOUSE (Q91W36), UBP3_SCHPO (O94269), UBP3_YEAST (Q01477), UBP40_HUMAN (Q9NVE5), UBP40_MOUSE (Q8BWR4), UBP41_HUMAN (Q3LFD5), UBP42_BOVIN (E1B9W9), UBP42_HUMAN (Q9H9J4), UBP42_MOUSE (B2RQC2), UBP42_RAT (D3ZU96), UBP43_HUMAN (Q70EL4), UBP43_MOUSE (Q8BUM9), UBP44_AILME (D2HBJ8), UBP44_DANRE (Q7ZUM8), UBP44_HUMAN (Q9H0E7), UBP44_XENTR (Q0V9G5), UBP45_HUMAN (Q70EL2), UBP45_MOUSE (Q8K387), UBP46_DANRE (A5WWB0), UBP46_HUMAN (P62068), UBP46_MOUSE (P62069), UBP46_PONAB (Q5RBQ4), UBP47_CHICK (E1C1R4), UBP47_HUMAN (Q96K76), UBP47_MOUSE (Q8BY87), UBP47_XENLA (Q5U252), UBP47_XENTR (A1A5G2), UBP48_CHICK (Q5ZM45), UBP48_HUMAN (Q86UV5), UBP48_MOUSE (Q3V0C5), UBP48_RAT (Q76LT8), UBP49_HUMAN (Q70CQ1), UBP49_MOUSE (Q6P9L4), UBP4_ARATH (Q8LAM0), UBP4_ASHGO (Q754R5), UBP4_BOVIN (A6QR55), UBP4_CANGA (Q6FQF0), UBP4_HUMAN (Q13107), UBP4_KLULA (Q9HFS7), UBP4_MOUSE (P35123), UBP4_PONAB (Q5RCD3), UBP4_RAT (B2GUZ1), UBP4_SCHPO (O60139), UBP4_VANPO (A7TGY3), UBP4_YEAS1 (B3LGK1), UBP4_YEAS7 (A6ZY34), UBP4_YEAST (P32571), UBP50_HUMAN (Q70EL3), UBP50_MACFA (Q4R6D3), UBP50_MOUSE (Q6P8X6), UBP51_HUMAN (Q70EK9), UBP53_HUMAN (Q70EK8), UBP53_MOUSE (P15975), UBP54_HUMAN (Q70EL1), UBP54_MOUSE (Q8BL06), UBP54_RAT (Q6IE24), UBP5_ARATH (O22207), UBP5_HUMAN (P45974), UBP5_MOUSE (P56399), UBP5_PONAB (Q5R407), UBP5_SCHPO (Q09879), UBP5_YEAST (P39944), UBP6_ARATH (Q949Y0), UBP6_HUMAN (P35125), UBP6_SCHPO (Q92353), UBP6_YEAST (P43593), UBP7_ARATH (Q84WC6), UBP7_CAEBR (Q60MK8), UBP7_CAEEL (Q7JKC3), UBP7_CHICK (Q6U7I1), UBP7_DROME (Q9VYQ8), UBP7_HUMAN (Q93009), UBP7_MOUSE (Q6A4J8), UBP7_RAT (Q4VSI4), UBP7_SCHPO (Q9P7S5), UBP7_YEAST (P40453), UBP8_ARATH (Q9C585), UBP8_HUMAN (P40818), UBP8_MOUSE (Q80U87), UBP8_SCHPO (Q09738), UBP8_YEAST (P50102), UBP9_ARATH (Q93Y01), UBP9_SCHPO (Q9P7V9), UBP9_YEAST (P39967), UBPA_DICDI (P54201), UBPB_DICDI (O96612), UBPE_DROME (Q24574), UBPL1_MIMIV (Q5UQR3), UBPL2_MIMIV (Q5UPW7), UBPW_MOUSE (Q61068), UBPX_CAEEL (P34547), UBPY_CAEEL (Q09931), UP44A_XENLA (Q6NTR6), UP44B_XENLA (Q5XGZ2), USP9X_HUMAN (Q93008), USP9X_MOUSE (P70398), USP9Y_HUMAN (O00507), USPL1_HUMAN (Q5W0Q7), USPL1_MOUSE (Q3ULM6) False negative hits (sequences which belong to the set under consideration, but which have not been picked up by the pattern or profile): PAN2_YARLI (Q6C462) Sequences which could potentially belong to the set under consideration: R1AB_BEV (P0C6V7), R1AB_BRV1 (P0C6V8), R1A_BEV (P0C6F3) Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
PDB [Detailed view]	1NB8; 1NBF; 1VJV; 2AYN; 2AYO; 2F1Z; 2GFO; 2HD5; 2IBI; 2VHF; 2Y6E; 3I3T; 3IHP; 3M99; 3MHH; 3MHS; 3MTN; 3N3K; 3NHE;

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)

If you would like to retrieve all the Swiss-Prot entries referenced in the DR lines of this entry (with the exception of false positive hits) , you can enter a file name. These entries will then be saved to a file under this name. (Please note that this temporary file will only be kept for 1 week.)

Swiss Institute of Bioinformatics | Disclaimer

Back to the Top