PROSITE entry PS51078
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | ICLR_ED |
| Accession [info] | PS51078 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-FEB-2005 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00807 |
| Associated ProRule [info] | PRU00394 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | IclR effector binding domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=184; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=179; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9659883; R2=0.0176867; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=10567.5791016; R2=10.6514912; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=466; H_SCORE=15531; N_SCORE=10.2; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=257; H_SCORE=13305; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='K'; M= -4, -5,-26, -5, 6,-25,-13, -5,-25, 24,-22,-10, -2,-13, 5, 23, -6, -9,-16,-22,-12, 4; /M: SY='L'; M= -6,-20,-18,-25,-21, 10,-26,-18, 14,-22, 20, 8,-17,-27,-21,-18,-15, -3, 14,-20, 0,-21; /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-31,-24, 19,-31,-18, 17,-22, 20, 10,-24,-28,-23,-14,-20, -8, 15,-12, 10,-24; /M: SY='E'; M= -9, 1,-26, 2, 21,-24,-17, -2,-24, 12,-18,-11, 2,-11, 14, 21, 0, -4,-21,-26,-15, 16; /M: SY='L'; M=-10,-28,-19,-29,-21, 11,-29,-18, 18,-25, 36, 18,-28,-29,-20,-16,-25, -9, 13,-18, 3,-21; /M: SY='G'; M= 7, -8,-24, -9,-15,-27, 49,-18,-33,-17,-28,-19, 1,-17,-15,-18, 9,-10,-23,-24,-27,-15; /M: SY='S'; M= 3, -5,-14, -7, 0,-23, -1, -1,-22, -6,-19,-11, -2,-15, 2, -4, 5, -3,-15,-27,-15, 0; /M: SY='S'; M= 4, -6,-19, -9, -1,-13, -8, -7,-17, -4,-14,-10, -2,-14, -2, -4, 7, 4,-12,-24,-10, -2; /M: SY='Y'; M= 5,-20,-19,-25,-19, 17,-20,-10, 0,-13, 1, -2,-18,-23,-18,-15, -9, -6, 3, -2, 20,-19; /M: SY='L'; M= -4,-24,-19,-26,-17, 2,-25,-19, 12,-22, 30, 12,-22,-25,-16,-13,-18, -6, 8,-22, -4,-17; /M: SY='D'; M= -2, 6,-23, 9, 7,-27, -8, 5,-26, 3,-24,-14, 5,-12, 9, 5, 7, -4,-20,-29,-13, 7; /M: SY='R'; M= -8, -2,-22, -3, 3,-20,-14, 1,-21, 8,-20,-11, 5,-16, 6, 20, 6, -1,-15,-29,-12, 3; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='L'; M= -9,-16,-22,-19,-11, -2,-24, -3, 1, -9, 8, 7,-13,-21, -2, -1,-13, -6, -2,-15, 4, -8; D=-6; /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='D'; M=-15, 23,-30, 29, 10,-28,-11, 1,-29, 0,-27,-22, 14, 1, -1, -7, -3,-10,-28,-21,-15, 4; D=-6; /I: I=-6; DM=-29; /M: SY='L'; M= -5,-28,-23,-33,-24, 3,-31,-24, 30,-28, 32, 17,-25,-25,-20,-24,-22, -9, 19,-20, -2,-24; /M: SY='R'; M= -4,-16,-24,-18,-10,-11,-17,-15, -8, -2, -8, -5,-11, -6, -8, 7, -7, -6, -4,-22,-11,-11; /M: SY='E'; M= 0, -1,-23, 0, 8,-23,-17, -5,-15, 5,-16, -9, -3,-12, 5, 2, 0, -4,-10,-26,-13, 6; /M: SY='V'; M= -4,-21,-21,-23,-15, -7,-24,-18, 9,-12, 6, 5,-17,-22, -9, -7,-10, -5, 11,-18, -7,-13; /M: SY='A'; M= 38,-11, -4,-20,-12,-18, -5,-21, -8,-12,-10, -9,-11,-13,-12,-19, 9, 3, 3,-24,-19,-12; /M: SY='R'; M= -6, -6,-26, -7, -1,-18,-13, 2,-22, 10,-16, -7, -2,-17, 7, 20, -5, -9,-17,-21, -8, 1; /M: SY='P'; M= -7,-15,-32, -9, -4,-24,-16,-18,-14,-10,-23,-15,-13, 48,-10,-14, -4, -6,-17,-30,-24,-10; /M: SY='Y'; M=-14,-22,-28,-25,-18, 7,-28, 2, 4,-17, 1, 3,-17,-19,-13,-12,-18,-12, 0, -1, 12,-17; /M: SY='L'; M= -9,-25,-19,-29,-19, 5,-26,-13, 18,-22, 36, 33,-25,-25,-12,-16,-24, -7, 9,-21, -1,-16; /M: SY='E'; M= -9, 10,-26, 13, 14,-27,-10, -4,-26, 7,-21,-15, 5,-12, 8, 9, 0, -4,-20,-28,-16, 10; /M: SY='E'; M= -5, 11,-26, 16, 22,-28,-14, -3,-25, 6,-18,-15, 4,-10, 10, 5, -1, -8,-22,-28,-17, 15; /M: SY='L'; M= -9,-30,-21,-31,-22, 8,-31,-22, 24,-29, 45, 19,-29,-29,-21,-21,-28, -9, 14,-21, -1,-22; /M: SY='M'; M= 5,-10,-10,-16, -9,-13,-13, -9, -3, -9, -3, 10, -7,-17, -2, -8, 1, -2, -2,-27,-12, -5; /M: SY='E'; M= -1, 2,-24, 3, 11,-22,-16, -8,-18, 5,-12,-11, -1,-12, 2, 6, -4, -8,-14,-26,-14, 6; /M: SY='R'; M= -2, -4,-24, -5, 10,-23,-17, -7,-19, 11,-14, -8, -3,-12, 12, 13, 0, -2,-16,-24,-13, 10; /M: SY='T'; M= 1, -7,-11,-13,-12, -9,-18,-20, -3,-13, -7, -7, -5,-15,-12,-12, 16, 31, 7,-31,-11,-12; /M: SY='G'; M= -3, -7,-27, -7,-11,-26, 39, -9,-31,-11,-26,-16, 1,-19,-12,-11, 0,-15,-22,-24,-22,-12; /M: SY='E'; M= -6, -4,-29, 1, 30,-19,-20, -8,-19, -1, -8,-12,-10, -9, 8, -7, -9,-12,-21, -6,-11, 20; /M: SY='T'; M= 3, -5,-15,-11,-10,-12,-17, -9, -8,-11, -9, -8, -2, -7,-10,-12, 10, 22, -2,-29,-11,-10; /M: SY='V'; M= 4,-22, 12,-28,-25, -4,-25,-27, 9,-21, 0, 0,-21,-26,-25,-22, -5, 2, 22,-29,-12,-25; /M: SY='H'; M=-13, 12,-24, 7, -2,-17,-14, 41,-20, -7,-20, -9, 20,-20, 1, -4, 0, -6,-20,-31, 3, -3; /M: SY='L'; M= -4,-27,-18,-30,-21, 8,-27,-19, 19,-24, 33, 21,-26,-26,-18,-19,-22, -8, 15,-20, -1,-20; /M: SY='A'; M= 12,-11,-17,-16,-15,-11, 11,-20,-13,-16,-14,-11, -6,-17,-16,-18, 8, 2, -5,-23,-16,-15; /M: SY='V'; M= 3,-19,-14,-23,-19, -5,-23,-23, 14,-19, 7, 4,-16,-21,-18,-18, -1, 9, 19,-27, -9,-19; /M: SY='L'; M= -9,-23,-22,-24,-16, 0,-26,-14, 8,-11, 22, 12,-20,-25,-12, 1,-20, -9, 6,-19, -1,-15; /M: SY='D'; M=-13, 25,-26, 36, 20,-30,-12, 8,-30, -1,-25,-21, 13,-10, 4, -7, 4, -6,-23,-36,-15, 11; /M: SY='G'; M= -4, 3,-26, 5, 5,-29, 17, -9,-27, -7,-24,-16, 4,-14, 2,-10, 4, -9,-22,-27,-22, 3; /M: SY='D'; M=-14, 21,-27, 29, 5,-24, -6, 2,-27, -5,-23,-18, 11,-15, -1, -7, 0, -8,-22,-29,-10, 1; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='E'; M= -4, 4,-19, 9, 26,-23,-11, 1,-26, -1,-20,-17, 0, -9, 6, -7, 4, -6,-23,-27,-11, 16; /M: SY='A'; M= 15,-18,-16,-24,-18,-10,-10,-20, 8,-17, 1, 6,-15,-18,-15,-20, -2, -3, 13,-24,-13,-17; /M: SY='V'; M= -5,-27,-17,-30,-26, 3,-31,-24, 27,-23, 19, 12,-25,-26,-23,-21,-15, -1, 30,-23, -1,-26; /M: SY='Y'; M=-15,-24,-26,-25,-22, 20,-30, 0, 10,-16, 7, 4,-22,-23,-16,-15,-19, -8, 4, 7, 43,-22; /M: SY='I'; M= -8,-29,-23,-34,-27, 0,-34,-27, 35,-23, 17, 15,-23,-24,-21,-19,-17, -7, 31,-23, -4,-27; /M: SY='D'; M= 2, 9,-24, 14, 12,-24, -8, 3,-23, -5,-16,-15, 1,-11, 0,-11, 1, -8,-18,-27,-11, 5; /M: SY='K'; M=-11, -1,-29, -2, 9,-29,-20, 2,-26, 30,-24, -7, 1,-12, 21, 25, -5, -6,-22,-21, -8, 15; /M: SY='V'; M= -2,-20,-15,-22,-20, -3,-24,-22, 17,-20, 9, 5,-16,-24,-19,-18, -4, 4, 23,-29, -9,-20; /M: SY='E'; M=-10, 4,-29, 11, 30,-20,-19, 5,-26, 4,-18,-15, -1, -5, 10, 1, -3,-10,-25,-24, -9, 19; /M: SY='S'; M= -1, -9, -6,-11,-10,-18, -1,-16,-19,-10,-19,-14, -3,-13, -9, -5, 11, 8,-10,-32,-19,-11; /M: SY='T'; M= -6,-10,-23,-11, -1,-11,-20, -9,-13, -1,-12, -7, -8, 1, -5, -1, -2, 3,-10,-24,-10, -4; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='Q'; M= -8, 3,-25, 5, 10,-24,-16, 10,-24, 6,-19,-10, 2,-13, 12, 8, 1, -4,-20,-26, -7, 10; /M: SY='S'; M= -3, -1,-24, 0, -1,-22, -3,-11,-21, -4,-19,-12, 0, 1, -4, -2, 3, -1,-17,-28,-19, -4; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='I'; M= -4,-24,-20,-28,-23, 0,-20,-19, 19,-22, 16, 16,-21,-24,-17,-20,-14, -7, 17,-21, -2,-21; /M: SY='R'; M=-11,-10,-27,-10, -4,-20,-10, -2,-23, 9,-20, -8, -1, -8, 2, 28, -1, -6,-17,-25,-13, -4; /M: SY='M'; M= -3,-18,-18,-24,-17, 0,-23, -7, 9,-15, 8, 16,-16,-21,-10,-14, -9, 0, 11,-22, -2,-14; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: M= -7,-13,-17,-13,-11, -2,-16, -9,-13, -6,-10, -8,-10,-13,-12, 0, -8, -8, -7,-18, -2,-13; /M: SY='S'; M= 11,-10,-13,-14, -9, -8, -9,-13, -6,-13, -6, -1, -5,-15, -7,-14, 13, 10, -2,-28,-12, -8; /M: SY='R'; M=-14,-10,-31, -8, 3,-18,-19, 5,-22, 9,-19, -7, -6, 1, 4, 18, -9,-10,-21,-14, -5, 0; /M: SY='I'; M= -7,-27,-23,-30,-22, 0,-33,-24, 29,-23, 16, 12,-24,-19,-20,-22,-17, -7, 25,-22, -2,-23; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='R'; M= -6, -5,-24, -9, -5,-21, -3, -7,-22, 9,-18, -6, 1,-16, 2, 19, 0, -1,-16,-23,-14, -3; /M: SY='R'; M=-12, -7,-25, -8, 0,-21,-18, 1,-22, 18,-19, -5, -1,-17, 10, 35, -2, -5,-14,-24, -9, 2; /M: SY='L'; M= -1,-21,-18,-25,-16, 5,-22,-17, 10,-21, 23, 11,-19,-24,-14,-17,-15, -6, 7,-20, -3,-15; /M: SY='P'; M= -9,-14,-36, -5, 4,-28,-19,-17,-20, -6,-26,-18,-15, 66, -7,-16, -7, -8,-27,-30,-26, -5; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='L'; M= -3,-25,-18,-27,-18, 6,-24,-18, 14,-23, 31, 14,-24,-20,-17,-18,-20, -8, 8,-18, -2,-18; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='H'; M=-19, -8,-29, -8, -8, -2,-24, 66,-17,-11, -9, 1, -2,-24, 2, -5,-15,-16,-21,-11, 37, -8; /M: SY='C'; M= 12,-11, 17,-17,-11,-20,-13,-18,-18, -6,-17,-13, -7,-19,-10, -6, 5, -2, -7,-31,-19,-11; /M: SY='T'; M= 3, -2,-13, -7, -6,-16, -9,-17,-16,-11,-19,-15, 2, -3, -7,-11, 23, 31, -7,-33,-16, -7; /M: SY='A'; M= 26, -9,-17,-13,-10,-23, 15,-18,-20,-12,-20,-15, -5, -4,-10,-18, 12, -2,-11,-25,-23,-10; /M: SY='I'; M= -1,-16,-12,-22,-18, -4,-21,-15, 10,-18, 4, 7,-11,-21,-13,-18, -4, 0, 8,-23, -3,-17; /M: SY='G'; M= -1, -9,-30, -9,-18,-31, 65,-18,-39,-18,-29,-19, 0,-19,-16,-18, 0,-19,-30,-20,-29,-17; /M: SY='K'; M= -6, -4,-28, -5, 5,-25,-19,-10,-25, 37,-22, -8, -3,-13, 6, 27,-10, -9,-16,-20,-10, 5; /M: SY='V'; M= 15,-17, -6,-23,-18,-11,-17,-24, 8,-17, -3, -2,-14,-19,-17,-20, 3, 4, 16,-27,-14,-18; /M: SY='L'; M=-11,-27,-24,-30,-23, 11,-30,-19, 18,-25, 26, 11,-25,-27,-20,-20,-23, -6, 9, -3, 10,-22; /M: SY='L'; M= -8,-27,-19,-29,-20, 6,-28,-19, 20,-26, 39, 20,-27,-28,-18,-19,-23, -7, 13,-22, -2,-19; /M: SY='A'; M= 40, -9,-11,-17, -9,-18, -1,-16,-11,-10,-13,-11, -7,-11, -8,-18, 13, 3, -2,-21,-15, -9; /M: SY='W'; M=-12,-23,-29,-26,-19, 19,-22, -6,-10,-17, -9, -8,-19,-19,-16,-15,-16,-11,-12, 33, 20,-16; /M: SY='L'; M= -6,-17,-12,-20,-15, -1,-20,-15, 1,-15, 11, 8,-17,-23,-12,-12,-15, -9, 1,-21, -5,-13; /M: SY='P'; M= -6, 2,-30, 10, 6,-29, -5, -7,-27, -7,-27,-20, -2, 25, -4,-14, 1, -5,-25,-31,-22, -1; /M: SY='E'; M= -5, 4,-26, 10, 24,-26,-18, -7,-23, 5,-19,-16, -2, 1, 6, 3, 0, -4,-19,-29,-18, 14; /M: SY='E'; M= 1, 8,-25, 12, 25,-29,-15, -5,-25, 9,-20,-15, 1, -6, 13, -1, 2, -4,-21,-27,-17, 19; /M: SY='E'; M=-10, 6,-26, 12, 22,-24,-19, 3,-20, 2,-17,-12, -1,-11, 12, -1, -1, -7,-16,-27,-10, 16; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='L'; M= -8,-20,-20,-20,-11, -7,-25,-13, 6, -9, 13, 8,-18,-23, -2, 0,-14, -7, 8,-21, -6, -7; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='K'; M= -5, 0,-24, -1, 6,-22,-13, -8,-17, 8,-18, -8, 1,-12, 5, 6, 1, -1,-14,-26,-13, 5; /M: SY='E'; M= 0, 3,-22, 4, 21,-22,-13, -4,-22, 5,-20,-15, 3, -9, 9, 2, 8, 0,-19,-26,-13, 14; /M: SY='Y'; M=-11,-28,-28,-31,-24, 15,-29,-13, 14,-22, 16, 7,-25,-27,-18,-20,-24,-12, 3, 16, 25,-22; /M: SY='L'; M= -8,-30,-24,-33,-23, 10,-31,-23, 23,-29, 34, 16,-26,-26,-21,-23,-25,-10, 12,-10, 2,-23; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='E'; M= 0, 0,-24, 2, 20,-23, -6, -3,-23, 4,-17,-13, -2, -8, 5, 0, 1, -7,-19,-25,-16, 13; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='R'; M= -7, -6,-25, -8, 2,-22,-10, -4,-18, 11,-15, -3, -3,-13, 12, 19, -4, -6,-15,-19,-11, 6; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='V'; M= 5,-15,-15,-18,-14, -2,-18, -8, 3,-12, 5, 2,-15,-19,-12,-12, -7, 0, 7,-15, 3,-14; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='G'; M= -2, 1,-25, 5, 5,-26, 12,-11,-25, -4,-21,-16, -1, -7, -3,-10, 0, -8,-19,-24,-20, 1; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='L'; M=-10,-25,-22,-26,-18, 8,-24,-16, 9,-20, 23, 10,-23,-25,-15,-12,-21, -9, 2, 1, 5,-16; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='K'; M= -9, -6,-26, -5, 5,-23,-20, -5,-16, 14,-18, -7, -5, 1, 9, 9, -5, -4,-14,-22,-10, 6; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='P'; M= 4,-11,-25,-11, -1,-23,-13,-11,-18, 2,-19,-11, -9, 19, 3, 6, -2, -5,-17,-22,-18, -2; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='F'; M= -4,-16,-22,-20,-14, 9,-14, 1,-11,-11, -1, -2,-10,-22,-13, -4,-11, -8, -8,-13, 6,-14; /M: SY='T'; M= 0, 1,-12, -6, -9,-11,-19,-19,-10,-11, -7, -9, -1,-12,-10,-11, 14, 38, -1,-29,-10, -9; /M: SY='P'; M=-11, 4,-31, 14, 7,-30,-15, -5,-25, -2,-26,-19, -1, 25, 0, -4, -1, -7,-24,-32,-20, 1; /M: SY='N'; M= -9, 6,-24, 3, 0,-16,-10, 8,-22, 4,-19,-12, 11,-17, 0, 10, -1, -2,-20,-22, -2, -2; /M: SY='T'; M= -2, 1,-13, -7, -2,-14,-20,-16,-12, -7,-12,-10, 0, -9, -3, -8, 17, 41, -5,-29,-11, -2; /M: SY='I'; M= -9,-28,-24,-33,-25, 6,-34,-25, 31,-25, 25, 16,-23,-24,-21,-22,-21, -9, 22,-20, 0,-25; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='T'; M= 4, -7, -4,-13,-12,-11,-14,-12, -8,-12, -9, -7, -5,-15,-12,-13, 10, 22, 3,-28,-11,-12; D=-5; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='D'; M=-11, 22,-23, 31, 17,-26,-10, 4,-28, 2,-22,-19, 12, -9, 4, 0, 4, -3,-22,-31,-14, 10; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='P'; M= -7,-13,-31,-10, 0,-22,-19,-14,-15, 2,-18, -9,-12, 30, -3, -1, -7, -6,-17,-26,-18, -5; /M: SY='E'; M=-12, 2,-30, 10, 18,-25,-20, -3,-21, 0,-14,-13, -5, 8, 4, -4, -7,-10,-21,-29,-16, 10; /M: SY='A'; M= 4, -8,-19,-11, -2,-17,-13, -9,-11, -4, -9, -6, -5,-14, -1, -3, 3, 3, -6,-25,-12, -2; /M: SY='L'; M=-13,-29,-21,-32,-22, 27,-30,-16, 14,-27, 35, 16,-26,-30,-23,-19,-26,-10, 6, -9, 13,-22; /M: SY='L'; M=-10,-15,-24,-16, -3, -1,-24, -6, -5, -3, 7, 5,-13,-20, -6, 2,-16,-10, -6,-18, -2, -5; /M: SY='E'; M= 3, 2,-24, 5, 20,-26,-13, 3,-25, 7,-21,-14, 0, -5, 7, 1, 2, -6,-20,-27,-14, 12; /M: SY='E'; M= -2, 4,-15, 7, 19,-24,-18, -9,-18, -2,-15,-14, -3,-10, 3, -6, -1, -5,-13,-30,-17, 10; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22, 8,-32,-22, 26,-30, 44, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 14,-20, 0,-22; /M: SY='A'; M= 15, 3,-21, 4, 12,-28, -9, -8,-20, -2,-18,-14, -2, -3, 8,-10, 6, -4,-16,-26,-19, 10; /M: SY='Q'; M= -2, -2,-25, -2, 5,-25,-18, -2,-16, 9,-15, -6, -3,-13, 11, 8, -4, -8,-13,-23,-11, 7; /M: SY='V'; M= 7,-19,-17,-27,-21, -6,-25,-26, 19,-19, 5, 5,-16,-18,-18,-21, -2, 9, 22,-25, -9,-21; /M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9, 1,-21,-20, 0,-29, 30,-20, -9, 0,-19, 13, 65, -9,-10,-21,-20,-10, 2; /M: SY='Q'; M= -1, -4,-26, -5, 12,-26,-18, -5,-20, 14,-14, -6, -4,-12, 18, 14, -4, -8,-18,-21,-12, 14; /M: SY='R'; M=-11, -5,-26, -4, 12,-23,-19, -2,-21, 10,-14, -7, -2,-14, 18, 24, -2, -4,-19,-24,-12, 13; /M: SY='G'; M= -2, -7,-30, -6,-17,-30, 62,-18,-40,-17,-30,-20, 1,-20,-18,-15, 0,-19,-30,-21,-29,-18; /M: SY='Y'; M=-16,-24,-32,-25,-22, 22,-26, 5, -3,-13, -4, -4,-24,-29,-13,-13,-22,-13,-11, 50, 60,-20; /M: SY='A'; M= 28, -9, 2,-16,-12,-21, 6,-20,-18,-14,-17,-14, -6,-15,-12,-19, 11, 1, -7,-27,-22,-12; /M: SY='V'; M= -5,-22,-20,-24,-15, 1,-28,-16, 16,-17, 11, 10,-21,-23,-13,-16,-13, -6, 17,-18, 2,-15; /M: SY='D'; M=-13, 32,-25, 42, 11,-32, -3, -3,-31, -4,-27,-24, 18,-13, -3,-10, 5, -6,-23,-37,-20, 4; /M: SY='B'; M=-12, 7,-23, 6, -4,-13,-17, 6,-12, -5, -7, -5, 7,-20, -5, -4, -6, -5,-12,-27, -3, -5; /M: SY='E'; M= -9, 6,-29, 11, 35,-28, -9, 6,-29, 5,-22,-16, 4, -7, 15, 3, 1,-10,-28,-29,-16, 24; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='E'; M=-11, 15,-30, 26, 50,-32,-14, -1,-32, 7,-22,-22, 3, -2, 15, -2, 0,-10,-30,-31,-20, 33; /M: SY='H'; M=-13, 4,-25, 1, -1,-15,-16, 16,-17, -2,-13, -6, 10,-19, 8, 5, -3, -4,-19,-23, 1, 2; /M: SY='E'; M= -6, -1,-26, 4, 28,-18,-19, -1,-20, -1,-14,-14, -5, -9, 7, -6, -1, -5,-19,-16, -8, 17; /M: SY='E'; M= -5,-10,-26,-10, 4,-12,-22, -7, -5, -8, -4, -4,-11, -3, 1,-11, -9, -8,-10,-18, -2, 1; /M: SY='G'; M= -4, -1,-29, 1, -4,-30, 44,-14,-37, -9,-29,-20, 4,-16,-10,-12, 0,-16,-29,-23,-26, -7; /M: SY='V'; M= -2,-27,-17,-31,-25, 1,-30,-25, 27,-23, 20, 15,-25,-25,-22,-21,-15, -2, 29,-25, -6,-25; /M: SY='R'; M= -1, -6,-20,-11, -8,-15,-15, -9,-11, 3,-13, -6, 1,-18, -3, 17, 3, 2, -4,-26,-13, -7; /M: SY='C'; M= 6,-12, 51,-18,-16,-20,-16,-13,-24,-20,-20,-16, -8,-25,-16,-21, 6, -2,-10,-40,-22,-16; /M: SY='I'; M= -4,-29,-22,-35,-28, 0,-34,-28, 37,-26, 20, 16,-24,-24,-22,-25,-17, -7, 31,-23, -4,-28; /M: SY='A'; M= 35, -5,-14,-10, -8,-23, 9,-18,-17,-11,-15,-13, -5,-11,-10,-19, 9, -3, -7,-23,-21, -9; /M: SY='A'; M= 22,-17,-11,-22,-17,-11,-13,-22, 6,-14, -3, 0,-16,-18,-16,-18, 5, 2, 18,-26,-15,-16; /M: SY='P'; M= -1,-19,-29,-12, -3,-28,-18,-20,-19,-11,-27,-19,-19, 70,-11,-20, -7, -9,-25,-29,-29,-11; /M: SY='I'; M= -6,-30,-21,-35,-29, 1,-35,-29, 40,-26, 18, 16,-25,-25,-24,-25,-17, -6, 37,-24, -4,-29; /M: SY='F'; M=-18,-24,-26,-27,-20, 36,-27, -2, -4,-16, 5, 0,-18,-24,-20, -6,-20,-11, -7, 8, 29,-20; /M: SY='D'; M=-14, 39,-26, 47, 11,-33, -1, 0,-34, -2,-30,-26, 27,-13, -2, -8, 5, -6,-29,-38,-21, 5; /M: SY='H'; M= -3, -4,-26, -4, 6,-18,-17, 13,-16, -3,-14, -6, -4, -6, 4, -2, -4, -9,-17,-22, -2, 3; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='H'; M= -5, -3,-21, -6, -3,-11, -9, 4,-16, -5,-16, -8, 3,-16, 3, -2, 3, 0,-14,-21, -4, 0; D=-6; /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='G'; M= -6, -4,-28, -6,-10,-25, 30, -6,-32, -7,-27,-17, 6,-10, -9, 0, -1,-13,-26,-23,-22,-11; D=-6; /I: I=-6; DM=-29; /M: SY='R'; M= -5, -8,-23, -8, 3,-17,-14, -8,-13, 3,-13, -5, -7,-11, 2, 5, -1, -2, -9,-24,-10, 1; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='V'; M= -4,-23,-19,-24,-20, -6,-27,-25, 18,-18, 4, 4,-22, -2,-20,-19, -9, 0, 21,-26,-11,-22; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='I'; M= 0,-17,-19,-24,-21, -3,-25,-22, 18,-19, 5, 4,-12,-16,-19,-20, -7, 0, 17,-25, -8,-21; /M: SY='A'; M= 23,-13,-18,-19,-15,-12, 9,-14,-13,-14, -8, -8,-11,-17,-13,-18, 0, -7, -7,-12, -5,-15; /M: SY='A'; M= 25,-11, -6,-18,-14,-20, 11,-19,-16,-14,-14, -8, -8,-15,-12,-19, 6, -2, -7,-24,-21,-13; /M: SY='I'; M= -7,-30,-20,-33,-26, 4,-33,-26, 31,-27, 30, 17,-27,-27,-23,-23,-21, -7, 27,-23, -3,-26; /M: SY='S'; M= 5, 6,-14, 2, -3,-21, 6, -8,-22, -9,-29,-19, 18,-13, -3, -9, 29, 14,-15,-37,-21, -3; /M: SY='I'; M= -6,-29,-16,-35,-27, 0,-34,-27, 33,-27, 22, 15,-24,-25,-22,-26,-19, -8, 25,-23, -4,-27; /M: SY='S'; M= 9,-11,-10,-13,-12,-12,-11,-17, -1,-13,-12, -5, -6,-17,-11,-14, 18, 12, 11,-33,-15,-11; /M: SY='G'; M= 2,-12,-25,-13,-16,-16, 28,-17,-24,-17,-19,-14, -6,-10,-16,-18, 1, -7,-19,-18,-15,-17; /M: SY='P'; M= -4,-11,-27, -8, -3,-21,-17, -8,-12,-11,-15, -7,-11, 26, -4,-14, -2, -3,-14,-29,-17, -6; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='A'; M= 12, -7,-14,-11, -9,-15,-12,-17, -7, -9,-11, -9, -6, -8, -9,-11, 9, 11, 2,-27,-15,-10; D=-6; /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='S'; M= -3, -7,-20, -8, -3,-13, -7,-11, -6,-10,-11, -8, -2,-15, -6, -9, 6, 0, -4,-26,-10, -5; D=-6; /I: I=-6; DM=-29; /M: SY='R'; M=-11,-12,-27,-12, -2,-20,-20, -6,-21, 19,-18, -8, -5,-11, 6, 42, -8, -8,-13,-22,-12, -2; /M: SY='M'; M= -9,-26,-19,-30,-24, 9,-28,-12, 21,-21, 21, 22,-24,-27,-18,-17,-19, -8, 20,-18, 5,-22; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='T'; M= -2, -1, -9, -6, -6,-16,-17,-14,-11, -6,-14,-10, 2,-14, -4, -8, 12, 20, -6,-31,-13, -5; /M: SY='E'; M= -8, 3,-30, 9, 24,-30, -6, -6,-30, 8,-23,-17, -1, 1, 9, 5, -3,-11,-26,-26,-20, 15; /M: SY='E'; M= 0, 8,-25, 13, 25,-28,-14, -4,-22, 1,-20,-16, 2, -3, 12, -6, 4, -6,-20,-30,-19, 18; /M: SY='R'; M= -1, -4,-25, -4, 1,-18, -7, -6,-21, 9,-18,-11, -2,-16, -1, 12, -4, -8,-15,-18, -7, -2; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='L'; M= -5,-22,-20,-24,-15, 1,-26,-19, 10,-15, 18, 8,-20,-24,-15, -8,-16, -5, 11,-21, -4,-16; /M: SY='E'; M= -4, 5,-22, 7, 11,-22,-17, -4,-17, -3,-17,-13, 0, -4, 0, -8, 4, 5,-12,-30,-14, 4; /M: SY='E'; M=-10, 7,-26, 8, 15,-19,-12, -2,-25, 6,-21,-15, 6,-12, 7, 6, 2, -4,-22,-25,-10, 10; /M: SY='L'; M=-14,-22,-19,-24,-16, 7,-28, -4, 3,-18, 14, 7,-19,-26, -9,-10,-21,-12, -3, -5, 13,-13; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='L'; M= -3,-17,-22,-17,-14,-12, -3,-18, -7,-10, 1, -2,-14,-16,-14, -8, -9, -6, -2,-23,-13,-14; /M: SY='P'; M= 2, -7,-27, -5, 6,-24,-13,-16,-16, -5,-18,-14,-10, 20, -5,-13, -2, -3,-15,-27,-21, -1; /M: SY='M'; M= -2,-16,-23,-20,-10,-11,-22, -8, 5,-11, 7, 11,-15,-13, 0,-11,-11, -6, 0,-22, -6, -6; /M: SY='L'; M= -4,-29,-17,-30,-23, 5,-29,-23, 22,-26, 34, 15,-29,-29,-22,-20,-22, -7, 22,-23, -4,-23; /M: SY='R'; M= -8,-10,-27,-12, -1,-20,-22, -4,-12, 11,-10, -2, -5,-16, 11, 20, -8, -7,-11,-21, -8, 3; /M: SY='E'; M= 6, 8,-22, 7, 13,-26,-10, -6,-23, 6,-20,-15, 6,-10, 7, 1, 5, -3,-18,-27,-17, 10; /M: SY='A'; M= 20,-12, 10,-20,-15,-16,-13,-22, -8,-12,-10, -9,-11,-17,-14,-18, 6, 6, 4,-29,-18,-15; /M: SY='A'; M= 40, -9,-11,-17,-10,-20, 3,-19,-13,-11,-13,-11, -7,-11,-10,-19, 12, 4, -3,-22,-20,-10; /M: SY='R'; M= -5, -2,-26, -3, 10,-24,-17, -4,-24, 20,-19,-10, 1,-13, 12, 27, -5, -8,-19,-22,-13, 10; /M: SY='E'; M= 0, 10,-25, 13, 21,-29,-13, -4,-26, 8,-22,-16, 4, -8, 13, 3, 3, -6,-22,-28,-17, 16; /M: SY='I'; M= -8,-30,-23,-35,-27, 3,-34,-26, 37,-27, 26, 20,-25,-25,-21,-24,-21, -8, 28,-22, -2,-26; /M: SY='S'; M= 5, -1, -4, -2, 2,-20, -6,-11,-21, -8,-26,-19, 6,-12, -1, -7, 30, 17,-11,-38,-19, 0; /M: SY='R'; M=-13, 1,-27, 1, 10,-19,-19, 4,-21, 12,-16,-10, 3,-15, 7, 20, -5, -6,-18,-24, -6, 6; /M: SY='A'; M= 9, -5,-22, -7, 0,-23, -3,-10,-16, -2,-11, -6, -5,-14, 4, -5, 0, -7,-13,-23,-15, 1; /M: SY='L'; M= -9,-29,-20,-30,-22, 9,-30,-19, 22,-27, 41, 19,-29,-29,-20,-20,-26, -9, 15,-19, 2,-21; /M: SY='G'; M= 2,-11,-27,-11,-14,-20, 47,-18,-32,-18,-22,-16, -3,-19,-17,-18, -2,-16,-24,-19,-23,-15; /M: SY='W'; M= -6,-13,-28,-13,-15, -1, -4,-10,-17,-12,-12,-11,-12,-22,-13,-11, -9, -9,-16, 16, 12,-14; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
| PROMOTED_BY | PS51077 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 35 in 35 different sequences |
| Number of true positive hits | 35 in 35 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Archaea, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | PS_Langendijk_Genevaux |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | IclR-ED |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
35 sequences
ALLR_ECO57 (P0ACN6), ALLR_ECOK1 (A1A8H2), ALLR_ECOL5 (Q0TKD5), ALLR_ECOL6 (P0ACN5), ALLR_ECOLI (P0ACN4), ALLR_ECOUT (Q1RF28), ALLR_KLEPN (Q765S0), ALLR_SALCH (Q57S48), ALLR_SALPA (Q5PCF5), ALLR_SALTI (Q8Z8R2), ALLR_SALTY (Q8ZR86), ARCR_HALS3 (B0R9X6), BHCR_PARDP (A1B8Z4), GYLR_STRCO (P15360), GYLR_STRGR (P22866), ICLR_ECOLI (P16528), ICLR_SALTY (P17430), KDGR_DICCH (P37728), KDGR_ECOLI (P76268), KIPR_BACSU (P42968), MHPR_ECOLI (P77569), PCAR_PSEPU (Q52154), PCAU_ACIAD (O83046), POBR_ACIAD (Q43992), RHMR_ECOLI (P77732), SAUR_CUPNH (Q0K846), SRPS_PSEPU (Q9R9U0), TSAQ_COMTE (Q6XL52), TTGV_PSEPT (Q93PU6), XACR_HALVD (D4GP42), XYNR_ECOLI (P77300), Y1032_HAEIN (P44996), Y1719_MYCTU (P71977), YIAJ_ECOLI (P37671), YJHI_ECOLI (P39360)» more
|
| PDB [Detailed view] |
10 PDB
1TD5; 1TF1; 1YSP; 1YSQ; 2O99; 2O9A; 2XRN; 2XRO; 5HPF; 5HPI |