Entry: PS51236

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] TSP_CTER
Accession [info] PS51236
Entry type [info] MATRIX
Date [info] MAR-2007 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51236
Associated ProRule [info] PRU00635

Name and characterization of the entry

Description [info] Thrombospondin C-terminal domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=215;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=210;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9005461; R2=0.0112374; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-9.791e+04; R2=1.088e+02; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=899; N_SCORE=12.0; H_SCORE=48317; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=410; N_SCORE=6.5; H_SCORE=38634; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='R'; M=-16, -8,-26,-10, -2,-18,-20, -4,-26, 21,-18,-10,  0,-18,  6, 53, -4,  3,-16,-22,-10, -2;
/M: SY='N'; M= -4, 12,-21,  7,  3,-24,-11, -2,-18,  2,-20, -8, 15,-13, 11, -1,  8,  5,-18,-30,-14,  7;
/M: SY='F'; M=-16,-28,-22,-32,-24, 43,-30,-12,  8,-26, 24,  8,-24,-30,-26,-18,-24,-10,  2,  2, 28,-24;
/M: SY='Q'; M=-12,  5,-30,  7, 17,-37,-19,  6,-24, 15,-22, -6,  2,-11, 42, 16, -2,-10,-28,-22,-11, 29;
/M: SY='M'; M= -5,-10,-15,-20,-15, -5,-20,-10,  5,-10,  5, 26,-10,-15, -5,-10,  0, 20,  5,-25, -5,-10;
/M: SY='V'; M= -4,-29,-16,-31,-29,  3,-32,-25, 31,-21, 11, 11,-27,-28,-26,-21,-13, -3, 40,-22,  1,-29;
/M: SY='A'; M= 17, -8,-19,-13, -9,-19,-10,-18, -9,-10,-15,-11, -6, 13,-11,-17,  3,  1, -5,-27,-21,-11;
/M: SY='L'; M=-10,-26,-21,-25,-12,  6,-29,-18, 15,-26, 43, 16,-27,-27,-16,-18,-27,-10,  6,-21, -2,-14;
/M: SY='D'; M=-17, 33,-15, 47, 19,-37,-14, -2,-36, -1,-27,-25, 12,-12,  6, -9, -1,-10,-28,-38,-20, 12;
/M: SY='P'; M=-11,-18,-39, -9,  0,-29,-20, -8,-21,-10,-29,-18,-17, 79, -8,-18,-10,-11,-30,-30,-25, -9;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='E'; M= -9, -1,-27,  4, 25,-25,-18, -3,-20, 10,-15, -9, -4,  3, 18,  3, -5, -9,-22,-22,-14, 21; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='G'; M=  0, -7,-21, -7,-14,-21, 48,-14,-28,-14,-21,-14,  0,-14,-14,-14,  0,-14,-21,-14,-21,-14; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='T'; M= -3,  4,-17,  4, -4,-16,-15,-14,-10,-12,-12,-11,  2,-13, -7,-13, 14, 16, -5,-33,-13, -6;
/M: SY='A'; M= 25, -5,-12, -9, -5,-20, -2, -3,-16,-10,-20,-13,  1,-11, -4,-14, 21,  7, -7,-30,-16, -5;
/M: SY='Q'; M= -5, -1,-24, -1, 12,-32,-14,  3,-21,  6,-23, -7,  3,-11, 36, 10, 11, -1,-23,-26,-13, 24;
/M: SY='I'; M=  2,-21,-24,-28,-19, -8,-25,-23, 16,-18,  2,  4,-17,-18, -9,-20, -9, -3, 11, -5, -4,-16;
/M: SY='D'; M= -9, 21,-30, 33,  8,-32,-14, -9,-24, -6,-23,-21,  5,  9, -5,-15, -3, -9,-21,-34,-20,  0;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='N'; M=-10,  5,-21, -3, -9, -9,-16,  8, -7, -3,-12, -6, 14,-23, -6, -3, -5, -5, -8,-25,  0, -9;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='V'; M= -2,-26,-14,-25,-20, -3,-30,-27, 25,-18,  8,  8,-26,-26,-24,-19,-10, -2, 39,-29,-10,-22;
/M: SY='V'; M= -4,-30,-17,-34,-30,  0,-34,-30, 37,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 43,-26, -6,-30;
/M: SY='Y'; M=-18,-15,-28,-15, -9,  2,-25, 13,-10,  1, -1,  0,-11,-25,  2, 15,-16,-11,-13, -2, 27, -7;
/M: SY='N'; M= -9, 36,-23, 31,  5,-26, -5, 12,-26, -2,-28,-21, 38,-16,  0, -5,  5, -5,-28,-38,-17,  2;
/M: SY='K'; M=-11, 10,-28,  8,  7,-30, -5, -1,-28, 17,-27,-13, 13,-14, 15, 15, -2, -9,-26,-26,-15, 10;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='A'; M= 19, -9,-17,-16, -7,-18,-10,-13,-11,  5,-10,  1, -8,-12, -3, -1,  0,  0, -4,-21,-13, -5;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,  2,-38,-28, 44,-30, 26, 20,-22,-22,-20,-28,-22,-10, 26,-20,  0,-28;
/M: SY='V'; M=-10,-21,-21,-24,-21,  3,-29, 12, 12,-20,  3,  8,-14,-25,-17,-16,-13, -9, 16,-24,  6,-21;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='T'; M= -4, -1,-17,-11,-10,-12,-21,-17, -3, -6, -9, -6,  3,-13, -8, -8,  8, 27,  0,-28, -9,-10;
/M: SY='M'; M= -8,-20,-20,-23,-14,  1,-26,-14,  9, -9,  9, 14,-19,-23, -6, -8,-14, -7, 11,-20, -2,-10;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='S'; M=  6, -4, 16, -6, -6,-20, -6,-14,-22,-14,-28,-20,  4,-16, -6,-14, 30, 14,-10,-42,-22, -6;
/M: SY='D'; M=-12, 43,-28, 60, 17,-38, -9, -2,-37, -1,-28,-28, 17,-10, -1,-11,  1, -9,-27,-38,-20,  8;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='G'; M= 10,-10,-26,-12,-18,-28, 56,-20,-34,-18,-26,-18, -2,-18,-18,-20,  2,-16,-24,-20,-28,-18;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 25,-30, 45, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 13,-20,  0,-22;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='V'; M= -4,-30,-18,-34,-30,  0,-34,-30, 38,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 42,-26, -6,-30;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='Y'; M=-18,  5,-28, 10, -2, -6,-20, 10,-18,  1,-12, -4, -1,-19, -3,  2,-11,-11,-17,-14, 13, -4;
/M: SY='D'; M= -9, 26,-25, 35,  8,-30,-12, 15,-30, -5,-23,-19, 12,-12, -1, -9,  2, -2,-22,-34,-11,  3;
/M: SY='A'; M= 11, -7,-16,-10, -2,-18,-11,-13,-14,  0,-15,-11, -4,-14, -3,  5, 10,  6, -4,-27,-16, -4;
/M: SY='F'; M=-16,-28,-20,-36,-26, 48,-28,-16,  8,-26, 20, 17,-22,-28,-27,-18,-22,-10,  4, -3, 17,-24;
/M: SY='E'; M= -8,  2,-24,  3,  5,-20, -8,-11,-11, -4,-14,-10,  2,-16, -6, -9, -3, -8, -7,-29,-17, -1;
/M: SY='G'; M=  4,  4,-24,  6, -7,-29, 32,-14,-33,-13,-28,-21,  5,-15,-11,-16,  9, -8,-23,-28,-25, -9;
/M: SY='V'; M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='E'; M= -5, 14,-22, 21, 29,-27,-12, -5,-27,  1,-24,-21,  7, -6,  8, -6, 13,  4,-22,-35,-19, 19;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='F'; M=-20,-25,-23,-32,-25, 60,-29, -2, -2,-23,  5,  0,-18,-29,-29,-16,-19,-11, -5, 13, 43,-25;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-23,-36,-30,  0,-36,-30, 43,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 37,-24, -4,-30;
/M: SY='N'; M= -9, 27,-23, 20, 19,-23, -9,  3,-23,  2,-25,-19, 32,-12,  5, -2,  7,  2,-27,-36,-19, 12;
/M: SY='D'; M=-10, 25,-20, 30,  5,-25,-15,-10,-25, -5,-20,-20, 10,-10, -5,-10, 10, 20,-15,-35,-15,  0;
/M: SY='E'; M= -1,  3,-20,  3, 14,-23,-18, -9,-16, -1,-14,-11, -2, -9,  9, -6,  6, 10,-11,-28,-14, 11;
/M: SY='T'; M= -2, -7,-20,-11, -7,-13,-15,-16,-15, -2,-19,-12, -2,-14, -5, -1, 11, 16, -9,-11, -8, -6;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23, 45,-30,  8,  0,-16,  3,  0,-20,-30,-19,-13,-20,-10, -7, 24, 65,-23;
/M: SY='A'; M= 26,-20,-10,-25,-20,-10,-14,-25,  9,-15,  0,  0,-20,-20,-20,-20,  0,  0, 24,-25,-15,-20;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='V'; M= -4,-27,-18,-32,-28, -1,-33,-29, 33,-23, 12, 12,-23,-24,-24,-23,-10,  2, 36,-26, -6,-28;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='G'; M=  8, -5,-19, -6,-10,-25, 33,-15,-29,-15,-28,-19,  4,-15,-10,-15, 19,  0,-19,-29,-25,-10;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='Q'; M= -9, -3,-28, -3, 14,-36,-21,  6,-14,  7,-17,  1, -3,-12, 50,  7, -1, -9,-21,-21,-10, 32;
/M: SY='S'; M=  2, 14,-15, 16,  4,-24, -2, -6,-24, -7,-30,-22, 18,-11,  0, -9, 29, 12,-16,-40,-20,  2;
/M: SY='N'; M= -2, 23,-16, 12,  0,-20,  0,  2,-20, -4,-30,-20, 39,-16,  0, -4, 23,  8,-22,-40,-20,  0;
/M: SY='S'; M= 11, -5,-15, -7, -4,-16, -6, -2,-18, -6,-21,-14,  2,-13, -1, -3, 20,  8,-10,-27, -8, -4;
/M: SY='K'; M=-10, -2,-27, -2,  6,-26,-17,  3,-29, 32,-27,-10,  2,-13,  9, 29, -3, -7,-20,-24, -8,  6;
/M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29, 76,-30,-17,  0,-28,  9,  0,-20,-30,-38,-19,-20,-10, -1, 12, 34,-29;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='V'; M=  8,-23,-11,-27,-24, -4,-23,-24, 19,-16,  6, 10,-23,-24,-22,-18, -5,  3, 33,-27,-11,-23;
/M: SY='V'; M= -2,-28,-12,-30,-28,  0,-28,-24, 28,-18, 12, 20,-28,-28,-24,-18,-12, -2, 42,-28, -8,-26;
/M: SY='M'; M= -1,-13,-18,-21,-12, -9,-16, -4,  6, -8,  5, 32,-12,-16,  3, -9, -5,  0,  2,-23, -6, -5;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 14,-34,-20, -1,-26, 33,-26, -6,  0,-10, 32, 21, -6,-10,-24,-20,-10, 23;
/M: SY='A'; M= 12, -8,-16,-13,-13,-16,  2,-18, -8,-14,-14, -9, -2,-15,-13,-16, 11,  7, -1,-28,-17,-13;
/M: SY='N'; M= -6,  5,-24,  2,  7,-22,-14, -9,-17, -1,-22,-15, 10,  8, -1, -6,  6,  5,-19,-32,-18,  2;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='T'; M= -2, 10,-12,  4, -4,-14,-13,-11,-14, -7,-15,-13,  9,-10, -6, -8, 16, 30, -7,-30,-12, -5; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='Y'; M=-18,-22,-30,-22,-20, 23,-25,  8, -4,-11, -4, -4,-22,-27,-11,-11,-22,-13,-13, 50, 61,-18; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='W'; M=-18,-33,-38,-35,-27, 23,-20,-25,-14,-20,-12,-14,-31,-27,-22,-18,-31,-23,-21,105, 27,-20; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='E'; M= -3,  2,-17,  4, 17,-21,-10, -1,-17,  8,-17, -9,  2, -5, 17,  4,  6, -1,-16,-19,-11, 17; D=-4;
/I:         I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
/M: SY='S'; M= 12,  1,-11, -3, -2,-15, -2, -8,-12, -6,-16,-12,  6,  0, -3, -9, 13,  5, -9,-22,-15, -3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='T'; M= -3, -3,-11, -7, -6, -4,-13, -6, -8, -4, -9, -7, -1,-10, -4,  0,  9, 19, -4,-14,  3, -6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='P'; M= -7,-14,-28, -7,  0,-21,-14,-14,-14, -7,-21,-14,-14, 62, -7,-14, -7, -7,-21,-21,-21, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='F'; M= -9,-15,-12,-20,-16, 36,-16,-13, -3,-17,  1, -3, -9,-17,-20,-12, -4,  1, -1, -2, 12,-16; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='R'; M=-11,  1,-19,  3,  2,-16,-13, -2,-20, 16,-15, -9,  2,-11,  4, 30, -3, -2,-13,-17, -8,  1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='A'; M= 40,-10,-14,-18,-12,-22, 15,-20,-16,-12,-14,-12, -8,-12,-12,-20,  8, -4, -6,-20,-22,-12;
/M: SY='S'; M= -3, -3,-17, -6, -5,-18,-15,  2, -8, -8,-15, -6,  3,-17,  3, -7, 10,  7, -2,-32,-10, -1;
/M: SY='A'; M= 34,-10,-16,-17,-13,-23, 22,-20,-19,-13,-16,-13, -7,-13,-13,-20,  7, -6, -9,-20,-23,-13;
/M: SY='E'; M= -6, -5,-25, -4, 14,-12,-21,  0,-13, -2, -6, -6, -8,-13, 11, -5, -4, -3,-16,-14,  5, 12;
/M: SY='P'; M= -6,-10,-28, -6,  1,-25,-14,-12,-23,  5,-28,-17, -5, 26, -1,  7,  5, -1,-21,-30,-21, -3;
/M: SY='G'; M=  6,-10,-28,-11,-19,-29, 62,-20,-36,-19,-28,-19, -1,-19,-19,-20,  1,-18,-26,-20,-29,-19;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-20,-34,-28,  2,-34,-28, 36,-26, 21, 16,-26,-26,-24,-24,-18, -6, 35,-24, -4,-28;
/M: SY='Q'; M= -6, -3,-23, -5,  8,-27,-20, -1,-14,  0,-11, -1, -3,-12, 33,  1,  4,  4,-18,-24,-10, 20;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-20,-32,-23,  7,-32,-23, 26,-29, 40, 19,-28,-28,-21,-22,-26, -9, 18,-21, -1,-23;
/M: SY='K'; M=-11, -1,-30, -1,  9,-29,-20, -9,-30, 48,-29,-10,  0,-11, 10, 35,-10,-10,-20,-20,-10,  9;
/M: SY='L'; M=  3,-27,-15,-28,-22,  1,-25,-24, 19,-23, 25, 11,-27,-27,-22,-20,-16, -5, 23,-24, -7,-22;
/M: SY='V'; M= -2,-30,-13,-32,-30,  0,-32,-30, 33,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 47,-28, -8,-30;
/M: SY='N'; M=-13, 37,-24, 30,  6,-26, -5,  5,-26,  7,-30,-21, 41,-16,  1,  2,  5, -4,-29,-37,-19,  4;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='A'; M= 11,  4,-17, -4,  1,-20,-11,-12,-17,  3,-17,-12,  6,-11, -3, -4,  9, 11,-11,-27,-15, -1;
/M: SY='T'; M= -1,  1,-14, -5, -1,-15,-18,-16,-15, -2,-15,-12,  1, -9, -4, -5, 18, 36, -6,-30,-12, -3;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='P'; M= -9,-18,-36,-10, -1,-28,-20,-20,-19,-10,-28,-19,-18, 78,-10,-19, -6, -3,-26,-30,-28,-10;
/M: SY='G'; M=  1, -9,-28, -9,-18,-29, 62,-19,-38,-19,-30,-20,  1,-19,-18,-19,  5,-15,-28,-22,-29,-18;
/M: SY='E'; M= -8,  5,-27,  7, 25,-25,-18, -6,-22,  1,-21,-17,  3, 12,  8, -5,  3,  3,-24,-31,-19, 16;
/M: SY='A'; M= 13,-10,-18,-17,-10,-11,-13,  6, -9, -6, -7,  2, -8,-16, -4, -5, -2, -2, -6,-17,  1, -9;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,  8,-28,-16, 20,-26, 45, 27,-28,-28,-16,-18,-28,-10, 10,-20,  0,-18;
/M: SY='R'; M=-12,-10,-28,-11, -1,-20,-18, -2,-28, 25,-19,-10, -1,-19,  8, 60, -8, -9,-18,-20,-11, -1;
/M: SY='N'; M=-13, 43,-23, 36,  6,-26, -3,  7,-26,  0,-30,-23, 48,-17,  0, -3,  7, -3,-30,-40,-20,  3;
/M: SY='A'; M= 34, -6,-10,-12, -6,-20,  0,-16,-14,-10,-18,-14, -2,-10, -6,-16, 22,  8, -4,-28,-20, -6;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='H'; M=-15, -1,-27, -2,  2,-16,-20, 46,-19, -4, -9, -1,  6,-19,  4,  0,-11,-14,-21,-28,  5,  0;
/M: SY='T'; M= -2,  6,-14,  2,  0,-16,-17,-15,-16, -7,-15,-14,  3, -9, -5, -9, 18, 35, -7,-32,-13, -3;
/M: SY='G'; M= 11,-10,-25,-12,-18,-28, 54,-20,-33,-18,-25,-18, -2,-18,-18,-20,  2,-15,-23,-20,-28,-18;
/M: SY='D'; M= -8, 28,-21, 35,  9,-29, -7, -5,-29, -4,-28,-24, 18,-11, -1, -9, 15,  7,-20,-39,-19,  4;
/M: SY='T'; M=  0, -3,-10,-12,-12, -9,-21,-21, -6,-11, -8, -8, -3,-12,-12,-11, 17, 44,  6,-30,-10,-12;
/M: SY='P'; M= -6, -1,-25,  0,  1,-24,-18,-15,-21,  7,-24,-15, -3, 16, -3, -2,  3, 11,-16,-29,-17, -2;
/M: SY='N'; M= -8, 30,-23, 24,  1,-26,  9,  1,-28, -4,-30,-22, 36,-17, -3, -7, 10, -3,-28,-37,-22, -1;
/M: SY='Q'; M=-10,  3,-30,  6, 32,-37,-20,  7,-23, 10,-20, -6,  0, -7, 48,  7,  0,-10,-30,-23,-13, 40;
/M: SY='V'; M= 14,-21,-10,-25,-22, -7,-21,-26, 14,-16,  2,  2,-21,-22,-22,-19, -1,  6, 31,-27,-13,-22;
/M: SY='R'; M=-11, -4,-24, -7,  0,-20,-20, -9,-24, 23,-20,-10,  0,-14,  4, 34, -1,  8,-14,-23,-10,  0;
/M: SY='L'; M= -7,-24,-17,-26,-19,  5,-28,-21, 15,-25, 34, 13,-24,-26,-19,-18,-18,  3, 12,-23, -3,-19;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='H'; M=-13, -2,-28, -2,  3,-19,-19, 39,-24,  9,-21, -5,  3,-16, 12,  7, -5,-11,-23,-20, 11,  5;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='P'; M= -5, -5,-30,  2,  0,-28, -4,-15,-24,-10,-30,-21, -5, 40, -7,-16,  6, -3,-25,-33,-26, -6;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='M'; M= -7,-11,-15,-13, -8, -6,-16, -7,  1,  5,  2, 13,-10,-14, -2,  7,-11, -6,  3,-15, -4, -5; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='N'; M= -5, 19,-20, 13,  5,-25, -5,  1,-23,  4,-29,-17, 28,-14,  8,  1, 15,  3,-23,-35,-18,  7;
/M: SY='I'; M= -3,-19,-24,-23,-13,-14,-28,-18, 17, -9,  1,  8,-15,-18,  0,-12,-10, -7, 13,-22, -7, -9;
/M: SY='G'; M=  4,-10,-28,-11,-19,-29, 64,-20,-38,-19,-28,-19, -1,-19,-19,-20,  1,-18,-28,-20,-29,-19;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='K'; M= -8, -3,-24, -4,  5,-22,-21,-12,-19, 24,-19, -9, -3,-12,  3, 18, -3,  3, -9,-24,-11,  3;
/M: SY='P'; M=-14, 15,-34, 29, 17,-34,-16, -8,-30, -3,-29,-24,  0, 34, -1,-13, -4,-10,-30,-34,-24,  6;
/M: SY='R'; M=-15,  0,-27, -5, -2, -9,-18,  0,-22, 19,-20,-10,  9,-19,  2, 28, -8, -8,-19,-16,  2, -2;
/M: SY='T'; M=  0,-11,-10,-17,-17, -6,-24,-24,  5,-14, -3, -3,-11,-17,-17,-14,  9, 31, 19,-30,-10,-17;
/M: SY='A'; M= 33, -6,-10,-11, -6,-20,  0,-16,-14,-10,-19,-14, -1,-10, -6,-16, 23,  9, -4,-29,-20, -6;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='Q'; M= -9, -5,-24, -6,  7,-16,-20,  2,-14,  0, -8, -3, -4,-14, 15,  0, -2, -1,-16,-23, -5, 11;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='H'; M=-11,-10,-25,-12, -3,-16,-24, 24, -6,-10, -2,  5, -6,-19, 12, -5, -9, -8,-10,-25,  2,  2;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='E'; M= -2,  5,-23,  8, 18,-27,-14, -5,-24,  6,-22,-14,  3, -8, 14,  3,  9,  3,-19,-29,-16, 15;
/M: SY='I'; M= -6,-24,-21,-32,-26, -2,-34,-28, 33,-24, 12, 12,-18,-20,-20,-24,-10,  4, 29,-24, -4,-26;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='Y'; M=-11,-19,-20,-22,-19, 16,-27, -2,  4,-19, 11,  4,-17,-25,-17,-14,-13,  2,  3, -8, 21,-19;
/M: SY='I'; M=-10,-28,-28,-38,-28,  0,-36,-24, 44,-26, 20, 28,-20,-20,-16,-26,-20,-10, 26,-20,  0,-26;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='F'; M=-12,-30,-18,-35,-28, 36,-31,-24, 17,-27, 20,  9,-25,-29,-31,-21,-20, -7, 18,-10, 10,-28;
/M: SY='R'; M=-14,-12,-26,-13, -7, -4,-24,  2,-13,  9,-11, -4, -9,-21,  2, 20, -9, -2,-10, -6, 18, -6;
/M: SY='L'; M=-11,-26,-19,-32,-22, 17,-26,-13, 17,-22, 30, 30,-25,-26,-17,-16,-24, -9, 11,-16,  4,-19;
/M: SY='Y'; M=-20,-21,-28,-23,-21, 38,-29, 17, -2,-15,  1,  0,-18,-29,-15,-12,-19,-11, -9, 20, 63,-21;
/M: SY='E'; M=-12, 11,-29, 14, 31,-30,-17,  2,-27, 15,-23,-15,  8, -8, 22, 12, -1, -9,-28,-28,-16, 26;
/M: SY='G'; M= -1, -9,-30, -9,-17,-30, 61,-19,-39,-13,-30,-19,  0,-19,-17,-15, -1,-19,-29,-20,-28,-17;
/M: SY='N'; M=  1, 11,-18,  4,  4,-22, -7, -5,-21,  6,-26,-16, 19,-12,  1,  1, 15,  8,-17,-33,-17,  3;
/M: SY='N'; M=-12, 18,-25, 13,  7,-24,-13, 10,-26, 12,-25,-15, 21,-14,  4, 10,  1, -1,-24,-31,-11,  5;
/M: SY='L'; M=-10,-26,-22,-28,-17,  3,-28,-15, 19,-23, 36, 24,-25,-26, -9,-16,-25,-10,  8,-20, -1,-14;
/M: SY='V'; M= -1,-23,-18,-25,-16, -4,-28,-22, 22,-18, 12, 12,-22,-22,-17,-19,-12, -5, 26,-25, -8,-18;
/M: SY='A'; M= 20,-19,-16,-28,-19, -3,-16,-21, 11,-17,  3,  7,-16,-17,-16,-21, -4, -4, 13,-19, -8,-18;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='S'; M=  9,  0,-10, -1, -1,-19, -2,-11,-19,-10,-28,-19,  9,-10, -1,-10, 38, 23, -9,-39,-19, -1;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='N'; M= -3, 15,-21,  3, -5,-18, -7, -1,-13, -2,-20,-10, 27, -8, -3, -1,  3, -3,-18,-33,-18, -5;
/M: SY='I'; M= -8,-28,-23,-34,-26,  2,-35,-27, 36,-27, 23, 16,-23,-24,-21,-25,-18, -5, 27,-22, -2,-26;
/M: SY='Y'; M=-18,-24,-26,-27,-23, 34,-31,  2,  7,-19, 12,  5,-22,-29,-18,-15,-22,-10, -2, 14, 51,-23;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='D'; M= -6, 10,-22, 15, 12,-27,-12, -6,-28, 11,-27,-18,  7,-10,  5,  8, 11,  3,-19,-32,-16,  8;
/M: SY='T'; M=  1,  0,-10, -9, -9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,  1,-10, -9,-10, 22, 47, -1,-31,-11, -9;
/M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-31,-23, 16,-30,-16, 20,-25, 30, 21,-26,-27,-20,-19,-24, -9, 13,-14,  9,-22;
/M: SY='K'; M=  0, -7,-25, -9,  2,-23,-17, -9,-19, 21,-14, -6, -5,-14,  8, 19, -7, -8,-14,-20,-11,  4;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,  8,-30,-19, 24,-28, 43, 25,-28,-28,-18,-20,-28,-10, 12,-20,  0,-20;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='V'; M= -5,-30,-14,-31,-27, 12,-30,-26, 24,-24, 21, 12,-29,-30,-28,-20,-17, -4, 33,-23, -3,-27;
/M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28, 69,-30,-11,  0,-26,  8,  0,-20,-30,-34,-18,-20,-10, -2, 14, 41,-28;
/M: SY='C'; M= -9,-22, 92,-31,-30,-16,-31,-30,-16,-29,-13,-13,-21,-37,-29,-29,-11, -9, -1,-45,-25,-30;
/M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 72,-30,-20,  2,-30, 15,  2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,  1,  7, 27,-29;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='E'; M=-11,  4,-31, 12, 43,-29,-20, -3,-29, 13,-22,-18, -2,  8, 15,  6, -3,-10,-28,-28,-19, 28;
/M: SY='Q'; M=-10,  5,-24, -1,  9,-18,-15,  2,-10,  5,-10, 10,  8,-14, 11,  1, -5, -8,-15,-27,-11, 10;
/M: SY='I'; M= -5,-30,-20,-35,-30,  0,-35,-30, 40,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 40,-25, -5,-30;
/M: SY='I'; M=-11,-26,-27,-35,-27, 11,-36,-24, 34,-26, 14, 13,-18,-21,-20,-25,-16, -3, 20,-14,  9,-27;
/M: SY='W'; M=-20,-38,-44,-40,-30, 24,-22,-28,-16,-22,-14,-16,-36,-30,-24,-20,-36,-26,-24,122, 30,-22;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='N'; M=-13, 43,-23, 33,  5,-25, -3,  7,-25,  0,-30,-23, 50,-17,  0, -3,  7, -3,-30,-40,-20,  3;
/M: SY='L'; M= -8,-28,-18,-30,-22,  6,-28,-17, 22,-23, 35, 27,-28,-28,-17,-18,-24, -8, 18,-22, -2,-20;
/M: SY='K'; M= -9, -5,-27, -6,  9,-24,-21, -5,-14, 22,-14,  6, -6,-12, 15, 12, -9, -9,-12,-22, -9, 12;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='R'; M= -9, -6,-23, -7,  2,-18,-16, -5,-20, 13,-17, -5,  0,-14,  5, 27,  3,  2,-13,-26,-12,  2;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='N'; M= -9, 25,-22, 13,  7,-22, -6,  4,-23,  8,-28,-18, 37,-16,  4,  8,  8, -1,-26,-35,-18,  5;
/M: SY='D'; M=-18, 38,-29, 51, 20,-35,-11,  1,-36,  5,-28,-26, 19,-11,  3,  1,  0, -9,-29,-37,-19, 11;
/M: SY='T'; M= -3, 16,-18, 12,  0,-21,-11, -8,-21, -3,-20,-17, 15,-13, -4, -3, 13, 17,-14,-33,-16, -2;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-20,-35,-29,  1,-35,-29, 38,-26, 20, 16,-25,-25,-24,-25,-17, -6, 36,-24, -4,-29;
/M: SY='P'; M=-10,-18,-39, -9,  1,-30,-20,-19,-21, -4,-30,-19,-18, 80, -8,-15,-10,-10,-29,-29,-28, -8;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH PS51234

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 22 in 22 different sequences
Number of true positive hits 22 in 22 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] N_Hulo
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] TSP C-terminal
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
22 sequences

COMP_BOVIN  (P35445), COMP_HUMAN  (P49747), COMP_MOUSE  (Q9R0G6), 
COMP_RAT    (P35444), TSP1_BOVIN  (Q28178), TSP1_HUMAN  (P07996), 
TSP1_MOUSE  (P35441), TSP1_XENLA  (P35448), TSP2_BOVIN  (Q95116), 
TSP2_CHICK  (P35440), TSP2_HUMAN  (P35442), TSP2_MOUSE  (Q03350), 
TSP3A_DANRE (Q8JHW2), TSP3B_DANRE (Q1L8P7), TSP3_HUMAN  (P49746), 
TSP3_MOUSE  (Q05895), TSP4B_DANRE (Q8JGW0), TSP4_BOVIN  (Q3SWW8), 
TSP4_HUMAN  (P35443), TSP4_MOUSE  (Q9Z1T2), TSP4_RAT    (P49744), 
TSP4_XENLA  (Q06441)
» More

PDB
[Detailed view]
4 PDB

1UX6; 1YO8; 2RHP; 3FBY

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission