Entry: PS51468

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] VIT
Accession [info] PS51468
Entry type [info] MATRIX
Date [info] OCT-2009 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); SEP-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51468
Associated ProRule [info] PRU00801

Name and characterization of the entry

Description [info] VIT domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=129;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=124;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1037693; R2=0.0080717; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=18598.92576; R2=33.41048; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=979; N_SCORE=10.0; H_SCORE=47131; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=545; N_SCORE=6.5; H_SCORE=36808; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-24; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
...
                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-255; BD=-255;
/M: SY='Q'; M= 21,-72,-23, -8,-16, 11,-13,-36, -5,-12, 31,-13,-24, 36, -9, 10,  1,  7, 29,-22;
/M: SY='Q'; M=  3, 32,-27, -1,-64,-24,-61,-22, -4, 13,-24, -3, 26, 49,-60, 20, -2,-14,  7,  2;
/M: SY='L'; M=-13,-21,-13, 21,-16, 18,-14,-42,-29, 21,-55,  0, 19,  9, 11, -2, 13,-12,-76,-32;
/M: SY='C'; M=-26, 26, -5, -3,-39,  6, -8, -5, -1, 26,-21,-60, 14, 14, -7,  2, -4, -6,-72, 19;
/M: SY='F'; M= -7, 10,-19,-42, 36, 19,-63,-25, -7, 11,-19, 18, 12,-24,-11, 14,-16, -3,-70, -6;
/M: SY='T'; M=-36,  6, -9,-30,-36, 28, 20,-10, -6,  3, -9,-32, -5,-29, 29,  7, 32,-11,-77,-10;
/M: SY='L'; M=-16,-14,-14, -3,  4,-72,  3,  1,-13, 35,-49,-11, 32, -4,-20,  6, -7, 14, -2,-58;
/M: SY='Q'; M=-10,  4,  8, 22,-68, -8,-63,-17, -9,  4,-57,-12, 27, 27, -7,  3, 14, 12, 13,-65;
/M: SY='Q'; M= -2,-74, 36, 18,-38,-18,-55,-49,  6,-47,-65, 28, -3, 53,  0, 34,  3,-69,-79,-25;
/M: SY='G'; M= 22,-21, 20,  0,-74, 28, 16,-24,-19,-48,-64,  9, -4, -6,  9, 19, 21,-19,-82,-67;
/M: SY='N'; M= 10,-72, 16, 11,-36,-11,-13, -9, 15,-20,-61, 30,-33, 17,  6, 28, -6,-12, -7,-64;
/M: SY='W'; M=  0,-14, 10, 28,-19, 23,-59,-67, 25,-54,-64, 16,-32, 18,  1, -6,-25,  2, 34,  7;
/M: SY='Q'; M=-42,-74,  8, 19,-43,-32,  2,-22, 17,-10,-58, 19,-15, 40, 34,-15, 31,  1,-80,-63;
/M: SY='P'; M= 12,-74,  7,-56,-28, -7,-62,-33, 23,-33, 30,-27, 57,  2,-39, 14,-14, 11,-74,  8;
/M: SY='V'; M= 15, 12,-79,-73, 10,-76,-74, 35,-72, 39,-10,-73,  1,-39,-74,-26,-15, 46,-75,-57;
/M: SY='P'; M=-41,-77, 16, 25, -3,-73,-16,-29,-33, 16,-56,-62, 73,  0, -3,-32, 17, -6,-76,-18;
/M: SY='L'; M=-33,-72,-77,-40,-16,-80,  6, 30,-70, 60, 42,-28,  6,-32,-40,-44,-43, 15,-72, -8;
/M: SY='K'; M=  7, -2,-40, -8,-60,-70,-60,-22, 41, 18,  1,-23,-23, 32,  6,-20, 18, -5,-71, 23;
/M: SY='S'; M=-11,-72, 24, 11,-74, 14,  0,-77,  2,-76,-69, -1,-66,  6, 16, 67,-13,-71,  7,-19;
/M: SY='V'; M=-19, 24,-70,-34, 12,-76, 42, 21,-65,  4, -7,-64,-73,  6,-32,-14, 35, 46,-74, 13;
/M: SY='H'; M=  6,-74, 32, -8,-71,-62, 53,-74, 20,-37,-64, -5,-67, 29, 20, 44, -5,-70, 45,-17;
/M: SY='V'; M= -8,-69,-79,-76,-13,-51,-72, 41,-72,-22, 15,-28,-77,-72,-74,-64,-26, 76,-71, 41;
/M: SY='N'; M=-61,-75, 18, 29,-77,-44, 36,-76, 35,-75,-66, 54,-66, 30, 37,-10, 24,-48,-83,-64;
/M: SY='C'; M= 31, 64,-71,-69,-31, 15,-72,  8,-68,-29, 22,-62,-22,-66,-72, 27,  5, 39,-81,-66;
/M: SY='T'; M=-45,-73, 12, 15,-34,-70, 36,-61, 27,-47,-60, -7,-66, 34, 18,-30, 55, 16, 13,-21;
/M: SY='I'; M=-20,-72,-80,-37,-53,-83,-79, 72,-72, 10,-40,-75, -6,-20,-35,-68,-56, 62,-78,-60;
/M: SY='T'; M=-21,-18,-60, -2,-28,-69, 10, 16,-21,-11, -5, 24,-70, -3, 11, 23, 41,  9,-73, 30;
/M: SY='G'; M= 15,-71, 11,-61,-79, 68,-61,-79,-59,-51,-70, 48,-68, -7,-31, 36,-55,-73,-80,-72;
/M: SY='R'; M=-15,-75, 18,-40, -3, 27,-21,-45,-49,  0,  1, 13, -7, -1, 59,-20,-20,-17,  1,-32;
/M: SY='Y'; M=-29,-71,-75,-74, 30,-79,-64, 42,-70, 20, -6, -6,-76,-69,-72,-63, 28, 32, 14, 61;
/M: SY='A'; M= 78, 18,-65,-61, -8,-20,-66,-63,-62,-30,-19,  9,-68,-22,-66, 32,-51,-30,-76,-66;
/M: SY='R'; M=-46,-76,  4,  1,  9,-71, 42, -8,  9,-47,-58, 12,-70, 32, 58,-11, 13,-11,-73, 11;
/M: SY='T'; M= -8,-65,-66,-27,-58,-73,-17,-21,-64,-41, -7,-34,-68,-65,-69,-35, 78, 63,-81, 12;
/M: SY='T'; M=-11,-22,-10, 49,-38,-70,-23,-12, -3,-29,-15,  6,-65, 15, 11,-14, 51, 10,-81,-64;
/M: SY='V'; M=-11,-69,-80,-74,-51,-81,-76, 47,-38, 39,  3,-75,-77,-28,-73,-66, -8, 64,-78,-59;
/M: SY='T'; M=-56,-70,  8, 51,-44,-69,-17,-64, 13,-67,-63, -8,-62,  0, -1,  0, 72, -3,-81,-20;
/M: SY='Q'; M=-59, 22,-26, 20,-34,-70,  5,-15,-50, 18,  2,-55,-69, 99,-34, 17,-58,-62,-75,-59;
/M: SY='T'; M=-57, -3,-12, 23,-68,-52,-29,-11,  8,-32,-58,-22,-66,  7, 28, -4, 67, 21,-83,-65;
/M: SY='F'; M=-50,-73,-82,-79, 91,-81,-58,-26,-74, 13, 20,-76,-83,-75,-71,-71,-64, 10,-44, 77;
/M: SY='W'; M=  2,-72,-28, 12,-18,-70,-17,  8, 14,-18,-15,-31,-69, 17, 21, 13, 12, 30, 31,-10;
/M: SY='N'; M=-61,-67,-38,-58,-73,-53, -1,-38,-50,-78,-67,118,-72,-51,-58,-15, -4,-35,-92,-22;
/M: SY='P'; M= -8,-21, 33, 11,-33,-66,-58,-71,-12,-42,-65, 31, 70, 41, 17,-40,  9,-41,-81,-69;
/M: SY='S'; M= -1,-69,-28, 29,-10, 13,-15,-70,-56,-23,-64, 52,-66,-24,-62, 55, 26,-66,-78,-16;
/M: SY='D'; M= -2,-75, 59, 15,-17,-25,  3,-74, -7,-48,-67, 37, 20, 34,-20, 12, -1,-72,-81,-21;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
/M: SY='Q'; M=-19,-18,-53, 34,-40,-52,-20,-14, 30,-65,-10, 29,-67, 54, 39,-25,  0,  4,-77,-25;
/M: SY='P'; M= 25,-77, 12,  4,-73,-19,-19,-39,-59,-71,-65,  2, 76, 11,-66, -8,  0, -1, 61,-33;
/M: SY='I'; M=-63, -9,-74,-66,  1,-80,  8, 45,  9, 43,-10,-68,-76, 31, -6,-33,-36, 11,-69, 14;
/I:         I=-20; MI=0; MD=-50; IM=0; DM=-50;
/M: SY='E'; M=-44,-78, 31, 97,-83,-69,-52,-83,-26,-78,-73, 30,-59,-10,-53, -7,-57,-76,-83,-72;
/M: SY='A'; M= 65,-66,-71,-68,-33, 43,-72,-26,-68,  5,-54,-63,-71,-65,-72,-50,-33, 31,-76,-67;
/M: SY='E'; M=-14,-72,-60, 36, -7,-72,-22, 35,  2,-25, -6, -9,-69,-11,  7, 13,  3, 34,  6,-59;
/M: SY='Y'; M=-71,-76,-76,-76, 80,-79,-48,-52,-69,-11,-49,-73,-84,-69,-32,-31,-65,-36,-35,108;
/M: SY='Q'; M=-26,-73,  8,-15,-30,-45,-11,  7,-53,-11,-54,-57,-70, 48, 29, 15, 29, 31,  6,  1;
/M: SY='F'; M=-46,-71,-86,-81,107,-38,-68,-11,-77,-13, 31,-76,-83,-82,-75,-71,-64, 17,-48,-10;
/M: SY='P'; M=-45,-85,-15, -4,-83,-42,-64,-73,-58,-49,-67,-25,110, 36,-67, -5, -6,-75,-80,-76;
/M: SY='L'; M=-51,-70,-83,-77,-44,-85,-72, 48,-77, 73, -3,-28,-81,-71,-76,-74,-60, 20,-74,-55;
/I:         I=-30; MD=-77;
/M: SY='P'; M= -6,-86, 20,-53,-77,-67,-13,-73,-15,-78, -5,-64,109,-28,-28,-27,-59,-75,-76, 10; D=-30;
/I:         I=-30; MI=-77; IM=-77; DM=-77;
/M: SY='E'; M=-18,-77, 48, 64,-76,-32,  0,-74, 15,-25,-67, -9, 27, -1,-55,  5,-22,-48,  0,-30;
/M: SY='G'; M=-12, -9, 29, 14,-75, 42, -5,-76,-17,-53, -5, 32,-67,  1,  7, 32,  5,-71,-80,-25;
/M: SY='A'; M= 81,-13,-67,-60,-35,-23,-67,-20,-61,-64,-59,-60,-68, 25,-65,  8,-14, -5,-74,-17;
/M: SY='A'; M= 50, 50,-70,-66, 45,-46,-69,-31,-65,-33,-56,-18,-73,  6,-69, 20,  4, 31,-72,-55;
/M: SY='V'; M=-58,-69,-83,-78,-24,-85,-81, 56,-76, 30,-38,-78,-78,-75,-77,-34,-55, 75,-79,-58;
/M: SY='S'; M=-41, 41, 24, 16,-63,-31,  0,-64,-39,-25,-62,-51,-67,  6,-62, 52, 48,-12,-75, 36;
/M: SY='G'; M=-15,-73, 21,  0,-78, 48,-13,-80,  4,-79,-70, 43,-67,  6, 25, 34,-26,-75,-80,-34;
/M: SY='F'; M=-70, 25,-86,-80, 97,-82,-66,-44,-76, 32, 52,-77,-84,-78,-74,-74,-65,-25, 25, 11;
/M: SY='T'; M= 21,-70,-38, 38,-70,-49,-61,-45, -6,-24,-23,-27,-65,  7, 24, 34, 46,-29, 38,-64;
/M: SY='M'; M= 29, 40,-79,-72, -5,-73,-67, 21,-70, 32, 86,-72,-75,-15,-70,-64,-58, 19,-73,-13;
/M: SY='W'; M=-21,-73, 15, 18,-40,-40,-26, 15,  6,-19,-58,  1,-67,-11, 12, -4, 48,-14, 72,-26;
/M: SY='I'; M=-25,-26,-14,-74,  3,-82,-75, 79,-73, -9,-14,-71,-23,-17,-75,-40,-31, 40,-71, 16;
/M: SY='G'; M=-17,-74, 62,  0,-82, 65,-57,-83,-58,-83,-75, 65,-68,-56,-66,-49,-28,-79,-85,-74;
/M: SY='G'; M=-23,-76, 53, 34,-82, 65,-13,-82,-10,-80,-73, 27,-66, -5,-62,-23,-60,-41,-82,-72;
/M: SY='R'; M=-47,-77, -1,  0,-75,-71,-55,-70, 55,-42,-62,  6,-69, 22, 77,-26,-14, -9,-78,-64;
/M: SY='T'; M=-58,-71,-15,  8,-62,-39,-27, -3, 12, 15, -5,-58,-21,-25, 22,-28, 58, 26,  1,-62;
/M: SY='I'; M=-64,-75,-34,-38, 20,-42,-66, 70,-70, 11,-41,-35,-77,-31,-22,-69,-60, 29,-61, 59;
/M: SY='V'; M=-44,-75, 20, 36,-66,-74, 21, 14, 26,-34,-56,-57, -8, -1, 10,-22,  8, 39,-80,-22;
/M: SY='G'; M= 27,-14,-63,-26,-78, 78,-68,-75,-20,-77,-69,-53,-22,-61,-32, 22,-29,-17,-76,-74;
/M: SY='E'; M=-13,-75, -2, 60,-10,-20,-60, 16,  7,-29, 16,-33,-66, 46,-32,-32,-31, 16,-76,-62;
/M: SY='V'; M=-14,-14,-79,-74,-24,-81,-78, 53,-72, 13,-41,-30,-35, -5,-75,-65,-31, 73,-80,-59;
/I:         I=-26; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65;
/M: SY='K'; M=-38,-75,-19,-14,-67,-73,-61,-20, 68,-41,  3,-56,-68, 32, 25,-31, -2, 34, 16,-11;
/M: SY='E'; M=-25,-81, 35, 78,-83,-70,-59,-79,-32,-78,-72,-56, 71,-46,-11,-18,  3,-74,-82,-74;
/M: SY='K'; M=-39,-78,-58,-45,-77,-71,-57,-78, 93,-76,-65,-51,-67,-40, 69,-58,-59,-48,-73,-64;
/M: SY='E'; M= 33,-74, 12, 66,-24,  4,-15,-73, 19,-72,-66,-54,-63, 37,-30,-33,-14,-27,-77,-67;
/M: SY='Q'; M= 24,-75,-27, 51,-76,-68,-19,-15, 35,-49, -7,-55,-64, 57, 27,-25,-16,-27,-77,-65;
/M: SY='A'; M= 90,-63,-67,-62,-76, 26,-70,-66,-64,-69,-62,-60,-67,-60,-68,-19,-53,-31,-76,-72;
/M: SY='R'; M=-26,-79,  7, 22,-45,-72,-19,-75, 56,-26,-63,-28,-68, 30, 70,-57,-13,-72, 12,-62;
/M: SY='Q'; M= 17,-76,-16, 38,-80,-49,-55,-73, 50,-51,-63,-26,-64, 77,  9,-10,-20,-43,-76,-66;
/M: SY='E'; M= 14,-73,-24, 53,-66,-26,-65, 25,-22,-16, 19,-36,-67, 21,-17,-57, -2, 35,-79,-64;
/M: SY='Y'; M=-72,-79,-71,-73, 59,-77,-43,-56,-30,-52,-51, -4,-83,-64,-63,-66,-65,-61, 19,121;
/M: SY='E'; M=-22,-78, 45, 76,-82,-68,-53,-39,-14,-75,-69, 19,-62, 53,  7,-14,-28,-73,-82,-69;
/I:         I=-11; MD=-27;
/M: SY='E'; M=-16,-77, 45, 60,-34,-26,  3,-78,  8,-48,-70, 24,-65, 36,-55,  4,  1,-74,-84,-68; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='A'; M= 73,-69,-65, -1,-38, -9,-68, 16,-61,-63,-10,  4,-70, -7,-16,-25,-56,-17,-78,-69; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-27;
/M: SY='K'; M=-12,-74,-66,-10,-63,-43,-18, 15, 59, 10,-15,-62,-28,-22, 16,-62,-28, 33,-76,-19; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-27;
/M: SY='Q'; M= 27,-73, -2,  5,-72,-19,-16, -7, 20,-69,-62,-52,-67, 52, 35, 39,-30,-64,-74,  2;
/M: SY='Q'; M= -3,-77,-20, 39,-79,-66,-12,-75, -4,-72,-63,-20,-26, 87, 35, 11, 11,-71,-76,-29;
/M: SY='G'; M=-52,-77,-10,-28,-79, 90,-66,-83,-39,-80, 13,  3,-25,-62, -4,-51,-29,-79, 10,-73;
/M: SY='K'; M=-15,-76,-13,  5,-74,-46, 56,-19, 57,-70,-61, 22,-67, 32, 38,-16, -9,-15,-80,-61;
/M: SY='T'; M=-39,-71, 54,  4,-14,-36, -5, -5, -7,-38,-63,  8,-66,  1,  6, 21, 57,-41,-83,-63;
/M: SY='A'; M= 70,-68,-69,-62,-71,-32,-70,-19,-64,-39, 16,-64, 61,-62,-70, -9, -1, 11,-78,-70;
/M: SY='A'; M= 50,-68,-24,-27, -1, 42,-68, -8,-64,-26,-60,-57,-69,-61,-41, 37,-26,  4,-74,-34;
/M: SY='L'; M=-38,-71,-28,-71,-42,-80, 38, -9,-43, 72,-36,-26,-80,-66,-69,-44,-40,  4,-67, 43;
/M: SY='V'; M= 18,-67,-76,-72,-53,-10,-71,-34,-71, 46, 34,-22,-76,-68,-72,-14,-23, 59,-79,-60;
/M: SY='E'; M=-16,-78, 26, 90,-81,-26,  5,-82, -9,-77,-71,-18,-60, -4,  0,  1,-32,-75,-82,-70;
/M: SY='Q'; M=-27,-79,-56, 33,-34,-70,  4, 12, 15,-40, -6,-19,-67, 86, -8,-10,-18,-63, 53,  4;
/M: SY='D'; M=-11,-73, 44, 11,-39,-15, -9,  0, -1,-36,-61, 28,-67, 39,-13, 25,  7, -2,-82,-64;
/M: SY='R'; M= -3,-74, 46, 33,-77, 14,-57,-74, -6,-41,-67, 18,-67,-49, 48, 10, 10,-32,-82,-68;
/M: SY='P'; M=-20,-78, 20,-12, -4, 21,-14,-73,-11,-29,-65, 23, 66,  7, 16, 17,-57,-72,-75,-11;
/I:         I=-24; MD=-61;
/M: SY='N'; M=-24,-14, 10,  8, -7, 23,  7,-75, 11,-76,-68, 73,-70,-22, 18,  1,-12,-36,-82,-66; D=-24;
/I:         I=-24; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61;
/M: SY='E'; M=-39,-73, 11, 34,-32,-73, -9, 17,-58, 22, 24,  5,-71, 32,-31, -2,-20, 25,-75,  5;
/M: SY='F'; M=-69,-73,-76,-41, 92,-80,-60,  2,-15, -2, -1, -6,-81,-25,-67,-69,-63,  5,-47, 61;
/M: SY='T'; M=-20, 37,-23, 16, 42,-69,-60,-44, 13,-64,-61,-26,-68, 34, 33, 16, 46,-39,-72,-55;
/M: SY='T'; M= -5,-21,-68,-38, -7,-73,-32, 33,  8,  9, 41,-21,-70, -1, 22,-17, 41, 10,-76,-58;
/M: SY='R'; M=-12,-73,-34,  5,-71,-36,-58,  7, 24,-35,-60, 41,-69,-19, 60, 26, -4,-11,-80,-65;
/M: SY='V'; M= -4,-69,-75,-37,-55,-77,-13, 43,-15, 18,-43,-70,-75,-23,-69,  8,-53, 68,-80,-60;
/M: SY='G'; M= 25,-72,-71,-73, 33, 60,-66,  6,-70,-15,-56,-62,-73,-67,-73,-16,-35,  2,-61, 46;
/I:         I=-30; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77;
/M: SY='N'; M=-37,-73,-47,-57,-77, -8,-53,-36,-12,-78,-67, 99, 66,-31,-60,-13,-24,-24,-87,-73;
/I:         I=-30; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77;
/M: SY='I'; M=-62,-72,-84,-78, -7,-87,-77, 66,-75, 49, -7,-78,-79,-73,-28,-72,-58, 49,-74,-55;
/M: SY='P'; M= 28,-77,-67,-17,-71,  6,-68,-39,-63,  5,  9,-25, 93,-63,-39,-31,-58,-14,-77,-72;
/M: SY='P'; M= 43,-78,-64,-33,-82,-20,-67,-72,  7,-78,-67,-64,101,-18,-64, -2,-56,-69,-78,-76;
/M: SY='G'; M=-55,-75,-29,-32,-76, 62, 22,-79, 21,-78,-68, 49,-69, 22, 23,  9,-58,-37,-77,-18;
/M: SY='E'; M=-16,-74, 12, 60,-79, 21,-58,-73, 12,-74,-67,  0,-63, 43,-26,  5, 28,-24,-80,-69;
/M: SY='K'; M=-10,-73,-29, 38,-75,-67, -8,-43, 50,-55,-31,-52,-21, 41,-12, 20, 41,-10,-79,-65;
/M: SY='V'; M= 26,-17,-74,-67,-29,-74,-71, 34,-37, -2,-47,-29,-75,-21, 39,-60,-11, 59,-79,-61;
/M: SY='T'; M=-20,-72,-59, 21,-67,-34, 11, -1, 21,-35,-56,-56,-67, 22, 35,-14, 51, 25,-78,-21;
/M: SY='V'; M=-43,-16,-83,-79, 50,-84,-78, 59,-76,-14, -9,-32,-79,-77,-77,-69,-56, 68,-69,-13;
/M: SY='E'; M=-41,-15,-31, 50,-24,-70,  9,-36, 12,-30,-60,  7,-66, 39, 33,  4, 20, 12,-79,-63;
/M: SY='L'; M=-65,-72,-36,-77, 41,-47,-72, 53,-77, 60,-13,-77,-80,-73,-76,-40,-61, 11,-67,-19;
/M: SY='T'; M= -6,-26,-34, 16,-70,-38,-10,-34, 12,-65, 13,-10,-65, 20, 17, 33, 55, -3, 22,-63;
/M: SY='Y'; M=-69,-78,-74,-75, 44,-46,-47, -7,-69,-16,-49,-73,-30,-66,-67,-67,-28, -7, 29,115;
/M: SY='Q'; M=-17,-72,-33, 25,-62,-71,-64, 27,-58, -1,-51,-60,-25, 51,-35, 21, 26, 30,-13, -5;
/M: SY='Q'; M= -6,-77,-27, 62,-41,-12,-54,-72,-46,-18,-23, -4,-64, 85,-13, -9, -1,-69,-76,-65;
/I:         E1=0; IE=-255; DE=-255;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_10 which contains 546'790 sequence entries.


Total number of hits 40 in 40 different sequences
Number of true positive hits 40 in 40 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] VIT
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
40 sequences

ITIH1_BOVIN (Q0VCM5), ITIH1_HUMAN (P19827), ITIH1_MESAU (P97278), 
ITIH1_MOUSE (Q61702), ITIH1_PIG   (Q29052), ITIH2_HUMAN (P19823), 
ITIH2_MESAU (P97279), ITIH2_MOUSE (Q61703), ITIH2_PIG   (O02668), 
ITIH3_BOVIN (P56652), ITIH3_HUMAN (Q06033), ITIH3_MESAU (P97280), 
ITIH3_MOUSE (Q61704), ITIH3_PONAB (Q5RB37), ITIH3_RABIT (Q9GLY5), 
ITIH3_RAT   (Q63416), ITIH4_BOVIN (Q3T052), ITIH4_HUMAN (Q14624), 
ITIH4_MOUSE (A6X935), ITIH4_PIG   (P79263), ITIH5_BOVIN (A2VE29), 
ITIH5_HUMAN (Q86UX2), ITIH5_MOUSE (Q8BJD1), ITIH5_PONAB (Q5RER0), 
ITIH6_HUMAN (Q6UXX5), PARP4_HUMAN (Q9UKK3), VMA5A_HUMAN (O00534), 
VMA5A_MOUSE (Q99KC8), VW5B1_HUMAN (Q5TIE3), VW5B1_MOUSE (A9Z1V5), 
VW5B2_HUMAN (Q8N398), VW5B2_MOUSE (Q3UR50), VWA5A_RAT   (Q75WE7), 
Y2016_DICDI (Q54DV3), Y2028_DICDI (Q54DU5), Y2740_DICDI (Q54CQ8), 
Y5975_DICDI (Q54MG4), Y5981_DICDI (Q54MG1), Y6969_DICDI (C7G046), 
Y7758_DICDI (Q55G98)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission