Entry: PS51516

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] SOX_C
Accession [info] PS51516
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2010 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); DEC-2010 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51516
Associated ProRule [info] PRU00849

Name and characterization of the entry

Description [info] Sox C-terminal domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=124;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=119;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3774827; R2=0.0158878; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6672.42748; R2=26.98092; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=386; N_SCORE=8.5; H_SCORE=12824; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=260; N_SCORE=6.5; H_SCORE=12824; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='G'; M=  1,-10,-27, -8, -4,-26, 20,-17,-24,-12,-23,-16, -7,  4,-11,-16,  1,-10,-19,-26,-25, -8;
/M: SY='S'; M=  4, -4,-20, -5, -6,-21,  0, -4,-18, -7,-23,-14,  3, -5, -6, -9, 11,  1,-12,-31,-17, -7;
/M: SY='P'; M= -2,-16,-27,-15, -5,-18,-19,-14, -8, -7, -5,  0,-15, 18, -3,-11, -8, -7,-12,-25,-15, -5;
/M: SY='M'; M= -4, -8, -8,-12, -3,-15,-19, -9, -5, -9, -4,  5, -7,-10, -2,-11, -8, -7, -6,-29,-14, -3;
/M: SY='Q'; M=  5, -7,-22, -8,  1,-23,-13,  6,-15, -7,-14, -6, -4, -3, 12, -8,  4, -4,-16,-26,-11,  5;
/M: SY='G'; M=  2, -8,-24, -9, -5,-23, 20,-14,-23,-13,-15,-11, -4,-16, -5,-13,  2, -6,-18,-24,-20, -5;
/M: SY='I'; M=  8,-19,-19,-26,-19, -4,-20,-15, 15,-16,  5, 15,-16,-18,-11,-19, -6, -4, 12,-18, -1,-17;
/M: SY='M'; M=-10,-14,-22,-18,-12, -7,-22, 11,  1,-14,  8, 20,-12,-10, -5,-11,-12, -1, -4,-25, -1,-10;
/M: SY='G'; M= -1,-13,-29,-12,-11,-24, 19, -9,-26,-12,-20,-13, -7,  5,-12,-10, -5,-14,-23,-23,-21,-13;
/M: SY='C'; M= -5, -9, 38,-16,-16,-18,-20,-20,-17,-19,-20,-16, -4,-14,-16,-20,  4,  3,-10,-41,-23,-17;
/M: SY='P'; M=  5, -9,-26, -9,  1,-27,-15, -2,-17, -5,-20,-10, -8, 21,  8,-10,  0, -2,-19,-25,-16,  3;
/M: SY='A'; M=  7,-11,-19,-12,-10,-16, -6,-17, -8,-14,-11, -9, -6,  2,-12,-16,  4, -1, -5,-29,-19,-12;
/M: SY='P'; M=  5,-10,-23, -7, -1,-24, -9,-15,-19,-10,-28,-19, -5, 35, -5,-15, 15,  5,-18,-33,-24, -5;
/M: SY='P'; M=  4,-19,-24,-16, -9,-16,-17,-20, -6,-15, -7, -8,-17, 25,-13,-19, -4, -4, -7,-28,-19,-13;
/M: SY='A'; M=  9, -1,-20, -6, -1,-23, -4,  4,-17, -7,-14, -7,  4,-15,  9, -7,  5, -5,-16,-26,-13,  3;
/M: SY='M'; M=-11,-22,-24,-26,-19, 10,-25, -7, 11,-17, 10, 20,-19,-12,-11,-15,-15, -8,  3,-11, 12,-16;
/M: SY='Y'; M=-19,-22,-28,-23,-21, 32,-30, 13,  2,-13,  6,  2,-21,-30,-13,-12,-21,-10, -7, 24, 68,-21;
/M: SY='Y'; M= -4, -7,-20,-12,-12, 11,-15,  2, -9,-11,-12, -9,  0,-21,-10,-11,  3,  0,-11, -6, 23,-12;
/M: SY='G'; M= -2, -8,-25, -8,-11,-21, 22, -4,-27,-14,-25,-16, -1, -7,-10,-14,  7, -4,-22,-23,-13,-12;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='Q'; M=  7, -5,-21, -7,  9,-25,-13, -4,-13,  0,-12, -1, -6, -1, 18, -5,  0, -6,-15,-20,-14, 13; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='M'; M= -9,-14,-21,-18,-14,  2,-20,  8,  2,-12,  4, 18,-12,-21, -4,-10, -7,  0, -2,-14, 16,-11;
/M: SY='Y'; M=-11,-10,-13,-14,-18,  7, -4,  1,-15,-14,-13,-10, -4,-26,-14,-13, -7, -8,-16, -3, 23,-18;
/M: SY='T'; M= -5,-14,-18,-15,-12,  3,-19, -3, -5,-16, -7, -5, -9,-12,-13,-13,  3,  4, -1,-21,  3,-13;
/M: SY='P'; M= -8, -7,-34,  2,  2,-31, -8,-14,-24, -8,-29,-20, -8, 49, -3,-15, -2, -8,-28,-30,-26, -3;
/M: SY='N'; M= -1,  1,-20, -4, -1,-16, -8,  2,-14, -9,-11, -8,  5,-16, -5, -9,  2,  3,-11,-29,-11, -4;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='S'; M=  2, -4,  6, -7, -4,-16,-10,  0,-15, -8,-14, -8, -1,-12,  2, -8,  8,  4,-10,-24,-10, -1; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
/M: SY='A'; M= 11, -8,-11, -9, -4,-13, -8,-10, -4, -6, -9, -5, -7,  0, -1, -9,  4,  0, -1,-17,-12, -3; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='H'; M=-11, -6,-25, -7, -1,-14,-20, 14,-18,  8,-13, -4, -3,-17,  7, 10, -5, -4,-16,-18,  6,  1;
/M: SY='P'; M=-10,-10,-29,-10, -3,-20,-14,  2,-15, -5,-17, -7, -7,  7,  6, -3, -4, -4,-18,-21, -6, -1;
/M: SY='H'; M=-15,  0,-26, -4, -6,-10, -8, 53,-25,-12,-18, -5, 10,-20, -2, -5, -5,-10,-24,-26,  8, -6;
/M: SY='P'; M= -8, -9,-29, -7, -2,-22,-16, -2,-14, -9,-17, -6, -5, 28,  0,-11, -4, -6,-21,-30,-17, -3;
/M: SY='A'; M=  3,-12,-22,-12, -7,-21,  0,-14,-12,-12,-13, -7, -9, -4, -1,-13,  3, -4, -9,-26,-18, -5;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='A'; M=  8,-12, -8,-13,-10,-18, -6, -7,-13,-13,-16,-10, -9,  3,-11,-16,  1, -4, -7,-27,-16,-12; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='H'; M= -9, -4,-28, -4,  1,-24, -1, 26,-24, -5,-21, -6,  2,-16, 18, -3,  1,-11,-26,-20,  1,  8;
/M: SY='L'; M=  2,-19,-21,-21,-13, -8,-20,-18,  2,-17, 11,  7,-19,  2,-12,-17,-10,  0, -1,-23,-11,-14;
/M: SY='G'; M= -1, -7,-30, -6, -9,-30, 58,-17,-39,-16,-29,-20,  0,-17,-14,-17,  0,-19,-30,-21,-29,-12;
/M: SY='Q'; M=-10, -2,-31, -1, 18,-39,-20,  7,-20,  8,-21, -2, -2,  0, 53,  7, -1,-10,-30,-21,-12, 35;
/M: SY='L'; M=-11,-18,-23,-19,-13, -1,-25, -1,  5,-22, 24,  9,-15,-15,-13,-15,-21,-10, -3,-24, -2,-14;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='P'; M= -7,-17,-36, -9,  0,-29,-17,-19,-20,-10,-30,-20,-16, 76, -9,-19, -3, -6,-27,-31,-29, -9;
/M: SY='P'; M= -7,-17,-36, -9,  0,-29,-17,-19,-20,-10,-30,-20,-16, 76, -9,-19, -3, -6,-27,-31,-29, -9;
/M: SY='P'; M=-11,-17,-39, -9,  0,-29,-20, -3,-21,-10,-29,-17,-16, 75, -7,-17,-10,-11,-30,-30,-23, -9;
/M: SY='E'; M=-11, 12,-30, 22, 51,-32,-19,  1,-30,  9,-21,-18,  2, -2, 24,  0,  0,-10,-30,-30,-19, 37;
/M: SY='A'; M= 13, -5,-17, -9, -3,-21,-10, -4,-16, -8,-19,-12, -2,  2,  0,-12, 13,  9,-11,-29,-15, -3;
/M: SY='P'; M= -7,-13,-30,-12, -1,-24,-14,-11, -9, -9,-12, -4,-10, 13, 11,-11, -4, -8,-16,-25,-16,  3;
/M: SY='P'; M= -8,-11,-33, -6,  3,-31,-10, -2,-23, -6,-27,-14, -8, 38,  8,-10, -2, -9,-28,-28,-20,  2;
/M: SY='M'; M=  3,-17, -2,-24,-17,  1,-18,-16,  0,-17,  7, 11,-15,-21,-14,-17, -5,  2,  2,-23, -7,-15;
/M: SY='D'; M=  0,  4,-21,  8,  7,-24, -5,-10,-20, -3,-19,-15,  0,-13, -3, -4,  6, -3,-11,-30,-19,  2;
/M: SY='T'; M= -5, -4,  6, -6,-10,-17,-11,-16,-19,-12,-13,-13, -3,-20,-11, -8,  6,  9,-10,-33,-17,-11;
/M: SY='A'; M=  4,-15,-22,-17, -9,-15, -8,-13, -6,-14,  2,  3,-14, -5, -2,-14, -6, -7, -8,-23,-14, -6;
/M: SY='D'; M=-10, 27,-23, 32, 17,-28,-12, -3,-28, -1,-24,-22, 17,-10,  2, -7,  9,  6,-22,-36,-18,  9;
/M: SY='Q'; M= -6, -4,-25, -2,  9,-20,-15, 10,-19, -3,-21,-10, -1, -3, 17, -4,  7, -2,-21,-22, -1, 11;
/M: SY='L'; M= -6,-23, -5,-26,-18,  0,-25,-18, 11,-25, 23, 12,-20,-26,-16,-19,-13, -5,  6,-27, -7,-17;
/M: SY='S'; M= -5, -4,-25, -4,  2,-22, -8, -1,-14, -8,-19,-10,  2, -1,  1,-10,  3, -5,-14,-30,-15,  0;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='P'; M= -5, -6,-18, -5,  0,-15,-12,  6, -9, -6,-13, -5, -3, 11,  4, -7,  1, -3,-12,-19, -7,  0; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='H'; M= -4,  4,-26,  7,  7,-29,-13, 18,-24, -3,-23,-11,  4, -2, 16, -4,  5, -6,-24,-29,-10, 10;
/M: SY='A'; M= 16,-11,-14,-14,-14,-17,  7,-20,-11,-14,-15,-11, -6,-16,-14,-17, 12,  5,  1,-27,-19,-14;
/M: SY='E'; M=-15, 21,-30, 33, 39,-32,-17, 14,-33,  4,-23,-20,  8, -6, 12, -3, -1,-11,-30,-33,-14, 25;
/M: SY='L'; M=-12,-29,-20,-32,-22, 21,-29,-18, 16,-28, 40, 20,-27,-29,-22,-19,-27,-10,  8,-15,  5,-21;
/M: SY='W'; M=-13,-27,-30,-26,-12,  4,-26,-20,  2,-22, 21,  4,-29,-26,-14,-17,-29,-15, -6, 25,  5,-12;
/M: SY='G'; M=  9, -6, -7, -8, -5,-25, 20,-16,-28,-13,-24,-18, -2,-15,-10,-16, 10, -5,-18,-29,-25, -7;
/M: SY='D'; M=-15, 31,-30, 47, 39,-35,-15,  0,-35,  5,-25,-25, 11, -5,  9, -5,  0,-10,-30,-35,-20, 24;
/M: SY='V'; M= -2,-29,-14,-31,-29,  0,-30,-27, 32,-20, 12, 16,-28,-28,-26,-20,-12, -2, 43,-28, -8,-28;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='R'; M=-18,-11,-29,-11, -1,-19,-21, -3,-25, 27,-15, -7, -3,-20,  7, 56,-12,-10,-17,-20, -9, -1;
/M: SY='B'; M=-10, 18,-20, 14,  0,-20,-14, 11,-22, -6,-20,-14, 17,-14, -3, -6,  9, 16,-17,-34, -9, -2;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='D'; M=-16, 37,-29, 51, 30,-35,-12,  1,-35,  3,-27,-26, 18, -8,  6, -6,  1, -9,-30,-37,-20, 18;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-18,-30,-22,  8,-30,-22, 22,-28, 43, 18,-30,-30,-22,-20,-26, -8, 17,-22, -2,-22;
/M: SY='N'; M= -8, 19,-21, 13,  0,-21, -6,  1,-17, -4,-23,-10, 26, -6, -1, -7,  8,  0,-21,-36,-18, -1;
/M: SY='Y'; M= -2,-13, -5,-18,-15,  5,-19,-10, -6,-16,-10, -8, -8,-21,-13,-16,  5,  5, -3,-15, 10,-15;
/M: SY='S'; M=  6, -9,-19, -9, -3,-19,  0,-17,-13,-11,-17,-12, -7, -5,-10,-15,  7,  2, -4,-29,-20, -7;
/M: SY='R'; M=  4,-11,-24,-12, -6,-17, -5, -9,-20,  0,-20,-13, -5, -2, -4,  7,  3, -4,-15,-20, -9, -8;
/M: SY='K'; M=  2, -2,-23, -8, -4,-17,-16,  0,-14, 10,-16, -7,  2,-14, -1,  2, -2, -2,-11,-20, -2, -4;
/M: SY='R'; M= -6, -7,-25, -5,  2,-24,-13,  2,-23,  3,-26,-14,  0,  6,  7, 12,  9,  0,-20,-30,-15,  2;
/M: SY='D'; M= -7, 11,-27, 21, 19,-29,-16, -9,-22, -2,-20,-19, -2,  8, -1,-11, -2, -8,-17,-32,-21,  8;
/M: SY='E'; M= -9,  4,-25, 10, 14,-21,-17, -8,-17, -5,-12, -8, -3,  2,  1,-10,  0,  1,-16,-31,-16,  7;
/M: SY='A'; M= 17, -9,-19,-13, -3,-21,  5,-14,-13, -9,-11, -4, -9,-13, -3,-14,  1, -7, -7,-22,-18, -3;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='A'; M=  3,-11,-12,-13, -8, -6,-11,-11,  0,-10,  3,  3,-10, -2, -7,-11, -2,  3, -1,-17, -8, -8; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='G'; M= -2, -6,-21, -5, -9,-21, 27, -3,-25,-12,-22,-13,  0, -3, -9,-12,  3, -9,-20,-20,-17,-10; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='Y'; M=-13,-24,-24,-25,-21, 18,-21, -7,  4,-18, 14,  5,-21,-28,-18,-10,-20,-10,  1, -2, 23,-21;
/M: SY='G'; M= -7,-13,-31,-14,-12,-23, 13, -5,-16,-15,-17, -4, -7,  1, -5,-16, -7,-15,-18,-23,-17,-11;
/M: SY='Y'; M=-10,-13,-26,-14,-15, -3, -6,  7,-13,-13,-12, -7,-10,-11,-11,-13, -6, -2,-12, -9, 17,-16;
/M: SY='H'; M= -9, -9, -6,-12,-11,-18, -8, 17,-18,-15,-11, -5, -5,-22, -4,-11, -5, -6,-13,-29, -6, -9;
/M: SY='V'; M= -7,-10,-21, -9, -7,-13,-25,-18,  2, -9, -6, -4,-11, -8,-11, -8, -4,  4,  8,-29,-12,-11;
/M: SY='G'; M= -1, -2,-10, -2,-11,-24, 19, -7,-29,-16,-20,-15, -1,-20,-13,-17,  0,-11,-20,-29,-20,-12;
/M: SY='H'; M= -7, -6,-23, -6,  1,-19,-11,  8,-16, -5,-12, -5, -3,-16,  5, -4,  0, -1,-12,-27, -8,  2;
/M: SY='A'; M=  5, -8,-20, -9,-12,-16, -9,-17, -2,-13, -8,  0,-10, -8,-12,-17, -1, -4,  3,-28,-16,-13;
/M: SY='P'; M= -4, -2,-26, -2,  2,-27, -5,-10,-24,  3,-29,-16,  3, 15,  2, -3,  7, -2,-23,-30,-21,  1;
/M: SY='L'; M= -3,-17,-17,-21,-18, -5,-11,-19,  4,-19, 10,  7,-15,-22,-16,-16, -5,  6,  8,-26,-10,-17;
/M: SY='S'; M= 12, -4,-17, -8, -4,-23,  4,-12,-19, -8,-19,-12,  0,-12,  3,-10, 14,  9,-13,-26,-18,  0;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
/M: SY='S'; M=  4, -4,-12, -4, -1,-15,  3, -7,-13, -5,-15, -9, -1,  3,  2, -7,  8,  0,-11,-17,-12,  0; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='A'; M=  8, -6,-10, -8, -6,-11,  2, -9, -8, -4, -9, -6, -3, -9, -5, -2,  5,  0, -2,-15,-11, -6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='S'; M=  4, -5,  1, -7, -6,-12,  1,-11,-12, -8,-13,-10, -3, -1, -7,-10,  6,  4, -7,-18,-13, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='S'; M=  1, -5,-11, -5, -4,-11,  3, -7,-10, -7,-12, -4, -1,  2, -3, -8,  9,  2, -8,-18,-11, -4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='C'; M=  1, -4, 17, -6, -6,-11, -7,-10,-12, -9,-14,-11, -1,-11, -6, -9, 12,  9, -5,-24,-12, -6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='D'; M= -4,  2,  1,  5, -5,-13, -2, -9,-12, -8,-11,-10, -1,-12, -8,-10,  1, -3, -4,-21,-12, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='P'; M= -4,  0,-26,  2, -1,-18,  4, -6,-22, -8,-21,-16,  1,  5, -7,-12, -3, -9,-22,-18, -8, -6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='G'; M= -1,  1,-23,  3,  0,-25, 13,-14,-27,-10,-26,-19,  3, -3, -7,-13, 12,  5,-20,-30,-22, -4;
/M: SY='E'; M= -8, 13,-24, 16, 21,-26, -8,  6,-27, -1,-23,-18, 10, -9,  5, -5,  7,  0,-24,-32,-15, 13;
/M: SY='S'; M=  3,  4,-15, -1, -6,-20, 10,-11,-22,-11,-26,-18, 13,-13, -6,-11, 24, 15,-15,-34,-20, -6;
/M: SY='S'; M=  3, -7,-19, -8, -6,-15,-11,-13,-10,-13,-10,-10, -1,  4, -8,-14,  7,  3,-11,-31,-17, -8;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,  7,-33,-23, 29,-30, 41, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 16,-20,  0,-23;
/M: SY='I'; M= -4,-20,-26,-24,-17,-10,-26,-23, 20,-21, -1,  3,-11, -2,-13,-23, -1, -1, 10,-27,-10,-19;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='V'; M= 11,-25,-14,-29,-23, -4,-23,-26, 20,-20, 11,  7,-23,-23,-22,-21, -9, -3, 28,-25,-10,-23;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-33,-24, 16,-31,-22, 23,-29, 37, 16,-27,-29,-24,-21,-25, -9, 16,-17,  3,-24;
/M: SY='S'; M= 22, -3,-10, -6, -3,-20,  0,-13,-17,-10,-24,-17,  4,-10, -3,-13, 31, 14, -7,-34,-20, -3;
/M: SY='D'; M=-19, 44,-30, 63, 26,-39,-11,  0,-39,  1,-29,-29, 17, -9,  3, -9,  0,-10,-30,-39,-20, 14;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='S'; M=  4,  6,-11,  0, -3,-17, -6,-10,-17, -9,-24,-17, 14,-11, -3, -9, 30, 26,-10,-37,-17, -3;
/M: SY='S'; M= 20, -3,-10, -8, -5,-18, -4,-15,-15,-10,-20,-15,  2,-10, -5,-13, 27, 20, -5,-32,-18, -5;
/M: SY='A'; M= 31,-14,-11,-22,-14,-13,-10,-21, -1,-14,  0, -4,-14,-15,-14,-19,  3,  3,  8,-22,-15,-14;
/M: SY='V'; M= -7,-26,  2,-27,-27,  6,-30,-15, 13,-18,  3,  3,-26,-31,-24,-18,-13, -4, 24,-15, 14,-27;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='Y'; M=-15, -7,-26,-10,-14, 15,-21, 15, -6, -8, -9, -6, -2,-26, -7, -8, -7, -5,-14,  9, 50,-14;
/M: SY='C'; M= -3,  8, 23,  4, -6,-23,-10,-11,-26,-13,-27,-21, 11,-20, -9,-14, 15,  4,-16,-43,-23, -7;
/M: SY='Y'; M=  1, -4,-20,-11,-11,  0,-15, -1, -6,-11, -5, -6,  1,-21, -8,-11, -1,  1, -9,-11, 15,-11;
/M: SY='C'; M= -7,-14, 38,-18,-18, -6,-21,-10,-18,-18,-17,-14,-11,-28,-15,-18,  2, -1,-10,-24,  5,-18;
/M: SY='I'; M= -9,-19,-28,-24,-20, -2,-15,-22,  9,-21, -4,  0,-11,  0,-20,-22,-12,-10,  3,-21, -9,-22;
/M: SY='S'; M= -2,  5,-15,  3, -4,-18,-11,  2,-15, -9,-20,-13,  8,-15, -5, -9, 17, 13, -6,-36,-12, -5;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_10 which contains 546'790 sequence entries.


Total number of hits 19 in 19 different sequences
Number of true positive hits 19 in 19 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Sox C-terminal
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
19 sequences

S17AA_XENLA (Q3KQ35), S17AB_XENLA (Q90ZH9), S17B1_XENLA (O42601), 
S17B1_XENTR (Q8AWH2), S17B2_XENTR (Q6GLH8), S17B3_XENLA (A5D8R3), 
S17B3_XENTR (Q6F2F0), SOX17_HUMAN (Q9H6I2), SOX17_MOUSE (Q61473), 
SOX18_HUMAN (P35713), SOX18_MOUSE (P43680), SOX18_XENTR (B3DLD3), 
SOX7_HUMAN  (Q9BT81), SOX7_MOUSE  (P40646), SOX7_XENLA  (O42342), 
SOX7_XENTR  (Q28GD5), SX17A_XENTR (Q8AWH3), SX18A_XENLA (Q90ZH8), 
SX18B_XENLA (Q90ZH7)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission