PROSITE entry PS52031
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | GG_LECTIN |
| Accession [info] | PS52031 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
08-NOV-2023 CREATED;
08-NOV-2023 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC52031 |
| Associated ProRule [info] | PRU01375 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | GG-type lectin domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=163; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=163; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.3806356; R2=0.0117180; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=864; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='R'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=565; N_SCORE=7.0; MODE=1; TEXT='RR'; /DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='N'; M= -1, 23,-21, 17, -1,-22, 7,-15,-14, 5,-18, -8, 33,-10, -7, -9, -1, -4,-22,-39,-26, -4; /M: SY='S'; M= 8, 0,-25, 2, 0,-20, -7, 2,-10, -4,-12, -8, -1, -7, 3, -8, 13, 8, -9,-32,-15, -1; /M: SY='Y'; M=-13,-23,-30,-25,-25, 27,-25,-11, 19,-14, 22, 2,-19,-31,-20,-12,-14, -4, 22, -2, 32,-25; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='A'; M= 10, -3,-24, -2, -2,-13, -7,-13,-11, 4,-10, 1, -2, -7, 9, 7, 1, -2, -7,-28,-17, -1; /M: SY='F'; M=-21,-26,-37,-29,-28, 55,-29,-18, 0,-11, 21,-12,-20,-30,-17, -6,-12, -9, 12, 14, 44,-27; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='R'; M= -3, -7,-21, -4, 10,-12,-13, -3,-18, 14,-13, 4, -8, 1, 18, 20, -3,-10,-15, -9, -2, 10; D=-4; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='I'; M= -1,-12,-12,-17,-15, 8,-11,-12, 21,-11, 17, 10, -9,-25,-17,-14, -8, 1, 15,-19, 6,-16; D=-4; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='S'; M= -2, -8,-15, -6, 0, -6,-13, -2, -8, 0, -5, -4, -7, -3, -2, 0, 1, -2, -5,-17, -3, -2; D=-4; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='S'; M= 9, -2,-18, -4, -6, -8, -1,-13, 4, -4, -8, -9, -1,-13,-10,-11, 18, 10, 3,-26,-15,-12; D=-4; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='G'; M= 4, -3,-22, -5, -3,-16, 20,-16, -8, -1,-10, -4, -4, -7, -1, -2, 0, -8,-13, -8,-15, -3; D=-4; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='G'; M= 11, -1,-26, -5, -7,-20, 28,-19, -7, -3,-13, -6, -1, -7, -3, -8, 5, -4,-11,-13,-24, -7; D=-4; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='S'; M= 11, 0,-21, 1, 1,-17, -2, -1, -7, -2,-10, -5, -2, -6, -2,-10, 12, 6, -5,-29,-18, -2; D=-4; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='N'; M= -4, 7, 16, -4, -1,-12,-10,-17, -7, 0,-11, -2, 22,-15, -6, -6, 1, 0,-12,-33,-26, -4; D=-4; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='A'; M= 8, -5,-16, -2, -4,-10,-14,-13, 4, -6, -3, -5, -8,-10, 0, -4, 0, 6, 8,-23, -5, -3; D=-4; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='D'; M= 2, 0,-15, 6, -1,-10,-11,-12, -3, 1, -4, -3, -6, -5, -4, 0, -2, -2, 1,-18, -4, -3; D=-4; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='G'; M= -1, -5,-22, -5, -4,-14, 11, -3, -9, -3,-11,-12, -6, 6, -3, -7, 6, 1,-14, -8, -8, -6; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: SY='K'; M= -3, -3,-20, 0, 1, -1, -9, -9, -9, 8, -4, 0, -4, 3, -3, -1, 0, -1, -6, -9, 3, -2; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='I'; M= 4, -9,-13,-18,-15, -2,-10,-10, 25, -8, 10, 10, 1,-20,-11,-14, -5, 4, 18,-24, -6,-15; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='C'; M= -8, -6, 49, -6, 7,-16,-17,-22,-12, -6, -3, -6, -5,-12, -6, -5, -6, -9,-10,-15,-24, 2; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='V'; M= -1, -8,-15,-10,-16, 11,-17,-16, 9, -9, 8, -4, -7,-14,-14,-12, -4, 5, 12,-19, 7,-16; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='E'; M= 4, 1,-15, 5, 12,-24, -6, 2,-15, 3,-12,-10, -2, 10, 9, -6, 2, -1,-17,-23,-16, 10; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='D'; M= -1, 11,-21, 16, -4,-15, 6,-17,-13, -1,-10,-12, 5,-12, -7, -6, 1, -7,-12,-11,-10, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='I'; M= -1, -3,-15,-10, -5, -8,-11,-10, 7, -1, -2, 1, 6, -7, -4, -9, -2, 2, 3,-23, -8, -6; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='I'; M= 3,-11,-18,-17,-12, -6, -9,-11, 15, -3, 5, 9, -5,-13, -9, -9, -4, 2, 10,-23, -6,-12; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='L'; M= -4,-11,-13,-13,-11, 11,-17,-12, 14,-12, 18, 5,-13,-22,-13,-14, -7, 2, 12,-15, 15,-11; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='I'; M= 2, -5,-16,-12,-16, 5,-13,-12, 14, -5, 8, 9, 3,-29,-17,-10, -9, 1, 11,-25, -1,-17; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='G'; M= 1, 11,-20, 11, 2,-21, 14,-15,-12, 2,-13,-11, 9, -8, -7,-11, 5, -5,-17,-19,-19, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='G'; M= 3, -4,-21, -5, -6, -6, 6,-16, -4, -2, -7, -9, -5, -8, -8, -6, 2, -5, -5,-13,-11, -9; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='Q'; M= 5, -2,-15, -2, 2,-16,-11,-12, -5, 0, -8, -5, -1, -7, 9, -2, 3, 7, -4,-22, -9, 4; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='D'; M= -2, 0,-19, 7, 3,-12,-16,-13,-11, 3, 0, 2, -8,-10, 3, 6, -5, -6, -6,-20, 2, 2; /M: SY='N'; M= -5, 6,-22, 0,-10, 2, -5,-15, -7, -2, -5, -5, 14,-21, -6, -3, -4, -5, -9,-24, -5,-10; /M: SY='N'; M= 1, 16,-18, 12, -1,-22, -3,-10,-12, 0,-15,-13, 22, 2, -7,-16, 6, 8,-18,-43,-22, -5; /M: SY='F'; M= 1,-14,-16,-22,-17, 17,-18,-23, 9,-11, 3, -7, -8,-26,-10, -9, -2, 1, 11,-13, 1,-16; /M: SY='G'; M= 2, -4,-34, -8,-13,-21, 43,-21,-12, -5,-17,-15, -4,-10, -7, -4, 5,-11,-20, 0,-20,-13; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='R'; M= 0, -7,-21, -2, -8,-12,-14,-14,-16, 6,-15, 0, -5,-13, 14, 41, -4,-15, -5,-19,-10, -4; /M: SY='G'; M= 0, 0,-40,-10,-20,-30, 80,-30,-10,-10,-20,-20, 0,-10,-20,-20, 0,-20,-30, 10,-30,-20; /M: SY='I'; M= -2,-16,-13,-27,-22, 12,-16,-18, 39,-19, 26, 12, -9,-31,-20,-23,-13, 0, 27,-25, 7,-22; /M: SY='N'; M= -2, 21,-14, 1, -9,-10, -8, 4, 2, -6,-10, 4, 48,-23, -5,-17, -3, 7,-14,-56,-24, -7; /M: SY='I'; M= 3,-14, -8,-20,-19, 9,-19,-21, 28,-17, 18, 8,-12,-30,-19,-18,-10, 3, 25,-28, 3,-19; /M: SY='V'; M= 11,-13,-24,-15,-13, -2,-15,-13, 11, -6, 1, 7, -9,-19, -3, 1, -4, -2, 16,-30, -9,-12; /M: SY='I'; M= 5,-15,-18,-19,-19, 1,-23,-14, 29,-15, 13, 7,-12,-28,-19,-16, -8, 8, 29,-31, 4,-19; /M: SY='I'; M= 0,-18,-16,-26,-26, 17,-21,-22, 37,-19, 21, 6,-13,-34,-24,-18,-12, 2, 33,-24, 10,-26; /M: SY='D'; M= 1, 38,-20, 48, 2,-32, -7,-15,-21, 0,-13,-16, 32,-15, -8,-15, 3, 3,-17,-49,-21, -3; /M: SY='P'; M= 0,-10,-32, -9, -1,-28, 17,-10,-15, -1,-18,-20,-14, 27, 3, -8, -5, -7,-24,-11,-17, -2; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='S'; M= 2, 3, 2, 5, 6,-18,-13,-19,-12, 3,-10, -5, 1, -8, -6, -9, 7, 3, -8,-28,-18, 0; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='T'; M= 8, 2,-19, -7,-14,-11,-14,-17, -3, -6, -5, -4, 12, -8, -1,-19, 17, 31, 2,-43,-13, -9; /M: SY='G'; M= 3, -3,-34, -9,-13,-25, 52,-25, -7, -6,-15,-14, -4, -6,-15,-17, -1,-14,-20, -2,-24,-14; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='E'; M= 4, -2,-23, 1, 9,-21,-14, -1,-16, 9,-14, 1, -3, 3, 9, 5, 1, -3,-13,-28,-13, 7; /M: SY='V'; M= 5,-16,-16,-19,-23, 9,-24,-23, 34,-19, 17, 6,-16,-34,-24,-15,-10, 8, 36,-29, 10,-23; /M: SY='I'; M= 3,-12,-18,-18,-18, -2,-20,-10, 22,-12, 12, 10, -7,-23,-15,-18, -4, 13, 20,-33, 2,-17; /M: SY='D'; M= 8, 10,-19, 18, 18,-29,-10, -6,-19, 9,-11, -2, 2, -4, 3, -8, 3, -6,-14,-31,-19, 12; /M: SY='T'; M= 4, 1,-23, -4, 1,-14,-12, -3, -8, 5,-10, 3, 8, -7, 1, -8, 8, 10, -9,-34,-12, -1; /M: SY='K'; M= 3, 1,-22, 3, 4,-12,-10,-16,-15, 11,-11, 2, 0, -6, 3, 7, 2, -5,-10,-25,-12, 2; /M: SY='T'; M= 1, -9,-20, -8, -9, -9,-19, -1, -3, -4, -1, 4, -7,-14, -6, -3, 2, 6, 2,-27, -2, -9; /M: SY='F'; M=-21,-28,-34,-42,-35, 84,-29,-22, -2,-10, 19,-18,-13,-35,-26, -9, -9,-17, 8, 12, 35,-36; /M: SY='D'; M= 0, 29,-28, 55, 4,-33,-10,-16,-29, 0, -9,-22, 5, -8, -7, -5, 3, -5,-15,-33, -8, -3; /M: SY='M'; M= 3, -9,-20,-19,-18, 2,-15,-10, 7, -2, 9, 13, 2,-25,-13,-14, -1, 12, 6,-30, -3,-16; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='Y'; M=-19,-20,-35,-11,-11, 9,-15, 0, -8, -9, 8, -7,-25,-14, -6, -4, -8, -6, 1, 29, 37,-11; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='F'; M= -2, -2, -9, -3, -2, 1, -7, -5, -3, -1, -2, -5, 0, -6, -4, -2, 1, 0, -3,-11, 0, -4; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='P'; M= 2, 1,-21, 3, 2,-21, -1, -8,-15, 4,-14, -9, -1, 7, 6, 0, 3, 0,-16,-21,-14, 2; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='G'; M= 6, 8,-28, 9, -5,-25, 15,-13,-10, -4,-10, -7, 4, -9, -8,-15, 2, -1,-12,-26,-19, -7; /M: SY='D'; M= 3, 15,-16, 23, 11,-29,-13, -7,-13, 0, -7,-10, 8, -9, -2,-15, 2, -2,-10,-35,-16, 6; /M: SY='S'; M= 6, -4,-23, -1,-11, -7,-10,-18, 1, -7, -8,-15, -7,-10,-15,-12, 13, 12, 6,-29, -8,-16; /M: SY='E'; M= 2, 1,-19, 4, 9,-19, -4,-10,-14, 5,-11, -3, -1, -9, 1, -4, -1, -8,-14,-14,-13, 5; /M: SY='P'; M= 7, -8,-27, -5, -1,-22, -5, -3,-15, 3,-13, -2, -9, 10, 10, 8, -3, -4,-12,-27,-17, 0; /M: SY='F'; M= -8,-17,-12,-24,-15, 30,-22, -9, 12, -8, 28, 16,-13,-33,-19,-14,-16, -6, 7,-14, 19,-16; /M: SY='I'; M= 2,-14,-17,-18,-10, -4,-17,-15, 11, -6, 4, 3, -8,-19, 1, -2, -6, 0, 10,-21, -3, -7; /M: SY='E'; M= 2, 5,-14, 6, 12,-16,-12,-12,-15, 7, -9, -7, 4, -5, 2,-10, 9, 4,-14,-27,-13, 8; /M: SY='F'; M=-30,-32,-38,-34,-29, 64,-25,-22, -7,-11, 19,-17,-28,-32,-21, -6,-16,-20, 5, 46, 52,-29; /M: SY='L'; M= -4,-14,-10,-18,-16, 15,-20,-15, 26,-15, 28, 15,-15,-31,-21,-17,-16, 1, 19,-23, 17,-16; /M: SY='N'; M= 4, 9,-21, 1, -2,-15, -2,-13, -9, 6,-13, 3, 20,-13, 1, -2, 2, 2,-14,-35,-20, -3; /M: SY='A'; M= 13, -2,-22, -3, 1,-15, -4,-13, -7, 3, -9, -2, -2, -5, -2,-11, 13, 10, -5,-32,-19, -2; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='I'; M= 2,-16,-18,-23,-20, 4,-17,-18, 35,-17, 19, 9,-10,-28,-14,-19,-10, 3, 28,-26, 4,-19; /M: SY='P'; M= 2,-10,-26, -4, 11,-32,-11, 4,-21, 10,-19,-14,-15, 51, 5, -7, -4, 0,-24,-32,-20, 6; /M: SY='P'; M= 4, 7,-28, 16, 5,-32, -4, -4,-20, 3,-16,-16, -1, 21, -2,-12, 3, 2,-19,-36,-20, -1; /M: SY='G'; M= 0, 10,-27, 1,-11,-21, 29,-20,-12, 0,-19, -9, 18,-14, -6, -2, 0,-11,-21,-20,-26,-11; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='R'; M= -2, -8,-23, -6, -8, -3,-12,-11,-14, 2,-11, -7, -5,-10, 3, 15, 11, 2, -6,-16, -2, -8; D=-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='I'; M= -1,-18,-16,-32,-26, 5,-14,-19, 51,-20, 22, 11, -6,-31,-21,-26,-12, 1, 36,-28, -1,-26; /M: SY='V'; M= 4,-18,-16,-22,-26, 14,-25,-25, 37,-20, 18, 5,-17,-37,-27,-15,-12, 6, 39,-26, 12,-26; /M: SY='L'; M= 5,-11, -3,-15,-11, 9,-16,-20, 12,-13, 14, 7,-10,-26,-13,-15, -7, 1, 12,-28, -3,-12; /M: SY='I'; M= 0,-17, -6,-25,-18, 7,-21,-12, 24,-10, 21, 19,-10,-34,-19,-15,-14, -1, 18,-25, 2,-18; /M: SY='A'; M= 21, -8,-26, -9,-11, -8,-10,-19, 11, -6, 0, 7, -6,-19, -5,-12, 4, 10, 18,-37,-16,-11; /M: SY='T'; M= 10, -3,-20, -6,-11,-11,-11,-16, 1, -6, -9,-10, 1,-11, -9,-17, 26, 29, 5,-37,-12,-13; /M: SY='Y'; M=-15,-13,-35,-14,-12, 14,-14, 4,-11, -2, 2, -3, -9,-15, -7, 3, -6,-11, -7, -3, 19,-13; /M: SY='D'; M= 0, 30,-32, 48, -2,-40, 21,-23,-27, -4,-13,-24, 9,-10,-13,-15, 1,-10,-22,-24,-18, -8; /M: SY='D'; M= 3, 12,-14, 28, 25,-33,-13,-11,-28, 11,-13,-11, -3, -1, 10, 2, 2,-11,-20,-23,-16, 19; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='G'; M= 3, -9,-22,-11, -9,-11, 8,-11, 0, -4, -5, -7, -9, 6,-10,-12, -3, -2, -6,-17,-11,-11; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='A'; M= 11, -2,-18, -2, -4, -8, 3,-11, -1, -2, -6, -3, -3, -8, -2, -7, 9, 5, 1,-18,-13, -6; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='T'; M= 1, -1, -9, -5, -4, -2, -9, -9, -3, 0, -1, 0, 3, -4, -1, -5, 4, 8, -1,-17, -3, -2; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='N'; M= -4, 5,-21, -1, 2, -8, -9, 5, -9, 8,-11, 6, 15, -7, 0, -1, -2, -3,-14,-27, -8, 0; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='L'; M= 0,-14,-14,-19,-16, 13,-18,-12, 19,-10, 20, 13,-11,-30,-19,-14, -8, 2, 15,-23, 9,-17; /M: SY='N'; M= 2, 8,-22, 4, -3, -9, -9,-14,-10, 4,-11, -7, 14, -3, -7,-12, 8, 9,-11,-37,-15, -7; /M: SY='D'; M= 4, 13,-19, 24, 14,-32,-12, -9,-24, 5,-15,-14, 5, 2, 15, 4, -2, -7,-21,-31,-18, 13; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M= 4, 6,-15, 5, 11,-27, -9, -9,-12, 6,-10, -3, 9, -1, 6,-11, 0, 2,-15,-32,-19, 10; /M: SY='V'; M= 10,-12,-23,-17,-14, 3,-10,-22, 14, -9, 3, 1, -9,-22,-10,-14, 1, 4, 15,-19, -8,-15; /M: SY='R'; M= 2, -3,-23, 0, -3,-15,-14,-15,-12, 7,-12, 0, -2, -8, 10, 19, 0, -4, -5,-23, -9, -1; /M: SY='Q'; M= 5, -1,-21, 3, 5,-21,-15, -6,-16, 7,-12, 1, -1, -7, 15, 12, 0, -3,-11,-26,-12, 7; /M: SY='Y'; M=-10,-21,-19,-21,-16, 13,-13,-21, 12,-15, 14, 1,-24,-28,-15,-12,-14, -8, 11, 18, 21,-16; /M: SY='F'; M= -9,-21,-19,-33,-23, 37,-22,-11, 16,-11, 23, 7,-10,-33,-17,-13,-14, -8, 11,-12, 16,-22; /M: SY='R'; M= 4, -2,-19, 5, 6,-18,-14,-12,-17, 5,-10, -5, -6, -7, 8, 9, 5, -3, -7,-21, -9, 5; /M: SY='E'; M= 9, 0,-19, 2, 12,-21, -7,-13,-14, 9,-13, -2, -3, 0, 9, -1, 4, -1,-12,-25,-18, 10; /M: SY='L'; M= -5,-13,-14,-15,-13, 15,-18,-10, 16,-13, 29, 17,-16,-28,-15,-16,-15, -1, 11,-18, 20,-13; /M: SY='G'; M= 0, 0,-40,-10,-20,-30, 80,-30,-10,-10,-20,-20, 0,-10,-20,-20, 0,-20,-30, 10,-30,-20; /M: SY='S'; M= 11, -2,-20, -3, -3, -9, -3,-12, -3, -3,-12,-12, -1,-12, -9,-12, 30, 18, -3,-32,-18,-10; /M: SY='S'; M= 9, -1,-22, 1, 0,-15,-11,-15, -8, 3,-13, -5, -2,-10, 5, 2, 11, 7, -3,-29,-14, -1; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='A'; M= 6, -3,-23, -3, 2, -9, -6, -5, -5, 4, -6, 3, -2, -9, -4, -6, 5, 1, -5,-23, -9, -2; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='I'; M= 3,-12,-21,-20,-14, -6, -4,-13, 17, -8, 2, -4, -5, 0,-10,-18, -1, 3, 9,-26,-12,-15; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='D'; M= 2, 8,-24, 19, 3,-23, -6,-13,-18, 4,-10,-10, -2, 4, 0, -3, 2, -1,-14,-27,-11, 0; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='D'; M= 1, 5,-24, 6, 0,-20, -2, 5,-13, -2,-12, -5, 5, -9, 2, -1, 3, -4,-15,-28,-14, -1; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='L'; M= -8,-12, -9,-12,-11, 11,-14,-13, 11,-14, 24, 11,-18,-28,-13,-11,-17, -5, 5, -8, 19,-10; /M: SY='G'; M= 0, -4,-28, -4, -3,-15, 11,-16,-11, 4, -7, 0, -6, -9, -2, -1, -2, -8,-14, -9, -7, -4; /M: SY='F'; M=-16,-17,-29,-21,-20, 33,-19,-17, -4, -8, 7,-14,-12,-17,-16, -7, -8, -9, 1, 6, 22,-22; /M: SY='R'; M= -6,-14,-23, -8, -5,-11,-12,-13,-26, 13,-20, 1,-14, -7, 20, 57, -4,-22,-13, -5, -5, 0; /M: SY='D'; M= 0, 9,-28, 18, -2,-17, -4,-10,-14, -4, -8,-15, 0,-13, -7, -9, 4, -3,-10,-22, -5, -6; /M: SY='S'; M= 13, 4,-22, 3, 0,-16, -3,-12,-10, 1,-17,-13, 5, -5, -3,-10, 25, 16, -9,-37,-23, -6; /M: SY='W'; M=-28,-34,-31,-26,-15, 10, -8,-27,-10,-13, 1,-11,-43,-26,-10, -4,-20,-22, -4, 92, 42,-14; /M: SY='V'; M= 15,-11,-25,-12,-15, 5,-14,-21, 14, -9, 2, 1,-10,-24,-11,-11, 3, 7, 21,-31, -7,-16; /M: SY='F'; M=-10,-22,-30,-32,-27, 58,-23,-22, 4,-10, 18, -8,-13,-31,-19,-11, -9,-11, 11, 0, 24,-27; /M: SY='I'; M= 4,-19,-13,-26,-26, 9,-22,-26, 38,-19, 15, 4,-13,-35,-24,-17,-10, 4, 38,-28, 3,-26; /M: SY='G'; M= 1, -5,-35,-11,-17,-12, 37,-23, -4, -9, -8,-12, -4,-13,-15,-17, 3, -7,-13, -2,-13,-17; /M: SY='F'; M= 5, -7,-27,-12,-13, 8, -2,-20, -4, -5, -6,-10, -3,-20, -1, -2, 0, -5, -2,-16, -8,-11; /M: SY='K'; M= -2, -6,-18, -7, 3, -8,-13,-17, -9, 14, -9, 7, -4, -3, -3, 3, 4, -1, -8,-20, -6, -1; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='G'; M= 0, 8,-28, 3,-11,-24, 40,-20,-11, -3,-16,-14, 10, -5,-13,-15, 1, -8,-22,-11,-23,-12; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='I'; M= 3, -4,-22,-14,-15, -9, 7,-17, 9, -9, 0, -1, 3,-18,-10,-17, 3, 5, 0,-24,-12,-14; /M: SY='G'; M= -3, -8,-23,-14, -7, -1, 4,-16, -4, 2, -5, -3, -3, -8, -6, -5, -4, -9,-10,-13, -8, -8; /M: SY='K'; M= 7, -3,-24, -5, -2,-11, -6,-17, -6, 8,-11, 4, -1, -4, -2, 2, 2, 1, -5,-28,-14, -4; /M: SY='P'; M= -5,-12,-25,-11, -2,-11, -7, -9, -7, 6, -7, -3,-13, 16, -5, -1, -5, -4,-11,-18, -4, -6; /M: SY='S'; M= 7, -3,-18, -8, -1, -9, -3,-12, -1, -1, -9, -8, 1,-14, -8,-13, 17, 8, -3,-27,-17, -7; /M: SY='C'; M=-14,-18, 17,-16, 8,-23,-16, -7,-18, -6,-12,-15,-20, 15, -4,-12, -9,-11,-21, 1,-16, 2; /M: SY='F'; M= -2,-14,-24,-21,-13, 11,-21,-10, 8, -5, 6, 0, -5,-20, -8,-11, -5, -1, 9,-20, 4,-12; /M: SY='E'; M= 1, -4, -9, 1, 30,-28,-13, 2,-19, 10, -8, -3, -9, 8, 13, -7, -2, -9,-22,-18,-14, 26; /M: SY='Q'; M= -5, -2,-21, 1, -2, -8,-10,-11,-11, -2, -2, -5, -4,-15, 5, 0, -4, -4,-11, -8, 3, 0; /M: SY='H'; M= -5,-11,-26,-14, -5, 5,-21, 19, -6, -5, -1, 0, -5,-14, -7, -7, -2, -7, -6,-25, 0, -7; /M: SY='T'; M= 7, -2,-21, -7,-13,-10,-10,-18, 7, -5, -3, 1, 3,-17, -8,-10, 4, 11, 9,-35,-12,-13; /M: SY='K'; M= 0, -3,-22, -6, 7,-17, 0, -8, -8, 10,-11, 0, 0, 3, -4, -9, 3, -4,-14,-23,-15, 2; /M: SY='N'; M= -5, 4,-26, -1, -9, -7, -6, -1, -6, -4, -5, -5, 12, -5,-10,-14, -5, 0,-11,-31, -6,-10; /M: SY='H'; M= -1, 3,-22, 3, 1,-18,-10, 11, -7, -5, -4, 0, 3, -9, -3,-13, 2, 1,-11,-34, -9, -1; /M: SY='E'; M= -1, 0,-12, -4, 6,-18, 1,-15,-10, 5,-12, -6, 4, -4, -5,-11, 3, -4,-15,-20,-17, 1; /M: SY='H'; M= 2, 2,-24, 6, 7,-28, -6, 11,-18, -2,-14, -7, 0, -3, 11, -3, 4, -2,-19,-28,-15, 8; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='G'; M= 0, 4,-19, 4, 0,-15, 5,-15,-10, 2,-12, -6, 3, -8, 1, -2, 1, -5,-13, -7,-11, -2; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='S'; M= 1, -3,-17, -3, -8, -8, 2,-13, -1, -6, -2, -6, -4, -9, -7,-12, 6, 6, -1, -8, -3, -9; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='A'; M= 2, -3,-16, -4, -4, -3,-11, -9, -2, -1, -1, -1, 0,-11, 0, -4, 0, 2, 1,-17, -3, -4; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='Q'; M= 6, -4,-17, -3, 4,-13, -7, -6,-10, 4,-12, -7, -6, 6, 9, 2, 8, 5,-11,-20,-11, 3; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='T'; M= 10, -4,-25,-11,-13,-12, -4,-22, 7, -4, -5, 1, 1,-12, -8,-13, 6, 13, 9,-32,-14,-12; /M: SY='N'; M= -4, -2,-20,-10, -9, -3,-15, -6, 3, -5, -1, 1, 8,-10, -2, -8, -7, 3, -3,-31, -3, -8; /M: SY='L'; M= -1,-11,-15,-13, -9, 8,-18,-16, 12, -6, 14, 11,-12,-21, -8, -6,-10, 0, 10,-22, 9, -9; /M: SY='Y'; M=-14, -7,-15, 5, 16, -7,-21, -8,-20, 4, 3,-12,-16, -7, 0, -6, -4,-12,-12, 4, 17, 9; /M: SY='A'; M= 2, -8,-21, -7, -1, -8,-13,-16, 0, 0, -4, -5, -8,-13, -1, -4, 1, -1, 2,-18, -4, -3; /M: SY='I'; M= -3,-10, -5,-13,-14, 0, -1,-28, 5,-13, 1,-11,-10,-25,-21,-14, -8, -8, 5,-12, -7,-17; /M: SY='W'; M=-27,-33,-26,-37,-24, 42,-14,-31, -1,-16, 9,-15,-33,-33,-20, -8,-18,-24, 2, 68, 38,-24; /M: SY='P'; M= -4, 8,-29, 28, 9,-41,-10, -4,-30, 4,-20,-32,-11, 48, -1, -9, -4, -3,-28,-33,-15, 1; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='E'; M= 6, 1, -9, 7, 23,-23,-12, -8,-15, 7, -7, -6, -5, 2, 6,-10, 4, -4,-15,-25,-16, 17; /M: SY='D'; M= 3, 12,-24, 24, 3,-26, -5, -9,-13, -4, -7,-13, -1,-12, -3, -9, 3, -3, -9,-28,-10, -1; /M: SY='I'; M= 3,-14,-17,-20,-19, 4,-12,-17, 30,-15, 19, 11,-11,-29,-18,-19,-11, 2, 24,-25, 4,-19; /M: SY='E'; M= 1, -1,-17, 3, 21,-32, 10, -4,-21, 5,-14,-13, -7, 3, 7,-10, 1,-14,-26,-10,-19, 17; /M: SY='M'; M= 6,-10,-17,-13, 0,-13,-12, -7, 9, 0, 6, 12, -7,-17, -5,-13, -6, -2, 6,-25, -9, -2; /M: SY='T'; M= -3, -9,-11, -9, 1,-11,-14,-16,-11, -3, -1, -8, -8, -7, -1,-16, 4, 7, -5, -9, -1, 1; /M: SY='G'; M= 2, 2,-34, -7,-13,-28, 62,-26,-10, -7,-19,-17, 3,-10,-15,-18, 2,-15,-27, 0,-30,-14; /M: SY='C'; M=-20,-19, 58,-25, -6, -1,-27,-32, -8,-18, 7,-14,-12,-24,-16,-16,-12, -9, -4, -9,-14,-10; /M: SY='P'; M= -4,-17,-27,-17, -6,-21, -9, 3, -2, -2,-12,-13,-16, 29, -3, -5, -5, -2, -9,-26,-13, -9; /M: SY='P'; M= -7,-14,-19, -6, 6,-22,-15, -7,-19, 4,-15,-17,-21, 25, 8, 11, -8,-12,-17, -6, -6, 5; /M: SY='R'; M= 2, -4,-23, 1, 1,-17, -9,-12,-17, 8,-11, 1, -7, -6, 11, 20, -2, -9,-10,-19,-10, 2; /M: SY='K'; M= 3, -3,-25, -6, -4,-10, -8,-18, -3, 7, -6, 4, 0, -8, -5, -7, 3, 3, -2,-25,-10, -6; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 30 in 25 different sequences |
| Number of true positive hits | 30 in 25 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Bacteriophages, Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 2 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | GG-type lectin |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
25 sequences
CEIP2_DANRE (A3KPQ7), CEIP2_HUMAN (Q9UHN6), CEIP2_MOUSE (Q5FWI3), CEMIP_HUMAN (Q8WUJ3), CEMIP_MOUSE (Q8BI06), FAM3A_HUMAN (P98173), FAM3A_MOUSE (Q9D8T0), FAM3A_PONAB (Q5R5C3), FAM3B_HUMAN (P58499), FAM3B_MOUSE (Q9D309), FAM3C_BOVIN (A5PKI3), FAM3C_DANRE (Q7ZYY4), FAM3C_HUMAN (Q92520), FAM3C_MOUSE (Q91VU0), FAM3C_RAT (Q810F4), FAM3C_XENLA (Q6GQC1), FAM3C_XENTR (B0BLS9), FAM3D_HUMAN (Q96BQ1), FAM3D_MOUSE (P97805), FIB35_BPT4 (P03742), PMGT1_BOVIN (Q5EAB6), PMGT1_HUMAN (Q8WZA1), PMGT1_MOUSE (Q91X88), PMGT1_PONAB (Q5RCB9), PMGT1_RAT (Q5XIN7)» more
|
| PDB [Detailed view] |
17 PDB
2YOP; 2YOQ; 5GGF; 5GGG; 5GGI; 5GGJ; 5GGK; 5GGL; 5GGN; 5GGO; 5GGP; 5LC2; 5LC3; 5LC4; 5XFC; 7ECQ; 8C6I » more |