PROSITE logo

PROSITE entry PS52038


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] TOPO_IB_2
Accession [info] PS52038
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 24-JAN-2024 CREATED;
24-JAN-2024 DATA UPDATE;
27-MAR-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC00159
Associated ProRule [info] PRU01382

Name and characterization of the entry

Description [info] Topoisomerase (Topo) IB-type catalytic domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=304;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=299;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6132002; R2=0.0145468; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=646; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=268; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-7; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='S';  M= -1, -2,-16, -5, -2,-16, -7,-14,-10, -9,-15,-11,  1,-15, -8,-11, 11, 11, -1,-32,-17, -5;
/M: SY='S';  M=  7, -6,-18, -8, -1,-22,-11, -9, -8, -8,-18, -8,  1,-12, 10, -9, 18,  6, -8,-30,-15,  4;
/M: SY='N';  M= -3, 13,-21, 10,  2,-23, -8, 12,-25,  3,-25,-15, 19,-15,  2,  4,  8, -2,-21,-33,-12,  1;
/M: SY='I';  M=-11,-25,-27,-31,-23,  5,-23,-22, 19,-21, 15, 10,-17,-23,-18,-13,-19,-11, 10,-17, -1,-23;
/M: SY='K';  M= -4,  4,-27,  1,  8,-29,-15, -5,-25, 31,-26,-10,  7,-11, 14, 18, -4, -8,-21,-23,-12, 11;
/M: SY='G';  M=  4,-10,-24,-12,-13,-24, 31,-17,-24,-15,-16,-11, -4,-18, -9,-16,  0, -8,-19,-21,-21,-11;
/M: SY='K';  M= -1,  1,-25, -2, 10,-25,-16, -6,-19, 16,-16, -7,  2,-12, 14,  7, -4, -7,-18,-23,-12, 12;
/M: SY='R';  M= -1, -2,-22, -1, 10,-24,-12, -7,-25, 15,-24,-15,  2,-11,  7, 18,  9,  0,-17,-28,-16,  7;
/M: SY='D';  M=-18, 33,-32, 48, 13,-33,-13, -5,-36,  5,-29,-26, 11,-12, -1, -5, -6,-12,-28,-17,-13,  7;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='R';  M=-10, -8,-20, -8, -3, -6,-13, -3,-14, 14,-12, -6, -6,-12,  1, 17,-10, -8,-12,  9,  7, -2; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E';  M= -9,  2,-28,  6, 27,-30,-18, -1,-27, 18,-23,-13,  1, -8, 22, 16,  1, -7,-24,-26,-15, 24;
/M: SY='K';  M=-11, -5,-30, -6,  4,-25,-23,-12,-20, 37,-22, -6, -3,-12,  6, 26,-11,-10,-13,-20, -9,  4;
/M: SY='F';  M=-19,-27,-23,-33,-26, 57,-30, -8,  2,-24, 11,  2,-21,-30,-29,-17,-21,-10, -2, 13, 42,-26;
/M: SY='E';  M= -9,  7,-25, 13, 29,-25,-20, -8,-21,  9,-18,-15, -2, -8,  7,  0, -1, -2,-15,-30,-16, 18;
/M: SY='R';  M=-12, -7,-26, -8,  0,-21,-21, -9,-22, 30,-20, -8, -3,-16,  4, 37, -7, -3,-11,-22,-10,  0;
/M: SY='A';  M= 27,-18,-13,-25,-16, -2,-12,-21,  1,-16,  4, -2,-17,-18,-17,-20, -2, -3,  8,-18,-10,-16;
/M: SY='R';  M=-12,-11,-28,-10,  0, -7,-21,  4,-19, 12,-13, -8, -7,-20,  3, 30,-10, -9,-16, -7, 13, -2;
/M: SY='N';  M=-10, 12,-27,  9,  0,-26,  4, -2,-25,  4,-22, -8, 15,-16,  4,  4, -2,-10,-23,-28,-17,  2;
/M: SY='L';  M= -4,-28,-18,-30,-22, 16,-27,-21, 15,-27, 32, 13,-26,-28,-23,-20,-22, -8, 13,-17,  1,-22;
/M: SY='K';  M=-10, -4,-26, -5,  2,-16,-23,-12, -5,  6, -4,  4, -7,-14, -1, -1,-10, -4, -6,-24, -8,  0;
/M: SY='K';  M= -8, 11,-25,  9,  5,-26,-13, -7,-25, 16,-28,-16, 13, -2,  2,  6,  4,  1,-21,-30,-16,  3;
/M: SY='H';  M= -9,-10,  6,-13,-12,-12,-21, 11,-17,-10,-15, -8, -5,-23, -7, -2,  0,  0, -8,-28,  1,-12;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-25,-37,-29,  1,-37,-29, 43,-28, 21, 18,-23,-23,-22,-27,-19, -8, 32,-22, -2,-29;
/M: SY='D';  M=-13, 22,-30, 29,  8,-33, -5, -6,-32,  7,-30,-22, 13,  3, -1, -3, -2,-10,-28,-32,-20,  3;
/M: SY='K';  M= -2,  4,-22,  2,  2,-24,-13, -7,-19, 12,-22,-11,  5,-14,  6, 10,  3, -3,-12,-28,-14,  3;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='I';  M= -8,-21,-26,-27,-14, -6,-34,-24, 29,-21, 10, 10,-16,-17,-14,-22,-12, -3, 20,-24, -5,-17;
/M: SY='R';  M=-15, -1,-27, -5,  0,-20,-17, -2,-27, 25,-22,-11,  8,-17,  7, 46, -4, -2,-19,-24,-11,  0;
/M: SY='K';  M=  4,  0,-22, -4,  5,-22,-13, -8,-22, 15,-20,-12,  3,-12,  3, 15,  1,  0,-15,-24,-15,  3;
/M: SY='D';  M=-11, 17,-25, 18,  3,-26, -6, -3,-22,  2,-19, -7, 11,-14,  4, -3, -1, -3,-20,-30,-15,  4;
/M: SY='Y';  M=-11,-26,-24,-28,-25, 13,-32, -9, 22,-19, 13,  9,-24,-28,-19,-18,-19, -7, 17, -3, 29,-25;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='R';  M= -9, -2,-17, -7, -4, -4,-14, -4,-13,  3,-11, -7,  4,-13,  2, 14,  0,  6,-11,-16, -4, -2; D=-13;
/I:         I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='K';  M=-10,  7,-23, 11, 13,-23,-14, -4,-24, 25,-21,-12,  3, -8,  7, 18, -5, -8,-18,-19,-10,  9; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='N';  M= -6, 22,-16, 15,  0,-18,  7,  1,-19, -3,-23,-16, 31,-13, -2, -4,  8, -1,-21,-28,-16, -1; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='F';  M=-14,-14,-25,-19,-14, 11,-22,-13, -6, -8,  6, -1, -8,-25,-14, -1,-18,-10, -9, -1,  3,-13;
/M: SY='K';  M= -5, -3,-23, -8, -2, -8,-18,-11,-20, 19,-19, -9,  2,-15, -3, 15, -4, -2,-14,-18, -6, -2;
/M: SY='S';  M=  8,  1,-16,  3,  1,-23, -4,-12,-21, -9,-28,-20,  4,  5, -3,-13, 26, 11,-14,-36,-22, -2;
/M: SY='K';  M= -8, -5,-26, -5,  4,-12,-10,-12,-25, 19,-23,-12, -2,-13, -1,  9, -3, -7,-18,-19, -8,  2;
/M: SY='T';  M= -7, -5,-20, -2,  2, -8,-22, -9, -5, -9, -4, -6, -9,-17, -7,-11, -2,  3,  0,-22,  1, -3;
/M: SY='P';  M=-10,  0,-25, -1, -5,-18,-17, -8,-10, -4,-13,  0,  0,  5, -5, -3, -5, -2,-10,-30,-15, -7;
/M: SY='K';  M= -8, -4,-27, -2,  8,-23,-18,  0,-22, 18,-20, -9, -3, -2,  4,  8, -5, -7,-19,-26,-10,  5;
/M: SY='N';  M=-10,  5,-23, -1,  6,-17,-15, -1,-11,  6,-12,  2, 10,-16,  3,  6, -4, -6,-12,-29,-13,  4;
/M: SY='R';  M=-19,-10,-30,-10, -2,-15,-21,  2,-26, 27,-18, -9, -3,-20,  7, 55,-11,-10,-19,-13,  2, -2;
/M: SY='Q';  M= -7, -7,-25, -5, 12,-29,-23, -1, -8,  2,-12,  0, -8,-14, 33,  1, -3, -7,-10,-24,-11, 22;
/M: SY='I';  M=-11,-24,-27,-30,-20, -3,-32,-20, 24,-14, 18, 18,-18,-21,-12,-10,-20,-10, 13,-20, -2,-19;
/M: SY='A';  M= 44, -8,-10,-17, -8,-20,  0,-18,-12,-10,-13,-12, -7,-10, -8,-18, 15,  3, -2,-23,-20, -8;
/M: SY='V';  M= -4,-27,-14,-28,-24,  3,-29,-25, 22,-23, 23, 12,-27,-28,-24,-19,-14,  1, 30,-26, -6,-24;
/M: SY='A';  M= 19,-17,-16,-27,-17,  0,-13,-16,  5,-15,  3, 12,-15,-16,-12,-18, -5, -5,  6,-16, -6,-15;
/M: SY='L';  M= -7,-21, -2,-27,-21, -1,-28,-21, 12,-22, 19, 13,-20,-25,-17,-19,-13,  3, 12,-26, -6,-20;
/M: SY='Y';  M=-17,-19,-31,-19,-13, 10,-26,  6, -6, -6, -1, -1,-18,-26,  0, -1,-19,-12,-14, 23, 41, -9;
/M: SY='L';  M=-11,-27,-20,-31,-21, 14,-27,-14, 18,-24, 38, 29,-26,-27,-16,-17,-26,-10,  9,-17,  3,-18;
/M: SY='I';  M= -8,-25,-26,-30,-17, -3,-35,-25, 33,-23, 16, 13,-20,-20,-16,-24,-17, -8, 23,-23, -4,-20;
/M: SY='D';  M=-17, 29,-27, 40, 11,-31,-14,  8,-34,  2,-25,-21, 13,-13,  1,  3,  0, -3,-25,-35,-13,  5;
/M: SY='K';  M=-11, -1,-23, -2, -7, -9,-19, -9, -9,  5,-10,  0, -2,-20, -7,  5, -9, -7, -2,-24, -7, -7;
/M: SY='F';  M= -9,-26,-20,-31,-22, 34,-27,-14,  7,-25, 23,  7,-23,-28,-24,-18,-21, -9,  3, -2, 20,-22;
/M: SY='A';  M= 20, -4,-15,-13, -9, -7, -6,-12,-13, -7,-14,-11,  2,-15, -9, -7,  7,  0, -8,-21,-12, -9;
/M: SY='L';  M=-11,-27,-21,-32,-22, 13,-29,-16, 22,-25, 34, 28,-25,-26,-17,-19,-25,-10, 12,-17,  3,-20;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='V';  M= 18,-22,-11,-27,-22,  2,-18,-25, 10,-17,  2,  1,-21,-22,-23,-20, -3, -1, 23,-21, -9,-22;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='N';  M= -8, 20,-24, 15,  3,-26,  1, -2,-27, 11,-30,-18, 27,-15,  1,  4,  5, -4,-25,-32,-18,  2;
/M: SY='E';  M=-11, 10,-29, 19, 45,-27,-19,  0,-25,  6,-16,-11, -1, -4, 15, -2, -3,-10,-25,-30,-17, 30;
/M: SY='K';  M= -8, -8,-27, -9,  0,-22,-24,-15,-13, 31,-19, -4, -7,-14,  1, 16,-11, -8, -4,-22, -9,  0;
/M: SY='Y';  M=-12,  2,-28,  7, -2, -8, -2,  3,-22, -8,-17,-14, -2,-19, -6,-11, -4, -9,-20, -8, 17, -6;
/M: SY='E';  M=  4,  0,-25,  5, 21,-23,-15,-10,-18, -4,-10,-13, -7,  3,  2,-11, -2, -7,-17,-27,-19, 11;
/M: SY='D';  M=-17, 22,-30, 33, 10,-33, -6, -3,-36, 12,-27,-21, 10,-14,  2, 15, -4,-11,-26,-30,-17,  5;
/M: SY='E';  M=-10,  6,-30, 13, 46,-34,-20,  4,-26, 10,-20,-13,  0, -4, 34,  4,  0,-10,-30,-26,-16, 40;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='A';  M= 26,  5,-15, -7, -6,-20, -2,  1,-15, -7,-17,-12, 12,-14, -5,-12,  8, -2,-12,-27,-16, -6;
/M: SY='D';  M=-15, 28,-30, 40, 27,-35,-15, -3,-35, 15,-28,-23, 10, -8,  7,  3, -3,-10,-27,-33,-17, 17;
/M: SY='T';  M=  2,  0,-10, -8, -8,-12,-17,-18,-12,-10,-13,-12,  2,-10, -8,-10, 23, 45, -2,-32,-12, -8;
/M: SY='V';  M= -7,-26,-17,-26,-26, 11,-30,-12, 19,-16,  6,  6,-26,-30,-23,-16,-14, -4, 28, -8, 22,-26;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='C';  M= -2,-24, 36,-30,-25, -8,-28,-27,  2,-27,  7,  0,-22,-30,-24,-25,-14, -8,  8,-33,-15,-25;
/M: SY='C';  M= -4,-14, 54,-20,-19,-15,-21,-22,-19,-23,-12,-14,-11,-28,-19,-21,  4,  4, -6,-41,-21,-19;
/M: SY='T';  M=  6,  0,-10, -4, -4,-16, -9,-14,-16,-10,-21,-16,  6,-10, -4,-10, 31, 33, -6,-36,-16, -4;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R';  M=-18, -8,-30, -8,  2,-22,-20, -2,-30, 35,-22,-10,  0,-18, 10, 61,-10,-10,-20,-20,-10,  2;
/M: SY='V';  M= -7,-11, -5,-15,-14,-10,-24,-12,  0, -4, -9, -2, -9,-25, -9, -7, -7, -5,  8,-25, -4,-12;
/M: SY='E';  M=-10,  3,-30,  8, 31,-29,-11, -5,-31, 20,-24,-16,  0, -7, 12, 14, -4,-11,-26,-25,-17, 21;
/M: SY='H';  M=-19,  4,-29,  2,  0,-20,-18, 91,-29, -9,-21, -2, 15,-20,  9,  0, -8,-18,-30,-31, 16,  0;
/M: SY='V';  M=  2,-28,-16,-32,-28, -2,-30,-29, 32,-22, 11, 11,-25,-25,-25,-23,-11, -3, 38,-26, -8,-28;
/M: SY='K';  M= -8,  3,-25,  2, 15,-25,-19, -7,-20, 18,-20,-10,  3,-11, 10,  9, -2, -2,-15,-26,-13, 13;
/M: SY='I';  M= -9,-29, -8,-34,-26,  2,-34,-26, 27,-29, 27, 15,-25,-27,-22,-25,-22, -9, 20,-24, -4,-26;
/M: SY='E';  M= -6,  0,-23,  2,  5,-20,-17, -1,-14,  1,-14, -8,  0,-13,  1, -3,  3, -3,-12,-30,-10,  2;
/M: SY='P';  M= -7,-14,-33, -8,  3,-26, -9,-15,-19, -9,-24,-12,-13, 47, -6,-16, -4, -8,-24,-29,-25, -4;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='P';  M= -5, -3,-22, -1,  3,-19,  2, -8,-17, -5,-19,-13, -1, 23, -4, -9, -2, -7,-20,-19,-18, -2; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='D';  M=-10, 20,-15, 24,  5,-13, -6,  3,-16, -1,-14,-12, 11, -8, -1, -4, -1, -4,-14,-15, -1,  2; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='T';  M= -5, -9,-17,-13, -9,-13,-22,-18, -7,  6,-11, -5, -7,-16, -8,  6,  2, 17,  5,-27,-10, -9;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-24,-37,-30,  0,-37,-30, 44,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 36,-23, -3,-30;
/M: SY='T';  M= -6, -5,-20, -7,  3,-15,-23, -5, -7, -3, -9, -5, -5,-13, -3, -6,  2, 11, -2,-28, -8, -1;
/M: SY='F';  M=-15,-30,-21,-37,-27, 45,-31,-21, 14,-30, 25, 10,-23,-29,-30,-21,-23,-10,  7, -4, 16,-27;
/M: SY='D';  M=-16, 32,-28, 40, 18,-33,-12,  0,-34, 11,-28,-23, 19,-12,  4,  6, -1, -8,-28,-34,-18, 11;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='L';  M= -9,-22,-21,-22,-14, -2,-27,-19,  9, -8, 24, 11,-22,-25,-14, -7,-22, -9,  8,-21, -4,-14;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='D';  M=-15, 37,-27, 52, 15,-35,-10,  9,-36, -3,-29,-25, 17,-11,  1, -9,  5, -7,-27,-39,-16,  7;
/M: SY='S';  M=  5, -3,-18, -3, -4,-24, 15,-13,-26, -5,-30,-19,  6,-13, -4, -7, 23,  6,-16,-32,-21, -4;
/M: SY='I';  M= -7,-23,-21,-29,-20, -6,-30,-18, 27,-17, 10, 21,-20,-22, -7,-17,-14, -7, 24,-23, -5,-15;
/M: SY='R';  M=-11, -6,-25, -6,  3,-23,-15, -2,-27, 21,-23,-11,  2,-16, 13, 41,  3, -3,-19,-25,-12,  5;
/M: SY='Y';  M=-17,-21,-29,-23,-16, 21,-27,  9, -5,-16,  3,  1,-18,-27, -9,-11,-20,-14,-12, 19, 35,-13;
/M: SY='H';  M=-12, -2,-25, -2,  7,-10,-21, 12,-10, -4, -8, -5,  0,-18,  5, -5, -7, -9,-14,-17,  8,  5;
/M: SY='N';  M=-13,  6,-26,  0,  4, -5,-17,  2,-18,  8,-18,-10, 12,-18,  4,  3, -5, -7,-21,-15,  5,  4;
/M: SY='T';  M=  2,  1,-16,  0,  1,-18,-16,-15,-13, -2,-15,-12, -2,-12, -5, -7, 10, 17, -3,-30,-14, -2;
/M: SY='V';  M= -4,-27,-16,-31,-27,  0,-32,-28, 30,-23, 15, 12,-24,-25,-24,-22,-12,  2, 35,-26, -6,-27;
/M: SY='E';  M=-12,  4,-29, 10, 18,-28,-17, 10,-28,  9,-24,-14,  3, -1, 13, 11, -1, -8,-25,-29,-12, 13;
/M: SY='V';  M= -8, -7,-21,-10,-14,-10,-24,-17, 10, -9,  1,  2, -5,-22,-14,-11,-10, -5, 12,-28, -9,-15;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='D';  M=-10, 13,-22, 19, 16,-24,-13, -3,-26,  6,-21,-17,  6, -9,  5, 10,  5,  1,-19,-29,-15,  9; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='P';  M=-11, -6,-32, -6,  3,-23,-20,-12,-13,  6,-20,-11, -2, 19, -1,  2, -8, -9,-18,-27,-17, -2;
/M: SY='R';  M=-13,  6,-27, 10, 11,-25,-19, -5,-24, 12,-15,-11,  1,-13,  9, 16, -5, -4,-19,-26,-12,  9;
/M: SY='V';  M=  1,-27,-14,-29,-24,  0,-26,-22, 22,-20, 19, 18,-27,-27,-21,-18,-14, -4, 30,-25, -7,-23;
/M: SY='Y';  M=-11,-22,-23,-26,-20, 31,-26, -5, -1,-15,  7,  1,-18,-27,-18, -7,-17, -9, -4,  6, 32,-20;
/M: SY='K';  M= -4, -4,-26, -7,  5,-26,-18, -7,-19, 30,-19,  2, -4,-12, 12, 16, -8, -9,-15,-20,-10,  8;
/M: SY='N';  M= -2,  6,-21, -1, -6,-19,-12, -8,-10,  1,-20,-11, 15, -5, -7, -4,  0, -3, -9,-32,-18, -7;
/M: SY='L';  M=-11,-29,-22,-33,-23, 15,-31,-20, 24,-28, 36, 22,-26,-27,-20,-21,-26,-10, 13,-17,  3,-22;
/M: SY='E';  M= -2, -3,-25, -3, 14,-24,-10, -8,-18,  1,-11, -8, -5,-11, 12, -3, -2, -4,-18,-24,-14, 13;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='R';  M=-13,-10,-25,-11,  2, -1,-23, -9,-16,  8, -8, -5, -7,-16,  1, 12, -9, -4,-13,-16, -2,  2;
/M: SY='L';  M=-13,-27,-21,-30,-20, 26,-29,-19,  9,-22, 30, 11,-24,-28,-23,-15,-25,-10,  4,-11,  8,-20;
/M: SY='M';  M=-10,-17,-21,-21,-12,  4,-25,-13,  0, -6,  7,  8,-14,-21, -6,  0,-12, -1,  1,-18, -1, -9;
/M: SY='E';  M= -4, 11,-27, 18, 20,-32,-14, -5,-27,  5,-24,-17,  3,  3, 12, -3,  3, -6,-24,-30,-19, 16;
/M: SY='G';  M=-10,  3,-28,  3, -9,-16, 11, -5,-22,-12,-17,-14,  6,-10,-11,-13, -5,-11,-23,-20, -7,-11;
/M: SY='K';  M= -6, -8,-28, -8, -1,-24,-11,-15,-17, 17,-22, -9, -4, -2, -1,  5, -4, -7,-13,-24,-14, -3;
/M: SY='Q';  M= -1, -3,-21, -4,  2,-25, -3, -6,-20,  5,-23, -6,  2,-12, 12,  1, 11,  0,-16,-28,-15,  7;
/M: SY='P';  M= -8, -9,-32, -5,  7,-27,-20,-16,-22,  5,-26,-16,-11, 44, -3, -6, -4, -1,-23,-28,-22,  0;
/M: SY='D';  M= -9,  9,-28, 14,  9,-24,  2,-11,-30, -6,-23,-21,  1,-12, -4,-11,  0, -2,-24,-12,-15,  3;
/M: SY='D';  M=-15, 20,-29, 31, 24,-29,-17,  7,-29,  4,-18,-17,  6,-10,  6, -3, -5,-11,-25,-32,-13, 14;
/M: SY='D';  M=-14,  8,-25, 12,  2, -5,-18, -5,-18, -9,-11,-11,  0,-17,  2, -9, -3, -7,-17,-22, -4,  3;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='L';  M=-10,-21,-25,-22, -9, -2,-30,-19, 14,-14, 24, 11,-20,-22,-11,-13,-22,-10,  6,-21, -4,-11;
/M: SY='F';  M=-18,-28,-23,-37,-27, 57,-30,-19,  4,-24,  8,  2,-18,-27,-32,-12,-19,-10,  2,  2, 21,-27;
/M: SY='D';  M=-15, 19,-12, 22,  4,-27,-14, -1,-24,  0,-19, -9, 11,-17,  5,  0, -4, -9,-21,-34,-16,  4;
/M: SY='R';  M= -6,  0,-25, -2,  6,-22,-14, -3,-26, 19,-22,-13,  7,-15,  7, 33,  0, -5,-19,-25,-14,  4;
/M: SY='L';  M= -8,-29,-23,-30,-22,  2,-31,-24, 24,-26, 29, 14,-27,-15,-20,-22,-23, -8, 16,-23, -5,-23;
/M: SY='N';  M=-10, 26,-22, 23,  9,-24, -8, 11,-25, -2,-26,-19, 28,-14,  2, -4, 10,  2,-25,-37,-15,  5;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='T';  M= -3, -9,-18, -8, -5,-16,-14,-13,-12, -4,-17,-11, -5,  9, -5,  0,  8, 11, -7,-27,-15, -7; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='S';  M= -4, 10,-17,  9, -1,-19, -1, -7,-21, -3,-21,-16, 11,-12, -3,  0, 12, 10,-15,-29,-15, -2; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='E';  M= -9, -8,-26, -8,  8,-17,-23,  1, -4, -4, -3, -1, -6,-14,  6, -6, -7, -8, -9,-26, -6,  5;
/M: SY='L';  M= -9,-17,-19,-20,-17, -1,-24,-15, 10,-15, 20,  8,-13,-27,-15, -5,-17, -6,  9,-25, -6,-17;
/M: SY='N';  M=-10, 29,-23, 14,  3,-23, -6,  4,-23, 14,-30,-17, 43,-17,  3,  8,  4, -3,-27,-34,-17,  3;
/M: SY='K';  M=  1, -6,-22,-10, -5,-14,-17, -5,-12,  8,-14, -6, -3,-18,  2,  7, -4, -6, -7,-16,  1, -3;
/M: SY='Y';  M=-18,-18,-28,-21,-18, 22,-29, 27, -1,-17, -1,  3,-11,-26,-12,-12,-17,-13, -8,  0, 39,-18;
/M: SY='L';  M=-10,-20,-23,-19, -4, -3,-27,-13,  7,-19, 30, 12,-22,-23, -3,-13,-22,-10, -1,-21, -4, -3;
/M: SY='Q';  M= -5, -1,-25,  1, 13,-29, -5, -5,-27, 12,-25,-13,  2,-11, 16, 11,  6, -4,-22,-26,-16, 14;
/M: SY='N';  M=-11, 13,-27, 11, 14,-25,-17, -4,-18, 14,-21,-13, 15,-12,  5,  4, -3, -7,-19,-29,-14,  8;
/M: SY='M';  M=-11,-20,-24,-22,-14,  1,-27, -7, 10, -8, 10, 15,-19,-23, -4, -8,-18, -9,  5,-11, 13,-11;
/M: SY='M';  M= -6,-19,-22,-24,-18,-10,-11,-11, 11,-13,  5, 25,-17,-21, -4,-13,-12, -9,  9,-22, -8,-11;
/M: SY='P';  M= -6, -8,-26, -7,  1,-12, -9,-14,-22,  1,-22,-14, -5,  8, -6, -5,  1, -1,-18,-23,-13, -3;
/M: SY='G';  M= -3, -8,-31, -5, -6,-30, 47,-17,-36,-14,-28,-20, -2, -5,-13,-17, -1,-17,-30,-23,-28,-10;
/M: SY='L';  M=-13,-30,-21,-34,-24, 27,-31,-21, 19,-30, 36, 15,-26,-29,-25,-21,-26,-10, 10,-12,  8,-24;
/M: SY='T';  M= -1, -1,-13, -8, -7,-13,-16,-15,-15, -5,-15,-12,  2,-11, -5,  0, 20, 36, -5,-31,-12, -7;
/M: SY='A';  M= 33,-16,-16,-26,-16,-14,-11,-23,  7,-16, -2, -2,-13,-13,-13,-23,  2, -3,  8,-20,-14,-16;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='V';  M= -8,  1,-18,  9,-11,-15,-22,-18,  3,-12, -5, -5,-11,-22,-18,-16, -6, -4, 19,-34,-14,-15;
/M: SY='F';  M=-19,-30,-20,-39,-29, 71,-30,-20,  3,-30, 15,  3,-21,-30,-37,-20,-21,-10,  1,  6, 26,-29;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='Y';  M=-20,-24,-31,-25,-23, 35,-29,  9, -2,-14, -1, -2,-22,-30,-16,-13,-22,-12,-11, 40, 67,-22;
/M: SY='N';  M= -6, 13,-25,  2,-11,-22, 22, -6,-20,-11,-24,-15, 28,-20,-10,-11,  3, -9,-23,-30,-22,-11;
/M: SY='A';  M= 38,-13,-12,-20,-14,-18,  3,-21, -8,-12, -9, -8,-12,-14,-14,-20,  6, -2,  3,-21,-20,-14;
/M: SY='S';  M=  2, 11,-13,  3, -2,-18, -4, -7,-18, -7,-26,-18, 22,-13, -2, -7, 27, 21,-13,-38,-18, -2;
/M: SY='I';  M=-10,-22,-25,-25,-17,  0,-31,-17, 16, -9, 13, 10,-19,-23,-13,-11,-19, -9, 11,-15,  7,-17;
/M: SY='T';  M= -5,-10,-16,-17,-15, -1,-25,-15,  1,-14,  1, -2, -8,-16,-12,-13,  4, 28,  3,-19,  6,-15;
/M: SY='F';  M= -6,-27,-18,-33,-24, 32,-26,-19, 10,-25, 21, 12,-23,-27,-26,-19,-19, -8, 10,-10,  8,-23;
/M: SY='Q';  M= -5, -4,-27, -5,  3,-24,-21, -6, -6,  0, -6,  0, -6,-14, 18, -3, -7, -9,-11,-22, -9, 10;
/M: SY='E';  M=-12,  9,-30, 16, 18,-27,-10,  2,-27,  6,-22,-14,  2,-12, 17,  0, -4,-11,-26,-20, -5, 17;
/M: SY='Q';  M= -3, -6,-22,-11, -1, -3,-18, -2, -7, -7, -3,  2, -3,-18,  5, -7, -7, -7,-12,-15,  2,  2;
/M: SY='L';  M=-11,-30,-20,-31,-21, 19,-30,-20, 17,-30, 45, 17,-29,-30,-23,-20,-29,-10,  9,-16,  4,-21;
/M: SY='A';  M=  2, -1,-25,  2,  2,-18,-13,-13,-18, -4,-11,-13, -7,-15, -5,-10, -4, -7,-14, -5,-10, -1;
/M: SY='Q';  M=  1, -3,-21, -5,  8,-24,-16, -6,-15,  2,-13, -6, -3,-11, 17, -1,  6,  3,-15,-25,-13, 13;
/M: SY='E';  M= -9, -4,-25, -8,  6,-14,-23, -8,  1, -8, -1,  3, -1,-14,  4, -9, -6, -2, -6,-26,-10,  4;
/M: SY='T';  M= -5, -4,-23, -2, -1,-20,-11,-17,-15, -9,-17,-14, -6,  9,-10,-13,  4, 11, -9,-30,-18, -7;
/M: SY='R';  M= -5,  2,-23, -2,  6,-21,-16, -7,-23, 18,-20,-12,  5,-13,  4, 22,  1,  4,-16,-25,-13,  4;
/M: SY='E';  M= -9,  1,-30,  6, 15,-26,-16,-10,-28, 15,-27,-18, -3,  0,  5,  4, -3, -8,-24,-10,-12, 10;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='R';  M= -9, -5,-26, -3, -1,-18, -2,-11,-14,  0,-10, -7, -4,-15, -4,  3, -8,-11,-12,-21,-13, -4; D=-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='S';  M= -2,  6,-18,  6,  8,-23,-12, -9,-21,  1,-23,-15,  5, -9,  6, -3, 18, 16,-14,-32,-15,  7;
/M: SY='P';  M=  0, -8,-19, -7, -6,-19,-12,-15,-10,-11,-22,-14, -2, 13, -9,-14, 13,  6, -5,-35,-21, -9;
/M: SY='Q';  M= -4,-11,-25,-14,  0,-16,-23,-13, -3,  1, -3,  0, -9,-15,  3,  1, -7, -3, -5,-22, -9,  0;
/M: SY='P';  M=-12,  5,-32, 10, 17,-29,-16, -4,-25,  3,-26,-18,  4, 23,  8,  1, -3, -8,-29,-30,-21, 10;
/M: SY='K';  M= -3,  3,-24,  1, 10,-26,-13, -4,-25, 20,-25,-12,  7,-12, 12, 18,  3, -4,-20,-26,-14, 10;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='I';  M= -5,-21,-27,-25,-15, -2,-27,-22, 11,-10,  3,  4,-16, -5,-14,-14,-15, -9,  4,-18, -5,-17;
/M: SY='K';  M=-10,-16,-27,-19,-10,-13,-28,-18,  6,  8, -1,  4,-12,-18, -6,  6,-15, -9,  6,-21, -6,-10;
/M: SY='K';  M=-10,-14,-25,-14, -6, -8,-25,-12, -6, 12,  1,  2,-14,-20, -5,  6,-17, -9, -3,-15,  3, -6;
/M: SY='Y';  M= -5,-11,-20,-16,-16, 11,-19, -3,  0,-14,  0, -2, -6,-24,-14,-13, -7, -4, -2, -7, 20,-16;
/M: SY='Y';  M= -6,-14,-26,-20,-15,  1,-25, -5, 11,-15,  5,  4,-10,-22, -6,-15,-12, -8,  0, -7, 18,-13;
/M: SY='A';  M= 14,  5,-17, -5, -5,-20, -7,-10,-13,  5,-18,-11, 11,-15, -5, -3,  4, -2, -8,-27,-17, -5;
/M: SY='R';  M= -1,  1,-22, -1,  1,-16,-14, -7,-13, -3, -3, -7,  2,-17, -3,  3, -6, -6,-12,-26,-13, -2;
/M: SY='A';  M= 19,  0, 14,-12,-12,-19, -9,-16,-16,-12,-16,-14,  4,-18,-12,-17,  7,  5, -8,-31,-21,-12;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='N';  M= -8,  5,-16, -6,-12,  4,-13, -6,  1,-11, -7, -4, 16,-18,-12, -9, -3, -3, -3,-21, -5,-12; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='R';  M=-14, -7,-29, -7,  3,-22,-21, -7,-24, 33,-17, -7, -3,-16,  7, 40,-12,-10,-17,-20, -9,  3;
/M: SY='E';  M= -1, -2,-22, -3, 13,-16,-16, -6,-19,  3,-17,-10, -2,-10, 13, -1,  6,  2,-17,-23,-10, 13;
/M: SY='V';  M=  6,-19,-10,-23,-22, -5,-24,-26, 14,-16,  2,  2,-19,-22,-22,-17,  1, 14, 30,-29,-11,-22;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='I';  M=-13, -9,-30, -9,  2,-14,-29,-15,  9, -8, -1,  1, -8,-14, -4, -6,-12,-10,  2,-25, -8, -4;
/M: SY='L';  M= -3,-15,-21,-15,-11, -8,-24,-16,  9,-17, 16,  7,-17,-22, -6,-15,-14, -8,  6,-23, -7, -9;
/M: SY='C';  M= -9,-25, 52,-30,-26, -6,-30,-26, -4,-29, 10, -1,-25,-35,-26,-25,-17, -9,  5,-36,-16,-26;
/M: SY='N';  M= -8, 21,-25, 11,  5,-25,  9,  0,-27,  4,-29,-19, 32,-16,  0,  0,  4, -7,-29,-32,-21,  3;
/M: SY='H';  M=-18,  9,-28,  5,  0,-20,-15, 80,-28, -8,-22, -5, 21,-20,  8,  0, -5,-15,-30,-32, 11,  0;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='Q';  M= -7, -4,-20, -5,  6,-20,-16, -1, -5,  5, -9,  2, -3, -8, 24,  3, -4, -7,-11,-13, -5, 14; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='R';  M=-10, -8,-20, -9, -2,-12,-16, -6, -9, 15,-10, -3, -3,-12,  3, 26, -8, -7, -7,-13, -5, -2; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='T';  M= 10, -4, -9, -9, -5,-11, -8,-11, -9, -1, -8, -7, -3, -8, -4,  2,  7, 12, -3,-16, -9, -5; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='P';  M= -4,-17,-17,-16,-12, -8,-19,-17, 10,-12, -2,  0,-16, 13,-13,-15, -8, -4, 10,-19,-11,-15; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='P';  M= -4, -2,-18, -2,  0,-16,-10, -8,-14,  2,-18,-11,  1, 19, -2, -3,  2,  2,-14,-20,-14, -2; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='K';  M= -8,  5,-21,  9,  7,-21,-12, -6,-20, 21,-20,-10,  1,  2,  4, 10, -5, -7,-16,-17,-10,  5; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='N';  M= -3,  4,-10, -2, -5, -8,  1, -3, -7, -4, -8, -2,  9, -9, -4, -4,  3,  6, -7,-16, -8, -4; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='H';  M= -9,-12,-15,-12, -9,  6,-13, 10, -4,-11,  4,  1, -9,-14, -7, -7,-12, -9, -7,  7,  9, -8; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='A';  M=  6, -3,-12, -3,  6,-11,  0, -7, -9, -4, -4, -5, -4, -6, -2, -7, -1, -4, -7,-12,-10,  2; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='Q';  M=  0,  4,-13,  2,  9,-16, -7,  0,-11,  6,-11, -5,  4, -5, 13,  3,  1, -4,-12,-13, -8, 11; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='S';  M= -1, -1, -9, -3,  0,-11, -7, -4,-10,  0,-11, -6,  2, -6,  4,  4, 10, 10, -6,-16, -7,  2; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='I';  M= -4, -8,-12,-13,-12, -2,-13, -7, 14, -9,  5, 13, -4,-12, -6, -9, -7, -4,  9,-13, -3,-10; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='E';  M= -4, -3,-13, -2,  9,-10,-10, -2, -5, -2, -2,  2, -4, -6,  8, -2, -1, -3, -7,-14, -6,  8; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='K';  M= -5,  4,-15,  3,  9,-15, -9, -3,-15, 19,-15, -7,  5, -5,  5, 11, -3, -4,-12,-13, -7,  7; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='L';  M= -1, -9,-12,-11, -6, -5,-12, -9,  1, -1,  5,  2, -8,-10, -4,  1, -8, -4,  0,-11, -4, -6; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='B';  M= -4,  9,-11,  8,  7,-13, -8, -2,-11,  0,-11, -8,  7, -5,  5, -2,  4,  6,-11,-17, -8,  6; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='E';  M=  1,  5,-12,  3, 11,-13, -7, -2,-11,  1,-10, -7,  5, -4,  7, -2,  3,  1,-11,-15, -9,  9; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='R';  M= -9,  2,-16,  3,  3,-14,-10, -2,-17, 17,-13, -7,  2, -8,  4, 23, -4, -5,-12,-12, -6,  3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='I';  M= -4,-13,-14,-17,-12, -3,-18,-14, 17, -8,  5,  7,-10,-11, -9,-10, -9, -4, 13,-12, -2,-12; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='Q';  M= -6,  2,-16,  4,  9,-16,-12, -2, -8,  5, -9, -3,  0, -5, 11,  1, -3, -5,-10,-13, -6, 10; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='E';  M= -1, -1,-13,  0, 13, -5,-10, -4,-12,  4, -8, -7, -3, -4,  2, -1, -2, -4,-10,-11, -5,  8; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='L';  M= -5,-11,-12,-11, -5, -2,-14, -7,  3, -6, 14,  6,-11,-12, -1, -4,-12, -5, -1,-11, -2, -3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='K';  M= -6, -5,-15, -6,  2, -9,-12, -4, -4,  8, -5,  3, -4, -7,  3,  7, -6, -5, -4,-12, -4,  2; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='E';  M= -8,  1,-18,  5, 11,-13,-10, -2,-15,  4,-11, -9, -2, -6,  8,  5, -4, -7,-15,  1, -4, 10; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='Q';  M= -5, -7,-13, -7, -1, -7,-13,  0, -1, -2,  0,  3, -7,-11, 11, -2, -5, -4, -4, -7,  4,  5; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='L';  M= -5, -7,-13, -6,  3, -6,-13, -5, -2, -2,  7,  3, -8,-10,  2, -2, -9, -5, -4,-12, -4,  2; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='R';  M= -2, -3,-14, -4, -4,-10,-12, -8, -1,  1, -4, -2, -3, -8, -3,  2, -5, -4, -1,-12, -5, -5; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='E';  M= -7,  1,-14,  3,  9,-10,-11, -2, -8,  1, -2,  0, -3, -7,  3,  3, -5, -5, -8,-14, -6,  6; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='C';  M=  6, -8, 14,-11, -8, -9,-10,-11, -8, -5, -3, -4, -8,-12, -8, -8, -3, -4, -3,-16,-10, -8; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2;
/M: SY='E';  M=  3,  0,-11,  0,  7,-13, -5, -5,-12,  7,-13, -8,  1, -4,  3,  2,  6,  1, -8,-15, -9,  5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='I';  M= -2, -9,-14,-10, -7, -5,-10,-11,  1, -5, -6, -3, -5, -9, -4, -6,  0, -1, -1,  1, -2, -6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='K';  M=  0,  1,-14,  2, 13,-15, -9, -4,-14, 14,-12, -7, -1, -3,  5,  6, -2, -4,-11,-12, -8,  9; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='K';  M=  0,  0,-14,  0,  8,-15, -9, -5,-14, 18,-13, -6, -1, -4,  4,  9, -3, -4,-10,-11, -7,  6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='K';  M=  0, -1,-14, -2,  5,-16, -9, -4,-13, 18,-13, -4, -1, -5,  8, 10, -3, -4,-10,-11, -6,  6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='I';  M= -4,-13,-12,-16,-12, -3,-18,-14, 15, -6,  4,  6,-10,-11, -9, -8, -8, -4, 15,-12, -3,-12; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='A';  M= 11, -4,-10, -6,  3,-10, -6, -6, -5, -4, -2, -3, -5, -6,  2, -6,  0, -3, -4,-12, -8,  2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='R';  M= -5, -2,-14, -2,  3,-14, -9, -2,-14, 14,-13, -5,  1, -7,  9, 18,  0, -3,-11,-12, -6,  5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='L';  M= -6,-10,-14,-11, -5, -2,-15, -5,  4, -4,  6,  5, -9,-11,  0, -4,-10, -5, -1, -7,  5, -4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='E';  M=  1,  0,-12,  1, 13, -9, -8, -1,-10,  0, -9, -8, -2, -5,  3, -4,  3, -2, -9,-10, -2,  7; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='E';  M=  0,  3,-14,  5, 22,-16, -9, -1,-13,  4,-10, -8, -1, -2, 12, -1,  1, -4,-13,-14,-10, 17; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='R';  M= -7, -4,-15, -5,  2,-13,-11,  1,-10, 11, -8,  3, -2, -8, 13, 17, -5, -5,-10,-11, -4,  7; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='I';  M= -5,-16,-14,-19,-14,  2,-19,-14, 21,-16, 16, 11,-12,-12,-11,-14,-12, -5, 12,-11,  0,-14; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='E';  M= -5,  0,-15,  1, 13,-14,-11, -1,-11, 11, -9,  0, -2, -4, 11,  5, -3, -5,-11,-12, -6, 12; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='K';  M= -4,  0,-14, -1,  4,-14,-11, -6,-14, 21,-14, -5,  0, -5,  4, 12, -3,  0, -9,-12, -5,  4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='Q';  M=  2, -5,-10, -7, -1,-10, -8, -3, -3, -4, -1,  4, -4, -8,  8, -4,  0, -2, -4,-12, -5,  3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='E';  M= -4,  4,-14,  9, 26,-15, -9, -1,-15,  4,-12,-11,  1, -1,  9, -1,  4, -3,-14,-17,-11, 18; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='I';  M=  0,-12,-11,-15,-10, -3,-14,-11,  9, -8,  6,  4,-10,-12, -8, -4, -7, -4,  9,-11, -4,-10; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='Q';  M= -6,  7,-14,  7,  9,-14, -9,  1,-10,  0, -7, -5,  5, -7, 11, -1, -1, -4,-13,-15, -7, 10; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='L';  M=  0,-11,-11,-13, -7, -1,-12, -8,  4, -6, 12,  9,-11,-12, -6, -6,-10, -4,  2,-11, -2, -6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='T';  M= -5,  2,-11,  2, -1,-10,-11,  2, -8,  0, -8, -5,  0, -8, -3, -2,  1,  5, -3,-16, -4, -2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='B';  M= -5,  9,-12,  9, -1,-11, -1, -4,-11, -5, -6, -8,  6, -9, -4, -6,  0,  0, -9,-17, -9, -3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='K';  M=  0, -2,-14, -3,  3,-14, -9, -5,-14, 19,-13, -5, -1, -6,  3, 14, -3, -4, -9,-11, -6,  3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='E';  M= -5,  7,-13, 10, 14,-13, -9, -2,-10,  1, -9, -9,  4, -6,  2, -3,  0, -3, -8,-18,-10,  8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='D';  M= -9, 17,-19, 23, 21,-21, -9,  0,-21,  7,-17,-15, 10, -5,  6,  1,  0, -6,-19,-22,-12, 13; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='N';  M= -5,  4,-11, -3, -7, -5,-10, -5, -1, -8, -1, -3, 11,-15, -7, -6, -1,  3, -3,-21, -8, -7; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='K';  M= -4, -1,-16, -1,  4,-17,-10, -6,-18, 21,-19, -8,  2, -8,  5, 17,  2, -1,-12,-17, -8,  4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='D';  M=  1,  8,-14,  9,  4,-19, -9, -4,-14, -1,-12, -9,  2, -7,  7, -5,  5,  5,-11,-19,-10,  6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='V';  M= -3,-19,-10,-20,-19,  3,-21,-15, 19,-13,  7,  7,-18,-19,-17,-13, -8, -2, 26,-13,  3,-19; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='T';  M= 18,  0,-11, -8, -7,-17, -7,-15,-13, -9,-16,-13,  5,-11, -7,-12, 20, 21, -5,-30,-17, -7;
/M: SY='L';  M= -9,-25,-25,-23,-16, -3,-15,-20,  4,-25, 23,  7,-24, -4,-18,-20,-22,-11, -3,-22,-10,-18;
/M: SY='G';  M= 18, -8,-20,-11,-13,-25, 34,-18,-26,-15,-24,-17, -1,-15,-13,-18, 11, -6,-16,-24,-25,-13;
/M: SY='T';  M= -1,-10,-12,-18,-17, -7,-24,-23,  6,-14, -2, -2, -9,-16,-16,-14,  9, 32, 14,-29, -9,-17;
/M: SY='S';  M=  9,  0,-10, -1, -1,-19, -2,-11,-19,-10,-28,-19,  9,-10, -1,-10, 38, 23, -9,-39,-19, -1;
/M: SY='K';  M=-11, -4,-29, -4,  6,-25,-21,-10,-25, 40,-21, -7, -3,-13,  7, 29,-12,-10,-17,-20, -9,  6;
/M: SY='I';  M=-11,-20,-28,-24,-16, -9,-22,-18, 10, -6,  6,  6,-13,-20,-10,  1,-17,-11,  4,-20, -6,-16;
/M: SY='N';  M=  3, 22,-16,  9, -1,-20,  0,  1,-19, -4,-28,-19, 37,-16, -1, -5, 19,  6,-21,-38,-20, -1;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='I';  M= -9,-29,-24,-35,-26,  3,-34,-24, 36,-26, 26, 23,-24,-24,-19,-24,-21, -9, 25,-21, -1,-25;
/M: SY='D';  M=-10, 28,-13, 38,  7,-31,-12, -5,-28, -5,-20,-15,  8,-14, -4,-13, -2, -9,-20,-36,-18,  2;
/M: SY='P';  M= -9,-10,-34, -6, -1,-26,-17,-16,-19, -9,-28,-19, -7, 64, -9,-16, -4, -2,-27,-31,-26, -9;
/M: SY='R';  M=-16,-12,-26,-13, -6,-11,-22, -2,-18, 16,-14, -7, -5,-21,  2, 42, -8, -2,-10,-16,  2, -6;
/M: SY='I';  M= -8,-26,-25,-34,-26,  0,-36,-28, 38,-26, 18, 15,-19,-21,-20,-26,-15, -1, 26,-22, -2,-26;
/M: SY='T';  M= -7,-16,-18,-22,-17,  7,-25,-17,  6,-19, 10,  2,-13,-20,-16,-16, -3, 13,  5,-18,  5,-17;
/M: SY='V';  M= -7, -9, -2, -6,  1,-16,-25,-17, -6, -6, -5, -6,-14,-20,-10,-11, -8, -7,  5,-32,-15, -5;
/M: SY='A';  M= 19,-14,-14,-20,-12,-12,-11,-15, -2,-10, -1,  2,-12,-16, -9, -9,  2, -1,  4,-24,-13,-11;
/M: SY='W';  M=-18,-34,-38,-34,-28, 20,-24,-18, -8,-19,-10,-10,-33,-30,-21,-18,-30,-20,-14, 91, 37,-22;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='C';  M=  0,-15, 29,-19,-15,-16,-12,-17,-15,-18, -5, -7,-14,-24, -9,-17, -7, -8, -8,-28,-17,-12; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='K';  M=-12,  9,-29,  8,  9,-29,-16, -6,-30, 37,-29,-13, 10,-12,  8, 26, -6, -9,-22,-24,-12,  8;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='K';  M= -4,  0,-26,  3,  7,-20,-15, -6,-21, 13,-20,-13, -4,  2,  2,  6, -5, -8,-18,-18, -6,  3; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='Q';  M=-12, -1,-26, -3,  6,-15,-17,  7,-20,  7,-17, -9,  1,-14, 10,  8, -5, -5,-21, -4,  3,  7; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='D';  M=-11, 11,-25, 13,  5,-15,  1, -5,-25, -2,-20,-15,  9,-14, -1, -5, -2,-10,-23,-22,-12,  3; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='F';  M= -8,-23,-15,-24,-18, 20,-26,-17, 12,-17,  5,  3,-21,-25,-23,-15,-12, -4, 20,-12,  8,-20; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='P';  M= -5,-16,-32,-11,  4,-21,-22,-18, -7,-11,-11, -9,-16, 36, -7,-18,-10, -9,-15,-27,-20, -4;
/M: SY='I';  M=-12,-14,-32,-14, -5, -9,-28,-20,  8,-15, -3, -3,-16,-17,-10,-18,-16,-13,  0,  6, -2, -8;
/M: SY='E';  M=-13, 10,-25, 13, 14,-21,-18,  9,-19, -1,-13,-11,  7,-15,  2,  1, -5, -9,-16,-31,-11,  7;
/M: SY='K';  M=-10,  2,-28,  5, 11,-28,-20,-10,-24, 34,-25,-10, -2,-11,  6, 18, -8, -9,-14,-24,-12,  8;
/M: SY='I';  M= -8,-14,-26,-22,-19, -9,-19,-19, 18,-18,  0,  4, -3,-19,-12,-14, -7, -6,  8,-25, -8,-19;
/M: SY='F';  M=-17,-14,-24,-16,-15, 30,-26, -9, -5,-13,  6, -1,-14,-25,-20,-11,-18,-10, -6, -2, 23,-17;
/M: SY='T';  M= -1, 10,-13,  5, -3,-17,-13,-13,-17, -8,-19,-16, 10,-11, -6, -9, 21, 31, -9,-34,-14, -4;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='K';  M=  8, -2,-13, -5,  1,-15, -7, -8,-13, 15,-13, -6, -2, -6,  1,  6, -1, -3, -7,-12, -8,  1; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='T';  M= -2,  1,-18,  0, -2,-19,-14,-14,-18, -5,-21,-16,  2,  2, -5, -4, 17, 23,-11,-33,-16, -5;
/M: SY='L';  M= -9,-25,-23,-29,-19,  8,-29,-19, 19,-25, 24, 12,-20,-24,-14,-19,-17, -7,  9,-18,  1,-17;
/M: SY='R';  M=-14,  4,-28, 10,  7,-24,-11, -4,-23,  3,-10,-10, -1,-16,  7, 11, -8,-11,-20,-26,-13,  6;
/M: SY='E';  M=-12,  2,-29,  6, 22,-16,-12, -5,-27,  9,-19,-14, -1,-11,  8,  7, -5,-11,-24,-21,-11, 15;
/M: SY='K';  M= -5, -9,-26,-11, -3,-12,-13,-14,-19, 19,-13, -6, -7,-16, -4,  9,-11,-10,-13,-17, -7, -3;
/M: SY='F';  M=-16,-27,-21,-33,-23, 47,-29,-19,  4,-23, 20,  6,-22,-28,-29,-16,-22,-10,  2, -3, 16,-23;
/M: SY='K';  M=  7, -8,-25, -9,  0,-25,-13,-13,-21, 12,-23,-13, -6, 11, -1,  7,  1, -4,-16,-24,-18, -2;
/M: SY='W';  M=-11,-32,-40,-36,-26,  2,-23,-26, -3,-17, -9, -8,-29,-25,-16,-14,-28,-21,-12, 78, 15,-20;
/M: SY='A';  M= 18,-18,-15,-22,-15,-11,-14,-19,  3,-15,  1,  3,-17, -9,-14,-18, -1, -1,  9,-25,-14,-15;
/M: SY='M';  M=-10,-11,-25,-12, -5,-12,-25,-13,  6,  0,  3, 13,-12,-17, -5, -6,-14, -9,  4,-24, -7, -6;
/M: SY='D';  M= -9, 19,-24, 24, 16,-28,-13, -4,-25,  8,-25,-19, 13,-11,  3,  0,  4, -4,-19,-34,-17,  9;
/M: SY='A';  M=  7,-10,-19,-13,-10,-12, -7,  2,-11, -6,-13, -3, -6,-17, -6, -9,  2, -3, -5,-19,  0, -9;
/M: SY='E';  M= -1, -8,-19, -6,  9,-16,-19,-13, -8, -1,-11, -8, -9,-14, -3,  0,  2,  2,  2,-29,-15,  2;
/M: SY='D';  M=-12, 13,-28, 16,  6,-27,-16, -7,-24, 16,-25,-15,  9, -5,  0, 10, -5, -8,-18,-30,-16,  2;
/M: SY='E';  M=-10,  3,-25,  6, 14, -8,-19, -6,-22,  5,-18,-14, -1,-12,  0, -1,  0, -1,-17,-20, -2,  7;
/M: SY='D';  M=-11,  5,-23,  7,  0,-14,-18,  3, -9,-10, -9, -8,  2,-18, -5,-11, -3, -5, -7,-27, -3, -4;
/M: SY='F';  M=-14,-20,-24,-22,-12, 15,-25,-13, -5,-10,  1, -3,-16,-23,-14,  0,-14, -4, -4,  3, 10,-13;
/M: SY='E';  M=-12, -1,-28,  3,  9,-14, -6, -7,-22, -4,-11,-11, -3,-15,  2,  0, -7,-12,-20,-22,-11,  6;
/M: SY='E';  M=-10, -6,-26, -6, 10, -5, -7, -7,-22, -3,-16,-12, -3,-14,  2,  1, -1, -8,-20,-18, -8,  7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_02 which contains 571'282 sequence entries.


Total number of hits 28 in 28 different sequences
Number of true positive hits 28 in 28 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Topo IB-type catalytic
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
28 sequences

TOP1A_ARATH (P30181), TOP1B_ARATH (Q9FJ79), TOP1E_MIMIV (Q7T6X9), 
TOP1M_HUMAN (Q969P6), TOP1M_MOUSE (Q8R4U6), TOP1M_PANTR (A9Q1D5), 
TOP1M_RAT   (Q6IM78), TOP1_CAEEL  (O17966), TOP1_CANAR  (A0A0L0P4F8), 
TOP1_CANAX  (Q00313), TOP1_CHLAE  (Q7YR26), TOP1_CRIGR  (Q07050), 
TOP1_DAUCA  (P93119), TOP1_DICDI  (Q54RC3), TOP1_DROME  (P30189), 
TOP1_HUMAN  (P11387), TOP1_MONPV  (A0A7H0DN83), TOP1_MOUSE  (Q04750), 
TOP1_RAT(Q9WUL0), TOP1_RFVKA  (P16472), TOP1_SCHPO  (P07799), 
TOP1_USTMA  (P41511), TOP1_VACCA  (Q76ZS7), TOP1_VACCC  (P68697), 
TOP1_VACCW  (P68698), TOP1_VAR67  (P32989), TOP1_XENLA  (P41512), 
TOP1_YEAST  (P04786)
» more

PDB
[Detailed view]
19 PDB

1A31; 1A35; 1A36; 1A41; 1EJ9; 1K4S; 1K4T; 1LPQ; 1NH3; 1R49; 1RR8; 1RRJ; 1SC7; 1SEU; 1T8I; 1TL8; 2H7F; 2H7G; 3IGC
» more