 |
|
| Entry: PS51341 |
General information about the entry
| Entry name [info] | ZF_LTAG_D1 |
| Accession [info] | PS51341 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-NOV-2007 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 10-FEB-2021 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51341 |
| Associated ProRule [info] | PRU00671; PRU50000 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Zinc finger large T-antigen (T-ag) D1-type profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=93; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=88; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8921190; R2=0.0070282; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=12150.4101562; R2=8.6914349; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1083; H_SCORE=21563; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=798; H_SCORE=19086; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= 12, -1,-11, 2, 27,-28,-14,-10,-17, 12,-11, 0, -4, 3, 19, -6, 4, -1,-14,-26,-22, 24; /M: SY='K'; M= 1, 5,-30, 8, 13,-20, 1,-19,-21, 23,-19, 5, 0, 4, 6, 6, -1,-10,-23,-17,-13, 9; /M: SY='Q'; M= 9, -2,-21, -4, 8,-23, -9, -4,-15, 1,-20,-14, 1, 9, 29, 5, 6, 7,-21,-28,-20, 12; /M: SY='F'; M= -1,-22,-21,-28,-31, 38,-29,-28, 26,-17, 16, -3,-17,-39,-29,-11,-11, 0, 34,-17, 18,-31; /M: SY='N'; M= 3, 27,-15, 10, -7,-15, -4, -6, -4, 3,-13, 4, 51,-27,-10,-15, 2, 8,-16,-56,-30, -9; /M: SY='W'; M=-39,-39,-30,-29,-10, 4, -5, -9,-26,-15,-11,-16,-50,-20, -3, 8,-23,-37,-22,116, 42, -9; /M: SY='A'; M= 14, -5,-27, -7, 4,-12,-11,-18, 0, 11,-10, 10, -3, -6, 8, 1, 0, 0, 1,-30,-17, 3; /M: SY='M'; M= 8, -9,-11,-10, 1, -7,-15, -3, 6, 0, 17, 24, -9,-23, -6,-11,-11, 0, 2,-28, -2, 0; /M: SY='I'; M= -2,-16,-12,-23,-22, 10,-19,-18, 39,-20, 26, 12,-13,-32,-22,-21,-14, 2, 30,-26, 11,-22; /M: SY='S'; M= -1, -2, -1, -5, -6, -9,-12,-16, -8, -7, -6,-10, 5,-16, -8,-14, 12, 12, -5,-26,-12, -9; /M: SY='D'; M= 1, 23,-12, 39, 26,-39,-14, -9,-29, 7,-13,-17, 9, -4, 12, -6, -1,-10,-25,-29,-17, 21; /M: SY='F'; M=-31,-30,-46,-29,-29, 63,-30,-14, -5,-10, 25,-15,-26,-29,-19, -5,-15,-15, 10, 31, 62,-29; /M: SY='A'; M= 40, 0,-30, 0, 0,-20, 0,-20, 0, 0,-10, 10, 0,-10, 10,-10, 10, 10, 10,-50,-40, 0; /M: SY='C'; M=-11, -8, 41,-14, -8, 1,-24,-24, 10,-20, 17, 4, -4,-32,-20,-18,-16, -3, 4,-28, -6,-10; /M: SY='E'; M= 3, 5,-13, 13, 30,-28,-14, -9,-25, 17,-15, -6, -4, 3, 17, 1, 4, -8,-24,-19,-15, 25; /M: SY='I'; M= 7, -6,-18,-18,-14, -8,-12,-15, 23,-11, 7, 6, 5,-19, 1,-17, -4, 8, 13,-35,-12,-10; /M: SY='N'; M= 0, 27,-22, 17, -1,-19, 5,-16,-12, 9,-18, -2, 40,-14, -9,-11, 0, -2,-21,-43,-27, -5; /M: SY='C'; M=-16,-19, 80,-32, -7,-14,-26,-34, 15,-25, 12, -4, -7,-30,-20,-24,-16,-10, 6,-24,-32,-13; /M: SY='D'; M= 6, 16,-20, 28, 5,-30,-11,-15,-19, 0,-10,-16, 5, -5, -3,-16, 16, 14,-10,-36,-14, 1; /M: SY='D'; M= 0, 50,-30, 90, 10,-50,-10,-20,-40, 0,-10,-30, 10,-10,-10,-10, 0,-10,-20,-40,-10, 0; /M: SY='V'; M= 13,-14,-25,-14,-12,-11,-15,-17, 15, -7, -4, -5,-14, 4,-10,-12, -4, 7, 17,-36,-14,-14; /M: SY='Y'; M=-18,-17,-17,-15,-16, 32,-24,-10, 11,-16, 35, 8,-23,-29,-19,-14,-19, -5, 10, 0, 44,-16; /M: SY='L'; M=-11,-13, -4,-16,-14, 31,-21,-13, 17,-19, 37, 14,-19,-31,-21,-19,-19, -3, 10,-16, 30,-14; /M: SY='L'; M= -9,-11, -2,-13,-12, 18,-19,-11, 24,-20, 38, 19,-18,-30,-20,-21,-19, 0, 13,-21, 26,-12; /M: SY='M'; M= -1,-15, -9,-19,-10, 2,-20, 4, 15, -2, 31, 38,-11,-35,-15,-11,-20, 0, 5,-25, 12,-10; /M: SY='G'; M= 17, 0,-36, -6,-12,-26, 46,-26, -6, -6,-16, -7, 0,-10, -7,-16, 4, -7,-13,-15,-34,-12; /M: SY='I'; M= -5,-17,-17,-22,-19, 9,-20,-11, 30,-14, 27, 16,-14,-32,-19,-17,-16, 0, 23,-19, 17,-19; /M: SY='Y'; M=-40,-30,-60,-10,-20, 30,-30, 0,-10,-10, 30,-10,-40,-20,-10, 0,-20,-10, 10, 50, 90,-20; /M: SY='M'; M= -5, -7,-15,-10, -1, 5,-15,-15, 9, 4, 13, 19, -9,-14,-12, -9,-11, -4, 2,-21, 9, -5; /M: SY='D'; M= -2, 11,-16, 30, 17,-34,-16,-10,-32, 8,-14,-14, -6, -4, 19, 21, -4,-17,-21,-18, -9, 17; /M: SY='F'; M=-13,-23,-20,-36,-28, 62,-26,-18, 7, -9, 25, 2,-11,-37,-24,-11,-14,-12, 9, -4, 24,-28; /M: SY='A'; M= 21, -2,-24, -4, 2,-20, -7,-13, -7, -1,-14, -4, -1, -6, 20, -3, 14, 15, -4,-36,-24, 5; /M: SY='I'; M= 7, -9,-17,-12, -2,-12,-18,-16, 8, -3, -3, -2, -7,-13, 3, -7, 1, 8, 8,-26, -7, -1; /M: SY='P'; M= 3, 5,-16, 2, 16,-26, -8, -5,-17, 12,-19, -9, 11, 23, 3,-10, -1, -2,-24,-37,-27, 10; /M: SY='P'; M= 0,-17,-25,-13, -8,-21,-18, -8, -3, -3,-12,-21,-21, 45,-10,-13, -5, 11, -3,-33, -9,-11; /M: SY='D'; M= -3, 9,-18, 24, 16,-34, -2, -9,-24, 3, -9,-20, -8, 17, -3,-13, -5,-10,-24,-22,-12, 9; /M: SY='E'; M= 7, 3,-15, 2, 23,-22,-10,-10,-17, 16,-16, 1, 5, 0, 14, 0, 4, -4,-19,-26,-21, 19; /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30, 0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60, 0; /M: SY='P'; M= 0, -5,-25, -6, 11,-20, 2,-13,-13, 16,-16, -3, -6, 17, -3, -5, 2, -7,-19,-19,-16, 3; /M: SY='K'; M= 1, 4,-23, 12, 18,-18,-14,-18,-17, 24,-13, 6, -3, 1, -2, 2, -1, -9,-13,-23, -9, 10; /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30, 0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60, 0; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='E'; M= 3, 8,-11, 13, 20,-23,-15,-12,-14, 10,-10, -7, 4, -7, -1, -8, 2, -5,-12,-27,-15, 13; /M: SY='K'; M= 1, 9,-18, 4, 16,-14, -8,-14,-15, 23,-19, 6, 18, -2, -1, -2, 5, -3,-20,-32,-20, 8; /M: SY='R'; M= -4, 4,-21, 11, 10,-22,-12,-10,-25, 16,-19, -5, 1, 10, 7, 17, -4,-13,-21,-24,-13, 6; /M: SY='R'; M= 0, -3,-16, 6, 16,-25,-17, -6,-24, 15,-12, 2, -8, -5, 20, 24, -6,-15,-19,-15, -9, 16; /M: SY='Q'; M= -4, -5,-19, 3, 6,-22,-20, 10,-20, 0, -8, -1,-10, -5, 18, 17, -6,-10,-15,-21, -3, 10; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='T'; M= 6, 1,-20, -3, 1,-14, -9,-10, -7, 3,-10, -3, 5, 4, 3, -8, 5, 10,-11,-36,-15, 0; /M: SY='N'; M= 2, 3,-15, -9, -8, -1,-13,-15, 1, -3, -4, -6, 19,-15, -7,-20, 9, 14, -2,-37,-14, -8; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='H'; M=-20,-20,-50,-20, 0,-30,-30,140,-20,-20,-10, 20,-10, 10, 0,-10,-10,-20,-30,-50, 0, 0; /M: SY='F'; M=-17,-18,-24,-24,-21, 28,-17,-19, 4,-10, 10, -5,-10,-28,-12, -2,-13,-14, 5, 13, 21,-20; /M: SY='N'; M= -2, 13,-17, 15, 9,-20,-11,-12,-22, 13,-17, -2, 16, -8, 6, 14, -2,-11,-19,-29,-17, 6; /M: SY='H'; M=-14, 5,-33, 14, -6, -6,-20, 24,-16,-10, 3, -5, 0,-14,-11,-11, -9,-10,-12,-26, 12, -9; /M: SY='H'; M=-20,-20,-50,-20, 0,-30,-30,140,-20,-20,-10, 20,-10, 10, 0,-10,-10,-20,-30,-50, 0, 0; /M: SY='K'; M= 6, -7,-22, -6, 9,-22,-13, -7,-15, 16,-12, 6, -7, 13, 6, 2, -1, 0,-13,-28,-16, 6; /M: SY='K'; M= 5, -3,-18, -1, 16,-19,-14,-14,-18, 19,-14, 6, -4, 3, 10, 8, 3, -4,-13,-23,-15, 13; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='H'; M=-20,-20,-50,-20, 0,-30,-30,140,-20,-20,-10, 20,-10, 10, 0,-10,-10,-20,-30,-50, 0, 0; /M: SY='H'; M= -5,-14,-37,-13, 0,-20,-23, 48,-14,-10, -6, 5,-10, 0, 21, 0, -5, -1,-16,-27, 3, 7; /M: SY='H'; M= -3,-11,-23, -8, 10,-13,-19, 18, -9, 5, 4, 14,-11, -8, 0, -6, -8, -8, -9,-19, 3, 6; /M: SY='N'; M= 0, 40,-10, 10,-10,-10, 0,-10, 0, 0,-20, 0, 80,-30,-10,-20, 0, 10,-20,-70,-40,-10; /M: SY='A'; M= 40, 0,-30, 0, 0,-20, 0,-20, 0, 0,-10, 10, 0,-10, 10,-10, 10, 10, 10,-50,-40, 0; /M: SY='C'; M= -5, -3, 9, 0, 4, -8,-17,-16, -6, -5, 5, 0, -9,-16, -2, -7, -5, -2, -9,-22, -4, 1; /M: SY='L'; M= -6,-13, -5,-17,-12, 12,-19, -7, 24,-14, 35, 24,-15,-31,-19,-18,-19, 0, 12,-23, 19,-12; /M: SY='F'; M=-20,-30,-30,-50,-40,100,-30,-30, 0,-10, 20,-20,-10,-40,-30,-10,-10,-20, 10, 10, 30,-40; /M: SY='L'; M= 7, -6,-12, -6, -3, 1,-13,-11, 7,-10, 14, 9,-12,-19, 1,-10, -5, 5, 2,-27, 3, -1; /M: SY='D'; M= 3, 18,-25, 31, 13,-36,-14, 11,-25, 0,-12,-10, 7, -5, 10, -5, -2, -7,-21,-37,-16, 11; /M: SY='C'; M= -3, -9, 22,-14, -4, -8,-13,-20, 3,-12, -1,-10, -5,-20,-15,-17, 12, 6, -2,-27,-20,-11; /M: SY='R'; M= -4, -8,-26, -4, 9,-10,-14,-16,-24, 29,-20, 12, -8, 2, 11, 36, -4,-18,-16,-12, -6, 6; /M: SY='N'; M= 12, 17,-17, 16, 5,-24, -7,-14,-12, 2,-12, -6, 20,-11, 0,-15, 10, 9,-10,-45,-26, 2; /M: SY='Q'; M= 10,-10,-20,-10, 20,-30,-20, 0,-20, 0,-20,-10,-10, 0, 80, 30,-10, 0,-30,-10,-10, 40; /M: SY='K'; M= 0, 0,-30, 0, 20,-10,-10,-20,-20, 40,-20, 20, 0, 10, 0, 10, 0,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='N'; M= 2, 4,-18, -4,-12,-13,-13,-13,-10, 0,-13, -2, 17,-12, 5, 7, 9, 13, -6,-38,-16, -7; /M: SY='I'; M= 5,-16,-18,-27,-23, 1,-13,-20, 43,-17, 18, 10, -5,-28,-17,-23, -9, 3, 32,-31, -6,-23; /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30, 0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60, 0; /M: SY='Q'; M= 9, -4,-19, -7, 16,-27,-17, -1,-17, 0,-20, -9, 2, -4, 68, 24, -9, 1,-29,-18,-14, 34; /M: SY='Q'; M= 2,-10, 13,-10, 24,-31,-23, -8,-21, -2,-16,-12,-10, -3, 56, 17,-10, -6,-28,-12,-19, 35; /M: SY='A'; M= 40, 0,-30, 0, 0,-20, 0,-20, 0, 0,-10, 10, 0,-10, 10,-10, 10, 10, 10,-50,-40, 0; /M: SY='V'; M= 7,-18, 4,-22,-22, 1,-26,-30, 31,-19, 8, 0,-14,-35,-24,-14, -9, 5, 36,-31, -6,-23; /M: SY='D'; M= 4, 45,-30, 81, 9,-47, -9,-20,-36, 0,-10,-26, 9,-10, -8,-10, 1, -8,-17,-41,-13, 0; /M: SY='A'; M= 18, -4,-25, -7, -8,-18, -3,-19, 0, -6, -8, -2, -1,-10, 7,-11, 9, 17, 3,-34,-20, -4; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='V'; M= 9,-18,-18,-18,-27, 9,-27,-27, 36,-18, 9, 0,-18,-36,-27, -9, -9, 9, 45,-27, 9,-27; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='L'; M= -2,-11, -8,-16,-13, 10,-15,-14, 27,-18, 29, 16,-13,-28,-16,-21,-14, 1, 17,-26, 12,-13; /M: SY='A'; M= 40, 0,-30, 0, 0,-20, 0,-20, 0, 0,-10, 10, 0,-10, 10,-10, 10, 10, 10,-50,-40, 0; /M: SY='E'; M= 7, -1,-16, 2, 27,-22,-12,-11,-19, 21,-16, 3, -4, 4, 15, 2, 4, -6,-19,-21,-18, 22; /M: SY='R'; M= -5,-13,-23, -7, 2,-12,-17,-12,-26, 17,-20, 4,-13, -3, 28, 54, -7,-21,-15, -7, -4, 8; /M: SY='R'; M=-10,-20,-20,-10,-10,-10,-20,-10,-30, 10,-20, 0,-20,-10, 30, 80,-10,-30,-10, 0, 0, 0; /M: SY='F'; M= -6,-19,-16,-25,-26, 40,-26,-23, 21,-17, 24, 1,-17,-36,-26,-14,-14, -2, 24,-15, 23,-26; /M: SY='D'; M= -2, 21,-28, 42, 11,-29,-12,-18,-31, 16,-15, -7, 2, -3, 0, 11, -2,-13,-18,-27, -8, 4; /M: SY='T'; M= 5, -7,-15,-11, -7, -7,-12, -4, 3, -1, 6, 11, -3,-20,-11,-13, 9, 15, 0,-31, -5,-10; /M: SY='I'; M= 10,-10,-19,-12,-11, 1,-15,-20, 19, -7, 10, 12,-10,-22,-12,-12, -6, 4, 19,-31, -3,-12; /M: SY='T'; M= 3, 1,-16, -4, 6,-26,-19, 8,-11, -2, -8, -1, 9, 0, 12,-15, 6, 15,-12,-39,-15, 10; /M: SY='M'; M= -2,-19, 26,-27, -5,-17,-25, 0, 4, 3, 18, 37, -5,-36,-14, -7,-20, -5, -3,-26,-16, -8; /M: SY='T'; M= 10, 0,-20, -8,-15,-18,-15,-18, -2, -8, -5, -5, 8, -2, -2,-25, 25, 43, 5,-45,-12,-10; /M: SY='R'; M=-10,-20,-20,-10,-10,-10,-20,-10,-30, 10,-20, 0,-20,-10, 30, 80,-10,-30,-10, 0, 0, 0; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 20 in 20 different sequences |
| Number of true positive hits | 20 in 20 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | ZN_FING |
| Feature description [info] | T-ag D1-type |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
20 sequences
LT_BFPYV (P13894 ), LT_POVBA (P14999 ), LT_POVBG (P0DOJ4 ), LT_POVBK (P03071 ), LT_POVBO (P24851 ), LT_POVHA (P03075 ), LT_POVJC (P03072 ), LT_POVK3 (P0DOI7 ), LT_POVK6 (P0DOI6 ), LT_POVKI (P0DOI5 ), LT_POVLY (P04008 ), LT_POVM1 (P0DOJ6 ), LT_POVM3 (P0DOJ5 ), LT_POVMA (P03073 ), LT_POVMC (P12905 ), LT_POVMK (P24597 ), LT_POVS1 (Q3L6L5 ), LT_POVSM (A8Y984 ), LT_POVWU (A5HBG1 ), LT_SV40 (P03070 )» more
|
| PDB [Detailed view] |
11 PDB
1N25; 1SVL; 1SVM; 1SVO; 2H1L; 4E2I; 4GDF; 5J40; 5J47; 5J4V; 5J4Y |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission