PROSITE entry PS51341

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	ZF_LTAG_D1
Accession [info]	PS51341
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-NOV-2007 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 13-SEP-2023 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51341
Associated ProRule [info]	PRU00671; PRU50000

Name and characterization of the entry

Description [info]

Zinc finger large T-antigen (T-ag) D1-type profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=93;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=88;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8921190; R2=0.0070282; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=12150.4101562; R2=8.6914349; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1083; H_SCORE=21563; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=798; H_SCORE=19086; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='E';  M= 12, -1,-11,  2, 27,-28,-14,-10,-17, 12,-11,  0, -4,  3, 19, -6,  4, -1,-14,-26,-22, 24;
/M: SY='K';  M=  1,  5,-30,  8, 13,-20,  1,-19,-21, 23,-19,  5,  0,  4,  6,  6, -1,-10,-23,-17,-13,  9;
/M: SY='Q';  M=  9, -2,-21, -4,  8,-23, -9, -4,-15,  1,-20,-14,  1,  9, 29,  5,  6,  7,-21,-28,-20, 12;
/M: SY='F';  M= -1,-22,-21,-28,-31, 38,-29,-28, 26,-17, 16, -3,-17,-39,-29,-11,-11,  0, 34,-17, 18,-31;
/M: SY='N';  M=  3, 27,-15, 10, -7,-15, -4, -6, -4,  3,-13,  4, 51,-27,-10,-15,  2,  8,-16,-56,-30, -9;
/M: SY='W';  M=-39,-39,-30,-29,-10,  4, -5, -9,-26,-15,-11,-16,-50,-20, -3,  8,-23,-37,-22,116, 42, -9;
/M: SY='A';  M= 14, -5,-27, -7,  4,-12,-11,-18,  0, 11,-10, 10, -3, -6,  8,  1,  0,  0,  1,-30,-17,  3;
/M: SY='M';  M=  8, -9,-11,-10,  1, -7,-15, -3,  6,  0, 17, 24, -9,-23, -6,-11,-11,  0,  2,-28, -2,  0;
/M: SY='I';  M= -2,-16,-12,-23,-22, 10,-19,-18, 39,-20, 26, 12,-13,-32,-22,-21,-14,  2, 30,-26, 11,-22;
/M: SY='S';  M= -1, -2, -1, -5, -6, -9,-12,-16, -8, -7, -6,-10,  5,-16, -8,-14, 12, 12, -5,-26,-12, -9;
/M: SY='D';  M=  1, 23,-12, 39, 26,-39,-14, -9,-29,  7,-13,-17,  9, -4, 12, -6, -1,-10,-25,-29,-17, 21;
/M: SY='F';  M=-31,-30,-46,-29,-29, 63,-30,-14, -5,-10, 25,-15,-26,-29,-19, -5,-15,-15, 10, 31, 62,-29;
/M: SY='A';  M= 40,  0,-30,  0,  0,-20,  0,-20,  0,  0,-10, 10,  0,-10, 10,-10, 10, 10, 10,-50,-40,  0;
/M: SY='C';  M=-11, -8, 41,-14, -8,  1,-24,-24, 10,-20, 17,  4, -4,-32,-20,-18,-16, -3,  4,-28, -6,-10;
/M: SY='E';  M=  3,  5,-13, 13, 30,-28,-14, -9,-25, 17,-15, -6, -4,  3, 17,  1,  4, -8,-24,-19,-15, 25;
/M: SY='I';  M=  7, -6,-18,-18,-14, -8,-12,-15, 23,-11,  7,  6,  5,-19,  1,-17, -4,  8, 13,-35,-12,-10;
/M: SY='N';  M=  0, 27,-22, 17, -1,-19,  5,-16,-12,  9,-18, -2, 40,-14, -9,-11,  0, -2,-21,-43,-27, -5;
/M: SY='C';  M=-16,-19, 80,-32, -7,-14,-26,-34, 15,-25, 12, -4, -7,-30,-20,-24,-16,-10,  6,-24,-32,-13;
/M: SY='D';  M=  6, 16,-20, 28,  5,-30,-11,-15,-19,  0,-10,-16,  5, -5, -3,-16, 16, 14,-10,-36,-14,  1;
/M: SY='D';  M=  0, 50,-30, 90, 10,-50,-10,-20,-40,  0,-10,-30, 10,-10,-10,-10,  0,-10,-20,-40,-10,  0;
/M: SY='V';  M= 13,-14,-25,-14,-12,-11,-15,-17, 15, -7, -4, -5,-14,  4,-10,-12, -4,  7, 17,-36,-14,-14;
/M: SY='Y';  M=-18,-17,-17,-15,-16, 32,-24,-10, 11,-16, 35,  8,-23,-29,-19,-14,-19, -5, 10,  0, 44,-16;
/M: SY='L';  M=-11,-13, -4,-16,-14, 31,-21,-13, 17,-19, 37, 14,-19,-31,-21,-19,-19, -3, 10,-16, 30,-14;
/M: SY='L';  M= -9,-11, -2,-13,-12, 18,-19,-11, 24,-20, 38, 19,-18,-30,-20,-21,-19,  0, 13,-21, 26,-12;
/M: SY='M';  M= -1,-15, -9,-19,-10,  2,-20,  4, 15, -2, 31, 38,-11,-35,-15,-11,-20,  0,  5,-25, 12,-10;
/M: SY='G';  M= 17,  0,-36, -6,-12,-26, 46,-26, -6, -6,-16, -7,  0,-10, -7,-16,  4, -7,-13,-15,-34,-12;
/M: SY='I';  M= -5,-17,-17,-22,-19,  9,-20,-11, 30,-14, 27, 16,-14,-32,-19,-17,-16,  0, 23,-19, 17,-19;
/M: SY='Y';  M=-40,-30,-60,-10,-20, 30,-30,  0,-10,-10, 30,-10,-40,-20,-10,  0,-20,-10, 10, 50, 90,-20;
/M: SY='M';  M= -5, -7,-15,-10, -1,  5,-15,-15,  9,  4, 13, 19, -9,-14,-12, -9,-11, -4,  2,-21,  9, -5;
/M: SY='D';  M= -2, 11,-16, 30, 17,-34,-16,-10,-32,  8,-14,-14, -6, -4, 19, 21, -4,-17,-21,-18, -9, 17;
/M: SY='F';  M=-13,-23,-20,-36,-28, 62,-26,-18,  7, -9, 25,  2,-11,-37,-24,-11,-14,-12,  9, -4, 24,-28;
/M: SY='A';  M= 21, -2,-24, -4,  2,-20, -7,-13, -7, -1,-14, -4, -1, -6, 20, -3, 14, 15, -4,-36,-24,  5;
/M: SY='I';  M=  7, -9,-17,-12, -2,-12,-18,-16,  8, -3, -3, -2, -7,-13,  3, -7,  1,  8,  8,-26, -7, -1;
/M: SY='P';  M=  3,  5,-16,  2, 16,-26, -8, -5,-17, 12,-19, -9, 11, 23,  3,-10, -1, -2,-24,-37,-27, 10;
/M: SY='P';  M=  0,-17,-25,-13, -8,-21,-18, -8, -3, -3,-12,-21,-21, 45,-10,-13, -5, 11, -3,-33, -9,-11;
/M: SY='D';  M= -3,  9,-18, 24, 16,-34, -2, -9,-24,  3, -9,-20, -8, 17, -3,-13, -5,-10,-24,-22,-12,  9;
/M: SY='E';  M=  7,  3,-15,  2, 23,-22,-10,-10,-17, 16,-16,  1,  5,  0, 14,  0,  4, -4,-19,-26,-21, 19;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/M: SY='P';  M=  0, -5,-25, -6, 11,-20,  2,-13,-13, 16,-16, -3, -6, 17, -3, -5,  2, -7,-19,-19,-16,  3;
/M: SY='K';  M=  1,  4,-23, 12, 18,-18,-14,-18,-17, 24,-13,  6, -3,  1, -2,  2, -1, -9,-13,-23, -9, 10;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='E';  M=  3,  8,-11, 13, 20,-23,-15,-12,-14, 10,-10, -7,  4, -7, -1, -8,  2, -5,-12,-27,-15, 13;
/M: SY='K';  M=  1,  9,-18,  4, 16,-14, -8,-14,-15, 23,-19,  6, 18, -2, -1, -2,  5, -3,-20,-32,-20,  8;
/M: SY='R';  M= -4,  4,-21, 11, 10,-22,-12,-10,-25, 16,-19, -5,  1, 10,  7, 17, -4,-13,-21,-24,-13,  6;
/M: SY='R';  M=  0, -3,-16,  6, 16,-25,-17, -6,-24, 15,-12,  2, -8, -5, 20, 24, -6,-15,-19,-15, -9, 16;
/M: SY='Q';  M= -4, -5,-19,  3,  6,-22,-20, 10,-20,  0, -8, -1,-10, -5, 18, 17, -6,-10,-15,-21, -3, 10;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='T';  M=  6,  1,-20, -3,  1,-14, -9,-10, -7,  3,-10, -3,  5,  4,  3, -8,  5, 10,-11,-36,-15,  0;
/M: SY='N';  M=  2,  3,-15, -9, -8, -1,-13,-15,  1, -3, -4, -6, 19,-15, -7,-20,  9, 14, -2,-37,-14, -8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='H';  M=-20,-20,-50,-20,  0,-30,-30,140,-20,-20,-10, 20,-10, 10,  0,-10,-10,-20,-30,-50,  0,  0;
/M: SY='F';  M=-17,-18,-24,-24,-21, 28,-17,-19,  4,-10, 10, -5,-10,-28,-12, -2,-13,-14,  5, 13, 21,-20;
/M: SY='N';  M= -2, 13,-17, 15,  9,-20,-11,-12,-22, 13,-17, -2, 16, -8,  6, 14, -2,-11,-19,-29,-17,  6;
/M: SY='H';  M=-14,  5,-33, 14, -6, -6,-20, 24,-16,-10,  3, -5,  0,-14,-11,-11, -9,-10,-12,-26, 12, -9;
/M: SY='H';  M=-20,-20,-50,-20,  0,-30,-30,140,-20,-20,-10, 20,-10, 10,  0,-10,-10,-20,-30,-50,  0,  0;
/M: SY='K';  M=  6, -7,-22, -6,  9,-22,-13, -7,-15, 16,-12,  6, -7, 13,  6,  2, -1,  0,-13,-28,-16,  6;
/M: SY='K';  M=  5, -3,-18, -1, 16,-19,-14,-14,-18, 19,-14,  6, -4,  3, 10,  8,  3, -4,-13,-23,-15, 13;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='H';  M=-20,-20,-50,-20,  0,-30,-30,140,-20,-20,-10, 20,-10, 10,  0,-10,-10,-20,-30,-50,  0,  0;
/M: SY='H';  M= -5,-14,-37,-13,  0,-20,-23, 48,-14,-10, -6,  5,-10,  0, 21,  0, -5, -1,-16,-27,  3,  7;
/M: SY='H';  M= -3,-11,-23, -8, 10,-13,-19, 18, -9,  5,  4, 14,-11, -8,  0, -6, -8, -8, -9,-19,  3,  6;
/M: SY='N';  M=  0, 40,-10, 10,-10,-10,  0,-10,  0,  0,-20,  0, 80,-30,-10,-20,  0, 10,-20,-70,-40,-10;
/M: SY='A';  M= 40,  0,-30,  0,  0,-20,  0,-20,  0,  0,-10, 10,  0,-10, 10,-10, 10, 10, 10,-50,-40,  0;
/M: SY='C';  M= -5, -3,  9,  0,  4, -8,-17,-16, -6, -5,  5,  0, -9,-16, -2, -7, -5, -2, -9,-22, -4,  1;
/M: SY='L';  M= -6,-13, -5,-17,-12, 12,-19, -7, 24,-14, 35, 24,-15,-31,-19,-18,-19,  0, 12,-23, 19,-12;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-30,-50,-40,100,-30,-30,  0,-10, 20,-20,-10,-40,-30,-10,-10,-20, 10, 10, 30,-40;
/M: SY='L';  M=  7, -6,-12, -6, -3,  1,-13,-11,  7,-10, 14,  9,-12,-19,  1,-10, -5,  5,  2,-27,  3, -1;
/M: SY='D';  M=  3, 18,-25, 31, 13,-36,-14, 11,-25,  0,-12,-10,  7, -5, 10, -5, -2, -7,-21,-37,-16, 11;
/M: SY='C';  M= -3, -9, 22,-14, -4, -8,-13,-20,  3,-12, -1,-10, -5,-20,-15,-17, 12,  6, -2,-27,-20,-11;
/M: SY='R';  M= -4, -8,-26, -4,  9,-10,-14,-16,-24, 29,-20, 12, -8,  2, 11, 36, -4,-18,-16,-12, -6,  6;
/M: SY='N';  M= 12, 17,-17, 16,  5,-24, -7,-14,-12,  2,-12, -6, 20,-11,  0,-15, 10,  9,-10,-45,-26,  2;
/M: SY='Q';  M= 10,-10,-20,-10, 20,-30,-20,  0,-20,  0,-20,-10,-10,  0, 80, 30,-10,  0,-30,-10,-10, 40;
/M: SY='K';  M=  0,  0,-30,  0, 20,-10,-10,-20,-20, 40,-20, 20,  0, 10,  0, 10,  0,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='N';  M=  2,  4,-18, -4,-12,-13,-13,-13,-10,  0,-13, -2, 17,-12,  5,  7,  9, 13, -6,-38,-16, -7;
/M: SY='I';  M=  5,-16,-18,-27,-23,  1,-13,-20, 43,-17, 18, 10, -5,-28,-17,-23, -9,  3, 32,-31, -6,-23;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/M: SY='Q';  M=  9, -4,-19, -7, 16,-27,-17, -1,-17,  0,-20, -9,  2, -4, 68, 24, -9,  1,-29,-18,-14, 34;
/M: SY='Q';  M=  2,-10, 13,-10, 24,-31,-23, -8,-21, -2,-16,-12,-10, -3, 56, 17,-10, -6,-28,-12,-19, 35;
/M: SY='A';  M= 40,  0,-30,  0,  0,-20,  0,-20,  0,  0,-10, 10,  0,-10, 10,-10, 10, 10, 10,-50,-40,  0;
/M: SY='V';  M=  7,-18,  4,-22,-22,  1,-26,-30, 31,-19,  8,  0,-14,-35,-24,-14, -9,  5, 36,-31, -6,-23;
/M: SY='D';  M=  4, 45,-30, 81,  9,-47, -9,-20,-36,  0,-10,-26,  9,-10, -8,-10,  1, -8,-17,-41,-13,  0;
/M: SY='A';  M= 18, -4,-25, -7, -8,-18, -3,-19,  0, -6, -8, -2, -1,-10,  7,-11,  9, 17,  3,-34,-20, -4;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='V';  M=  9,-18,-18,-18,-27,  9,-27,-27, 36,-18,  9,  0,-18,-36,-27, -9, -9,  9, 45,-27,  9,-27; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='L';  M= -2,-11, -8,-16,-13, 10,-15,-14, 27,-18, 29, 16,-13,-28,-16,-21,-14,  1, 17,-26, 12,-13;
/M: SY='A';  M= 40,  0,-30,  0,  0,-20,  0,-20,  0,  0,-10, 10,  0,-10, 10,-10, 10, 10, 10,-50,-40,  0;
/M: SY='E';  M=  7, -1,-16,  2, 27,-22,-12,-11,-19, 21,-16,  3, -4,  4, 15,  2,  4, -6,-19,-21,-18, 22;
/M: SY='R';  M= -5,-13,-23, -7,  2,-12,-17,-12,-26, 17,-20,  4,-13, -3, 28, 54, -7,-21,-15, -7, -4,  8;
/M: SY='R';  M=-10,-20,-20,-10,-10,-10,-20,-10,-30, 10,-20,  0,-20,-10, 30, 80,-10,-30,-10,  0,  0,  0;
/M: SY='F';  M= -6,-19,-16,-25,-26, 40,-26,-23, 21,-17, 24,  1,-17,-36,-26,-14,-14, -2, 24,-15, 23,-26;
/M: SY='D';  M= -2, 21,-28, 42, 11,-29,-12,-18,-31, 16,-15, -7,  2, -3,  0, 11, -2,-13,-18,-27, -8,  4;
/M: SY='T';  M=  5, -7,-15,-11, -7, -7,-12, -4,  3, -1,  6, 11, -3,-20,-11,-13,  9, 15,  0,-31, -5,-10;
/M: SY='I';  M= 10,-10,-19,-12,-11,  1,-15,-20, 19, -7, 10, 12,-10,-22,-12,-12, -6,  4, 19,-31, -3,-12;
/M: SY='T';  M=  3,  1,-16, -4,  6,-26,-19,  8,-11, -2, -8, -1,  9,  0, 12,-15,  6, 15,-12,-39,-15, 10;
/M: SY='M';  M= -2,-19, 26,-27, -5,-17,-25,  0,  4,  3, 18, 37, -5,-36,-14, -7,-20, -5, -3,-26,-16, -8;
/M: SY='T';  M= 10,  0,-20, -8,-15,-18,-15,-18, -2, -8, -5, -5,  8, -2, -2,-25, 25, 43,  5,-45,-12,-10;
/M: SY='R';  M=-10,-20,-20,-10,-10,-10,-20,-10,-30, 10,-20,  0,-20,-10, 30, 80,-10,-30,-10,  0,  0,  0;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2023_04 which contains 570'157 sequence entries.

Total number of hits	20 in 20 different sequences
Number of true positive hits	20 in 20 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Taxonomic range [info]	Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Feature key [info]	ZN_FING
Feature description [info]	T-ag D1-type
Version [info]	6

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

20 sequences

LT_BFPYV(P13894), LT_POVBA(P14999), LT_POVBG(P0DOJ4),

LT_POVBK(P03071), LT_POVBO(P24851), LT_POVHA(P03075), 
LT_POVJC(P03072), LT_POVK3(P0DOI7), LT_POVK6(P0DOI6), 
LT_POVKI(P0DOI5), LT_POVLY(P04008), LT_POVM1(P0DOJ6), 
LT_POVM3(P0DOJ5), LT_POVMA(P03073), LT_POVMC(P12905), 
LT_POVMK(P24597), LT_POVS1(Q3L6L5), LT_POVSM(A8Y984), 
LT_POVWU(A5HBG1), LT_SV40 (P03070)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

11 PDB

1N25; 1SVL; 1SVM; 1SVO; 2H1L; 4E2I; 4GDF; 5J40; 5J47; 5J4V; 5J4Y