Home  |  Contact
Entry: PS51789

General information about the entry

Entry name [info] RLR_CTR
Accession [info] PS51789
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-FEB-2016 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE;
31-JUL-2019 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51789
Associated ProRule [info] PRU01125

Name and characterization of the entry

Description [info] RIG-I-like receptor (RLR) C-terminal regulatory (CTR) domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=129;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=124;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3261869; R2=0.0074751; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=22952.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1161; H_SCORE=22952; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=559; H_SCORE=22952; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-16; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
...
                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-380; BD=-380;
/M: SY='E';  M= 21,-50,  2, 42,-32,-45,-38, -7, 11, -7,-16,-17,-43, 25,  6,  8,  3, -7,-56,-43;
/M: SY='R';  M=  6,-54,-22,  6,-25, -9,-35,-19, 44,-36, -3, -7,-26, 33, 56,-18,-37,-33,-52,-41;
/M: SY='R';  M=-38,-27,-32, 29,-36,-25,-15,-55, 47,-51,-20,-30,-21, 38, 61,  9,-18,-40,-53,-42;
/M: SY='Q';  M=  3,-51,-22,-18,-42,-32,-34,-12, 33,  1,  3, 29,-29, 48, 11,  2,-23, -9,-50, 11;
/M: SY='K';  M= -2,-53,-22, 21,-52,-18,-37,-27, 56,-19,-39,-31,-21, 31, 32,-14,  7,-22,-54,-43;
/M: SY='H';  M= -6,-50,-36, 19,  4,-35, 38, -1,  6, 19,-10, 23,-28,-32, -3, -5,  9,-12,  2, -8;
/M: SY='E';  M= -9,-52, 19, 30,-48,-11,  6,-46, 27,-12,-39, 22,-44, 24, 13, -1, 11,-23,-56, -5;
/M: SY='P';  M= 16,-53, 40,  6,-38, 19,-37,-55, -3,-55,-47, 20, 43, 13, -3, 11,-12,-50,-59,-48;
/I:         I=-25; MI=0; MD=-63; IM=0; DM=-63;
/M: SY='K';  M= 13,-11,  5,-16,-35,  3,-39,-25, 44,-50,-17,  5,-46, -4,  7, 38,-31,-20,-57,-45; D=-25;
/I:         I=-25; DM=-63;
/M: SY='N';  M=-23, -7, 10, 17,-45,-19,-16,  3,-14,  9,-33, 18,  0, 15,-15, 13, 13,  7,-60,-43; D=-25;
/I:         I=-25; DM=-63;
/M: SY='Y';  M=-26,-11,-52,-49, 54,-56, 16,  5, -8,-18,-11,-20,-57,-44,-13,-43,-27, 24, 26, 77;
/M: SY='Q';  M=-27,-51, 21, 21,-20,-46, -1,-44, 30,-34,-40,  8,-44, 32, 25, 11, 27, -3,-56,-20;
/M: SY='L';  M=-43, -7,-62,-56, 31,-63,-49, 48,-53, 54, 19,-56,-58,-50,-27,-36,-39,  9,-45, -9;
/M: SY='L';  M=-39, 26,-27, -7,-32,-27, 24,  5,-14, 36,-24, -3,-53,-27, 22, -8,-13, 16,-52, 15;
/M: SY='C';  M=-26,141,-55,-38,-49,-34,-10,-32,-52,-46,-46,-43,-66,-57,-58,-19,-38,-42,-76,-57;
/M: SY='R';  M=-16, 37,-41,-35, -8, 12,-14,-19, 43,-17,-39, -5,-24,-16, 46,  4,-14,-33,  3,-19;
/M: SY='K';  M=-37,-23,-16,-27,-49,-14, 25,-33, 68,-23,  8, 32,-24,  9, -8, 15,-21,-47,-54,-13;
/M: SY='C';  M=-39,144,-32,-55,-50,-35,-57,-56,-30,-48,-47,-43,-67,-32,-57,-41,-39,-45,-77,-59;
/M: SY='N';  M=-23,-51, 34,-11, -2, 13, 21,-49, 29,-24, 17, 36,-46, -1, 11, 15,-15,-48,-57,-39;
/M: SY='K';  M= 19,-50,-11, 15,-51,-43, 20,-29, 43,-45,-22,-17,-43, 30, -1,  6, 22,  5,  5,-41;
/M: SY='F';  M= -8,-51, -6, 12, 58,-52, 18,-14,-21,  7,-30,-41,-10, 14,-26,-18,  6,  4,-39, 24;
/M: SY='A';  M= 42,-46,-52,-25,  1,-33,-51, 35,-11, 19,-23,-48,-27,-44,-47,-26,-33, 35,-52,-37;
/M: SY='C';  M= -6,129,-56,-55,-27,-28,-56,  8,-51,-20,-38,-44,-62,-55,-32,-17,-16, -9,-68,-51;
/M: SY='D';  M=-37,-16, 31,-21,-30,-33, 28,-44, 27,-17, 31, 14, -2,-15,  8, 25, 27,-43,-56,  3;
/M: SY='S';  M=  1, 14,-14,-22,-53, 31,-39,-51,-37,-44,-47, 19,-44,-32,-43, 72, 13,-35,-60,-47;
/M: SY='D';  M=-12,-49, 46, 13,-32,-24,-12,-50, 25,-52,-46, 19,-42, -9, -4, 37, 32,-27,-62,-44;
/M: SY='D';  M=-14,-27, 93, 22,-39,-43, -7,-55, -7,-39,-52,  9,-44,-30,-23,-33,-19,-33,-72,-46;
/M: SY='I';  M=-42,-52,-62,-59, 21,-65,-56, 77,-55, 25, 21,-27,-55,-52,-56,-51,-37, 24,-49,-30;
/M: SY='R';  M=-41,-16,-37,  6,-54,-18,-15,-53, 43,-51,-41,-32,-48, 10, 84,-36,-20,-17,-54,-42;
/M: SY='T';  M=-27, 21,-44,-38,-40,-51, 13, 23, 34,  2,-29,-35,-47, -3, -4,  7, 40, 22,-58,-39;
/M: SY='I';  M=-21,-52,-34,-50,  9,-42,-49, 64,-27,  8,-20,-29,-54,-44, 27,-45,-37, 32,-48,  6;
/I:         I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106;
/M: SY='E';  M=-48, 12, 19, 42,-38,-54,-40,-63, 12,-61,-55, 27,-26, 27,-14,-12,-28,-45,-64,  0; D=-42;
/I:         I=-42; DM=-106;
/M: SY='N';  M=-21,-52, 41, 12,-54, 33,  3,-57,  7,-41,-47, 64,-46,  5, -5,-10,-34,-55,-60, -9;
/I:         I=-45; MI=0; MD=-115; IM=0; DM=-115;
/M: SY='S';  M=  3,  4,-37,-20,-46,-17,  3, -1,-25,-38, 45,  3,-43, 21,-39, 54, 39,-26,-59,-41;
/I:         I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90;
/M: SY='H';  M=-30,-55,-30,-29,-45,-42,113,-57,-18,-48,-36, 34,-47, 43,-29, 18,-36,-56,-63, 17;
/M: SY='H';  M=-47,-58,-38,-39, -7,-51,104,-48,-34,-40,-31,  1,-54,-30, 18,-39,-28,-50,-32, 88;
/M: SY='V';  M=  0, 17,-27,-52,  0,-57,-56, 39,-50,  0, 25,-50,-53,-51,-53,-41,  7, 64,-58,-36;
/I:         I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106;
/M: SY='V';  M=  1, 60,-48,-50,-38,-50,-22, 20,-46,-26, -4, 30,-55,-47,-50,-10,-19, 65,-65,-43;
/M: SY='C';  M=-39, 72,-60,-55, -5,-61,-56, 53,-50, 11, 20,-52, -1,-52,-17,-46,-23, 43,-57,-38;
/M: SY='D';  M=-17,  5, 67, 13,-58,  2, 10,-56,-16,-57,-51, 60,-46,-29,-21, 13,-14,-40,-69,-47;
/M: SY='P';  M=-30,-59, 12, 26,-59,-44,-39,-52,  8,-56,-47, -7, 84,  6, 10, 12, -7,-32,-59,-51;
/M: SY='D';  M= -4,-50, 53, 39,-56,-15,-33,-53,  6,-43,-17, 37,-42,  1,-34, 20, 20,-48,-64,-47;
/M: SY='F';  M=-47,-50,-64,-60, 89,-63,-49, 43,-56, 11, -3,-55,-60,-59,-55,-51,-41, 14,-30,  5;
/M: SY='W';  M=-34,-58,-50, -3,  5,-51,-48, -8, 25, 14, 10,-20,-13,-36, 11,-10,-43,-24,121,-23;
/M: SY='S';  M=-17,-52, 41, 39,-31,-41,-12,-31,  9,-36,-45, 19,-23,-10, 16, 42,-20,-34,-59,-23;
/M: SY='R';  M=-42,-19,-10,-11,-25,-49, 29,-32, 37,  5,-35, 22,-49,  8, 59,-19,-10,-44,-52,  7;
/M: SY='Y';  M=-16, 37,-54,-51, 18,-56,-43, 28,-23,-13, -7,-47,-55,-46,-15,-27, 12, 47,-40, 56;
/M: SY='R';  M=-30,-52,  9, 20,-43,-24,-38, 29,  7,-30,  4, 16,-46,-14, 38, -2, 20, -4,-56, -9;
/M: SY='I';  M=-27,  8,-28,-16,  0,-23, -6, 38, 10,  3, -7,  5,-49,-19,-41,-15, 26, 22,-52,  6;
/M: SY='E';  M=-18,-23, -6, 39,-47,-20,-39, 13, 36,-25,-15,-34,-44,  6, 21,  6,-12, 11,-55,-22;
/M: SY='P';  M=-19,-13, 23, 24,-32,-23,-41,-18,  0,-39,-43,-34, 68, -8, -3, 17,  9,-14,-58,-48;
/M: SY='H';  M=-41,-54, 22, -4, -6,-33, 62, -1, -1,  8,-13, 21, -6,  3, -1,  7,-36,-40,-49, 36;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24;
/M: SY='P';  M=-43,-70,-32, -5,-67,-67,-27,-24, 10,-49, -3,-23, 21, -2,-13,-35, 18, -9,-76,-62; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-24;
/M: SY='P';  M=-26,-29,  6, 20,-33,-51,-14,-24, 29,-53,-46,  2, 53, -6,-24,-18,  9,-14,-59, -3; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-24;
/M: SY='K';  M=-23,-55,-24, 13,-18,-19,  7, -7, 41,  3, 15,  0, 26,  4,-31,-15,-15,-10,-56,-42; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-24;
/M: SY='P';  M= -7,-57,-14,  4, 12, -8,-16,-45, 18,-32,-42,-23, 52, 28, -6,-15, -8,-14,-50,  6; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-24;
/M: SY='K';  M=-34,-57,-34, 35, -4,-52, -8, -3, 37,-29, 25, 13,-28, 12, 23,-29,-14,-42,-49, 19; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-24;
/M: SY='T';  M=-14,-14, 12,-35,-15,-35,-16,  2, 17,-13,-34, -7, 15,-23, 20,  7, 28, 14,  5, -2;
/M: SY='F';  M=-33,-23, 26,-17, 49,-13, 22, -4,  2,-12, 14,  9,-15,-39,-25, -8, -4,-21, 26, 25;
/M: SY='D';  M=  0,-53, 46, 32,-16,  0,-37,-34, -5,-15,-17,-19, 16,-17, -1,  4,-22, -9, -4,  5;
/M: SY='D';  M=-28,-52, 59, 28,-51, 18,-39, -5, -3,-38,-18,  3,-25,-32,-40,  3, 12,  3, -1,-45;
/M: SY='W';  M=-31,  1,-52,-21, 41,-35,-45, 25,-12, -1,-30,-46,-52,-25,-17,-10, 23,-22, 94, 42;
/M: SY='Q';  M= -7,  3,-19, 33,  4,-26,  6,-26,  3,-39, 26,-23,-45, 45, 16,  9,  5,  0,-53,-18;
/M: SY='M';  M=  4,-52,-43,-19,  3, -1,-41,  4, 22,-10, 36, -9, 32, 16, 20,-25, -2, -6,-51,-38;
/M: SY='M';  M=-27,  2,-30,-23,-12, 11,-43, 25, 16,  9, 33, 18,-26,-13,-40,-17, -3, 22,-53,-15;
/M: SY='G';  M= 13, 13,-15,-30,-27, 63,-41,-55, -3,-42,-45,-19,-46,  2, -3, 16, -7,-49,-50,  4;
/M: SY='K';  M=-38,-53, -8, 29,-28,-49,-38, 15, 60,-21, -8,  4,-25, -8,  1,  1, -6, -3,-54,-41;
/M: SY='I';  M=-21,-50,-60,-55,-16,-60,-20, 64,-36, 16, 39,-53,-27,-49,-53,-29,-35, 46, 15,-34;
/M: SY='H';  M=-17,  4,-39,-21, 22,-48, 64,-23, 27, -9, -4,  9,-51,-16, 21,  7,-37,-30,-42, 46;
/M: SY='C';  M=-39,142,-55,-56,-48,-53,  4,-53,-52,-45,  8,-13,-38,-58,-58,-41,-39,-44,-77,-55;
/M: SY='K';  M=-14,-53,-37,-19,-49,-16, 32,-24, 67,-20, 10,-10,-45,  5, 30,-16,-23, -4,-54,-39;
/I:         I=-24; MD=-60;
/M: SY='N';  M=-30,-57, -5, 11,-60, 22,-16,-59, 30,-60,-52, 37,-12,-33, 12,  8, -1,-37,-63,-30; D=-24;
/I:         I=-24; MI=0; MD=-60; IM=0; DM=-60;
/M: SY='C';  M=-13,142,-56,-33,-48,-53,-56,-54,-53,-45, -9,-45,-67,-58,-59,-40,-39,-43,-74,-31;
/M: SY='G';  M=-27, 14,  4,-25,  0, 56, -1,-58, 21,-54,-46, 24,-48, 19, 25,-22,-28,-54,-52,-22;
/M: SY='Q';  M=-13,-53,-30, 16,-29,-42, 55,-29,  6,-20,-37, 39,-46, 59, -8, 16,-11,-47,  2, 14;
/M: SY='D';  M=-15,-54, 60,  5,  1,-30,-13,-49, 31,-31,-44, -4,  8, 23, -1, -5,  1,-26,-57,-24;
/M: SY='W';  M=-47,-61,-69,-56,-21,-58,-61, 24,-50, 35,-26,-64,-22,-49,-28,-55,-49,  1,138, -3;
/M: SY='G';  M=-29,-56,-20,-53,-60, 92,-49,-67,-46,-44,-52,-29,-48,-45,-24,-29,-47,-61,-53,-56;
/M: SY='I';  M=-22,-52,-43,-22, 11,-49,-42, 31, 12,-27, 26, 16,  7,  3, 14,  8, 20,  0,-13,-37;
/M: SY='M';  M=-14,-51,-47, 20,-34,-57, -6, 41,-42,  9, 56,-46,-49,-12,-22,-31, 11, 24,  2, -7;
/M: SY='M';  M=  9, 16,-59,-54, 11,-20,-47, 38,-50,  4, 72,-50,-54,-47,-51,-22,-36, 29,-49,  8;
/M: SY='K';  M=-30,-53,-21, -6,-18,-36,  1, 20, 52, -1,-33, 10,-49,-30, 16, -6,-15, -1,-52, -2;
/M: SY='Y';  M=-35,-13,-52,-51, 30,-35, 33, 11,-47,-11,  8,-49,-59,-12,-45,-45,-43, -3, 32, 95;
/I:         I=-45; MI=0; MD=-115; IM=0; DM=-115;
/M: SY='K';  M=-12,-54,  3,-10,-52,-45,-13,-50, 58,-19,-41, 40,-25,  6, 41,-17,-35,-31,-56,-20;
/M: SY='G';  M=-20,-53, -9,-15,-57, 56, 20,-34, 16,-56,-47, 33,-46, 18,-19, 13, -6,-43,-58,-47;
/I:         I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90;
/M: SY='V';  M=  4,  5,-53,-47, 25,-34,-20, 18,-32,  1, 19,-46,-53, 15,-28,-25, 14, 47,-53,-33;
/I:         I=-33; MI=0; MD=-84; IM=0; DM=-84;
/M: SY='E';  M=-25,-55,-13, 46, -7,-48, -6,-43,-15,-43, 17, 14, 20, 28,-16,  8,  0,-10,-47, 38;
/I:         I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106;
/M: SY='F';  M=-48,-18,-63,-57, 62,-62,-44,  5,-55, 54, 32,-58,-61,-53,-53,-53,-27,-15,  2, 24;
/I:         I=-45; MI=0; MD=-115; IM=0; DM=-115;
/M: SY='P';  M=-24,-20,-48,-39,-48,-49,-46,  0,-42,-19, -7,-51,104,-44,-23,-23,-38,-33,-52, 10;
/M: SY='C';  M= -4, 61,-50,-48,-37,-36,-49, 16,-28,  8, 13,  7,-55,  1,-48,-15,  6, 44,-60,-13;
/M: SY='L';  M=-44,-51,-63,-57,  8,-38,-52, 44,-56, 61,  4,-59,-16,-52,-56,-53,-40, 10,-50,-32;
/M: SY='K';  M= 12,-51,-11,-29,-55,  1,  2,-32, 59,-53,-11, 16,-45,  1, -5, 35,-31,-47,-57,-45;
/M: SY='I';  M= 13, 34,-56,-52,-36,-56,-57, 69,-50,-13,-23,-23,-23,  2,-54,-41,-10, 31,-57,-41;
/M: SY='K';  M=-22, 20,  0, 46,-55,-50, -1,-32, 59,-31,-43, -7,-43,-10, 21,-15,-15,-37,-58,-46;
/M: SY='S';  M= 18,-14,-15,-25,-57,  3,  4,-55,  0,-56,-20, 50,-18,  1,-16, 52,-28,-49,-63,-48;
/M: SY='F';  M=-49,-19,-65,-60, 89,-38,-17, 18,-57, 18,  6,-55,-62,-60,-56,-31,-44, -4,-32,-11;
/M: SY='V';  M= -2,-48,-51,-47, -6,-19,-50,  3,-29,  5, 13,-24,-52, -2,-12, -4, 28, 48,-59,-40;
/M: SY='F';  M=-45,-50,-63,-59, 69,-63,-51, 20,-56, 26, 22,-27,-61,-57,-55,-52,-40, 39,-40,  0;
/M: SY='E';  M=-21,-15,  9, 42,-30,-54,-11,  4, -1,-20,  3,-16,-18,  1,  1,-18, -7, 22,-56,  4;
/M: SY='D';  M=-14,-14, 38,-18, -5,-46,-15, -4, -2, -9,-39, 32,  0,-38,-42, -3, 37,-20,-58,  4;
/M: SY='P';  M=-30,-19,  7, 24,-56,  5,-39,-24, 11,-53,-21, 21, 47, 13,  0,  5, -6,-24,-59,-26;
/M: SY='D';  M= -5,-54, 39, 17,-32,  3,-13,-29, 11,-41,-21, 37,-48, 16,  3, -3,-20,-17,-61,-23;
/M: SY='G';  M=-38, -9, 22, 20,-55, 32, 15,-31,  3,-39,-18,  8,-27, -5,-28, -2, 27,-34,-62,-27;
/I:         I=-26; MD=-67;
/M: SY='N';  M=-48,-77,  9,-28,-78, 13,-60,-79,-35,-63,-72, 21,-19,-32,-27,-24, -5,-76,-84,-32; D=-26;
/I:         I=-26; MI=0; MD=-67; IM=0; DM=-67;
/M: SY='E';  M=-18,-68, -5, 38,-70,-19,-20,-65,  9,-64,-24,-11,-18, 14,  7, -9,-28,-36,-71,-59; D=-26;
/I:         I=-26; DM=-67;
/M: SY='R';  M=-28,-58,-27,-19,-16,-13,-16,-16, 28, -5, -1,-38,  3, 27, 49,-26,  9,-43,-54,-17;
/M: SY='R';  M=-17,  7,-17,  2, -5,-37,  8, -9, 26, -6, 15,-11,-28,  1, 27, -4, -1,-15, -5,-40;
/M: SY='T';  M=-26,-14,-17,-27,-14,-36, 13,-31, -2,-23,-38,-22, 13,  7, 19,-23, 55,  1,-56, 11;
/M: SY='Y';  M=-35,  1,-53,-32, 39,-58,-11, 12, 14, -4,-32,-27,  0,-45, -4,-22,-42, 13, 16, 45;
/M: SY='K';  M=  1,-57, -9,-13,-60,-36,-12,-58, 69,-45,-46,  2,-47, 23, 23,-18,-10,-53,-58,-47;
/M: SY='K';  M=-25,-59,-17,-12,-61,-30, -9,-60, 72,-58,-46,-18,-46, 46, 17, -8,-10,-55,-57,-46;
/M: SY='W';  M=-57,-81,-83,-62,-22,-56,-81,-51,-54,-39,-53,-77,-61,-54,-57,-63,-68,-42,165,  6;
/M: SY='K';  M=-40,-56,-37,-18,-57,-14,-40,-44, 73,-32,-46, 13,-47,-12,  4, 22,-25,-33,-58,-48;
/M: SY='D';  M=-32,-58, 58, 11,-38,-32,-36,-59, 40,-42,-51, 23,-48, 16,  6, -2,-23,-56,-63,-24;
/M: SY='V';  M=  4, 16,-60,-56, -4,-22,-60, 22,-54,  3,-27,-53,-58,-54,-57, -9,-10, 60,-61,-42;
/M: SY='P';  M=-27,-18,  3, 16,-59,-37, -3,-50, -6,-27,-47,-13, 81, -7,-28, -6, -1,-27,-63,-54;
/M: SY='F';  M=-50,-55, -8, 14, 86,-31,-45,-14,-20,-19,-36, -9,-58,-49,-30,-27,-29,-28,-34,  5;
/M: SY='Q';  M=-12,-16,-10, 15,-30,-36, 18, -1,-18, -2,-14,  6,  6, 33, -2,  3,  0,-23,-58,-12;
/M: SY='I';  M=-45,-54,-62,-58, 38,-65,-19, 47,-27, 10, 12,-29,-35,-54,-54,-51,-26, 40,-48, 11;
/M: SY='F';  M= -4,-59, 11, 29, 45,-53,-45,-36, 23,-38,-45,-42, 32, -3,-26,-41,-12,-35, 37,-34;
/M: SY='E';  M=-18,-57, 13, 48,  3,-51,-42,  1,  3,-34,-44, 12,-13,-18,-25,  0,  8,-27,  4,-21;
/M: SY='F';  M=-33,-57,-58,-13, 56,-63,-19, 30,-38, 14, 15,-56, 32,-53,-55,-52,-44,  6,-44, -2;
/M: SY='D';  M=-30,-55, 43, 12,-16, -1,-40,-54,-24,-42,-15, 26,-11,  2,-14, 24, 22,-41,-65,-48;
/M: SY='P';  M= -9,-59, -2, 18, 22,-53,-40, -6,-18,-17,-40, -1, 44, -9,-25,-22,-22,-24,-45, 41;
/M: SY='E';  M=  2,-18,  7, 27,-27,-20,-46, 24,-23,-17,-38,-11,-32,  0,-46,  8,-14,  2,  0, -4;
/M: SY='E';  M=-32,-59, 40, 52,-58,-51,-16,-56,-13,-26, -4,  0,-47,  9, -2,  7,  7,-53, 12,-49;
/M: SY='Y';  M=-25,-26,-19,  9,-12,-57,  9, 17,-43, 16, -2, -5,-31, 31,-46,-29, -7,-20,-48, 40;
/M: SY='C';  M= -8, 36, -8,  8,-43,-30,-13, -2,  0, 13, -7,-23,-34,-16, -7, 13,-39,-10,-58,  3;
/M: SY='D';  M=-23,-59, 55, 16, -7,-27, -9,-52, -8,-13,-46,-12,-52, 13, 19,  4,-40,-27,-63,-26;
/I:         E1=0; IE=-380; DE=-380;
» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH PS51788; PS51790; PS51792; PS51793

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2019_07 which contains 560'537 sequence entries.


Total number of hits 7 in 7 different sequences
Number of true positive hits 7 in 7 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] RLR CTR
Version [info] 3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
7 sequences

DDX58_HUMAN (O95786    ), DDX58_MOUSE (Q6Q899    ), DDX58_PIG   (Q9GLV6    ), 
DHX58_HUMAN (Q96C10    ), DHX58_MOUSE (Q99J87    ), IFIH1_HUMAN (Q9BYX4    ), 
IFIH1_MOUSE (Q8R5F7    )
» more

PDB
[Detailed view]
31 PDB

2QFB; 2QFD; 2RMJ; 2RQA; 2RQB; 2W4R; 2YKG; 3EQT; 3GA3; 3LRN; 3LRR; 3NCU; 3OG8; 3ZD6; 3ZD7; 4AY2; 4BPB; 4GL2; 5E3H; 5F98; 5F9F; 5F9H; 6G19; 6G1S; 6G1X; 6GJZ; 6GKH; 6GKM; 6GPG; 6H61; 6H66
» more

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission