PROSITE entry PS51789
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | RLR_CTR |
| Accession [info] | PS51789 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-FEB-2016 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51789 |
| Associated ProRule [info] | PRU01125 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | RIG-I-like receptor (RLR) C-terminal regulatory (CTR) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=129; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=124; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3261869; R2=0.0074751; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=22952.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1161; H_SCORE=22952; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=559; H_SCORE=22952; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-16; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=0; BI=-380; BD=-380; /M: SY='E'; M= 21,-50, 2, 42,-32,-45,-38, -7, 11, -7,-16,-17,-43, 25, 6, 8, 3, -7,-56,-43; /M: SY='R'; M= 6,-54,-22, 6,-25, -9,-35,-19, 44,-36, -3, -7,-26, 33, 56,-18,-37,-33,-52,-41; /M: SY='R'; M=-38,-27,-32, 29,-36,-25,-15,-55, 47,-51,-20,-30,-21, 38, 61, 9,-18,-40,-53,-42; /M: SY='Q'; M= 3,-51,-22,-18,-42,-32,-34,-12, 33, 1, 3, 29,-29, 48, 11, 2,-23, -9,-50, 11; /M: SY='K'; M= -2,-53,-22, 21,-52,-18,-37,-27, 56,-19,-39,-31,-21, 31, 32,-14, 7,-22,-54,-43; /M: SY='H'; M= -6,-50,-36, 19, 4,-35, 38, -1, 6, 19,-10, 23,-28,-32, -3, -5, 9,-12, 2, -8; /M: SY='E'; M= -9,-52, 19, 30,-48,-11, 6,-46, 27,-12,-39, 22,-44, 24, 13, -1, 11,-23,-56, -5; /M: SY='P'; M= 16,-53, 40, 6,-38, 19,-37,-55, -3,-55,-47, 20, 43, 13, -3, 11,-12,-50,-59,-48; /I: I=-25; MI=0; MD=-63; IM=0; DM=-63; /M: SY='K'; M= 13,-11, 5,-16,-35, 3,-39,-25, 44,-50,-17, 5,-46, -4, 7, 38,-31,-20,-57,-45; D=-25; /I: I=-25; DM=-63; /M: SY='N'; M=-23, -7, 10, 17,-45,-19,-16, 3,-14, 9,-33, 18, 0, 15,-15, 13, 13, 7,-60,-43; D=-25; /I: I=-25; DM=-63; /M: SY='Y'; M=-26,-11,-52,-49, 54,-56, 16, 5, -8,-18,-11,-20,-57,-44,-13,-43,-27, 24, 26, 77; /M: SY='Q'; M=-27,-51, 21, 21,-20,-46, -1,-44, 30,-34,-40, 8,-44, 32, 25, 11, 27, -3,-56,-20; /M: SY='L'; M=-43, -7,-62,-56, 31,-63,-49, 48,-53, 54, 19,-56,-58,-50,-27,-36,-39, 9,-45, -9; /M: SY='L'; M=-39, 26,-27, -7,-32,-27, 24, 5,-14, 36,-24, -3,-53,-27, 22, -8,-13, 16,-52, 15; /M: SY='C'; M=-26,141,-55,-38,-49,-34,-10,-32,-52,-46,-46,-43,-66,-57,-58,-19,-38,-42,-76,-57; /M: SY='R'; M=-16, 37,-41,-35, -8, 12,-14,-19, 43,-17,-39, -5,-24,-16, 46, 4,-14,-33, 3,-19; /M: SY='K'; M=-37,-23,-16,-27,-49,-14, 25,-33, 68,-23, 8, 32,-24, 9, -8, 15,-21,-47,-54,-13; /M: SY='C'; M=-39,144,-32,-55,-50,-35,-57,-56,-30,-48,-47,-43,-67,-32,-57,-41,-39,-45,-77,-59; /M: SY='N'; M=-23,-51, 34,-11, -2, 13, 21,-49, 29,-24, 17, 36,-46, -1, 11, 15,-15,-48,-57,-39; /M: SY='K'; M= 19,-50,-11, 15,-51,-43, 20,-29, 43,-45,-22,-17,-43, 30, -1, 6, 22, 5, 5,-41; /M: SY='F'; M= -8,-51, -6, 12, 58,-52, 18,-14,-21, 7,-30,-41,-10, 14,-26,-18, 6, 4,-39, 24; /M: SY='A'; M= 42,-46,-52,-25, 1,-33,-51, 35,-11, 19,-23,-48,-27,-44,-47,-26,-33, 35,-52,-37; /M: SY='C'; M= -6,129,-56,-55,-27,-28,-56, 8,-51,-20,-38,-44,-62,-55,-32,-17,-16, -9,-68,-51; /M: SY='D'; M=-37,-16, 31,-21,-30,-33, 28,-44, 27,-17, 31, 14, -2,-15, 8, 25, 27,-43,-56, 3; /M: SY='S'; M= 1, 14,-14,-22,-53, 31,-39,-51,-37,-44,-47, 19,-44,-32,-43, 72, 13,-35,-60,-47; /M: SY='D'; M=-12,-49, 46, 13,-32,-24,-12,-50, 25,-52,-46, 19,-42, -9, -4, 37, 32,-27,-62,-44; /M: SY='D'; M=-14,-27, 93, 22,-39,-43, -7,-55, -7,-39,-52, 9,-44,-30,-23,-33,-19,-33,-72,-46; /M: SY='I'; M=-42,-52,-62,-59, 21,-65,-56, 77,-55, 25, 21,-27,-55,-52,-56,-51,-37, 24,-49,-30; /M: SY='R'; M=-41,-16,-37, 6,-54,-18,-15,-53, 43,-51,-41,-32,-48, 10, 84,-36,-20,-17,-54,-42; /M: SY='T'; M=-27, 21,-44,-38,-40,-51, 13, 23, 34, 2,-29,-35,-47, -3, -4, 7, 40, 22,-58,-39; /M: SY='I'; M=-21,-52,-34,-50, 9,-42,-49, 64,-27, 8,-20,-29,-54,-44, 27,-45,-37, 32,-48, 6; /I: I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106; /M: SY='E'; M=-48, 12, 19, 42,-38,-54,-40,-63, 12,-61,-55, 27,-26, 27,-14,-12,-28,-45,-64, 0; D=-42; /I: I=-42; DM=-106; /M: SY='N'; M=-21,-52, 41, 12,-54, 33, 3,-57, 7,-41,-47, 64,-46, 5, -5,-10,-34,-55,-60, -9; /I: I=-45; MI=0; MD=-115; IM=0; DM=-115; /M: SY='S'; M= 3, 4,-37,-20,-46,-17, 3, -1,-25,-38, 45, 3,-43, 21,-39, 54, 39,-26,-59,-41; /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90; /M: SY='H'; M=-30,-55,-30,-29,-45,-42,113,-57,-18,-48,-36, 34,-47, 43,-29, 18,-36,-56,-63, 17; /M: SY='H'; M=-47,-58,-38,-39, -7,-51,104,-48,-34,-40,-31, 1,-54,-30, 18,-39,-28,-50,-32, 88; /M: SY='V'; M= 0, 17,-27,-52, 0,-57,-56, 39,-50, 0, 25,-50,-53,-51,-53,-41, 7, 64,-58,-36; /I: I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106; /M: SY='V'; M= 1, 60,-48,-50,-38,-50,-22, 20,-46,-26, -4, 30,-55,-47,-50,-10,-19, 65,-65,-43; /M: SY='C'; M=-39, 72,-60,-55, -5,-61,-56, 53,-50, 11, 20,-52, -1,-52,-17,-46,-23, 43,-57,-38; /M: SY='D'; M=-17, 5, 67, 13,-58, 2, 10,-56,-16,-57,-51, 60,-46,-29,-21, 13,-14,-40,-69,-47; /M: SY='P'; M=-30,-59, 12, 26,-59,-44,-39,-52, 8,-56,-47, -7, 84, 6, 10, 12, -7,-32,-59,-51; /M: SY='D'; M= -4,-50, 53, 39,-56,-15,-33,-53, 6,-43,-17, 37,-42, 1,-34, 20, 20,-48,-64,-47; /M: SY='F'; M=-47,-50,-64,-60, 89,-63,-49, 43,-56, 11, -3,-55,-60,-59,-55,-51,-41, 14,-30, 5; /M: SY='W'; M=-34,-58,-50, -3, 5,-51,-48, -8, 25, 14, 10,-20,-13,-36, 11,-10,-43,-24,121,-23; /M: SY='S'; M=-17,-52, 41, 39,-31,-41,-12,-31, 9,-36,-45, 19,-23,-10, 16, 42,-20,-34,-59,-23; /M: SY='R'; M=-42,-19,-10,-11,-25,-49, 29,-32, 37, 5,-35, 22,-49, 8, 59,-19,-10,-44,-52, 7; /M: SY='Y'; M=-16, 37,-54,-51, 18,-56,-43, 28,-23,-13, -7,-47,-55,-46,-15,-27, 12, 47,-40, 56; /M: SY='R'; M=-30,-52, 9, 20,-43,-24,-38, 29, 7,-30, 4, 16,-46,-14, 38, -2, 20, -4,-56, -9; /M: SY='I'; M=-27, 8,-28,-16, 0,-23, -6, 38, 10, 3, -7, 5,-49,-19,-41,-15, 26, 22,-52, 6; /M: SY='E'; M=-18,-23, -6, 39,-47,-20,-39, 13, 36,-25,-15,-34,-44, 6, 21, 6,-12, 11,-55,-22; /M: SY='P'; M=-19,-13, 23, 24,-32,-23,-41,-18, 0,-39,-43,-34, 68, -8, -3, 17, 9,-14,-58,-48; /M: SY='H'; M=-41,-54, 22, -4, -6,-33, 62, -1, -1, 8,-13, 21, -6, 3, -1, 7,-36,-40,-49, 36; /I: I=-10; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24; /M: SY='P'; M=-43,-70,-32, -5,-67,-67,-27,-24, 10,-49, -3,-23, 21, -2,-13,-35, 18, -9,-76,-62; D=-10; /I: I=-10; DM=-24; /M: SY='P'; M=-26,-29, 6, 20,-33,-51,-14,-24, 29,-53,-46, 2, 53, -6,-24,-18, 9,-14,-59, -3; D=-10; /I: I=-10; DM=-24; /M: SY='K'; M=-23,-55,-24, 13,-18,-19, 7, -7, 41, 3, 15, 0, 26, 4,-31,-15,-15,-10,-56,-42; D=-10; /I: I=-10; DM=-24; /M: SY='P'; M= -7,-57,-14, 4, 12, -8,-16,-45, 18,-32,-42,-23, 52, 28, -6,-15, -8,-14,-50, 6; D=-10; /I: I=-10; DM=-24; /M: SY='K'; M=-34,-57,-34, 35, -4,-52, -8, -3, 37,-29, 25, 13,-28, 12, 23,-29,-14,-42,-49, 19; D=-10; /I: I=-10; DM=-24; /M: SY='T'; M=-14,-14, 12,-35,-15,-35,-16, 2, 17,-13,-34, -7, 15,-23, 20, 7, 28, 14, 5, -2; /M: SY='F'; M=-33,-23, 26,-17, 49,-13, 22, -4, 2,-12, 14, 9,-15,-39,-25, -8, -4,-21, 26, 25; /M: SY='D'; M= 0,-53, 46, 32,-16, 0,-37,-34, -5,-15,-17,-19, 16,-17, -1, 4,-22, -9, -4, 5; /M: SY='D'; M=-28,-52, 59, 28,-51, 18,-39, -5, -3,-38,-18, 3,-25,-32,-40, 3, 12, 3, -1,-45; /M: SY='W'; M=-31, 1,-52,-21, 41,-35,-45, 25,-12, -1,-30,-46,-52,-25,-17,-10, 23,-22, 94, 42; /M: SY='Q'; M= -7, 3,-19, 33, 4,-26, 6,-26, 3,-39, 26,-23,-45, 45, 16, 9, 5, 0,-53,-18; /M: SY='M'; M= 4,-52,-43,-19, 3, -1,-41, 4, 22,-10, 36, -9, 32, 16, 20,-25, -2, -6,-51,-38; /M: SY='M'; M=-27, 2,-30,-23,-12, 11,-43, 25, 16, 9, 33, 18,-26,-13,-40,-17, -3, 22,-53,-15; /M: SY='G'; M= 13, 13,-15,-30,-27, 63,-41,-55, -3,-42,-45,-19,-46, 2, -3, 16, -7,-49,-50, 4; /M: SY='K'; M=-38,-53, -8, 29,-28,-49,-38, 15, 60,-21, -8, 4,-25, -8, 1, 1, -6, -3,-54,-41; /M: SY='I'; M=-21,-50,-60,-55,-16,-60,-20, 64,-36, 16, 39,-53,-27,-49,-53,-29,-35, 46, 15,-34; /M: SY='H'; M=-17, 4,-39,-21, 22,-48, 64,-23, 27, -9, -4, 9,-51,-16, 21, 7,-37,-30,-42, 46; /M: SY='C'; M=-39,142,-55,-56,-48,-53, 4,-53,-52,-45, 8,-13,-38,-58,-58,-41,-39,-44,-77,-55; /M: SY='K'; M=-14,-53,-37,-19,-49,-16, 32,-24, 67,-20, 10,-10,-45, 5, 30,-16,-23, -4,-54,-39; /I: I=-24; MD=-60; /M: SY='N'; M=-30,-57, -5, 11,-60, 22,-16,-59, 30,-60,-52, 37,-12,-33, 12, 8, -1,-37,-63,-30; D=-24; /I: I=-24; MI=0; MD=-60; IM=0; DM=-60; /M: SY='C'; M=-13,142,-56,-33,-48,-53,-56,-54,-53,-45, -9,-45,-67,-58,-59,-40,-39,-43,-74,-31; /M: SY='G'; M=-27, 14, 4,-25, 0, 56, -1,-58, 21,-54,-46, 24,-48, 19, 25,-22,-28,-54,-52,-22; /M: SY='Q'; M=-13,-53,-30, 16,-29,-42, 55,-29, 6,-20,-37, 39,-46, 59, -8, 16,-11,-47, 2, 14; /M: SY='D'; M=-15,-54, 60, 5, 1,-30,-13,-49, 31,-31,-44, -4, 8, 23, -1, -5, 1,-26,-57,-24; /M: SY='W'; M=-47,-61,-69,-56,-21,-58,-61, 24,-50, 35,-26,-64,-22,-49,-28,-55,-49, 1,138, -3; /M: SY='G'; M=-29,-56,-20,-53,-60, 92,-49,-67,-46,-44,-52,-29,-48,-45,-24,-29,-47,-61,-53,-56; /M: SY='I'; M=-22,-52,-43,-22, 11,-49,-42, 31, 12,-27, 26, 16, 7, 3, 14, 8, 20, 0,-13,-37; /M: SY='M'; M=-14,-51,-47, 20,-34,-57, -6, 41,-42, 9, 56,-46,-49,-12,-22,-31, 11, 24, 2, -7; /M: SY='M'; M= 9, 16,-59,-54, 11,-20,-47, 38,-50, 4, 72,-50,-54,-47,-51,-22,-36, 29,-49, 8; /M: SY='K'; M=-30,-53,-21, -6,-18,-36, 1, 20, 52, -1,-33, 10,-49,-30, 16, -6,-15, -1,-52, -2; /M: SY='Y'; M=-35,-13,-52,-51, 30,-35, 33, 11,-47,-11, 8,-49,-59,-12,-45,-45,-43, -3, 32, 95; /I: I=-45; MI=0; MD=-115; IM=0; DM=-115; /M: SY='K'; M=-12,-54, 3,-10,-52,-45,-13,-50, 58,-19,-41, 40,-25, 6, 41,-17,-35,-31,-56,-20; /M: SY='G'; M=-20,-53, -9,-15,-57, 56, 20,-34, 16,-56,-47, 33,-46, 18,-19, 13, -6,-43,-58,-47; /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90; /M: SY='V'; M= 4, 5,-53,-47, 25,-34,-20, 18,-32, 1, 19,-46,-53, 15,-28,-25, 14, 47,-53,-33; /I: I=-33; MI=0; MD=-84; IM=0; DM=-84; /M: SY='E'; M=-25,-55,-13, 46, -7,-48, -6,-43,-15,-43, 17, 14, 20, 28,-16, 8, 0,-10,-47, 38; /I: I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106; /M: SY='F'; M=-48,-18,-63,-57, 62,-62,-44, 5,-55, 54, 32,-58,-61,-53,-53,-53,-27,-15, 2, 24; /I: I=-45; MI=0; MD=-115; IM=0; DM=-115; /M: SY='P'; M=-24,-20,-48,-39,-48,-49,-46, 0,-42,-19, -7,-51,104,-44,-23,-23,-38,-33,-52, 10; /M: SY='C'; M= -4, 61,-50,-48,-37,-36,-49, 16,-28, 8, 13, 7,-55, 1,-48,-15, 6, 44,-60,-13; /M: SY='L'; M=-44,-51,-63,-57, 8,-38,-52, 44,-56, 61, 4,-59,-16,-52,-56,-53,-40, 10,-50,-32; /M: SY='K'; M= 12,-51,-11,-29,-55, 1, 2,-32, 59,-53,-11, 16,-45, 1, -5, 35,-31,-47,-57,-45; /M: SY='I'; M= 13, 34,-56,-52,-36,-56,-57, 69,-50,-13,-23,-23,-23, 2,-54,-41,-10, 31,-57,-41; /M: SY='K'; M=-22, 20, 0, 46,-55,-50, -1,-32, 59,-31,-43, -7,-43,-10, 21,-15,-15,-37,-58,-46; /M: SY='S'; M= 18,-14,-15,-25,-57, 3, 4,-55, 0,-56,-20, 50,-18, 1,-16, 52,-28,-49,-63,-48; /M: SY='F'; M=-49,-19,-65,-60, 89,-38,-17, 18,-57, 18, 6,-55,-62,-60,-56,-31,-44, -4,-32,-11; /M: SY='V'; M= -2,-48,-51,-47, -6,-19,-50, 3,-29, 5, 13,-24,-52, -2,-12, -4, 28, 48,-59,-40; /M: SY='F'; M=-45,-50,-63,-59, 69,-63,-51, 20,-56, 26, 22,-27,-61,-57,-55,-52,-40, 39,-40, 0; /M: SY='E'; M=-21,-15, 9, 42,-30,-54,-11, 4, -1,-20, 3,-16,-18, 1, 1,-18, -7, 22,-56, 4; /M: SY='D'; M=-14,-14, 38,-18, -5,-46,-15, -4, -2, -9,-39, 32, 0,-38,-42, -3, 37,-20,-58, 4; /M: SY='P'; M=-30,-19, 7, 24,-56, 5,-39,-24, 11,-53,-21, 21, 47, 13, 0, 5, -6,-24,-59,-26; /M: SY='D'; M= -5,-54, 39, 17,-32, 3,-13,-29, 11,-41,-21, 37,-48, 16, 3, -3,-20,-17,-61,-23; /M: SY='G'; M=-38, -9, 22, 20,-55, 32, 15,-31, 3,-39,-18, 8,-27, -5,-28, -2, 27,-34,-62,-27; /I: I=-26; MD=-67; /M: SY='N'; M=-48,-77, 9,-28,-78, 13,-60,-79,-35,-63,-72, 21,-19,-32,-27,-24, -5,-76,-84,-32; D=-26; /I: I=-26; MI=0; MD=-67; IM=0; DM=-67; /M: SY='E'; M=-18,-68, -5, 38,-70,-19,-20,-65, 9,-64,-24,-11,-18, 14, 7, -9,-28,-36,-71,-59; D=-26; /I: I=-26; DM=-67; /M: SY='R'; M=-28,-58,-27,-19,-16,-13,-16,-16, 28, -5, -1,-38, 3, 27, 49,-26, 9,-43,-54,-17; /M: SY='R'; M=-17, 7,-17, 2, -5,-37, 8, -9, 26, -6, 15,-11,-28, 1, 27, -4, -1,-15, -5,-40; /M: SY='T'; M=-26,-14,-17,-27,-14,-36, 13,-31, -2,-23,-38,-22, 13, 7, 19,-23, 55, 1,-56, 11; /M: SY='Y'; M=-35, 1,-53,-32, 39,-58,-11, 12, 14, -4,-32,-27, 0,-45, -4,-22,-42, 13, 16, 45; /M: SY='K'; M= 1,-57, -9,-13,-60,-36,-12,-58, 69,-45,-46, 2,-47, 23, 23,-18,-10,-53,-58,-47; /M: SY='K'; M=-25,-59,-17,-12,-61,-30, -9,-60, 72,-58,-46,-18,-46, 46, 17, -8,-10,-55,-57,-46; /M: SY='W'; M=-57,-81,-83,-62,-22,-56,-81,-51,-54,-39,-53,-77,-61,-54,-57,-63,-68,-42,165, 6; /M: SY='K'; M=-40,-56,-37,-18,-57,-14,-40,-44, 73,-32,-46, 13,-47,-12, 4, 22,-25,-33,-58,-48; /M: SY='D'; M=-32,-58, 58, 11,-38,-32,-36,-59, 40,-42,-51, 23,-48, 16, 6, -2,-23,-56,-63,-24; /M: SY='V'; M= 4, 16,-60,-56, -4,-22,-60, 22,-54, 3,-27,-53,-58,-54,-57, -9,-10, 60,-61,-42; /M: SY='P'; M=-27,-18, 3, 16,-59,-37, -3,-50, -6,-27,-47,-13, 81, -7,-28, -6, -1,-27,-63,-54; /M: SY='F'; M=-50,-55, -8, 14, 86,-31,-45,-14,-20,-19,-36, -9,-58,-49,-30,-27,-29,-28,-34, 5; /M: SY='Q'; M=-12,-16,-10, 15,-30,-36, 18, -1,-18, -2,-14, 6, 6, 33, -2, 3, 0,-23,-58,-12; /M: SY='I'; M=-45,-54,-62,-58, 38,-65,-19, 47,-27, 10, 12,-29,-35,-54,-54,-51,-26, 40,-48, 11; /M: SY='F'; M= -4,-59, 11, 29, 45,-53,-45,-36, 23,-38,-45,-42, 32, -3,-26,-41,-12,-35, 37,-34; /M: SY='E'; M=-18,-57, 13, 48, 3,-51,-42, 1, 3,-34,-44, 12,-13,-18,-25, 0, 8,-27, 4,-21; /M: SY='F'; M=-33,-57,-58,-13, 56,-63,-19, 30,-38, 14, 15,-56, 32,-53,-55,-52,-44, 6,-44, -2; /M: SY='D'; M=-30,-55, 43, 12,-16, -1,-40,-54,-24,-42,-15, 26,-11, 2,-14, 24, 22,-41,-65,-48; /M: SY='P'; M= -9,-59, -2, 18, 22,-53,-40, -6,-18,-17,-40, -1, 44, -9,-25,-22,-22,-24,-45, 41; /M: SY='E'; M= 2,-18, 7, 27,-27,-20,-46, 24,-23,-17,-38,-11,-32, 0,-46, 8,-14, 2, 0, -4; /M: SY='E'; M=-32,-59, 40, 52,-58,-51,-16,-56,-13,-26, -4, 0,-47, 9, -2, 7, 7,-53, 12,-49; /M: SY='Y'; M=-25,-26,-19, 9,-12,-57, 9, 17,-43, 16, -2, -5,-31, 31,-46,-29, -7,-20,-48, 40; /M: SY='C'; M= -8, 36, -8, 8,-43,-30,-13, -2, 0, 13, -7,-23,-34,-16, -7, 13,-39,-10,-58, 3; /M: SY='D'; M=-23,-59, 55, 16, -7,-27, -9,-52, -8,-13,-46,-12,-52, 13, 19, 4,-40,-27,-63,-26; /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;» more |
Post-processing [info]
| COMPETES_HIT_WITH | PS51788; PS51790; PS51792; PS51793 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 7 in 7 different sequences |
| Number of true positive hits | 7 in 7 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | RLR CTR |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
7 sequences
DHX58_HUMAN (Q96C10), DHX58_MOUSE (Q99J87), IFIH1_HUMAN (Q9BYX4), IFIH1_MOUSE (Q8R5F7), RIGI_HUMAN (O95786), RIGI_MOUSE (Q6Q899), RIGI_PIG(Q9GLV6)» more
|
| PDB [Detailed view] |
58 PDB
2QFB; 2QFD; 2RMJ; 2RQA; 2RQB; 2W4R; 2YKG; 3EQT; 3GA3; 3LRN; 3LRR; 3NCU; 3OG8; 3ZD6; 3ZD7; 4AY2; 4BPB; 4GL2; 5E3H; 5F98; 5F9F; 5F9H; 6G19; 6G1S; 6G1X; 6GJZ; 6GKH; 6GKM; 6GPG; 6H61; 6H66; 6KYV; 7BAH; 7BAI; 7BKP; 7BKQ; 7JL0; 7JL1; 7JL2; 7JL3; 7MK1; 7NGA; 7NIC; 7NIQ; 7TNX; 7TNY; 7TNZ; 7TO0; 7TO1; 7TO2; 8DVR; 8DVS; 8DVU; 8G7T; 8G7U; 8G7V; 8SCZ; 8SD0 » more |