Home  |  Contact
Entry: PS51792

General information about the entry

Entry name [info] YIPPEE
Accession [info] PS51792
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-FEB-2016 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE;
13-NOV-2019 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51792
Associated ProRule [info] PRU01128

Name and characterization of the entry

Description [info] Yippee domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=98;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=93;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3076599; R2=0.0090335; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=14664.4541016; R2=8.8706064; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=852; H_SCORE=22222; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=465; H_SCORE=18789; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-18; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
...
                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-380; BD=-380;
/M: SY='R';  M=-17,-53, 10,-21,-50,-43, 33,-17, 26,-33,-35, -9,  2, 39, 49, -9,-33,-43,-53,-35;
/M: SY='T';  M=-33, 34,-44,-41,-27,-49,-39, 18, -4, 14, 25,-36,-46,-37,-16, -5, 39,  1,-46, 19;
/M: SY='Y';  M=-44,-52,-46, -7, 53,-55,-25, 23,-43, -8,-21,-47,-54,-40,-42,-43,-38,-23,-14, 85;
/M: SY='S';  M=-29,-45,-36,-36,  0,  5, 33,-21, -9,-35, 25, -4,-44,-29, 13, 36,  5,-11,-45, 20;
/M: SY='C';  M=-35,139,-55,-55,-46,-51,-55,-52,-51,-43,-43,-41,-66,-59,-58,-38,-35,-40,-75,-56;
/M: SY='R';  M= 14,  9,-33,-32,-46, -4,-34,-16, 12,-41,-35, 34,-45,-27, 46,-26,  4,  1,-55,-41;
/M: SY='H';  M=-36,-49,-28,-28,-15,-40, 65,-44, 21,-31,-34, 44,-45,  2, 37,  3,-30,-20,-54, -9;
/M: SY='C';  M=-35,139,-55,-55,-46,-51,-55,-52,-51,-43,-43,-41,-66,-59,-58,-38,-35,-40,-75,-56;
/M: SY='R';  M=-36,-52,  0, -2,-52, 22, 42,-57, 26,-52,-41, 29,-43, -4, 51,-29,-35,-53,-55,-37;
/M: SY='T';  M=  9,-37,-28,-34,-43,-36,-37,-33,-31,-39,-35, 38,-37,-34,-39,-13, 77,-11,-62,-41;
/M: SY='H';  M=-41,-55, 21,-24,-36,-43, 92,-18,-29,-41,-31, 16,  2, 41,-29,-31,-36,-47,-49, 36;
/M: SY='L';  M=-18,-43,-58,-51, -5,-58,-47, 16,-51, 58, -7,-55,-56,-46,-50,-46,-34, 30,-47,-29;
/M: SY='A';  M= 60,-37,-38,-36,-49, 14,-43,-41,-36,-43,-37,-30,-39,-34,-42,  9, 34,-30,-52,-45;
/M: SY='C';  M=-23, 56,-39,-41, 28,-40,-37,-28,-26, 23,-26, 28,-50,-37,-41, 33,-12,-19,-48,-29;
/M: SY='H';  M=-13, -1,-16,-31,-47,-10, 49,-41, -4,-45,-37,-27, 45,-29,  9, 26, 15, -5,-58,-38;
/M: SY='D';  M=-22,-46, 56, 39, -6, -7,-24,-43, -2,-39, 31, 22,-35, 29,-26,  6,-26,-41,-51,-33;
/M: SY='D';  M=-15,-50, 71, 32,-44,  6, 51,-52,-23,-47,-40, -2,-36, 22,-28,-25,-30,-49,-52, 14;
/I:         I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106;
/M: SY='L';  M=-35,-43,-47,-40, 16,-52, 31, 34,-40, 47, -7,-42,-49, 21,-39,-40,-32, 13,-36, 25;
/M: SY='I';  M=-33,-43,-54,-50, 23,-57,-49, 69,-47, 24, 10,-46,-46,-45,-48,-41, -4, 29,-41,-22;
/M: SY='S';  M=-18,-40, 31,  7,-47,-25,-28,-47,-22,-49,-42,-16, 18,-18, 10, 74,-13,-40,-54,-38;
/M: SY='R';  M=-31,-45,  8,-20,-39,-41, 20, -1, 50, -7,-28,-22,-38,-17, 50,  9,  9,-32,-48,-31;
/I:         I=-31; MD=-79;
/M: SY='W';  M=  0,-46, 27,-28,-40,-38,-38,  0, -5,-36,-33,-28,-43, 12,  9, 32,-25, 20, 61,-33; D=-31;
/I:         I=-31; MD=-79;
/M: SY='F';  M=-45,-50,-50,-45, 82,-52,-29,-28,-42,-22,-26,-46, 15, 12,-41,-42,-39,-33,-13, 66; D=-31;
/I:         I=-31; MD=-79;
/M: SY='Q';  M=-32,-49,-30,-23,-49,-40, 31,-43,  7,-44,-35, 15, 12, 46, 43, 10, 20,-16,-54,-35; D=-31;
/I:         I=-31; MD=-79;
/M: SY='G';  M=-29, 45,-46,-53,-50, 69,-50,-44,-48,-17,-41,-33,-50,-47,-54,-17,-41, -2,-55,-51; D=-31;
/I:         I=-31; MI=-79; MD=-79; IM=-79; DM=-79;
/M: SY='R';  M= 24, 30,  6,-23,-51,-36,-32,-49, 20,-47,-39,-26,-43, 26, 47, 20,-28,-41,-52,-40; D=-31;
/I:         I=-31; DM=-79;
/M: SY='T';  M=-32,-43,  8,-26, -8,-41, 36,-36,-27, -4,-30, 16,-40, 39,-12, -1, 55,-34,-55,-31; D=-31;
/I:         I=-31; DM=-79;
/M: SY='G';  M=-20,-45,-34,-39,-48, 78,-38,  1,-35,-45,-38,-21,-38, 16,-41, 20,-31,-39,-45,-42;
/I:         I=-33; MI=0; MD=-84; IM=0; DM=-84;
/M: SY='R';  M=-41,-55,-34,-30,-53,-46, 31,-54, 14,-52,-41, 19, 40,-25, 57,-32, 15,-50,-58,-41; D=-33;
/I:         I=-33; DM=-84;
/M: SY='A';  M= 64,-39,-43,-38,-50,-28,-46,-37,-40,-43,-38,-37,-44,-35,-44, 26,-25,  0,-55,-47; D=-33;
/I:         I=-33; DM=-84;
/M: SY='Y';  M=-46, 22,-51,-50, 35,-56,-27,-29,-40, 13,-24,-48,-59,-42,  4,-43,-11,-33,-20, 80; D=-33;
/I:         I=-33; DM=-84;
/M: SY='L';  M=-34,-41,-51,-41,-15,-54,-37, 17,-42, 65, 26,-48,-50, 21,-40,-42,-31, 11,-42,-24;
/M: SY='F';  M=-44,-42,-58,-53,103,-53,-38,  6,-48, -9, 16,-46,-54,-56,-46,-44,-36,-20,-13,  9;
/M: SY='N';  M= -3,-39, 13,-21,-47,-24,-20,-46, 35,-50,-39, 79,-38,-18,-19, 34,-17,-43,-56,-39;
/M: SY='H';  M=-21,-44,-24,-21,-44,-33, 70,-49, 38,-45,-34, 29,-38,-14, 48, 34,-24,-45,-53,-28;
/M: SY='V';  M= 14, 32,-46,-38,-30,-45,-47,  1,-38,-17,-18,-41,-46, 20,-40,-14,-22, 72,-55,-34;
/M: SY='V';  M= -1,-40,-47, -9, 37,-48,-42, -4,-36,  8, 32,-44,-47,-38,  2,-36,-27, 55, 39,-19;
/M: SY='N';  M=-30,-37, -6,-27,-47,-20,-14,-46,-19,-53,-40,104,-42,-20,-27, 15,-15,-47,-65,-41;
/M: SY='V';  M=-24,-37,-50,-46,-23,-53,-52, 28,-43,  8,-12,-44,-47,-45,-46,-34, 15, 75,-55,-31;
/I:         I=-29; MD=-75;
/M: SY='V';  M=-25,-48,-37,  2,-42,  0,-41, -3,-33,-35,-33,  8,-47,  2,  5,  7,  7, 33,-56,-13; D=-29;
/I:         I=-29; MI=-75; MD=-75; IM=-75; DM=-75;
/M: SY='C';  M=-24, 46,-48,  6, 40,-56,-44,-18,-46,-12,  2,-49,-55,-45,-48,-27,-35, 37,-40, 26; D=-29;
/I:         I=-29; DM=-75;
/M: SY='G';  M=-30,-52,  7,-42,-51, 63,-42,-51,-38,-15, 11,-29,-47,-38,  4,  3,-39,-49,-54,-47; D=-29;
/I:         I=-29; DM=-75;
/M: SY='P';  M=-35,-53, 16, 42,-55, -4,-30,-53, 28,-53,-44, 25, 57,-11,  0,-29,-31,-51,-53,-46; D=-29;
/I:         I=-29; DM=-75;
/M: SY='N';  M= -2, 18,-37,-38,-40,-43,-39, -2, 21,  4,-28, 42,  2,-35,-33,-33,-22, 19,-58,-42; D=-29;
/I:         I=-29; DM=-75;
/M: SY='E';  M= -2,-49,-20, 58,-49,-44,-32,-10,  0,-39,-34,-30, 18, 40,-26,-26, 12, -2,-52,-41; D=-29;
/I:         I=-29; DM=-75;
/M: SY='D';  M= 18,-47, 48, 26,-53, -8, 28,-50,  7,-49,-41, 24,-38, 16,-27,-23, -2,-44,-58,-39; D=-29;
/I:         I=-29; DM=-75;
/M: SY='R';  M=-37,-50,-31, 18, 14,-48,-23,-40, -4, -3,-28,-31,-45,-15, 83,-33,-35,-38,-36, 21;
/M: SY='Y';  M=-30,-45,-37,-31,-25,  4, 33,  9,  9, -3, 27, -7,-43, 30, -1,-31,-29, 32,-39, 34;
/I:         I=-45; MD=-115;
/M: SY='M';  M=  1,-44,-49,-39,-22,-47,-29,-16,-33, 34, 82,-42,-48, 18,  7,-38,-34,-21,-40, 21; D=-45;
/I:         I=-45; MI=-115; IM=-115; DM=-115;
/M: SY='L';  M=-31,-41,-40,-35,-24,-44, 31, 14,  3, 41, 35,-32,-43,-28, 10, 13, 17,-17,-47,-26;
/M: SY='T';  M=-24,-35,-32,-35,-29,  5,-36,-23,-31, -4,-25,-22,-34,-33,-38, -2, 80,  4,-46, 19;
/M: SY='G';  M=-22,-46,-32,-42,-46, 82, 26,-51,-37,-13,-37, 17,-40,-34,-43,-21,-36,-48,-46,-41;
/M: SY='W';  M=-29,-43, -6,-36,-26, 20,-35,-20,-30, 38, 30,-34,-45,-30, 23, 14,-29, -1, 54,-27;
/M: SY='H';  M=-37,-48,-24,-24,  3,-40,113,-46,-26,-35,-25, 18,-41, 26,-24,-25,  6,-46,-49, 33;
/I:         I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90;
/M: SY='T';  M= 18,-37,-32,-31,-35,-36,-33,  0,-25,-10, 29, 22,-38, 13, 14,-10, 49, 14,-51,-33;
/M: SY='V';  M=-23,-37,-53,-47,-24,-55,-56, 26,-45, -9,-12,-48,-49,-47,-47,-37,-21, 84,-57,-31;
/M: SY='A';  M= 55, 52,-39,-31,-42,-30,-37,-29, -6,-34,-30,-31,-41,-27, 33,  5,-24, 17,-50,-39;
/M: SY='D';  M=-37,-51, 91, 22,-54,-36, 48,-55,  8,-51,-46, -8,-36,-20,-26,-26,-29,-52,-67,-35;
/M: SY='I';  M=  1,-41,-53,-49,-22,-53,-54, 69,-46, -7,-10,-46,-45,-45,-49,-37,-25, 57,-49,-30;
/M: SY='Y';  M=-37,-45,-39,-40, 56,-42, 53,-27,-36, -7, 31, 13,-48,-33,-35,  2,-32,-31, 56, 68;
/M: SY='C';  M=-31,143,-51,-51,-41,-47,-51,-48,-47,-39,-39,-37,-62,-55,-53,-34,-31,-36,-71,-52;
/M: SY='V';  M=-25, 40,-32, 11,-34,-43, 14,-10, 21,-24,-23,  9,-42,-29,-28,  6,-22, 58,-56,-34;
/M: SY='C';  M=-30, 48, 27,-20,  4,-20,-28,-31, 25,-41,-36, 31,-40, 41,  4, 14, -3,-41, 40,-30;
/M: SY='C';  M=-31,143,-51,-51,-41,-47,-51,-48,-47,-39,-39,-37,-62,-55,-53,-34,-31,-36,-71,-52;
/M: SY='G';  M=-24,-46,-27,-30,-51, 70, 27,-55, 18,-52,-39, 31,-38, 28,-27,-20,-33,-51,-47,-39;
/M: SY='S';  M= -9,-38,-23, 10,-41,-30,-27,-31,-22,-35, 26, 34,-36, 32, -1, 45, 29,  0,-53,-35;
/M: SY='N';  M=-32,-40,-25,-29, 10,-37,-26, -2, 32, -1,-26, 54,  1,-26,-23,-22, 39,-28,-41, 21;
/M: SY='L';  M=-30,-38,-54,-47,-16,-56,-45, 17,-47, 57, -3,-51,-52,-43,-46,-42,-28, 53,-47,-26;
/M: SY='G';  M=-19,-47,-34,-46,-53, 92,-41,-61,-40,-56,-45,-20,-38,-37,-47,-19,-38,-54,-44,-48;
/M: SY='W';  M=-45,-66,-68,-49, -8,-45,-60,-37,-42, -8,-36,-63,-50,-41,-45,-51,-54,-50,161, 32;
/M: SY='K';  M=-31,-46,-29,-16,-44,-40,-28,-14, 79,-38, 26,-21,-35,-12, 35,  0,-27,-36,-43,-33;
/M: SY='Y';  M=-41,-51,-42,-44,  9,-49,-10,  4,-37,  1,-17,-43,-53,-32,-34,-37,-35,-25, -1,112;
/M: SY='E';  M=-30,-47,-20, 67,-33,-52,-36, 45,-26, -7,-21,-36,-35,-20,-33,-33,-28, 26,-49,-35;
/I:         I=-19; MD=-47;
/M: SY='F';  M= -3,-47,  6, 21, 26,-43, 17,-20, -6,-33, 10,-30,-42, 25, 17,  4,-17,  3,-46,-27; D=-19;
/I:         I=-19; MD=-47;
/M: SY='A';  M= 61,-35,-40,-35,-43,-29,-44,-26,-36,-35,-31,-33,-40,-34,-41, 14, 21, 20,-53,-42; D=-19;
/I:         I=-19; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47;
/M: SY='Y';  M=-37,-48, 15,  0, 37,-46, 32,-33,-35,-32,-31,-31, 15,-34,-38, -7, 27,-14,-30, 58; D=-19;
/I:         I=-19; DM=-47;
/M: SY='E';  M=-33,-53, 33, 68,-56, -5,-28,-56,-18,-52,-47,  3, 19,-15,  9, -8,-32,-51,-56,-46; D=-19;
/I:         I=-19; DM=-47;
/M: SY='P';  M=-34,-49, 17, 19,-43,-44,-34,-33, 29,  9,-30,-29, 34, 20,-25, -2, -2, -6,-52,-39; D=-19;
/I:         I=-19; DM=-47;
/M: SY='S';  M=-10,-41,  3,  3,-49,-27, 28,-49, -4,-51,-43, 26,-38,-21,-30, 69,-15,-43,-58,-38; D=-19;
/I:         I=-19; DM=-47;
/M: SY='Q';  M=-28,-51,-24, 24,-50,-38,-22,-40,-15, -5,-27,-23, 14, 96,-17,  8,-29,-41,-44,-33;
/M: SY='K';  M=-31,-45,-29, 11,-40,-44,-30,-29, 61, -7,-27,-25,-38, 11, 42,-28, -4, 14,-46,-34;
/M: SY='Y';  M=-38,-50,-44,-46, 21, -4,-17, 35,-39,-18,-17,-41,-50,-35,-38,-36,-34,-19, -7,101;
/M: SY='K';  M=-33,-47,-29,-16,-43,-42,-28, -6, 80,-37, 26,-22,-36,-12, 38,-29,-29,-35,-43,-33;
/M: SY='E';  M= -4,-48, 14, 79,-50,-40,-24, -9,-15,-41,-37, 15,-30, 30,-23,-24,-29,-38,-51,-41;
/M: SY='G';  M=-21,-46,-32,-37,-51, 82,-38,-57, 25,-53,-43,-20,-37,-31,-32,-20, -8,-50,-44,-45;
/M: SY='K';  M=-34,-49,-27,-15,-46,-41, 47,-47, 68,-41, 13,-20,-37, 34, 50,-28,-31,-44,-46,-29;
/M: SY='F';  M= -6,-40,-48,-45, 86,-43,-34,-18,-42,-16,-22,-40,-50,-45,-42, 16,-28, 14,-18, 39;
/M: SY='I';  M=-32, 31,-55,-50,-20,-56,-49, 66,-46, 22, 39,-46,-47,-44,-48,-42,-28, 38,-47,-28;
/M: SY='L';  M=-36,-41,-55,-48, 26,-55,-38, 36,-46, 58, 56,-49,-50,-41,-44,-45,-32, -6,-38,-18;
/M: SY='E';  M=-31,-47,-11, 76,-41,-46,-27,  3,-16, -9,-30, 13,-32,-12, 10,-29,-29,  4,-50,-38;
/M: SY='M';  M=-34,-43,-36,-31,-25,-44,-27,-18, 20, 34, 48, 26,-46,-23, 45,-34,-29,  0,-43,  0;
/M: SY='A';  M= 39,-40,-28,  7, -4, 12,-28,-35, 18,-15, 22, 24,-38, 10,-26, -6,-26,-31,-40,  7;
/M: SY='K';  M=-35,-45,  3,-21,-32,-41, 41,-36, 51,  7,-26, 21,-40,-18, 36,-27,  4,-36,-42, 20;
/M: SY='M';  M= -9,-40,  1,-42,  5,-50,-41, 36,-43, 37, 50,-43,-47,-40,-44,-39,-28, 37,-45,-24;
/M: SY='C';  M= -1, 57,-38,-11,-29, -4,-40,  3,-34, 17,-22, 11,-44,-34, -8,-15, 16, 20, 52,-32;
/M: SY='K';  M=-36,-50, 25, 10,-34,  3,-30,-36, 47, 17,-28,-27,-42, 15,-19,-32,-34,-38,-42, 18;
/M: SY='W';  M=-19, 18, 13, 30,-41,-43,-38,-15,-28,-40, 24,-36, 47,  8, -4,-10,-34,-41, 88,-32;
/M: SY='W';  M= -2,-48, 13,  6,-34,  0, 37,-22,-28,-38, 24, 40,-43,-27, -2,-28, -5,-40, 68, 18;
/I:         E1=0; IE=-380; DE=-380;
» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH PS51788; PS51789; PS51790; PS51793

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2019_10 which contains 561'356 sequence entries.


Total number of hits 39 in 39 different sequences
Number of true positive hits 39 in 39 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Yippee
Version [info] 3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
39 sequences

MOH1_YEAST  (P38191    ), YIPL1_ARATH (Q9SR97    ), YIPL3_ARATH (Q9C777    ), 
YIPL4_ARATH (Q9LY56    ), YIPL5_ARATH (Q2V3E2    ), YIPL6_ARATH (Q9T096    ), 
YIPL7_ARATH (Q9FN32    ), YIPL_ORYSJ  (Q8S5M8    ), YIPL_SCHPO  (Q9URW3    ), 
YIPL_SOLTU  (P59234    ), YIPP_DROME  (Q9XZF0    ), YPEL1_CHLAE (Q65Z59    ), 
YPEL1_COTJA (Q9DG42    ), YPEL1_HUMAN (O60688    ), YPEL1_MOUSE (Q9ESC7    ), 
YPEL2_BOVIN (Q2YDI3    ), YPEL2_CHLAE (Q65Z58    ), YPEL2_HUMAN (Q96QA6    ), 
YPEL2_MOUSE (Q65Z95    ), YPEL2_PONAB (Q5RDN9    ), YPEL3_BOVIN (A6QPH8    ), 
YPEL3_CHLAE (Q65Z57    ), YPEL3_DANRE (Q6NWI4    ), YPEL3_HUMAN (P61236    ), 
YPEL3_MOUSE (P61237    ), YPEL3_ORYLA (Q65Z54    ), YPEL4_CHLAE (Q65Z56    ), 
YPEL4_HUMAN (Q96NS1    ), YPEL4_MOUSE (Q65Z93    ), YPEL4_RAT   (Q5XID5    ), 
YPEL5_BOVIN (Q3ZBE7    ), YPEL5_CHLAE (Q65Z55    ), YPEL5_HUMAN (P62699    ), 
YPEL5_MACFA (Q4R4Q6    ), YPEL5_MOUSE (P62700    ), YPEL5_PONAB (Q5RDU7    ), 
YPL1_CAEEL  (Q9U3G6    ), YPL1_DROME  (Q9W2X7    ), YPL2_CAEEL  (O44440    )
» more


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission