PROSITE entry PS51792
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | YIPPEE |
| Accession [info] | PS51792 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-FEB-2016 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51792 |
| Associated ProRule [info] | PRU01128 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Yippee domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=98; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=93; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3076599; R2=0.0090335; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=14664.4541016; R2=8.8706064; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=852; H_SCORE=22222; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=465; H_SCORE=18789; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-18; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=0; BI=-380; BD=-380; /M: SY='R'; M=-17,-53, 10,-21,-50,-43, 33,-17, 26,-33,-35, -9, 2, 39, 49, -9,-33,-43,-53,-35; /M: SY='T'; M=-33, 34,-44,-41,-27,-49,-39, 18, -4, 14, 25,-36,-46,-37,-16, -5, 39, 1,-46, 19; /M: SY='Y'; M=-44,-52,-46, -7, 53,-55,-25, 23,-43, -8,-21,-47,-54,-40,-42,-43,-38,-23,-14, 85; /M: SY='S'; M=-29,-45,-36,-36, 0, 5, 33,-21, -9,-35, 25, -4,-44,-29, 13, 36, 5,-11,-45, 20; /M: SY='C'; M=-35,139,-55,-55,-46,-51,-55,-52,-51,-43,-43,-41,-66,-59,-58,-38,-35,-40,-75,-56; /M: SY='R'; M= 14, 9,-33,-32,-46, -4,-34,-16, 12,-41,-35, 34,-45,-27, 46,-26, 4, 1,-55,-41; /M: SY='H'; M=-36,-49,-28,-28,-15,-40, 65,-44, 21,-31,-34, 44,-45, 2, 37, 3,-30,-20,-54, -9; /M: SY='C'; M=-35,139,-55,-55,-46,-51,-55,-52,-51,-43,-43,-41,-66,-59,-58,-38,-35,-40,-75,-56; /M: SY='R'; M=-36,-52, 0, -2,-52, 22, 42,-57, 26,-52,-41, 29,-43, -4, 51,-29,-35,-53,-55,-37; /M: SY='T'; M= 9,-37,-28,-34,-43,-36,-37,-33,-31,-39,-35, 38,-37,-34,-39,-13, 77,-11,-62,-41; /M: SY='H'; M=-41,-55, 21,-24,-36,-43, 92,-18,-29,-41,-31, 16, 2, 41,-29,-31,-36,-47,-49, 36; /M: SY='L'; M=-18,-43,-58,-51, -5,-58,-47, 16,-51, 58, -7,-55,-56,-46,-50,-46,-34, 30,-47,-29; /M: SY='A'; M= 60,-37,-38,-36,-49, 14,-43,-41,-36,-43,-37,-30,-39,-34,-42, 9, 34,-30,-52,-45; /M: SY='C'; M=-23, 56,-39,-41, 28,-40,-37,-28,-26, 23,-26, 28,-50,-37,-41, 33,-12,-19,-48,-29; /M: SY='H'; M=-13, -1,-16,-31,-47,-10, 49,-41, -4,-45,-37,-27, 45,-29, 9, 26, 15, -5,-58,-38; /M: SY='D'; M=-22,-46, 56, 39, -6, -7,-24,-43, -2,-39, 31, 22,-35, 29,-26, 6,-26,-41,-51,-33; /M: SY='D'; M=-15,-50, 71, 32,-44, 6, 51,-52,-23,-47,-40, -2,-36, 22,-28,-25,-30,-49,-52, 14; /I: I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106; /M: SY='L'; M=-35,-43,-47,-40, 16,-52, 31, 34,-40, 47, -7,-42,-49, 21,-39,-40,-32, 13,-36, 25; /M: SY='I'; M=-33,-43,-54,-50, 23,-57,-49, 69,-47, 24, 10,-46,-46,-45,-48,-41, -4, 29,-41,-22; /M: SY='S'; M=-18,-40, 31, 7,-47,-25,-28,-47,-22,-49,-42,-16, 18,-18, 10, 74,-13,-40,-54,-38; /M: SY='R'; M=-31,-45, 8,-20,-39,-41, 20, -1, 50, -7,-28,-22,-38,-17, 50, 9, 9,-32,-48,-31; /I: I=-31; MD=-79; /M: SY='W'; M= 0,-46, 27,-28,-40,-38,-38, 0, -5,-36,-33,-28,-43, 12, 9, 32,-25, 20, 61,-33; D=-31; /I: I=-31; MD=-79; /M: SY='F'; M=-45,-50,-50,-45, 82,-52,-29,-28,-42,-22,-26,-46, 15, 12,-41,-42,-39,-33,-13, 66; D=-31; /I: I=-31; MD=-79; /M: SY='Q'; M=-32,-49,-30,-23,-49,-40, 31,-43, 7,-44,-35, 15, 12, 46, 43, 10, 20,-16,-54,-35; D=-31; /I: I=-31; MD=-79; /M: SY='G'; M=-29, 45,-46,-53,-50, 69,-50,-44,-48,-17,-41,-33,-50,-47,-54,-17,-41, -2,-55,-51; D=-31; /I: I=-31; MI=-79; MD=-79; IM=-79; DM=-79; /M: SY='R'; M= 24, 30, 6,-23,-51,-36,-32,-49, 20,-47,-39,-26,-43, 26, 47, 20,-28,-41,-52,-40; D=-31; /I: I=-31; DM=-79; /M: SY='T'; M=-32,-43, 8,-26, -8,-41, 36,-36,-27, -4,-30, 16,-40, 39,-12, -1, 55,-34,-55,-31; D=-31; /I: I=-31; DM=-79; /M: SY='G'; M=-20,-45,-34,-39,-48, 78,-38, 1,-35,-45,-38,-21,-38, 16,-41, 20,-31,-39,-45,-42; /I: I=-33; MI=0; MD=-84; IM=0; DM=-84; /M: SY='R'; M=-41,-55,-34,-30,-53,-46, 31,-54, 14,-52,-41, 19, 40,-25, 57,-32, 15,-50,-58,-41; D=-33; /I: I=-33; DM=-84; /M: SY='A'; M= 64,-39,-43,-38,-50,-28,-46,-37,-40,-43,-38,-37,-44,-35,-44, 26,-25, 0,-55,-47; D=-33; /I: I=-33; DM=-84; /M: SY='Y'; M=-46, 22,-51,-50, 35,-56,-27,-29,-40, 13,-24,-48,-59,-42, 4,-43,-11,-33,-20, 80; D=-33; /I: I=-33; DM=-84; /M: SY='L'; M=-34,-41,-51,-41,-15,-54,-37, 17,-42, 65, 26,-48,-50, 21,-40,-42,-31, 11,-42,-24; /M: SY='F'; M=-44,-42,-58,-53,103,-53,-38, 6,-48, -9, 16,-46,-54,-56,-46,-44,-36,-20,-13, 9; /M: SY='N'; M= -3,-39, 13,-21,-47,-24,-20,-46, 35,-50,-39, 79,-38,-18,-19, 34,-17,-43,-56,-39; /M: SY='H'; M=-21,-44,-24,-21,-44,-33, 70,-49, 38,-45,-34, 29,-38,-14, 48, 34,-24,-45,-53,-28; /M: SY='V'; M= 14, 32,-46,-38,-30,-45,-47, 1,-38,-17,-18,-41,-46, 20,-40,-14,-22, 72,-55,-34; /M: SY='V'; M= -1,-40,-47, -9, 37,-48,-42, -4,-36, 8, 32,-44,-47,-38, 2,-36,-27, 55, 39,-19; /M: SY='N'; M=-30,-37, -6,-27,-47,-20,-14,-46,-19,-53,-40,104,-42,-20,-27, 15,-15,-47,-65,-41; /M: SY='V'; M=-24,-37,-50,-46,-23,-53,-52, 28,-43, 8,-12,-44,-47,-45,-46,-34, 15, 75,-55,-31; /I: I=-29; MD=-75; /M: SY='V'; M=-25,-48,-37, 2,-42, 0,-41, -3,-33,-35,-33, 8,-47, 2, 5, 7, 7, 33,-56,-13; D=-29; /I: I=-29; MI=-75; MD=-75; IM=-75; DM=-75; /M: SY='C'; M=-24, 46,-48, 6, 40,-56,-44,-18,-46,-12, 2,-49,-55,-45,-48,-27,-35, 37,-40, 26; D=-29; /I: I=-29; DM=-75; /M: SY='G'; M=-30,-52, 7,-42,-51, 63,-42,-51,-38,-15, 11,-29,-47,-38, 4, 3,-39,-49,-54,-47; D=-29; /I: I=-29; DM=-75; /M: SY='P'; M=-35,-53, 16, 42,-55, -4,-30,-53, 28,-53,-44, 25, 57,-11, 0,-29,-31,-51,-53,-46; D=-29; /I: I=-29; DM=-75; /M: SY='N'; M= -2, 18,-37,-38,-40,-43,-39, -2, 21, 4,-28, 42, 2,-35,-33,-33,-22, 19,-58,-42; D=-29; /I: I=-29; DM=-75; /M: SY='E'; M= -2,-49,-20, 58,-49,-44,-32,-10, 0,-39,-34,-30, 18, 40,-26,-26, 12, -2,-52,-41; D=-29; /I: I=-29; DM=-75; /M: SY='D'; M= 18,-47, 48, 26,-53, -8, 28,-50, 7,-49,-41, 24,-38, 16,-27,-23, -2,-44,-58,-39; D=-29; /I: I=-29; DM=-75; /M: SY='R'; M=-37,-50,-31, 18, 14,-48,-23,-40, -4, -3,-28,-31,-45,-15, 83,-33,-35,-38,-36, 21; /M: SY='Y'; M=-30,-45,-37,-31,-25, 4, 33, 9, 9, -3, 27, -7,-43, 30, -1,-31,-29, 32,-39, 34; /I: I=-45; MD=-115; /M: SY='M'; M= 1,-44,-49,-39,-22,-47,-29,-16,-33, 34, 82,-42,-48, 18, 7,-38,-34,-21,-40, 21; D=-45; /I: I=-45; MI=-115; IM=-115; DM=-115; /M: SY='L'; M=-31,-41,-40,-35,-24,-44, 31, 14, 3, 41, 35,-32,-43,-28, 10, 13, 17,-17,-47,-26; /M: SY='T'; M=-24,-35,-32,-35,-29, 5,-36,-23,-31, -4,-25,-22,-34,-33,-38, -2, 80, 4,-46, 19; /M: SY='G'; M=-22,-46,-32,-42,-46, 82, 26,-51,-37,-13,-37, 17,-40,-34,-43,-21,-36,-48,-46,-41; /M: SY='W'; M=-29,-43, -6,-36,-26, 20,-35,-20,-30, 38, 30,-34,-45,-30, 23, 14,-29, -1, 54,-27; /M: SY='H'; M=-37,-48,-24,-24, 3,-40,113,-46,-26,-35,-25, 18,-41, 26,-24,-25, 6,-46,-49, 33; /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90; /M: SY='T'; M= 18,-37,-32,-31,-35,-36,-33, 0,-25,-10, 29, 22,-38, 13, 14,-10, 49, 14,-51,-33; /M: SY='V'; M=-23,-37,-53,-47,-24,-55,-56, 26,-45, -9,-12,-48,-49,-47,-47,-37,-21, 84,-57,-31; /M: SY='A'; M= 55, 52,-39,-31,-42,-30,-37,-29, -6,-34,-30,-31,-41,-27, 33, 5,-24, 17,-50,-39; /M: SY='D'; M=-37,-51, 91, 22,-54,-36, 48,-55, 8,-51,-46, -8,-36,-20,-26,-26,-29,-52,-67,-35; /M: SY='I'; M= 1,-41,-53,-49,-22,-53,-54, 69,-46, -7,-10,-46,-45,-45,-49,-37,-25, 57,-49,-30; /M: SY='Y'; M=-37,-45,-39,-40, 56,-42, 53,-27,-36, -7, 31, 13,-48,-33,-35, 2,-32,-31, 56, 68; /M: SY='C'; M=-31,143,-51,-51,-41,-47,-51,-48,-47,-39,-39,-37,-62,-55,-53,-34,-31,-36,-71,-52; /M: SY='V'; M=-25, 40,-32, 11,-34,-43, 14,-10, 21,-24,-23, 9,-42,-29,-28, 6,-22, 58,-56,-34; /M: SY='C'; M=-30, 48, 27,-20, 4,-20,-28,-31, 25,-41,-36, 31,-40, 41, 4, 14, -3,-41, 40,-30; /M: SY='C'; M=-31,143,-51,-51,-41,-47,-51,-48,-47,-39,-39,-37,-62,-55,-53,-34,-31,-36,-71,-52; /M: SY='G'; M=-24,-46,-27,-30,-51, 70, 27,-55, 18,-52,-39, 31,-38, 28,-27,-20,-33,-51,-47,-39; /M: SY='S'; M= -9,-38,-23, 10,-41,-30,-27,-31,-22,-35, 26, 34,-36, 32, -1, 45, 29, 0,-53,-35; /M: SY='N'; M=-32,-40,-25,-29, 10,-37,-26, -2, 32, -1,-26, 54, 1,-26,-23,-22, 39,-28,-41, 21; /M: SY='L'; M=-30,-38,-54,-47,-16,-56,-45, 17,-47, 57, -3,-51,-52,-43,-46,-42,-28, 53,-47,-26; /M: SY='G'; M=-19,-47,-34,-46,-53, 92,-41,-61,-40,-56,-45,-20,-38,-37,-47,-19,-38,-54,-44,-48; /M: SY='W'; M=-45,-66,-68,-49, -8,-45,-60,-37,-42, -8,-36,-63,-50,-41,-45,-51,-54,-50,161, 32; /M: SY='K'; M=-31,-46,-29,-16,-44,-40,-28,-14, 79,-38, 26,-21,-35,-12, 35, 0,-27,-36,-43,-33; /M: SY='Y'; M=-41,-51,-42,-44, 9,-49,-10, 4,-37, 1,-17,-43,-53,-32,-34,-37,-35,-25, -1,112; /M: SY='E'; M=-30,-47,-20, 67,-33,-52,-36, 45,-26, -7,-21,-36,-35,-20,-33,-33,-28, 26,-49,-35; /I: I=-19; MD=-47; /M: SY='F'; M= -3,-47, 6, 21, 26,-43, 17,-20, -6,-33, 10,-30,-42, 25, 17, 4,-17, 3,-46,-27; D=-19; /I: I=-19; MD=-47; /M: SY='A'; M= 61,-35,-40,-35,-43,-29,-44,-26,-36,-35,-31,-33,-40,-34,-41, 14, 21, 20,-53,-42; D=-19; /I: I=-19; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47; /M: SY='Y'; M=-37,-48, 15, 0, 37,-46, 32,-33,-35,-32,-31,-31, 15,-34,-38, -7, 27,-14,-30, 58; D=-19; /I: I=-19; DM=-47; /M: SY='E'; M=-33,-53, 33, 68,-56, -5,-28,-56,-18,-52,-47, 3, 19,-15, 9, -8,-32,-51,-56,-46; D=-19; /I: I=-19; DM=-47; /M: SY='P'; M=-34,-49, 17, 19,-43,-44,-34,-33, 29, 9,-30,-29, 34, 20,-25, -2, -2, -6,-52,-39; D=-19; /I: I=-19; DM=-47; /M: SY='S'; M=-10,-41, 3, 3,-49,-27, 28,-49, -4,-51,-43, 26,-38,-21,-30, 69,-15,-43,-58,-38; D=-19; /I: I=-19; DM=-47; /M: SY='Q'; M=-28,-51,-24, 24,-50,-38,-22,-40,-15, -5,-27,-23, 14, 96,-17, 8,-29,-41,-44,-33; /M: SY='K'; M=-31,-45,-29, 11,-40,-44,-30,-29, 61, -7,-27,-25,-38, 11, 42,-28, -4, 14,-46,-34; /M: SY='Y'; M=-38,-50,-44,-46, 21, -4,-17, 35,-39,-18,-17,-41,-50,-35,-38,-36,-34,-19, -7,101; /M: SY='K'; M=-33,-47,-29,-16,-43,-42,-28, -6, 80,-37, 26,-22,-36,-12, 38,-29,-29,-35,-43,-33; /M: SY='E'; M= -4,-48, 14, 79,-50,-40,-24, -9,-15,-41,-37, 15,-30, 30,-23,-24,-29,-38,-51,-41; /M: SY='G'; M=-21,-46,-32,-37,-51, 82,-38,-57, 25,-53,-43,-20,-37,-31,-32,-20, -8,-50,-44,-45; /M: SY='K'; M=-34,-49,-27,-15,-46,-41, 47,-47, 68,-41, 13,-20,-37, 34, 50,-28,-31,-44,-46,-29; /M: SY='F'; M= -6,-40,-48,-45, 86,-43,-34,-18,-42,-16,-22,-40,-50,-45,-42, 16,-28, 14,-18, 39; /M: SY='I'; M=-32, 31,-55,-50,-20,-56,-49, 66,-46, 22, 39,-46,-47,-44,-48,-42,-28, 38,-47,-28; /M: SY='L'; M=-36,-41,-55,-48, 26,-55,-38, 36,-46, 58, 56,-49,-50,-41,-44,-45,-32, -6,-38,-18; /M: SY='E'; M=-31,-47,-11, 76,-41,-46,-27, 3,-16, -9,-30, 13,-32,-12, 10,-29,-29, 4,-50,-38; /M: SY='M'; M=-34,-43,-36,-31,-25,-44,-27,-18, 20, 34, 48, 26,-46,-23, 45,-34,-29, 0,-43, 0; /M: SY='A'; M= 39,-40,-28, 7, -4, 12,-28,-35, 18,-15, 22, 24,-38, 10,-26, -6,-26,-31,-40, 7; /M: SY='K'; M=-35,-45, 3,-21,-32,-41, 41,-36, 51, 7,-26, 21,-40,-18, 36,-27, 4,-36,-42, 20; /M: SY='M'; M= -9,-40, 1,-42, 5,-50,-41, 36,-43, 37, 50,-43,-47,-40,-44,-39,-28, 37,-45,-24; /M: SY='C'; M= -1, 57,-38,-11,-29, -4,-40, 3,-34, 17,-22, 11,-44,-34, -8,-15, 16, 20, 52,-32; /M: SY='K'; M=-36,-50, 25, 10,-34, 3,-30,-36, 47, 17,-28,-27,-42, 15,-19,-32,-34,-38,-42, 18; /M: SY='W'; M=-19, 18, 13, 30,-41,-43,-38,-15,-28,-40, 24,-36, 47, 8, -4,-10,-34,-41, 88,-32; /M: SY='W'; M= -2,-48, 13, 6,-34, 0, 37,-22,-28,-38, 24, 40,-43,-27, -2,-28, -5,-40, 68, 18; /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;» more |
Post-processing [info]
| COMPETES_HIT_WITH | PS51788; PS51789; PS51790; PS51793 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 39 in 39 different sequences |
| Number of true positive hits | 39 in 39 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Yippee |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
39 sequences
MOH1_YEAST (P38191), YIPL1_ARATH (Q9SR97), YIPL3_ARATH (Q9C777), YIPL4_ARATH (Q9LY56), YIPL5_ARATH (Q2V3E2), YIPL6_ARATH (Q9T096), YIPL7_ARATH (Q9FN32), YIPL_ORYSJ (Q8S5M8), YIPL_SCHPO (Q9URW3), YIPL_SOLTU (P59234), YIPP_DROME (Q9XZF0), YPEL1_CHLAE (Q65Z59), YPEL1_COTJA (Q9DG42), YPEL1_HUMAN (O60688), YPEL1_MOUSE (Q9ESC7), YPEL2_BOVIN (Q2YDI3), YPEL2_CHLAE (Q65Z58), YPEL2_HUMAN (Q96QA6), YPEL2_MOUSE (Q65Z95), YPEL2_PONAB (Q5RDN9), YPEL3_BOVIN (A6QPH8), YPEL3_CHLAE (Q65Z57), YPEL3_DANRE (Q6NWI4), YPEL3_HUMAN (P61236), YPEL3_MOUSE (P61237), YPEL3_ORYLA (Q65Z54), YPEL4_CHLAE (Q65Z56), YPEL4_HUMAN (Q96NS1), YPEL4_MOUSE (Q65Z93), YPEL4_RAT (Q5XID5), YPEL5_BOVIN (Q3ZBE7), YPEL5_CHLAE (Q65Z55), YPEL5_HUMAN (P62699), YPEL5_MACFA (Q4R4Q6), YPEL5_MOUSE (P62700), YPEL5_PONAB (Q5RDU7), YPL1_CAEEL (Q9U3G6), YPL1_DROME (Q9W2X7), YPL2_CAEEL (O44440)» more
|
| PDB [Detailed view] |
1 PDB
8QBN |