PROSITE entry PS51714
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | G_BMS1 |
| Accession [info] | PS51714 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-APR-2014 CREATED;
12-AUG-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51714 |
| Associated ProRule [info] | PRU01051 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Bms1-type guanine nucleotide-binding (G) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=163; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=158; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.1958400; R2=0.0110559; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1340; N_SCORE=15.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=571; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='P'; M= 16, -7,-25, -5, 1,-22, -8,-11, -6, 2,-12, -6, -9, 20, 2,-10, 2, 7, -3,-39,-25, -3; /M: SY='P'; M= -8,-16,-28, -7, 11,-38,-10, 8,-28, 9,-28,-36,-25, 93, 3, -9, -8, 0,-37,-29,-20, 2; /M: SY='R'; M= -7,-14,-27,-12, -4, -2,-17, -2,-14, 9,-10, 3,-11, 0, 5, 20, -7,-14,-10,-15, 0, -3; /M: SY='I'; M= -2,-16,-18,-24,-21, 8,-19,-12, 31,-16, 19, 10, -9,-30,-18,-17,-12, 1, 25,-25, 7,-21; /M: SY='V'; M= 7,-18,-16,-22,-26, 5,-24,-26, 36,-18, 11, 3,-14,-34,-23,-13, -9, 7, 39,-29, 3,-25; /M: SY='A'; M= 18, -6,-16, -9, -9,-13, -7,-21, 5, -7, -4, 1, -3,-14, -4,-14, 7, 12, 10,-37,-22, -9; /M: SY='I'; M= 4,-17,-17,-23,-24, 8,-21,-22, 38,-18, 16, 6,-13,-33,-23,-17,-11, 4, 36,-27, 6,-24; /M: SY='I'; M= 3,-17,-16,-25,-24, 8,-20,-22, 38,-18, 17, 7,-12,-33,-22,-17,-11, 4, 34,-27, 5,-24; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='P'; M= 1, -6,-13, -5, 1,-14, -1, -2, -9, 1,-11,-12, -8, 21, 0, -5, 2, 2,-12,-15,-11, -2; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='L'; M= -3, -6, -4, -8, -7, 1, 0, -9, 6, -9, 11, 5, -8,-14,-11,-11, -8, -2, 0,-10, 4, -7; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='P'; M= -1, -4, -4, -4, 0,-14, -5, -1, -8, -3, -8, -8, -3, 7, -3, -8, 4, 3,-10,-20,-13, -2; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='P'; M= -1, -7,-24, 1, 8,-29, -8, -1,-22, 6,-19,-22,-14, 46, 1, -7, 0, 0,-24,-30,-18, 1; /M: SY='D'; M= -1, 3,-16, 7, -6, -7, -5,-15, -2, -8, 7, -1, -4,-18,-11,-13, -4, -1, -4,-24, 1, -8; /M: SY='V'; M= 4, -7, 2, -9, -8,-11,-14,-18, 5,-12, -3, -6, -5,-21,-12,-13, 3, 5, 7,-30,-15,-11; /M: SY='D'; M= 1, 13,-23, 19, 2,-27, 7,-13,-18, 0,-14,-15, 8, -6, -4, -9, 3, -5,-19,-26,-19, -2; /M: SY='D'; M= 7, 7,-21, 9, 2,-20, -5,-16,-10, 4,-10, -5, 4, -4, -4, -9, 4, 3, -8,-33,-18, -2; /M: SY='I'; M= 2, -9,-17,-10, -9, -6,-13,-15, 7, -8, 1, -2, -8,-17, -8,-10, 0, 4, 7,-21, -4,-10; /M: SY='D'; M= 5, 11,-20, 14, 0,-21, -8,-11,-13, -1, -8, -6, 8,-10, 0, -9, 4, 5,-10,-34,-15, -1; /M: SY='I'; M= 5,-14,-17,-16,-15, 1,-17,-17, 18,-11, 8, 1,-13,-13,-16,-15, -6, 5, 17,-29, -1,-16; /M: SY='A'; M= 4, -7,-18, -8, -4,-11,-13,-11, 2, -3, -3, 1, -5,-13, 1, -1, -2, -1, 2,-25, -9, -4; /M: SY='E'; M= 5, 2,-20, 5, 10,-19, -8,-13,-16, 10,-14, -2, 0, -4, 8, 4, 4, -4,-14,-23,-15, 7; /M: SY='I'; M= 6, -6,-19, -9, -9, -1, -9,-17, 7, -7, 3, 1, -5,-20, -7,-11, 1, 3, 7,-26, -7,-10; /M: SY='I'; M= -4,-14, -9,-19,-17, 13,-19,-15, 29,-17, 28, 15,-15,-31,-20,-19,-15, 1, 21,-22, 16,-17; /M: SY='I'; M= 2, -4,-10, -7, -3, -7,-13,-15, 3, -4, 1, 2, -2,-18, -4, -7, -4, -1, 2,-25, -7, -4; /M: SY='K'; M= 4, -1,-21, 0, 6,-15, -6,-13,-12, 7, -9, 0, -1, -6, 5, 0, 1, -3,-12,-22,-12, 4; /M: SY='L'; M= -1,-10,-14,-14, -9, 2,-15, -4, 6, -8, 9, 7, -8,-19,-10,-11, -5, 0, 3,-25, 0,-10; /M: SY='L'; M= -4, -9, -6,-11, -9, 2,-15,-18, 2, -8, 7, 1, -7,-21,-11,-10, -8, -3, 3,-16, 1,-11; /M: SY='S'; M= 6, 5,-22, 5, 2,-21, 3,-15,-12, 2,-13, -8, 4, -7, -1, -9, 9, 3,-13,-26,-18, 0; /M: SY='C'; M= 2, -3, 3, -5, 3,-20, -6,-14,-10, -3,-10, -7, -2,-10, -3, -9, 3, -2,-11,-25,-23, -1; /M: SY='D'; M= 1, 10,-21, 21, 4,-24,-11, -9,-14, -1, -7,-11, 0, -8, -3, -7, 0, -3, -9,-29, -8, 0; /M: SY='D'; M= 3, 8,-17, 14, 9,-25, -5,-13,-15, 2, -9,-11, 1, -3, 0,-10, 3, -2,-13,-26,-15, 5; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='E'; M= 3, 0,-13, 3, 5,-17, -7, -7, -7, 1, -7, -5, -2, -2, 2, -5, 2, 0, -6,-21,-10, 3; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: SY='A'; M= 2, -3,-12, -5, -3, -7, -6, -9, 2, -3, -1, -2, -1, -7, -3, -7, -1, 1, 2,-17, -6, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='V'; M= 2, -5,-15, -5, -6, -6,-10, -9, 4, -4, 0, -2, -4,-10, -5, -6, -1, 1, 5,-19, -3, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='A'; M= 2, -2,-17, -1, -1,-12, -8, -7, -3, -1, -3, -3, -3, -4, -2, -7, 0, 2, -3,-20, -6, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='I'; M= 0, -6,-16, -9, -7, -6,-10,-11, 4, -6, -1, -4, -3,-11, -9,-12, 0, 3, 2,-23, -6, -9; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='A'; M= 4, -1,-18, 0, 3,-18, -7,-10, -9, 2,-10, -7, -1, 0, 0, -8, 3, 1,-11,-27,-15, 0; /M: SY='S'; M= 3, 0,-20, 2, 3,-20, -2, -8,-12, 0,-10, -8, -2, -2, 0, -8, 4, -1,-13,-24,-15, 0; /M: SY='A'; M= 1, -5,-15, -6, -2,-16, -8,-10, -4, -4, -7, -8, -5, -3, -3, -9, 0, 0, -6,-23,-12, -3; /M: SY='G'; M= 1, -1,-25, -5, -5,-18, 15,-13,-10, -1,-13, -8, 1, -5, -4, -6, 1, -6,-16,-17,-17, -6; /M: SY='I'; M= 1,-11,-17,-15,-11,-12, -2,-13, 5, -8, -2, -5, -8, -8, -9,-12, -3, 1, 0,-21,-10,-12; /M: SY='T'; M= -3,-13,-16,-18,-15, 0,-15,-15, 3, -8, -1, -8, -7, -3,-12,-14, -1, 7, 3,-22, -4,-15; /M: SY='H'; M= -2,-10,-25,-14,-12,-10,-18, 7, 1, -8, -2, 1, -5, -8, -5, -9, 1, 6, 3,-30, -3,-10; /M: SY='I'; M= 2,-13,-13,-19,-19, 4,-19,-18, 21,-14, 14, 6, -9,-26,-16,-18, -6, 8, 20,-27, 3,-18; /M: SY='T'; M= 1, -5,-18, -8, -8, -4,-12,-15, 2, -4, -3, -2, -2,-16, -8, -6, 1, 3, 3,-23, -5, -9; /M: SY='I'; M= 4,-14,-11,-19,-18, 3,-16,-20, 21,-13, 8, 1, -9,-27,-16,-14, -4, 4, 21,-26, -3,-19; /M: SY='P'; M= 2, -3,-22, 3, 8,-27, -7, -4,-17, 5,-16,-16, -8, 25, 2, -8, 2, 1,-18,-28,-17, 3; /M: SY='R'; M= -3,-10,-22, -7, -5,-12,-10,-11,-21, 8,-17, -2, -8, -8, 15, 39, -2,-15,-12,-12, -8, -1; /M: SY='F'; M=-14,-20,-28,-28,-20, 47,-22,-14, -3, -4, 11, -5,-11,-24,-16, -5, -9,-13, 1, -1, 20,-21; /M: SY='K'; M= -1, -1,-26, -1, 12,-11,-11,-15,-18, 28,-18, 13, 1, 3, 4, 15, 0, -9,-17,-21,-10, 7; /M: SY='Q'; M= 6, -7,-19, -8, 5,-16,-16, -6,-12, 2,-13, -4, -5, -5, 29, 11, 2, 4,-14,-22,-10, 12; /M: SY='R'; M= -4,-10,-22, -7, -5,-10,-14, -9,-20, 10,-17, 2, -7, -8, 15, 41, -1,-14,-11,-15, -7, -1; /M: SY='F'; M=-10,-20,-19,-26,-23, 33,-22,-17, 19,-15, 24, 4,-15,-32,-21,-15,-14, -5, 18, -8, 23,-23; /M: SY='T'; M= 6, -6,-16,-10, -3,-18,-14,-12, -8, -2, -8, -3, -1, -6, 16, -4, 7, 17, -7,-27,-11, 3; /M: SY='F'; M=-15,-25,-25,-36,-31, 61,-26,-23, 12,-13, 23, -8,-14,-34,-25,-13,-13,-11, 16, 1, 28,-31; /M: SY='I'; M= -3,-17,-17,-23,-22, 14,-19,-15, 30,-17, 21, 8,-12,-31,-21,-18,-12, 1, 25,-21, 12,-22; /M: SY='E'; M= 1, -8, -4, -7, 6,-18,-18,-11, -2, -3, -2, -7, -9, 2, -1,-12, -4, 0, -3,-27,-12, 3; /M: SY='P'; M= -2,-14, 8,-12, 1,-20,-17,-13, -7, -5, -7,-14,-17, 25, -8,-13, -8, 0,-10,-30,-20, -5; /M: SY='P'; M= 0, 2,-25, 7, 5,-28, -5, -6,-20, 6,-19,-17, -3, 32, 2, -5, -2, 0,-23,-31,-18, 1; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='P'; M= -5, -9,-15, -8, -4, -5,-11, -2, -7, -1, -2, -5, -9, 4, -1, -2, -4, 0, -6,-10, 3, -5; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='R'; M= 2, 4,-23, 6, -4,-18, 6,-14,-15, 1,-14, -7, 4,-10, 1, 8, 2, -7,-13,-19,-16, -4; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='D'; M= 1, 29,-16, 37, 5,-30, -6,-12,-20, 0,-14,-15, 24,-14, -5,-11, 4, -1,-18,-43,-22, -1; /M: SY='L'; M= -5,-14,-14,-20,-17, 18,-19,-15, 21,-14, 23, 7,-12,-26,-18,-18,-12, 0, 16,-20, 14,-17; /M: SY='L'; M= -9, -8,-20,-11, -9, 8,-18, -3, 2, -8, 10, 1, -4,-19, -7,-10, -9, -4, -1,-17, 10,-10; /M: SY='A'; M= 13, 4,-25, 9, 3,-24, -1,-12,-12, 0,-13,-10, 0, -1, 1, -9, 10, 5, -9,-33,-22, -1; /M: SY='I'; M= 6,-15, -7,-22,-17, -4,-19,-18, 24,-11, 11, 11, -7,-28,-15,-16, -7, 7, 22,-32, -8,-17; /M: SY='L'; M= -5,-12, -4,-15,-13, 13,-19,-11, 23,-16, 32, 19,-15,-30,-19,-19,-17, 1, 14,-23, 18,-13; /M: SY='D'; M= 1, 43,-26, 78, 14,-47,-11,-18,-37, 2,-11,-27, 9, -9, -6,-10, 1,-10,-21,-37,-12, 5; /M: SY='A'; M= 17, -8,-19,-11,-10, -6,-10,-18, 9, -7, 2, 7, -6,-19, -6,-13, 2, 8, 13,-35,-15,-10; /M: SY='A'; M= 13, -8, 8,-12, -6,-12,-12,-24, 5,-10, 0, 2, -5,-19, -6,-15, 1, 5, 8,-36,-26, -7; /M: SY='K'; M= -1, -3,-28, -2, 14,-10,-12,-17,-20, 32,-19, 15, -3, 5, 6, 19, -1,-12,-18,-18, -9, 8; /M: SY='V'; M= 10,-17,-19,-20,-24, 3,-21,-26, 34,-17, 10, 3,-13,-33,-22,-14, -7, 8, 38,-31, 0,-24; /M: SY='A'; M= 30, -1,-20, -2, 0,-18, -2,-19, -2, -1,-11, 2, -1,-11, 4,-10, 15, 11, 5,-44,-35, -3; /M: SY='D'; M= 0, 47,-29, 83, 9,-46,-10,-19,-37, 0,-10,-28, 12,-11,-10,-11, 1, -8,-19,-40,-11, -1; /M: SY='F'; M= -8,-18,-21,-23,-22, 23,-21,-18, 13,-13, 16, -2,-13,-26,-17,-15, -6, 3, 15, -9, 18,-21; /M: SY='V'; M= 6,-17,-16,-21,-24, 7,-22,-23, 34,-17, 15, 6,-14,-34,-23,-15,-10, 7, 35,-29, 6,-24; /M: SY='I'; M= 1,-14, -8,-19,-18, 8,-20,-18, 30,-18, 23, 12,-14,-31,-20,-18,-13, 3, 25,-27, 9,-18; /M: SY='F'; M=-13,-22,-15,-33,-26, 56,-25,-22, 11,-14, 24, -3,-13,-33,-25,-14,-13,-10, 12, -5, 23,-27; /M: SY='I'; M= 5,-14,-16,-17,-20, 4,-15,-19, 26,-15, 15, 9,-13,-31,-21,-15,-10, 4, 25,-26, 5,-20; /M: SY='I'; M= -6,-17,-14,-20,-17, 10,-16,-16, 20,-16, 20, 10,-18,-29,-18,-16,-14, -1, 15, -5, 16,-17; /M: SY='D'; M= 3, 10,-23, 20, 3,-25, -5, -9,-20, 1,-18,-23, 1, 8, -8,-11, 18, 8,-17,-33,-18, -5; /M: SY='A'; M= 16, -6,-18, -5, -4,-19, -2,-16, -3, -3,-10, -4, -7, 3, -2,-12, 5, 7, -1,-36,-26, -6; /M: SY='S'; M= 5, 3,-16, 4, 3,-19,-10,-12, -9, -1, -8, -8, 4, -8, 1,-10, 8, 8, -8,-30,-14, 1; /M: SY='E'; M= 1, -2,-17, -2, 6,-16, -8,-11, -9, 1, -7, -8, -3, -7, 3, -8, 0, -2, -9,-19,-10, 5; /M: SY='E'; M= 2, -1,-10, 0, 19,-29, 9,-13,-17, 4,-11,-12, -5, -1, 3,-12, 2,-12,-22,-11,-21, 14; /I: I=-4; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7; /M: SY='I'; M= -2,-19,-17,-26,-25, 19,-21,-23, 29,-17, 16, 2,-15,-33,-23,-15,-11, 0, 29,-14, 12,-25; D=-4; /I: I=-4; DM=-7; /M: SY='D'; M= 2, 28,-21, 50, 15,-40, -8,-14,-29, 2,-11,-21, 6, -6, -1,-11, 4, -5,-19,-32,-14, 8; /M: SY='E'; M= 6, 0,-15, 4, 15,-26,-12, -5,-14, 8, -8, -2, -3, 2, 7, -5, 1, -2,-15,-27,-17, 11; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='W'; M= -7, -8,-18, -3, 5, -4,-11,-14,-14, -2, -2,-11,-13,-12, 0, -8, -4,-10,-11, 9, 5, 3; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='G'; M= 4, 0,-32, -7,-15,-25, 42,-23, -8, -8,-15,-13, 1,-10,-10,-16, 3, -5,-17, -8,-24,-14; /M: SY='E'; M= -2, 2,-10, 8, 23,-15,-18, -7,-20, 9, -6, -9, -4, -5, 6, -5, -2,-13,-17,-16, -9, 17; /M: SY='E'; M= -1, -5,-13, -5, 8,-13,-17, -4, -6, 1, 0, 3, -5, -8, 7, -4, -4, -1, -8,-22, -3, 8; /M: SY='L'; M= -7,-16, 8,-24,-17, 15,-22,-21, 17,-16, 19, 4,-11,-30,-19,-18,-12, -2, 14,-19, 4,-18; /M: SY='L'; M= -6,-13, -7,-18,-15, 15,-19,-12, 27,-18, 33, 18,-15,-31,-19,-20,-17, 0, 17,-22, 19,-15; /M: SY='S'; M= 4, 0,-20, -2, -6,-12, -9,-13,-12, 2,-15, -5, 6,-11, 3, 10, 12, 7, -7,-30,-15, -6; /M: SY='C'; M= 6,-10, 13,-17, -8,-12,-15,-21, 7,-10, 3, 3, -4,-21,-10,-16, -1, 6, 7,-33,-23,-10; /M: SY='I'; M= -3,-14, -2,-21,-17, 9,-18,-17, 28,-18, 25, 12,-12,-30,-20,-20,-14, 0, 20,-24, 7,-17; /M: SY='Q'; M= -2,-10,-13,-11, 5, -4,-19, -9, -8, 4, -1, 3, -8,-11, 13, 8, -8, -8, -9,-15, -1, 7; /M: SY='A'; M= 24, 0,-25, -2, -4,-15, 1,-18, 0, -3, -9, 1, 2,-12, 1,-12, 13, 11, 3,-40,-28, -5; /M: SY='Q'; M= 3,-12,-26,-13, 12,-26,-21, 27,-15, -5,-13, 0, -9, -1, 52, 16,-10, -4,-25,-20, -6, 25; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='G'; M= 1, 0,-39, -9,-19,-29, 76,-29,-10, -9,-19,-19, 0,-10,-19,-19, 1,-19,-28, 8,-30,-19; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='L'; M= -4,-15,-10,-21,-18, 16,-19,-13, 24,-14, 26, 14,-13,-31,-20,-17,-14, 0, 18,-21, 14,-18; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='P'; M= -2,-14,-26, -8, 5,-31, -7, 2,-21, 6,-24,-30,-20, 71, -2,-11, 1, 6,-27,-30,-20, -3; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='S'; M= 8, 2,-20, -2, -4,-14, -7,-11, -7, 0,-12, -5, 8, -7, -2, -9, 16, 16, -5,-35,-17, -5; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='V'; M= 3,-13,-16,-16,-18, -2,-20,-16, 16,-12, 4, -3,-10,-12,-15,-15, -2, 12, 19,-28, 0,-18; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='I'; M= 2,-16,-18,-22,-20, 9,-18,-14, 24,-11, 16, 10, -9,-29,-18,-14, -9, 4, 22,-23, 5,-20; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='G'; M= 3, -6,-24,-11,-12,-11, 6, -5, 1, -9, -6, -5, -2,-10,-12,-14, 0, 0, -3,-24,-14,-13; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='V'; M= 8,-15,-16,-19,-22, 7,-20,-24, 27,-15, 10, 3,-12,-31,-20,-14, -7, 5, 30,-29, 0,-22; /M: SY='I'; M= 4,-16,-12,-20,-21, 5,-22,-21, 30,-17, 14, 6,-13,-29,-21,-16,-10, 7, 30,-30, 4,-21; /M: SY='Q'; M= 5, -9,-22, -9, 3,-22,-14, -3,-13, 0,-14, -9, -7, 12, 25, 4, -1, 7,-16,-24,-12, 9; /M: SY='G'; M= -1, 10,-32, 5, -8,-25, 20, 3,-11, -7,-15, -8, 14,-10,-10,-15, 0, -7,-20,-28,-22,-10; /M: SY='L'; M= -5,-12, -8,-15,-13, 12,-18,-11, 20,-15, 28, 15,-15,-26,-18,-18,-15, 1, 12,-22, 17,-13; /M: SY='D'; M= 2, 9,-16, 16, 12,-26, -8,-11,-18, 4,-11,-13, 2, 1, 1, -8, 2, -4,-16,-27,-15, 7; /M: SY='A'; M= 4, 1,-16, 0, 4,-18, -8, -9,-11, 3,-10, -2, 2, -6, 3, -4, 4, 1,-12,-28,-16, 2; /I: I=-3; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7; /M: SY='I'; M= 0, -8,-15, -9, -6, -7,-14, -8, 5, -4, 4, 3, -8, -9,-10,-11, -6, 1, 3,-25, -3, -8; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='P'; M= 1, 4,-24, 8, 2,-26, -6, -9,-18, 4,-17,-16, 0, 22, -3, -9, 3, 3,-18,-34,-19, -3; /M: SY='P'; M= 5, -6,-23, -7, -2,-17, -7,-10, -4, 2, -9, -4, -6, 8, 0, -5, -1, 2, -7,-29,-14, -3; /M: SY='K'; M= 1, 1,-27, -1, 12,-11,-10,-16,-16, 28,-17, 13, 4, 4, 0, 7, 2, -5,-16,-25,-12, 6; /M: SY='K'; M= 1, -4,-25, -4, 6,-11,-11,-11,-14, 16,-13, 7, -2, -3, 8, 11, -1, -6,-13,-21, -9, 5; /M: SY='R'; M= -1,-11,-20, -8, 4,-14,-17, -7,-17, 8,-14, 2,-11, -6, 25, 31, -7,-13,-13,-11, -5, 9; /M: SY='Q'; M= 5, 0,-19, -3, 2,-17, -7, -8, -9, 0,-12, -6, 4, -2, 7, -3, 5, 5,-12,-30,-16, 2; /M: SY='D'; M= 4, 15,-19, 27, 13,-30, -9,-13,-21, 5,-10,-10, 3, -6, 4, -5, 2, -4,-15,-29,-15, 9; /M: SY='V'; M= 7,-12,-19,-16,-15, -3,-17,-16, 15,-10, 5, 4, -7,-21, -9,-11, -2, 8, 18,-30, -4,-14; /M: SY='R'; M= -4, -9,-23, -7, 3, -6,-15,-13,-13, 17,-10, 11,-10, -5, 5, 23, -6,-13, -9,-12, -1, 2; /M: SY='K'; M= 1, -2,-26, -1, 12,-13,-12,-14,-19, 25,-18, 10, -2, 3, 10, 16, 0, -8,-17,-19,-10, 9; /M: SY='S'; M= 5, -2,-17, -4, 0, -9,-10,-10, -9, 1,-10, -5, 1,-12, 0, -3, 10, 4, -8,-26,-13, -2; /M: SY='L'; M= -2,-12,-10,-16,-14, 10,-16,-13, 20,-15, 23, 12,-13,-27,-17,-17,-12, 1, 14,-23, 11,-14; /M: SY='Q'; M= 2, -5,-18, -6, 8,-14,-16, -1, -9, 3, -7, 3, -4, -5, 15, 2, -1, 0,-12,-24, -7, 9; /M: SY='K'; M= 3, -1,-25, -1, 5,-11, -8, -8,-15, 13,-16, 1, 0, -4, -1, 5, 11, 0,-13,-26,-13, -1; /M: SY='F'; M=-10,-17,-28,-18,-15, 24,-21,-15, -5, -4, 9, -5,-14,-21, -5, 2, -7, -8, 3, -1, 20,-14; /M: SY='F'; M= -3,-18,-19,-28,-22, 25,-19,-16, 20,-11, 20, 9, -9,-32,-19,-15,-10, -2, 17,-17, 10,-22; /M: SY='Q'; M= 1, -2,-18, -2, 8,-19, -9, -6,-15, 3,-12, -5, -1, -7, 11, -1, 3, -1,-16,-14,-11, 9; /M: SY='H'; M= -6, -7,-32, -7, -2, -9,-17, 18,-13, 0, -7, 2, -3, -4, 0, -2, 1, -2,-11,-24, 1, -3; /M: SY='W'; M=-16,-21,-20,-20, -2, 14,-17,-11,-16, -2, -2,-10,-22,-17, -2, 4,-11,-22,-11, 28, 14, -3; /M: SY='F'; M= -9,-20,-22,-32,-27, 51,-22,-21, 11,-12, 18, -6, -9,-33,-23,-14, -8, -8, 13, -9, 16,-28; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='P'; M= -5,-12,-19, -9, 0,-16, -4, -1,-14, 2,-12,-17,-16, 37, -4, -8, -5, -2,-18,-13, -9, -4; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='P'; M= 1, 3,-21, 10, 9,-29, -3, -7,-20, 4,-16,-17, -3, 21, -1,-11, 3, 0,-21,-29,-18, 3; /M: SY='D'; M= 2, 5,-19, 12, 9,-25, -4,-12,-14, 1, -8,-10, -3, -6, 5, -5, -1, -7,-14,-20,-11, 7; /M: SY='E'; M= 7, 3,-14, 9, 13,-25,-11,-11,-12, 2, -9, -7, -2, -4, 4, -9, 3, -2, -9,-28,-17, 9; /M: SY='K'; M= -2, -4,-27, -2, 12,-11,-11,-16,-21, 30,-19, 13, -4, 6, 6, 23, -2,-13,-18,-16, -8, 7; /M: SY='I'; M= -2,-18,-14,-24,-22, 13,-20,-19, 30,-17, 20, 6,-15,-28,-22,-17,-13, 1, 26,-21, 11,-22; /M: SY='F'; M=-14,-22,-29,-26,-19, 29,-24, 5, 0, -9, 15, 2,-15,-24,-14, -7,-12, -9, 3, -5, 23,-19; /M: SY='D'; M= 0, -1,-19, 2, -1,-14,-12, -8,-10, -3, -5, -9, -4, -2, -4,-10, 1, 2, -7,-26, -7, -4; /M: SY='L'; M= -2,-12, -2,-16,-13, 9,-16,-15, 17,-16, 22, 11,-13,-26,-16,-18,-12, 1, 12,-24, 8,-13; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='D'; M= 2, 27,-20, 46, 12,-36, -7,-13,-27, 2,-12,-20, 8, -7, -3,-11, 6, -3,-18,-33,-15, 5; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; /M: SY='T'; M= 6, 4,-19, -2, -2,-13, -8,-14, -6, 3,-10, -2, 10, -6, -2,-10, 11, 13, -6,-35,-16, -3; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='E'; M= 2, 1,-19, 7, 12,-22,-10,-10,-17, 7,-13,-11, -5, 9, 4, -3, 3, -2,-16,-23,-13, 7; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='Q'; M= 8, 3,-19, 1, 3,-19, -6,-10,-10, 1,-13, -6, 5, -8, 10, -3, 8, 6,-11,-30,-18, 3; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='D'; M= 1, 25,-14, 48, 26,-41,-13,-12,-31, 7,-10,-19, 3, -3, 2,-10, 1,-11,-21,-28,-14, 17; /M: SY='A'; M= 5, -9, 2,-13, -9,-11, -5,-22, 1,-10, -3, -3, -6,-18, -8,-11, -2, -1, 2,-24,-21,-10; /M: SY='L'; M= 2, -6,-15, -8, -5, -4,-14, -8, 3, -7, 5, 4, -6,-15, 0, -8, -4, 2, 0,-26, -2, -4; /M: SY='N'; M= 4, 10,-15, -2, -6,-11, -9,-10, -1, -2, -7, 3, 24,-19, 4, -8, -2, 8, -9,-42,-18, -3; /M: SY='I'; M= 0,-14, -6,-18,-16, 10,-20,-17, 22,-15, 22, 11,-13,-30,-18,-17,-12, 3, 19,-24, 9,-16; /M: SY='L'; M= -1,-13,-11,-16,-14, 9,-18,-13, 20,-13, 23, 14,-14,-29,-18,-16,-11, 3, 16,-24, 12,-15; /M: SY='R'; M=-11,-19,-20,-11, -8, -9,-19, -9,-27, 8,-18, 0,-19,-11, 26, 68,-10,-28,-11, 3, 2, 0; /M: SY='H'; M= -2,-10,-22,-15,-10, 1,-15, 2, -5, -6, -1, 0, -5,-14, -1, -4, 0, 1, -4,-23, -2, -8; /M: SY='I'; M= -3,-15,-11,-22,-18, 10,-17,-14, 34,-17, 28, 16,-11,-30,-19,-21,-15, 0, 23,-25, 10,-18; /M: SY='C'; M= 6, -3, 11, -7, -2,-19, -1,-24, -7, -8,-10, -9, 0,-14, -7,-14, 8, 3, -7,-28,-30, -6; /M: SY='T'; M= 6, 3,-14, -1, 2,-19,-10,-13, -5, -2, -8, -5, 8,-10, 4,-13, 7, 11, -6,-34,-17, 2; /M: SY='Q'; M= 6, -8,-21,-11, 3,-18,-11, -6, -6, 2, -7, 4, -5, -9, 20, 3, -3, 3,-11,-20,-10, 8; /M: SY='K'; M= -2, -8,-25, -9, 1, -4,-15, -9,-10, 13, -8, 9, -5, -4, 0, 7, -2, -5, -8,-19, -3, -2; /M: SY='P'; M= -6,-15,-24,-11, 3,-17,-16, -2,-13, 4,-10,-13,-19, 34, 6, 0, -9, -3,-17,-20, -4, 1; /M: SY='R'; M= -2, -4,-24, -2, 4,-12,-13,-13,-19, 18,-18, 6, -2, -2, 10, 27, -1,-11,-14,-19, -9, 3; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
| COMPETES_HIT_WITH | PS51705; PS51706; PS51709; PS51710; PS51711; PS51712; PS51713; PS51715; PS51716; PS51717; PS51718; PS51719; PS51720; PS51721; PS51722 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 13 in 13 different sequences |
| Number of true positive hits | 13 in 13 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Bms1-type G |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
13 sequences
BMS1_HUMAN (Q14692), BMS1_SCHPO (O94653), BMS1_YEAST (Q08965), TSR1_CAEBR (Q61WR2), TSR1_CAEEL (Q19329), TSR1_DICDI (Q54YA7), TSR1_DROME (Q9VP47), TSR1_HUMAN (Q2NL82), TSR1_MOUSE (Q5SWD9), TSR1_PONAB (Q5R434), TSR1_SCHPO (O13956), TSR1_XENLA (Q5XGY1), TSR1_YEAST (Q07381)» more
|
| PDB [Detailed view] |
57 PDB
5IW7; 5JPQ; 5WLC; 5WWN; 5WYJ; 5WYK; 6EML; 6FAI; 6G18; 6G4S; 6G4W; 6G51; 6G53; 6KE6; 6LQP; 6LQQ; 6LQR; 6LQS; 6LQT; 6LQU; 6LQV; 6RBD; 6WDR; 6Y7C; 6ZMT; 6ZN5; 6ZQA; 6ZQB; 6ZQC; 6ZQD; 6ZQE; 6ZQF; 6ZQG; 7AJT; 7AJU; 7D4I; 7D5S; 7D5T; 7D63; 7MQ9; 7MQA; 7SUK; 7WTL; 7WTP; 7WTQ; 7WTR; 7WTS; 7WTT; 7WTU; 7WTV; 7WTW; 7WTX; 7WTZ; 7WU0; 8C00; 8C01; 8CBJ » more |